FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1433, 499 aa 1>>>pF1KE1433 499 - 499 aa - 499 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8639+/-0.00104; mu= 7.5620+/- 0.061 mean_var=188.8409+/-39.642, 0's: 0 Z-trim(111.0): 124 B-trim: 492 in 1/51 Lambda= 0.093331 statistics sampled from 11863 (12008) to 11863 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.714), E-opt: 0.2 (0.369), width: 16 Scan time: 3.470 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS484.1 CDC20 gene_id:991|Hs108|chr1 ( 499) 3401 470.5 1.8e-132 CCDS45916.1 FZR1 gene_id:51343|Hs108|chr19 ( 496) 1095 160.0 5.4e-39 CCDS12109.1 FZR1 gene_id:51343|Hs108|chr19 ( 493) 1094 159.9 5.9e-39 CCDS54852.1 CDC20B gene_id:166979|Hs108|chr5 ( 519) 1064 155.9 1e-37 CCDS3966.1 CDC20B gene_id:166979|Hs108|chr5 ( 515) 1049 153.9 4e-37 CCDS45917.1 FZR1 gene_id:51343|Hs108|chr19 ( 404) 876 130.5 3.5e-30 CCDS47207.1 CDC20B gene_id:166979|Hs108|chr5 ( 477) 734 111.4 2.2e-24 >>CCDS484.1 CDC20 gene_id:991|Hs108|chr1 (499 aa) initn: 3401 init1: 3401 opt: 3401 Z-score: 2491.6 bits: 470.5 E(32554): 1.8e-132 Smith-Waterman score: 3401; 100.0% identity (100.0% similar) in 499 aa overlap (1-499:1-499) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAQFAFESDLHSLLQLDAPIPNAPPARWQRKAKEAAGPAPSPMRAANRSHSAGRTPGRTP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 MAQFAFESDLHSLLQLDAPIPNAPPARWQRKAKEAAGPAPSPMRAANRSHSAGRTPGRTP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 GKSSSKVQTTPSKPGGDRYIPHRSAAQMEVASFLLSKENQPENSQTPTKKEHQKAWALNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 GKSSSKVQTTPSKPGGDRYIPHRSAAQMEVASFLLSKENQPENSQTPTKKEHQKAWALNL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 NGFDVEEAKILRLSGKPQNAPEGYQNRLKVLYSQKATPGSSRKTCRYIPSLPDRILDAPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 NGFDVEEAKILRLSGKPQNAPEGYQNRLKVLYSQKATPGSSRKTCRYIPSLPDRILDAPE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 IRNDYYLNLVDWSSGNVLAVALDNSVYLWSASSGDILQLLQMEQPGEYISSVAWIKEGNY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 IRNDYYLNLVDWSSGNVLAVALDNSVYLWSASSGDILQLLQMEQPGEYISSVAWIKEGNY 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 LAVGTSSAEVQLWDVQQQKRLRNMTSHSARVGSLSWNSYILSSGSRSGHIHHHDVRVAEH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 LAVGTSSAEVQLWDVQQQKRLRNMTSHSARVGSLSWNSYILSSGSRSGHIHHHDVRVAEH 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 HVATLSGHSQEVCGLRWAPDGRHLASGGNDNLVNVWPSAPGEGGWVPLQTFTQHQGAVKA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 HVATLSGHSQEVCGLRWAPDGRHLASGGNDNLVNVWPSAPGEGGWVPLQTFTQHQGAVKA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 VAWCPWQSNVLATGGGTSDRHIRIWNVCSGACLSAVDAHSQVCSILWSPHYKELISGHGF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 VAWCPWQSNVLATGGGTSDRHIRIWNVCSGACLSAVDAHSQVCSILWSPHYKELISGHGF 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 AQNQLVIWKYPTMAKVAELKGHTSRVLSLTMSPDGATVASAAADETLRLWRCFELDPARR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 