FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6417, 560 aa 1>>>pF1KE6417 560 - 560 aa - 560 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8327+/-0.000422; mu= 15.6360+/- 0.026 mean_var=70.3681+/-13.816, 0's: 0 Z-trim(111.9): 48 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.152893 statistics sampled from 20611 (20657) to 20611 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.6), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16 Scan time: 7.760 The best scores are: opt bits E(85289) NP_006662 (OMIM: 604471) excitatory amino acid tra ( 560) 3599 803.4 0 NP_001274526 (OMIM: 604471) excitatory amino acid ( 472) 2241 503.8 4.8e-142 NP_001274524 (OMIM: 604471) excitatory amino acid ( 619) 2218 498.8 2.1e-140 XP_016882641 (OMIM: 600637) PREDICTED: excitatory ( 564) 1698 384.1 6.4e-106 NP_005062 (OMIM: 600637) excitatory amino acid tra ( 564) 1698 384.1 6.4e-106 XP_006722905 (OMIM: 600637) PREDICTED: excitatory ( 564) 1698 384.1 6.4e-106 XP_006722907 (OMIM: 600637) PREDICTED: excitatory ( 564) 1698 384.1 6.4e-106 XP_011540304 (OMIM: 604471) PREDICTED: excitatory ( 337) 1383 314.5 3.3e-85 NP_001182657 (OMIM: 600300,617105) excitatory amin ( 565) 1368 311.3 5.3e-84 XP_016873626 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 565) 1368 311.3 5.3e-84 XP_016873627 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 565) 1368 311.3 5.3e-84 NP_001239581 (OMIM: 600300,617105) excitatory amin ( 565) 1368 311.3 5.3e-84 XP_011518587 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 570) 1368 311.3 5.3e-84 XP_005253124 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 571) 1368 311.3 5.3e-84 NP_004162 (OMIM: 600300,617105) excitatory amino a ( 574) 1368 311.3 5.3e-84 XP_016873625 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 579) 1368 311.3 5.4e-84 XP_011512386 (OMIM: 600111,612656) PREDICTED: exci ( 435) 1220 278.6 2.8e-74 NP_001276868 (OMIM: 600111,612656) excitatory amin ( 496) 1220 278.6 3.1e-74 XP_005248399 (OMIM: 600111,612656) PREDICTED: exci ( 542) 1220 278.6 3.4e-74 NP_004163 (OMIM: 600111,612656) excitatory amino a ( 542) 1220 278.6 3.4e-74 XP_011516312 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 477) 1118 256.1 1.8e-67 XP_011516311 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 504) 1118 256.1 1.9e-67 NP_004161 (OMIM: 133550,615232) excitatory amino a ( 524) 1118 256.1 2e-67 XP_011516310 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 527) 1118 256.1 2e-67 XP_011516309 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 547) 1118 256.1 2e-67 NP_001276869 (OMIM: 600111,612656) excitatory amin ( 430) 1053 241.8 3.4e-63 NP_003029 (OMIM: 600229,616657) neutral amino acid ( 532) 942 217.3 9.6e-56 XP_006712142 (OMIM: 600229,616657) PREDICTED: neut ( 312) 930 214.6 3.8e-55 NP_001274525 (OMIM: 604471) excitatory amino acid ( 158) 911 210.3 3.7e-54 NP_001138617 (OMIM: 109190) neutral amino acid tra ( 339) 915 211.3 4e-54 NP_005619 (OMIM: 109190) neutral amino acid transp ( 541) 915 211.4 6.1e-54 NP_001138616 (OMIM: 109190) neutral amino acid tra ( 313) 905 209.1 1.7e-53 NP_001160167 (OMIM: 600111,612656) excitatory amin ( 497) 844 195.7 2.9e-49 XP_016870532 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 488) 839 194.6 6.2e-49 XP_016870531 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 511) 839 194.6 6.4e-49 XP_005259224 (OMIM: 109190) PREDICTED: neutral ami ( 469) 827 191.9 3.7e-48 NP_001259017 (OMIM: 600637) excitatory amino acid ( 312) 691 161.9 2.8e-39 NP_001259016 (OMIM: 600637) excitatory amino acid ( 312) 691 161.9 2.8e-39 XP_016873628 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 496) 627 147.8 7.5e-35 NP_001180422 (OMIM: 600229,616657) neutral amino a ( 234) 593 140.2 6.9e-33 >>NP_006662 (OMIM: 604471) excitatory amino acid transpo (560 aa) initn: 3599 init1: 3599 opt: 3599 Z-score: 4288.8 bits: 803.4 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 3599; 99.8% identity (100.0% similar) in 560 aa overlap (1-560:1-560) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 LKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGSAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 LKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGSAA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 QKETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 QKETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLLENNH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLLENNH 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 IDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 IDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE6 GIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 GIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKD 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE6 FARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVERDEE ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: NP_006 FARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVEQDEE 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KE6 LPAASLNHCTIQISELETNV :::::::::::::::::::: NP_006 LPAASLNHCTIQISELETNV 550 560 >>NP_001274526 (OMIM: 604471) excitatory amino acid tran (472 aa) initn: 2714 init1: 2233 opt: 2241 Z-score: 2671.1 bits: 503.8 E(85289): 4.8e-142 Smith-Waterman score: 2543; 84.8% identity (85.0% similar) in 492 aa overlap (1-492:1-420) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 LKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGSAA ::::::::::: NP_001 LKMMILPLVVS------------------------------------------------- 70 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 QKETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 -----------------------RNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR 80 90 100 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG 110 120 130 140 150 160 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV 170 180 190 200 210 220 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLLENNH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLLENNH 230 240 250 260 270 280 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 IDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 IDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAA 290 300 310 320 330 340 430 440 450 460 470 480 pF1KE6 GIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 GIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKD 350 360 370 380 390 400 490 500 510 520 530 540 pF1KE6 FARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVERDEE :::::::: .: NP_001 FARDTGTETCFPSPETAALRDQASEPPGDRGSPAEWLCEECSRGLRAHPGPHLPPPRPRS 410 420 430 440 450 460 >>NP_001274524 (OMIM: 604471) excitatory amino acid tran (619 aa) initn: 2218 init1: 2218 opt: 2218 Z-score: 2641.8 bits: 498.8 E(85289): 2.1e-140 Smith-Waterman score: 3306; 90.0% identity (90.0% similar) in 592 aa overlap (1-533:1-592) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 LKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGSAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGSAA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 QKETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 QKETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSS----------------- ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSRKNQVRALQCPRSLPPA 310 320 330 340 350 360 350 360 pF1KE6 ------------------------------------------SSATLPITFKCLLENNHI :::::::::::::::::: NP_001 GAALQRHKHSWRGGCLGRGELPDRGPSHPGGGCWADTGPSNRSSATLPITFKCLLENNHI 370 380 390 400 410 420 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 DRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 DRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAAG 430 440 450 460 470 480 430 440 450 460 470 480 pF1KE6 IPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 IPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDF 490 500 510 520 530 540 490 500 510 520 530 540 pF1KE6 ARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVERDEEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 ARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVEQDEEL 550 560 570 580 590 600 550 560 pF1KE6 PAASLNHCTIQISELETNV NP_001 PAASLNHCTIQISELETNV 610 >>XP_016882641 (OMIM: 600637) PREDICTED: excitatory amin (564 aa) initn: 1680 init1: 1160 opt: 1698 Z-score: 2022.6 bits: 384.1 E(85289): 6.4e-106 Smith-Waterman score: 1698; 54.4% identity (80.6% similar) in 504 aa overlap (15-510:54-552) 10 20 30 40 pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSP :::....:.: .:..: :.: :: .:. XP_016 QRLQESLQQRALRTRLRLQTMTLEHVLRFLRRNAFILLTVSAVVIGVSLAFALRPYQLTY 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV ..:.::.::::::::::.:..:::.::::..:.:::: :...:.:. ...::. ::..:: XP_016 RQIKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIVSSLVTGMASLDNKATGRMGMRAAVYYMVTTIIAV 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTK- ..::.::.:::::... :: .. :. . .:::..:::::::: ::::: :::..:. XP_016 FIGILMVTIIHPGKGS-KEGLHREGRIETIPTADAFMDLIRNMFPPNLVEACFKQFKTQY 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 pF1KE6 TTPVVKSPKVAPEE-APPRRILIYGVQEENG-SHVQNFALDLTPPPEVVYKSE----PGT .: :: : :. . : . . ::: : ..: . : :.. : ::. XP_016 STRVVTRTMVRTENGSEPGASMPPPFSVENGTSFLENVTRALGTLQEMLSFEETVPVPGS 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 pF1KE6 SDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLI ..:.:.::.: ::...:...: : .: : .: . :::..:..:.. .:: : ::.::: XP_016 ANGINALGLVVFSVAFGLVIGGMKHKGRVLRDFFDSLNEAIMRLVGIIIWYAPVGILFLI 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 AGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALL :::::::.: ..: .::.:..::. :: ::. ..:::.::..:..::. :: :.::::. XP_016 AGKILEMEDMAVLGGQLGMYTLTVIVGLFLHAGIVLPLIYFLVTHRNPFPFIGGMLQALI 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 IALATSSSSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVN :..::::::::::::.:: :. .::::.:::::::::.::::::::::.::::::::: XP_016 TAMGTSSSSATLPITFRCLEEGLGVDRRITRFVLPVGATVNMDGTALYEALAAIFIAQVN 390 400 410 420 430 440 400 410 420 430 440 450 pF1KE6 NYELDFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDR ::::..::: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: ::: XP_016 NYELNLGQITTISITATAASVGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTEDITLIIAVDWFLDR 450 460 470 480 490 500 460 470 480 490 500 510 pF1KE6 FRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVA .::: :::::...:... :. .... . . : :: :: . . ::..: XP_016 LRTMTNVLGDSIGAAVIEHLSQRELELQEA-ELTLPSLGKPY---KSLMAQEKGASRGRG 510 520 530 540 550 520 530 540 550 560 pF1KE6 EASELTLGPTCPHHVPVQVERDEELPAASLNHCTIQISELETNV XP_016 GNESAM 560 >>NP_005062 (OMIM: 600637) excitatory amino acid transpo (564 aa) initn: 1680 init1: 1160 opt: 1698 Z-score: 2022.6 bits: 384.1 E(85289): 6.4e-106 Smith-Waterman score: 1698; 54.4% identity (80.6% similar) in 504 aa overlap (15-510:54-552) 10 20 30 40 pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSP :::....:.: .:..: :.: :: .:. NP_005 QRLQESLQQRALRTRLRLQTMTLEHVLRFLRRNAFILLTVSAVVIGVSLAFALRPYQLTY 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV ..:.::.::::::::::.:..:::.::::..:.:::: :...:.:. ...::. ::..:: NP_005 RQIKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIVSSLVTGMASLDNKATGRMGMRAAVYYMVTTIIAV 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTK- ..::.::.:::::... :: .. :. . .:::..:::::::: ::::: :::..:. NP_005 FIGILMVTIIHPGKGS-KEGLHREGRIETIPTADAFMDLIRNMFPPNLVEACFKQFKTQY 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 pF1KE6 TTPVVKSPKVAPEE-APPRRILIYGVQEENG-SHVQNFALDLTPPPEVVYKSE----PGT .: :: : :. . : . . ::: : ..: . : :.. : ::. NP_005 STRVVTRTMVRTENGSEPGASMPPPFSVENGTSFLENVTRALGTLQEMLSFEETVPVPGS 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 pF1KE6 SDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLI ..:.:.::.: ::...:...: : .: : .: . :::..:..:.. .:: : ::.::: NP_005 ANGINALGLVVFSVAFGLVIGGMKHKGRVLRDFFDSLNEAIMRLVGIIIWYAPVGILFLI 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 AGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALL :::::::.: ..: .::.:..::. :: ::. ..:::.::..:..::. :: :.::::. NP_005 