Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5730
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5730, 732 aa
1>>>pF1KB5730 732 - 732 aa - 732 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0867+/-0.000794; mu= 22.0312+/- 0.048
mean_var=75.8295+/-15.233, 0's: 0 Z-trim(108.7): 15 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.147284
statistics sampled from 10355 (10369) to 10355 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.687), E-opt: 0.2 (0.319), width: 16
Scan time: 3.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34766.1 KEL gene_id:3792|Hs108|chr7 ( 732) 4987 1069.4 0
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CCDS44082.1 ECE1 gene_id:1889|Hs108|chr1 ( 767) 1253 276.0 1.5e-73
CCDS215.1 ECE1 gene_id:1889|Hs108|chr1 ( 770) 1253 276.0 1.5e-73
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CCDS43179.1 ECE2 gene_id:9718|Hs108|chr3 ( 811) 1185 261.5 3.6e-69
CCDS3256.2 ECE2 gene_id:9718|Hs108|chr3 ( 883) 1185 261.6 3.8e-69
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CCDS77540.1 ECEL1 gene_id:9427|Hs108|chr2 ( 773) 667 151.5 4.7e-36
CCDS30569.2 MMEL1 gene_id:79258|Hs108|chr1 ( 779) 530 122.3 2.7e-27
CCDS14204.1 PHEX gene_id:5251|Hs108|chrX ( 749) 496 115.1 4e-25
CCDS3172.1 MME gene_id:4311|Hs108|chr3 ( 750) 352 84.5 6.5e-16
>>CCDS34766.1 KEL gene_id:3792|Hs108|chr7 (732 aa)
initn: 4987 init1: 4987 opt: 4987 Z-score: 5722.0 bits: 1069.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4987; 100.0% identity (100.0% similar) in 732 aa overlap (1-732:1-732)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FSVLLFYNFQNCGPRPCETSVCLDLRDHYLASGNTSVAPCTDFFSFACGRAKETNNSFQE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LATKNKNRLRRILEVQNSWHPGSGEEKAFQFYNSCMDTLAIEAAGTGPLRQVIEELGGWR
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CCDS34 ISGKWTSLNFNRTLRLLMSQYGHFPFFRAYLGPHPASPHTPVIQIDQPEFDVPLKQDQEQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MVTIDQLKEMAPAIDWLSCLQATFTPMSLSPSQSLVVHDVEYLKNMSQLVEEMLLKQRDF
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pF1KB5 LQSHMILGLVVTLSPALDSQFQEARRKLSQKLRELTEQPPMPARPRWMKCVEETGTFFEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LQSHMILGLVVTLSPALDSQFQEARRKLSQKLRELTEQPPMPARPRWMKCVEETGTFFEP
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430 440 450 460 470 480
pF1KB5 TLAALFVREAFGPSTRSAAMKLFTAIRDALITRLRNLPWMNEETQNMAQDKVAQLQVEMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TLAALFVREAFGPSTRSAAMKLFTAIRDALITRLRNLPWMNEETQNMAQDKVAQLQVEMG
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pF1KB5 ASEWALKPELARQEYNDIQLGSSFLQSVLSCVRSLRARIVQSFLQPHPQHRWKVSPWDVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ASEWALKPELARQEYNDIQLGSSFLQSVLSCVRSLRARIVQSFLQPHPQHRWKVSPWDVN
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pF1KB5 AYYSVSDHVVVFPAGLLQPPFFHPGYPRAVNFGAAGSIMAHELLHIFYQLLLPGGCLACD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AYYSVSDHVVVFPAGLLQPPFFHPGYPRAVNFGAAGSIMAHELLHIFYQLLLPGGCLACD
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610 620 630 640 650 660
pF1KB5 NHALQEAHLCLKRHYAAFPLPSRTSFNDSLTFLENAADVGGLAIALQAYSKRLLRHHGET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NHALQEAHLCLKRHYAAFPLPSRTSFNDSLTFLENAADVGGLAIALQAYSKRLLRHHGET
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pF1KB5 VLPSLDLSPQQIFFRSYAQVMCRKPSPQDSHDTHSPPHLRVHGPLSSTPAFARYFRCARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VLPSLDLSPQQIFFRSYAQVMCRKPSPQDSHDTHSPPHLRVHGPLSSTPAFARYFRCARG
670 680 690 700 710 720
730
pF1KB5 ALLNPSSRCQLW
::::::::::::
CCDS34 ALLNPSSRCQLW
730
>>CCDS44081.1 ECE1 gene_id:1889|Hs108|chr1 (754 aa)
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Smith-Waterman score: 1272; 31.5% identity (62.6% similar) in 730 aa overlap (35-732:36-754)
10 20 30 40 50
pF1KB5 DQSEEEPRERSQAGGMGTLWSQESTPEERLPVEGSRPWA----VARR--VLTAILILGLL
: :.: :: : .: ::...: ::.
