FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1418, 409 aa 1>>>pF1KE1418 409 - 409 aa - 409 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3478+/-0.00121; mu= 16.8705+/- 0.073 mean_var=68.4753+/-14.217, 0's: 0 Z-trim(100.9): 46 B-trim: 22 in 1/48 Lambda= 0.154991 statistics sampled from 6294 (6314) to 6294 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.531), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16 Scan time: 2.610 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4927.1 RHAG gene_id:6005|Hs108|chr6 ( 409) 2655 603.3 1.4e-172 CCDS10351.1 RHCG gene_id:51458|Hs108|chr15 ( 479) 1360 313.7 2.3e-85 CCDS41414.2 RHBG gene_id:57127|Hs108|chr1 ( 458) 1296 299.4 4.5e-81 CCDS262.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 ( 417) 772 182.2 7.8e-46 CCDS30635.1 RHCE gene_id:6006|Hs108|chr1 ( 417) 758 179.1 6.8e-45 CCDS60029.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 ( 463) 684 162.6 7.1e-40 CCDS81283.1 RHCE gene_id:6006|Hs108|chr1 ( 372) 652 155.4 8.5e-38 CCDS60030.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 ( 396) 651 155.1 1e-37 CCDS60027.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 ( 431) 651 155.2 1.1e-37 CCDS60028.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 ( 493) 651 155.2 1.3e-37 CCDS53285.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 ( 321) 636 151.7 9e-37 CCDS60031.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 ( 378) 636 151.8 1e-36 CCDS30637.1 RHCE gene_id:6006|Hs108|chr1 ( 354) 614 146.8 2.9e-35 >>CCDS4927.1 RHAG gene_id:6005|Hs108|chr6 (409 aa) initn: 2655 init1: 2655 opt: 2655 Z-score: 3212.0 bits: 603.3 E(32554): 1.4e-172 Smith-Waterman score: 2655; 99.5% identity (99.8% similar) in 409 aa overlap (1-409:1-409) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYPLFQDVHVM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYPLFQDVHVM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 IFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTLQSQGQKFNIGIKNMINADF ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: CCDS49 IFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGILQSQGQKFNIGIKNMINADF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGASMTIHAFGAY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 SAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGASMTIHAFGAY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 FGLAVAGILYRSGLRKGRENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIAEPGDKQCRAI :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 FGLAVAGILYRSGLRKGHENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIAEPGDKQCRAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 VNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMAIHPFGSMIIG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 VNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMAIHPFGSMIIG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 SIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAVAMGASNTSMAM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 SIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAVAMGASNTSMAM 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 QAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPLWGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 QAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPLWGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR 370 380 390 400 >>CCDS10351.1 RHCG gene_id:51458|Hs108|chr15 (479 aa) initn: 1500 init1: 997 opt: 1360 Z-score: 1646.0 bits: 313.7 E(32554): 2.3e-85 Smith-Waterman score: 1510; 50.7% identity (80.6% similar) in 434 aa overlap (1-407:7-440) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEY--ETDQTVLEQLNITKPTDM-GIFFELY .:. .:: ..:.. :..:::.::.: :.: . . . .:: . :. : CCDS10 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYYRY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 PLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTLQS-QGQKFNI : :::::::.:::::::::::..::::.::.:.:.::.:.::. ..:: .. : . . . CCDS10 PSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYIVV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 GIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGA :..:.::::: .:.: ..:::::::.:: :.::::......:: ::... ...:..: :. CCDS10 GVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDAGG 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 SMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGRENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIA :::::.:::::::.:. :::: .:....: ..:.: ::::::::::::::.::::::::. CCDS10 SMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSAIS 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 EPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMA ::.: :: .::: ::::::::. :.:: ....:::.::::::::::::::::: :.: CCDS10 YHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAEMM 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 IHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAVA . :.:..::: . :..:.::. .:::.. ..:.:.::::..::::.::..::..: :..: CCDS10 LMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVTAA 310 320 330 340 350 360 360 370 380 pF1KE1 MGA-----------------------SNTSMAMQAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPL .. . :. .: .: ... :..::...::::.::. CCDS10 SASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRLPF 370 380 390 400 410 420 390 400 pF1KE1 WGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR ::::::.::..:.:::..:. CCDS10 WGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPLVP 430 440 450 460 470 >>CCDS41414.2 RHBG gene_id:57127|Hs108|chr1 (458 aa) initn: 1370 init1: 951 opt: 1296 Z-score: 1569.0 bits: 299.4 E(32554): 4.5e-81 Smith-Waterman score: 1392; 50.8% identity (79.7% similar) in 429 aa overlap (2-406:12-438) 10 20 30 40 pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEY--ETDQTVLEQLNITKPTDMGIFF :. .::. . :. : :::..::.: .:: .. .. : .. .: ..: CCDS41 MAGSPSRAAGRRLQLPLLCLFLQGATAVLFAVFVRYNHKTDAALWHRSNHSN-ADNEFYF 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 ELYPLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTLQS-QGQK . :: :::::.:.::::::::.::..:::::::...:.::..:::.:.::: :.: .: . CCDS41 R-YPSFQDVHAMVFVGFGFLMVFLQRYGFSSVGFTFLLAAFALQWSTLVQGFLHSFHGGH 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 FNIGIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASD ...:...:::::: :..::::::::::::.:::.:.:..::.:.:. ::... ... . : CCDS41 IHVGVESMINADFCAGAVLISFGAVLGKTGPTQLLLMALLEVVLFGINEFVLLHLLGVRD 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 IGASMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGRENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNS :.:::::.:::::::... .::: :.:... . :.:.:::::::::.:::.::::::. CCDS41 AGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQLEKSKHRQGSVYHSDLFAMIGTIFLWIFWPSFNA 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 AIAEPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCA :.. : : :. .:::.:::: .: .::.:.:: . :.:.:::::::.:::::.::: . CCDS41 ALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLGTFALSALVGEDGRLDMVHIQNAALAGGVVVGTSS 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 DMAIHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIV .: . :::.. : .:: ::.:::::.::.. .:....::::::::::.:::.:.: :.. CCDS41 EMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKFFTPILESKFKVQDTCGVHNLHGMPGVLGALLGVL 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 pF1KE1 A-------------------VAMGA-SNTSMAM-QAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLP . .: : : ::.:: : .: .. : ::: . ::.:::: CCDS41 VAGLATHEAYGDGLESVFPLIAEGQRSATSQAMHQLFGLFVTLMFASVGGGLGGLLLKLP 360 370 380 390 400 410 390 400 pF1KE1 LWGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR . .: :.. :.:.:.:.:: CCDS41 FLDSPPDSQHYEDQVHWQVPGEHEDKAQRPLRVEEADTQA 420 430 440 450 >>CCDS262.