Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6349
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6349, 390 aa
1>>>pF1KE6349 390 - 390 aa - 390 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7057+/-0.000848; mu= 14.7395+/- 0.051
mean_var=63.9790+/-13.000, 0's: 0 Z-trim(106.0): 17 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.160345
statistics sampled from 8714 (8728) to 8714 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.268), width: 16
Scan time: 2.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30802.1 CHI3L2 gene_id:1117|Hs108|chr1 ( 390) 2611 612.7 1.8e-175
CCDS30803.1 CHI3L2 gene_id:1117|Hs108|chr1 ( 380) 2469 579.8 1.4e-165
CCDS41367.1 CHI3L2 gene_id:1117|Hs108|chr1 ( 311) 2080 489.8 1.4e-138
CCDS1436.1 CHIT1 gene_id:1118|Hs108|chr1 ( 466) 1411 335.1 7.9e-92
CCDS1435.1 CHI3L1 gene_id:1116|Hs108|chr1 ( 383) 1371 325.8 4.1e-89
CCDS41368.1 CHIA gene_id:27159|Hs108|chr1 ( 476) 1310 311.7 8.7e-85
CCDS834.1 OVGP1 gene_id:5016|Hs108|chr1 ( 678) 1161 277.3 2.9e-74
CCDS58057.1 CHIT1 gene_id:1118|Hs108|chr1 ( 447) 1045 250.4 2.3e-66
CCDS832.1 CHIA gene_id:27159|Hs108|chr1 ( 368) 936 225.2 7.7e-59
CCDS58017.1 CHIA gene_id:27159|Hs108|chr1 ( 315) 789 191.2 1.1e-48
>>CCDS30802.1 CHI3L2 gene_id:1117|Hs108|chr1 (390 aa)
initn: 2611 init1: 2611 opt: 2611 Z-score: 3263.6 bits: 612.7 E(32554): 1.8e-175
Smith-Waterman score: 2611; 99.7% identity (100.0% similar) in 390 aa overlap (1-390:1-390)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGATTMDQKSLWAGVVVLLLLQGGSAYKLVCYFTNWSQDRQEPGKFTPENIDPFLCSHLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MGATTMDQKSLWAGVVVLLLLQGGSAYKLVCYFTNWSQDRQEPGKFTPENIDPFLCSHLI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YSFASIENNKVIIKDKSEVMLYQTINSLKTKNPKLKILLSIGGYLFGSKGFHPMVDSSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YSFASIENNKVIIKDKSEVMLYQTINSLKTKNPKLKILLSIGGYLFGSKGFHPMVDSSTS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 RLEFINSIILFLRNHNFDGLDVSWIYPDQKENTHFTVLIHELAEAFQKDFTKSTKERLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RLEFINSIILFLRNHNFDGLDVSWIYPDQKENTHFTVLIHELAEAFQKDFTKSTKERLLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 TVGVSAGRQMIDNSYQVEKLAKDLDFINLLSFDFHGSWEKPLITGHNSPLSKGWQDRGPS
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TAGVSAGRQMIDNSYQVEKLAKDLDFINLLSFDFHGSWEKPLITGHNSPLSKGWQDRGPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SYYNVEYAVGYWIHKGMPSEKVVMGIPTYGHSFTLASAETTVGAPASGPGAAGPITESSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SYYNVEYAVGYWIHKGMPSEKVVMGIPTYGHSFTLASAETTVGAPASGPGAAGPITESSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 FLAYYEICQFLKGAKITRLQDQQVPYAVKGNQWVGYDDVKSMETKVQFLKNLNLGGAMIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FLAYYEICQFLKGAKITRLQDQQVPYAVKGNQWVGYDDVKSMETKVQFLKNLNLGGAMIW
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KE6 SIDMDDFTGKSCNQGPYPLVQAVKRSLGSL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SIDMDDFTGKSCNQGPYPLVQAVKRSLGSL
370 380 390
>>CCDS30803.1 CHI3L2 gene_id:1117|Hs108|chr1 (380 aa)
initn: 2469 init1: 2469 opt: 2469 Z-score: 3086.2 bits: 579.8 E(32554): 1.4e-165
Smith-Waterman score: 2523; 97.2% identity (97.4% similar) in 390 aa overlap (1-390:1-380)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGATTMDQKSLWAGVVVLLLLQGGSAYKLVCYFTNWSQDRQEPGKFTPENIDPFLCSHLI
