Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7783
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7783, 457 aa
1>>>pF1KB7783 457 - 457 aa - 457 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7964+/-0.000416; mu= -10.2044+/- 0.026
mean_var=549.6681+/-132.083, 0's: 0 Z-trim(124.0): 691 B-trim: 4906 in 2/58
Lambda= 0.054705
statistics sampled from 43455 (44836) to 43455 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.799), E-opt: 0.2 (0.526), width: 16
Scan time: 11.460
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001721 (OMIM: 602903) Krueppel-like factor 5 is ( 457) 3180 265.5 2.1e-70
NP_001273747 (OMIM: 602903) Krueppel-like factor 5 ( 366) 2537 214.6 3.5e-55
XP_016863768 (OMIM: 609392) PREDICTED: Krueppel-li ( 320) 624 63.6 8.9e-10
NP_057615 (OMIM: 609392) Krueppel-like factor 3 [H ( 345) 624 63.6 9.4e-10
XP_011533213 (OMIM: 607531) PREDICTED: Krueppel-li ( 383) 608 62.4 2.4e-09
XP_011533214 (OMIM: 607531) PREDICTED: Krueppel-li ( 383) 608 62.4 2.4e-09
XP_016875873 (OMIM: 607531) PREDICTED: Krueppel-li ( 393) 608 62.4 2.4e-09
XP_011533212 (OMIM: 607531) PREDICTED: Krueppel-li ( 400) 608 62.5 2.5e-09
XP_005266308 (OMIM: 607531) PREDICTED: Krueppel-li ( 402) 608 62.5 2.5e-09
NP_009180 (OMIM: 607531) Krueppel-like factor 12 [ ( 402) 608 62.5 2.5e-09
XP_011533211 (OMIM: 607531) PREDICTED: Krueppel-li ( 402) 608 62.5 2.5e-09
XP_011533209 (OMIM: 607531) PREDICTED: Krueppel-li ( 415) 608 62.5 2.5e-09
XP_016875874 (OMIM: 607531) PREDICTED: Krueppel-li ( 352) 606 62.2 2.5e-09
XP_011529061 (OMIM: 300286) PREDICTED: Krueppel-li ( 354) 591 61.0 5.8e-09
XP_016884739 (OMIM: 300286) PREDICTED: Krueppel-li ( 354) 591 61.0 5.8e-09
NP_001311034 (OMIM: 300286) Krueppel-like factor 8 ( 356) 591 61.1 5.8e-09
NP_009181 (OMIM: 300286) Krueppel-like factor 8 is ( 359) 591 61.1 5.8e-09
NP_001311031 (OMIM: 300286) Krueppel-like factor 8 ( 359) 591 61.1 5.8e-09
XP_005262036 (OMIM: 300286) PREDICTED: Krueppel-li ( 359) 591 61.1 5.8e-09
XP_005262034 (OMIM: 300286) PREDICTED: Krueppel-li ( 359) 591 61.1 5.8e-09
NP_001311033 (OMIM: 300286) Krueppel-like factor 8 ( 364) 591 61.1 5.9e-09
NP_057354 (OMIM: 602016) Krueppel-like factor 2 [H ( 355) 588 60.8 6.8e-09
NP_001291 (OMIM: 176807,602053,613659) Krueppel-li ( 283) 564 58.8 2.2e-08
NP_001300981 (OMIM: 602253) Krueppel-like factor 4 ( 513) 568 59.4 2.6e-08
NP_001257872 (OMIM: 604865) Krueppel-like factor 7 ( 269) 559 58.4 2.8e-08
NP_001257873 (OMIM: 604865) Krueppel-like factor 7 ( 274) 559 58.4 2.8e-08
XP_016860650 (OMIM: 604865) PREDICTED: Krueppel-li ( 302) 559 58.4 3e-08
NP_003700 (OMIM: 604865) Krueppel-like factor 7 is ( 302) 559 58.4 3e-08
NP_004226 (OMIM: 602253) Krueppel-like factor 4 is ( 479) 562 58.9 3.4e-08
XP_011525944 (OMIM: 111150,600599,613566,613673) P ( 324) 550 57.8 5.1e-08
XP_011510376 (OMIM: 604865) PREDICTED: Krueppel-li ( 270) 547 57.4 5.4e-08
XP_011510375 (OMIM: 604865) PREDICTED: Krueppel-li ( 272) 547 57.4 5.4e-08
XP_016860651 (OMIM: 604865) PREDICTED: Krueppel-li ( 275) 547 57.4 5.5e-08
