FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6418, 623 aa 1>>>pF1KE6418 623 - 623 aa - 623 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5958+/-0.00095; mu= 18.8702+/- 0.058 mean_var=85.3864+/-16.652, 0's: 0 Z-trim(106.5): 69 B-trim: 6 in 1/50 Lambda= 0.138797 statistics sampled from 8944 (9010) to 8944 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.277), width: 16 Scan time: 2.230 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5923.1 ABCF2 gene_id:10061|Hs108|chr7 ( 623) 4156 842.5 0 CCDS5922.1 ABCF2 gene_id:10061|Hs108|chr7 ( 634) 4156 842.5 0 CCDS3254.1 ABCF3 gene_id:55324|Hs108|chr3 ( 709) 1442 299.1 1.4e-80 CCDS34381.1 ABCF1 gene_id:23|Hs108|chr6 ( 807) 1419 294.5 3.7e-79 CCDS34380.1 ABCF1 gene_id:23|Hs108|chr6 ( 845) 1404 291.5 3e-78 >>CCDS5923.1 ABCF2 gene_id:10061|Hs108|chr7 (623 aa) initn: 4156 init1: 4156 opt: 4156 Z-score: 4498.2 bits: 842.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4156; 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CCDS32 ENFDVSFGDRVLLAGADVNLAWGRRYGLVGRNGLGKTTLLKMLATRSLRVPAHISLLHVE 190 200 210 220 230 240 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 REMPPSDKTPLHCVMEVDTERA-MLEKEAERLAH------EDAECEKLMELYERLEELDA .:. .: :. :.: :. : .:..: : :. : .: .: :.: .:::..: CCDS32 QEVAGDDTPALQSVLESDSVREDLLRRERELTAQIAAGRAEGSEAAELAEIYAKLEEIEA 250 260 270 280 290 300 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 DKAEMRASRILHGLGFTPAMQRKKLKDFSGGWRMRVALARALFIRPFMLLLDEPTNHLDL ::: ::: :: :::::: ::.. ..::::::::.::::::: :: .:::::::: ::. CCDS32 DKAPARASVILAGLGFTPKMQQQPTREFSGGWRMRLALARALFARPDLLLLDEPTNMLDV 310 320 330 340 350 360 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 DACVWLEEELKTFKRILVLVSHSQDFLNGVCTNIIHMHNKKLKYYTGNYDQYVKTRLELE : .:::. :.:. ...:::...:::.. :.:::.:...: : :... ..:.. : CCDS32 RAILWLENYLQTWPSTILVVSHDRNFLNAIATDIIHLHSQRLDGYRGDFETFIKSKQERL 370 380 390 400 410 420 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 ENQMKRFHWEQDQIAHMKNYIARFGHGSAKLARQAQSKEKTLQKMMASGLTERVVSDKTL ::..... .:. :.. .: :: . .:. : :.::: : :.:. ... :. .. CCDS32 LNQQREYEAQQQYRQHIQVFIDRFRY-NANRASQVQSKLKMLEKLPELKPVDKE-SEVVM 430 440 450 460 470 390 400 410 420 430 pF1KE6 SFYFPPCG--KIPPPVIMVQNVSFKYTKDGPCIYNNLEFGIDLDTRVALVGPNGAGKSTL .: : : :. ::......:.: : :.. : . ::..:. .:: :::::::. CCDS32 KF---PDGFEKFSPPILQLDEVDFYYDPKH-VIFSRLSVSADLESRICVVGENGAGKSTM 480 490 500 510 520 530 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 LKLLTGELLPTDGMIRKHSHVKIGRYHQHLQEQLDLDLSPLEYMMKCYPEIKEKEEMRKI :::: :.: :. :. . : ..::: . :: :::::..: .: . . .: . .::.:. CCDS32 LKLLLGDLAPVRGIRHAHRNLKIGYFSQHHVEQLDLNVSAVELLARKFPG-RPEEEYRHQ 540 550 560 570 580 590 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 IGRYGLTGKQQVSPIRNLSDGQKCRVCLAWLAWQNPHMLFLDEPTNHLDIETIDALADAI .::::..:. . :. .:: ::: :: .: .. :.. .:::::::::.:::.::. :. CCDS32 LGRYGISGELAMRPLASLSGGQKSRVAFAQMTMPCPNFYILDEPTNHLDMETIEALGRAL 600 610 620 630 640 650 560 570 580 590 600 610 pF1KE6 NEFEGGMMLVSHDFRLIQQVAQEIWVCEKQTITKWPGDILAYKEHLKSKLVDEEPQLTKR :.:.::..::::: :.:. : .:.:::: .:. : . :. :. .. : CCDS32 