FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6427, 621 aa 1>>>pF1KE6427 621 - 621 aa - 621 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7136+/-0.00117; mu= 16.2801+/- 0.070 mean_var=63.0747+/-12.488, 0's: 0 Z-trim(100.1): 24 B-trim: 0 in 0/47 Lambda= 0.161490 statistics sampled from 5977 (5998) to 5977 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.533), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16 Scan time: 2.780 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3053.1 ACAD9 gene_id:28976|Hs108|chr3 ( 621) 3995 940.2 0 CCDS11090.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 655) 1697 404.9 1.8e-112 CCDS58509.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 678) 1697 404.9 1.8e-112 CCDS42249.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 633) 1696 404.6 2e-112 CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 ( 432) 782 191.6 1.8e-48 CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 ( 426) 770 188.8 1.2e-47 CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 ( 412) 755 185.3 1.4e-46 CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 ( 330) 742 182.3 9e-46 CCDS53930.1 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 ( 396) 740 181.8 1.5e-45 CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 385) 730 179.5 7.2e-45 CCDS668.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 421) 726 178.6 1.5e-44 CCDS44165.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 425) 726 178.6 1.5e-44 CCDS72807.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 454) 657 162.5 1.1e-39 CCDS8498.1 ACAD8 gene_id:27034|Hs108|chr11 ( 415) 623 154.6 2.5e-37 CCDS2389.1 ACADL gene_id:33|Hs108|chr2 ( 430) 575 143.4 5.9e-34 CCDS76610.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 ( 408) 474 119.9 6.8e-27 CCDS3074.1 ACAD11 gene_id:84129|Hs108|chr3 ( 780) 451 114.6 5.1e-25 CCDS31903.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12 (1059) 431 110.0 1.7e-23 CCDS44973.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12 (1090) 431 110.0 1.8e-23 CCDS12286.1 GCDH gene_id:2639|Hs108|chr19 ( 438) 385 99.1 1.3e-20 >>CCDS3053.1 ACAD9 gene_id:28976|Hs108|chr3 (621 aa) initn: 3995 init1: 3995 opt: 3995 Z-score: 5026.7 bits: 940.2 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3995; 100.0% identity (100.0% similar) in 621 aa overlap (1-621:1-621) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MSGCGLFLRTTAAARACRGLVVSTANRRLLRTSPPVRAFAKELFLGKIKKKEVFPFPEVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 MSGCGLFLRTTAAARACRGLVVSTANRRLLRTSPPVRAFAKELFLGKIKKKEVFPFPEVS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 QDELNEINQFLGPVEKFFTEEVDSRKIDQEGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEEYGGLGF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 QDELNEINQFLGPVEKFFTEEVDSRKIDQEGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEEYGGLGF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 SNTMYSRLGEIISMDGSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGEHIAAFCL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 SNTMYSRLGEIISMDGSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGEHIAAFCL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 TEPASGSDAASIRSRATLSEDKKHYILNGSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVDSDGSVKD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 TEPASGSDAASIRSRATLSEDKKHYILNGSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVDSDGSVKD 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 KITAFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDGFKVAMNIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 KITAFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDGFKVAMNIL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 NSGRFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 NSGRFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 YLTAGMLDQPGFPDCSIEAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPYERILRDTR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 YLTAGMLDQPGFPDCSIEAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPYERILRDTR 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE6 ILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRILTTRIHELKQAKVSTVMDTVGRRLRDSLGRTVD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 ILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRILTTRIHELKQAKVSTVMDTVGRRLRDSLGRTVD 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE6 LGLTGNHGVVHPSLADSANKFEENTYCFGRTVETLLLRFGKTIMEEQLVLKRVANILINL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 LGLTGNHGVVHPSLADSANKFEENTYCFGRTVETLLLRFGKTIMEEQLVLKRVANILINL 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE6 YGMTAVLSRASRSIRIGLRNHDHEVLLANTFCVEAYLQNLFSLSQLDKYAPENLDEQIKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 YGMTAVLSRASRSIRIGLRNHDHEVLLANTFCVEAYLQNLFSLSQLDKYAPENLDEQIKK 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KE6 VSQQILEKRAYICAHPLDRTC ::::::::::::::::::::: CCDS30 VSQQILEKRAYICAHPLDRTC 610 620 >>CCDS11090.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 (655 aa) initn: 948 init1: 566 opt: 1697 Z-score: 2132.8 bits: 404.9 E(32554): 1.8e-112 Smith-Waterman score: 1697; 46.6% identity (75.0% similar) in 599 aa overlap (29-617:60-653) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MSGCGLFLRTTAAARACRGLVVSTANRRLLRTSPP---VRAFAKELFLGKIKKKEVFP : : .: ..:: .: :.. .::: CCDS11 QPRPGPARRPYAGGAAQLALDKSDSHPSDALTRKKPAKAESKSFAVGMFKGQLTTDQVFP 30 40 50 60 70 80 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 FPEVSQDELNE-INQFLGPVEKFFTEEVDSRKIDQEGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEE .: : ..: .. ..... :: .:: : : : : . . : . :: :: :::::: : CCDS11 YPSVLNEEQTQFLKELVEPVSRFFEEVNDPAKNDALEMVEETTWQGLKELGAFGLQVPSE 90 100 110 120 130 140 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 YGGLGFSNTMYSRLGEIISM-DGSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGE ::.:. ::.:.:: ::..: : .. .::.:::.::.:::.: ::. :: :::::::::: CCDS11 LGGVGLCNTQYARLVEIVGMHDLGVGITLGAHQSIGFKGILLFGTKAQKEKYLPKLASGE 150 160 170 180 190 200 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 HIAAFCLTEPASGSDAASIRSRATLSEDKKHYILNGSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVD .::::::::.:::::::::. :. : :.: :::::.::.:::::.:::::::: :.: CCDS11 TVAAFCLTEPSSGSDAASIRTSAVPSPCGKYYTLNGSKLWISNGGLADIFTVFAKTPVTD 210 220 230 240 250 260 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 -SDGSVKDKITAFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDG . :.::.:::::.::: :::.:.: :: :.::..::: :: :.....: ::.:::::.: CCDS11 PATGAVKEKITAFVVERGFGGITHGPPEKKMGIKASNTAEVFFDGVRVPSENVLGEVGSG 270 280 290 300 310 320 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 FKVAMNILNSGRFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQK :::::.:::.:::.:....:: .. .: ....: .: ::.... .:::::::.: :.. CCDS11 FKVAMHILNNGRFGMAAALAGTMRGIIAKAVDHATNRTQFGEKIHNFGLIQEKLARMVML 330 340 350 360 370 380 