Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1440
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1440, 349 aa
1>>>pF1KE1440 349 - 349 aa - 349 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9009+/-0.00091; mu= 19.2115+/- 0.055
mean_var=79.2005+/-15.600, 0's: 0 Z-trim(106.8): 33 B-trim: 11 in 2/48
Lambda= 0.144115
statistics sampled from 9164 (9193) to 9164 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16
Scan time: 2.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs108|chr3 ( 349) 2477 524.6 4.8e-149
CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 ( 349) 2026 430.8 8.1e-121
CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 391) 1210 261.2 1e-69
CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 372) 1209 261.0 1.2e-69
CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 ( 351) 1173 253.5 2e-67
CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12 ( 359) 1157 250.2 2e-66
CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 365) 1140 246.6 2.4e-65
CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 380) 1140 246.6 2.4e-65
CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17 ( 355) 1122 242.9 3.1e-64
CCDS5771.1 WNT2 gene_id:7472|Hs108|chr7 ( 360) 1105 239.3 3.6e-63
CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1 ( 352) 1102 238.7 5.5e-63
CCDS76188.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 299) 1083 234.7 7.6e-62
CCDS5781.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 365) 1083 234.8 8.7e-62
CCDS5780.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 355) 1082 234.6 9.9e-62
CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12 ( 370) 981 213.6 2.1e-55
CCDS7494.1 WNT8B gene_id:7479|Hs108|chr10 ( 351) 891 194.8 8.8e-50
CCDS8242.1 WNT11 gene_id:7481|Hs108|chr11 ( 354) 882 193.0 3.3e-49
CCDS11506.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 357) 822 180.5 1.9e-45
CCDS43368.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 351) 821 180.3 2.1e-45
CCDS75311.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 369) 821 180.3 2.2e-45
CCDS31045.1 WNT9A gene_id:7483|Hs108|chr1 ( 365) 794 174.7 1.1e-43
CCDS8775.1 WNT10B gene_id:7480|Hs108|chr12 ( 389) 713 157.9 1.3e-38
CCDS2426.1 WNT10A gene_id:80326|Hs108|chr2 ( 417) 693 153.8 2.5e-37
CCDS2425.1 WNT6 gene_id:7475|Hs108|chr2 ( 365) 668 148.5 8.2e-36
CCDS82147.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 329) 601 134.5 1.2e-31
>>CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs108|chr3 (349 aa)
initn: 2477 init1: 2477 opt: 2477 Z-score: 2789.3 bits: 524.6 E(32554): 4.8e-149
Smith-Waterman score: 2477; 100.0% identity (100.0% similar) in 349 aa overlap (1-349:1-349)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNRKARRCLGHLFLSLGMVYLRIGGFSSVVALGASIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAII
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CCDS26 MNRKARRCLGHLFLSLGMVYLRIGGFSSVVALGASIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAII
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VIGEGSQMGLDECQFQFRNGRWNCSALGERTVFGKELKVGSREAAFTYAIIAAGVAHAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 VIGEGSQMGLDECQFQFRNGRWNCSALGERTVFGKELKVGSREAAFTYAIIAAGVAHAIT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AACTQGNLSDCGCDKEKQGQYHRDEGWKWGGCSADIRYGIGFAKVFVDAREIKQNARTLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 AACTQGNLSDCGCDKEKQGQYHRDEGWKWGGCSADIRYGIGFAKVFVDAREIKQNARTLM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 NLHNNEAGRKILEENMKLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPQFRELGYVLKDKYNEAVHVEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 NLHNNEAGRKILEENMKLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPQFRELGYVLKDKYNEAVHVEP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VRASRNKRPTFLKIKKPLSYRKPMDTDLVYIEKSPNYCEEDPVTGSVGTQGRACNKTAPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 VRASRNKRPTFLKIKKPLSYRKPMDTDLVYIEKSPNYCEEDPVTGSVGTQGRACNKTAPQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE1 ASGCDLMCCGRGYNTHQYARVWQCNCKFHWCCYVKCNTCSERTEMYTCK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 ASGCDLMCCGRGYNTHQYARVWQCNCKFHWCCYVKCNTCSERTEMYTCK