NP_006554 (OMIM: 111150,600599,613566,613673) Krue ( 362) 550 57.8 5.5e-08
XP_011510374 (OMIM: 604865) PREDICTED: Krueppel-li ( 303) 547 57.5 5.8e-08
XP_005246983 (OMIM: 604865) PREDICTED: Krueppel-li ( 303) 547 57.5 5.8e-08
XP_006712878 (OMIM: 604865) PREDICTED: Krueppel-li ( 303) 547 57.5 5.8e-08
NP_001171189 (OMIM: 603301,610508) Krueppel-like f ( 495) 509 54.7 6.4e-07
NP_001171187 (OMIM: 603301,610508) Krueppel-like f ( 495) 509 54.7 6.4e-07
NP_003588 (OMIM: 603301,610508) Krueppel-like fact ( 512) 509 54.8 6.5e-07
NP_054798 (OMIM: 606465) Krueppel-like factor 15 [ ( 416) 498 53.8 1e-06
XP_005247457 (OMIM: 606465) PREDICTED: Krueppel-li ( 416) 498 53.8 1e-06
XP_011511045 (OMIM: 606465) PREDICTED: Krueppel-li ( 435) 498 53.8 1.1e-06
NP_057079 (OMIM: 605328,612001) Krueppel-like fact ( 288) 488 52.8 1.4e-06
NP_001027453 (OMIM: 601878) Krueppel-like factor 1 ( 469) 480 52.4 3e-06
NP_005646 (OMIM: 601878) Krueppel-like factor 10 i ( 480) 480 52.4 3.1e-06
XP_011539002 (OMIM: 609602) PREDICTED: Krueppel-li ( 352) 457 50.5 8.8e-06
NP_775755 (OMIM: 609602) Krueppel-like factor 17 [ ( 389) 458 50.6 8.9e-06
NP_114124 (OMIM: 606139) Krueppel-like factor 16 [ ( 252) 450 49.7 1e-05
NP_001197 (OMIM: 602902) Krueppel-like factor 9 [H ( 244) 434 48.5 2.4e-05
>>NP_001721 (OMIM: 602903) Krueppel-like factor 5 isofor (457 aa)
initn: 3180 init1: 3180 opt: 3180 Z-score: 1384.9 bits: 265.5 E(85289): 2.1e-70
Smith-Waterman score: 3180; 100.0% identity (100.0% similar) in 457 aa overlap (1-457:1-457)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MATRVLSMSARLGPVPQPPAPQDEPVFAQLKPVLGAANPARDAALFPGEELKHAHHRPQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MATRVLSMSARLGPVPQPPAPQDEPVFAQLKPVLGAANPARDAALFPGEELKHAHHRPQA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QPAPAQAPQPAQPPATGPRLPPEDLVQTRCEMEKYLTPQLPPVPIIPEHKKYRRDSASVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QPAPAQAPQPAQPPATGPRLPPEDLVQTRCEMEKYLTPQLPPVPIIPEHKKYRRDSASVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DQFFTDTEGLPYSINMNVFLPDITHLRTGLYKSQRPCVTHIKTEPVAIFSHQSETTAPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DQFFTDTEGLPYSINMNVFLPDITHLRTGLYKSQRPCVTHIKTEPVAIFSHQSETTAPPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 APTQALPEFTSIFSSHQTAAPEVNNIFIKQELPTPDLHLSVPTQQGHLYQLLNTPDLDMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APTQALPEFTSIFSSHQTAAPEVNNIFIKQELPTPDLHLSVPTQQGHLYQLLNTPDLDMP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SSTNQTAAMDTLNVSMSAAMAGLNTHTSAVPQTAVKQFQGMPPCTYTMPSQFLPQQATYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSTNQTAAMDTLNVSMSAAMAGLNTHTSAVPQTAVKQFQGMPPCTYTMPSQFLPQQATYF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 PPSPPSSEPGSPDRQAEMLQNLTPPPSYAATIASKLAIHNPNLPTTLPVNSQNIQPVRYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPSPPSSEPGSPDRQAEMLQNLTPPPSYAATIASKLAIHNPNLPTTLPVNSQNIQPVRYN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 RRSNPDLEKRRIHYCDYPGCTKVYTKSSHLKAHLRTHTGEKPYKCTWEGCDWRFARSDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRSNPDLEKRRIHYCDYPGCTKVYTKSSHLKAHLRTHTGEKPYKCTWEGCDWRFARSDEL
