FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1543, 473 aa 1>>>pF1KE1543 473 - 473 aa - 473 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2583+/-0.000803; mu= 17.9015+/- 0.048 mean_var=69.8568+/-13.587, 0's: 0 Z-trim(107.5): 24 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.153451 statistics sampled from 9596 (9613) to 9596 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16 Scan time: 3.130 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2818.1 HYAL2 gene_id:8692|Hs108|chr3 ( 473) 3323 744.9 4.3e-215 CCDS5789.1 HYAL4 gene_id:23553|Hs108|chr7 ( 481) 1193 273.3 3.8e-73 CCDS2816.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 ( 435) 1183 271.1 1.6e-72 CCDS5791.1 SPAM1 gene_id:6677|Hs108|chr7 ( 509) 1157 265.4 1e-70 CCDS5790.1 SPAM1 gene_id:6677|Hs108|chr7 ( 511) 1157 265.4 1e-70 CCDS2815.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 ( 417) 1088 250.1 3.4e-66 CCDS2817.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 ( 405) 832 193.4 3.8e-49 CCDS56257.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 ( 387) 757 176.8 3.7e-44 CCDS46832.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 ( 253) 692 162.3 5.6e-40 CCDS56260.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 ( 168) 432 104.6 8.5e-23 CCDS46833.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 ( 176) 406 98.8 4.8e-21 >>CCDS2818.1 HYAL2 gene_id:8692|Hs108|chr3 (473 aa) initn: 3323 init1: 3323 opt: 3323 Z-score: 3975.2 bits: 744.9 E(32554): 4.3e-215 Smith-Waterman score: 3323; 99.8% identity (100.0% similar) in 473 aa overlap (1-473:1-473) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MRAGPGPTVTLALVLAVAWAMELKPTAPPIFTGRPFVVAWDVPTQDCGPRLKVPLDLNAF :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS28 MRAGPGPTVTLALVLAVSWAMELKPTAPPIFTGRPFVVAWDVPTQDCGPRLKVPLDLNAF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 DVQASPNEGFVNQNITIFYRDRLGLYPRFDSAGRSVHGGVPQNVSLWAHRKMLQKRVEHY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS28 DVQASPNEGFVNQNITIFYRDRLGLYPRFDSAGRSVHGGVPQNVSLWAHRKMLQKRVEHY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 IRTQESAGLAVIDWEDWRPVWVRNWQDKDVYRRLSRQLVASRHPDWPPDRIVKQAQYEFE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS28 IRTQESAGLAVIDWEDWRPVWVRNWQDKDVYRRLSRQLVASRHPDWPPDRIVKQAQYEFE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 FAAQQFMLETLRYVKAVRPRHLWGFYLFPDCYNHDYVQNWESYTGRCPDVEVARNDQLAW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS28 FAAQQFMLETLRYVKAVRPRHLWGFYLFPDCYNHDYVQNWESYTGRCPDVEVARNDQLAW 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 LWAESTALFPSVYLDETLASSRHGRNFVSFRVQEALRVARTHHANHALPVYVFTRPTYSR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS28 LWAESTALFPSVYLDETLASSRHGRNFVSFRVQEALRVARTHHANHALPVYVFTRPTYSR 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 RLTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTSTETCQYLKDYLTRLLVPYVVNVSW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS28 RLTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTSTETCQYLKDYLTRLLVPYVVNVSW 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 ATQYCSRAQCHGHGRCVRRNPSASTFLHLSTNSFRLVPGHAPGEPQLRPVGELSWADIDH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS28 ATQYCSRAQCHGHGRCVRRNPSASTFLHLSTNSFRLVPGHAPGEPQLRPVGELSWADIDH 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 LQTHFRCQCYLGWSGEQCQWDHRQAAGGASEAWAGSHLTSLLALAALAFTWTL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS28 