Result of FASTA (omim) for pFN21AE6430
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6430, 614 aa
  1>>>pF1KE6430 614 - 614 aa - 614 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9215+/-0.00041; mu= 21.4076+/- 0.025
 mean_var=65.5445+/-12.974, 0's: 0 Z-trim(110.5): 50  B-trim: 93 in 1/53
 Lambda= 0.158419
 statistics sampled from 18804 (18827) to 18804 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.586), E-opt: 0.2 (0.221), width:  16
 Scan time:  6.260

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_004661 (OMIM: 603005,612847) bifunctional 3'-ph ( 614) 4171 962.7       0
NP_001015880 (OMIM: 603005,612847) bifunctional 3' ( 619) 4151 958.1       0
XP_011530702 (OMIM: 603262) PREDICTED: bifunctiona ( 603) 3381 782.1       0
XP_011530703 (OMIM: 603262) PREDICTED: bifunctiona ( 603) 3381 782.1       0
NP_005434 (OMIM: 603262) bifunctional 3'-phosphoad ( 624) 3381 782.2       0


>>NP_004661 (OMIM: 603005,612847) bifunctional 3'-phosph  (614 aa)
 initn: 4171 init1: 4171 opt: 4171  Z-score: 5148.3  bits: 962.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4171; 100.0% identity (100.0% similar) in 614 aa overlap (1-614:1-614)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MSGIKKQKTENQQKSTNVVYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTISF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MSGIKKQKTENQQKSTNVVYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTISF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 ALEEYLVSHAIPCYSLDGDNVRHGLNRNLGFSPGDREENIRRIAEVAKLFADAGLVCITS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ALEEYLVSHAIPCYSLDGDNVRHGLNRNLGFSPGDREENIRRIAEVAKLFADAGLVCITS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 FISPFAKDRENARKIHESAGLPFFEIFVDAPLNICESRDVKGLYKRARAGEIKGFTGIDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FISPFAKDRENARKIHESAGLPFFEIFVDAPLNICESRDVKGLYKRARAGEIKGFTGIDS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 DYEKPETPERVLKTNLSTVSDCVHQVVELLQEQNIVPYTIIKDIHELFVPENKLDHVRAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DYEKPETPERVLKTNLSTVSDCVHQVVELLQEQNIVPYTIIKDIHELFVPENKLDHVRAE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 AETLPSLSITKLDLQWVQVLSEGWATPLKGFMREKEYLQVMHFDTLLDDGVINMSIPIVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AETLPSLSITKLDLQWVQVLSEGWATPLKGFMREKEYLQVMHFDTLLDDGVINMSIPIVL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 PVSAEDKTRLEGCSKFVLAHGGRRVAILRDAEFYEHRKEERCSRVWGTTCTKHPHIKMVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PVSAEDKTRLEGCSKFVLAHGGRRVAILRDAEFYEHRKEERCSRVWGTTCTKHPHIKMVM
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 ESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPLELKQKCKEMNADAVFAFQLRNPVHNGHAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPLELKQKCKEMNADAVFAFQLRNPVHNGHAL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE6 LMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKSTIVAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKSTIVAI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE6 FPSPMLYAGPTEVQWHCRSRMIAGANFYIVGRDPAGMPHPETKKDLYEPTHGGKVLSMAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FPSPMLYAGPTEVQWHCRSRMIAGANFYIVGRDPAGMPHPETKKDLYEPTHGGKVLSMAP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE6 GLTSVEIIPFRVAAYNKAKKAMDFYDPARHNEFDFISGTRMRKLAREGENPPDGFMAPKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GLTSVEIIPFRVAAYNKAKKAMDFYDPARHNEFDFISGTRMRKLAREGENPPDGFMAPKA
              550       560       570       580       590       600