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 (417 aa) initn: 866 init1: 511 opt: 772 Z-score: 936.3 bits: 182.2 E(32554): 7.8e-46 Smith-Waterman score: 823; 36.5% identity (70.4% similar) in 416 aa overlap (1-406:9-411) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYP .: .:: :..:: :.:.:: .:..: : .. .: ... ..: CCDS26 MSSKYPRSVRRCLPLWALTLEAALILLFYFFTHY--DASLEDQKGLVASYQVG------- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTL-QSQGQKFNIG ::. :: .:.::: . ......:::..::.. :::.::. ...: : : . : : CCDS26 --QDLTVMAAIGLGFLTSSFRRHSWSSVAFNLFMLALGVQWAILLDGFLSQFPSGKVVIT 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 IKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGAS . .. : .:: .:::: :::::.. .:...:...:.. ... ....:.::... CCDS26 LFSIRLATMSALSVLISVDAVLGKVNLAQLVVMVLVEVTALGNLRMVISNIFNTDYHMNM 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 MTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGREN-EESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIA : :..:.:::::.:: : . : .: :. ...: .: ::.:.:::::::::::::. CCDS26 MHIYVFAAYFGLSVAWCLPKP-LPEGTEDKDQTATIPSLSAMLGALFLWMFWPSFNSALL 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 EPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMA . .. :. :::...:. :.::.. :::.. .::.. .....:.::::::::: . CCDS26 RSPIERKNAVFNTYYAVAVSVVTAISGSSLAHPQGKISKTYVHSAVLAGGVAVGTSCHLI 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 pF1KE1 IHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRI-HDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAV :. .:..: .::..:: : :.: . : : :.. .:. .: :..: . :: . CCDS26 PSPWLAMVLGLVAGLISVGGAKYLPGCCNRVLGIPHSSIMGYNF-SLLGLLGEIIYIVLL 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 AM---GASNTSMAMQA----AALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPLWGQPSDQNCYDDSVY .. ::.: ...:. . :. .: :...::.:::.:.: .: : . . .::.:. CCDS26 VLDTVGAGNGMIGFQVLLSIGELSLAIVIALMSGLLTGLLLNLKIWKAPHEAKYFDDQVF 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 WKVPKTR :: : CCDS26 WKFPHLAVGF 410 >>CCDS30635.1 RHCE gene_id:6006|Hs108|chr1 (417 aa) initn: 812 init1: 517 opt: 758 Z-score: 919.4 bits: 179.1 E(32554): 6.8e-45 Smith-Waterman score: 808; 36.1% identity (68.8% similar) in 416 aa overlap (1-406:9-411) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYP .: .:: :..:: :.:.:: .:..: : .. .: ... ..: CCDS30 MSSKYPRSVRRCLPLCALTLEAALILLFYFFTHY--DASLEDQKGLVASYQVG------- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTL-QSQGQKFNIG ::. :: .:.::: . ......:::..::.. :::.::. ...: : : : : CCDS30 --QDLTVMAALGLGFLTSNFRRHSWSSVAFNLFMLALGVQWAILLDGFLSQFPPGKVVIT 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 IKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGAS . .. : .:: .:::: ::::::.. .:...:...:.. .. ....:.::. .: . CCDS30 LFSIRLATMSAMSVLISAGAVLGKVNLAQLVVMVLVEVTALGTLRMVISNIFN-TDYHMN 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KE1 MT-IHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGRE-NEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAI . ...:.:::::.:: : . : :: : :.. : .: ::.:.::::::::: :::. CCDS30 LRHFYVFAAYFGLTVAWCLPKP-LPKGTEDNDQRATIPSLSAMLGALFLWMFWPSVNSAL 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 AEPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADM . .. :. :::..::. :.::.. :::.. . :..:.....:.::::::::: . CCDS30 LRSPIQRKNAMFNTYYALAVSVVTAISGSSLAHPQRKISMTYVHSAVLAGGVAVGTSCHL 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 AIHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAV :. .:..: .::..:. : : : . : :: .:.. .: :..: .. :: . CCDS30 IPSPWLAMVLGLVAGLISIGGAKCLPVCCNRVLGIHHISVMHSIFSLLGLLGEITYIVLL 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 AM-------GASNTSMAMQAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPLWGQPSDQNCYDDSVY .. : . .. .. . :. .: :...::.:::.:.: .: : . .::.:. CCDS30 VLHTVWNGNGMIGFQVLLSIGELSLAIVIALTSGLLTGLLLNLKIWKAPHVAKYFDDQVF 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 WKVPKTR :: : CCDS30 WKFPHLAVGF 410 >>CCDS60029.