LQTHFRCQCYLGWSGEQCQWDHRQAAGGASEAWAGSHLTSLLALAALAFTWTL 430 440 450 460 470 >>CCDS5789.1 HYAL4 gene_id:23553|Hs108|chr7 (481 aa) initn: 1122 init1: 610 opt: 1193 Z-score: 1426.6 bits: 273.3 E(32554): 3.8e-73 Smith-Waterman score: 1193; 40.8% identity (69.4% similar) in 448 aa overlap (23-466:35-474) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MRAGPGPTVTLALVLAVAWAMELKPTAPPIFTGRPFVVAWDVPTQDCGPRLK :::. ::. .::..::..::..: . . CCDS57 SEGQLKLCVVQPVHLTSWLLIFFILKSISCLKPARLPIYQRKPFIAAWNAPTDQCLIKYN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 VPLDLNAFDVQASPNEGFVNQNITIFYRDRLGLYPRFDSAGRSVHGGVPQNVSLWAHRKM . :.:. : : .:: .::.:::: .::: :: . : : ..::.:::.:: .: . CCDS57 LRLNLKMFPVIGSPLAKARGQNVTIFYVNRLGYYPWYTSQGVPINGGLPQNISLQVHLEK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 LQKRVEHYIRTQESAGLAVIDWEDWRPVWVRNWQDKDVYRRLSRQLVASRHPDWPPDRIV .. ...:: ... .:::::::: ::: :.:::..:::::. ::.:... . : CCDS57 ADQDINYYIPAEDFSGLAVIDWEYWRPQWARNWNSKDVYRQKSRKLISDMGKNVSATDIE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 KQAQYEFEFAAQQFMLETLRYVKAVRPRHLWGFYLFPDCYNHD-YVQNWESYTGRCPDVE :. :: .:. :: ::.. ::. :::.::.:::.:.. :. : :.: ::. : CCDS57 YLAKVTFEESAKAFMKETIKLGIKSRPKGLWGYYLYPDCHNYNVYAPN---YSGSCPEDE 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 VARNDQLAWLWAESTALFPSVYLDETLASSRHGRNFVSFRVQEALRVARTHHANHALPVY : ::..:.::: :.::.::. . ..:..:.. : .:::.:..:.. ..::::. CCDS57 VLRNNELSWLWNSSAALYPSIGVWKSLGDSENILRFSKFRVHESMRISTMTSHDYALPVF 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 VFTRPTYSRR-LTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTSTETCQYLKDYLTRL :.:: : . : ::..::.:::::::::::::...::: . :.: .: .:.... CCDS57 VYTRLGYRDEPLFFLSKQDLVSTIGESAALGAAGIVIWGDMNLTASKANCTKVKQFVSSD 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 LVPYVVNVSWATQYCSRAQCHGHGRCVRRNPSASTFLHLSTNSFRLVPGHAPGEPQLRPV : :..::. :.. :: :...:::.:. .: ..:::. :.. . . :: .. CCDS57 LGSYIANVTRAAEVCSLHLCRNNGRCIRKMWNAPSYLHLNPASYH-IEASEDGEFTVK-- 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 GELSWADIDHLQTHFRCQCYLGWSGEQCQWDHRQAAG--GASEAWAGSHLTSLLALAALA :. : .:. . : :.:: :. : .:. . . : : :.: . :: .: : : : CCDS57 GKASDTDLAVMADTFSCHCYQGYEGADCR-EIKTADGCSGVSPS-PGSLMTLCLLLLASY 420 430 440 450 460 470 470 pF1KE1 FTWTL CCDS57 RSIQL 480 >>CCDS2816.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 (435 aa) initn: 1185 init1: 639 opt: 1183 Z-score: 1415.3 bits: 271.1 E(32554): 1.6e-72 Smith-Waterman score: 1183; 42.9% identity (70.0% similar) in 413 aa overlap (29-439:25-430) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MRAGPGPTVTLALVLAVAWAMELKPTAPPIFTGRPFVVAWDVPTQDCGPRLKVPLDLNAF :.. .:::...:.. :: : : : .:...: CCDS28 MAAHLLPICALFLTLLDMAQGFRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCLERHGVDVDVSVF 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 DVQASPNEGFVNQNITIFYRDRLGLYPRFDSAGRSVHGGVPQNVSLWAHRKMLQKRVEHY :: :.:.. : . ..:::: ..:: :: . .:. : ::.:::.:: :: . . CCDS28 DVVANPGQTFRGPDMTIFYSSQLGTYPYYTPTGEPVFGGLPQNASLIAHLARTFQDILAA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 IRTQESAGLAVIDWEDWRPVWVRNWQDKDVYRRLSRQLVASRHPDWPPDRIVKQAQYEFE : . . .:::::::: ::: :. ::. ::.::. :: :: ..::::: .. :: .:. CCDS28 IPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQ 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 FAAQQFMLETLRYVKAVRPRHLWGFYLFPDCYNHDYVQNWESYTGRCPDVEVARNDQLAW ::. .: ::. .:.::: ::::: ::::::.:... .:::.::. :.::::.: CCDS28 GAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLS--PNYTGQCPSGIRAQNDQLGW 