AQNQLVIWKYPTMAKVAELKGHTSRVLSLTMSPDGATVASAAADETLRLWRCFELDPARR 430 440 450 460 470 480 490 pF1KE1 REREKASAAKSSLIHQGIR ::::::::::::::::::: CCDS48 REREKASAAKSSLIHQGIR 490 >>CCDS45916.1 FZR1 gene_id:51343|Hs108|chr19 (496 aa) initn: 1157 init1: 490 opt: 1095 Z-score: 813.6 bits: 160.0 E(32554): 5.4e-39 Smith-Waterman score: 1114; 40.5% identity (66.7% similar) in 472 aa overlap (58-487:29-487) 30 40 50 60 70 80 pF1KE1 WQRKAKEAAGPAPSPMRAANRSHSAGRTPGRTPGKSSSKVQTTPSKPGGDRYIPHRSAAQ :: .:: : ..::: : ::.:: :..:. 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CCDS12 MDQDYERRLLRQIVIQNENTMPRVTEMRRTLTPASSPV-SSPSKHG-DRFIPSRAGAN 10 20 30 40 50 90 100 110 120 130 140 pF1KE1 MEVASFLLSKENQPENSQTPTKKEHQKAWALNLNGFD-VEEAKILR--LSG----KPQNA : .. :: ..:..... : : . :: : . . .:. : : : :. CCDS12 WSVNFHRIN-----ENEKSPSQNRKAKD-ATSDNGKDGLAYSALLKNELLGAGIEKVQD- 60 70 80 90 100 150 160 pF1KE1 PEGYQNRLK------------VLYSQKATPG----------------------SSRKTCR :. . ::. : .....: : :: : CCDS12 PQTEDRRLQPSTPEKKGLFTYSLSTKRSSPDDGNDVSPYSLSPVSNKSQKLLRSPRKPTR 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 YIPSLPDRILDAPEIRNDYYLNLVDWSSGNVLAVALDNSVYLWSASSGDILQLLQMEQPG : ..: ..:::::...:.::::::::: :::.:.: . :::::: .... .: .. : CCDS12 KISKIPFKVLDAPELQDDFYLNLVDWSSLNVLSVGLGTCVYLWSACTSQVTRLCDLSVEG 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 EYISSVAWIKEGNYLAVGTSSAEVQLWDVQQQKRLRNMTSHSARVGSLSWNSYILSSGSR . ..::.: ..:: .:::: .. ::.::. :.: . .:.::::.:.::. :::::: CCDS12 DSVTSVGWSERGNLVAVGTHKGFVQIWDAAAGKKLSMLEGHTARVGALAWNAEQLSSGSR 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 SGHIHHHDVRVAEHHVAT-LSGHSQEVCGLRWAPDGRHLASGGNDNLVNVWPSAPGEGGW . : ..:.:. . :.:: ::::::.:. : . :::::::: . :: .... CCDS12 DRMILQRDIRTPPLQSERRLQGHRQEVCGLKWSTDHQLLASGGNDNKLLVW----NHSSL 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 VPLQTFTQHQGAVKAVAWCPWQSNVLATGGGTSDRHIRIWNVCSGACLSAVDAHSQVCSI :.: .:.: .::::.:: : : ..::.::::.:: ::.::. .: :. .:. ::::.. CCDS12 SPVQQYTEHLAAVKAIAWSPHQHGLLASGGGTADRCIRFWNTLTGQPLQCIDTGSQVCNL 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 LWSPHYKELISGHGFAQNQLVIWKYPTMAKVAELKGHTSRVLSLTMSPDGATVASAAADE :: : .::.: ::..:::...::::....::.: ::. ::: :.::::: .....:.:: CCDS12 AWSKHANELVSTHGYSQNQILVWKYPSLTQVAKLTGHSYRVLYLAMSPDGEAIVTGAGDE 410 420 430 440 450 460 470 480 490 pF1KE1 TLRLWRCFELDPARRREREKASAAKSSLIHQGIR :::.: : CCDS12 TLRFWNVFSKTRSTKESVSVLNLFTRIR 470 480 490 >>CCDS54852.1 CDC20B gene_id:166979|Hs108|chr5 (519 aa) initn: 1065 init1: 520 opt: 1064 Z-score: 790.8 bits: 155.9 E(32554): 1e-37 Smith-Waterman score: 1070; 37.9% identity (66.0% similar) in 486 aa overlap (6-473:54-519) 10 20 30 pF1KE1 MAQFAFESDLHSLLQLDAPIPNAP-PARWQRKAKE :.:.. . :. ..:. ..: .:::. CCDS54 IMRVLSKDLKQKRSQDSANVLDSVNATYSDFKSNFAKRLSAEVPVASSPITTRWQQ---- 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 AAGPAPSPMRAANRSHSAGRTPGRT--PGKSSSKVQTTPSKPGGDRYIPHRSAAQMEVAS : :: . : : :. . : : :.: ..: : : . :... : CCDS54 ------SQTRALS-SDSFGEEQSTTYLPEASGSVLKTPPEK---ETLTLGSRKEQLKTPS 