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 (463 aa) initn: 752 init1: 511 opt: 684 Z-score: 829.3 bits: 162.6 E(32554): 7.1e-40 Smith-Waterman score: 735; 36.1% identity (70.4% similar) in 388 aa overlap (1-382:9-383) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYP .: .:: :..:: :.:.:: .:..: : .. .: ... ..: CCDS60 MSSKYPRSVRRCLPLWALTLEAALILLFYFFTHY--DASLEDQKGLVASYQVG------- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTL-QSQGQKFNIG ::. :: .:.::: . ......:::..::.. :::.::. ...: : : . : : CCDS60 --QDLTVMAAIGLGFLTSSFRRHSWSSVAFNLFMLALGVQWAILLDGFLSQFPSGKVVIT 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 IKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGAS . .. : .:: .:::: :::::.. .:...:...:.. ... ....:.::... CCDS60 LFSIRLATMSALSVLISVDAVLGKVNLAQLVVMVLVEVTALGNLRMVISNIFNTDYHMNM 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 MTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGREN-EESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIA : :..:.:::::.:: : . : .: :. ...: .: ::.:.:::::::::::::. CCDS60 MHIYVFAAYFGLSVAWCLPKP-LPEGTEDKDQTATIPSLSAMLGALFLWMFWPSFNSALL 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 EPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMA . .. :. :::...:. :.::.. :::.. .::.. .....:.::::::::: . CCDS60 RSPIERKNAVFNTYYAVAVSVVTAISGSSLAHPQGKISKTYVHSAVLAGGVAVGTSCHLI 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 pF1KE1 IHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRI-HDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAV :. .:..: .::..:: : :.: . : : :.. .:. .: :..: . :: . CCDS60 PSPWLAMVLGLVAGLISVGGAKYLPGCCNRVLGIPHSSIMGYNF-SLLGLLGEIIYIVLL 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 AM---GASNTSMAMQAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPLWGQPSDQNCYDDSVYWKVP .. ::.: ...:. . .. :.: .::.::. CCDS60 VLDTVGAGNGMIGFQVLLSIGELSLAIVIALMSGLLTVSSFGCWILSKSIQEKQGLFKNK 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 KTR CCDS60 TTSSHCCLHLYVRNAHDSKVSNVRAGTGVRENGVESFLCHSLRRISPFIMHCRIQQ 410 420 430 440 450 460 >>CCDS81283.1 RHCE gene_id:6006|Hs108|chr1 (372 aa) initn: 701 init1: 511 opt: 652 Z-score: 792.1 bits: 155.4 E(32554): 8.5e-38 Smith-Waterman score: 702; 37.0% identity (70.1% similar) in 354 aa overlap (1-351:9-349) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYP .: .:: :..:: :.:.:: .:..: : .. .: ... ..: CCDS81 MSSKYPRSVRRCLPLCALTLEAALILLFYFFTHY--DASLEDQKGLVASYQVG------- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTL-QSQGQKFNIG ::. :: .:.::: . ......:::..::.. :::.::. ...: : : : : CCDS81 --QDLTVMAALGLGFLTSNFRRHSWSSVAFNLFMLALGVQWAILLDGFLSQFPPGKVVIT 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 IKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGAS . .. : .:: .:::: ::::::.. .:...:...:.. .. ....:.::. .: . 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CCDS81 VLHTVWNGNGMFAPKSQNMESTSCG 350 360 370 >>CCDS60030.