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 LWAESTALFPSVYLDETLASSRHGRNFVSFRVQEALRVARTHHANHALPVYVFTRPTYSR ::..: ::.::.:. .: .. ... .:. :: ::.::: . .. ::: ... :. CCDS28 LWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVA-VAAGDPNLPVLPYVQIFYDT 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 RLTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTSTETCQYLKDYLTRLLVPYVVNVSW : .: ..::::: :::::.:: . : . :.:: .:.:. : :...::. CCDS28 TNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDTTLGPFILNVTS 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 pF1KE1 ATQYCSRAQCHGHGRCVRR--NPSASTFLHLSTNSFRLVPGHAPGEPQLRPVGELSWADI .. ::.: : :::::::: .:.: .:. .. :..:.:: .: .:: : :: : CCDS28 GALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPL--SLR--GALSLEDQ 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 DHLQTHFRCQCYLGWSGEQCQWDHRQAAGGASEAWAGSHLTSLLALAALAFTWTL .. ..:.:.:: ::.. :. CCDS28 AQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW 410 420 430 >>CCDS5791.1 SPAM1 gene_id:6677|Hs108|chr7 (509 aa) initn: 977 init1: 531 opt: 1157 Z-score: 1383.2 bits: 265.4 E(32554): 1e-70 Smith-Waterman score: 1157; 40.3% identity (71.8% similar) in 412 aa overlap (21-430:34-438) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MRAGPGPTVTLALVLAVAWAMELKPTAPPIFTGRPFVVAWDVPTQDCGPR . :. :::.. . ::. ::..:.. : . CCDS57 LKFKHIFFRSFVKSSGVSQIVFTFLLIPCCLTLNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFCLGK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE1 LKVPLDLNAFDVQASPNEGFVNQNITIFYRDRLGLYPRFDS-AGRSVHGGVPQNVSLWAH . :::.. :. .:: . ..:..:::: :::: :: .:: .: .:.::.::..:: : CCDS57 FDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISLQDH 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 RKMLQKRVEHYIRTQESAGLAVIDWEDWRPVWVRNWQDKDVYRRLSRQLVASRHPDWPPD .: . :. . .. :.::::::.:::.:.:::. ::::. : .:: ... . CCDS57 LDKAKKDITFYMPV-DNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLSLT 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 RIVKQAQYEFEFAAQQFMLETLRYVKAVRPRHLWGFYLFPDCYNHDYVQNWESYTGRCPD . ...:. ::: :...:..::.. : .:: ::::.::::::::: : . .:.: : . CCDS57 EATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKK--PGYNGSCFN 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 VEVARNDQLAWLWAESTALFPSVYLDETLASSRHGRNFVSFRVQEALRVARTHHANHALP ::. :::.:.::: :::::.::.::. : : . .: ::.::.::.. :. :: CCDS57 VEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLN-TQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLP 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 VYVFTRPTYSRR-LTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTSTETCQYLKDYLT :...:: ... . : ::. .:. :.::..::::.:...:: . : ..: : .:. CCDS57 VFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYME 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 RLLVPYVVNVSWATQYCSRAQCHGHGRCVRRNPSASTFLHLSTNSFRLVPGHAPGEPQLR .: ::..::. :...::.. :. .: :.:.: ..: .:::. ..: . . :. .: CCDS57 TILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFA-IQLEKGGKFTVR 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 PVGELSWADIDHLQTHFRCQCYLGWSGEQCQWDHRQAAGGASEAWAGSHLTSLLALAALA :. . :..... .: :.:: CCDS57 --GKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETE 420 430 440 450 460 470 >>CCDS5790.1 SPAM1 gene_id:6677|Hs108|chr7 (511 aa) initn: 977 init1: 531 opt: 1157 Z-score: 1383.2 bits: 265.4 E(32554): 1e-70 Smith-Waterman score: 1157; 40.3% identity (71.8% similar) in 412 aa overlap (21-430:34-438) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MRAGPGPTVTLALVLAVAWAMELKPTAPPIFTGRPFVVAWDVPTQDCGPR . :. :::.. . ::. ::..:.. : . CCDS57 LKFKHIFFRSFVKSSGVSQIVFTFLLIPCCLTLNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFCLGK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE1 LKVPLDLNAFDVQASPNEGFVNQNITIFYRDRLGLYPRFDS-AGRSVHGGVPQNVSLWAH . :::.. :. .:: . ..:..:::: :::: :: .:: .: .:.::.::..:: : CCDS57 FDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISLQDH 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 RKMLQKRVEHYIRTQESAGLAVIDWEDWRPVWVRNWQDKDVYRRLSRQLVASRHPDWPPD .: . :. . .. :.::::::.:::.:.:::. ::::. : .:: ... . CCDS57 LDKAKKDITFYMPV-DNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLSLT 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 RIVKQAQYEFEFAAQQFMLETLRYVKAVRPRHLWGFYLFPDCYNHDYVQNWESYTGRCPD . ...:. ::: :...:..::.. : .:: ::::.::::::::: : . .:.: : . CCDS57 EATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKK--PGYNGSCFN 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 VEVARNDQLAWLWAESTALFPSVYLDETLASSRHGRNFVSFRVQEALRVARTHHANHALP ::. :::.:.::: :::::.::.::. : : . .: ::.::.::.. :. :: CCDS57 VEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLN-TQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLP 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 VYVFTRPTYSRR-LTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTSTETCQYLKDYLT :...:: ... . : ::. .:. :.::..::::.:...:: . : ..: : .:. CCDS57 VFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYME 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 RLLVPYVVNVSWATQYCSRAQCHGHGRCVRRNPSASTFLHLSTNSFRLVPGHAPGEPQLR .: ::..::. :...::.. :. .: :.:.: ..: .:::. ..: . . :. .: CCDS57 TILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFA-IQLEKGGKFTVR 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 PVGELSWADIDHLQTHFRCQCYLGWSGEQCQWDHRQAAGGASEAWAGSHLTSLLALAALA :. . :..... .: :.:: CCDS57 --GKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETE 420 430 440 450 460 470 >>CCDS2815.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 (417 aa) initn: 1085 init1: 359 opt: 1088 Z-score: 1301.9 bits: 250.1 E(32554): 3.4e-66 Smith-Waterman score: 1126; 42.2% identity (64.6% similar) in 438 aa overlap (6-439:6-407) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MRAGPGPTVTLALVLAVAWAMELKPTAPPIFTGRPFVVAWDVPTQDCGPRLKVPLDLNAF ::...:...: .. .. : : .: ::: : :.::. : :. : : :::. CCDS28 MTTQLGPALVLGVALCLGCGQPL-PQVPE----RPFSVLWNVPSAHCEARFGVHLPLNAL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 DVQASPNEGFVNQNITIFYRDRLGLYPRFDSAGRSVHGGVPQNVSLWAHRKMLQKRVEHY . :. .. : .::.::::...::::: : : . .::.:: . : : . ...: CCDS28 GIIANRGQHFHGQNMTIFYKNQLGLYPYFGPRGTAHNGGIPQALPLDRHLALAAYQIHHS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 IRTQESAGLAVIDWEDWRPVWVRNWQDKDVYRRLSRQLVASRHPDWPPDRIVKQAQYEFE .: :: ::.:::.: :.:. :: . .:. : . . :: :.. . .: :: CCDS28 LRPGF-AGPAVLDWEEWCPLWAGNWGRRRAYQAASWAWAQQVFPDLDPQEQLYKAYTGFE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE1 FAAQQFMLETLRYVKAVRPRHLWGFYLFPDCYN--HDYVQNWESYTGRCPDVEVARNDQL ::. .: .::: ..:.::. ::::: .: : : :....: ::::: . .::: :: CCDS28 QAARALMEDTLRVAQALRPHGLWGFYHYPACGNGWHSMASN---YTGRCHAATLARNTQL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 AWLWAESTALFPSVYLDETLASSRHGRNFVSFRVQEALRVARTHHANHALPVYVFTRPTY :::: :.:::::.:: : ..: . :: :..::.::: . : : ::: ...: :. CCDS28 HWLWAASSALFPSIYLPPRLPPAHH-QAFVRHRLEEAFRVALVGH-RHPLPVLAYVRLTH 