FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1543, 473 aa 1>>>pF1KE1543 473 - 473 aa - 473 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9322+/-0.000363; mu= 19.8764+/- 0.022 mean_var=70.6427+/-14.018, 0's: 0 Z-trim(114.1): 52 B-trim: 818 in 2/56 Lambda= 0.152595 statistics sampled from 23771 (23823) to 23771 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16 Scan time: 7.610 The best scores are: opt bits E(85289) XP_005265582 (OMIM: 603551) PREDICTED: hyaluronida ( 473) 3323 740.9 1.7e-213 NP_003764 (OMIM: 603551) hyaluronidase-2 precursor ( 473) 3323 740.9 1.7e-213 XP_005265581 (OMIM: 603551) PREDICTED: hyaluronida ( 473) 3323 740.9 1.7e-213 NP_149348 (OMIM: 603551) hyaluronidase-2 precursor ( 473) 3323 740.9 1.7e-213 XP_016867400 (OMIM: 604510) PREDICTED: hyaluronida ( 481) 1193 272.0 2.5e-72 XP_011514292 (OMIM: 604510) PREDICTED: hyaluronida ( 481) 1193 272.0 2.5e-72 NP_036401 (OMIM: 604510) hyaluronidase-4 [Homo sap ( 481) 1193 272.0 2.5e-72 XP_011531969 (OMIM: 601492,607071) PREDICTED: hyal ( 435) 1183 269.8 1.1e-71 NP_149349 (OMIM: 601492,607071) hyaluronidase-1 is ( 435) 1183 269.8 1.1e-71 NP_695013 (OMIM: 601492,607071) hyaluronidase-1 is ( 435) 1183 269.8 1.1e-71 XP_011531971 (OMIM: 601492,607071) PREDICTED: hyal ( 435) 1183 269.8 1.1e-71 XP_011531970 (OMIM: 601492,607071) PREDICTED: hyal ( 435) 1183 269.8 1.1e-71 NP_001167515 (OMIM: 600930) hyaluronidase PH-20 is ( 509) 1157 264.1 6.4e-70 NP_001167516 (OMIM: 600930) hyaluronidase PH-20 is ( 509) 1157 264.1 6.4e-70 NP_001167517 (OMIM: 600930) hyaluronidase PH-20 is ( 509) 1157 264.1 6.4e-70 NP_694859 (OMIM: 600930) hyaluronidase PH-20 isofo ( 509) 1157 264.1 6.4e-70 NP_003108 (OMIM: 600930) hyaluronidase PH-20 isofo ( 511) 1157 264.1 6.4e-70 NP_001186958 (OMIM: 604038) hyaluronidase-3 isofor ( 417) 1088 248.9 2.1e-65 NP_003540 (OMIM: 604038) hyaluronidase-3 isoform 1 ( 417) 1088 248.9 2.1e-65 XP_011514293 (OMIM: 604510) PREDICTED: hyaluronida ( 451) 835 193.2 1.3e-48 NP_695014 (OMIM: 601492,607071) hyaluronidase-1 is ( 405) 832 192.5 1.9e-48 NP_001186959 (OMIM: 604038) hyaluronidase-3 isofor ( 387) 757 176.0 1.7e-43 NP_695015 (OMIM: 601492,607071) hyaluronidase-1 is ( 253) 692 161.5 2.5e-39 NP_001186960 (OMIM: 604038) hyaluronidase-3 isofor ( 168) 432 104.1 3.1e-22 NP_695017 (OMIM: 601492,607071) hyaluronidase-1 is ( 176) 406 98.4 1.7e-20 NP_001186961 (OMIM: 604038) hyaluronidase-3 isofor ( 138) 220 57.4 3e-08 >>XP_005265582 (OMIM: 603551) PREDICTED: hyaluronidase-2 (473 aa) initn: 3323 init1: 3323 opt: 3323 Z-score: 3953.8 bits: 740.9 E(85289): 1.7e-213 Smith-Waterman score: 3323; 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XP_011 LRLNLKMFPVIGSPLAKARGQNVTIFYVNRLGYYPWYTSQGVPINGGLPQNISLQVHLEK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 LQKRVEHYIRTQESAGLAVIDWEDWRPVWVRNWQDKDVYRRLSRQLVASRHPDWPPDRIV .. ...:: ... .:::::::: ::: :.:::..:::::. ::.:... . : XP_011 ADQDINYYIPAEDFSGLAVIDWEYWRPQWARNWNSKDVYRQKSRKLISDMGKNVSATDIE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 KQAQYEFEFAAQQFMLETLRYVKAVRPRHLWGFYLFPDCYNHD-YVQNWESYTGRCPDVE :. :: .:. :: ::.. ::. :::.::.:::.:.. :. : :.: ::. : XP_011 YLAKVTFEESAKAFMKETIKLGIKSRPKGLWGYYLYPDCHNYNVYAPN---YSGSCPEDE 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 VARNDQLAWLWAESTALFPSVYLDETLASSRHGRNFVSFRVQEALRVARTHHANHALPVY : ::..:.::: :.::.::. . ..:..:.. : .:::.:..:.. ..::::. XP_011 VLRNNELSWLWNSSAALYPSIGVWKSLGDSENILRFSKFRVHESMRISTMTSHDYALPVF 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 VFTRPTYSRR-LTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTSTETCQYLKDYLTRL :.:: : . : ::..::.:::::::::::::...::: . :.: .: .:.... 