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 FLLSKENQPENSQTPTKKEHQKAWALNLNGFDVEEAKILRLSGKPQNAPEGYQNRLKVLY .:. .. . . .. : .. . . : :. ::. . ...... CCDS54 KGISETSNSALHFCKAPHAMDRDWKESVAS---KGQKCLKQLFVTQNVVQQANGKMQLCE 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 pF1KE1 SQ----KATPGSSRKTCRYIPS---LPDRILDAPEI-------RNDYYLNLVDWSSGNVL .. :. . : .. : . : ::. ::. :::::::..::: :.. CCDS54 QSECVWKGCKDGVRDESFHLKSSGDINDSILQ-PEVKIHITGLRNDYYLNILDWSFQNLV 190 200 210 220 230 240 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 AVALDNSVYLWSASSGDILQLLQMEQPGEYISSVAWIKEGNYLAVGTSSAEVQLWDVQQQ :.:: ..::.:.. . . .. ... .:::::.:::::. :::::: .::::::: . CCDS54 AIALGSAVYIWNGENHNGIENIDLSLTCNYISSVSWIKEGTCLAVGTSEGEVQLWDVVTK 250 260 270 280 290 300 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 KRLRNMTSHSARVGSLSWNSYILSSGSRSGHIHHHDVRVAEHHVATLSGHSQEVCGLRWA :::::: .: . ::.:::: .::::::: :...:::::::.:::.:: :.: ::.:.:. CCDS54 KRLRNMLGHLSVVGALSWNHFILSSGSRLGRVYHHDVRVAQHHVGTLR-HKQAVCALKWS 310 320 330 340 350 360 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 PDGRHLASGGNDNLVNVWPSAPGEGGW-VPLQTFTQHQGAVKAVAWCPWQSNVLATGGGT :::: :.:: .:.:...:: :: .. ::...:: . ::::. ::::::.::: ::: CCDS54 PDGRLLSSGCSDGLLTIWPHDPGASAQGQPLKVITQ-STAVKAMDWCPWQSGVLAIGGGM 370 380 390 400 410 420 380 390 400 410 420 430 pF1KE1 SDRHIRIWNVCSGACLSAVDAHSQVCSILWSPHYKELISGHGFAQNQLVIWKYPTMAKVA .: ...: .. .: ... ...::.::..: :. ::. .:.: .:....: ::... . CCDS54 KDGRLHILDINAGKSIQTPSTNSQICSLIWLPKTKEIATGQGTPKNDVTVWTCPTVSRSG 430 440 450 460 470 480 440 450 460 470 480 490 pF1KE1 ELKGHTSRVLSLTMSPDGATVASAAADETLRLWRCFELDPARRREREKASAAKSSLIHQG . :: .::: :..::: . : ::::: : .: :. CCDS54 GFFGHRGRVLHLSLSPDQTRVFSAAADGTASVWNCY 490 500 510 pF1KE1 IR >>CCDS3966.1 CDC20B gene_id:166979|Hs108|chr5 (515 aa) initn: 1025 init1: 509 opt: 1049 Z-score: 779.9 bits: 153.9 E(32554): 4e-37 Smith-Waterman score: 1060; 37.9% identity (65.8% similar) in 486 aa overlap (6-473:54-515) 10 20 30 pF1KE1 MAQFAFESDLHSLLQLDAPIPNAP-PARWQRKAKE :.:.. . :. ..:. ..: .:::. CCDS39 IMRVLSKDLKQKRSQDSANVLDSVNATYSDFKSNFAKRLSAEVPVASSPITTRWQQ---- 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 AAGPAPSPMRAANRSHSAGRTPGRT--PGKSSSKVQTTPSKPGGDRYIPHRSAAQMEVAS : :: . : : :. . : : :.: ..: : : . :... : CCDS39 ------SQTRALS-SDSFGEEQSTTYLPEASGSVLKTPPEK---ETLTLGSRKEQLKTPS 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 FLLSKENQPENSQTPTKKEHQKAWALNLNGFDVEEAKILRLSGKPQNAPEGYQNRLKVLY .:. .. . . .. : .. . . : :. ::. . ...... CCDS39 KGISETSNSALHFCKAPHAMDRDWKESVAS---KGQKCLKQLFVTQNVVQQANGKMQLCE 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 pF1KE1 SQ----KATPGSSRKTCRYIPS---LPDRILDAPEI-------RNDYYLNLVDWSSGNVL .. :. . : .. : . : ::. ::. :::::::..::: :.. CCDS39 QSECVWKGCKDGVRDESFHLKSSGDINDSILQ-PEVKIHITGLRNDYYLNILDWSFQNLV 190 200 210 220 230 240 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 AVALDNSVYLWSASSGDILQLLQMEQPGEYISSVAWIKEGNYLAVGTSSAEVQLWDVQQQ :.:: ..::.:.. . . .. ... .:::::.:::::. :::::: .::::::: . CCDS39 