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB7 TRHYRKHTGAKPFQCGVCNRSFSRSDHLALHMKRHQN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TRHYRKHTGAKPFQCGVCNRSFSRSDHLALHMKRHQN
430 440 450
>>NP_001273747 (OMIM: 602903) Krueppel-like factor 5 iso (366 aa)
initn: 2537 init1: 2537 opt: 2537 Z-score: 1111.8 bits: 214.6 E(85289): 3.5e-55
Smith-Waterman score: 2537; 100.0% identity (100.0% similar) in 366 aa overlap (92-457:1-366)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PAPAQAPQPAQPPATGPRLPPEDLVQTRCEMEKYLTPQLPPVPIIPEHKKYRRDSASVVD
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEKYLTPQLPPVPIIPEHKKYRRDSASVVD
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QFFTDTEGLPYSINMNVFLPDITHLRTGLYKSQRPCVTHIKTEPVAIFSHQSETTAPPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QFFTDTEGLPYSINMNVFLPDITHLRTGLYKSQRPCVTHIKTEPVAIFSHQSETTAPPPA
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PTQALPEFTSIFSSHQTAAPEVNNIFIKQELPTPDLHLSVPTQQGHLYQLLNTPDLDMPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTQALPEFTSIFSSHQTAAPEVNNIFIKQELPTPDLHLSVPTQQGHLYQLLNTPDLDMPS
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 STNQTAAMDTLNVSMSAAMAGLNTHTSAVPQTAVKQFQGMPPCTYTMPSQFLPQQATYFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STNQTAAMDTLNVSMSAAMAGLNTHTSAVPQTAVKQFQGMPPCTYTMPSQFLPQQATYFP
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 PSPPSSEPGSPDRQAEMLQNLTPPPSYAATIASKLAIHNPNLPTTLPVNSQNIQPVRYNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSPPSSEPGSPDRQAEMLQNLTPPPSYAATIASKLAIHNPNLPTTLPVNSQNIQPVRYNR
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 RSNPDLEKRRIHYCDYPGCTKVYTKSSHLKAHLRTHTGEKPYKCTWEGCDWRFARSDELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSNPDLEKRRIHYCDYPGCTKVYTKSSHLKAHLRTHTGEKPYKCTWEGCDWRFARSDELT
280 290 300 310 320 330
430 440 450
pF1KB7 RHYRKHTGAKPFQCGVCNRSFSRSDHLALHMKRHQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RHYRKHTGAKPFQCGVCNRSFSRSDHLALHMKRHQN
340 350 360
>>XP_016863768 (OMIM: 609392) PREDICTED: Krueppel-like f (320 aa)
initn: 615 init1: 563 opt: 624 Z-score: 296.5 bits: 63.6 E(85289): 8.9e-10
Smith-Waterman score: 636; 39.2% identity (61.7% similar) in 316 aa overlap (154-455:23-317)
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FTDTEGLPYSINMNVFLPDITHLRTGLYKSQRPC-VTH-IKTEPVAIFSHQSETTAPPPA
: : ..: :. ::: . .. ..:: :
XP_016 MESMKPNKYGVIYSTPLPEKFFQTPEGLSHGIQMEPVDLTVNKR--SSPPSA
10 20 30 40 50
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PTQALPEFTSIFSSHQTAAPEVNNIFIKQELPTPDLHLSVPTQQGHLYQLLNTPDLDMPS
.. : .. :::. :.: .. . .: .. : . : : ...: :.::
XP_016 GNS--PSSLKFPSSHRRASPGLS-----MPSSSPPIKKYSPPSPG--VQPFGVP-LSMPP
60 70 80 90 100
250 260 270 280 290
pF1KB7 STNQTAAMDTLNVSMSAAMAGLN-THTSAVPQTAVKQFQG--MPPCTYTMP----SQFLP
..::.. .. . . .. . .. :: ....: : . : :. .:
XP_016 V--MAAALSRHGIRSPGILPVIQPVVVQPVPFMYTSHLQQPLMVSLSEEMENSSSSMQVP
110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 QQATYFPPSPPSS---EPG-SPDRQAEMLQNLTPPPSYAATIASKLAIHNPNLPTTLPVN
.: : .. ::: :.: . ....:: ... :. . : :...
