FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1418, 409 aa 1>>>pF1KE1418 409 - 409 aa - 409 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1401+/-0.000526; mu= 18.2529+/- 0.032 mean_var=76.8397+/-15.990, 0's: 0 Z-trim(107.6): 85 B-trim: 978 in 1/51 Lambda= 0.146312 statistics sampled from 15621 (15703) to 15621 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.511), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16 Scan time: 7.780 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000315 (OMIM: 180297,185000,268150) ammonium tr ( 409) 2655 570.7 2.3e-162 NP_001307970 (OMIM: 605381) ammonium transporter R ( 479) 1360 297.4 5e-80 NP_057405 (OMIM: 605381) ammonium transporter Rh t ( 479) 1360 297.4 5e-80 XP_011513090 (OMIM: 180297,185000,268150) PREDICTE ( 217) 1340 292.9 5.2e-79 XP_016857347 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium tr ( 414) 1296 283.8 5.3e-76 XP_016857346 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium tr ( 428) 1296 283.8 5.4e-76 NP_065140 (OMIM: 607079) ammonium transporter Rh t ( 458) 1296 283.9 5.7e-76 NP_001243325 (OMIM: 607079) ammonium transporter R ( 428) 1223 268.4 2.4e-71 NP_001243324 (OMIM: 607079) ammonium transporter R ( 389) 1179 259.1 1.4e-68 NP_057208 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) polypep ( 417) 771 173.0 1.2e-42 NP_065231 (OMIM: 111690,111700) blood group Rh(CE) ( 417) 758 170.3 8.1e-42 XP_016857348 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium tr ( 291) 756 169.7 8.3e-42 XP_011508101 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium tr ( 400) 756 169.8 1.1e-41 XP_011540191 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 374) 754 169.4 1.3e-41 XP_011540190 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 377) 754 169.4 1.4e-41 XP_011540193 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 361) 735 165.4 2.1e-40 NP_001269799 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 463) 676 153.0 1.4e-36 NP_001317359 (OMIM: 111690,111700) blood group Rh( ( 372) 652 147.8 4.1e-35 XP_005246014 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 396) 652 147.9 4.3e-35 XP_006710873 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 425) 652 147.9 4.5e-35 NP_001269798 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 396) 651 147.7 4.9e-35 XP_016857504 (OMIM: 111680) PREDICTED: blood group ( 425) 651 147.7 5.2e-35 NP_001269801 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 431) 651 147.7 5.2e-35 NP_001269800 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 493) 651 147.7 5.8e-35 NP_001121163 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 321) 636 144.4 3.8e-34 NP_001269797 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 378) 636 144.5 4.3e-34 NP_619524 (OMIM: 111690,111700) blood group Rh(CE) ( 354) 614 139.8 1e-32 XP_016857503 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 378) 614 139.8 1.1e-32 XP_011508102 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium tr ( 296) 572 130.9 4.1e-30 NP_001269796 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 251) 537 123.4 6.1e-28 NP_619522 (OMIM: 111690,111700) blood group Rh(CE) ( 266) 246 62.0 2e-09 NP_619523 (OMIM: 111690,111700) blood group Rh(CE) ( 267) 170 46.0 0.00013 >>NP_000315 (OMIM: 180297,185000,268150) ammonium transp (409 aa) initn: 2655 init1: 2655 opt: 2655 Z-score: 3035.9 bits: 570.7 E(85289): 2.3e-162 Smith-Waterman score: 2655; 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NP_001 WGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPLVP 430 440 450 460 470 >>NP_057405 (OMIM: 605381) ammonium transporter Rh type (479 aa) initn: 1500 init1: 997 opt: 1360 Z-score: 1557.7 bits: 297.4 E(85289): 5e-80 Smith-Waterman score: 1510; 50.7% identity (80.6% similar) in 434 aa overlap (1-407:7-440) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEY--ETDQTVLEQLNITKPTDM-GIFFELY .:. .:: ..:.. :..:::.::.: :.: . . . .:: . :. : NP_057 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYYRY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 PLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTLQS-QGQKFNI : :::::::.:::::::::::..::::.::.:.:.::.:.::. ..:: .. : . . . NP_057 PSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYIVV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 GIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGA :..:.::::: .:.: ..:::::::.:: :.::::......:: ::... ...:..: :. NP_057 GVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDAGG 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 SMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGRENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIA :::::.:::::::.:. :::: .:....: ..:.: ::::::::::::::.::::::::. NP_057 SMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSAIS 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 EPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMA ::.: :: .::: ::::::::. :.:: ....:::.::::::::::::::::: :.: NP_057 YHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAEMM 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 IHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAVA . :.:..::: . :..:.::. .:::.. ..:.:.::::..::::.::..::..: :..: NP_057 LMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVTAA 310 320 330 340 350 360 360 370 380 pF1KE1 MGA-----------------------SNTSMAMQAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPL .. . :. .: .: ... :..::...::::.::. NP_057 SASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRLPF 370 380 390 400 410 420 390 400 pF1KE1 WGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR ::::::.::..:.:::..:. NP_057 WGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPLVP 430 440 450 460 470 >>XP_011513090 (OMIM: 180297,185000,268150) PREDICTED: a (217 aa) initn: 1340 init1: 1340 opt: 1340 Z-score: 1539.5 bits: 292.9 E(85289): 5.2e-79 Smith-Waterman score: 1340; 99.1% identity (99.5% similar) in 213 aa overlap (1-213:1-213) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYPLFQDVHVM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYPLFQDVHVM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 IFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTLQSQGQKFNIGIKNMINADF ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: XP_011 IFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGILQSQGQKFNIGIKNMINADF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGASMTIHAFGAY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 SAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGASMTIHAFGAY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 FGLAVAGILYRSGLRKGRENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIAEPGDKQCRAI :::::::::::::::::.::::::::::::::: XP_011 FGLAVAGILYRSGLRKGHENEESAYYSDLFAMIDNQD 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 VNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMAIHPFGSMIIG >>XP_016857347 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium transp (414 aa) initn: 1253 init1: 951 opt: 1296 Z-score: 1485.5 bits: 283.8 E(85289): 5.3e-76 Smith-Waterman score: 1297; 50.9% identity (79.5% similar) in 405 aa overlap (2-382:12-414) 10 20 30 40 pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEY--ETDQTVLEQLNITKPTDMGIFF :. .::. . :. : :::..::.: .:: .. .. : .. .: ..: XP_016 MAGSPSRAAGRRLQLPLLCLFLQGATAVLFAVFVRYNHKTDAALWHRSNHSN-ADNEFYF 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 ELYPLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTLQS-QGQK . :: :::::.:.::::::::.::..:::::::...:.::..:::.:.::: :.: .: . XP_016 R-YPSFQDVHAMVFVGFGFLMVFLQRYGFSSVGFTFLLAAFALQWSTLVQGFLHSFHGGH 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 FNIGIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASD ...:...:::::: :..::::::::::::.:::.:.:..::.:.:. ::... ... . : XP_016 IHVGVESMINADFCAGAVLISFGAVLGKTGPTQLLLMALLEVVLFGINEFVLLHLLGVRD 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 IGASMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGRENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNS :.:::::.:::::::... .::: :.:... . :.:.:::::::::.:::.::::::. XP_016 AGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQLEKSKHRQGSVYHSDLFAMIGTIFLWIFWPSFNA 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 AIAEPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCA :.. : : :. .:::.:::: .: .::.:.:: . :.:.:::::::.:::::.::: . XP_016 ALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLGTFALSALVGEDGRLDMVHIQNAALAGGVVVGTSS 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 DMAIHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIV .: . :::.. : .:: ::.:::::.::.. .:....::::::::::.:::.:.: :.. XP_016 EMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKFFTPILESKFKVQDTCGVHNLHGMPGVLGALLGVL 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 pF1KE1 A-------------------VAMGA-SNTSMAM-QAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLP . .: : : ::.:: : .: .. : ::: . ::. XP_016 VAGLATHEAYGDGLESVFPLIAEGQRSATSQAMHQLFGLFVTLMFASVGGGLGGLL 360 370 380 390 400 410 390 400 pF1KE1 LWGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR >>XP_016857346 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium transp (428 aa) initn: 1284 init1: 951 opt: 1296 Z-score: 1485.3 bits: 283.8 E(85289): 5.4e-76 Smith-Waterman score: 1307; 50.1% identity (77.8% similar) in 423 aa overlap (2-400:12-424) 10 20 30 40 pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEY--ETDQTVLEQLNITKPTDMGIFF :. .::. . :. : :::..::.: .:: .. .. : .. .: ..: XP_016 MAGSPSRAAGRRLQLPLLCLFLQGATAVLFAVFVRYNHKTDAALWHRSNHSN-ADNEFYF 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 ELYPLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTLQS-QGQK . :: :::::.:.::::::::.::..:::::::...:.::..:::.:.::: :.: .: . XP_016 R-YPSFQDVHAMVFVGFGFLMVFLQRYGFSSVGFTFLLAAFALQWSTLVQGFLHSFHGGH 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 FNIGIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASD ...:...:::::: :..::::::::::::.:::.:.:..::.:.:. ::... ... . : XP_016 IHVGVESMINADFCAGAVLISFGAVLGKTGPTQLLLMALLEVVLFGINEFVLLHLLGVRD 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 IGASMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGRENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNS :.:::::.:::::::... .::: :.:... . :.:.:::::::::.:::.::::::. XP_016 AGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQLEKSKHRQGSVYHSDLFAMIGTIFLWIFWPSFNA 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 AIAEPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCA :.. : : :. .:::.:::: .: .::.:.:: . :.:.:::::::.:::::.::: . XP_016 ALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLGTFALSALVGEDGRLDMVHIQNAALAGGVVVGTSS 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 DMAIHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIV .: . :::.. : .:: ::.:::::.::.. .:....::::::::::.:::.:.: :.. XP_016 EMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKFFTPILESKFKVQDTCGVHNLHGMPGVLGALLGVL 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 pF1KE1 A-------------------VAMGA-SNTSMAM-QAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLP . .: : : ::.:: : .: .. : ::: . :.:: : XP_016 VAGLATHEAYGDGLESVFPLIAEGQRSATSQAMHQLFGLFVTLMFASVGGGLGGIILAL- 360 370 380 390 400 410 390 400 pF1KE1 LWGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR :.: : : XP_016 -------QGCCDYSGKQD 420 >>NP_065140 (OMIM: 607079) ammonium transporter Rh type (458 aa) initn: 1370 init1: 951 opt: 1296 Z-score: 1484.9 bits: 283.9 E(85289): 5.7e-76 Smith-Waterman score: 1392; 50.8% identity (79.7% similar) in 429 aa overlap (2-406:12-438) 10 20 30 40 pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEY--ETDQTVLEQLNITKPTDMGIFF :. .::. . :. : :::..::.: .:: .. .. : .. .: ..: NP_065 MAGSPSRAAGRRLQLPLLCLFLQGATAVLFAVFVRYNHKTDAALWHRSNHSN-ADNEFYF 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 ELYPLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTLQS-QGQK . :: :::::.:.::::::::.::..:::::::...:.::..:::.:.::: :.: .: . NP_065 R-YPSFQDVHAMVFVGFGFLMVFLQRYGFSSVGFTFLLAAFALQWSTLVQGFLHSFHGGH 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 FNIGIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASD ...:...:::::: :..::::::::::::.:::.:.:..::.:.:. ::... ... . : NP_065 IHVGVESMINADFCAGAVLISFGAVLGKTGPTQLLLMALLEVVLFGINEFVLLHLLGVRD 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 IGASMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGRENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNS :.:::::.:::::::... .::: :.:... . :.:.:::::::::.:::.::::::. NP_065 AGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQLEKSKHRQGSVYHSDLFAMIGTIFLWIFWPSFNA 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 AIAEPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCA :.. : : :. .:::.:::: .: .::.:.:: . :.:.:::::::.:::::.::: . NP_065 ALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLGTFALSALVGEDGRLDMVHIQNAALAGGVVVGTSS 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 DMAIHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIV .: . :::.. : .:: ::.:::::.::.. .:....::::::::::.:::.:.: :.. NP_065 EMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKFFTPILESKFKVQDTCGVHNLHGMPGVLGALLGVL 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 pF1KE1 A-------------------VAMGA-SNTSMAM-QAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLP . .: : : ::.:: : .: .. : ::: . ::.:::: NP_065 VAGLATHEAYGDGLESVFPLIAEGQRSATSQAMHQLFGLFVTLMFASVGGGLGGLLLKLP 360 370 380 390 400 410 390 400 pF1KE1 LWGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR . .: :.. :.:.:.:.:: NP_065 FLDSPPDSQHYEDQVHWQVPGEHEDKAQRPLRVEEADTQA 420 430 440 450 >>NP_001243325 (OMIM: 607079) ammonium transporter Rh ty (428 aa) initn: 1312 init1: 951 opt: 1223 Z-score: 1402.0 bits: 268.4 E(85289): 2.4e-71 Smith-Waterman score: 1319; 53.3% identity (81.2% similar) in 377 aa overlap (52-406:32-408) 30 40 50 60 70 80 pF1KE1 LFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYPLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVG : :::::.:.::::::::.::..::::::: NP_001 NFTFATQKSLTLLPRLECNGAISAHCNLHLPGFQDVHAMVFVGFGFLMVFLQRYGFSSVG 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 140 pF1KE1 INLLVAALGLQWGTIVQGTLQS-QGQKFNIGIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQ ...:.::..:::.:.::: :.: .: ....:...:::::: :..::::::::::::.::: NP_001 FTFLLAAFALQWSTLVQGFLHSFHGGHIHVGVESMINADFCAGAVLISFGAVLGKTGPTQ 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 pF1KE1 MLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGASMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGREN .:.:..::.:.:. ::... ... . : :.:::::.:::::::... .::: :.:... NP_001 LLLMALLEVVLFGINEFVLLHLLGVRDAGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQLEKSKHR 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 pF1KE1 EESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIAEPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSL . :.:.:::::::::.:::.::::::.:.. : : :. .:::.:::: .: .::.:.: NP_001 QGSVYHSDLFAMIGTIFLWIFWPSFNAALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLGTFALSAL 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 VEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMAIHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTT : . :.:.:::::::.:::::.::: ..: . :::.. : .:: ::.:::::.::.. . NP_001 VGEDGRLDMVHIQNAALAGGVVVGTSSEMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKFFTPILES 250 260 270 280 290 300 330 340 350 360 pF1KE1 KLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVA-------------------VAMGA-SNTSMAM :....::::::::::.:::.:.: :... .: : : ::.:: NP_001 KFKVQDTCGVHNLHGMPGVLGALLGVLVAGLATHEAYGDGLESVFPLIAEGQRSATSQAM 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 -QAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPLWGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR : .: .. : ::: . ::.::::. .: :.. :.:.:.:.:: NP_001 HQLFGLFVTLMFASVGGGLGGLLLKLPFLDSPPDSQHYEDQVHWQVPGEHEDKAQRPLRV 370 380 390 400 410 420 NP_001 EEADTQA >>NP_001243324 (OMIM: 607079) ammonium transporter Rh ty (389 aa) initn: 1268 init1: 951 opt: 1179 Z-score: 1352.4 bits: 259.1 E(85289): 1.4e-68 Smith-Waterman score: 1275; 52.8% identity (81.0% similar) in 369 aa overlap (60-406:1-369) 30 40 50 60 70 80 pF1KE1 