Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4581
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4581, 805 aa
1>>>pF1KE4581 805 - 805 aa - 805 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5928+/-0.000927; mu= 19.4442+/- 0.056
mean_var=72.8728+/-14.837, 0's: 0 Z-trim(105.6): 30 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.150242
statistics sampled from 8497 (8526) to 8497 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16
Scan time: 3.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32361.1 CLCN7 gene_id:1186|Hs108|chr16 ( 805) 5294 1157.2 0
CCDS45378.1 CLCN7 gene_id:1186|Hs108|chr16 ( 781) 4817 1053.8 0
CCDS138.1 CLCN6 gene_id:1185|Hs108|chr1 ( 869) 1135 255.8 2.3e-67
CCDS57972.1 CLCN6 gene_id:1185|Hs108|chr1 ( 847) 1084 244.7 4.8e-64
CCDS168.1 CLCNKB gene_id:1188|Hs108|chr1 ( 687) 566 132.4 2.5e-30
CCDS41269.1 CLCNKA gene_id:1187|Hs108|chr1 ( 686) 539 126.5 1.5e-28
CCDS167.1 CLCNKA gene_id:1187|Hs108|chr1 ( 687) 539 126.5 1.5e-28
CCDS57973.1 CLCNKA gene_id:1187|Hs108|chr1 ( 644) 530 124.6 5.3e-28
CCDS14328.1 CLCN5 gene_id:1184|Hs108|chrX ( 746) 478 113.3 1.5e-24
CCDS48115.1 CLCN5 gene_id:1184|Hs108|chrX ( 816) 478 113.4 1.6e-24
CCDS54692.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3 ( 869) 478 113.4 1.7e-24
CCDS3263.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3 ( 898) 478 113.4 1.7e-24
CCDS75208.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4 ( 791) 464 110.3 1.3e-23
CCDS34101.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4 ( 818) 464 110.3 1.3e-23
CCDS34100.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4 ( 866) 464 110.3 1.4e-23
CCDS54690.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3 ( 854) 461 109.7 2.1e-23
CCDS59159.1 CLCN4 gene_id:1183|Hs108|chrX ( 666) 452 107.7 6.7e-23
CCDS14137.1 CLCN4 gene_id:1183|Hs108|chrX ( 760) 452 107.7 7.5e-23
CCDS57974.1 CLCNKB gene_id:1188|Hs108|chr1 ( 517) 376 91.1 5e-18
CCDS5881.1 CLCN1 gene_id:1180|Hs108|chr7 ( 988) 369 89.8 2.4e-17
CCDS54691.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3 ( 881) 358 87.4 1.2e-16
CCDS58932.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4 ( 791) 305 75.9 3e-13
>>CCDS32361.1 CLCN7 gene_id:1186|Hs108|chr16 (805 aa)
initn: 5294 init1: 5294 opt: 5294 Z-score: 6195.4 bits: 1157.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5294; 100.0% identity (100.0% similar) in 805 aa overlap (1-805:1-805)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MANVSKKVSWSGRDRDDEEAAPLLRRTARPGGGTPLLNGAGPGAARQSPRSALFRVGHMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MANVSKKVSWSGRDRDDEEAAPLLRRTARPGGGTPLLNGAGPGAARQSPRSALFRVGHMS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SVELDDELLDPDMDPPHPFPKEIPHNEKLLSLKYESLDYDNSENQLFLEEERRINHTAFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SVELDDELLDPDMDPPHPFPKEIPHNEKLLSLKYESLDYDNSENQLFLEEERRINHTAFR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 TVEIKRWVICALIGILTGLVACFIDIVVENLAGLKYRVIKGNIDKFTEKGGLSFSLLLWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TVEIKRWVICALIGILTGLVACFIDIVVENLAGLKYRVIKGNIDKFTEKGGLSFSLLLWA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TLNAAFVLVGSVIVAFIEPVAAGSGIPQIKCFLNGVKIPHVVRLKTLVIKVSGVILSVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TLNAAFVLVGSVIVAFIEPVAAGSGIPQIKCFLNGVKIPHVVRLKTLVIKVSGVILSVVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 GLAVGKEGPMIHSGSVIAAGISQGRSTSLKRDFKIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAAGVSAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GLAVGKEGPMIHSGSVIAAGISQGRSTSLKRDFKIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAAGVSAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 FGAPVGGVLFSLEEGASFWNQFLTWRIFFASMISTFTLNFVLSIYHGNMWDLSSPGLINF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FGAPVGGVLFSLEEGASFWNQFLTWRIFFASMISTFTLNFVLSIYHGNMWDLSSPGLINF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 