              610    
pF1KE6 WKVLTDYYRSLEKN
       ::::::::::::::
NP_004 WKVLTDYYRSLEKN
              610    

>>NP_001015880 (OMIM: 603005,612847) bifunctional 3'-pho  (619 aa)
 initn: 2269 init1: 2269 opt: 4151  Z-score: 5123.5  bits: 958.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4151; 99.2% identity (99.2% similar) in 619 aa overlap (1-614:1-619)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MSGIKKQKTENQQKSTNVVYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTISF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSGIKKQKTENQQKSTNVVYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTISF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 ALEEYLVSHAIPCYSLDGDNVRHGLNRNLGFSPGDREENIRRIAEVAKLFADAGLVCITS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALEEYLVSHAIPCYSLDGDNVRHGLNRNLGFSPGDREENIRRIAEVAKLFADAGLVCITS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 FISPFAKDRENARKIHESAGLPFFEIFVDAPLNICESRDVKGLYKRARAGEIKGFTGIDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FISPFAKDRENARKIHESAGLPFFEIFVDAPLNICESRDVKGLYKRARAGEIKGFTGIDS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 DYEKPETPERVLKTNLSTVSDCVHQVVELLQEQNIVPYTIIKDIHELFVPENKLDHVRAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DYEKPETPERVLKTNLSTVSDCVHQVVELLQEQNIVPYTIIKDIHELFVPENKLDHVRAE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280            290     
pF1KE6 AETLPSLSITKLDLQWVQVLSEGWATPLKGFMREKEYLQVMHFDTLLD-----DGVINMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::     :::::::
NP_001 AETLPSLSITKLDLQWVQVLSEGWATPLKGFMREKEYLQVMHFDTLLDGMALPDGVINMS
              250       260       270       280       290       300

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE6 IPIVLPVSAEDKTRLEGCSKFVLAHGGRRVAILRDAEFYEHRKEERCSRVWGTTCTKHPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPIVLPVSAEDKTRLEGCSKFVLAHGGRRVAILRDAEFYEHRKEERCSRVWGTTCTKHPH
              310       320       330       340       350       360

         360       370       380       390       400       410     
pF1KE6 IKMVMESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPLELKQKCKEMNADAVFAFQLRNPVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IKMVMESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPLELKQKCKEMNADAVFAFQLRNPVH
              370       380       390       400       410       420

         420       430       440       450       460       470     
pF1KE6 NGHALLMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NGHALLMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKS
              430       440       450       460       470       480

         480       490       500       510       520       530     
pF1KE6 TIVAIFPSPMLYAGPTEVQWHCRSRMIAGANFYIVGRDPAGMPHPETKKDLYEPTHGGKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TIVAIFPSPMLYAGPTEVQWHCRSRMIAGANFYIVGRDPAGMPHPETKKDLYEPTHGGKV
              490       500       510       520       530       540

         540       550       560       570       580       590     
pF1KE6 LSMAPGLTSVEIIPFRVAAYNKAKKAMDFYDPARHNEFDFISGTRMRKLAREGENPPDGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSMAPGLTSVEIIPFRVAAYNKAKKAMDFYDPARHNEFDFISGTRMRKLAREGENPPDGF
              550       560       570       580       590       600

         600       610    
pF1KE6 MAPKAWKVLTDYYRSLEKN
       :::::::::::::::::::
NP_001 MAPKAWKVLTDYYRSLEKN
              610         

>>XP_011530702 (OMIM: 603262) PREDICTED: bifunctional 3'  (603 aa)
 initn: 3381 init1: 3381 opt: 3381  Z-score: 4172.6  bits: 782.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3381; 78.4% identity (94.0% similar) in 601 aa overlap (13-613:2-602)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MSGIKKQKTENQQKSTNVVYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTISF
                   :..:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.
XP_011            MQRATNVTYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTVSM
                          10        20        30        40         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 ALEEYLVSHAIPCYSLDGDNVRHGLNRNLGFSPGDREENIRRIAEVAKLFADAGLVCITS
       ::::::: :.::::.:::::.:.:::.:::::: :::::.::::::::::::::::::::
XP_011 ALEEYLVCHGIPCYTLDGDNIRQGLNKNLGFSPEDREENVRRIAEVAKLFADAGLVCITS
      50        60        70        80        90       100         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 FISPFAKDRENARKIHESAGLPFFEIFVDAPLNICESRDVKGLYKRARAGEIKGFTGIDS
       ::::...::.:::.:::.:.:::::.::::::..::.::::::::.::::::::::::::
XP_011 FISPYTQDRNNARQIHEGASLPFFEVFVDAPLHVCEQRDVKGLYKKARAGEIKGFTGIDS
     110       120       130       140       150       160         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 DYEKPETPERVLKTNLSTVSDCVHQVVELLQEQNIVPYTIIKDIHELFVPENKLDHVRAE
       .:::::.:: ::::.   :.:::.::::::::..:::     ...::.::::::  ....
XP_011 EYEKPEAPELVLKTDSCDVNDCVQQVVELLQERDIVPVDASYEVKELYVPENKLHLAKTD
     170       180       190       200       210       220         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 AETLPSLSITKLDLQWVQVLSEGWATPLKGFMREKEYLQVMHFDTLLDDGVINMSIPIVL
       :::::.:.:.:.:.::::::.:::::::.:::::.:::: .::: ::: ::::.:.::::
XP_011 AETLPALKINKVDMQWVQVLAEGWATPLNGFMREREYLQCLHFDCLLDGGVINLSVPIVL
     230       240       250       260       270       280         