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60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LCFSVLLFYNFQNCGPRPCETSVCLDLRDHYLASGNTSVAPCTDFFSFACGRAKETN---
:...: . ..:. .: : . .:... . :.: . .: :: ::::.::: ..:
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120 130 140 150 160
pF1KB5 ------NSFQELATKNKNRLRRILEVQNSWHPGSGEEKAFQFYNSCMDTLAIEAAGTGPL
..:..: .:. ....:: ... . .:.:: .: .::. :: . ::
CCDS44 DGHSRWGTFSNLWEHNQAIIKHLLE-NSTASVSEAERKAQVYYRACMNETRIEELRAKPL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 RQVIEELGGWRISGKWTSLNFNRTLRLLMSQYGHFPFFRAYLGPHPASPHTPVIQIDQPE
..::.:::: :.: :.. ::. ::... ..: ::: .:.. . .. :::.::
CCDS44 MELIERLGGWNITGPWAKDNFQDTLQVVTAHYRTSPFFSVYVSADSKNSNSNVIQVDQSG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 FDVPLKQDQEQKIYAQ-IFREYLTYLNQLGTLLGG-DPSKVQEHSSLSISITSRLFQFLR
. .: .. .: . .. ::.:. ::: :::: : .. . . ... . : ..
CCDS44 LGLPSRDYYLNKTENEKVLTGYLNYMVQLGKLLGGGDEEAIRPQMQQILDFETALANITI
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290 300 310 320 330 340
pF1KB5 PLEQRRAQGKLFQMVTIDQLKEMAPAIDWLSCLQATFTPMSLSPSQSLVVHDVEYLKNMS
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CCDS44 PQEKRRDEELIYHKVTAAELQTLAPAINWLPFLNTIFYPVEINESEPIVVYDKEYLEQIS
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350 360 370 380 390 400
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:.. .: .:...:: .:: : ::..::.: ..:. :. :::
CCDS44 TLINT---TDRCLLNNYMIWNLVRKTSSFLDQRFQDA----DEKFMEVMYGTKKTCLPRW
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410 420 430 440 450 460
pF1KB5 MKCVEETGTFFEPTLAALFVREAFGPSTRSAAMKLFTAIRDALITRLRNLPWMNEETQNM
:: .: . . .:. .::. .:. ...: : ... :. :. : .: ::.:::..
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pF1KB5 AQDKVAQLQVEMGASEWALKPELARQEYNDIQ-LGSSFLQSVLSCVRSLRARIVQSFLQP
:..:. . .: .. . :. . .:: . . ...... .. :.. . :.
