FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4442, 459 aa 1>>>pF1KE4442 459 - 459 aa - 459 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2681+/-0.000816; mu= 5.5073+/- 0.049 mean_var=203.1600+/-40.061, 0's: 0 Z-trim(115.1): 29 B-trim: 2 in 1/51 Lambda= 0.089982 statistics sampled from 15607 (15632) to 15607 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.801), E-opt: 0.2 (0.48), width: 16 Scan time: 3.620 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6585.1 CA9 gene_id:768|Hs108|chr9 ( 459) 3145 420.6 1.7e-117 CCDS947.1 CA14 gene_id:23632|Hs108|chr1 ( 337) 725 106.3 5.1e-23 CCDS10185.1 CA12 gene_id:771|Hs108|chr15 ( 354) 692 102.0 1e-21 CCDS30578.1 CA6 gene_id:765|Hs108|chr1 ( 308) 666 98.6 9.6e-21 CCDS57970.1 CA6 gene_id:765|Hs108|chr1 ( 313) 666 98.6 9.7e-21 CCDS10186.1 CA12 gene_id:771|Hs108|chr15 ( 343) 650 96.6 4.4e-20 CCDS10821.1 CA7 gene_id:766|Hs108|chr16 ( 264) 547 83.1 3.8e-16 CCDS57971.1 CA6 gene_id:765|Hs108|chr1 ( 248) 530 80.9 1.7e-15 CCDS6239.1 CA2 gene_id:760|Hs108|chr8 ( 260) 500 77.0 2.6e-14 CCDS6236.1 CA13 gene_id:377677|Hs108|chr8 ( 262) 494 76.2 4.5e-14 CCDS6237.1 CA1 gene_id:759|Hs108|chr8 ( 261) 483 74.8 1.2e-13 CCDS76767.1 CA12 gene_id:771|Hs108|chr15 ( 283) 482 74.7 1.4e-13 CCDS6174.1 CA8 gene_id:767|Hs108|chr8 ( 290) 475 73.8 2.7e-13 CCDS6238.1 CA3 gene_id:761|Hs108|chr8 ( 260) 456 71.3 1.4e-12 CCDS14171.1 CA5B gene_id:11238|Hs108|chrX ( 317) 457 71.5 1.4e-12 CCDS42173.1 CA7 gene_id:766|Hs108|chr16 ( 208) 453 70.8 1.5e-12 CCDS10965.1 CA5A gene_id:763|Hs108|chr16 ( 305) 441 69.4 5.9e-12 CCDS2895.1 PTPRG gene_id:5793|Hs108|chr3 (1445) 451 71.3 7.7e-12 >>CCDS6585.1 CA9 gene_id:768|Hs108|chr9 (459 aa) initn: 3145 init1: 3145 opt: 3145 Z-score: 2222.8 bits: 420.6 E(32554): 1.7e-117 Smith-Waterman score: 3145; 99.8% identity (100.0% similar) in 459 aa overlap (1-459:1-459) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MAPLCPSPWLPLLIPAPAPGLTVQLLLSLLLLMPVHPQRLPRMQEDSPLGGGSSGEDDPL ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 MAPLCPSPWLPLLIPAPAPGLTVQLLLSLLLLVPVHPQRLPRMQEDSPLGGGSSGEDDPL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GEEDLPSEEDSPREEDPPGEEDLPGEEDLPGEEDLPEVKPKSEEEGSLKLEDLPTVEAPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 GEEDLPSEEDSPREEDPPGEEDLPGEEDLPGEEDLPEVKPKSEEEGSLKLEDLPTVEAPG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 DPQEPQNNAHRDKEGDDQSHWRYGGDPPWPRVSPACAGRFQSPVDIRPQLAAFCPALRPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 DPQEPQNNAHRDKEGDDQSHWRYGGDPPWPRVSPACAGRFQSPVDIRPQLAAFCPALRPL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 ELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMALGPGREYRALQLHLHWGAAGRPGSEHT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 ELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMALGPGREYRALQLHLHWGAAGRPGSEHT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 VEGHRFPAEIHVVHLSTAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLEEGPEENSAYEQLLSRLEEIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 VEGHRFPAEIHVVHLSTAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLEEGPEENSAYEQLLSRLEEIA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 EEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVIWTVFNQTVMLSAKQLHTLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 EEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVIWTVFNQTVMLSAKQLHTLS 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 DTLWGPGDSRLQLNFRATQPLNGRVIEASFPAGVDSSPRAAEPVQLNSCLAAGDILALVF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 DTLWGPGDSRLQLNFRATQPLNGRVIEASFPAGVDSSPRAAEPVQLNSCLAAGDILALVF 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 GLLFAVTSVAFLVQMRRQHRRGTKGGVSYRPAEVAETGA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 GLLFAVTSVAFLVQMRRQHRRGTKGGVSYRPAEVAETGA 430 440 450 >>CCDS947.1 CA14 gene_id:23632|Hs108|chr1 (337 aa) initn: 696 init1: 314 opt: 725 Z-score: 526.7 bits: 106.3 E(32554): 5.1e-23 Smith-Waterman score: 729; 39.4% identity (66.4% similar) in 330 aa overlap (136-453:17-332) 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 GSLKLEDLPTVEAPGDPQEPQNNAHRDKEGDDQSHWRY-G--GDPPWPRVSPACAGRFQS : .:: : : :. :: : :.. :: CCDS94 MLFSALLLEVIWILAADGGQHWTYEGPHGQDHWPASYPECGNNAQS 10 20 30 40 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 PVDIRPQLAAFCPALRPLELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMALGPGREYRA :.::. . ..: : : :. :.. : : :.::::.:::.:: : .. : :.: : CCDS94 PIDIQTDSVTFDPDLPALQPHGYDQPGTEPLDLHNNGHTVQLSLPSTLYLG-GLPRKYVA 50 60 70 80 90 100 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 LQLHLHWGAAGRPG-SEHTVEGHRFPAEIHVVHL-STAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLE ::::::: : :: ::: .... ::.:.:: : .. ..:: :: :::::. ..: CCDS94 AQLHLHWGQKGSPGGSEHQINSEATFAELHIVHYDSDSYDSLSEAAERPQGLAVLGILIE 110 120 130 140 150 160 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 EGPEENSAYEQLLSRLEEIAEEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGV : .: :::..::.:.:. .. ..:.:: ... :::.....::.:.:::::::: :.: CCDS94 VGETKNIAYEHILSHLHEVRHKDQKTSVPPFNLRELLPKQLGQYFRYNGSLTTPPCYQSV 170 180 190 200 210 220 350 360 370 380 390 pF1KE4 IWTVFNQTVMLSAKQLHTLSDTLWGPGD--SRLQL-NFRATQPLNGRVIEASFPAGVDSS .:::: . ..: .::. :. ::.. . :.: . :.:: :::: :.. ::: CCDS94 LWTVFYRRSQISMEQLEKLQGTLFSTEEEPSKLLVQNYRALQPLNQRMVFASF------- 230 240 250 260 270 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 PRAAEPVQLNSCLAAGDILALVFGLLFA----VTSVAFLVQMRRQHRRGTKGGVSYRPAE .: .: ..:..:.: :.: . . .: :... :..: .. .: . :. CCDS94 ------IQAGSSYTTGEMLSLGVGILVGCLCLLLAVYFIARKIRKKRLENRKSVVFTSAQ 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 VAETGA CCDS94 ATTEA >>CCDS10185.1 CA12 gene_id:771|Hs108|chr15 (354 aa) initn: 510 init1: 444 opt: 692 Z-score: 503.3 bits: 102.0 E(32554): 1e-21 Smith-Waterman score: 692; 36.7% identity (63.6% similar) in 338 aa overlap (139-459:30-352) 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 KLEDLPTVEAPGDPQEPQNNAHRDKEGDDQSHWRY---GGDPPWPRVSPACAGRFQSPVD :.: : :. : . :.:.: .:::.: CCDS10 MPRRSLHAAAVLLLVILKEQPSSPAPVNGSKWTYFGPDGENSWSKKYPSCGGLLQSPID 10 20 30 40 50 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 IRPQLAAFCPALRPLELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMALGPGREYRALQL .. .. . .: :::. :..: .. : ::::::.:.:: ... : .: : :: CCDS10 LHSDILQYDASLTPLEFQGYNLSANKQFLLTNNGHSVKLNLPSDMHIQ-GLQSRYSATQL 