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 AYVMESMTYLTAGMLDQPGFPDCSIEAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPY :: :::.:.... .:: : : .::::. :.:.:::::. ..: .::.::.:. .. CCDS11 QYVTESMAYMVSANMDQ-GATDFQIEAAISKIFGSEAAWKVTDECIQIMGGMGFMKEPGV 390 400 410 420 430 440 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 ERILRDTRILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRILTTRIHELKQ--AKVSTVMDTVGRR ::.::: ::. ::::::.:::...:: : . :. :. ::. .... .. .:.. CCDS11 ERVLRDLRIFRIFEGTNDILRLFVALQGCMDKGKELSGLGSALKNPFGNAGLLLGEAGKQ 450 460 470 480 490 500 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 LRDSLGRTVDLGLTGNHGVVHPSLADSANKFEENTYCFGRTVETLLLRFGKTIMEEQLVL :: : :.:. :.::: :. :.. . :. .::. :.. : :..::..: CCDS11 LRRRAGLGSGLSLS---GLVHPELSRSGELAVRALEQFATVVEAKLIKHKKGIVNEQFLL 510 520 530 540 550 560 540 550 560 570 580 pF1KE6 KRVANILINLYGMTAVLSRASRSIRIGLRNHDHEVLLANTFCVEA--YLQNLFSLSQLDK .:.:. :.::.:..::::::::. : . .:: .: .:.:.:: ... .. : : CCDS11 QRLADGAIDLYAMVVVLSRASRSLSEGHPTAQHEKMLCDTWCIEAAARIREGMAALQSDP 570 580 590 600 610 620 590 600 610 620 pF1KE6 YAPENLDEQIKKVSQQILEKRAYICAHPLDRTC . : : ...:..:. ..:. . . ..:: CCDS11 WQQE-LYRNFKSISKALVERGGVVTSNPLGF 630 640 650 >>CCDS58509.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 (678 aa) initn: 948 init1: 566 opt: 1697 Z-score: 2132.5 bits: 404.9 E(32554): 1.8e-112 Smith-Waterman score: 1697; 46.6% identity (75.0% similar) in 599 aa overlap (29-617:83-676) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MSGCGLFLRTTAAARACRGLVVSTANRRLLRTSPP---VRAFAKELFLGKIKKKEVFP : : .: ..:: .: :.. .::: CCDS58 QPRPGPARRPYAGGAAQLALDKSDSHPSDALTRKKPAKAESKSFAVGMFKGQLTTDQVFP 60 70 80 90 100 110 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 FPEVSQDELNE-INQFLGPVEKFFTEEVDSRKIDQEGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEE .: : ..: .. ..... :: .:: : : : : . . : . :: :: :::::: : CCDS58 YPSVLNEEQTQFLKELVEPVSRFFEEVNDPAKNDALEMVEETTWQGLKELGAFGLQVPSE 120 130 140 150 160 170 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 YGGLGFSNTMYSRLGEIISM-DGSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGE ::.:. ::.:.:: ::..: : .. .::.:::.::.:::.: ::. :: :::::::::: CCDS58 LGGVGLCNTQYARLVEIVGMHDLGVGITLGAHQSIGFKGILLFGTKAQKEKYLPKLASGE 180 190 200 210 220 230 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 HIAAFCLTEPASGSDAASIRSRATLSEDKKHYILNGSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVD .::::::::.:::::::::. :. : :.: :::::.::.:::::.:::::::: :.: CCDS58 TVAAFCLTEPSSGSDAASIRTSAVPSPCGKYYTLNGSKLWISNGGLADIFTVFAKTPVTD 240 250 260 270 280 290 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 -SDGSVKDKITAFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDG . :.::.:::::.::: :::.:.: :: :.::..::: :: :.....: ::.:::::.: CCDS58 PATGAVKEKITAFVVERGFGGITHGPPEKKMGIKASNTAEVFFDGVRVPSENVLGEVGSG 300 310 320 330 340 350 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 FKVAMNILNSGRFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQK :::::.:::.:::.:....:: .. .: ....: .: ::.... .:::::::.: :.. CCDS58 FKVAMHILNNGRFGMAAALAGTMRGIIAKAVDHATNRTQFGEKIHNFGLIQEKLARMVML 360 370 380 390 400 410 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 AYVMESMTYLTAGMLDQPGFPDCSIEAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPY :: :::.:.... .:: : : .::::. :.:.:::::. ..: .::.::.:. .. CCDS58 QYVTESMAYMVSANMDQ-GATDFQIEAAISKIFGSEAAWKVTDECIQIMGGMGFMKEPGV 420 430 440 450 460 470 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 ERILRDTRILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRILTTRIHELKQ--AKVSTVMDTVGRR ::.::: ::. ::::::.:::...:: : . :. :. ::. .... .. .:.. CCDS58 ERVLRDLRIFRIFEGTNDILRLFVALQGCMDKGKELSGLGSALKNPFGNAGLLLGEAGKQ 480 490 500 510 520 530 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 LRDSLGRTVDLGLTGNHGVVHPSLADSANKFEENTYCFGRTVETLLLRFGKTIMEEQLVL :: : :.:. :.::: :. :.. . :. .::. :.. : :..::..: CCDS58 LRRRAGLGSGLSLS---GLVHPELSRSGELAVRALEQFATVVEAKLIKHKKGIVNEQFLL 540 550 560 570 580 540 550 560 570 580 pF1KE6 KRVANILINLYGMTAVLSRASRSIRIGLRNHDHEVLLANTFCVEA--YLQNLFSLSQLDK .:.:. :.::.:..::::::::. : . .:: .: .:.:.:: ... .. : : CCDS58 QRLADGAIDLYAMVVVLSRASRSLSEGHPTAQHEKMLCDTWCIEAAARIREGMAALQSDP 590 600 610 620 630 640 590 600 610 620 pF1KE6 YAPENLDEQIKKVSQQILEKRAYICAHPLDRTC . : : ...:..:. ..:. . . ..:: CCDS58 WQQE-LYRNFKSISKALVERGGVVTSNPLGF 650 660 670 >>CCDS42249.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 (633 aa) initn: 948 init1: 566 opt: 1696 Z-score: 2131.8 bits: 404.6 E(32554): 2e-112 Smith-Waterman score: 1696; 46.9% identity (75.7% similar) in 588 aa overlap (37-617:49-631) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 FLRTTAAARACRGLVVSTANRRLLRTSPPVRAFAKELFLGKIKKKEVFPFPEVSQDELNE ..:: .: :.. .:::.: : ..: .. CCDS42 GGSSRLTALLGQPRPGPARRPYAGGAAQESKSFAVGMFKGQLTTDQVFPYPSVLNEEQTQ 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 -INQFLGPVEKFFTEEVDSRKIDQEGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEEYGGLGFSNTMY ..... :: .:: : : : : . . : . :: :: :::::: : ::.:. ::.: CCDS42 FLKELVEPVSRFFEEVNDPAKNDALEMVEETTWQGLKELGAFGLQVPSELGGVGLCNTQY 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 SRLGEIISM-DGSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGEHIAAFCLTEPA .:: ::..: : .. .::.:::.::.:::.: ::. :: :::::::::: .::::::::. CCDS42 ARLVEIVGMHDLGVGITLGAHQSIGFKGILLFGTKAQKEKYLPKLASGETVAAFCLTEPS 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 SGSDAASIRSRATLSEDKKHYILNGSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVD-SDGSVKDKIT :::::::::. :. : :.: :::::.::.:::::.:::::::: :.: . :.::.::: CCDS42 SGSDAASIRTSAVPSPCGKYYTLNGSKLWISNGGLADIFTVFAKTPVTDPATGAVKEKIT 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 AFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDGFKVAMNILNSG ::.::: :::.:.: :: :.::..::: :: :.....: ::.:::::.::::::.:::.: CCDS42 AFVVERGFGGITHGPPEKKMGIKASNTAEVFFDGVRVPSENVLGEVGSGFKVAMHILNNG 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 RFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMTYLT ::.:....:: .. .: ....: .: ::.... .:::::::.: :.. :: :::.:.. CCDS42 RFGMAAALAGTMRGIIAKAVDHATNRTQFGEKIHNFGLIQEKLARMVMLQYVTESMAYMV 320 330 340 350 360 370 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 AGMLDQPGFPDCSIEAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPYERILRDTRILL .. .:: : : .::::. :.:.:::::. ..: .::.::.:. .. ::.::: ::. CCDS42 SANMDQ-GATDFQIEAAISKIFGSEAAWKVTDECIQIMGGMGFMKEPGVERVLRDLRIFR 380 390 400 410 420 430 430 440 450 460 470 480 pF1KE6 IFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRILTTRIHELKQ--AKVSTVMDTVGRRLRDSLGRTVDL ::::::.:::...:: : . :. :. ::. .... .. .:..:: : : CCDS42 IFEGTNDILRLFVALQGCMDKGKELSGLGSALKNPFGNAGLLLGEAGKQLRRRAGLGSGL 440 450 460 470 480 490 490 500 510 520 530 540 pF1KE6 GLTGNHGVVHPSLADSANKFEENTYCFGRTVETLLLRFGKTIMEEQLVLKRVANILINLY .:.: .::: :. :.. . :. .::. :.. : :..::..:.:.:. :.:: CCDS42 SLSG---LVHPELSRSGELAVRALEQFATVVEAKLIKHKKGIVNEQFLLQRLADGAIDLY 500 510 520 530 540 550 550 560 570 580 590 pF1KE6 