FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8024, 205 aa 1>>>pF1KB8024 205 - 205 aa - 205 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2620+/-0.00102; mu= 13.7294+/- 0.062 mean_var=74.0485+/-15.628, 0's: 0 Z-trim(105.3): 225 B-trim: 536 in 3/48 Lambda= 0.149045 statistics sampled from 8093 (8340) to 8093 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.256), width: 16 Scan time: 1.880 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2 ( 205) 1330 295.2 1.9e-80 CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11 ( 201) 1215 270.4 5.2e-73 CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19 ( 207) 753 171.1 4.3e-43 CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15 ( 207) 743 168.9 1.9e-42 CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1 ( 203) 713 162.5 1.6e-40 CCDS1720.1 RAB10 gene_id:10890|Hs108|chr2 ( 200) 708 161.4 3.4e-40 CCDS41846.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12 ( 201) 699 159.5 1.3e-39 CCDS12372.1 RAB3A gene_id:5864|Hs108|chr19 ( 220) 643 147.5 6e-36 CCDS3976.1 RAB3C gene_id:115827|Hs108|chr5 ( 227) 640 146.8 9.6e-36 CCDS12257.1 RAB3D gene_id:9545|Hs108|chr19 ( 219) 635 145.7 2e-35 CCDS560.1 RAB3B gene_id:5865|Hs108|chr1 ( 219) 618 142.1 2.5e-34 CCDS34762.2 RAB19 gene_id:401409|Hs108|chr7 ( 217) 615 141.4 3.8e-34 CCDS10460.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16 ( 256) 609 140.2 1.1e-33 CCDS32722.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 223) 605 139.3 1.7e-33 CCDS33850.1 RAB43 gene_id:339122|Hs108|chr3 ( 212) 604 139.1 1.9e-33 CCDS76691.1 RAB15 gene_id:376267|Hs108|chr14 ( 212) 602 138.6 2.6e-33 CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14 ( 216) 601 138.4 3.1e-33 CCDS10212.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15 ( 216) 599 138.0 4.1e-33 CCDS6175.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8 ( 212) 597 137.6 5.5e-33 CCDS12201.1 RAB11B gene_id:9230|Hs108|chr19 ( 218) 587 135.4 2.5e-32 CCDS42410.1 RAB12 gene_id:201475|Hs108|chr18 ( 244) 587 135.5 2.7e-32 CCDS82198.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 196) 585 135.0 3.1e-32 CCDS54161.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 228) 585 135.0 3.5e-32 CCDS8264.1 RAB30 gene_id:27314|Hs108|chr11 ( 203) 584 134.8 3.7e-32 CCDS76806.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16 ( 190) 581 134.1 5.5e-32 CCDS6827.1 RAB14 gene_id:51552|Hs108|chr9 ( 215) 575 132.8 1.5e-31 CCDS53836.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12 ( 152) 559 129.3 1.2e-30 CCDS7155.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10 ( 206) 557 129.0 2.1e-30 CCDS11703.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 216) 554 128.3 3.4e-30 CCDS33030.1 RAB4B gene_id:53916|Hs108|chr19 ( 213) 549 127.2 7.1e-30 CCDS2633.1 RAB5A gene_id:5868|Hs108|chr3 ( 215) 549 127.2 7.1e-30 CCDS11419.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17 ( 216) 544 126.2 1.5e-29 CCDS58551.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17 ( 249) 544 126.2 1.7e-29 CCDS31050.1 RAB4A gene_id:5867|Hs108|chr1 ( 218) 540 125.3 2.8e-29 CCDS8900.1 RAB5B gene_id:5869|Hs108|chr12 ( 215) 537 124.7 4.3e-29 CCDS3747.1 RAB33B gene_id:83452|Hs108|chr4 ( 229) 521 121.2 4.9e-28 CCDS14621.1 RAB33A gene_id:9363|Hs108|chrX ( 237) 520 121.0 5.8e-28 CCDS58373.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15 ( 155) 511 119.0 1.6e-27 CCDS8338.1 RAB39A gene_id:54734|Hs108|chr11 ( 217) 509 118.6 2.8e-27 CCDS41413.1 RAB25 gene_id:57111|Hs108|chr1 ( 213) 508 118.4 3.2e-27 CCDS14766.1 RAB39B gene_id:116442|Hs108|chrX ( 213) 507 118.2 3.7e-27 CCDS45826.1 RAB31 gene_id:11031|Hs108|chr18 ( 195) 497 116.0 1.5e-26 CCDS33497.1 RAB22A gene_id:57403|Hs108|chr20 ( 194) 486 113.7 7.9e-26 CCDS11816.1 RAB40B gene_id:10966|Hs108|chr17 ( 278) 482 112.9 1.9e-25 CCDS9003.1 RAB21 gene_id:23011|Hs108|chr12 ( 225) 476 111.6 3.9e-25 CCDS8223.