XP_016 VIESYEKPISQKKIKIEPGIEPQRTDYYPEEMSPP--LMNSVSPPQALLQENHPSVIVQP
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400
pF1KB7 SQNIQPVRYNRRSNPDLE-KRRIHYCDYPGCTKVYTKSSHLKAHLRTHTGEKPYKCTWEG
.. ::. .:: . ::::: ::: ::.:::::::::::: :::::::::::::::
XP_016 GKRPLPVE-----SPDTQRKRRIHRCDYDGCNKVYTKSSHLKAHRRTHTGEKPYKCTWEG
220 230 240 250 260 270
410 420 430 440 450
pF1KB7 CDWRFARSDELTRHYRKHTGAKPFQCGVCNRSFSRSDHLALHMKRHQN
: :.::::::::::.::::: ::::: :.:::::::::::: :::
XP_016 CTWKFARSDELTRHFRKHTGIKPFQCPDCDRSFSRSDHLALHRKRHMLV
280 290 300 310 320
>>NP_057615 (OMIM: 609392) Krueppel-like factor 3 [Homo (345 aa)
initn: 615 init1: 563 opt: 624 Z-score: 296.1 bits: 63.6 E(85289): 9.4e-10
Smith-Waterman score: 641; 35.7% identity (59.7% similar) in 370 aa overlap (102-455:6-342)
80 90 100 110 120
pF1KB7 QPPATGPRLPPEDLVQTRCEMEKYLTPQLPPVPIIPEHKKYRRDSASVV--DQFFTDTEG
:::. :. : .:: .... . .
NP_057 MLMFDPVPV----KQEAMDPVSVSYPSNYMESMKP
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LPYSINMNVFLPDITHLRTGLYKSQRPCVTHIKTEPVAIFSHQSETTAPPPAPTQALPEF
:.. ... ::. .... . :. ::: . .. ..:: : .. :
NP_057 NKYGVIYSTPLPE------KFFQTPEGLSHGIQMEPVDLTVNKR--SSPPSAGNS--PSS
40 50 60 70 80
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TSIFSSHQTAAPEVNNIFIKQELPT--PDLHLSVPTQQGHLYQLLNTPDLDMPSSTNQTA
.. :::. :.: .. .:. : .. : . : : ...: :.:: ..:
NP_057 LKFPSSHRRASPGLS-------MPSSSPPIKKYSPPSPG--VQPFGVP-LSMPPV--MAA
90 100 110 120
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 AMDTLNVSMSAAMAGLN-THTSAVPQTAVKQFQG--MPPCTYTMP----SQFLPQQATYF
:.. .. . . .. . .. :: ....: : . : :. .: .:
NP_057 ALSRHGIRSPGILPVIQPVVVQPVPFMYTSHLQQPLMVSLSEEMENSSSSMQVPVIESYE
130 140 150 160 170 180
310 320 330 340 350
pF1KB7 PPSPPSS---EPG-SPDRQAEMLQNLTPPPSYAATIASKLAIHNPNLPTTLPVNSQNIQP
: .. ::: :.: . ....:: ... :. . : :... .. :
NP_057 KPISQKKIKIEPGIEPQRTDYYPEEMSPP--LMNSVSPPQALLQENHPSVIVQPGKRPLP
190 200 210 220 230 240
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 VRYNRRSNPDLE-KRRIHYCDYPGCTKVYTKSSHLKAHLRTHTGEKPYKCTWEGCDWRFA
:. .:: . ::::: ::: ::.:::::::::::: :::::::::::::::: :.::
NP_057 VE-----SPDTQRKRRIHRCDYDGCNKVYTKSSHLKAHRRTHTGEKPYKCTWEGCTWKFA
250 260 270 280 290 300
420 430 440 450
pF1KB7 RSDELTRHYRKHTGAKPFQCGVCNRSFSRSDHLALHMKRHQN
::::::::.::::: ::::: :.:::::::::::: :::
NP_057 RSDELTRHFRKHTGIKPFQCPDCDRSFSRSDHLALHRKRHMLV
310 320 330 340
>>XP_011533213 (OMIM: 607531) PREDICTED: Krueppel-like f (383 aa)
initn: 618 init1: 584 opt: 608 Z-score: 288.8 bits: 62.4 E(85289): 2.4e-09
Smith-Waterman score: 627; 34.5% identity (59.5% similar) in 385 aa overlap (100-455:7-380)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PAQPPATGPRLPPEDLVQTRCEMEKYLTPQLPPVPIIPEHKKYRRDSASVVDQFFTDTEG
.: : . : . .. : .: . . : :.