GRFDSEKMAYTIHEIPVFIAMGVVGGVLGAVFNALNYWLTMFRIRYIHRPCLQVIEAVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GRFDSEKMAYTIHEIPVFIAMGVVGGVLGAVFNALNYWLTMFRIRYIHRPCLQVIEAVLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 AAVTATVAFVLIYSSRDCQPLQGGSMSYPLQLFCADGEYNSMAAAFFNTPEKSVVSLFHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AAVTATVAFVLIYSSRDCQPLQGGSMSYPLQLFCADGEYNSMAAAFFNTPEKSVVSLFHD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 PPGSYNPLTLGLFTLVYFFLACWTYGLTVSAGVFIPSLLIGAAWGRLFGISLSYLTGAAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PPGSYNPLTLGLFTLVYFFLACWTYGLTVSAGVFIPSLLIGAAWGRLFGISLSYLTGAAI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 WADPGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMMEATSNVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFIEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WADPGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMMEATSNVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFIEG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LYDMHIQLQSVPFLHWEAPVTSHSLTAREVMSTPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASNHNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LYDMHIQLQSVPFLHWEAPVTSHSLTAREVMSTPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASNHNG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 FPVVEHADDTQPARLQGLILRSQLIVLLKHKVFVERSNLGLVQRRLRLKDFRDAYPRFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FPVVEHADDTQPARLQGLILRSQLIVLLKHKVFVERSNLGLVQRRLRLKDFRDAYPRFPP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 IQSIHVSQDERECTMDLSEFMNPSPYTVPQEASLPRVFKLFRALGLRHLVVVDNRNQVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IQSIHVSQDERECTMDLSEFMNPSPYTVPQEASLPRVFKLFRALGLRHLVVVDNRNQVVG
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KE4 LVTRKDLARYRLGKRGLEELSLAQT
:::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LVTRKDLARYRLGKRGLEELSLAQT
790 800
>>CCDS45378.1 CLCN7 gene_id:1186|Hs108|chr16 (781 aa)
initn: 5122 init1: 4817 opt: 4817 Z-score: 5636.8 bits: 1053.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5078; 97.0% identity (97.0% similar) in 805 aa overlap (1-805:1-781)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MANVSKKVSWSGRDRDDEEAAPLLRRTARPGGGTPLLNGAGPGAARQSPRSALFRVGHMS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MANVSKKVSWSGRDRDDEEAAPLLRRTARPGGGTPLLNGAGPGAARQ-------------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SVELDDELLDPDMDPPHPFPKEIPHNEKLLSLKYESLDYDNSENQLFLEEERRINHTAFR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 -----------DMDPPHPFPKEIPHNEKLLSLKYESLDYDNSENQLFLEEERRINHTAFR
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 TVEIKRWVICALIGILTGLVACFIDIVVENLAGLKYRVIKGNIDKFTEKGGLSFSLLLWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TVEIKRWVICALIGILTGLVACFIDIVVENLAGLKYRVIKGNIDKFTEKGGLSFSLLLWA
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TLNAAFVLVGSVIVAFIEPVAAGSGIPQIKCFLNGVKIPHVVRLKTLVIKVSGVILSVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TLNAAFVLVGSVIVAFIEPVAAGSGIPQIKCFLNGVKIPHVVRLKTLVIKVSGVILSVVG
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 GLAVGKEGPMIHSGSVIAAGISQGRSTSLKRDFKIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAAGVSAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GLAVGKEGPMIHSGSVIAAGISQGRSTSLKRDFKIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAAGVSAA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 FGAPVGGVLFSLEEGASFWNQFLTWRIFFASMISTFTLNFVLSIYHGNMWDLSSPGLINF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FGAPVGGVLFSLEEGASFWNQFLTWRIFFASMISTFTLNFVLSIYHGNMWDLSSPGLINF
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 GRFDSEKMAYTIHEIPVFIAMGVVGGVLGAVFNALNYWLTMFRIRYIHRPCLQVIEAVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GRFDSEKMAYTIHEIPVFIAMGVVGGVLGAVFNALNYWLTMFRIRYIHRPCLQVIEAVLV