310 320 330 340
>>CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 (349 aa)
initn: 2011 init1: 2011 opt: 2026 Z-score: 2282.6 bits: 430.8 E(32554): 8.1e-121
Smith-Waterman score: 2026; 77.9% identity (94.0% similar) in 349 aa overlap (1-349:1-349)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNRKARRCLGHLFLSLGMVYLRIGGFSSVVALGASIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAII
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CCDS33 MHRNFRKWIFYVFLCFGVLYVKLGALSSVVALGANIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAII
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VIGEGSQMGLDECQFQFRNGRWNCSALGERTVFGKELKVGSREAAFTYAIIAAGVAHAIT
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CCDS33 VIGEGAQMGINECQYQFRFGRWNCSALGEKTVFGQELRVGSREAAFTYAITAAGVAHAVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AACTQGNLSDCGCDKEKQGQYHRDEGWKWGGCSADIRYGIGFAKVFVDAREIKQNARTLM
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CCDS33 AACSQGNLSNCGCDREKQGYYNQAEGWKWGGCSADVRYGIDFSRRFVDAREIKKNARRLM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 NLHNNEAGRKILEENMKLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPQFRELGYVLKDKYNEAVHVEP
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CCDS33 NLHNNEAGRKVLEDRMQLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPKFREVGHLLKEKYNAAVQVEV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VRASRNKRPTFLKIKKPLSYRKPMDTDLVYIEKSPNYCEEDPVTGSVGTQGRACNKTAPQ
::::: ..::::.::. ::.:::.:::::::::::::::: .::::::::: ::.:.:
CCDS33 VRASRLRQPTFLRIKQLRSYQKPMETDLVYIEKSPNYCEEDAATGSVGTQGRLCNRTSPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE1 ASGCDLMCCGRGYNTHQYARVWQCNCKFHWCCYVKCNTCSERTEMYTCK
:.::: ::::::::::::..::::::::::::.:::::::::::..:::
CCDS33 ADGCDTMCCGRGYNTHQYTKVWQCNCKFHWCCFVKCNTCSERTEVFTCK
310 320 330 340
>>CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 (391 aa)
initn: 1207 init1: 409 opt: 1210 Z-score: 1365.0 bits: 261.2 E(32554): 1e-69
Smith-Waterman score: 1210; 49.7% identity (75.7% similar) in 346 aa overlap (8-349:43-380)
10 20 30
pF1KE1 MNRKARRCLGHLFLSLGMVYLRIG-GFSSVVALGASI
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CCDS84 LPLRRASAPVPVPSPAAPDGSRASARLGLACL--LLLLLLTLPARVDTSWWYIGALGARV
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 ICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAIIVIGEGSQMGLDECQFQFRNGRWNCSALG-ERTVFGK
::..::::. ::: .:: :: . .:::.. . ::: :::. ::::..: ..::::.
CCDS84 ICDNIPGLVSRQRQLCQRYPDIMRSVGEGAREWIRECQHQFRHHRWNCTTLDRDHTVFGR
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 ELKVGSREAAFTYAIIAAGVAHAITAACTQGNLSDCGCDKEKQGQYHRDEG-WKWGGCSA
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CCDS84 VMLRSSREAAFVYAISSAGVVHAITRACSQGELSVCSCDPYTRGRHHDQRGDFDWGGCSD
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 DIRYGIGFAKVFVDAREIK-QNARTLMNLHNNEAGRKILEENMKLECKCHGVSGSCTTKT
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CCDS84 NIHYGVRFAKAFVDAKEKRLKDARALMNLHNNRCGRTAVRRFLKLECKCHGVSGSCTLRT
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 CWTTLPQFRELGYVLKDKYNEAVHVEPVRASRNKRPTFLKIKKPLSYRKPMDTDLVYIEK
:: .: .::. : :. .:. ::.: .. . : : .. .::. :::::...