:::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MGATTMDQKSLWAG----------SAYKLVCYFTNWSQDRQEPGKFTPENIDPFLCSHLI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YSFASIENNKVIIKDKSEVMLYQTINSLKTKNPKLKILLSIGGYLFGSKGFHPMVDSSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YSFASIENNKVIIKDKSEVMLYQTINSLKTKNPKLKILLSIGGYLFGSKGFHPMVDSSTS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 RLEFINSIILFLRNHNFDGLDVSWIYPDQKENTHFTVLIHELAEAFQKDFTKSTKERLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RLEFINSIILFLRNHNFDGLDVSWIYPDQKENTHFTVLIHELAEAFQKDFTKSTKERLLL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 TVGVSAGRQMIDNSYQVEKLAKDLDFINLLSFDFHGSWEKPLITGHNSPLSKGWQDRGPS
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TAGVSAGRQMIDNSYQVEKLAKDLDFINLLSFDFHGSWEKPLITGHNSPLSKGWQDRGPS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SYYNVEYAVGYWIHKGMPSEKVVMGIPTYGHSFTLASAETTVGAPASGPGAAGPITESSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SYYNVEYAVGYWIHKGMPSEKVVMGIPTYGHSFTLASAETTVGAPASGPGAAGPITESSG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 FLAYYEICQFLKGAKITRLQDQQVPYAVKGNQWVGYDDVKSMETKVQFLKNLNLGGAMIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FLAYYEICQFLKGAKITRLQDQQVPYAVKGNQWVGYDDVKSMETKVQFLKNLNLGGAMIW
300 310 320 330 340 350
370 380 390
pF1KE6 SIDMDDFTGKSCNQGPYPLVQAVKRSLGSL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SIDMDDFTGKSCNQGPYPLVQAVKRSLGSL
360 370 380
>>CCDS41367.1 CHI3L2 gene_id:1117|Hs108|chr1 (311 aa)
initn: 2080 init1: 2080 opt: 2080 Z-score: 2601.3 bits: 489.8 E(32554): 1.4e-138
Smith-Waterman score: 2080; 99.7% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (80-390:1-311)
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 NIDPFLCSHLIYSFASIENNKVIIKDKSEVMLYQTINSLKTKNPKLKILLSIGGYLFGSK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MLYQTINSLKTKNPKLKILLSIGGYLFGSK
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 GFHPMVDSSTSRLEFINSIILFLRNHNFDGLDVSWIYPDQKENTHFTVLIHELAEAFQKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GFHPMVDSSTSRLEFINSIILFLRNHNFDGLDVSWIYPDQKENTHFTVLIHELAEAFQKD
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 FTKSTKERLLLTVGVSAGRQMIDNSYQVEKLAKDLDFINLLSFDFHGSWEKPLITGHNSP
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FTKSTKERLLLTAGVSAGRQMIDNSYQVEKLAKDLDFINLLSFDFHGSWEKPLITGHNSP
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 LSKGWQDRGPSSYYNVEYAVGYWIHKGMPSEKVVMGIPTYGHSFTLASAETTVGAPASGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LSKGWQDRGPSSYYNVEYAVGYWIHKGMPSEKVVMGIPTYGHSFTLASAETTVGAPASGP
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 GAAGPITESSGFLAYYEICQFLKGAKITRLQDQQVPYAVKGNQWVGYDDVKSMETKVQFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GAAGPITESSGFLAYYEICQFLKGAKITRLQDQQVPYAVKGNQWVGYDDVKSMETKVQFL
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390
pF1KE6 KNLNLGGAMIWSIDMDDFTGKSCNQGPYPLVQAVKRSLGSL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KNLNLGGAMIWSIDMDDFTGKSCNQGPYPLVQAVKRSLGSL
280 290 300 310
>>CCDS1436.1 CHIT1 gene_id:1118|Hs108|chr1 (466 aa)
initn: 1415 init1: 530 opt: 1411 Z-score: 1762.0 bits: 335.1 E(32554): 7.9e-92
Smith-Waterman score: 1411; 52.1% identity (80.6% similar) in 382 aa overlap (12-387:7-385)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGATTMDQKSLWAGVVVLLLLQGGSAYKLVCYFTNWSQDRQEPGKFTPENIDPFLCSHLI
::: .:::.. ::: :::::::::.: :: ..: :...:: ::.:::
CCDS14 MVRSVAWAGFMVLLMIPWGSAAKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YSFASIENNKVIIKDKSEVMLYQTINSLKTKNPKLKILLSIGGYLFGSKGFHPMVDSSTS
:.::.. :... . .. ::: .:.:: ::::: ::.:::. ::.. : :: ....
CCDS14 YAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE6 RLEFINSIILFLRNHNFDGLDVSWIYPDQK-----ENTHFTVLIHELAEAFQKDFTKSTK
: :.:: : :::...:::::..: :: .. .. .::.:...::.:::.. : :
CCDS14 RQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 ERLLLTVGVSAGRQMIDNSYQVEKLAKDLDFINLLSFDFHGSWEKPLITGHNSPLSKGWQ
:::::...: ::. ..: .:.:.:.:..:::.::...:::::::: .::::::: : .
