FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6409, 471 aa 1>>>pF1KE6409 471 - 471 aa - 471 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9941+/-0.00107; mu= 13.7120+/- 0.063 mean_var=68.0997+/-13.844, 0's: 0 Z-trim(103.3): 20 B-trim: 368 in 1/48 Lambda= 0.155418 statistics sampled from 7339 (7349) to 7339 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.598), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16 Scan time: 2.750 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1293.2 FMO2 gene_id:2327|Hs108|chr1 ( 535) 3182 722.9 2e-208 CCDS1294.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 ( 532) 2011 460.3 2.2e-129 CCDS926.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 ( 533) 1995 456.7 2.7e-128 CCDS1292.1 FMO3 gene_id:2328|Hs108|chr1 ( 532) 1990 455.6 5.8e-128 CCDS44209.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 ( 464) 1832 420.2 2.3e-117 CCDS1295.1 FMO4 gene_id:2329|Hs108|chr1 ( 558) 1832 420.2 2.8e-117 CCDS60351.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 ( 469) 1462 337.2 2.2e-92 CCDS44210.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 ( 285) 1271 294.3 1.1e-79 >>CCDS1293.2 FMO2 gene_id:2327|Hs108|chr1 (535 aa) initn: 3182 init1: 3182 opt: 3182 Z-score: 3855.3 bits: 722.9 E(32554): 2e-208 Smith-Waterman score: 3182; 100.0% identity (100.0% similar) in 471 aa overlap (1-471:1-471) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVVT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 NTSKEMSCFSDFPMPEDFPNFLHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVRKCPDFS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 NTSKEMSCFSDFPMPEDFPNFLHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVRKCPDFS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 SSGQWKVVTQSNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLKSFPGMERFKGQYFHSRQYKHPD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 SSGQWKVVTQSNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLKSFPGMERFKGQYFHSRQYKHPD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 GFEGKRILVIGMGNSGSDIAVELSKNAAQVFISTRHGTWVMSRISEDGYPWDSVFHTRFR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 GFEGKRILVIGMGNSGSDIAVELSKNAAQVFISTRHGTWVMSRISEDGYPWDSVFHTRFR 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 SMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 SMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKVK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 STVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPAH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 STVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPAH 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 LDKSTLACIGLIQPLGSIFPTAELQARWVTRVFKGLCSLPSERTMMMDIIKRNEKRIDLF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 LDKSTLACIGLIQPLGSIFPTAELQARWVTRVFKGLCSLPSERTMMMDIIKRNEKRIDLF 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 GESQSQTLQTNYVDYLDELALEIGAKPDFCSLLFKDPKLAVRLYFGPCNSY ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 GESQSQTLQTNYVDYLDELALEIGAKPDFCSLLFKDPKLAVRLYFGPCNSYQYRLVGPGQ 430 440 450 460 470 480 CCDS12 WEGARNAIFTQKQRILKPLKTRALKDSSNFSVSFLLKILGLLAVVVAFFCQLQWS 490 500 510 520 530 >>CCDS1294.