GMTAVLSRASRSIRIGLRNHDHEVLLANTFCVEA--YLQNLFSLSQLDKYAPENLDEQIK .:..::::::::. : . .:: .: .:.:.:: ... .. : : . : : ...: CCDS42 AMVVVLSRASRSLSEGHPTAQHEKMLCDTWCIEAAARIREGMAALQSDPWQQE-LYRNFK 560 570 580 590 600 610 600 610 620 pF1KE6 KVSQQILEKRAYICAHPLDRTC ..:. ..:. . . ..:: CCDS42 SISKALVERGGVVTSNPLGF 620 630 >>CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 (432 aa) initn: 647 init1: 335 opt: 782 Z-score: 983.7 bits: 191.6 E(32554): 1.8e-48 Smith-Waterman score: 782; 38.6% identity (69.3% similar) in 368 aa overlap (74-437:68-425) 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 FLGKIKKKEVFPFPEVSQDELNEINQFLGPVEKFFTEEVDS--RKIDQEGKIPDETLEKL :.:: :.. .:...:. ... : CCDS76 SEALLNITNNGIHFAPLQTFTDEEMMIKSSVKKFAQEQIAPLVSTMDENSKMEKSVIQGL 40 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 pF1KE6 KSLGLFGLQVPEEYGGLG--FSNTMYSRLGEIISMDGSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTE . ::.:..: :::: : : .:. . :. ..:.:..: .... : ::: CCDS76 FQQGLMGIEVDPEYGGTGASFLSTVLV-IEELAKVDASVAVFCEIQNTLINTLIRKHGTE 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 EQKAKYLPKLASGEHIAAFCLTEPASGSDAASIRSRATLSEDKKHYILNGSKVWITNGGL :::: :::.:.. :....:::.: ..:::. ....:: : .:.:::::.::... CCDS76 EQKATYLPQLTT-EKVGSFCLSEAGAGSDSFALKTRADKEGD--YYVLNGSKMWISSAEH 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE6 ANIFTVFAKTEVVDSDGSVKDKITAFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTK :..: :.:. :: . : ::.:.:.:: :. ::::.:::.:.:.:: . :::.: CCDS76 AGLFLVMAN---VDPTIGYKG-ITSFLVDRDTPGLHIGKPENKLGLRASSTCPLTFENVK 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 IPVENILGEVGDGFKVAMNILNSGRFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEF .: ::::..: :.: :.. :: ::..... . :: . ...: : : ::.::: .: CCDS76 VPEANILGQIGHGYKYAIGSLNEGRIGIAAQMLGLAQGCFDYTIPYIKERIQFGKRLFDF 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 GLIQEKFALMAQKAYVMESMTYLTAGMLDQPGFPDCSIEAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQ .:.. : .: . . . .:: .: .:. : : . ::.:.: ..:: : : .:. .. CCDS76 QGLQHQVAHVATQLEAARLLTYNAARLLEA-GKPFIK-EASMAKYYASEIAGQTTSKCIE 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KE6 ILGGLGYTRDYPYERILRDTRILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRILTTRIHELKQAK .::.:::.::: :. .::..: :.::...: :: CCDS76 WMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKIGTIYEGASNIQLNTIAKHIDAEY 390 400 410 420 430 460 470 480 490 500 510 pF1KE6 VSTVMDTVGRRLRDSLGRTVDLGLTGNHGVVHPSLADSANKFEENTYCFGRTVETLLLRF >>CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 (426 aa) initn: 661 init1: 227 opt: 770 Z-score: 968.7 bits: 188.8 E(32554): 1.2e-47 Smith-Waterman score: 770; 34.5% identity (66.0% similar) in 429 aa overlap (14-436:5-417) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MSGCGLFLRTTAAARACRGLVVSTANRRLLRTSPPVRAFAKELFLGKIKKKEVFPFPEVS : : : : .:. :: ::. .:... . . ..: .. CCDS10 MAEMATATRLLGWRVASWRL---RPPLAGFVSQ------RAHSLLPVDDAI 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KE6 QDELNEINQFLGPVEKFFTEEV--DSRKIDQEGKIPD--ETLEKLKSLGLFGLQVPEEYG . .: :. . ::. :.. ...::. ... . : ..: .::..:. .: .:: CCDS10 NGLSEEQRQLRQTMAKFLQEHLAPKAQEIDRSNEFKNLREFWKQLGNLGVLGITAPVQYG 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 GLGFSNTMYSRLGEIIS-MDGSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGEHI : :.. . . : :: .:.. .. .::. . .. .. :.: :: :::::: :::.: CCDS10 GSGLGYLEHVLVMEEISRASGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYI 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 