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NP_036 VLRNNELSWLWNSSAALYPSIGVWKSLGDSENILRFSKFRVHESMRISTMTSHDYALPVF 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 VFTRPTYSRR-LTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTSTETCQYLKDYLTRL :.:: : . : ::..::.:::::::::::::...::: . :.: .: .:.... NP_036 VYTRLGYRDEPLFFLSKQDLVSTIGESAALGAAGIVIWGDMNLTASKANCTKVKQFVSSD 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 LVPYVVNVSWATQYCSRAQCHGHGRCVRRNPSASTFLHLSTNSFRLVPGHAPGEPQLRPV : :..::. :.. :: :...:::.:. .: ..:::. :.. . . :: .. NP_036 LGSYIANVTRAAEVCSLHLCRNNGRCIRKMWNAPSYLHLNPASYH-IEASEDGEFTVK-- 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 GELSWADIDHLQTHFRCQCYLGWSGEQCQWDHRQAAG--GASEAWAGSHLTSLLALAALA :. : .:. . : :.:: :. : .:. . . : : :.: . :: .: : : : NP_036 GKASDTDLAVMADTFSCHCYQGYEGADCR-EIKTADGCSGVSPS-PGSLMTLCLLLLASY 420 430 440 450 460 470 470 pF1KE1 FTWTL NP_036 RSIQL 480 >>XP_011531969 (OMIM: 601492,607071) PREDICTED: hyaluron (435 aa) initn: 1185 init1: 639 opt: 1183 Z-score: 1408.2 bits: 269.8 E(85289): 1.1e-71 Smith-Waterman score: 1183; 42.9% identity (70.0% similar) in 413 aa overlap (29-439:25-430) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MRAGPGPTVTLALVLAVAWAMELKPTAPPIFTGRPFVVAWDVPTQDCGPRLKVPLDLNAF :.. .:::...:.. :: : : : .:...: XP_011 MAAHLLPICALFLTLLDMAQGFRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCLERHGVDVDVSVF 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 DVQASPNEGFVNQNITIFYRDRLGLYPRFDSAGRSVHGGVPQNVSLWAHRKMLQKRVEHY :: :.:.. : . ..:::: ..:: :: . .:. : ::.:::.:: :: . . 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NP_149 IPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQ 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 FAAQQFMLETLRYVKAVRPRHLWGFYLFPDCYNHDYVQNWESYTGRCPDVEVARNDQLAW ::. .: ::. .:.::: ::::: ::::::.:... .:::.::. :.::::.: NP_149 GAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLS--PNYTGQCPSGIRAQNDQLGW 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 LWAESTALFPSVYLDETLASSRHGRNFVSFRVQEALRVARTHHANHALPVYVFTRPTYSR ::..: ::.::.:. .: .. ... .:. :: ::.::: . .. ::: ... :. NP_149 LWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVA-VAAGDPNLPVLPYVQIFYDT 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 RLTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTSTETCQYLKDYLTRLLVPYVVNVSW : .: ..::::: :::::.:: . : . :.:: .:.:. : :...::. NP_149 TNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDTTLGPFILNVTS 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 pF1KE1 ATQYCSRAQCHGHGRCVRR--NPSASTFLHLSTNSFRLVPGHAPGEPQLRPVGELSWADI .. ::.: : :::::::: .:.: .:. .. :..:.:: .: .:: : :: : NP_149 GALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPL--SLR--GALSLEDQ 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 DHLQTHFRCQCYLGWSGEQCQWDHRQAAGGASEAWAGSHLTSLLALAALAFTWTL .. ..:.:.:: ::.. :. NP_149 AQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW 410 420 430 >>NP_695013 (OMIM: 601492,607071) hyaluronidase-1 isofor (435 aa) initn: 1185 init1: 639 opt: 1183 Z-score: 1408.2 bits: 269.8 E(85289): 1.1e-71 Smith-Waterman score: 1183; 42.9% identity (70.0% similar) in 413 aa overlap (29-439:25-430) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MRAGPGPTVTLALVLAVAWAMELKPTAPPIFTGRPFVVAWDVPTQDCGPRLKVPLDLNAF :.. .:::...:.. :: : : : .:...: NP_695 MAAHLLPICALFLTLLDMAQGFRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCLERHGVDVDVSVF 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 DVQASPNEGFVNQNITIFYRDRLGLYPRFDSAGRSVHGGVPQNVSLWAHRKMLQKRVEHY :: :.:.. : . ..:::: ..:: :: . .:. : ::.:::.:: :: . . NP_695 DVVANPGQTFRGPDMTIFYSSQLGTYPYYTPTGEPVFGGLPQNASLIAHLARTFQDILAA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 IRTQESAGLAVIDWEDWRPVWVRNWQDKDVYRRLSRQLVASRHPDWPPDRIVKQAQYEFE : . . .:::::::: ::: :. ::. ::.::. :: :: ..::::: .. :: .:. NP_695 IPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQ 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 FAAQQFMLETLRYVKAVRPRHLWGFYLFPDCYNHDYVQNWESYTGRCPDVEVARNDQLAW ::. .: ::. .:.::: ::::: ::::::.:... .:::.::. :.::::.: NP_695 GAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLS--PNYTGQCPSGIRAQNDQLGW 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 LWAESTALFPSVYLDETLASSRHGRNFVSFRVQEALRVARTHHANHALPVYVFTRPTYSR ::..: ::.::.:. .: .. ... .:. :: ::.::: . .. ::: ... :. NP_695 LWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVA-VAAGDPNLPVLPYVQIFYDT 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 RLTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTSTETCQYLKDYLTRLLVPYVVNVSW : .: ..::::: :::::.:: . : . :.:: .:.:. : :...::. 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