XP_011 MLMLDGMPAVRVKTELLESEQGSPNVHN--YPDMEA
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LPYSINMNVFLPDITHLRTGLYKSQ-RPC---VTHIKTEPVAIFSHQSETTAPPPAP--T
.: .: : : . ...: .: ... .: :.:. : :: .: :
XP_011 VPLLLNNVKGEPPEDSLSVDHFQTQTEPVDLSINKARTSPTAVSSSPVSMTASASSPSST
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230
pF1KB7 QALPEFTSIFSSHQTAAPEVNNIFIKQELPTPDLHLSVPTQQGHLYQLLNT-----PDLD
.. .: ..: :. :.. .. . :: .. . : :.:. :.
XP_011 STSSSSSSRLASSPTVITSVSSASSSSTVLTPGPLVASASGVGG-QQFLHIIHPVPPSSP
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 MPSSTNQTA-------AMDTLNVSMSAAMAGLNTHTS-AVPQTAVKQFQGMPPCTYTMPS
: ..:. . ..... : ..:. . :.... .:: . .: :
XP_011 MNLQSNKLSHVHRIPVVVQSVPVVYTAVRSPGNVNNTIVVPLLEDGRGHGKAQMD---PR
160 170 180 190 200 210
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: ..:. . ..... : ..:. . :.... .:: . .: :
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: ..:. . ..... : ..:. . :.... .:: . .: :
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. :.:. .: .: : :: . :. .:.. : : .. . .. ..:
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XP_011 KPYKCTWEGCTWKFARSDELTRHYRKHTGVKPFKCADCDRSFSRSDHLALHRRRHMLV
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pF1KB7 NLPTTLPVNSQNIQPVRYNRRS-NPDLEKRRIHYCDYPGCTKVYTKSSHLKAHLRTHTGE
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XP_005 KFPCS--ISPFSIESTRRQRRSESPDSRKRRIHRCDFEGCNKVYTKSSHLKAHRRTHTGE
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XP_005 KPYKCTWEGCTWKFARSDELTRHYRKHTGVKPFKCADCDRSFSRSDHLALHRRRHMLV
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>>NP_009180 (OMIM: 607531) Krueppel-like factor 12 [Homo (402 aa)
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pF1KB7 LPYSINMNVFLPDITHLRTGLYKSQ-RPC---VTHIKTEPVAIFSHQSETTAPPPAP--T
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pF1KB7 QALPEFTSIFSSHQTAAPEVNNIFIKQELPTPDLHLSVPTQQGHLYQLLNT-----PDLD
.. .: ..: :. :.. .. . :: .. . : :.:. :.
NP_009 STSSSSSSRLASSPTVITSVSSASSSSTVLTPGPLVASASGVGG-QQFLHIIHPVPPSSP
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pF1KB7 MPSSTNQTA-------AMDTLNVSMSAAMAGLNTHTS-AVPQTAVKQFQGMPPCTYTMPS
: ..:. . ..... : ..:. . :.... .:: . .: :
NP_009 MNLQSNKLSHVHRIPVVVQSVPVVYTAVRSPGNVNNTIVVPLLEDGRGHGKAQMD---PR
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pF1KB7 QFLPQQATY------FPPSPPSS--EPGSPDRQ-AEMLQNLTPPPSYAATIASKLAIHNP
. :.:. .: .: : :: . :. .:.. : : .. . .. ..:
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NP_009 KFPCS--ISPFSIESTRRQRRSESPDSRKRRIHRCDFEGCNKVYTKSSHLKAHRRTHTGE
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pF1KB7 KPYKCTWEGCDWRFARSDELTRHYRKHTGAKPFQCGVCNRSFSRSDHLALHMKRHQN
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NP_009 KPYKCTWEGCTWKFARSDELTRHYRKHTGVKPFKCADCDRSFSRSDHLALHRRRHMLV
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457 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]