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 AAVTATVAFVLIYSSRDCQPLQGGSMSYPLQLFCADGEYNSMAAAFFNTPEKSVVSLFHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AAVTATVAFVLIYSSRDCQPLQGGSMSYPLQLFCADGEYNSMAAAFFNTPEKSVVSLFHD
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 PPGSYNPLTLGLFTLVYFFLACWTYGLTVSAGVFIPSLLIGAAWGRLFGISLSYLTGAAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PPGSYNPLTLGLFTLVYFFLACWTYGLTVSAGVFIPSLLIGAAWGRLFGISLSYLTGAAI
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 WADPGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMMEATSNVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFIEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WADPGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMMEATSNVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFIEG
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LYDMHIQLQSVPFLHWEAPVTSHSLTAREVMSTPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASNHNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LYDMHIQLQSVPFLHWEAPVTSHSLTAREVMSTPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASNHNG
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 FPVVEHADDTQPARLQGLILRSQLIVLLKHKVFVERSNLGLVQRRLRLKDFRDAYPRFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FPVVEHADDTQPARLQGLILRSQLIVLLKHKVFVERSNLGLVQRRLRLKDFRDAYPRFPP
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 IQSIHVSQDERECTMDLSEFMNPSPYTVPQEASLPRVFKLFRALGLRHLVVVDNRNQVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IQSIHVSQDERECTMDLSEFMNPSPYTVPQEASLPRVFKLFRALGLRHLVVVDNRNQVVG
700 710 720 730 740 750
790 800
pF1KE4 LVTRKDLARYRLGKRGLEELSLAQT
:::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LVTRKDLARYRLGKRGLEELSLAQT
760 770 780
>>CCDS138.1 CLCN6 gene_id:1185|Hs108|chr1 (869 aa)
initn: 1690 init1: 693 opt: 1135 Z-score: 1322.9 bits: 255.8 E(32554): 2.3e-67
Smith-Waterman score: 1804; 43.2% identity (71.2% similar) in 732 aa overlap (86-784:40-756)
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 VGHMSSVELDDELLDPDMDPPHPFPKEIPHNEKLLSLKYESLDYDNSENQLFLEEERRIN
.: : ::::::: :. .:: . ..
CCDS13 CCCRWCCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYESLDYDRCINDPYLEVLETMD
10 20 30 40 50 60
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 HTAFRTVEIKRWVICALIGILTGLVACFIDIVVENLAGLKYRVIKGNIDKFTEKGGLSFS
. : : .:.. ::. ::::. :.:. :. .. ::. :.. .... ..:: :..:
CCDS13 NKKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGLFVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEECSQKGCLALS
70 80 90 100 110 120
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LLLWATLNAAFVLVGSVIVAFIEPVAAGSGIPQIKCFLNGVKIPHVVRLKTLVIKVSGVI
:: .: .::...:..: .:::::::::::..::.:::::.: .:::.::. :: ::.
CCDS13 LLELLGFNLTFVFLASLLV-LIEPVAAGSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTLLCKVLGVL
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 LSVVGGLAVGKEGPMIHSGSVIAAGISQGRSTSLKRDFKIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAA
.::.::: : :::::::::::..::. : .: ::.. : ::: : .:::::::::::
CCDS13 FSVAGGLFVEKEGPMIHSGSVVGAGLPQFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRDFVSAGAAA
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 GVSAAFGAPVGGVLFSLEEGASFWNQFLTWRIFFASMISTFTLNFVLS-IYHGNMWDLSS
::.::::::.::.:::::::.::::: :::...: :: .:::::: : : :. ...
CCDS13 GVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQGLTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQFGSWGSFQL
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400
pF1KE4 PGLINFGRF---DSEKMAY--TIHEIPVFIAMGVVGGVLGAVFNALNYWLTMFRIRYIH-
:::.:::.: ::.: . : .. :..:::.::.:::.:: :: :. .:.: .:
CCDS13 PGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLGFFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAKYRMRNVHP
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450
pF1KE4 RPCL-QVIEAVLVAAVTATVAFVLIYSSRDCQPL----QGGSMSYPLQL-----------
.: : .:.:..::. ::..:.:: . .:. . : :. :. ::.