CCDS84 CWRALSDFRRTGDYLRRRYDGAVQVMATQDGAN----FTAARQ--GYRRATRTDLVYFDN
260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 SPNYCEEDPVTGSVGTQGRACNKTAPQASGCDLMCCGRGYNTHQYARVWQCNCKFHWCCY
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CCDS84 SPDYCVLDKAAGSLGTAGRVCSKTSKGTDGCEIMCCGRGYDTTRVTRVTQCECKFHWCCA
310 320 330 340 350 360
340
pF1KE1 VKCNTCSERTEMYTCK
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CCDS84 VRCKECRNTVDVHTCKAPKKAEWLDQT
370 380 390
>>CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 (372 aa)
initn: 1207 init1: 409 opt: 1209 Z-score: 1364.2 bits: 261.0 E(32554): 1.2e-69
Smith-Waterman score: 1209; 51.6% identity (77.6% similar) in 322 aa overlap (31-349:46-361)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNRKARRCLGHLFLSLGMVYLRIGGFSSVVALGASIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAII
:::: .::..::::. ::: .:: :: .
CCDS84 QLKTEGSLRTAVPGIPTQSAFNKCLQRYIGALGARVICDNIPGLVSRQRQLCQRYPDIMR
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110
pF1KE1 VIGEGSQMGLDECQFQFRNGRWNCSALG-ERTVFGKELKVGSREAAFTYAIIAAGVAHAI
.:::.. . ::: :::. ::::..: ..::::. . .::::::.::: .:::.:::
CCDS84 SVGEGAREWIRECQHQFRHHRWNCTTLDRDHTVFGRVMLRSSREAAFVYAISSAGVVHAI
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 TAACTQGNLSDCGCDKEKQGQYHRDEG-WKWGGCSADIRYGIGFAKVFVDAREIK-QNAR
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CCDS84 TRACSQGELSVCSCDPYTRGRHHDQRGDFDWGGCSDNIHYGVRFAKAFVDAKEKRLKDAR
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 TLMNLHNNEAGRKILEENMKLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPQFRELGYVLKDKYNEAVH
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CCDS84 ALMNLHNNRCGRTAVRRFLKLECKCHGVSGSCTLRTCWRALSDFRRTGDYLRRRYDGAVQ
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VEPVRASRNKRPTFLKIKKPLSYRKPMDTDLVYIEKSPNYCEEDPVTGSVGTQGRACNKT
: .. . : : .. .::. :::::...::.:: : ..::.:: ::.:.::
CCDS84 VMATQDGAN----FTAARQ--GYRRATRTDLVYFDNSPDYCVLDKAAGSLGTAGRVCSKT
260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KE1 APQASGCDLMCCGRGYNTHQYARVWQCNCKFHWCCYVKCNTCSERTEMYTCK
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CCDS84 SKGTDGCEIMCCGRGYDTTRVTRVTQCECKFHWCCAVRCKECRNTVDVHTCKAPKKAEWL
310 320 330 340 350 360
CCDS84 DQT
370
>>CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 (351 aa)
initn: 1133 init1: 392 opt: 1173 Z-score: 1324.1 bits: 253.5 E(32554): 2e-67
Smith-Waterman score: 1173; 45.5% identity (72.9% similar) in 354 aa overlap (6-349:4-351)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MNRKARRCLGHLFLSLGMVY-------LRIGGFSSVVALGASIICNKIPGLAPRQRAICQ
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CCDS22 MSPRSCLRSLRLLVFAVFSAAASNWLYLAKLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQMCK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 SRPDAIIVIGEGSQMGLDECQFQFRNGRWNCSALGERTVFGKELKVGSREAAFTYAIIAA
... . .:.:....:::.:::: :::::.: :::: . :.:::::.::: .:
CCDS22 RNLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GVAHAITAACTQGNLSDCGCDKEKQGQYHRDEGWKWGGCSADIRYGIGFAKVFVDAREIK
::: :.: ::..:.: ::::. .: .:..:.::: .: ::..:.. :::.:: .
CCDS22 GVAFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGV--SPQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRERS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 QNA---RTLMNLHNNEAGRKILEENMKLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPQFRELGYVLKD
..: :.:::::::::::: . .:..::::::::::: .:::: ..: ::..:..::.
CCDS22 KGASSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 KYNEAVHVEPVRASRNKRPTFLKIKKPLSYRKPMDTDLVYIEKSPNYCEEDPVTGSVGTQ
:.. :..::: :.. .. . . ... : ::::.: ::..::.: .: .::.
