Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5978
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5978, 564 aa
1>>>pF1KB5978 564 - 564 aa - 564 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5975+/-0.00133; mu= 0.0625+/- 0.079
mean_var=299.1784+/-59.244, 0's: 0 Z-trim(110.1): 117 B-trim: 96 in 1/51
Lambda= 0.074150
statistics sampled from 11276 (11390) to 11276 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.35), width: 16
Scan time: 3.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 3628 402.2 8.6e-112
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 3594 398.6 1.1e-110
CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 ( 564) 3592 398.4 1.2e-110
CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 2776 311.1 2.4e-84
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 2379 268.6 1.4e-71
CCDS44895.1 KRT3 gene_id:3850|Hs108|chr12 ( 628) 2169 246.2 8.9e-65
CCDS8836.1 KRT1 gene_id:3848|Hs108|chr12 ( 644) 2089 237.6 3.4e-62
CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 ( 638) 2061 234.6 2.7e-61
CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 ( 520) 2041 232.4 1e-60
CCDS8837.1 KRT77 gene_id:374454|Hs108|chr12 ( 578) 1994 227.4 3.6e-59
CCDS8839.1 KRT79 gene_id:338785|Hs108|chr12 ( 535) 1982 226.1 8.4e-59
CCDS8835.1 KRT2 gene_id:3849|Hs108|chr12 ( 639) 1974 225.3 1.7e-58
CCDS8834.1 KRT73 gene_id:319101|Hs108|chr12 ( 540) 1871 214.2 3.2e-55
CCDS8831.1 KRT71 gene_id:112802|Hs108|chr12 ( 523) 1848 211.8 1.7e-54
CCDS8833.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12 ( 511) 1836 210.5 4.1e-54
CCDS8832.1 KRT74 gene_id:121391|Hs108|chr12 ( 529) 1804 207.1 4.5e-53
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 1768 203.3 7.1e-52
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 1714 197.4 3.3e-50
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 1714 197.4 3.3e-50
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 1714 197.4 3.5e-50
CCDS8840.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12 ( 520) 1622 187.6 3.2e-47
CCDS8826.1 KRT82 gene_id:3888|Hs108|chr12 ( 513) 1522 176.9 5.3e-44
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 507) 1449 169.1 1.2e-41
CCDS31805.1 KRT81 gene_id:3887|Hs108|chr12 ( 505) 1432 167.3 4.1e-41
CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12 ( 486) 1392 163.0 7.8e-40
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12 ( 493) 1389 162.6 9.9e-40
CCDS73473.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12 ( 410) 1268 149.6 6.8e-36
CCDS53795.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12 ( 469) 1207 143.2 6.9e-34
CCDS41784.1 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12 ( 422) 1061 127.5 3.2e-29
CCDS8821.2 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12 ( 452) 1061 127.5 3.4e-29
CCDS73472.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 295) 886 108.6 1.1e-23
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 777 97.2 4.8e-20
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 765 96.0 1.4e-19
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 763 95.7 1.5e-19
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 749 94.2 3.9e-19
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 ( 623) 743 93.6 7.4e-19
CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12 ( 470) 734 92.6 1.2e-18
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 688 87.6 3.4e-17
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 688 87.6 3.4e-17
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 688 87.6 3.4e-17
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 665 85.2 1.9e-16
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 660 84.7 3e-16
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 661 85.0 4.3e-16
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 652 83.7 4.8e-16
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 ( 525) 645 83.1 9.4e-16
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 629 81.3 2.9e-15
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 614 79.7 8.7e-15
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 608 79.1 1.4e-14
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 574 75.4 1.6e-13
CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22 (1020) 580 76.4 1.9e-13
>>CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 (564 aa)
initn: 3628 init1: 3628 opt: 3628 Z-score: 2120.5 bits: 402.2 E(32554): 8.6e-112
Smith-Waterman score: 3628; 100.0% identity (100.0% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 VRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGLS
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KB5 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
550 560
>>CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 (564 aa)
initn: 3594 init1: 3594 opt: 3594 Z-score: 2100.8 bits: 398.6 E(32554): 1.1e-110