QTVLEQLNITKPTDMGIFFELYPLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAAL :.::::::::.::..:::::::...:.::. NP_001 MVFVGFGFLMVFLQRYGFSSVGFTFLLAAF 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE1 GLQWGTIVQGTLQS-QGQKFNIGIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILE .:::.:.::: :.: .: ....:...:::::: :..::::::::::::.:::.:.:..:: NP_001 ALQWSTLVQGFLHSFHGGHIHVGVESMINADFCAGAVLISFGAVLGKTGPTQLLLMALLE 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE1 IVFFAHNEYLVSEIFKASDIGASMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGRENEESAYYSD .:.:. ::... ... . : :.:::::.:::::::... .::: :.:... . :.:.:: NP_001 VVLFGINEFVLLHLLGVRDAGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQLEKSKHRQGSVYHSD 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE1 LFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIAEPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLN :::::::.:::.::::::.:.. : : :. .:::.:::: .: .::.:.:: . :.:. NP_001 LFAMIGTIFLWIFWPSFNAALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLGTFALSALVGEDGRLD 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 MVHIQNATLAGGVAVGTCADMAIHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTC :::::::.:::::.::: ..: . :::.. : .:: ::.:::::.::.. .:....::: NP_001 MVHIQNAALAGGVVVGTSSEMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKFFTPILESKFKVQDTC 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 pF1KE1 GVHNLHGLPGVVGGLAGIVA-------------------VAMGA-SNTSMAM-QAAALGS :::::::.:::.:.: :... .: : : ::.:: : .: NP_001 GVHNLHGMPGVLGALLGVLVAGLATHEAYGDGLESVFPLIAEGQRSATSQAMHQLFGLFV 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 pF1KE1 SIGTAVVGGLMTGLILKLPLWGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR .. : ::: . ::.::::. .: :.. :.:.:.:.:: NP_001 TLMFASVGGGLGGLLLKLPFLDSPPDSQHYEDQVHWQVPGEHEDKAQRPLRVEEADTQA 340 350 360 370 380 >>NP_057208 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) polypeptide (417 aa) initn: 813 init1: 511 opt: 771 Z-score: 886.5 bits: 173.0 E(85289): 1.2e-42 Smith-Waterman score: 822; 36.5% identity (70.4% similar) in 416 aa overlap (1-406:9-411) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYP .: .:: :..:: :.:.:: .:..: : .. .: ... ..: NP_057 MSSKYPRSVRRCLPLWALTLEAALILLFYFFTHY--DASLEDQKGLVASYQVG------- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTL-QSQGQKFNIG ::. :: .:.::: . ......:::..::.. :::.::. ...: : : . : : NP_057 --QDLTVMAAIGLGFLTSSFRRHSWSSVAFNLFMLALGVQWAILLDGFLSQFPSGKVVIT 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 IKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGAS . .. : .:: .:::: :::::.. .:...:...:.. ... ....:.::... NP_057 LFSIRLATMSALSVLISVDAVLGKVNLAQLVVMVLVEVTALGNLRMVISNIFNTDYHMNM 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 MTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGREN-EESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIA : :..:.:::::.:: : . : .: :. ...: .: ::.:.:::::::::::::. NP_057 MHIYVFAAYFGLSVAWCLPKP-LPEGTEDKDQTATIPSLSAMLGALFLWMFWPSFNSALL 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 EPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMA . .. :. :::...:. :.::.. :::.. .::.. .....:.::::::::: . NP_057 RSPIERKNAVFNTYYAVAVSVVTAISGSSLAHPQGKISKTYVHSAVLAGGVAVGTSCHLI 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 pF1KE1 IHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRI-HDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAV :. .:..: .::..:: : :.: . : : :.. .:. .: :..: . :: . NP_057 PSPWLAMVLGLVAGLISVGGAKYLPGCCNRVLGIPHSSIMGYNF-SLLGLLGEIIYIVLL 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 AM---GASNTSMAMQA----AALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPLWGQPSDQNCYDDSVY .. ::.: ...:. . :. .: :...::.:::.:.: .: : . . .::.:. NP_057 VLDTVGAGNGMIGFQVLLSIGELSLAIVIALTSGLLTGLLLNLKIWKAPHEAKYFDDQVF 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 WKVPKTR :: : NP_057 WKFPHLAVGF 410 409 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 23:01:17 2016 done: Sun Nov 6 23:01:18 2016 Total Scan time: 7.780 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]