CCDS13 KPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMVLGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTF
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 FCADGEYNSMAAAFFNTPEKSVVSLFHDPPGSYNPLTLGLFTLVYFFLACWTYGLTVSAG
:: . ::.::. ::: :.....:::. :...:.::.:: ..::.:::::::..: .:
CCDS13 FCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFHQD-GTFSPVTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSG
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 VFIPSLLIGAAWGRLFGISL-SYLTGAAIWADPGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMM
.:.:::: :::.::: . : ::. . :.. : .::.:::: :::.::::.:::::..
CCDS13 LFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLGHIYS--GTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILI
490 500 510 520 530 540
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 EATSNVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFIEGLYDMHIQLQSVPFLHWEAPVTSHSLTAREVM
:.:...:::.:::..::.:: .:: : .:.::.:. :..::.:.::. : .: : ..:
CCDS13 ESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLRASDIM
550 560 570 580 590 600
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 STPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASNHNGFPVVEHADDTQPARLQGLILRSQLIVLLKHK
.: . . .. .:..: :. :..:::: . .. ..: : :. : . : .
CCDS13 EPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTV--HHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSS
610 620 630 640 650 660
700 710 720 730 740
pF1KE4 VFVERSNLGLVQRRLRLKDFRDAYP--RFPPIQSIHVSQDERECTMDLSEFM-----NPS
... :.. ..: : .... .:: .. . . :....: :: . : .:
CCDS13 ILT-RAG----EQRKRSQSMK-SYPSSELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPY
670 680 690 700 710
750 760 770 780 790 800
pF1KE4 PYTVPQEASLP--RVFKLFRALGLRHLVVVDNRNQVVGLVTRKDLARYRLGKRGLEELSL
: :... . . :: : .. :.. :.:.: :..:
CCDS13 PNLYPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLIL---RSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSY
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 AQT
CCDS13 AEMAEDYPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRH
780 790 800 810 820 830
>>CCDS57972.1 CLCN6 gene_id:1185|Hs108|chr1 (847 aa)
initn: 1732 init1: 693 opt: 1084 Z-score: 1263.3 bits: 244.7 E(32554): 4.8e-64
Smith-Waterman score: 1753; 43.3% identity (71.6% similar) in 705 aa overlap (113-784:45-734)
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 IPHNEKLLSLKYESLDYDNSENQLFLEEERRINHTAFRTVEIKRWVICALIGILTGLVAC
: .. : : .:.. ::. ::::.
CCDS57 CCCCGERETRTPEELTILGETQEEEDEILPRKDYEKGRRYEAVKWMVVFAIGVCTGLVGL
20 30 40 50 60 70
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 FIDIVVENLAGLKYRVIKGNIDKFTEKGGLSFSLLLWATLNAAFVLVGSVIVAFIEPVAA
:.:. :. .. ::. :.. .... ..:: :..::: .: .::...:..: .::::::
CCDS57 FVDFFVRLFTQLKFGVVQTSVEECSQKGCLALSLLELLGFNLTFVFLASLLV-LIEPVAA
80 90 100 110 120 130
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 GSGIPQIKCFLNGVKIPHVVRLKTLVIKVSGVILSVVGGLAVGKEGPMIHSGSVIAAGIS
:::::..::.:::::.: .:::.::. :: ::..::.::: : :::::::::::..::.
CCDS57 GSGIPEVKCYLNGVKVPGIVRLRTLLCKVLGVLFSVAGGLFVEKEGPMIHSGSVVGAGLP
140 150 160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 QGRSTSLKRDFKIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAAGVSAAFGAPVGGVLFSLEEGASFWNQF
: .: ::.. : ::: : .:::::::::::::.::::::.::.:::::::.:::::
CCDS57 QFQSISLRKIQFNFPYFRSDRDKRDFVSAGAAAGVAAAFGAPIGGTLFSLEEGSSFWNQG
200 210 220 230 240 250
330 340 350 360 370
pF1KE4 LTWRIFFASMISTFTLNFVLS-IYHGNMWDLSSPGLINFGRF---DSEKMAY--TIHEIP
:::...: :: .:::::: : : :. ... :::.:::.: ::.: . : ..