Smith-Waterman score: 3594; 98.4% identity (100.0% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 VRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS88 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCASLQAAIADAEQRGEMAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGLS
:::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS88 VGQVNVSVVQSTISSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGIGGGFSSSSGRAIGGGLS
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KB5 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
550 560
>>CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 (564 aa)
initn: 3592 init1: 3592 opt: 3592 Z-score: 2099.7 bits: 398.4 E(32554): 1.2e-110
Smith-Waterman score: 3592; 98.6% identity (99.8% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 VRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS88 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 EELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS88 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRATGGGLS
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KB5 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
550 560
>>CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 (590 aa)
initn: 2642 init1: 2491 opt: 2776 Z-score: 1627.7 bits: 311.1 E(32554): 2.4e-84
Smith-Waterman score: 2867; 77.2% identity (90.3% similar) in 588 aa overlap (3-563:2-589)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLG-----GACGGAG
: .... .:.. :.::. :: :.:::..:.::: : . :.::.: :::: .:
CCDS88 MSRQSSVSFRSGGSRSFSTASAITPSVSRTSFTSVSRSGGGGGGGFGRVSLAGACGVGG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 FGSRSLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGG-AGSGFGFGGGAGIGFGLGG
.::::::.:::::::::. .. .. . .:. :::.::::: :::::::::::: ::::::
CCDS88 YGSRSLYNLGGSKRISISTSGGSFRNRFGAGAGGGYGFGGGAGSGFGFGGGAGGGFGLGG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GAGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKF
:::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::
CCDS88 GAGFGGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPSIQRVRTEEREQIKTLNNKF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 ASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGR
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 ASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDE
::::::.::::::::::::::::::::.:::::: :::::::::::::::.::.:.: ::
CCDS88 LDSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLKKDVDAAYMNKVELEAKVDALMDE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 INFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAES
:::.. ..::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::
CCDS88 INFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIANRSRTEAES
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 WYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQ
:::::::::: :::::::::::::.::.:.::::::::.:::.::::::::: :::::::
CCDS88 WYQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRLRAEIDNVKKQCANLQNAIADAEQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 RGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEEC
:::.:::::.::: ::.::::::::.::::.:::::::.::::::::::::::::::::
CCDS88 RGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMNTKLALDVEIATYRKLLEGEEC
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KB5 RLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLG----------LGGGSSYSY-------
::.::::: :::::: :.::::::..:: :.::: :.:::: ::
CCDS88 RLSGEGVGPVNISVVTSSVSSGYGSGSGYGGGLGGGLGGGLGGGLAGGSSGSYYSSSSGG
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KB5 ---GSGLGVGG-GFSSSSGRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
:.::.::: :::.::::..: :..: ::.::..:...:.::::::.:
CCDS88 VGLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGSSSSVKFVSTTSSSRKSFKS
540 550 560 570 580 590
>>CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 (551 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSR-GSGGLGG-ACGGAGFGS
: ...: .:.::::::..:: :...:: ::::::.:: :::::: . .::.:::
CCDS88 MSRQSSITFQSGSRRGFSTTSAITPAAGRSRFSSVSVARSAAGSGGLGRISSAGASFGS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 RSLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGL
::::.:::.::.::.: . . .:.:.::.. .: ..::::.:::.:
CCDS88 RSLYNLGGAKRVSINGCGSSCRSGFGGRASNRFG---VNSGFGYGGGVG-----------
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 AGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFI
:::.::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 -GGFSGPSFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLHLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFI
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 DKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSE
:::::::::::::::::.::::::..::::::::::..: ..:::::.::. :::::..:
CCDS88 DKVRFLEQQNKVLETKWALLQEQGSRTVRQNLEPLFDSYTSELRRQLESITTERGRLEAE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFL
::.:::.::::: .::::::::::::::::.:::::::::::::::.::. .: .::::.