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11 ( 208) 471 110.5 7.8e-25 CCDS6662.1 RASEF gene_id:158158|Hs108|chr9 ( 740) 477 112.1 8.6e-25 CCDS56275.1 RAB43 gene_id:339122|Hs108|chr3 ( 155) 468 109.7 9.6e-25 CCDS8224.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11 ( 208) 466 109.4 1.6e-24 CCDS9768.1 RAB15 gene_id:376267|Hs108|chr14 ( 208) 465 109.2 1.9e-24 >>CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2 (205 aa) initn: 1330 init1: 1330 opt: 1330 Z-score: 1557.7 bits: 295.2 E(32554): 1.9e-80 Smith-Waterman score: 1330; 100.0% identity (100.0% similar) in 205 aa overlap (1-205:1-205) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 KLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEIDRYASENVNKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 KLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEIDRYASENVNKL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 LVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQSFMTMAAEIKKRMGPGA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 LVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQSFMTMAAEIKKRMGPGA 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KB8 TAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC ::::::::::::::::::::::::: CCDS46 TAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC 190 200 >>CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11 (201 aa) initn: 1119 init1: 1119 opt: 1215 Z-score: 1424.2 bits: 270.4 E(32554): 5.2e-73 Smith-Waterman score: 1215; 93.1% identity (97.0% similar) in 202 aa overlap (4-205:1-201) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTI ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 MNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTI 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 KLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEIDRYASENVNKL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::: CCDS31 KLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESYANVKQWLQEIDRYASENVNKL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 LVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQSFMTMAAEIKKRMGPGA ::::: ::::::::: :::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: CCDS31 LVGNKSDLTTKKVVDNTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQAFMTMAAEIKKRMGPGA 120 130 140 150 160 170 190 200 pF1KB8 TAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC ..:: :. :.::.::::: .::::: CCDS31 ASGG-ERPNLKIDSTPVKPAGGGCC 180 190 200 >>CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19 (207 aa) initn: 749 init1: 749 opt: 753 Z-score: 887.1 bits: 171.1 E(32554): 4.3e-43 Smith-Waterman score: 753; 55.1% identity (84.2% similar) in 196 aa overlap (4-199:1-196) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTI : :::::::::::::::::.:.:.::..:... ..:::::.:::::::::::: : CCDS12 MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDGKRI 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 KLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEIDRYASENVNKL :::::::::::::::::..::::: ::..:::.:...::.:...:...:...:: .:.:. CCDS12 KLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASADVEKM 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 LVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQSFMTMAAEIKKRMGPGA ..:::::.. :. :. ....: . :: :.::::: :::..:.:.: .:: .: CCDS12 ILGNKCDVNDKRQVSKERGEKLALDYGIKFMETSAKANINVENAFFTLARDIKAKMDKKL 120 130 140 150 160 170 190 200 pF1KB8 TAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC ... . :: .. :: .: CCDS12 EGNSPQGSNQGVKITPDQQKRSSFFRCVLL 180 190 200 >>CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15 (207 aa) initn: 730 init1: 730 opt: 743 Z-score: 875.5 bits: 168.9 E(32554): 1.9e-42 Smith-Waterman score: 743; 53.9% identity (84.5% similar) in 206 aa overlap (4-205:1-204) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTI : :::::::::::::::::.:::.::..:... ..:::::.:::::::::::: : CCDS10 MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCLLFRFSEDAFNTTFISTIGIDFKIRTIELDGKKI 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 KLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEIDRYASENVNKL :::::::::::::::::..::::: ::..:::.:...::.:.:.:...:...:: .:... CCDS10 KLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIKNWIRNIEEHASSDVERM 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KB8 LVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQSFMTMAAEI----KKRM ..:::::.. :. :. ....: . :: :::::::...:::..:.:.: .: ...: CCDS10 ILGNKCDMNDKRQVSKERGEKLAIDYGIKFLETSAKSSANVEEAFFTLARDIMTKLNRKM 120 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KB8 GPGATAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC . . .::.. . ::: . :... : CCDS10 NDSNSAGAG--GPVKITENRSKKTSFFRCSLL 180 190 200 >>CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1 (203 aa) initn: 695 init1: 695 opt: 713 Z-score: 840.7 bits: 162.5 E(32554): 1.6e-40 Smith-Waterman score: 713; 52.2% identity (81.1% similar) in 201 aa overlap (4-204:1-200) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTI : ::.::::::::::::::.::..:::.:.....::::::.::::::....:: : CCDS10 MAKAYDHLFKLLLIGDSGVGKTCLIIRFAEDNFNNTYISTIGIDFKIRTVDIEGKKI 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 KLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEIDRYASENVNKL :::.:::::::::.:::..::::: :::.:::.::..::.:...:.. : . :: .:..: CCDS10 KLQVWDTAGQERFKTITTAYYRGAMGIILVYDITDEKSFENIQNWMKSIKENASAGVERL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 LVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQSFMTMAAEIKKRMGPGA :.:::::. .:. :. : ..: :: :.:::::.. ::...: ..: .: . : : CCDS10 LLGNKCDMEAKRKVQKEQADKLAREHGIRFFETSAKSSMNVDEAFSSLARDILLKSG-GR 120 130 140 150 160 170 190 200 pF1KB8 TAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC .:...: .: :.. . : CCDS10 RSGNGNKPPSTDLKTCDKKNTNKCSLG 180 190 200 >>CCDS1720.1 RAB10 gene_id:10890|Hs108|chr2 (200 aa) initn: 723 init1: 708 opt: 708 Z-score: 835.0 bits: 161.4 E(32554): 3.4e-40 Smith-Waterman score: 708; 58.9% identity (88.1% similar) in 168 aa overlap (8-175:6-173) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTI :: ::::::::::::::.:.:.::.::... ..:::::.::::.:.::.:: : CCDS17 MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAFNTTFISTIGIDFKIKTVELQGKKI 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 KLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEIDRYASENVNKL :::::::::::::.:::.:::::: ::..:::.:. .::.:...::..::..:.:.:... CCDS17 KLQIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNGKSFENISKWLRNIDEHANEDVERM 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 LVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQSFMTMAAEIKKRMGPGA :.:::::. :.:: ....: :: :.::::: :.:..:.:.: .: .. CCDS17 LLGNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAKANINIEKAFLTLAEDILRKTPVKE 120 130 140 150 160 170 190 200 pF1KB8 TAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC CCDS17 PNSENVDISSGGGVTGWKSKCC 180 190 200 >>CCDS41846.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12 (201 aa) initn: 694 init1: 551 opt: 699 Z-score: 824.5 bits: 159.5 E(32554): 1.3e-39 Smith-Waterman score: 699; 54.0% identity (77.2% similar) in 202 aa overlap (4-205:1-201) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTI : .::.:::::.::::::::: :::::::.:.. :::.::::::::::.:..:. . CCDS41 MARDYDHLFKLLIIGDSGVGKSSLLLRFADNTFSGSYITTIGVDFKIRTVEINGEKV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 KLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEIDRYASENVNKL ::::::::::::::::::.::::.::.:::::::. ::: :::.::.::.. ..: .. CCDS41 KLQIWDTAGQERFRTITSTYYRGTHGVIVVYDVTSAESFVNVKRWLHEINQ-NCDDVCRI 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 LVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQSFMTMAAEIKKRMGPGA ::::: : .:::. : .:: ..:: ..:::::. .:::. : .. . . . CCDS41 