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 PVSAEDKTRLEGCSKFVLAHGGRRVAILRDAEFYEHRKEERCSRVWGTTCTKHPHIKMVM
        .. ::: ::.::. :.: . ::::::::. ::.::::::::.: ::::: .::.:::::
XP_011 TATHEDKERLDGCTAFALMYEGRRVAILRNPEFFEHRKEERCARQWGTTCKNHPYIKMVM
     290       300       310       320       330       340         

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 ESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPLELKQKCKEMNADAVFAFQLRNPVHNGHAL
       :.::::.:::::::... :::::::::::: ::::: :.:::::::::::::::::::::
XP_011 EQGDWLIGGDLQVLDRVYWNDGLDQYRLTPTELKQKFKDMNADAVFAFQLRNPVHNGHAL
     350       360       370       380       390       400         

              430       440       450       460       470       480
pF1KE6 LMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKSTIVAI
       :::::...::::::..::::::::::::::::::: :::::::::::::::.:..:.:::
XP_011 LMQDTHKQLLERGYRRPVLLLHPLGGWTKDDDVPLMWRMKQHAAVLEEGVLNPETTVVAI
     410       420       430       440       450       460         

              490       500       510       520       530       540
pF1KE6 FPSPMLYAGPTEVQWHCRSRMIAGANFYIVGRDPAGMPHPETKKDLYEPTHGGKVLSMAP
       :::::.::::::::::::.::.:::::::::::::::::::: ::::::.::.:::.:::
XP_011 FPSPMMYAGPTEVQWHCRARMVAGANFYIVGRDPAGMPHPETGKDLYEPSHGAKVLTMAP
     470       480       490       500       510       520         

              550       560       570       580       590       600
pF1KE6 GLTSVEIIPFRVAAYNKAKKAMDFYDPARHNEFDFISGTRMRKLAREGENPPDGFMAPKA
       :: ..::.::::::::: :: ::.::  .:..:.::::::::::::::..::.:::::::
XP_011 GLITLEIVPFRVAAYNKKKKRMDYYDSEHHEDFEFISGTRMRKLAREGQKPPEGFMAPKA
     530       540       550       560       570       580         