CCDS57 LTWKVLFCSMSATFTLNFFRSGIQFGSWGSFQLPGLLNFGEFKCSDSDKKCHLWTAMDLG
260 270 280 290 300 310
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 VFIAMGVVGGVLGAVFNALNYWLTMFRIRYIH-RPCL-QVIEAVLVAAVTATVAFVLIYS
:..:::.::.:::.:: :: :. .:.: .: .: : .:.:..::. ::..:.:: .
CCDS57 FFVVMGVIGGLLGATFNCLNKRLAKYRMRNVHPKPKLVRVLESLLVSLVTTVVVFVASMV
320 330 340 350 360 370
440 450 460 470
pF1KE4 SRDCQPL----QGGSMSYPLQL-----------FCADGEYNSMAAAFFNTPEKSVVSLFH
.:. . : :. :. ::. :: . ::.::. ::: :.....:::
CCDS57 LGECRQMSSSSQIGNDSFQLQVTEDVNSSIKTFFCPNDTYNDMATLFFNPQESAILQLFH
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 DPPGSYNPLTLGLFTLVYFFLACWTYGLTVSAGVFIPSLLIGAAWGRLFGISL-SYLTGA
. :...:.::.:: ..::.:::::::..: .:.:.:::: :::.::: . : ::. .
CCDS57 QD-GTFSPVTLALFFVLYFLLACWTYGISVPSGLFVPSLLCGAAFGRLVANVLKSYIGLG
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 AIWADPGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMMEATSNVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFI
:.. : .::.:::: :::.::::.:::::..:.:...:::.:::..::.:: .:: :
CCDS57 HIYS--GTFALIGAAAFLGGVVRMTISLTVILIESTNEITYGLPIMVTLMVAKWTGDFFN
500 510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 EGLYDMHIQLQSVPFLHWEAPVTSHSLTAREVMSTPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASNH
.:.::.:. :..::.:.::. : .: : ..: .: . . .. .:..: :. :
CCDS57 KGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLRASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTV--H
560 570 580 590 600
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pF1KE4 NGFPVVEHADDTQPARLQGLILRSQLIVLLKHKVFVERSNLGLVQRRLRLKDFRDAYP--
..:::: . .. ..: : :. : . : ..... .. ::. : .... .::
CCDS57 HAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSSILTRAGE----QRK-RSQSMK-SYPSS
610 620 630 640 650 660
720 730 740 750 760
pF1KE4 RFPPIQSIHVSQDERECTMDLSEFM-----NPSPYTVPQEASLP--RVFKLFRALGLRHL
.. . . :....: :: . : .: : :... . . :: : .. :
CCDS57 ELRNMCDEHIASEEPAEKEDLLQQMLERRYTPYPNLYPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGL
670 680 690 700 710 720
770 780 790 800
pF1KE4 VVVDNRNQVVGLVTRKDLARYRLGKRGLEELSLAQT
.. :.:.: :..:
CCDS57 IL---RSQLVTLLVRGVCYSESQSSASQPRLSYAEMAEDYPRYPDIHDLDLTLLNPRMIV
730 740 750 760 770
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: . .:.: .::.: .:..::.
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pF1KE4 RVIKGNIDKFTEKGGLSF-SLLLWATLNAAFVLVGSVIVAFIEPVAAGSGIPQIKCFLNG
:.... . : : . : :.. .:.: .: . : : ..:::::..: .: :
CCDS16 -VVRAHQWLYREIGDSHLLRYLSWTVYPVALVSFSSGFSQSITPSSGGSGIPEVKTMLAG
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: . . .:.. :: :. ... : : .:: ::..: . ..:: ... :.:.. .
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pF1KE4 KIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAAGVSAAFGAPVGGVLFSLEEGASFWNQFLTWRIFFASMI
. ... ... :.::.::...:.:: .:::::.: .: .. . :: :::.