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 (532 aa) initn: 2082 init1: 2011 opt: 2011 Z-score: 2436.3 bits: 460.3 E(32554): 2.2e-129 Smith-Waterman score: 2011; 58.4% identity (84.7% similar) in 471 aa overlap (1-471:1-471) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVVT :::.::..::::::: :.:::..::::::::::..:.::.::: :.::.::::.:.:::. CCDS12 MAKRVAIVGAGVSGLASIKCCLEEGLEPTCFERSDDLGGLWRFTEHVEEGRASLYKSVVS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 NTSKEMSCFSDFPMPEDFPNFLHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVRKCPDFS :. :::::.::::.:::.::.. ::..:::....:..:::::.:::.: : :: :: : . CCDS12 NSCKEMSCYSDFPFPEDYPNYVPNSQFLEYLKMYANHFDLLKHIQFKTKVCSVTKCSDSA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 SSGQWKVVTQSNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLKSFPGMERFKGQYFHSRQYKHPD ::::.:::. . :..::.:::::::.: :..:: ::::.. ::::::::::::::: CCDS12 VSGQWEVVTMHEEKQESAIFDAVMVCTGFLTNPYLPLDSFPGINAFKGQYFHSRQYKHPD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 GFEGKRILVIGMGNSGSDIAVELSKNAAQVFISTRHGTWVMSRISEDGYPWDSVFHTRFR :. ::.:::::::::.::::: :. : .::.:: : ::.::: ..::::: :: :::. CCDS12 IFKDKRVLVIGMGNSGTDIAVEASHLAEKVFLSTTGGGWVISRIFDSGYPWDMVFMTRFQ 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 SMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKVK .:::: :: : :..:...: :.:: :::: :... .:: ::::..:.:.. : . .. CCDS12 NMLRNSLPTPIVTWLMERKINNWLNHANYGLIPEDRTQLKEFVLNDELPGRIITGKVFIR 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 STVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPAH ..::. :.:.::.. . :: ::.:.:::::.:.::::..:.::::....:::::::::: CCDS12 PSIKEVKENSVIFNNTSKEEPIDIIVFATGYTFAFPFLDESVVKVEDGQASLYKYIFPAH 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 LDKSTLACIGLIQPLGSIFPTAELQARWVTRVFKGLCSLPSERTMMMDIIKRNEKRIDLF :.: ::: ::::.::::..::.: ::::..::.::. .:: .:. .: :.:.. . : CCDS12 LQKPTLAIIGLIKPLGSMIPTGETQARWAVRVLKGVNKLPPPSVMIEEINARKENKPSWF 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 GESQSQTLQTNYVDYLDELALEIGAKPDFCSLLFKDPKLAVRLYFGPCNSY : ..::..:. :.::: :.:::.. :.:. ::.::. ..::::. : CCDS12 GLCYCKALQSDYITYIDELLTYINAKPNLFSMLLTDPHLALTVFFGPCSPYQFRLTGPGK 430 440 450 460 470 480 CCDS12 WEGARNAIMTQWDRTFKVIKARVVQESPSPFESFLKVFSFLALLVAIFLIFL 490 500 510 520 530 >>CCDS926.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 (533 aa) initn: 1584 init1: 1549 opt: 1995 Z-score: 2416.9 bits: 456.7 E(32554): 2.7e-128 Smith-Waterman score: 1995; 58.4% identity (87.1% similar) in 466 aa overlap (3-468:4-468) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVV :..::::.::::: :.::::.:::::.:::::.::::.:::.:: :.::::::.::. 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CCDS92 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 RSMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKV .. .. .. .. ..:...:. :.:: .::.:... . ..:.::::.:.:.. : .:: CCDS92 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRALSQHPTLNDDLPNRIISGLVKV 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 KSTVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPA :..:::.:::.::::::. :..::..::::::::.::::::: ::: .: .:::: .:: CCDS92 KGNVKEFTETAAIFEDGSREDDIDAVIFATGYSFDFPFLEDS-VKVVKNKISLYKKVFPP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 HLDKSTLACIGLIQPLGSIFPTAELQARWVTRVFKGLCSLPSERTMMMDIIKRNEKRIDL .:.. ::: ::::::::.:.: .:::.::.:.::::: .:::. :: .: : .:. CCDS92 