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 SRRLTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTSTETCQYLKDYLTRLLVPYVVNV : ::. ::...:: :::::::::.:::: . ..: : : .:.:::. : :::.:: CCDS28 RRSGRFLSQDDLVQSIGVSAALGAAGVVLWGDLSLSSSEEECWHLHDYLVDTLGPYVINV 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 SWATQYCSRAQCHGHGRCVRRNPSA-STFLHLSTNSFRLVPGHAPGEPQLRPVGELS-WA . :.. ::. .:::::::.::.:. .:::: : : :. : CCDS28 TRAAMACSHQRCHGHGRCARRDPGQMEAFLHL------------------WPDGSLGDWK 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 DIDHLQTHFRCQCYLGWSGEQCQWDHRQAAGGASEAWAGSHLTSLLALAALAFTWTL . : :.:: ::.: :: CCDS28 S-------FSCHCYWGWAGPTCQEPRPGPKEAV 400 410 >>CCDS2817.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 (405 aa) initn: 1095 init1: 639 opt: 832 Z-score: 995.8 bits: 193.4 E(32554): 3.8e-49 Smith-Waterman score: 1047; 39.2% identity (65.9% similar) in 413 aa overlap (29-439:25-400) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MRAGPGPTVTLALVLAVAWAMELKPTAPPIFTGRPFVVAWDVPTQDCGPRLKVPLDLNAF :.. .:::...:.. :: : : : .:...: CCDS28 MAAHLLPICALFLTLLDMAQGFRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCLERHGVDVDVSVF 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 DVQASPNEGFVNQNITIFYRDRLGLYPRFDSAGRSVHGGVPQNVSLWAHRKMLQKRVEHY :: :.:.. : . ..:::: ..:: :: . .:. : ::.:::.:: :: . . 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CCDS28 -------------------------IFYDTTNHFLPLESCQAIKEYMDTTLGPFILNVTS 290 300 310 320 370 380 390 400 410 pF1KE1 ATQYCSRAQCHGHGRCVRR--NPSASTFLHLSTNSFRLVPGHAPGEPQLRPVGELSWADI .. ::.: : :::::::: .:.: .:. .. :..:.:: .: .:: : :: : CCDS28 GALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPL--SLR--GALSLEDQ 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 DHLQTHFRCQCYLGWSGEQCQWDHRQAAGGASEAWAGSHLTSLLALAALAFTWTL .. ..:.:.:: ::.. :. CCDS28 AQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW 380 390 400 >>CCDS56257.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 (387 aa) initn: 880 init1: 262 opt: 757 Z-score: 906.3 bits: 176.8 E(32554): 3.7e-44 Smith-Waterman score: 942; 38.1% identity (58.9% similar) in 438 aa overlap (6-439:6-377) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MRAGPGPTVTLALVLAVAWAMELKPTAPPIFTGRPFVVAWDVPTQDCGPRLKVPLDLNAF ::...:...: .. .. : : .: ::: : :.::. : :. : : :::. CCDS56 MTTQLGPALVLGVALCLGCGQPL-PQVPE----RPFSVLWNVPSAHCEARFGVHLPLNAL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 DVQASPNEGFVNQNITIFYRDRLGLYPRFDSAGRSVHGGVPQNVSLWAHRKMLQKRVEHY . :. .. : .::.::::...::::: : : . .::.:: . : : . ...: CCDS56 GIIANRGQHFHGQNMTIFYKNQLGLYPYFGPRGTAHNGGIPQALPLDRHLALAAYQIHHS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 IRTQESAGLAVIDWEDWRPVWVRNWQDKDVYRRLSRQLVASRHPDWPPDRIVKQAQYEFE .: :: ::.:::.: :.:. :: . .:. : . . :: :.. . .: :: CCDS56 LRPGF-AGPAVLDWEEWCPLWAGNWGRRRAYQAASWAWAQQVFPDLDPQEQLYKAYTGFE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE1 FAAQQFMLETLRYVKAVRPRHLWGFYLFPDCYN--HDYVQNWESYTGRCPDVEVARNDQL ::. .: .::: ..:.::. ::::: .: : : :....: ::::: . .::: :: CCDS56 QAARALMEDTLRVAQALRPHGLWGFYHYPACGNGWHSMASN---YTGRCHAATLARNTQL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 AWLWAESTALFPSVYLDETLASSRHGRNFVSFRVQEALRVARTHHANHALPVYVFTRPTY :::: :.:::::.:: : ..: . :: :..::.::: . : : ::: ...: :. CCDS56 HWLWAASSALFPSIYLPPRLPPAHH-QAFVRHRLEEAFRVALVGH-RHPLPVLAYVRLTH 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 SRRLTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTSTETCQYLKDYLTRLLVPYVVNV : .: : : : .:.:::. : :::.:: CCDS56 RR------------------------------SGRFLSQEECWHLHDYLVDTLGPYVINV 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 SWATQYCSRAQCHGHGRCVRRNPSA-STFLHLSTNSFRLVPGHAPGEPQLRPVGELS-WA . :.. ::. .:::::::.::.:. .:::: : : :. : CCDS56 TRAAMACSHQRCHGHGRCARRDPGQMEAFLHL------------------WPDGSLGDWK 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 DIDHLQTHFRCQCYLGWSGEQCQWDHRQAAGGASEAWAGSHLTSLLALAALAFTWTL . : :.:: ::.: :: CCDS56 S-------FSCHCYWGWAGPTCQEPRPGPKEAV 370 380 >>CCDS46832.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 (253 aa) initn: 692 init1: 280 opt: 692 Z-score: 831.2 bits: 162.3 E(32554): 5.6e-40 Smith-Waterman score: 692; 42.4% identity (69.8% similar) in 255 aa overlap (187-439:1-248) 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 QLVASRHPDWPPDRIVKQAQYEFEFAAQQFMLETLRYVKAVRPRHLWGFYLFPDCYNHDY : ::. .:.::: ::::: ::::::.:. CCDS46 MAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDF 10 20 30 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 VQNWESYTGRCPDVEVARNDQLAWLWAESTALFPSVYLDETLASSRHGRNFVSFRVQEAL .. .:::.::. :.::::.:::..: ::.::.:. .: .. ... .:. :: ::. CCDS46 LS--PNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAF 40 50 60 70 80 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 RVARTHHANHALPVYVFTRPTYSRRLTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTS ::: . .. ::: ... :. : .: ..::::: :::::.:: . : . CCDS46 RVA-VAAGDPNLPVLPYVQIFYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRT 90 100 110 120 130 140 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 TETCQYLKDYLTRLLVPYVVNVSWATQYCSRAQCHGHGRCVRR--NPSASTFLHLSTNSF :.:: .:.:. : :...::. .. ::.: : :::::::: .:.: .:. .. :. CCDS46 KESCQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSI 150 160 170 180 190 200 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 RLVPGHAPGEPQLRPVGELSWADIDHLQTHFRCQCYLGWSGEQCQWDHRQAAGGASEAWA .:.:: .: .:: : :: : .. ..:.:.:: ::.. :. CCDS46 QLTPGGGPL--SLR--GALSLEDQAQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW 210 220 230 240 250 460 470 pF1KE1 GSHLTSLLALAALAFTWTL >>CCDS56260.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 (168 aa) initn: 479 init1: 359 opt: 432 Z-score: 522.7 bits: 104.6 E(32554): 8.5e-23 Smith-Waterman score: 469; 43.8% identity (63.5% similar) in 178 aa overlap (263-439:6-158) 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 ARNDQLAWLWAESTALFPSVYLDETLASSRHGRNFVSFRVQEALRVARTHHANHALPVYV : . :: :..::.::: . : : ::: . CCDS56 MLPPAHHQAFVRHRLEEAFRVALVGH-RHPLPVLA 10 20 30 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 FTRPTYSRRLTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTSTETCQYLKDYLTRLLV ..: :. : ::. ::...:: :::::::::.:::: . ..: : : .:.:::. : CCDS56 YVRLTHRRSGRFLSQDDLVQSIGVSAALGAAGVVLWGDLSLSSSEEECWHLHDYLVDTLG 40 50 60 70 80 90 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 PYVVNVSWATQYCSRAQCHGHGRCVRRNPSA-STFLHLSTNSFRLVPGHAPGEPQLRPVG :::.::. :.. ::. .:::::::.::.:. .:::: : . :. CCDS56 PYVINVTRAAMACSHQRCHGHGRCARRDPGQMEAFLHL-------WPDGSLGD------- 100 110 120 130 140 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 ELSWADIDHLQTHFRCQCYLGWSGEQCQWDHRQAAGGASEAWAGSHLTSLLALAALAFTW : . : :.:: ::.: :: CCDS56 ---WKS-------FSCHCYWGWAGPTCQEPRPGPKEAV 150 160 473 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 23:34:16 2016 done: Sun Nov 6 23:34:16 2016 Total Scan time: 3.130 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]