CCDS22 KFDGATEVEPRRVGSSRA----LVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE1 GRACNKTAPQASGCDLMCCGRGYNTHQYARVWQCNCKFHWCCYVKCNTCSERTEMYTCK
::.::::. .::.:.:::::..: : . .:.:::::::.::: :.. .:..::.
CCDS22 GRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
300 310 320 330 340 350
>>CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12 (359 aa)
initn: 693 init1: 693 opt: 1157 Z-score: 1306.0 bits: 250.2 E(32554): 2e-66
Smith-Waterman score: 1157; 47.7% identity (73.4% similar) in 327 aa overlap (32-349:42-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 NRKARRCLGHLFLSLGMVYLRIGGFSSVVALGASIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAIIV
.::. .:...:::.: :: .:: . .
CCDS85 LLSSWAQLLTDANSWWSLALNPVQRPEMFIIGAQPVCSQLPGLSPGQRKLCQLYQEHMAY
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 IGEGSQMGLDECQFQFRNGRWNCSALGERTVFGKELKVGSREAAFTYAIIAAGVAHAITA
::::.. :. ::: :::. :::::. . .:::. ...::::.:::.:. ::::..::.
CCDS85 IGEGAKTGIKECQHQFRQRRWNCSTADNASVFGRVMQIGSRETAFTHAVSAAGVVNAISR
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KE1 ACTQGNLSDCGCDKEKQGQ-YHRDEGWKWGGCSADIRYGIGFAKVFVDAREIKQN-----
:: .:.:: :::.. . . :: : ::::. ...:: ::: :::::: ..:
CCDS85 ACREGELSTCGCSRTARPKDLPRD--WLWGGCGDNVEYGYRFAKEFVDAREREKNFAKGS
140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 ---ARTLMNLHNNEAGRKILEENMKLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPQFRELGYVLKDKY
.:.::::.::::::. . . . ::::::::::. :::: : .::..: ::.::
CCDS85 EEQGRVLMNLQNNEAGRRAVYKMADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLAEFRKVGDRLKEKY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 NEAVHVEPVRASRNKRPTFLKIKKPLSYRKPMDTDLVYIEKSPNYCEEDPVTGSVGTQGR
. :. .:..:. : ... . . .: ::::.. ::.:: .. :::.:::::
CCDS85 DSAA---AMRVTRKGRLELVNSR----FTQPTPEDLVYVDPSPDYCLRNESTGSLGTQGR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KE1 ACNKTAPQASGCDLMCCGRGYNTHQYARVWQCNCKFHWCCYVKCNTCSERTEMYTCK
::::. .::.::::::::: . ..: .:.:::::::.:.:. :.: ...: ::
CCDS85 LCNKTSEGMDGCELMCCGRGYNQFKSVQVERCHCKFHWCCFVRCKKCTEIVDQYICK
310 320 330 340 350
>>CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 (365 aa)
initn: 682 init1: 682 opt: 1140 Z-score: 1286.8 bits: 246.6 E(32554): 2.4e-65
Smith-Waterman score: 1140; 47.0% identity (72.9% similar) in 332 aa overlap (27-349:43-365)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MNRKARRCLGHLFLSLGMVYLRIGGFSSVVALGASIICNKIPGLAPRQRAICQSRP
: : .::. .:... ::. :. .:.
CCDS58 VALAIFFSFAQVVIEANSWWSLGMNNPVQMSEVYIIGAQPLCSQLAGLSQGQKKLCHLYQ
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 DAIIVIGEGSQMGLDECQFQFRNGRWNCSALGERTVFGKELKVGSREAAFTYAIIAAGVA
: . ::::.. :. :::.:::. :::::.. . .:::. ...::::.:::::. ::::.
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230 240 250 260 270 280
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CCDS11 AFVHAIASAGVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKGPP--GEGWKWGGCSEDADFGVLVSR
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CCDS11 EFADARENRPDARSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAI
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CCDS11 GDFLKDKYDSASEMVVEKHRESRGWVET-LRAKYSL-FKPPTERDLVYYENSPNFCEPNP
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pF1KE1 TEMYTCK
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CCDS11 YDVHTCK
350
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CCDS57 CHRHPDVMRAISQGVAEWTAECQHQFRQHRWNCNTLDRDHSLFGRVLLRSSRESAFVYAI
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:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]