NNFRGGVILVSHDERFIRLVCRELWVCEGGGVTRVEGGFDQYRALLQEQFRREGFL 660 670 680 690 700 620 pF1KE6 THNV >>CCDS34381.1 ABCF1 gene_id:23|Hs108|chr6 (807 aa) initn: 1383 init1: 525 opt: 1419 Z-score: 1534.7 bits: 294.5 E(32554): 3.7e-79 Smith-Waterman score: 1419; 38.8% identity (70.5% similar) in 614 aa overlap (5-605:196-793) 10 20 30 pF1KE6 MPSDLAKKKAAKKKEAAKARQRPRKGHEENGDVV : ... :..: : .. :..:.:. CCDS34 SEEQQPALKGKKGKEEKSKGKAKPQNKFAALDNEEEDKEEEIIKEKEPPKQGKEKA---- 170 180 190 200 210 220 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 TEPQVAEKNEANGRETTEVDLLTKELEDFEMKKAAARAVTGVLASHPNSTDVHIINLSLT . ::. : . :... . . .:: ...: . ..: :..:... ..:.. CCDS34 ---KKAEQMEYE-RQVASLKAANAAENDFSVSQAEMSSRQAMLE---NASDIKLEKFSIS 230 240 250 260 270 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 FHGQELLSDTKLELNSGRRYGLIGLNGIGKSMLLSAIGKREVPIPEHIDIYHLTREMPPS ::.::. .. : . .::::::.: :: ::. ::. :..: . :: .::. .:. . CCDS34 AHGKELFVNADLYIVAGRRYGLVGPNGKGKTTLLKHIANRALSIPPNIDVLLCEQEVV-A 280 290 300 310 320 330 160 170 180 190 200 pF1KE6 DKTP-LHCVMEVDTERAMLEKEAERLAHE-----DAECEKLMELYERLEELDADKAEMRA :.:: .. :...::.: : .: .:: . :. :.: ..::.:. : :: .: CCDS34 DETPAVQAVLRADTKRLKLLEEERRLQGQLEQGDDTAAERLEKVYEELRATGAAAAEAKA 340 350 360 370 380 390 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 SRILHGLGFTPAMQRKKLKDFSGGWRMRVALARALFIRPFMLLLDEPTNHLDLDACVWLE ::: :::: : :: . . :::::::::.::::::..: .:.::::::::::.: .::. CCDS34 RRILAGLGFDPEMQNRPTQKFSGGWRMRVSLARALFMEPTLLMLDEPTNHLDLNAVIWLN 400 410 420 430 440 450 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 EELKTFKRILVLVSHSQDFLNGVCTNIIHMHNKKLKYYTGNYDQYVKTRLELEENQMKRF . :. ... :..:::.: ::. :::.:::. ..:.:: ::: . : . ... .:.. CCDS34 NYLQGWRKTLLIVSHDQGFLDDVCTDIIHLDAQRLHYYRGNYMTFKKMYQQKQKELLKQY 460 470 480 490 500 510 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 HWEQDQIAHMK--NYIARFGHGSAK--LARQAQS---KEKTLQKMMASGLTERVVSDKTL . .. .. ..: . .. .. ..: :.:. :. :.. ... : : .: .. :. CCDS34 EKQEKKLKELKAGGKSTKQAEKQTKEALTRKQQKCRRKNQDEESQEAPELLKRP-KEYTV 520 530 540 550 560 570 390 400 410 420 430 440 pF1KE6 SFYFPPCGKIPPPVIMVQNVSFKYTKDGPCIYNNLEFGIDLDTRVALVGPNGAGKSTLLK : :: . :::. ...:.: : . : ...::.::::.:.:. .:::::.:::::: CCDS34 RFTFPDPPPLSPPVLGLHGVTFGYQGQKP-LFKNLDFGIDMDSRICIVGPNGVGKSTLLL 580 590 600 610 620 630 450 460 470 480 490 500 pF1KE6 LLTGELLPTDGMIRKHSHVKIGRYHQHLQEQLDLDLSPLEYMMKCYPEIKEKEEMRKIIG ::::.: :: : .::. ..::: ..:. ::: .. .: ::... . .. :: .: CCDS34 LLTGKLTPTHGEMRKNHRLKIGFFNQQYAEQLRMEETPTEYLQRGFNL--PYQDARKCLG 640 650 660 670 680 510 520 530 540 550 560 pF1KE6 RYGLTGKQQVSPIRNLSDGQKCRVCLAWLAWQNPHMLFLDEPTNHLDIETIDALADAINE :.:: .. .. : .:: ::: :: .: :: ..: .:.::::::.::::.::::..:::: CCDS34 RFGLESHAHTIQICKLSGGQKARVVFAELACREPDVLILDEPTNNLDIESIDALGEAINE 690 700 710 720 730 740 570 580 590 600 610 620 pF1KE6 FEGGMMLVSHDFRLIQQVAQEIWVCEKQTITKWPGDILAYKEHLKSKLVDEEPQLTKRTH ..:....:::: ::: .. ..:: :.:.... ::. ::... CCDS34 YKGAVIVVSHDARLITETNCQLWVVEEQSVSQIDGDFEDYKREVLEALGEVMVSRPRE 750 760 770 780 790 800 pF1KE6 NV >>CCDS34380.1 ABCF1 gene_id:23|Hs108|chr6 (845 aa) initn: 1383 init1: 525 opt: 1404 Z-score: 1518.2 bits: 291.5 E(32554): 3e-78 Smith-Waterman score: 1413; 38.1% identity (70.5% similar) in 627 aa overlap (2-605:213-831) 10 20 30 pF1KE6 MPSDLAKKKAAKKKEAAKARQRPRKGHEENG : .:.:: : ..... . . .. .::.: CCDS34 SKGKAKPQNKFAALDNEEEDKEEEIIKEKEPPKQGKEKAKKAEQGSEEEGEGEEEEEEGG 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 pF1KE6 DV-VTEP--QVAEKNEANGRETTEVDLLTKELE-------DFEMKKAAARAVTGVLASHP . . .: ....:.. . .. : . . :. :: ...: . ..: CCDS34 ESKADDPYAHLSKKEKKKLKKQMEYERQVASLKAANAAENDFSVSQAEMSSRQAML---E 250 260 270 280 290 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 NSTDVHIINLSLTFHGQELLSDTKLELNSGRRYGLIGLNGIGKSMLLSAIGKREVPIPEH :..:... ..:.. ::.::. .. : . .::::::.: :: ::. ::. :..: . :: . CCDS34 NASDIKLEKFSISAHGKELFVNADLYIVAGRRYGLVGPNGKGKTTLLKHIANRALSIPPN 300 310 320 330 340 350 150 160 170 180 190 pF1KE6 IDIYHLTREMPPSDKTP-LHCVMEVDTERAMLEKEAERLAHE-----DAECEKLMELYER ::. .:. .:.:: .. :...::.: : .: .:: . :. :.: ..::. CCDS34 IDVLLCEQEVV-ADETPAVQAVLRADTKRLKLLEEERRLQGQLEQGDDTAAERLEKVYEE 360 370 380 390 400 410 200 210 220 230 240 250 pF1KE6 LEELDADKAEMRASRILHGLGFTPAMQRKKLKDFSGGWRMRVALARALFIRPFMLLLDEP :. : :: .: ::: :::: : :: . . :::::::::.::::::..: .:.:::: CCDS34 LRATGAAAAEAKARRILAGLGFDPEMQNRPTQKFSGGWRMRVSLARALFMEPTLLMLDEP 420 430 440 450 460 470 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 TNHLDLDACVWLEEELKTFKRILVLVSHSQDFLNGVCTNIIHMHNKKLKYYTGNYDQYVK ::::::.: .::.. :. ... :..:::.: ::. :::.:::. ..:.:: ::: . : CCDS34 TNHLDLNAVIWLNNYLQGWRKTLLIVSHDQGFLDDVCTDIIHLDAQRLHYYRGNYMTFKK 480 490 500 510 520 530 320 330 340 350 360 pF1KE6 TRLELEENQMKRFHWEQDQIAHMK--NYIARFGHGSAK--LARQAQS---KEKTLQKMMA . ... .:... .. .. ..: . .. .. ..: :.:. :. :.. ... : CCDS34 MYQQKQKELLKQYEKQEKKLKELKAGGKSTKQAEKQTKEALTRKQQKCRRKNQDEESQEA 540 550 560 570 580 590 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 SGLTERVVSDKTLSFYFPPCGKIPPPVIMVQNVSFKYTKDGPCIYNNLEFGIDLDTRVAL : .: .. :. : :: . :::. ...:.: : . : ...::.::::.:.:. . CCDS34 PELLKRP-KEYTVRFTFPDPPPLSPPVLGLHGVTFGYQGQKP-LFKNLDFGIDMDSRICI 600 610 620 630 640 650 430 440 450 460 470 480 pF1KE6 VGPNGAGKSTLLKLLTGELLPTDGMIRKHSHVKIGRYHQHLQEQLDLDLSPLEYMMKCYP :::::.:::::: ::::.: :: : .::. ..::: ..:. ::: .. .: ::... . CCDS34 VGPNGVGKSTLLLLLTGKLTPTHGEMRKNHRLKIGFFNQQYAEQLRMEETPTEYLQRGFN 660 670 680 690 700 710 490 500 510 520 530 540 pF1KE6 EIKEKEEMRKIIGRYGLTGKQQVSPIRNLSDGQKCRVCLAWLAWQNPHMLFLDEPTNHLD .. :: .::.:: .. .. : .:: ::: :: .: :: ..: .:.::::::.:: CCDS34 L--PYQDARKCLGRFGLESHAHTIQICKLSGGQKARVVFAELACREPDVLILDEPTNNLD 720 730 740 750 760 770 550 560 570 580 590 600 pF1KE6 IETIDALADAINEFEGGMMLVSHDFRLIQQVAQEIWVCEKQTITKWPGDILAYKEHLKSK ::.::::..::::..:....:::: ::: .. ..:: :.:.... ::. ::... CCDS34 IESIDALGEAINEYKGAVIVVSHDARLITETNCQLWVVEEQSVSQIDGDFEDYKREVLEA 780 790 800 810 820 830 610 620 pF1KE6 LVDEEPQLTKRTHNV CCDS34 LGEVMVSRPRE 840 623 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 13:05:56 2016 done: Tue Nov 8 13:05:57 2016 Total Scan time: 2.230 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]