CCDS14 ERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEK--VTGHNSPLYKRQE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DRGPSSYYNVEYAVGYWIHKGMPSEKVVMGIPTYGHSFTLASA-ETTVGAPASGPGAAGP
. : .. ::. :: :..:: :. :...:.::::.::::::. .: :::::.: :. ::
CCDS14 ESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 ITESSGFLAYYEICQFLKGAKITRLQDQQVPYAVKGNQWVGYDDVKSMETKVQFLKNLNL
.:. .:.:::::.:.. ::: :.:::.::: . :::::.:::.:..:::..::. .:
CCDS14 FTKEGGMLAYYEVCSW-KGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KE6 GGAMIWSIDMDDFTGKSCNQGPYPLVQAVKRSLGSL
::::.:..:.:::.: ::::: :::.:.... :
CCDS14 GGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELSLPYLPSGTPELEVPKPGQPSEPEHGP
360 370 380 390 400 410
CCDS14 SPGQDTFCQGKADGLYPNPRERSSFYSCAAGRLFQQSCPTGLVFSNSCKCCTWN
420 430 440 450 460
>>CCDS1435.1 CHI3L1 gene_id:1116|Hs108|chr1 (383 aa)
initn: 1351 init1: 656 opt: 1371 Z-score: 1713.4 bits: 325.8 E(32554): 4.1e-89
Smith-Waterman score: 1371; 50.9% identity (80.0% similar) in 385 aa overlap (6-389:1-382)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGATTMDQKSLWAGVVVLLLLQGGSAYKLVCYFTNWSQDRQEPGKFTPENIDPFLCSHLI
: :. .: :::.::: ::::::::.:.::: :. :. :. .: :::.:.:
CCDS14 MGVKASQTGFVVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYREGDGSCFPDALDRFLCTHII
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YSFASIENNKVIIKDKSEVMLYQTINSLKTKNPKLKILLSIGGYLFGSKGFHPMVDSSTS
::::.: :... . ..: :: .:.::..::.:: :::.::. :::. : ..... :
CCDS14 YSFANISNDHIDTWEWNDVTLYGMLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNFGSQRFSKIASNTQS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 RLEFINSIILFLRNHNFDGLDVSWIYPDQKENTHFTVLIHELAEAFQKDFTKSTKERLLL
: ::.:. :::.:.:::::..:.:: .... :::.::.:. : :. .. :..:::
CCDS14 RRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKQHFTTLIKEMKAEFIKE-AQPGKKQLLL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 TVGVSAGRQMIDNSYQVEKLAKDLDFINLLSFDFHGSWEKPLITGHNSPLSKGWQDRGPS
....:::. ::.::.. :... ::::.....::::.:. :::.::: .: .: .:.
CCDS14 SAALSAGKVTIDSSYDIAKISQHLDFISIMTYDFHGAWRGT--TGHHSPLFRGQEDASPD
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SYYNVEYAVGYWIHKGMPSEKVVMGIPTYGHSFTLASAETTVGAPASGPGAAGPITESSG
. :..::::: .. : :. :.::::::.:.::::::.:: :::: :::: : .:. .:
CCDS14 RFSNTDYAVGYMLRLGAPASKLVMGIPTFGRSFTLASSETGVGAPISGPGIPGRFTKEAG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 FLAYYEICQFLKGAKITRLQDQQVPYAVKGNQWVGYDDVKSMETKVQFLKNLNLGGAMIW
:::::::.::.:: . :. ::::::.:::::::::: .:...:::.::. .:.:::.:
CCDS14 TLAYYEICDFLRGATVHRILGQQVPYATKGNQWVGYDDQESVKSKVQYLKDRQLAGAMVW
300 310 320 330 340 350
370 380 390
pF1KE6 SIDMDDFTGKSCNQG-PYPLVQAVKRSLGSL
..:.::: :. :.: .::..:.: .:..
CCDS14 ALDLDDFQGSFCGQDLRFPLTNAIKDALAAT
360 370 380
>>CCDS41368.1 CHIA gene_id:27159|Hs108|chr1 (476 aa)
initn: 884 init1: 481 opt: 1310 Z-score: 1635.6 bits: 311.7 E(32554): 8.7e-85
Smith-Waterman score: 1310; 49.0% identity (77.9% similar) in 390 aa overlap (6-388:1-388)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGATTMDQKSLWAGVVVLLLLQGGSAYKLVCYFTNWSQDRQEPGKFTPENIDPFLCSHLI
: . : .:.:..: :: ::::.:.::::::.: : :.: :.:::: ::.:::
CCDS41 MTKLILLTGLVLILNLQLGSAYQLTCYFTNWAQYRPGLGRFMPDNIDPCLCTHLI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YSFASIENNKVIIKDKSEVMLYQTINSLKTKNPKLKILLSIGGYLFGSKGFHPMVDSSTS
:.::. .::.. . ..: :::..:.::.:: .:: ::.:::. ::. : ::.. .