LVGNKNDDPERKVVETEDAYKFAGQMGIQLFETSAKENVNVEEMFNCITELVLRAKKDNL 120 130 140 150 160 170 190 200 pF1KB8 TAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC . ...: .. : .. :: CCDS41 AKQQQQQQNDVVKLTKNSKRKKRCC 180 190 200 >>CCDS12372.1 RAB3A gene_id:5864|Hs108|chr19 (220 aa) initn: 641 init1: 621 opt: 643 Z-score: 758.9 bits: 147.5 E(32554): 6e-36 Smith-Waterman score: 643; 45.8% identity (79.3% similar) in 203 aa overlap (3-199:14-216) 10 20 30 40 pF1KB8 MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFK : . ..::.::.:.::.:.:::. .:.:.:::..: ...::.:.::: CCDS12 MASATDSRYGQKESSDQNFDYMFKILIIGNSSVGKTSFLFRYADDSFTPAFVSTVGIDFK 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB8 IRTIELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEI ..:: . : :::::::::::::.::::..::::: :.:..::.:..:::: :..: .: CCDS12 VKTIYRNDKRIKLQIWDTAGQERYRTITTAYYRGAMGFILMYDITNEESFNAVQDWSTQI 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB8 DRYASENVNKLLVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQSFMTMA :. .:.. ::::::::. ..::. ....:: ::. :.:.:::. ::.:.: .. CCDS12 KTYSWDNAQVLLVGNKCDMEDERVVSSERGRQLADHLGFEFFEASAKDNINVKQTFERLV 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 pF1KB8 AEIKKRMGPG------ATAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC : ..:. . :..:. . ... :..: .: CCDS12 DVICEKMSESLDTADPAVTGAKQGPQLSDQQVPPHQDCAC 190 200 210 220 >>CCDS3976.1 RAB3C gene_id:115827|Hs108|chr5 (227 aa) initn: 628 init1: 608 opt: 640 Z-score: 755.2 bits: 146.8 E(32554): 9.6e-36 Smith-Waterman score: 640; 44.7% identity (77.7% similar) in 206 aa overlap (3-205:22-227) 10 20 30 40 pF1KB8 MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYI : . ..::.::::.::.:.:::. .:.:.:::..: ... CCDS39 MRHEAPMQMASAQDARYGQKDSSDQNFDYMFKLLIIGNSSVGKTSFLFRYADDSFTSAFV 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB8 STIGVDFKIRTIELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNN ::.:.:::..:. . : :::::::::::::.::::..::::: :.:..::.:..:::: CCDS39 STVGIDFKVKTVFKNEKRIKLQIWDTAGQERYRTITTAYYRGAMGFILMYDITNEESFNA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB8 VKQWLQEIDRYASENVNKLLVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNV :..: .: :. .:.. .:::::::. ..:.. .......::. :.:::::. :: CCDS39 VQDWSTQIKTYSWDNAQVILVGNKCDMEDERVISTERGQHLGEQLGFEFFETSAKDNINV 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 pF1KB8 EQSFMTMAAEIKKRMGPGAT---AGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC .:.: .. : .:. . : : :.:.... :: . . : CCDS39 KQTFERLVDIICDKMSESLETDPAITAAKQNTRLKETPPPPQPNCAC 190 200 210 220 >>CCDS12257.1 RAB3D gene_id:9545|Hs108|chr19 (219 aa) initn: 639 init1: 619 opt: 635 Z-score: 749.6 bits: 145.7 E(32554): 2e-35 Smith-Waterman score: 635; 44.9% identity (78.0% similar) in 205 aa overlap (5-205:16-219) 10 20 30 40 pF1KB8 MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFK . ..::.:::::::.:.:::. .:.:.:::..: ...::.:.::: CCDS12 MASAGDTQAGPRDAADQNFDYMFKLLLIGNSSVGKTSFLFRYADDSFTPAFVSTVGIDFK 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB8 IRTIELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEI ..:. : :::::::::::::.::::..::::: :....::...:::: :..: .: CCDS12 VKTVYRHDKRIKLQIWDTAGQERYRTITTAYYRGAMGFLLMYDIANQESFAAVQDWATQI 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB8 DRYASENVNKLLVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQSFMTMA :. .:.. .:::::::: ..:: ....::.::. :.:.:::. ::.: : .. CCDS12 KTYSWDNAQVILVGNKCDLEDERVVPAEDGRRLADDLGFEFFEASAKENINVKQVFERLV 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 pF1KB8 AEIKKRMG----PGATAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC : ..:. :....:. :. . . ..:. : .. : CCDS12 DVICEKMNESLEPSSSSGSNGKGPA-VGDAPAPQPSSCSC 190 200 210 205 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 23:33:05 2016 done: Sun Nov 6 23:33:06 2016 Total Scan time: 1.880 Total Display time: -0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]