60 70 80 90 100 110 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 HLHWGAAGRP-GSEHTVEGHRFPAEIHVVHL-STAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLEEGP ::::: . : :::::: :..: ::.:.:: : . .. : .. ::::::...: : CCDS10 HLHWGNPNDPHGSEHTVSGQHFAAELHIVHYNSDLYPDASTASNKSEGLAVLAVLIEMGS 120 130 140 150 160 170 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 EENSAYEQLLSRLEEIAEEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVIWT : .:....:.:... .:.:. :::..: ::: ..:..:.:::::::: :.:: CCDS10 F-NPSYDKIFSHLQHVKYKGQEAFVPGFNIEELLPERTAEYYRYRGSLTTPPCNPTVLWT 180 190 200 210 220 230 350 360 370 380 390 pF1KE4 VFNQTVMLSAKQLHTLSDTLW-----GPGDSRLQLNFRATQPLNGRVIEASFPAGVDSSP :: . :..: .:: .: .:. :. .. ::: .: .. :.. .:: CCDS10 VFRNPVQISQEQLLALETALYCTHMDDPSPREMINNFRQVQKFDERLVYTSFS------- 240 250 260 270 280 290 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 RAAEPVQLNSCLAAGDILALVFGLLFA-------VTSVAFLVQMRRQHRRGTKGGVSYRP :.. : ::: :.....: .: :. :.. . :.. ..: . :: :.: CCDS10 ------QVQVCTAAGLSLGIILSLALAGILGICIVVVVSIWLFRRKSIKKGDNKGVIYKP 300 310 320 330 340 pF1KE4 AEVAETGA : :: : CCDS10 ATKMETEAHA 350 >>CCDS30578.1 CA6 gene_id:765|Hs108|chr1 (308 aa) initn: 684 init1: 291 opt: 666 Z-score: 485.9 bits: 98.6 E(32554): 9.6e-21 Smith-Waterman score: 666; 39.6% identity (68.1% similar) in 260 aa overlap (139-391:21-279) 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 KLEDLPTVEAPGDPQEPQNNAHRDKEGDDQSHWRYG----GDPPWPRVSPACAGRFQSPV : : :. . ::. :::.:. :::. CCDS30 MRALVLLLSLFLLGGQAQHVSDWTYSEGALDEAHWPQHYPACGGQRQSPI 10 20 30 40 50 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 DIRPQLAAFCPALRPLELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMALGPGREYRALQ ... . . :.:. :.. :.. :. . ::::.::..:: ..:... : : : : CCDS30 NLQRTKVRYNPSLKGLNMTGYETQA-GEFPMVNNGHTVQISLPSTMRMTVADGTVYIAQQ 60 70 80 90 100 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 LHLHWGAAGRP--GSEHTVEGHRFPAEIHVVHLSTAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLE-E .:.:::.:. ::::::.: : :::.:: .. . : : : ::::::::.: . CCDS30 MHFHWGGASSEISGSEHTVDGIRHVIEIHIVHYNSKYKSYDIAQDAPDGLAVLAAFVEVK 110 120 130 140 150 160 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 GPEENSAYEQLLSRLEEIAEEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVI . ::. : ...:.: .: :..: . :::.. .:: ....:. :.::::::::...: CCDS30 NYPENTYYSNFISHLANIKYPGQRTTLTGLDVQDMLPRNLQHYYTYHGSLTTPPCTENVH 170 180 190 200 210 220 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 WTVFNQTVMLSAKQLHTLSDTLWGPGDSRLQLNFRATQPLNGRVIEASFPAGVDSSPRAA : :. . : :: :. : ..: .. .. ..: ::::: ::.:..:: CCDS30 WFVLADFVKLSRTQVWKLENSLLDHRNKTIHNDYRRTQPLNHRVVESNFPNQEYTLGSEF 230 240 250 260 270 280 410 420 430 440 450 pF1KE4 EPVQLNSCLAAGDILALVFGLLFAVTSVAFLVQMRRQHRRGTKGGVSYRPAEVAETGA CCDS30 QFYLHKIEEILDYLRRALN 290 300 >>CCDS57970.1 CA6 gene_id:765|Hs108|chr1 (313 aa) initn: 684 init1: 291 opt: 666 Z-score: 485.8 bits: 98.6 E(32554): 9.7e-21 Smith-Waterman score: 673; 37.6% identity (65.8% similar) in 295 aa overlap (139-417:21-313) 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 KLEDLPTVEAPGDPQEPQNNAHRDKEGDDQSHWRYG----GDPPWPRVSPACAGRFQSPV : : :. . ::. :::.:. :::. CCDS57 