CCDS88 LRNMQDVVEDFKVRYEDEINKRTAAENEFVALKKDVDAAYMNKVELEAKVKSLPEEINFI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 RALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQT
....::::::.::...::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::
CCDS88 HSVFDAELSQLQTQVGDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESWYQT
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 KYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEM
:::::::::::::::::::::::.:.::::::::.::: :::::..::.::::::::::.
CCDS88 KYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEISEMNRMIQRLRAEIDSVKKQCSSLQTAIADAEQRGEL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 ALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNG
:::::. :: ::.::::::::.::::.:::::::.::::::::::::::::::::::.:
CCDS88 ALKDARAKLVDLEEALQKAKQDMARLLREYQELMNIKLALDVEIATYRKLLEGEECRLSG
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KB5 EGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSG-LGLGGGSSYSY--------GSGLGVGGGFSS
:::. :::::: ::.:::::..:..:.: :::::::.::. :.::: :.:::.
CCDS88 EGVSPVNISVVTSTLSSGYGSGSSIGGGNLGLGGGSGYSFTTSGGHSLGAGLG-GSGFSA
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560
pF1KB5 SSGRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
.:.: :: ::..:..:...:.:::.::: :
CCDS88 TSNR----GL---GGSGSSVKFVSTTSSSQKSYTH
530 540 550
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10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
.. ... .:::. :: . : :: .: :. : . :.:. : :..::::::
CCDS44 MSRQASKTSGGGSQGFSGRSAVVSGSSR--MSCVAHSGGAGGGAYGFRSGAGGFGSRS
10 20 30 40 50
70 80 90
pF1KB5 LYGLGGSKRISI------------GGG--SCAISGGYGSRAGGSYG--FGGA-------G
::.:::.: ::: ::: :::..::::. :..:: :::. :
CCDS44 LYNLGGNKSISISVAAGGSRAGGFGGGRSSCAFAGGYGGGFGSGYGGGFGGGFGGGRGMG
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100 110 120 130 140
pF1KB5 SGFG----FGGGAGIG----FGLGGGAGLAGGFGGPGFPVCP--------PGGIQEVTVN
.::: :::..:.: :: :: : .::::::: : ::::::::.:
CCDS44 GGFGGAGGFGGAGGFGGAGGFGGPGGFGGSGGFGGPGSLGSPGGFGPGGFPGGIQEVTIN
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 QSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQ
:::: :::..::: : .:.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
CCDS44 QSLLQPLNVEIDPQIGQVKAQEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWNLLQQQ
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250
pF1KB5 GTKTVR--QNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINK
::... .:::::::..:: :: ::.:.::::::::::..:.:::::::.::::::::
CCDS44 GTSSISGTNNLEPLFENHINYLRSYLDNILGERGRLDSELKNMEDLVEDFKKKYEDEINK
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 RTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVV
::::::::::::::::.:::::::::::.:.: :::.:::.::::::::::.::::::::
CCDS44 RTAAENEFVTLKKDVDSAYMNKVELQAKVDALIDEIDFLRTLYDAELSQMQSHISDTSVV
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 LSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQ
:::::::.::::::::::.::::.:::::.::::. :::: :::.:::::::::::::.
CCDS44 LSMDNNRSLDLDSIIAEVRAQYEDIAQRSKAEAEALYQTKLGELQTTAGRHGDDLRNTKS
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 EIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQ
:: :.::::::::.::. :::: ::::.:::.:::.::::::::. ::. :. :::.::.
CCDS44 EIIELNRMIQRLRAEIEGVKKQNANLQTAIAEAEQHGEMALKDANAKLQELQAALQQAKD
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 DLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVSS----
::::::..:::::::::::::::::::::::::: :..:: . :.::::.:...:
CCDS44 DLARLLRDYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEEYRMSGECPSAVSISVVSSSTTSASAG
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540
pF1KB5 GYGGASGVGSGLGLGGG--------SSYSYGSGLGVGGGFSS-SSGRAIGGGLSSVGGGS
::::. : : : ::::: :... :.: :.::::.. ::: . :.:..:..:.