CCDS16 ------ENKSKQNEMLVAAAAVGVATVFAAPFSGVLFSIEVMSSHFSVWDYWRGFFAATC
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CCDS16 GAFMFRL-LAVFNSEQETITSLYKTSF-RVD---VPFDLPEIFFFVALGGLCGILGSAYL
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. . : :: . . . : .. ::.... : . . .. .:. .:
CCDS16 FCQRIFFGF-IRNNRFSSKLLATSKPVYSALATLVLASITYPPSAGRFLASRLSMKQHL-
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:. ... . :... . :: :.: ::..: .. :.. .
CCDS16 --DSLFDNHSWALMTQNSSPPWPEELDPQHLWWEWYHPRFTIFGTLAFFLVMKFWMLILA
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. . :: :.: .. ::: ::::: .::.. .: : :: ::: :::: ..
CCDS16 TTIPMPAGYFMPIFVYGAAIGRLFGETLSFIFPEGIVAGGITNPIMPGGYALAGAAA-FS
420 430 440 450 460 470
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pF1KE4 GIVRMTLSLTVIMMEATSNVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFIEGLYDMHIQLQSVPFLH--
: : :.: ... .:.:.......:.......:. ... ..:: . ....:.:
CCDS16 GAVTHTISTALLAFEVTGQIVHALPVLMAVLAANAIAQSCQPSFYDGTVIVKKLPYLPRI
480 490 500 510 520 530
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pF1KE4 WEAPVTSHSLTAREVMSTPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASNHNGFPVVEHADDTQPARL
. :: . ... :. .: : . . .: :. :... .:.:: .:. :
CCDS16 LGRNIGSHRVRVEHFMNHSITTLAKDMPLEEVVKVV--TSTDVAKYPLVE---STESQIL
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pF1KE4 QGLILRSQLIVLLKHKVFVERSNLGLVQRRLRLKDFRDAYPRFPPIQSIHVSQDERECTM
:.. :.::. :: . : . : ...: .
CCDS16 VGIVRRAQLVQALKAEP-----------------------PSWAP--------GHQQCLQ
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:. :. : :. :.:: .. .::. :.: : . : .:...:: :. .. .
CCDS16 DILAAGCPTEPVTLKLSPETSLHEAHNLFELLNL-HSLFVTSRGRAVGCVSWVEMKKAIS
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800
pF1KE4 GKRGLEELSLAQT
CCDS16 NLTNPPAPK
680
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..... : :.... . : : . : :.. .:.: .: . : : ..
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... :.:.. . . ... ... :.::.::...:.:: .:::::.: .: ..
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:: :::. ..: . . :....... ..: .: : : . . . :: :.:
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.:: ::. :. :: :.. .. . . : .. : :.:
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::..: .. :.. . . . :: :.: ...::: :::.: .:. .: .
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:: ::: :::: ..: : :.: ... .: :.......:.......:. ...
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..:: : ....:.: . :: . ... :. .: : . . .: :. :...
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. .:.:: .. ::..: :.::: .. .. :
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: : : . :: : : . : :. .:..: .. .::. :.:. : :. .
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CCDS41 RGRAVGCVSWVEMKKAISNLTNPPAPK
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CCDS16 EGFSGDPVTLQELWGPCPHIRRAIQGGLEWLKQKVFRLGE--DWYFLMTLGVLMALVSYA
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pF1KE4 IDIVVENLAGLKYRVIKGNIDKFTEKGGLSF-SLLLWATLNAAFVLVGSVIVAFIEPVAA
..... : :.... . : : . : :.. .:.: .: . : : ..
CCDS16 MNFAI----GC---VVRAHQWLYREIGDSHLLRYLSWTVYPVALVSFSSGFSQSITPSSG
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CCDS16 GSGIPELKTMLAGVILEDYLDIKNFGAKVVGLSCTLATGSTLFLGKVGPFVHLSVMIAAY
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CCDS16 LGRVRTTTIGEP-------ENKSKQNEMLVAAAAVGVATVFAAPFSGVLFSIEVMSSHFS
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CCDS16 VRDYWRGFFAATCGAFIFRL-LAVFNSEQETITSLYKTSF-RVD---VPFDLPEIFFFVA
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pF1KE4 MGVVGGVLG-AVFNALNYWLTMFRI-RY------IHRPCLQVIEAVLVAAVTATVAFVLI
.: . :::. : . .:.... :: .: ... ..:.:..: . .