MRALVLLLSLFLLGGQAQHVSDWTYSEGALDEAHWPQHYPACGGQRQSPI 10 20 30 40 50 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 DIRPQLAAFCPALRPLELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMALGPGREYRALQ ... . . :.:. :.. :.. :. . ::::.::..:: ..:... : : : : CCDS57 NLQRTKVRYNPSLKGLNMTGYETQA-GEFPMVNNGHTVQISLPSTMRMTVADGTVYIAQQ 60 70 80 90 100 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 LHLHWGAAGRP--GSEHTVEGHRFPAEIHVVHLSTAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLE-E .:.:::.:. ::::::.: : :::.:: .. . : : : ::::::::.: . CCDS57 MHFHWGGASSEISGSEHTVDGIRHVIEIHIVHYNSKYKSYDIAQDAPDGLAVLAAFVEVK 110 120 130 140 150 160 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 GPEENSAYEQLLSRLEEIAEEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVI . ::. : ...:.: .: :..: . :::.. .:: ....:. :.::::::::...: CCDS57 NYPENTYYSNFISHLANIKYPGQRTTLTGLDVQDMLPRNLQHYYTYHGSLTTPPCTENVH 170 180 190 200 210 220 350 360 370 380 390 pF1KE4 WTVFNQTVMLSAKQLHTLSDTLWGPGDSRLQLNFRATQPLNGRVIEASFPA--------- : :. . : :: :. : ..: .. .. ..: ::::: ::.:..:: CCDS57 WFVLADFVKLSRTQVWKLENSLLDHRNKTIHNDYRRTQPLNHRVVESNFPNQGKGHGGHR 230 240 250 260 270 280 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 GVDSSPRAAEPVQLNSCLAAGDILALVFGLLFAVTSVAFLVQMRRQHRRGTKGGVSYRPA : ...::. .:.. :: :.. : CCDS57 GRSQNPRV-QPTSTRHPLALGSLEA 290 300 310 >>CCDS10186.1 CA12 gene_id:771|Hs108|chr15 (343 aa) initn: 576 init1: 414 opt: 650 Z-score: 474.0 bits: 96.6 E(32554): 4.4e-20 Smith-Waterman score: 680; 37.2% identity (63.7% similar) in 331 aa overlap (139-459:30-341) 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 KLEDLPTVEAPGDPQEPQNNAHRDKEGDDQSHWRY---GGDPPWPRVSPACAGRFQSPVD :.: : :. : . :.:.: .:::.: CCDS10 MPRRSLHAAAVLLLVILKEQPSSPAPVNGSKWTYFGPDGENSWSKKYPSCGGLLQSPID 10 20 30 40 50 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 IRPQLAAFCPALRPLELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMALGPGREYRALQL .. .. . .: :::. :..: .. : ::::::.:.:: ... : .: : :: CCDS10 LHSDILQYDASLTPLEFQGYNLSANKQFLLTNNGHSVKLNLPSDMHIQ-GLQSRYSATQL 60 70 80 90 100 110 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 HLHWGAAGRP-GSEHTVEGHRFPAEIHVVHL-STAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLEEGP ::::: . : :::::: :..: ::.:.:: : . .. : .. ::::::...: : CCDS10 HLHWGNPNDPHGSEHTVSGQHFAAELHIVHYNSDLYPDASTASNKSEGLAVLAVLIEMGS 120 130 140 150 160 170 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 EENSAYEQLLSRLEEIAEEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVIWT : .:....:.:... .:.:. :::..: ::: ..:..:.:::::::: :.:: CCDS10 F-NPSYDKIFSHLQHVKYKGQEAFVPGFNIEELLPERTAEYYRYRGSLTTPPCNPTVLWT 180 190 200 210 220 230 350 360 370 380 390 pF1KE4 VFNQTVMLSAKQLHTLSDTLW-----GPGDSRLQLNFRATQPLNGRVIEASFPAGVDSSP :: . :..: .:: .: .:. :. .. ::: .: .. :.. .:: :. : CCDS10 VFRNPVQISQEQLLALETALYCTHMDDPSPREMINNFRQVQKFDERLVYTSFSQGIILS- 240 250 260 270 280 290 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 RAAEPVQLNSCLAAGDILALVFGLLFAVTSVAFLVQMRRQHRRGTKGGVSYRPAEVAETG :: :: ..:. ..:. .: . :.. ..: . :: :.:: :: CCDS10 -----------LA----LAGILGICIVVVVSIWLFR-RKSIKKGDNKGVIYKPATKMETE 300 310 320 330 340 pF1KE4 A : CCDS10 AHA >>CCDS10821.1 CA7 gene_id:766|Hs108|chr16 (264 