CCDS44 AKEKADAIYNMIGYPNFIMDPKELDKVFNDYTAVPDLYFENAMRFF-NFSWRVTADQLRK
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pF1KB5 HPQH-RWKVSPWDVNAYYSVSDHVVVFPAGLLQPPFFHPGYPRAVNFGAAGSIMAHELLH
:.. .:...: :::::: . . .:::::.:: ::. . :.:.:::. : ...::: :
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pF1KB5 IFYQL---LLPGGCL-----ACDNHALQEAHLCLKRHYAAFPLPSRTSFNDSLTFLENAA
: . : : . .:... :. ..:. . . .. : :. :: :
CCDS44 AFDDQGREYDKDGNLRPWWKNSSVEAFKRQTECMVEQYSNYSVNGEP-VNGRHTLGENIA
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640 650 660 670 680 690
pF1KB5 DVGGLAIALQAYSKRLLRHHGETVLPSLDLSPQQIFFRSYAQVMCRKPSPQDSH-----D
: ::: : .::.. . .. .: ::.: :. .:.:: ..::: : .:..:: :
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700 710 720 730
pF1KB5 THSPPHLRVHGPLSSTPAFARYFRCARGALLNPSSRCQLW
::: ..:: : ::.. :...::: :. .:: .:..:
CCDS44 PHSPSRFRVIGSLSNSKEFSEHFRCPPGSPMNPPHKCEVW
720 730 740 750
>>CCDS44083.1 ECE1 gene_id:1889|Hs108|chr1 (758 aa)
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Smith-Waterman score: 1272; 31.5% identity (62.6% similar) in 730 aa overlap (35-732:40-758)
10 20 30 40 50
pF1KB5 DQSEEEPRERSQAGGMGTLWSQESTPEERLPVEGSRPWA----VARR--VLTAILILGLL
: :.: :: : .: ::...: ::.
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pF1KB5 LCFSVLLFYNFQNCGPRPCETSVCLDLRDHYLASGNTSVAPCTDFFSFACGRAKETN---
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..:..: .:. ....:: ... . .:.:: .: .::. :: . ::
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..::.:::: :.: :.. ::. ::... ..: ::: .:.. . .. :::.::
CCDS44 MELIERLGGWNITGPWAKDNFQDTLQVVTAHYRTSPFFSVYVSADSKNSNSNVIQVDQSG
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230 240 250 260 270 280
pF1KB5 FDVPLKQDQEQKIYAQ-IFREYLTYLNQLGTLLGG-DPSKVQEHSSLSISITSRLFQFLR
. .: .. .: . .. ::.:. ::: :::: : .. . . ... . : ..
CCDS44 LGLPSRDYYLNKTENEKVLTGYLNYMVQLGKLLGGGDEEAIRPQMQQILDFETALANITI
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290 300 310 320 330 340
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: :.:: . ... :: .:. .::::.:: :.. : :. .. :. .::.: :::...:
CCDS44 PQEKRRDEELIYHKVTAAELQTLAPAINWLPFLNTIFYPVEINESEPIVVYDKEYLEQIS
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350 360 370 380 390 400
pF1KB5 QLVEEMLLKQRDFLQSHMILGLVVTLSPALDSQFQEARRKLSQKLRELTEQPPMPARPRW
:.. .: .:...:: .:: : ::..::.: ..:. :. :::
CCDS44 TLINT---TDRCLLNNYMIWNLVRKTSSFLDQRFQDA----DEKFMEVMYGTKKTCLPRW
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pF1KB5 MKCVEETGTFFEPTLAALFVREAFGPSTRSAAMKLFTAIRDALITRLRNLPWMNEETQNM
:: .: . . .:. .::. .:. ...: : ... :. :. : .: ::.:::..
CCDS44 KFCVSDTENNLGFALGPMFVKATFAEDSKSIATEIILEIKKAFEESLSTLKWMDEETRKS
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470 480 490 500 510 520
pF1KB5 AQDKVAQLQVEMGASEWALKPELARQEYNDIQ-LGSSFLQSVLSCVRSLRARIVQSFLQP
:..:. . .: .. . :. . .:: . . ...... .. :.. . :.