              610    
pF1KE6 WKVLTDYYRSLEKN
       : :::.::.:::: 
XP_011 WTVLTEYYKSLEKA
     590       600   

>>XP_011530703 (OMIM: 603262) PREDICTED: bifunctional 3'  (603 aa)
 initn: 3381 init1: 3381 opt: 3381  Z-score: 4172.6  bits: 782.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3381; 78.4% identity (94.0% similar) in 601 aa overlap (13-613:2-602)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MSGIKKQKTENQQKSTNVVYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTISF
                   :..:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.
XP_011            MQRATNVTYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTVSM
                          10        20        30        40         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 ALEEYLVSHAIPCYSLDGDNVRHGLNRNLGFSPGDREENIRRIAEVAKLFADAGLVCITS
       ::::::: :.::::.:::::.:.:::.:::::: :::::.::::::::::::::::::::
XP_011 ALEEYLVCHGIPCYTLDGDNIRQGLNKNLGFSPEDREENVRRIAEVAKLFADAGLVCITS
      50        60        70        80        90       100         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 FISPFAKDRENARKIHESAGLPFFEIFVDAPLNICESRDVKGLYKRARAGEIKGFTGIDS
       ::::...::.:::.:::.:.:::::.::::::..::.::::::::.::::::::::::::
XP_011 FISPYTQDRNNARQIHEGASLPFFEVFVDAPLHVCEQRDVKGLYKKARAGEIKGFTGIDS
     110       120       130       140       150       160         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 DYEKPETPERVLKTNLSTVSDCVHQVVELLQEQNIVPYTIIKDIHELFVPENKLDHVRAE
       .:::::.:: ::::.   :.:::.::::::::..:::     ...::.::::::  ....
XP_011 EYEKPEAPELVLKTDSCDVNDCVQQVVELLQERDIVPVDASYEVKELYVPENKLHLAKTD
     170       180       190       200       210       220         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 AETLPSLSITKLDLQWVQVLSEGWATPLKGFMREKEYLQVMHFDTLLDDGVINMSIPIVL
       :::::.:.:.:.:.::::::.:::::::.:::::.:::: .::: ::: ::::.:.::::
XP_011 AETLPALKINKVDMQWVQVLAEGWATPLNGFMREREYLQCLHFDCLLDGGVINLSVPIVL
     230       240       250       260       270       280         

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 PVSAEDKTRLEGCSKFVLAHGGRRVAILRDAEFYEHRKEERCSRVWGTTCTKHPHIKMVM
        .. ::: ::.::. :.: . ::::::::. ::.::::::::.: ::::: .::.:::::
XP_011 TATHEDKERLDGCTAFALMYEGRRVAILRNPEFFEHRKEERCARQWGTTCKNHPYIKMVM
     290       300       310       320       330       340         

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 ESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPLELKQKCKEMNADAVFAFQLRNPVHNGHAL
       :.::::.:::::::... :::::::::::: ::::: :.:::::::::::::::::::::
XP_011 EQGDWLIGGDLQVLDRVYWNDGLDQYRLTPTELKQKFKDMNADAVFAFQLRNPVHNGHAL
     350       360       370       380       390       400         

              430       440       450       460       470       480
pF1KE6 LMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKSTIVAI
       :::::...::::::..::::::::::::::::::: :::::::::::::::.:..:.:::
XP_011 LMQDTHKQLLERGYRRPVLLLHPLGGWTKDDDVPLMWRMKQHAAVLEEGVLNPETTVVAI
     410       420       430       440       450       460         

              490       500       510       520       530       540
pF1KE6 FPSPMLYAGPTEVQWHCRSRMIAGANFYIVGRDPAGMPHPETKKDLYEPTHGGKVLSMAP
       :::::.::::::::::::.::.:::::::::::::::::::: ::::::.::.:::.:::
XP_011 FPSPMMYAGPTEVQWHCRARMVAGANFYIVGRDPAGMPHPETGKDLYEPSHGAKVLTMAP
     470       480       490       500       510       520         

              550       560       570       580       590       600
pF1KE6 GLTSVEIIPFRVAAYNKAKKAMDFYDPARHNEFDFISGTRMRKLAREGENPPDGFMAPKA
       :: ..::.::::::::: :: ::.::  .:..:.::::::::::::::..::.:::::::
XP_011 GLITLEIVPFRVAAYNKKKKRMDYYDSEHHEDFEFISGTRMRKLAREGQKPPEGFMAPKA
     530       540       550       560       570       580         

              610    
pF1KE6 WKVLTDYYRSLEKN
       : :::.::.:::: 
XP_011 WTVLTEYYKSLEKA
     590       600   

>>NP_005434 (OMIM: 603262) bifunctional 3'-phosphoadenos  (624 aa)
 initn: 3381 init1: 3381 opt: 3381  Z-score: 4172.4  bits: 782.2 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3381; 78.4% identity (94.0% similar) in 601 aa overlap (13-613:23-623)