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 (396 aa) initn: 691 init1: 500 opt: 651 Z-score: 790.5 bits: 155.1 E(32554): 1e-37 Smith-Waterman score: 702; 36.8% identity (70.6% similar) in 361 aa overlap (1-355:9-356) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYP .: .:: :..:: :.:.:: .:..: : .. .: ... ..: CCDS60 MSSKYPRSVRRCLPLWALTLEAALILLFYFFTHY--DASLEDQKGLVASYQVG------- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTL-QSQGQKFNIG ::. :: .:.::: . ......:::..::.. :::.::. ...: : : . : : CCDS60 --QDLTVMAAIGLGFLTSSFRRHSWSSVAFNLFMLALGVQWAILLDGFLSQFPSGKVVIT 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 IKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGAS . .. : .:: .:::: :::::.. .:...:...:.. ... ....:.::... 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CCDS60 LFSIRLATMSALSVLISVDAVLGKVNLAQLVVMVLVEVTALGNLRMVISNIFNTDYHMNM 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 MTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGREN-EESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIA : :..:.:::::.:: : . : .: :. ...: .: ::.:.:::::::::::::. CCDS60 MHIYVFAAYFGLSVAWCLPKP-LPEGTEDKDQTATIPSLSAMLGALFLWMFWPSFNSALL 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 EPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMA . .. :. :::...:. :.::.. :::.. .::.. .....:.::::::::: . CCDS60 RSPIERKNAVFNTYYAVAVSVVTAISGSSLAHPQGKISKTYVHSAVLAGGVAVGTSCHLI 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 pF1KE1 IHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRI-HDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAV :. .:..: .::..:: : :.: . : : :.. .:. .: :..: . :: . CCDS60 PSPWLAMVLGLVAGLISVGGAKYLPGCCNRVLGIPHSSIMGYNF-SLLGLLGEIIYIVLL 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 AM---GASNTSMAMQAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPLWGQPSDQNCYDDSVYWKVP .. ::.: CCDS60 VLDTVGAGNGMSLGWNLAVKMAEAGDEELMRLDVSQRNHGGAAVPTGSWMPSTETTIAPN 350 360 370 380 390 400 >>CCDS60028.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 (493 aa) initn: 691 init1: 500 opt: 651 Z-score: 789.0 bits: 155.2 E(32554): 1.3e-37 Smith-Waterman score: 702; 36.8% identity (70.6% similar) in 361 aa overlap (1-355:9-356) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYP .: .:: :..:: :.:.:: .:..: : .. .: ... ..: CCDS60 MSSKYPRSVRRCLPLWALTLEAALILLFYFFTHY--DASLEDQKGLVASYQVG------- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTL-QSQGQKFNIG ::. :: .:.::: . ......:::..::.. :::.::. ...: : : . : : CCDS60 --QDLTVMAAIGLGFLTSSFRRHSWSSVAFNLFMLALGVQWAILLDGFLSQFPSGKVVIT 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 IKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGAS . .. : .:: .:::: :::::.. .:...:...:.. ... ....:.::... CCDS60 LFSIRLATMSALSVLISVDAVLGKVNLAQLVVMVLVEVTALGNLRMVISNIFNTDYHMNM 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 MTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGREN-EESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIA : :..:.:::::.:: : . : .: :. ...: .: ::.:.:::::::::::::. CCDS60 MHIYVFAAYFGLSVAWCLPKP-LPEGTEDKDQTATIPSLSAMLGALFLWMFWPSFNSALL 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 EPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMA . .. :. :::...:. :.::.. :::.. .::.. .....:.::::::::: . CCDS60 RSPIERKNAVFNTYYAVAVSVVTAISGSSLAHPQGKISKTYVHSAVLAGGVAVGTSCHLI 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 pF1KE1 IHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRI-HDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAV :. .:..: .::..:: : :.: . : : :.. .:. .: :..: . :: . CCDS60 PSPWLAMVLGLVAGLISVGGAKYLPGCCNRVLGIPHSSIMGYNF-SLLGLLGEIIYIVLL 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 AM---GASNTSMAMQAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPLWGQPSDQNCYDDSVYWKVP .. ::.: CCDS60 VLDTVGAGNGMSLGWNLAVKMAEAGDEELMRLDVSQRNHGGAAVPTGSWMPSTETTIAPN 350 360 370 380 390 400 409 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 23:01:16 2016 done: Sun Nov 6 23:01:17 2016 Total Scan time: 2.610 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]