AGKILEMEDMAVLGGQLGMYTLTVIVGLFLHAGIVLPLIYFLVTHRNPFPFIGGMLQALI 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 IALATSSSSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVN :..::::::::::::.:: :. .::::.:::::::::.::::::::::.::::::::: NP_005 TAMGTSSSSATLPITFRCLEEGLGVDRRITRFVLPVGATVNMDGTALYEALAAIFIAQVN 390 400 410 420 430 440 400 410 420 430 440 450 pF1KE6 NYELDFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDR ::::..::: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: ::: NP_005 NYELNLGQITTISITATAASVGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTEDITLIIAVDWFLDR 450 460 470 480 490 500 460 470 480 490 500 510 pF1KE6 FRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVA .::: :::::...:... :. .... . . : :: :: . . ::..: NP_005 LRTMTNVLGDSIGAAVIEHLSQRELELQEA-ELTLPSLGKPY---KSLMAQEKGASRGRG 510 520 530 540 550 520 530 540 550 560 pF1KE6 EASELTLGPTCPHHVPVQVERDEELPAASLNHCTIQISELETNV NP_005 GNESAM 560 >>XP_006722905 (OMIM: 600637) PREDICTED: excitatory amin (564 aa) initn: 1680 init1: 1160 opt: 1698 Z-score: 2022.6 bits: 384.1 E(85289): 6.4e-106 Smith-Waterman score: 1698; 54.4% identity (80.6% similar) in 504 aa overlap (15-510:54-552) 10 20 30 40 pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSP :::....:.: .:..: :.: :: .:. XP_006 QRLQESLQQRALRTRLRLQTMTLEHVLRFLRRNAFILLTVSAVVIGVSLAFALRPYQLTY 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV ..:.::.::::::::::.:..:::.::::..:.:::: :...:.:. ...::. ::..:: XP_006 RQIKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIVSSLVTGMASLDNKATGRMGMRAAVYYMVTTIIAV 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTK- ..::.::.:::::... :: .. :. . .:::..:::::::: ::::: :::..:. XP_006 FIGILMVTIIHPGKGS-KEGLHREGRIETIPTADAFMDLIRNMFPPNLVEACFKQFKTQY 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 pF1KE6 TTPVVKSPKVAPEE-APPRRILIYGVQEENG-SHVQNFALDLTPPPEVVYKSE----PGT .: :: : :. . : . . ::: : ..: . : :.. : ::. XP_006 STRVVTRTMVRTENGSEPGASMPPPFSVENGTSFLENVTRALGTLQEMLSFEETVPVPGS 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 pF1KE6 SDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLI ..:.:.::.: ::...:...: : .: : .: . :::..:..:.. .:: : ::.::: XP_006 ANGINALGLVVFSVAFGLVIGGMKHKGRVLRDFFDSLNEAIMRLVGIIIWYAPVGILFLI 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 AGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALL :::::::.: ..: .::.:..::. :: ::. ..:::.::..:..::. :: :.::::. XP_006 AGKILEMEDMAVLGGQLGMYTLTVIVGLFLHAGIVLPLIYFLVTHRNPFPFIGGMLQALI 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 IALATSSSSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVN :..::::::::::::.:: :. .::::.:::::::::.::::::::::.::::::::: XP_006 TAMGTSSSSATLPITFRCLEEGLGVDRRITRFVLPVGATVNMDGTALYEALAAIFIAQVN 390 400 410 420 430 440 400 410 420 430 440 450 pF1KE6 NYELDFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDR ::::..::: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: ::: XP_006 NYELNLGQITTISITATAASVGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTEDITLIIAVDWFLDR 450 460 470 480 490 500 460 470 480 490 500 510 pF1KE6 FRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVA .::: :::::...:... :. .... . . : :: :: . . ::..: XP_006 LRTMTNVLGDSIGAAVIEHLSQRELELQEA-ELTLPSLGKPY---KSLMAQEKGASRGRG 510 520 530 540 550 520 530 540 550 560 pF1KE6 EASELTLGPTCPHHVPVQVERDEELPAASLNHCTIQISELETNV XP_006 GNESAM 560 >>XP_006722907 (OMIM: 600637) PREDICTED: excitatory amin (564 aa) initn: 1680 init1: 1160 opt: 1698 Z-score: 2022.6 bits: 384.1 E(85289): 6.4e-106 Smith-Waterman score: 1698; 54.4% identity (80.6% similar) in 504 aa overlap (15-510:54-552) 10 20 30 40 pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSP :::....:.: .:..: :.: :: .:. XP_006 QRLQESLQQRALRTRLRLQTMTLEHVLRFLRRNAFILLTVSAVVIGVSLAFALRPYQLTY 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV ..:.::.::::::::::.:..:::.::::..:.:::: :...:.:. ...::. ::..:: XP_006 RQIKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIVSSLVTGMASLDNKATGRMGMRAAVYYMVTTIIAV 