                         10        20        30        40        50
pF1KE6           MSGIKKQKTENQQKSTNVVYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGL
                             :..:::.:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MEIPGSLCKKVKLSNNAQNWGMQRATNVTYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGL
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KE6 SGAGKTTISFALEEYLVSHAIPCYSLDGDNVRHGLNRNLGFSPGDREENIRRIAEVAKLF
       :::::::.:.::::::: :.::::.:::::.:.:::.:::::: :::::.::::::::::
NP_005 SGAGKTTVSMALEEYLVCHGIPCYTLDGDNIRQGLNKNLGFSPEDREENVRRIAEVAKLF
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pF1KE6 ADAGLVCITSFISPFAKDRENARKIHESAGLPFFEIFVDAPLNICESRDVKGLYKRARAG
       ::::::::::::::...::.:::.:::.:.:::::.::::::..::.::::::::.::::
NP_005 ADAGLVCITSFISPYTQDRNNARQIHEGASLPFFEVFVDAPLHVCEQRDVKGLYKKARAG
              130       140       150       160       170       180

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pF1KE6 EIKGFTGIDSDYEKPETPERVLKTNLSTVSDCVHQVVELLQEQNIVPYTIIKDIHELFVP
       ::::::::::.:::::.:: ::::.   :.:::.::::::::..:::     ...::.::
NP_005 EIKGFTGIDSEYEKPEAPELVLKTDSCDVNDCVQQVVELLQERDIVPVDASYEVKELYVP
              190       200       210       220       230       240

              240       250       260       270       280       290
pF1KE6 ENKLDHVRAEAETLPSLSITKLDLQWVQVLSEGWATPLKGFMREKEYLQVMHFDTLLDDG
       ::::  ....:::::.:.:.:.:.::::::.:::::::.:::::.:::: .::: ::: :
NP_005 ENKLHLAKTDAETLPALKINKVDMQWVQVLAEGWATPLNGFMREREYLQCLHFDCLLDGG
              250       260       270       280       290       300

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pF1KE6 VINMSIPIVLPVSAEDKTRLEGCSKFVLAHGGRRVAILRDAEFYEHRKEERCSRVWGTTC
       :::.:.:::: .. ::: ::.::. :.: . ::::::::. ::.::::::::.: :::::
NP_005 VINLSVPIVLTATHEDKERLDGCTAFALMYEGRRVAILRNPEFFEHRKEERCARQWGTTC
              310       320       330       340       350       360

              360       370       380       390       400       410
pF1KE6 TKHPHIKMVMESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPLELKQKCKEMNADAVFAFQL
        .::.::::::.::::.:::::::... :::::::::::: ::::: :.:::::::::::
NP_005 KNHPYIKMVMEQGDWLIGGDLQVLDRVYWNDGLDQYRLTPTELKQKFKDMNADAVFAFQL
              370       380       390       400       410       420

              420       430       440       450       460       470
pF1KE6 RNPVHNGHALLMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGV
       :::::::::::::::...::::::..::::::::::::::::::: ::::::::::::::
NP_005 RNPVHNGHALLMQDTHKQLLERGYRRPVLLLHPLGGWTKDDDVPLMWRMKQHAAVLEEGV
              430       440       450       460       470       480

              480       490       500       510       520       530
pF1KE6 LDPKSTIVAIFPSPMLYAGPTEVQWHCRSRMIAGANFYIVGRDPAGMPHPETKKDLYEPT
       :.:..:.::::::::.::::::::::::.::.:::::::::::::::::::: ::::::.
NP_005 LNPETTVVAIFPSPMMYAGPTEVQWHCRARMVAGANFYIVGRDPAGMPHPETGKDLYEPS
              490       500       510       520       530       540

              540       550       560       570       580       590
pF1KE6 HGGKVLSMAPGLTSVEIIPFRVAAYNKAKKAMDFYDPARHNEFDFISGTRMRKLAREGEN
       ::.:::.::::: ..::.::::::::: :: ::.::  .:..:.::::::::::::::..
NP_005 HGAKVLTMAPGLITLEIVPFRVAAYNKKKKRMDYYDSEHHEDFEFISGTRMRKLAREGQK
              550       560       570       580       590       600

              600       610    
pF1KE6 PPDGFMAPKAWKVLTDYYRSLEKN
       ::.:::::::: :::.::.:::: 
NP_005 PPEGFMAPKAWTVLTEYYKSLEKA
              610       620    




614 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 13:13:29 2016 done: Tue Nov  8 13:13:30 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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