CCDS44 GYGGGYGGGMGGGLGGGFSAGGGSGSGFGRGGGGGIGGGFGGGSSGFSGGSGFGSISGAR
540 550 560 570 580 590
550 560
pF1KB5 STIKYTTTSSSSRKSYKH
.. ::.: .
CCDS44 YGVSGGGFSSASNRGGSIKFSQSSQSSQRYSR
600 610 620
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10 20 30 40 50
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAG-----
: . . :: : :::..:: . . .: :: :. :: :.:: ..:::.:
CCDS88 MSRQFSSRSGYRSGGGFSSGSAGIINYQRRTTSS-STRRSGGGGGRFSSCGGGGGSFGA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB5 ---FGSRSLYGLGGSKRISI----GGG-SCAISGGYGSRAGGSYGFGGAG-SGFGFGGGA
:::::: .::::: ::: ::: . ...::::. . :. ::::.: .: :.:::.
CCDS88 GGGFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGGYGGGGFGGGGFGGGGFGGGGIGGGG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 GIGFGLGGGAGLAGGFGGPGF-----PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRA
::: :::. .::::: :. ::::::::::::.::::: :::..::: ::.:..
CCDS88 FGGFGSGGGGFGGGGFGGGGYGGGYGPVCPPGGIQEVTINQSLLQPLNVEIDPEIQKVKS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 EEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNL
.::::::.:::.:::::::::::::::.::.::: :::. :.: .:::: ::..::::
CCDS88 REREQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNLEPYFESFINNL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 RRQLDSIVGERGRLDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNK
::..:.. ....::::::..:::.:::..::::::::::: :::::::.:::::.:::.:
CCDS88 RRRVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTIKKDVDGAYMTK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 VELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQY
:.:::: :.: .::.:: :::.::::::::.::.:.:.:::::::.::::::::::::::
CCDS88 VDLQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDLDSIIAEVKAQY
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 EEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQ
:.:::.:.::::: ::.::::::.:::::::..::.: ::.:.::.:::::::::.::::
CCDS88 EDIAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRSEIDNVKKQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 CANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVE
.::: .:.::::::: :::::::::. ::::::.::.::::::..::::::.:::::.:
CCDS88 ISNLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDLE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KB5 IATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLG-GGSSY-----
::::: :::::: :..:: . .:..:: : .. . ::. : :.: : : :::::
CCDS88 IATYRTLLEGEESRMSGECAPNVSVSVSTSHTTISGGGSRG-GGGGGYGSGGSSYGSGGG
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KB5 SYGSGLGVGGGFSS--SSGRAIGGGLSSVG-GGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
::::: : ::: .: :.: . :.: .: : ::.. . . :.:: .:.