aa) initn: 506 init1: 169 opt: 547 Z-score: 403.3 bits: 83.1 E(32554): 3.8e-16 Smith-Waterman score: 547; 37.3% identity (64.3% similar) in 263 aa overlap (141-392:7-264) 120 130 140 150 160 pF1KE4 EDLPTVEAPGDPQEPQNNAHRDKEGDDQSHWRYGGDP-P--WPRVSPACAGRFQSPVDIR : :: : : : .. : : :::..: CCDS10 MTGHHGWGYGQDDGPSHWHKLYPIAQGDRQSPINII 10 20 30 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 PQLAAFCPALRPLELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMAL---GPGR-EYRAL . :.. :.:.:::: . : . :::::::. . . . .. :: . :: CCDS10 SSQAVYSPSLQPLEL---SYEACMSLSITNNGHSVQVDFNDSDDRTVVTGGPLEGPYRLK 40 50 60 70 80 90 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 QLHLHWGAAGRPGSEHTVEGHRFPAEIHVVHLSTA-FARVDEALGRPGGLAVLAAFLEEG :.:.::: ::::::.:. ::.:.:.:: .. .. :: . : ::::...::: : CCDS10 QFHFHWGKKHDVGSEHTVDGKSFPSELHLVHWNAKKYSTFGEAASAPDGLAVVGVFLETG 100 110 120 130 140 150 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 PEENSAYEQLLSRLEEIAEEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVIW .:. ....: . : . .:...: .. . :::.. .:. : ::::::: ...: : CCDS10 -DEHPSMNRLTDALYMVRFKGTKAQFSCFNPKCLLPAS-RHYWTYPGSLTTPPLSESVTW 160 170 180 190 200 210 350 360 370 380 390 pF1KE4 TVFNQTVMLSAKQLHTLSDTLW-GPGDSRLQL--NFRATQPLNGRVIEASFPAGVDSSPR :. . . .: .:. . . :. . : :... ::: :::.:::..::: : CCDS10 IVLREPICISERQMGKFRSLLFTSEDDERIHMVNNFRPPQPLKGRVVKASFRA 220 230 240 250 260 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 AAEPVQLNSCLAAGDILALVFGLLFAVTSVAFLVQMRRQHRRGTKGGVSYRPAEVAETGA >>CCDS57971.1 CA6 gene_id:765|Hs108|chr1 (248 aa) initn: 555 init1: 291 opt: 530 Z-score: 391.7 bits: 80.9 E(32554): 1.7e-15 Smith-Waterman score: 530; 42.6% identity (70.8% similar) in 195 aa overlap (200-391:25-219) 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 LAAFCPALRPLELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMALGPGREYRALQLHLHW .:::..:: ..:... : : : :.:.:: CCDS57 MRALVLLLSLFLLGGQAQHVSDWTYSVQISLPSTMRMTVADGTVYIAQQMHFHW 10 20 30 40 50 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 GAAGRP--GSEHTVEGHRFPAEIHVVHLSTAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLE-EGPEEN :.:. ::::::.: : :::.:: .. . : : : ::::::::.: .. :: CCDS57 GGASSEISGSEHTVDGIRHVIEIHIVHYNSKYKSYDIAQDAPDGLAVLAAFVEVKNYPEN 60 70 80 90 100 110 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 SAYEQLLSRLEEIAEEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVIWTVFN . : ...:.: .: :..: . :::.. .:: ....:. :.::::::::...: : :. CCDS57 TYYSNFISHLANIKYPGQRTTLTGLDVQDMLPRNLQHYYTYHGSLTTPPCTENVHWFVLA 120 130 140 150 160 170 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 QTVMLSAKQLHTLSDTLWGPGDSRLQLNFRATQPLNGRVIEASFPAGVDSSPRAAEPVQL . : :: :. : ..: .. .. ..: ::::: ::.:..:: CCDS57 DFVKLSRTQVWKLENSLLDHRNKTIHNDYRRTQPLNHRVVESNFPNQEYTLGSEFQFYLH 180 190 200 210 220 230 410 420 430 440 450 pF1KE4 NSCLAAGDILALVFGLLFAVTSVAFLVQMRRQHRRGTKGGVSYRPAEVAETGA CCDS57 KIEEILDYLRRALN 240 >>CCDS6239.1 CA2 gene_id:760|Hs108|chr8 (260 aa) initn: 416 init1: 209 opt: 500 Z-score: 370.4 bits: 77.0 E(32554): 2.6e-14 Smith-Waterman score: 500; 34.5% identity (62.5% similar) in 261 aa overlap (140-390:4-259) 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 