FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6417, 560 aa 1>>>pF1KE6417 560 - 560 aa - 560 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6472+/-0.000954; mu= 16.7788+/- 0.057 mean_var=66.9566+/-13.237, 0's: 0 Z-trim(105.2): 32 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.156739 statistics sampled from 8256 (8279) to 8256 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.254), width: 16 Scan time: 2.330 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS574.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 560) 3599 823.0 0 CCDS72796.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 472) 2241 515.9 4.3e-146 CCDS72797.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 619) 2218 510.8 2e-144 CCDS12321.1 SLC1A6 gene_id:6511|Hs108|chr19 ( 564) 1698 393.2 4.6e-109 CCDS55756.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 ( 565) 1368 318.5 1.3e-86 CCDS31459.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 ( 574) 1368 318.5 1.4e-86 CCDS78004.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 496) 1220 285.0 1.4e-76 CCDS3919.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 542) 1220 285.1 1.5e-76 CCDS6452.1 SLC1A1 gene_id:6505|Hs108|chr9 ( 524) 1118 262.0 1.3e-69 CCDS78003.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 430) 1053 247.3 2.9e-65 CCDS1879.1 SLC1A4 gene_id:6509|Hs108|chr2 ( 532) 942 222.2 1.3e-57 CCDS72798.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 158) 911 215.0 5.5e-56 CCDS46125.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 339) 915 216.0 5.8e-56 CCDS12692.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 541) 915 216.1 8.8e-56 CCDS46126.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 313) 905 213.7 2.6e-55 CCDS54844.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 497) 844 200.0 5.5e-51 CCDS62578.1 SLC1A6 gene_id:6511|Hs108|chr19 ( 312) 691 165.3 9.6e-41 CCDS54362.1 SLC1A4 gene_id:6509|Hs108|chr2 ( 234) 593 143.1 3.5e-34 >>CCDS574.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 (560 aa) initn: 3599 init1: 3599 opt: 3599 Z-score: 4394.8 bits: 823.0 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3599; 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CCDS12 QRLQESLQQRALRTRLRLQTMTLEHVLRFLRRNAFILLTVSAVVIGVSLAFALRPYQLTY 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV ..:.::.::::::::::.:..:::.::::..:.:::: :...:.:. ...::. ::..:: CCDS12 RQIKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIVSSLVTGMASLDNKATGRMGMRAAVYYMVTTIIAV 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTK- ..::.::.:::::... :: .. :. . .:::..:::::::: ::::: :::..:. CCDS12 FIGILMVTIIHPGKGS-KEGLHREGRIETIPTADAFMDLIRNMFPPNLVEACFKQFKTQY 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 pF1KE6 TTPVVKSPKVAPEE-APPRRILIYGVQEENG-SHVQNFALDLTPPPEVVYKSE----PGT .: :: : :. . : . . ::: : ..: . : :.. : ::. 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CCDS55 DVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTIIAA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKT ..:...: ::::. :. . : .:: ::.::::::.:: :::.: :.: .: : CCDS55 VLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQTVT 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 TPVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVL :. .: :.: . .. .:. ..: . ..: :. .:::::: CCDS55 KKVLVAP--PPDEEANATSAVVSLLNETVTEVPE-------ETKMVIKKGLEFKDGMNVL 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 GIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEM :.. : ..:: .:.:::.. .:.: . ::: :::.: . .:: :.::. :: :::. . CCDS55 GLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAI 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 DDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSS : ..:...::.: :::. ::..:: ..:::.:: .:.:::. :. ::.:: . ::.:.: CCDS55 KDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTAS 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 SSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFG :..:::.::.:: :: ::.:..::::::::::::::::::::::::::::.:. :: : CCDS55 SAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGG 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 QIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINV ::.:.:.::: ::.:::.::.::::::...::.:::::.::.:..:::: :::.:: .:: CCDS55 QIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNV 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 LGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTL .::...:::. :. .... CCDS55 VGDSFGAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHN 480 490 500 510 520 530 >>CCDS31459.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 (574 aa) initn: 1450 init1: 1051 opt: 1368 Z-score: 1668.1 bits: 318.5 E(32554): 1.4e-86 Smith-Waterman score: 1480; 50.2% identity (78.4% similar) in 468 aa overlap (16-481:43-501) 10 20 30 40 pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRR-LSP .: :: :.:..::.: . : .:: . : CCDS31 QVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPIHP 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV . . . :::..:::::::.::::..:::..::..::::.:.:::. ...::. ::..:. CCDS31 DVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTIIAA 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKT ..:...: ::::. :. . : .:: ::.::::::.:: :::.: :.: .: : CCDS31 VLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQTVT 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 TPVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVL :. .: :.: . .. .:. ..: . ..: :. .:::::: CCDS31 KKVLVAP--PPDEEANATSAVVSLLNETVTEVPE-------ETKMVIKKGLEFKDGMNVL 