NLERPTLAIIGLIQPLGAIMPISELQGRWATQVFKGLKTLPSQSEMMAEISKAQEEIDKR 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 FGESQSQTLQTNYVDYLDELALEIGAKPDFCSLLFKDPKLAVRLYFGPCNSY . ::: .:.: .:.: ..::: .:..:.. :: : :::::..: .::: CCDS92 YVESQRHTIQGDYIDTMEELADLVGVRPNLLSLAFTDPKLALHLLLGPCTPIHYRVQGPG 420 430 440 450 460 470 CCDS92 KWDGARKAILTTDDRIRKPLMTRVVERSSSMTSTMTIGKFMLALAFFAIIIAYF 480 490 500 510 520 530 >>CCDS1292.1 FMO3 gene_id:2328|Hs108|chr1 (532 aa) initn: 2039 init1: 1819 opt: 1990 Z-score: 2410.9 bits: 455.6 E(32554): 5.8e-128 Smith-Waterman score: 1990; 58.4% identity (84.5% similar) in 471 aa overlap (1-471:1-469) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVVT :.::::.:::::::: :.. :..:::::::::...::::.:.:....:.::::::.:: . CCDS12 MGKKVAIIGAGVSGLASIRSCLEEGLEPTCFEKSNDIGGLWKFSDHAEEGRASIYKSVFS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 NTSKEMSCFSDFPMPEDFPNFLHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVRKCPDFS :.:::: :: :::.:.:::::.::::. ::. :::. .:::::::.: : :: : :::. CCDS12 NSSKEMMCFPDFPFPDDFPNFMHNSKIQEYIIAFAKEKNLLKYIQFKTFVSSVNKHPDFA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 SSGQWKVVTQSNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLKSFPGMERFKGQYFHSRQYKHPD ..::: :.:. .::..::::::::::::::. :..: .::::...:::. ::::.::.: CCDS12 TTGQWDVTTERDGKKESAVFDAVMVCSGHHVYPNLPKESFPGLNHFKGKCFHSRDYKEPG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 GFEGKRILVIGMGNSGSDIAVELSKNAAQVFISTRHGTWVMSRISEDGYPWDSVFHTRFR :.:::.::.:.:::: :::.:::..: ::.::.: :.:::::. ..::::: .. ::: CCDS12 VFNGKRVLVVGLGNSGCDIATELSRTAEQVMISSRSGSWVMSRVWDNGYPWDMLLVTRFG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 SMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKVK ..:.: :: . :. .::: :.:::::: : : . ::::.::..:. .::: ..:: CCDS12 TFLKNNLPTAISDWLYVKQMNARFKHENYGLMPLNGVLRKEPVFNDELPASILCGIVSVK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 STVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPAH .:::.:::::::::::. :.:: .::::::::..:::..:..: .:: . :.: .:: CCDS12 PNVKEFTETSAIFEDGTIFEGIDCVIFATGYSFAYPFLDESIIKSRNNEIILFKGVFPPL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 LDKSTLACIGLIQPLGSIFPTAELQARWVTRVFKGLCSLPSERTMMMDIIKRNEKRIDLF :.:::.: ::..: ::. .::..::.::...:.:: :.::: . :: :: .. ::. : CCDS12 LEKSTIAVIGFVQSLGAAIPTVDLQSRWAAQVIKGTCTLPSMEDMMNDINEKMEKKRKWF 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 GESQSQTLQTNYVDYLDELALEIGAKPDFCSLLFKDPKLAVRLYFGPCNSY : .:.:.::.:. :.:::. :::::.. :.. :::::...:::::. : CCDS12 G--KSETIQTDYIVYMDELSSFIGAKPNIPWLFLTDPKLAMEVYFGPCSPYQFRLVGPGQ 430 440 450 460 470 CCDS12 WPGARNAILTQWDRSLKPMQTRVVGRLQKPCFFFHWLKLFAIPILLIAVFLVLT 480 490 500 510 520 530 >>CCDS44209.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 (464 aa) initn: 1852 init1: 1549 opt: 1832 Z-score: 2220.4 bits: 420.2 E(32554): 2.3e-117 Smith-Waterman score: 1832; 60.1% identity (88.7% similar) in 416 aa overlap (3-418:4-417) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVV :..::::.::::: :.::::.:::::.:::::.::::.:::.:: :.::::::.::. CCDS44 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 TNTSKEMSCFSDFPMPEDFPNFLHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVRKCPDF :::::: ::::.:.:. .:::.::...:::::..::.:::::::.:.::: ::.: ::: CCDS44 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 SSSGQWKVVTQSNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLKSFPGMERFKGQYFHSRQYKHP ..::::.:::.:.::.. :::.::::.::: :.::.::::.:.:::::::::.::.: CCDS44 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 DGFEGKRILVIGMGNSGSDIAVELSKNAAQVFISTRHGTWVMSRISEDGYPWDSVFHTRF .:: :::...::.::::.:.:::.:..: :::.:::.:.:...:... ::: : .: .:. CCDS44 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 RSMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKV .. .. .. .. ..:...:. :.:: .::.:... . ..:.::::.:.:.. : .:: CCDS44 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRALSQHPTLNDDLPNRIISGLVKV 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 KSTVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPA :..:::.:::.::::::. :..::..::::::::.::::::: ::: .: .:::: .:: CCDS44 KGNVKEFTETAAIFEDGSREDDIDAVIFATGYSFDFPFLEDS-VKVVKNKISLYKKVFPP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 HLDKSTLACIGLIQPLGSIFPTAELQARWVTRVFKGLCSLPSERTMMMDIIKRNEKRIDL .:.. ::: ::::::::.:.: .:::.::.:.::::: .:::. :: .: : .:. :: CCDS44 NLERPTLAIIGLIQPLGAIMPISELQGRWATQVFKGLKTLPSQSEMMAEISKAQEE-IDK 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 FGESQSQTLQTNYVDYLDELALEIGAKPDFCSLLFKDPKLAVRLYFGPCNSY CCDS44 SLTMRKTSDKPKLKNILQIPDYLKTVKIINKESLRNCPGIKGPKET 420 430 440 450 460 >>CCDS1295.1 FMO4 gene_id:2329|Hs108|chr1 (558 aa) initn: 1803 init1: 1209 opt: 1832 Z-score: 2219.1 bits: 420.2 E(32554): 2.8e-117 Smith-Waterman score: 1832; 55.4% identity (83.1% similar) in 473 aa overlap (1-471:1-469) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVVT ::::::::::::::: :.:::::: ::::::::..::::.:.: :. .:: . .:.:.:: CCDS12 MAKKVAVIGAGVSGLSSIKCCVDEDLEPTCFERSDDIGGLWKFTESSKDGMTRVYKSLVT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 NTSKEMSCFSDFPMPEDFPNFLHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVRKCPDFS :. :::::.::::. ::.:::... :. .:.. ::..:::::::::.::: :. : :::: CCDS12 NVCKEMSCYSDFPFHEDYPNFMNHEKFWDYLQEFAEHFDLLKYIQFKTTVCSITKRPDFS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 SSGQWKVVTQSNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLKSFPGMERFKGQYFHSRQYKHPD .::: :::...::.. :::::::::.:: . ::.::..:::...:::: .::..:: :. CCDS12 ETGQWDVVTETEGKQNRAVFDAVMVCTGHFLNPHLPLEAFPGIHKFKGQILHSQEYKIPE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 GFEGKRILVIGMGNSGSDIAVELSKNAAQVFISTRHGTWVMSRISEDGYPWDSVFHTRFR ::.:::.::::.::.:.:::::::..::::..::: ::::..: :. :::.. . : CCDS12 GFQGKRVLVIGLGNTGGDIAVELSRTAAQVLLSTRTGTWVLGRSSDWGYPYNMMVTRRCC 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 SMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKVK :.. .::: ..:. :...:. ::::.::: .: . ..::..:. .::::: .: CCDS12 SFIAQVLPSRFLNWIQERKLNKRFNHEDYGLSI-TKGKKAKFIVNDELPNCILCGAITMK 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 STVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPAH ..: :.:::::.::::::::::::.::.:::.:::::.:. : .. .. . ::: .:: . 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CCDS44 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRSKDIALTE 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 KSTVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPA 471 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 12:59:50 2016 done: Tue Nov 8 12:59:51 2016 Total Scan time: 2.750 Total Display time: 0.070 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]