LEDLPTVEAPGDPQEPQNNAHRDKEGDDQSHWRYG---GDPPWPRVSPACAGRFQSPVDI :: :: : : . : :. :::::: CCDS62 MSHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDI 10 20 30 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 RPQLAAFCPALRPLELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMAL---GP-GREYRA . : . :.:.:: . . ::. ::::. .. . . . :. :: :: CCDS62 DTHTAKYDPSLKPLSV---SYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRL 40 50 60 70 80 90 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 LQLHLHWGAAGRPGSEHTVEGHRFPAEIHVVHLSTAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLEEG .:.:.:::. ::::::. ... ::.:.:: .: .. .:. .: :::::. ::. : CCDS62 IQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVG 100 110 120 130 140 150 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 PEENSAYEQLLSRLEEIAEEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVIW . . ..... :. : .:. .. ..: .::: ... :. : ::::::: . : : CCDS62 SAK-PGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLD-YWTYPGSLTTPPLLECVTW 160 170 180 190 200 350 360 370 380 390 pF1KE4 TVFNQTVMLSAKQLHTLSD-TLWGPGDSRLQL--NFRATQPLNGRVIEASFPAGVDSSPR :... . .:..:. . .. : :. . . :.: .:::..: :.::: CCDS62 IVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK 210 220 230 240 250 260 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 AAEPVQLNSCLAAGDILALVFGLLFAVTSVAFLVQMRRQHRRGTKGGVSYRPAEVAETGA >>CCDS6236.1 CA13 gene_id:377677|Hs108|chr8 (262 aa) initn: 421 init1: 190 opt: 494 Z-score: 366.1 bits: 76.2 E(32554): 4.5e-14 Smith-Waterman score: 494; 36.4% identity (60.2% similar) in 261 aa overlap (141-390:6-261) 120 130 140 150 160 pF1KE4 EDLPTVEAPGDPQEPQNNAHRDKEGDDQSHWRY---GGDPPWPRVSPACAGRFQSPVDIR : : .: : . : : :::..:. CCDS62 MSRLSWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIK 10 20 30 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 PQLAAFCPALRPLELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMAL---GPGR-EYRAL . . . .:::: . . : . :.::: .. . . .. :: :: CCDS62 TKEVKYDSSLRPLSI---KYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLR 40 50 60 70 80 90 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 QLHLHWGAAGRPGSEHTVEGHRFPAEIHVVHL-STAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLEEG :.:::::.: :::: :.: . ::.:::: : . :: .: :::::..::. : CCDS62 QVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIG 100 110 120 130 140 150 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 PEENSAYEQLLSRLEEIAEEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVIW : :: ... . :. : :.:..:. ..:. .::: ... :. : ::::.:: ..: : CCDS62 -EPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWD-YWTYPGSLTVPPLLESVTW 160 170 180 190 200 210 350 360 370 380 390 pF1KE4 TVFNQTVMLSAKQL---HTLSDTLWGPGDSRLQLNFRATQPLNGRVIEASFPAGVDSSPR :..: . .:..:: ..: : : . . : : : :::.:: ..::: CCDS62 IVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH 220 230 240 250 260 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 AAEPVQLNSCLAAGDILALVFGLLFAVTSVAFLVQMRRQHRRGTKGGVSYRPAEVAETGA 459 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 00:36:42 2016 done: Sun Nov 6 00:36:43 2016 Total Scan time: 3.620 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]