FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1352, 332 aa 1>>>pF1KE1352 332 - 332 aa - 332 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4912+/-0.000924; mu= 14.1889+/- 0.055 mean_var=58.2451+/-11.718, 0's: 0 Z-trim(103.6): 20 B-trim: 2 in 1/49 Lambda= 0.168052 statistics sampled from 7490 (7501) to 7490 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16 Scan time: 2.500 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6930.1 TOR1A gene_id:1861|Hs108|chr9 ( 332) 2208 543.9 6.9e-155 CCDS6929.1 TOR1B gene_id:27348|Hs108|chr9 ( 336) 1542 382.4 2.8e-106 CCDS43879.1 TOR2A gene_id:27433|Hs108|chr9 ( 321) 914 230.1 1.8e-60 CCDS1329.1 TOR3A gene_id:64222|Hs108|chr1 ( 397) 844 213.2 2.9e-55 CCDS48024.1 TOR2A gene_id:27433|Hs108|chr9 ( 242) 565 145.5 4.2e-35 CCDS6876.1 TOR2A gene_id:27433|Hs108|chr9 ( 253) 565 145.5 4.4e-35 CCDS7041.1 TOR4A gene_id:54863|Hs108|chr9 ( 423) 269 73.8 2.8e-13 >>CCDS6930.1 TOR1A gene_id:1861|Hs108|chr9 (332 aa) initn: 2208 init1: 2208 opt: 2208 Z-score: 2894.2 bits: 543.9 E(32554): 6.9e-155 Smith-Waterman score: 2208; 99.7% identity (99.7% similar) in 332 aa overlap (1-332:1-332) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAECCGQKRSLSREA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS69 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAECCGQKRSLSREA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 LQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS69 LQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 EGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEMDKMHAGLI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS69 EGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEMDKMHAGLI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 DAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIKLKDIEHAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS69 DAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIKLKDIEHAL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 SVSVFNNKNSGFWHSSLIHRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVEMQSRGYEIDEDIVSRV :::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS69 SVSVFNNKNSGFWHSSLIDRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVEMQSRGYEIDEDIVSRV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 AEEMTFFPKEERVFSDKGCKTVFTKLDYYYDD :::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS69 AEEMTFFPKEERVFSDKGCKTVFTKLDYYYDD 310 320 330 >>CCDS6929.1 TOR1B gene_id:27348|Hs108|chr9 (336 aa) initn: 1564 init1: 1453 opt: 1542 Z-score: 2021.5 bits: 382.4 E(32554): 2.8e-106 Smith-Waterman score: 1542; 67.2% identity (89.1% similar) in 329 aa overlap (4-329:9-336) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLAL--AGVLTGYI-YPRLYCLFAECCGQ : :.:.::: : :: : :::..:::. :...:::. : .:: ::::: . 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CCDS43 MAAATRGCRPWGSLLGLLGLVSAAA-AAWDLASLRCTLGAFCECDFRPDLPG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 LQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIY :. :: ..: :::::: ....:. .:. .: : :::.:::::::::::..::...:. .. CCDS43 LECDLAQHLAGQHLAKALVVKALKAFVRDPAPTKPLVLSLHGWTGTGKSYVSSLLAHYLF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 EGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEMDKMHAGLI .::: : :: : .::::: :.: :: .:. :..::..::.::.:.::::::: ::. CCDS43 QGGLRSPRVHHFSPVLHFPHPSHIERYKKDLKSWVQGNLTACGRSLFLFDEMDKMPPGLM 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 DAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIKLKDIEHAL ....::: .: :..:.::.:::.::.:...:..:::. ::: ..::.: :...: .. 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CCDS43 LDSTTFFPEDEQLFSSNGCKTVASRIAFFL 300 310 320 >>CCDS1329.1 TOR3A gene_id:64222|Hs108|chr1 (397 aa) initn: 838 init1: 456 opt: 844 Z-score: 1105.7 bits: 213.2 E(32554): 2.9e-55 Smith-Waterman score: 844; 39.4% identity (73.0% similar) in 315 aa overlap (20-329:82-395) 10 20 30 40 pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAEC :. :.. : : : . :: : .: CCDS13 LRAAGALSKRYWTLFSCQVWPDDCDEDEEAATGPLGWRLPLLGQRYLDLLTTWYCSFKDC 60 70 80 90 100 110 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 C--GQKR-SLSREALQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGT : :. : : . .:. ::. : ::::.....: .: :....:.:.: :.::.:::.:: CCDS13 CPRGDCRISNNFTGLEWDLNVRLHGQHLVQQLVLRTVRGYLETPQPEKALALSFHGWSGT 120 130 140 150 160 170 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 GKNFVSKIIAENIYEGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSI :::::.....::.:. :: :: :..:.::.:::: . . :::.::. :: . . : ... CCDS13 GKNFVARMLVENLYRDGLMSDCVRMFIATFHFPHPKYVDLYKEQLMSQIRETQQLCHQTL 180 190 200 210 220 230 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 