AAFCLTEPASGSDAASIRSRATLSEDKKHYILNGSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVDSD .:. ..:: .:::..:.. .: . .::::::.: ::::: :... :.:::... CCDS10 GALAMSEPNAGSDVVSMKLKAE--KKGNHYILNGNKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVP 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 GSVKDKITAFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDGFKV .: :::::::. . : ...: ::::.:::::::. ::. :::. ::::. . : : CCDS10 AS--RGITAFIVEKGMPGFSTSKKLDKLGMRGSNTCELIFEDCKIPAANILGHENKGVYV 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 AMNILNSGRFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQKAYV :. :. :. ... ::.. ... : : .:. :......: :.: :.: : . .. CCDS10 LMSGLDLERLVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMA 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 MESMTYLTAGMLDQPGFPDCSI-EAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPYER ....: .: :. : :. . : : ..:.: : : . ...: .:: :: :.:. : CCDS10 CRQYVYNVAKACDE-GH--CTAKDCAGVILYSAECATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGR 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 ILRDTRILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRILTTRIHELKQAKVSTVMDTVGRRLRDS .:::... : ::.:. :. : CCDS10 FLRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH 400 410 420 >>CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 (412 aa) initn: 700 init1: 283 opt: 755 Z-score: 950.0 bits: 185.3 E(32554): 1.4e-46 Smith-Waterman score: 755; 39.3% identity (67.8% similar) in 382 aa overlap (63-437:33-403) 40 50 60 70 80 pF1KE6 SPPVRAFAKELFLGKIKKKEVFPFPEVSQDELNEINQFLGPVEKFFTEEVD---SRKIDQ :: : .:.: . . :.:. . ..:. CCDS92 AALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKELFPIAAQVDK 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 EGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEEYGGLGFSNTMYSRLGEIISMD-GSITVTLAAHQAI : .: ..:. .:::....:::: :: :.. :. : :: .: : ....... CCDS92 EHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTGVIMSVNNSL 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 GLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGEHIAAFCLTEPASGSDAASIRSRATLSEDKKHYILN : :. :..::: .. ..::..:. : :.::..::::.. . : :. ..:: CCDS92 YLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTARAEGDS--WVLN 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 GSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVDSDGSVKDK-ITAFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRG :.:.::::. :. .:::.: : ....: :.::.: :.: :: :::::::: CCDS92 GTKAWITNAWEASAAVVFAST-----DRALQNKGISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGIRG 190 200 210 220 230 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 SNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDGFKVAMNILNSGRFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYAC :.: .. ::. .:: ..:::: : :::.::. :. ::....: . :. . .. ...:: CCDS92 SSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDCAVNYAE 240 250 260 270 280 290 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 TRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMTYLT--AGMLDQPGFPDCSIEAAMVKVF .: :. :... .:: :.: :: ..:: :: :.:: . : . ::::.:. CCDS92 NRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMA---LALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIK-EAAMAKLA 300 310 320 330 340 350 390 400 410 420 430 440 pF1KE6 SSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPYERILRDTRILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAG .:::: .:.:::::.::. ..: :: ::.:: :.:::.:: :. :: CCDS92 ASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRSYR 360 370 380 390 400 410 450 460 470 480 490 500 pF1KE6 RILTTRIHELKQAKVSTVMDTVGRRLRDSLGRTVDLGLTGNHGVVHPSLADSANKFEENT CCDS92 S >>CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 (330 aa) initn: 634 init1: 335 opt: 742 Z-score: 935.2 bits: 182.3 E(32554): 9e-46 Smith-Waterman score: 742; 39.8% identity (70.8% similar) in 332 aa overlap (108-437:2-323) 80 90 100 110 120 130 pF1KE6 FTEEVDSRKIDQEGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEEYGGLG--FSNTMYSRLGEIISMD :..: :::: : : .:. . :. ..: CCDS81 MGIEVDPEYGGTGASFLSTVLV-IEELAKVD 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KE6 GSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGEHIAAFCLTEPASGSDAASIRSR .:..: .... : ::::::: :::.:.. :....:::.: ..:::. ....: CCDS81 ASVAVFCEIQNTLINTLIRKHGTEEQKATYLPQLTT-EKVGSFCLSEAGAGSDSFALKTR 40 50 60 70 80 200 210 220 230 240 250 pF1KE6 ATLSEDKKHYILNGSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVDSDGSVKDKITAFIVERDFGGVT : ... .:.:::::.::... :..: :.:. :: . : ::.:.:.:: :. CCDS81 A--DKEGDYYVLNGSKMWISSAEHAGLFLVMAN---VDPTIGYKG-ITSFLVDRDTPGLH 90 100 110 120 130 140 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 NGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDGFKVAMNILNSGRFSMGSVVAGLL ::::.:::.:.:.:: . :::.:.: ::::..: :.: :.. :: ::..... . :: CCDS81 IGKPENKLGLRASSTCPLTFENVKVPEANILGQIGHGYKYAIGSLNEGRIGIAAQMLGLA 150 160 170 180 190 200 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 KRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMTYLTAGMLDQPGFPDC . ...: : : ::.::: .: .:.. : .: . . . .:: .: .:. : : CCDS81 QGCFDYTIPYIKERIQFGKRLFDFQGLQHQVAHVATQLEAARLLTYNAARLLEA-GKPFI 210 220 230 240 250 260 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 SIEAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPYERILRDTRILLIFEGTNEILRMY . ::.:.: ..:: : : .:. .. .::.:::.::: :. .::..: :.::...: CCDS81 K-EASMAKYYASEIAGQTTSKCIEWMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKIGTIYEGASNIQLNT 270 280 290 300 310 320 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 IALTGLQHAGRILTTRIHELKQAKVSTVMDTVGRRLRDSLGRTVDLGLTGNHGVVHPSLA :: CCDS81 IAKHIDAEY 330 >>CCDS53930.1 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 (396 aa) initn: 661 init1: 227 opt: 740 Z-score: 931.4 bits: 181.8 E(32554): 1.5e-45 Smith-Waterman score: 740; 38.4% identity (69.2% similar) in 344 aa overlap (96-436:52-387) 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 EINQFLGPVEKFFTEEVDSRKIDQEGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEEYGGLGFSNTMY : ..: .::..:. .: .::: :.. . CCDS53 PPLAGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQEFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEH 30 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 SRLGEIIS-MDGSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGEHIAAFCLTEPA . : :: .:.. .. .::. . .. .. :.: :: :::::: :::.:.:. ..:: CCDS53 VLVMEEISRASGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPN 90 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 SGSDAASIRSRATLSEDK-KHYILNGSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVDSDGSVKDKIT .:::..:.. .: : : .::::::.: ::::: :... :.:::... .: :: CCDS53 AGSDVVSMKLKA---EKKGNHYILNGNKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPAS--RGIT 150 160 170 180 190 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 AFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDGFKVAMNILNSG :::::. . : ...: ::::.:::::::. ::. :::. ::::. . : : :. :. CCDS53 AFIVEKGMPGFSTSKKLDKLGMRGSNTCELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLE 200 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 RFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMTYLT :. ... ::.. ... : : .:. :......: :.: :.: : . .. ....: . CCDS53 RLVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNV 260 270 280 290 300 310 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 AGMLDQPGFPDCSI-EAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPYERILRDTRIL : :. : :. . : : ..:.: : : . ...: .:: :: :.:. :.:::... CCDS53 AKACDE-G--HCTAKDCAGVILYSAECATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLY 320 330 340 350 360 370 430 440 450 460 470 480 pF1KE6 LIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRILTTRIHELKQAKVSTVMDTVGRRLRDSLGRTVDLG : ::.:. :. : CCDS53 EIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH 380 390 >>CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 (385 aa) initn: 641 init1: 230 opt: 730 Z-score: 919.0 bits: 179.5 E(32554): 7.2e-45 Smith-Waterman score: 730; 34.3% identity (67.8% similar) in 379 aa overlap (61-437:3-376) 40 50 60 70 80 pF1KE6 RTSPPVRAFAKELFLGKIKKKEVFPFPEVSQDELNEINQFLGPVEKFFTEEVD--SRKID :. .. ..: . ..:: ::. . . : CCDS65 MLQEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVAAEYD 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 QEGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEEYGGLGFSNTMYSRLGEIISMDGSITVTLAAHQAI . :. : ... :::.. ..::. ::::... ..: ... . . : ... CCDS65 KTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGCTGVQTAIEGNSL 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 GLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGEHIAAFCLTEPASGSDAASIRSRATLSEDKKHYILN : ::.::...:: ::: ... . :.:.:::..:::.:.:...: . :. ::.: CCDS65 GQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDE--YIIN 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 GSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVDSDGSVKDKITAFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGS :.:.:::::: :: . ..:... : . .. .:.:::: : :. :. : ..: : : CCDS65 GQKMWITNGGKANWYFLLARSDP-DPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQRCS 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 NTCEVHFENTKIPVENILGEVGDGFKVAMNILNSGRFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACT .: . ::..:.: ::.: : ::::::. ... : ... ..:: .: .. ...:: CCDS65 DTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATKYALE 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 RKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMTYLTAGMLDQPGFPDCSIEAAMVKVFSSE :: :.: : : :. .: ::.:. . :.: :. . : . . :...:.:... CCDS65 RKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVE-LARMSYQRAAWEVDSGRRN-TYYASIAKAFAGD 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 pF1KE6 AAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPYERILRDTRILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRIL : : ...:.::::: :.. .:: :...::..: :.:::..: :. .: CCDS65 IANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYKN 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 pF1KE6 TTRIHELKQAKVSTVMDTVGRRLRDSLGRTVDLGLTGNHGVVHPSLADSANKFEENTYCF 621 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 13:11:16 2016 done: Tue Nov 8 13:11:17 2016 Total Scan time: 2.780 Total Display time: 0.110 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]