CCDS41 YAFAGRQNNEITTIEWNDVTLYQAFNGLKNKNSQLKTLLAIGGWNFGTAPFTAMVSTPEN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE6 RLEFINSIILFLRNHNFDGLDVSWIYPDQK----ENTH-FTVLIHELAEAFQKDFTKSTK
: ::.:.: :::...::::: .: :: .. .. : ::::..:. :::... . .:
CCDS41 RQTFITSVIKFLRQYEFDGLDFDWEYPGSRGSPPQDKHLFTVLVQEMREAFEQEAKQINK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 ERLLLTVGVSAGRQMIDNSYQVEKLAKDLDFINLLSFDFHGSWEKPLITGHNSPLSKGWQ
::..:..:.:: . :...:.. .:.. ::.:.....:.::::: ::.:::: :
CCDS41 PRLMVTAAVAAGISNIQSGYEIPQLSQYLDYIHVMTYDLHGSWEG--YTGENSPLYKYPT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DRGPSSYYNVEYAVGYWIHKGMPSEKVVMGIPTYGHSFTLAS-AETTVGAPASGPGAAGP
: : ..: ::.:...:: .: :.::...:.:::::.: :.. ..: .:::.:: : :::
CCDS41 DTGSNAYLNVDYVMNYWKDNGAPAEKLIVGFPTYGHNFILSNPSNTGIGAPTSGAGPAGP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 ITESSGFLAYYEICQFLK-GAKITRLQDQQVPYAVKGNQWVGYDDVKSMETKVQFLKNLN
.. ::. :::::: ::: :: :.:::: .:: :::::..::.. :.:.::. .
CCDS41 YAKESGIWAYYEICTFLKNGATQGWDAPQEVPYAYQGNVWVGYDNIKSFDIKAQWLKHNK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KE6 LGGAMIWSIDMDDFTGKSCNQGPYPLVQAVKRSLGSL
.::::.:.::.::::: :::: .::....:..::
CCDS41 FGGAMVWAIDLDDFTGTFCNQGKFPLISTLKKALGLQSASCTAPAQPIEPITAAPSGSGN
360 370 380 390 400 410
CCDS41 GSGSSSSGGSSGGSGFCAVRANGLYPVANNRNAFWHCVNGVTYQQNCQAGLVFDTSCDCC
420 430 440 450 460 470
>>CCDS834.1 OVGP1 gene_id:5016|Hs108|chr1 (678 aa)
initn: 417 init1: 417 opt: 1161 Z-score: 1446.8 bits: 277.3 E(32554): 2.9e-74
Smith-Waterman score: 1161; 47.2% identity (76.4% similar) in 377 aa overlap (11-380:6-375)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGATTMDQKSLWAGVVVLLLLQGGSAYKLVCYFTNWSQDRQEPGKFTPENIDPFLCSHLI
::.:.:..: . :.:.:::::::::...: :... :...:::::.:::
CCDS83 MWKLLLWVGLVLVLKHHDGAAHKLVCYFTNWAHSRPGPASILPHDLDPFLCTHLI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE6 YSFASIENNKVIIKD-KSEVMLYQTINSLKTKNPKLKILLSIGGYLFGSKGFHPMVDSST
..:::..::... :: ..: .:: .:.:: .: .:: ::::::. ::.. : :... .
CCDS83 FAFASMNNNQIVAKDLQDEKILYPEFNKLKERNRELKTLLSIGGWNFGTSRFTTMLSTFA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 SRLEFINSIILFLRNHNFDGLDVSWIYPDQKENT-H----FTVLIHELAEAFQKDFTKST
.: .:: :.: .::.:.:::::. ..:: . . : : ::.:: ::.:. .
CCDS83 NREKFIASVISLLRTHDFDGLDLFFLYPGLRGSPMHDRWTFLFLIEELLFAFRKEALLTM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 KERLLLTVGVSAGRQMIDNSYQVEKLAKDLDFINLLSFDFHGSWEKPLITGHNSPLSKGW
. ::::...::. .....::.:. :.. :::::.::.:.:::::. .::::::: .
CCDS83 RPRLLLSAAVSGVPHIVQTSYDVRFLGRLLDFINVLSYDLHGSWER--FTGHNSPLFSLP
180 190 200 210 220 230
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]