CCDS88 SYGSGGGGGGGRGSYGSGGSSYGSGGGSYGSGGGGGGHGSYGSGSSSGGYRGGSGGGGGG
540 550 560 570 580 590
CCDS88 SSGGRGSGGGSSGGSIGGRGSSSGGVKSSGGSSSVKFVSTTYSGVTR
600 610 620 630 640
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10 20 30 40 50
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACG---GAG-F
.: :. .:::. :: . : :: . :.:: :.:: :::: ::: :
CCDS88 MNRQVCKKSFSGRSQGFSGRSAVVSGSSRMS----CVARSGGAGG--GACGFRSGAGSF
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KB5 GSRSLYGLGGSKRISI------------GGG--SCAISGGYGSRAGGSYG--FGGA-GSG
::::::.::..: ::: ::: ::...::::. ::::: :::. : :
CCDS88 GSRSLYNLGSNKSISISVAAGSSRAGGFGGGRSSCGFAGGYGGGFGGSYGGGFGGGRGVG
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 FGFGGGAGIGFGLGG--GAGLAGG---FGGPG-F-PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQI
::::..:.: : :: : :. :: ::::: : : ::::::: :::::: :::..:
CCDS88 SGFGGAGGFG-GAGGFGGPGVFGGPGSFGGPGGFGPGGFPGGIQEVIVNQSLLQPLNVEI
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 DPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEP
:: : .:.:.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.: : . ..:::
CCDS88 DPQIGQVKAQEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWELLQQQTTGSGPSSLEP
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 LFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKK
::.::. : .::::..:::: :..::..:::::::::.::::::::::::::::: :::
CCDS88 CFESYISFLCKQLDSLLGERGNLEGELKSMQDLVEDFKKKYEDEINKRTAAENEFVGLKK
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 DVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDS
:::::.:::::::::.:.::::..:::.::. ::::::.: ::::::::::::: ::: :
CCDS88 DVDAAFMNKVELQAKVDSLTDEVSFLRTLYEMELSQMQSHASDTSVVLSMDNNRCLDLGS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 IIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLR
:::::.::::::::::..:::. :::: :::.:::::::::::::.:: :.::::::::
CCDS88 IIAEVRAQYEEIAQRSKSEAEALYQTKLGELQTTAGRHGDDLRNTKSEIMELNRMIQRLR
360 370 380 390 400 410
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pF1KB5 SEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELM
.::..:::: ::::.:::.::::::::::::. ::. :. ::::::.::::::..:::::
CCDS88 AEIENVKKQNANLQTAIAEAEQRGEMALKDANAKLQDLQTALQKAKDDLARLLRDYQELM
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KB5 NVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVS-SG--------YGGASGV
:::::::::::::::::::::::..:: . : ::::....: :: .::.::
CCDS88 NVKLALDVEIATYRKLLEGEECRMSGECQSAVCISVVSNVTSTSGSSGSSRGVFGGVSGS
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 GSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGLSS--VGGGSSTIKYTTTSSSSRKS
::: : :::: : .:: ::.:: :.:: ::.:: .:: .:. .: ..::.::
CCDS88 GSG-GYKGGSSSSSSSGYGVSGG--SGSGY---GGVSSGSTGGRGSSGSYQSSSSGSRLG
540 550 560 570 580
pF1KB5 YKH
CCDS88 GAGSISVSHSGMGSSSGSIQTSGGSGYKSGGGGSTSIRFSQTTSSSQHSSTK
590 600 610 620 630
>>CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 (520 aa)
initn: 2085 init1: 1875 opt: 2041 Z-score: 1203.4 bits: 232.4 E(32554): 1e-60
Smith-Waterman score: 2132; 67.2% identity (85.6% similar) in 521 aa overlap (16-535:13-510)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
:::: .:: . : .:..:::::.: :: .: :...::::::
CCDS41 MIARQQCVRGGPRGFSCGSAIVGGGKRGAFSSVSMS-----GG-AGRCSSGGFGSRS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
::.: :.: ::. : : ::: :. ::::: ::: : ::: :: .: .
CCDS41 LYNLRGNKSISM---SVA-----GSRQGAC--FGGAG---GFGTG---GFG-GGFGGSFS
60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
: ::::::::: :::::::.::::::::...::: ::.::.::::::: :::::::::::
CCDS41 GKGGPGFPVCPAGGIQEVTINQSLLTPLHVEIDPEIQKVRTEEREQIKLLNNKFASFIDK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 VRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
:.:::::::::::::.:::.: : : .::::::: :.. ::.:::.. ...:::.:::.
CCDS41 VQFLEQQNKVLETKWNLLQQQTTTTSSKNLEPLFETYLSVLRKQLDTLGNDKGRLQSELK
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
::: :::::.:::.::::::::::.::.:::::::::.:::::.::.:.:.::::::..
CCDS41 TMQDSVEDFKTKYEEEINKRTAAENDFVVLKKDVDAAYLNKVELEAKVDSLNDEINFLKV
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
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