FIFDEMDKMHAGLIDAIKPFLDYYDLVDGVSYQK--AMFIFLSNAGAERITDVALDFWRS ::::: .:.: ::.... : :. .: .. ..:.:::: .. :..:.: . .. CCDS13 FIFDEAEKLHPGLLEVLGPHLERRA-PEGHRAESPWTIFLFLSNLRGDIINEVVLKLLKA 240 250 260 270 280 290 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 GKQREDIKLKDIEHALSVSVFNNKNSGFWHSSLIHRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVE : .::.: .. .: :.. . .. ..:: :: :...::::::.:::::::.:...: : CCDS13 GWSREEITMEHLEPHLQAEIVETIDNGFGHSRLVKENLIDYFIPFLPLEYRHVRLCARDA 300 310 320 330 340 350 290 300 310 320 330 pF1KE1 MQSRGYEIDEDIVSRVAEEMTFFPKEERVFSDKGCKTVFTKLDYYYDD . :. :. ....:. :.. ::::..::..:::.. ...:. CCDS13 FLSQELLYKEETLDEIAQMMVYVPKEEQLFSSQGCKSISQRINYFLS 360 370 380 390 >>CCDS48024.1 TOR2A gene_id:27433|Hs108|chr9 (242 aa) initn: 570 init1: 550 opt: 565 Z-score: 743.7 bits: 145.5 E(32554): 4.2e-35 Smith-Waterman score: 565; 45.9% identity (75.1% similar) in 181 aa overlap (26-206:18-197) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAECCGQKRSLSREA :::. :.. ... : : .. : . . CCDS48 MAAATRGCRPWGSLLGLLGLVSAAA-AAWDLASLRCTLGAFCECDFRPDLPG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 LQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIY :. :: ..: :::::: ....:. .:. .: : :::.:::::::::::..::...:. .. CCDS48 LECDLAQHLAGQHLAKALVVKALKAFVRDPAPTKPLVLSLHGWTGTGKSYVSSLLAHYLF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 EGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEMDKMHAGLI .::: : :: : .::::: :.: :: .:. :..::..::.::.:.::::::: ::. CCDS48 QGGLRSPRVHHFSPVLHFPHPSHIERYKKDLKSWVQGNLTACGRSLFLFDEMDKMPPGLM 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 DAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIKLKDIEHAL ....::: .: :..:.::.:::. CCDS48 EVLRPFLGSSWVVYGTNYRKAIFIFIRWLLKLGHHGRAPPRRSGALPPAPAAPRPALRAQ 180 190 200 210 220 230 >>CCDS6876.1 TOR2A gene_id:27433|Hs108|chr9 (253 aa) initn: 570 init1: 550 opt: 565 Z-score: 743.4 bits: 145.5 E(32554): 4.4e-35 Smith-Waterman score: 565; 45.9% identity (75.1% similar) in 181 aa overlap (26-206:18-197) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAECCGQKRSLSREA :::. :.. ... : : .. : . . CCDS68 MAAATRGCRPWGSLLGLLGLVSAAA-AAWDLASLRCTLGAFCECDFRPDLPG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 LQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIY :. :: ..: :::::: ....:. .:. .: : :::.:::::::::::..::...:. .. CCDS68 LECDLAQHLAGQHLAKALVVKALKAFVRDPAPTKPLVLSLHGWTGTGKSYVSSLLAHYLF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 EGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEMDKMHAGLI .::: : :: : .::::: :.: :: .:. :..::..::.::.:.::::::: ::. CCDS68 QGGLRSPRVHHFSPVLHFPHPSHIERYKKDLKSWVQGNLTACGRSLFLFDEMDKMPPGLM 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 DAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIKLKDIEHAL ....::: .: :..:.::.:::. CCDS68 EVLRPFLGSSWVVYGTNYRKAIFIFIRWGPALQWAQWGGHFSEVQLYSLSLCSQQNPVPH 180 190 200 210 220 230 >>CCDS7041.1 TOR4A gene_id:54863|Hs108|chr9 (423 aa) initn: 202 init1: 117 opt: 269 Z-score: 351.8 bits: 73.8 E(32554): 2.8e-13 Smith-Waterman score: 269; 24.0% identity (56.5% similar) in 283 aa overlap (59-327:151-421) 30 40 50 60 70 80 pF1KE1 ALAGVLTGYIYPRLYCLFAECCGQKRSLSREALQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFIN ..:.: :. .::: : . :. . .. CCDS70 RCLLLLVAIVGFQVLNAIENLDDNAQRYDLDGLEKALQRAVFGQPAAVSRIVALMRDYLA 130 140 150 160 170 180 90 100 110 120 130 140 pF1KE1 NPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIYEGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYK . ..:: :.::: .:.::. :....:... .: : . : : :.: . CCDS70 THVHSRPLLLALHGPSGVGKSHVGRLLARHFRSVLEDSALVLQYHARHHCPEARAAQDCR 190 200 210 220 230 240 150 160 170 180 190 200 pF1KE1 DQLQLWIRGNVSACARS-----IFIFDEMDKMHAGLIDAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMF ..: . ..: : :.. ....:... : :.: .. ::. . ...:.. CCDS70 EELARRV-ADVVARAEAEEKTPLLVLDDVELMPRPLLDELHGFLQPQR---SHHFHNAIY 250 260 270 280 290 210 220 230 240 250 pF1KE1 IFLSNAGAERITDV-------ALDFWRSGKQREDIKLKDIEHALSVSVFN--NKNSGFWH ..::.::. ..: :: . .: . . . :. : .:.. ... .:. CCDS70 VLLSGAGGAEVTRFVLQNASRALPLRPDGFRSAEAAAAQAEEDLRASLLAVLSREHPLWQ 300 310 320 330 340 350 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 SSLIHRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVEMQSRGYEIDEDIVSRVAEEMTFFPKEERVF .. : :::: :. . . :.: :: ..:. :. . .: ...:. : : CCDS70 AAAI--------VPFLLLDKRDVVSCFRDEMAGEGFFPDQARAENLAAQLSFYRVAGREF 360 370 380 390 400 320 330 pF1KE1 SDKGCKTVFTKLDYYYDD . ::: : . .. CCDS70 AVTGCKQVVATVNLL 410 420 332 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 23:34:51 2016 done: Sun Nov 6 23:34:52 2016 Total Scan time: 2.500 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]