CCDS16 LGGICGVLSCAYLFCQRTFLSFIKTNRYSSKLLATSKPVYSALATLLLASITYPPGVGHF
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.:: ::. :. :: :.. .. . . : .. : :.:
CCDS16 LASRL-------SMKQHLDSLF--DNHSWALMTQNSSPPWPEELDPQHLWWEWYHPRFTI
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::..: .. :.. . . . :: :.: ...::: :::.: .:. .: .
CCDS16 FGTLAFFLVMKFWMLILATTIPMPAGYFMPIFILGAAIGRLLGEALAVAFPEGIVTGGVT
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pF1KE4 ----PGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMMEATSNVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFIE
:: ::: :::: ..: : :.: ... .: :.......:.......:. ...
CCDS16 NPIMPGGYALAGAAA-FSGAVTHTISTALLAFELTGQIVHALPVLMAVLAANAIAQSCQP
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pF1KE4 GLYDMHIQLQSVPFLH--WEAPVTSHSLTAREVMSTPVTCLRRREKVGVIVDVLSDTASN
..:: : ....:.: . :: . ... :. .: : . . .: :. :...
CCDS16 SFYDGTIIVKKLPYLPRILGRNIGSHHVRVEHFMNHSITTLAKDTPLEEVVKVV--TSTD
520 530 540 550 560 570
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 HNGFPVVEHADDTQPARLQGLILRSQLIVLLKHKVFVERSNLGLVQRRLRLKDFRDAYPR
. .:.:: .:. : :.. :.::. :. .
CCDS16 VTEYPLVE---STESQILVGIVQRAQLVQALQAE--------------------------
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pF1KE4 FPPIQSIHVSQDERECTMDLSEFMNPS-PYTVP--QEASLPRVFKLFRALGLRHLVVVDN
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CCDS16 -PPSR----APGHQQCLQDILARGCPTEPVTLTLFSETTLHQAQNLFKLLNLQSLFVT-S
610 620 630 640 650 660
780 790 800
pF1KE4 RNQVVGLVTRKDLARYRLGKRGLEELSLAQT
:...:: :. .. .
CCDS16 RGRAVGCVSWVEMKKAISNLTNPPAPK
670 680
>>CCDS57973.1 CLCNKA gene_id:1187|Hs108|chr1 (644 aa)
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CCDS57 MEELVGLREGFSGDPVTLQELWGPCPHIRRAIQGGLEWLKQKVFRLGEDWYFLM--TLG
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CCDS57 VLMALVSYAMNFAIGCVVRGSGIPELKTMLAGVILEDYLDIKNFGAKVVGLSCTLATGST
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CCDS57 LFLGKVGPFVHLSVMIAAYLGRVRTTTIGEP-------ENKSKQNEMLVAAAAVGVATVF
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.:: .:::::.: .: .. :: :::. ..: . . :....... ..: .:
CCDS57 AAPFSGVLFSIEVMSSHFSVRDYWRGFFAATCGAFIFRL-LAVFNSEQETITSLYKTSF-
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CCDS57 RVD---VPFDLPEIFFFVALGGICGVLSCAYLFCQRTFLSFIKTNRYSSKLLATSKPVYS
230 240 250 260 270 280
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.. ..:.:..: . . .:: ::. :. :: :.. .. . . :
CCDS57 ALATLLLASITYPPGVGHFLASRL-------SMKQHLDSLF--DNHSWALMTQNSSPPWP
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.:.......:. ... ..:: : ....:.: . :: . ... :. .: :
CCDS57 LPVLMAVLAANAIAQSCQPSFYDGTIIVKKLPYLPRILGRNIGSHHVRVEHFMNHSITTL
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. . .: :. :... . .:.:: .:. : :.. :.::. :. .
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540 550 560 570 580
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CCDS48 VPLMAAAMTSKWVADALGREGIYDAHIRLNGYPFLEAKEEF-AHKTLAMDVMKPRRNDPL
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CCDS48 LTVLTQDSMTVEDVETIISET--TYSGFPVVV-SRESQ--RLVGFVLRRDLIISIEN---
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