AIALGSAVYIWNGENHNGIENIDLSLTCNYISSVSWIKEGTCLAVGTSEGEVQLWDVVTK 250 260 270 280 290 300 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 KRLRNMTSHSARVGSLSWNSYILSSGSRSGHIHHHDVRVAEHHVATLSGHSQEVCGLRWA :::::: .: . ::.:::: .::::::: :...:::::::.:::.:: :.: ::.:.:. CCDS39 KRLRNMLGHLSVVGALSWNHFILSSGSRLGRVYHHDVRVAQHHVGTLR-HKQAVCALKWS 310 320 330 340 350 360 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 PDGRHLASGGNDNLVNVWPSAPGEGGW-VPLQTFTQHQGAVKAVAWCPWQSNVLATGGGT :::: :.:: .:.:...:: :: .. ::...:: . ::::. ::::::.::: ::: CCDS39 PDGRLLSSGCSDGLLTIWPHDPGASAQGQPLKVITQ-STAVKAMDWCPWQSGVLAIGGGM 370 380 390 400 410 420 380 390 400 410 420 430 pF1KE1 SDRHIRIWNVCSGACLSAVDAHSQVCSILWSPHYKELISGHGFAQNQLVIWKYPTMAKVA .: ...: .. .: ... ...::.::..: :. ::. .:.: .:....: ::... CCDS39 KDGRLHILDINAGKSIQTPSTNSQICSLIWLPKTKEIATGQGTPKNDVTVWTCPTVSR-- 430 440 450 460 470 480 440 450 460 470 480 490 pF1KE1 ELKGHTSRVLSLTMSPDGATVASAAADETLRLWRCFELDPARRREREKASAAKSSLIHQG .:: .::: :..::: . : ::::: : .: :. CCDS39 --SGHRGRVLHLSLSPDQTRVFSAAADGTASVWNCY 490 500 510 pF1KE1 IR >>CCDS45917.1 FZR1 gene_id:51343|Hs108|chr19 (404 aa) initn: 934 init1: 490 opt: 876 Z-score: 655.4 bits: 130.5 E(32554): 3.5e-30 Smith-Waterman score: 876; 47.5% identity (76.4% similar) in 259 aa overlap (216-473:130-384) 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 YLNLVDWSSGNVLAVALDNSVYLWSASSGDILQLLQMEQPGEYISSVAWIKEGNYLAVGT . .: .. :. ..::.: ..:: .:::: CCDS45 LGAGIEKVQDPQTEDRRLQPSTPEKKGLFTVTRLCDLSVEGDSVTSVGWSERGNLVAVGT 100 110 120 130 140 150 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 SSAEVQLWDVQQQKRLRNMTSHSARVGSLSWNSYILSSGSRSGHIHHHDVRVAEHHVAT- .. ::.::. :.: . .:.::::.:.::. ::::::. : ..:.:. . CCDS45 HKGFVQIWDAAAGKKLSMLEGHTARVGALAWNAEQLSSGSRDRMILQRDIRTPPLQSERR 160 170 180 190 200 210 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 LSGHSQEVCGLRWAPDGRHLASGGNDNLVNVWPSAPGEGGWVPLQTFTQHQGAVKAVAWC :.:: ::::::.:. : . :::::::: . :: .... :.: .:.: .::::.:: CCDS45 LQGHRQEVCGLKWSTDHQLLASGGNDNKLLVW----NHSSLSPVQQYTEHLAAVKAIAWS 220 230 240 250 260 270 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 PWQSNVLATGGGTSDRHIRIWNVCSGACLSAVDAHSQVCSILWSPHYKELISGHGFAQNQ : : ..::.::::.:: ::.::. .: :. .:. ::::.. :: : .::.: ::..::: CCDS45 PHQHGLLASGGGTADRCIRFWNTLTGQPLQCIDTGSQVCNLAWSKHANELVSTHGYSQNQ 280 290 300 310 320 330 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 LVIWKYPTMAKVAELKGHTSRVLSLTMSPDGATVASAAADETLRLWRCFELDPARRRERE ...::::....::.: ::. ::: :.::::: .....:.:::::.: : CCDS45 ILVWKYPSLTQVAKLTGHSYRVLYLAMSPDGEAIVTGAGDETLRFWNVFSKTRSTKESVS 340 350 360 370 380 390 490 pF1KE1 KASAAKSSLIHQGIR CCDS45 VLNLFTRIR 400 >>CCDS47207.1 CDC20B gene_id:166979|Hs108|chr5 (477 aa) initn: 876 init1: 509 opt: 734 Z-score: 551.1 bits: 111.4 E(32554): 2.2e-24 Smith-Waterman score: 837; 34.2% identity (59.3% similar) in 486 aa overlap (6-473:54-477) 10 20 30 pF1KE1 MAQFAFESDLHSLLQLDAPIPNAP-PARWQRKAKE :.:.. . :. ..:. ..: .:::. 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