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 GIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEM :.. : ..:: .:.:::.. .:.: . ::: :::.: . .:: :.::. :: :::. . CCDS31 GLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAI 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 DDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSS : ..:...::.: :::. ::..:: ..:::.:: .:.:::. :. ::.:: . ::.:.: CCDS31 KDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTAS 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 SSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFG :..:::.::.:: :: ::.:..::::::::::::::::::::::::::::.:. :: : CCDS31 SAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGG 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 QIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINV ::.:.:.::: ::.:::.::.::::::...::.:::::.::.:..:::: :::.:: .:: CCDS31 QIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNV 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 LGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTL .::...:::. :. .... CCDS31 VGDSFGAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHN 490 500 510 520 530 540 >>CCDS78004.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 (496 aa) initn: 1536 init1: 1215 opt: 1220 Z-score: 1488.3 bits: 285.0 E(32554): 1.4e-76 Smith-Waterman score: 1508; 55.0% identity (79.9% similar) in 467 aa overlap (60-521:45-496) 30 40 50 60 70 80 pF1KE6 GCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLG ... .. :.:.... :.:.::.:.:...: CCDS78 MERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGMAALDSKASGKMG 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 VLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGKPI-MSSADALLDLIRNMFP . .:.::. ::..::..::..: :::::... ::. .. :: . ...:::.::::::::: CCDS78 MRAVVYYMTTTIIAVVIGIIIVIIIHPGKGT-KENMHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFP 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 ANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEV ::::: :::..:. .: :: : .: . :. :. .: :.... .: :. CCDS78 PNLVEACFKQFKTNYEK--RSFKV-PIQA--NETLV-GAVINNVSEAMETLTRITE--EL 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 VYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYF : ::. .:.:.::.: :: .:...: : ..: : : . :::..:..::: .:: CCDS78 V--PVPGSVNGVNALGLVVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYA 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 PFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFI : ::.:::::::.::.: ..: .:..:.:::. ::..:....::::::..:.::: ::: CCDS78 PVGILFLIAGKIVEMEDMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFI 250 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 RGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVA :.::::. ::.::::::::::::::: ::: .:.:..::::::::::::::::::::.: CCDS78 GGLLQALITALGTSSSSATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALA 310 320 330 340 350 360 390 400 410 420 430 440 pF1KE6 AIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLII :::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS78 AIFIAQVNNFELNFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLII 370 380 390 400 410 420 450 460 470 480 490 500 pF1KE6 AVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDFA-RDT--GTEKLLPCETK-PVSLQEIV :::: :::.:: :::::.:.:::. :. :... ::. :. . : : : .: CCDS78 AVDWFLDRLRTTTNVLGDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQL---- 430 440 450 460 470 510 520 530 540 550 560 pF1KE6 AAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVERDEELPAASLNHCTIQISELETNV ::.: : . ... CCDS78 IAQDNETEKPIDSETKM 480 490 >>CCDS3919.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 (542 aa) initn: 1774 init1: 1215 opt: 1220 Z-score: 1487.7 bits: 285.1 E(32554): 1.5e-76 Smith-Waterman score: 1745; 56.6% identity (80.8% similar) in 511 aa overlap (16-521:47-542) 10 20 30 40 pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQ ::....:.: .:::: .::: :: :.: . CCDS39 RFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGTILGFTLRPYRMSYR 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 EISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVI :..::.::::::::::.:..:::..:::..:.:.::.:.:...:. .:.::. ::..::. CCDS39 EVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTIIAVV 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 VGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGKPI-MSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTT .::..: :::::... ::. .. :: . ...:::.::::::::: ::::: :::..:. CCDS39 IGIIIVIIIHPGKGT-KENMHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPPNLVEACFKQFKTNYE 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 PVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLG .: :: : .: . :. .: :.... .: :.: ::. .:.:.:: CCDS39 K--RSFKV-PIQANET---LVGAVINNVSEAMETLTRITE--ELV--PVPGSVNGVNALG 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 IVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMD .: :: .:...: : ..: : : . :::..:..::: .:: : ::.:::::::.::. CCDS39 LVVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGKIVEME 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 DPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSS : ..: .:..:.:::. ::..:....::::::..:.::: ::: :.::::. ::.:::: CCDS39 DMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSS 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 SATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQ ::::::::::: ::: .:.:..::::::::::::::::::::.::::::::::.::.::: CCDS39 SATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQ 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 IITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:: ::: CCDS39 IITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRTTTNVL 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 GDALAAGIMAHICRKDFA-RDT--GTEKLLPCETK-PVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASE ::.:.:::. :. :... ::. :. . : : : .: ::.: : . .. CCDS39 GDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQL----IAQDNETEKPIDSETK 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 pF1KE6 LTLGPTCPHHVPVQVERDEELPAASLNHCTIQISELETNV . CCDS39 M >>CCDS6452.1 SLC1A1 gene_id:6505|Hs108|chr9 (524 aa) initn: 1508 init1: 871 opt: 1118 Z-score: 1363.3 bits: 262.0 E(32554): 1.3e-69 Smith-Waterman score: 1544; 52.5% identity (80.3% similar) in 478 aa overlap (15-488:16-478) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRR-LSPQEISYFQFPGELLM . : .:. .: .:..: : ..: . :: : :: ::::.:: CCDS64 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSNLSTLEKFYFAFPGEILM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 RMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGS ::::..::::..::...:.:.::...:...:. .:.::. ::..:::.:: .: :.:: CCDS64 RMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTLIAVILGIVLVVSIKPG- 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 AAQK--ETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEE ..:: : .. .. : .:..::.::::::::: :::.: :.::.:: : .: :: CCDS64 VTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKTKREEV--KPPSDPE- 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 APPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIML ... ::. . :.. :.. . : :: :::.::::.. : ..:... CCDS64 --------MNMTEESFTAVMTTAISKNKTKE--YKIVGMYSDGINVLGLIVFCLVFGLVI 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 GRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFY :.::..: ::.: . :....:::: . . :.:.::.:::::::.:..: . . .:::.: CCDS64 GKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWE-IFRKLGLY 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 SVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLL .::. ::..:.. ::::.::....:::. : :. :::: :: ::::::::.::.: CCDS64 MATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPVTFRCAE 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 ENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAAS :::..:.::.:::::::::::::::::::::::.::::.:. .: .:::::::::::.:: CCDS64 ENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISITATSAS 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 IGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHI :::::.::::::::::::..::::..:.:::::::: :::::::.::::::...::. .. CCDS64 IGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGTGIVEKL 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 CRKDFAR-DTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQV .:.. . :...: CCDS64 SKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISFTQTSQF 470 480 490 500 510 520 >>CCDS78003.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 (430 aa) initn: 1075 init1: 1048 opt: 1053 Z-score: 1285.2 bits: 247.3 E(32554): 2.9e-65 Smith-Waterman score: 1265; 47.4% identity (65.6% similar) in 511 aa overlap (16-521:47-430) 10 20 30 40 pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQ ::....:.: .:::: .::: :: :.: . CCDS78 RFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGTILGFTLRPYRMSYR 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 EISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVI :..::.::::::::::.:..:::..:::..:.:.::.:.:...:. .:.::. ::..::. CCDS78 EVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTIIAVV 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 VGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGKPI-MSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTT .::..: :::::... ::. .. :: . ...:::.::::: CCDS78 IGIIIVIIIHPGKGT-KENMHREGKIVRVTAADAFLDLIR-------------------- 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 PVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLG CCDS78 ------------------------------------------------------------ 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 IVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMD : : ::.:::::::.::. CCDS78 ------------------------------------------YAPVGILFLIAGKIVEME 180 190 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 DPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSS : ..: .:..:.:::. ::..:....::::::..:.::: ::: :.::::. ::.:::: CCDS78 DMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSS 200 210 220 230 240 250 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 SATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQ ::::::::::: ::: .:.:..::::::::::::::::::::.::::::::::.::.::: CCDS78 SATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQ 260 270 280 290 300 310 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 IITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:: ::: CCDS78 IITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRTTTNVL 320 330 340 350 360 370 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 GDALAAGIMAHICRKDFA-RDT--GTEKLLPCETK-PVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASE ::.:.:::. :. :... ::. :. . : : : .: ::.: : . .. CCDS78 GDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQL----IAQDNETEKPIDSETK 380 390 400 410 420 530 540 550 560 pF1KE6 LTLGPTCPHHVPVQVERDEELPAASLNHCTIQISELETNV . CCDS78 M 430 560 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 13:05:17 2016 done: Tue Nov 8 13:05:18 2016 Total Scan time: 2.330 Total Display time: 0.070 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]