CCDS44 AKEKADAIYNMIGYPNFIMDPKELDKVFNDYTAVPDLYFENAMRFF-NFSWRVTADQLRK
490 500 510 520 530
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pF1KB5 HPQH-RWKVSPWDVNAYYSVSDHVVVFPAGLLQPPFFHPGYPRAVNFGAAGSIMAHELLH
:.. .:...: :::::: . . .:::::.:: ::. . :.:.:::. : ...::: :
CCDS44 APNRDQWSMTPPMVNAYYSPTKNEIVFPAGILQAPFYTRSSPKALNFGGIGVVVGHELTH
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590 600 610 620 630
pF1KB5 IFYQL---LLPGGCL-----ACDNHALQEAHLCLKRHYAAFPLPSRTSFNDSLTFLENAA
: . : : . .:... :. ..:. . . .. : :. :: :
CCDS44 AFDDQGREYDKDGNLRPWWKNSSVEAFKRQTECMVEQYSNYSVNGEP-VNGRHTLGENIA
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640 650 660 670 680 690
pF1KB5 DVGGLAIALQAYSKRLLRHHGETVLPSLDLSPQQIFFRSYAQVMCRKPSPQDSH-----D
: ::: : .::.. . .. .: ::.: :. .:.:: ..::: : .:..:: :
CCDS44 DNGGLKAAYRAYQNWVKKNGAEHSLPTLGLTNNQLFFLGFAQVWCSVRTPESSHEGLITD
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730
pF1KB5 THSPPHLRVHGPLSSTPAFARYFRCARGALLNPSSRCQLW
::: ..:: : ::.. :...::: :. .:: .:..:
CCDS44 PHSPSRFRVIGSLSNSKEFSEHFRCPPGSPMNPPHKCEVW
720 730 740 750
>>CCDS44082.1 ECE1 gene_id:1889|Hs108|chr1 (767 aa)
initn: 1230 init1: 225 opt: 1253 Z-score: 1433.7 bits: 276.0 E(32554): 1.5e-73
Smith-Waterman score: 1272; 31.5% identity (62.6% similar) in 730 aa overlap (35-732:49-767)
10 20 30 40 50
pF1KB5 DQSEEEPRERSQAGGMGTLWSQESTPEERLPVEGSRPWA----VARR--VLTAILILGLL
: :.: :: : .: ::...: ::.
CCDS44 KRATLDEEDLVDSLSEGDAYPNGLQVNFHSPRSGQRCWAARTQVEKRLVVLVVLLAAGLV
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LCFSVLLFYNFQNCGPRPCETSVCLDLRDHYLASGNTSVAPCTDFFSFACGRAKETN---
:...: . ..:. .: : . .:... . :.: . .: :: ::::.::: ..:
CCDS44 ACLAALGI-QYQTRSPSVCLSEACVSVTSSILSSMDPTVDPCHDFFSYACGGWIKANPVP
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120 130 140 150 160
pF1KB5 ------NSFQELATKNKNRLRRILEVQNSWHPGSGEEKAFQFYNSCMDTLAIEAAGTGPL
..:..: .:. ....:: ... . .:.:: .: .::. :: . ::
CCDS44 DGHSRWGTFSNLWEHNQAIIKHLLE-NSTASVSEAERKAQVYYRACMNETRIEELRAKPL
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170 180 190 200 210 220
pF1KB5 RQVIEELGGWRISGKWTSLNFNRTLRLLMSQYGHFPFFRAYLGPHPASPHTPVIQIDQPE
..::.:::: :.: :.. ::. ::... ..: ::: .:.. . .. :::.::
CCDS44 MELIERLGGWNITGPWAKDNFQDTLQVVTAHYRTSPFFSVYVSADSKNSNSNVIQVDQSG
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230 240 250 260 270 280
pF1KB5 FDVPLKQDQEQKIYAQ-IFREYLTYLNQLGTLLGG-DPSKVQEHSSLSISITSRLFQFLR
. .: .. .: . .. ::.:. ::: :::: : .. . . ... . : ..
CCDS44 LGLPSRDYYLNKTENEKVLTGYLNYMVQLGKLLGGGDEEAIRPQMQQILDFETALANITI
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290 300 310 320 330 340
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CCDS44 PQEKRRDEELIYHKVTAAELQTLAPAINWLPFLNTIFYPVEINESEPIVVYDKEYLEQIS
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350 360 370 380 390 400
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:.. .: .:...:: .:: : ::..::.: ..:. :. :::
CCDS44 TLINT---TDRCLLNNYMIWNLVRKTSSFLDQRFQDA----DEKFMEVMYGTKKTCLPRW
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