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTK- ..::.::.:::::... :: .. :. . .:::..:::::::: ::::: :::..:. XP_006 FIGILMVTIIHPGKGS-KEGLHREGRIETIPTADAFMDLIRNMFPPNLVEACFKQFKTQY 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 pF1KE6 TTPVVKSPKVAPEE-APPRRILIYGVQEENG-SHVQNFALDLTPPPEVVYKSE----PGT .: :: : :. . : . . ::: : ..: . : :.. : ::. XP_006 STRVVTRTMVRTENGSEPGASMPPPFSVENGTSFLENVTRALGTLQEMLSFEETVPVPGS 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 pF1KE6 SDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLI ..:.:.::.: ::...:...: : .: : .: . :::..:..:.. .:: : ::.::: XP_006 ANGINALGLVVFSVAFGLVIGGMKHKGRVLRDFFDSLNEAIMRLVGIIIWYAPVGILFLI 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 AGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALL :::::::.: ..: .::.:..::. :: ::. ..:::.::..:..::. :: :.::::. XP_006 AGKILEMEDMAVLGGQLGMYTLTVIVGLFLHAGIVLPLIYFLVTHRNPFPFIGGMLQALI 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 IALATSSSSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVN :..::::::::::::.:: :. .::::.:::::::::.::::::::::.::::::::: XP_006 TAMGTSSSSATLPITFRCLEEGLGVDRRITRFVLPVGATVNMDGTALYEALAAIFIAQVN 390 400 410 420 430 440 400 410 420 430 440 450 pF1KE6 NYELDFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDR ::::..::: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: ::: XP_006 NYELNLGQITTISITATAASVGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTEDITLIIAVDWFLDR 450 460 470 480 490 500 460 470 480 490 500 510 pF1KE6 FRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVA .::: :::::...:... :. .... . . : :: :: . . ::..: XP_006 LRTMTNVLGDSIGAAVIEHLSQRELELQEA-ELTLPSLGKPY---KSLMAQEKGASRGRG 510 520 530 540 550 520 530 540 550 560 pF1KE6 EASELTLGPTCPHHVPVQVERDEELPAASLNHCTIQISELETNV XP_006 GNESAM 560 >>XP_011540304 (OMIM: 604471) PREDICTED: excitatory amin (337 aa) initn: 1383 init1: 1383 opt: 1383 Z-score: 1650.6 bits: 314.5 E(85289): 3.3e-85 Smith-Waterman score: 1642; 82.2% identity (82.5% similar) in 337 aa overlap (283-560:1-337) 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 LNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFIL :::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MDDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFIL 10 20 30 320 330 340 pF1KE6 PLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSS----------------------------- ::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 PLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSRKNQVRALQCPRSLPPAGAALQRHKHSWR 40 50 60 70 80 90 350 360 370 pF1KE6 ------------------------------SSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVG :::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 GGCLGRGELPDRGPSHPGGGCWADTGPSNRSSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVG 100 110 120 130 140 150 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 ATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 ATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIV 160 170 180 190 200 210 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 LTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 LTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPC 220 230 240 250 260 270 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 ETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVERDEELPAASLNHCTIQI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: XP_011 ETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVEQDEELPAASLNHCTIQI 280 290 300 310 320 330 560 pF1KE6 SELETNV ::::::: XP_011 SELETNV >>NP_001182657 (OMIM: 600300,617105) excitatory amino ac (565 aa) initn: 1450 init1: 1051 opt: 1368 Z-score: 1629.1 bits: 311.3 E(85289): 5.3e-84 Smith-Waterman score: 1480; 50.2% identity (78.4% similar) in 468 aa overlap (16-481:34-492) 10 20 30 40 pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRR-LSP .: :: :.:..::.: . : .:: . : NP_001 QVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPIHP 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV . . . :::..:::::::.::::..:::..::..::::.:.:::. ...::. ::..:. NP_001 DVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTIIAA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKT ..:...: ::::. :. . : .:: ::.::::::.:: :::.: :.: .: : NP_001 VLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQTVT 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 TPVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVL :. .: :.: . .. .:. ..: . ..: :. .:::::: NP_001 KKVLVAP--PPDEEANATSAVVSLLNETVTEVPE-------ETKMVIKKGLEFKDGMNVL 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 GIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEM :.. : ..:: .:.:::.. .:.: . ::: :::.: . .:: :.::. :: :::. . NP_001 GLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAI 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 DDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSS : ..:...::.: :::. ::..:: ..:::.:: .:.:::. :. ::.:: . ::.:.: NP_001 KDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTAS 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 SSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFG :..:::.::.:: :: ::.:..::::::::::::::::::::::::::::.:. :: : NP_001 SAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGG 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 QIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINV ::.:.:.::: ::.:::.::.::::::...::.:::::.::.:..:::: :::.:: .:: NP_001 QIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNV 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 LGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTL .::...:::. :. .... NP_001 VGDSFGAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHN 480 490 500 510 520 530 >>XP_016873626 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: excitato (565 aa) initn: 1450 init1: 1051 opt: 1368 Z-score: 1629.1 bits: 311.3 E(85289): 5.3e-84 Smith-Waterman score: 1480; 50.2% identity (78.4% similar) in 468 aa overlap (16-481:34-492) 10 20 30 40 pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRR-LSP .: :: :.:..::.: . : .:: . : XP_016 QVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPIHP 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV . . . :::..:::::::.::::..:::..::..::::.:.:::. ...::. ::..:. XP_016 DVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTIIAA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKT ..:...: ::::. :. . : .:: ::.::::::.:: :::.: :.: .: : XP_016 VLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQTVT 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 TPVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVL :. .: :.: . .. .:. ..: . ..: :. .:::::: XP_016 KKVLVAP--PPDEEANATSAVVSLLNETVTEVPE-------ETKMVIKKGLEFKDGMNVL 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 GIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEM :.. : ..:: .:.:::.. .:.: . ::: :::.: . .:: :.::. :: :::. . XP_016 GLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAI 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 DDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSS : ..:...::.: :::. ::..:: ..:::.:: .:.:::. :. ::.:: . ::.:.: XP_016 KDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTAS 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 SSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFG :..:::.::.:: :: ::.:..::::::::::::::::::::::::::::.:. :: : XP_016 SAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGG 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 QIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINV ::.:.:.::: ::.:::.::.::::::...::.:::::.::.:..:::: :::.:: .:: XP_016 QIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNV 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 LGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTL .::...:::. :. .... XP_016 VGDSFGAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHN 480 490 500 510 520 530 560 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 13:05:18 2016 done: Tue Nov 8 13:05:19 2016 Total Scan time: 7.760 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]