Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1065
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1065, 988 aa
1>>>pF1KE1065 988 - 988 aa - 988 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2607+/-0.000575; mu= 8.2398+/- 0.035
mean_var=316.5777+/-66.229, 0's: 0 Z-trim(115.9): 486 B-trim: 32 in 1/54
Lambda= 0.072083
statistics sampled from 26150 (26727) to 26150 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.313), width: 16
Scan time: 13.750
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_766638 (OMIM: 611746) signal peptide, CUB and E ( 988) 7230 767.5 0
XP_005261809 (OMIM: 611746) PREDICTED: signal pept (1018) 5408 578.0 8.4e-164
XP_011528692 (OMIM: 611746) PREDICTED: signal pept ( 912) 5376 574.6 7.9e-163
XP_011528691 (OMIM: 611746) PREDICTED: signal pept ( 912) 5376 574.6 7.9e-163
NP_001317128 (OMIM: 611747) signal peptide, CUB an ( 999) 3736 404.2 1.8e-111
XP_005253089 (OMIM: 611747) PREDICTED: signal pept (1028) 3568 386.7 3.4e-106
NP_689966 (OMIM: 614708) signal peptide, CUB and E ( 993) 3137 341.9 1e-92
XP_005253092 (OMIM: 611747) PREDICTED: signal pept ( 953) 3080 335.9 6.1e-91
XP_016873569 (OMIM: 611747) PREDICTED: signal pept ( 958) 3009 328.5 1e-88
XP_011518549 (OMIM: 611747) PREDICTED: signal pept ( 960) 2988 326.3 4.7e-88
XP_005253091 (OMIM: 611747) PREDICTED: signal pept ( 987) 2977 325.2 1.1e-87
XP_005253093 (OMIM: 611747) PREDICTED: signal pept ( 919) 2846 311.5 1.3e-83
XP_005253094 (OMIM: 611747) PREDICTED: signal pept ( 873) 2656 291.8 1.1e-77
NP_001290065 (OMIM: 614708) signal peptide, CUB an ( 992) 2365 261.6 1.5e-68
XP_016873571 (OMIM: 611747) PREDICTED: signal pept ( 844) 2358 260.7 2.3e-68
XP_011512706 (OMIM: 614708) PREDICTED: signal pept (1001) 2355 260.5 3.1e-68
XP_005249000 (OMIM: 614708) PREDICTED: signal pept (1009) 2355 260.5 3.2e-68
XP_005249004 (OMIM: 614708) PREDICTED: signal pept ( 955) 2303 255.1 1.3e-66
NP_066025 (OMIM: 611747) signal peptide, CUB and E ( 971) 1931 216.4 5.8e-55
NP_001164161 (OMIM: 611747) signal peptide, CUB an ( 807) 1402 161.3 1.9e-38
XP_011518550 (OMIM: 611747) PREDICTED: signal pept ( 695) 1373 158.2 1.4e-37
XP_016873570 (OMIM: 611747) PREDICTED: signal pept ( 892) 1373 158.3 1.6e-37
XP_011518548 (OMIM: 611747) PREDICTED: signal pept ( 962) 1373 158.4 1.7e-37
XP_016868907 (OMIM: 602108) PREDICTED: matrilin-2 ( 799) 1053 125.0 1.6e-27
XP_005250977 (OMIM: 602108) PREDICTED: matrilin-2 ( 818) 1053 125.0 1.6e-27
NP_085072 (OMIM: 602108) matrilin-2 isoform b prec ( 937) 1046 124.4 2.9e-27
NP_002371 (OMIM: 602108) matrilin-2 isoform a prec ( 956) 1046 124.4 2.9e-27
XP_016868906 (OMIM: 602108) PREDICTED: matrilin-2 ( 896) 974 116.9 5e-25
NP_001304677 (OMIM: 602108) matrilin-2 isoform c p ( 915) 974 116.9 5.1e-25
XP_016859597 (OMIM: 150390) PREDICTED: latent-tran (1681) 866 106.0 1.8e-21
XP_011531158 (OMIM: 150390) PREDICTED: latent-tran (1682) 866 106.0 1.8e-21
XP_016882867 (OMIM: 608529) PREDICTED: fibrillin-3 (1595) 840 103.3 1.1e-20
XP_011539190 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1364) 817 100.8 5.3e-20
NP_001400 (OMIM: 604266) multiple epidermal growth (1541) 817 100.8 5.7e-20
XP_011539188 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1560) 817 100.9 5.7e-20
XP_011539187 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1603) 817 100.9 5.8e-20
XP_016856022 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1559) 795 98.6 2.8e-19
XP_006710469 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1436) 770 95.9 1.6e-18
XP_011531163 (OMIM: 150390) PREDICTED: latent-tran (1632) 763 95.3 2.9e-18
XP_011531164 (OMIM: 150390) PREDICTED: latent-tran (1248) 759 94.7 3.3e-18
NP_001159738 (OMIM: 150390) latent-transforming gr (1300) 759 94.7 3.4e-18
NP_001159737 (OMIM: 150390) latent-transforming gr (1342) 759 94.7 3.4e-18
NP_001159736 (OMIM: 150390) latent-transforming gr (1353) 759 94.7 3.5e-18
NP_000618 (OMIM: 150390) latent-transforming growt (1395) 759 94.8 3.5e-18
XP_005264375 (OMIM: 150390) PREDICTED: latent-tran (1626) 759 94.8 3.9e-18
XP_011531162 (OMIM: 150390) PREDICTED: latent-tran (1666) 759 94.9 3.9e-18
XP_005264374 (OMIM: 150390) PREDICTED: latent-tran (1668) 759 94.9 3.9e-18
XP_011531161 (OMIM: 150390) PREDICTED: latent-tran (1669) 759 94.9 3.9e-18
XP_016859598 (OMIM: 150390) PREDICTED: latent-tran (1679) 759 94.9 3.9e-18
XP_011531159 (OMIM: 150390) PREDICTED: latent-tran (1680) 759 94.9 3.9e-18
>>NP_766638 (OMIM: 611746) signal peptide, CUB and EGF-l (988 aa)
initn: 7230 init1: 7230 opt: 7230 Z-score: 4085.9 bits: 767.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7230; 100.0% identity (100.0% similar) in 988 aa overlap (1-988:1-988)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGAAAVRWHLCVLLALGTRGRLAGGSGLPGSVDVDECSEGTDDCHIDAICQNTPKSYKCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_766 MGAAAVRWHLCVLLALGTRGRLAGGSGLPGSVDVDECSEGTDDCHIDAICQNTPKSYKCL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 CKPGYKGEGKQCEDIDECENDYYNGGCVHECINIPGNYRCTCFDGFMLAHDGHNCLDVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_766 CKPGYKGEGKQCEDIDECENDYYNGGCVHECINIPGNYRCTCFDGFMLAHDGHNCLDVDE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 CQDNNGGCQQICVNAMGSYECQCHSGFFLSDNQHTCIHRSNEGMNCMNKDHGCAHICRET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_766 CQDNNGGCQQICVNAMGSYECQCHSGFFLSDNQHTCIHRSNEGMNCMNKDHGCAHICRET
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 PKGGVACDCRPGFDLAQNQKDCTLTCNYGNGGCQHSCEDTDTGPTCGCHQKYALHSDGRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_766 PKGGVACDCRPGFDLAQNQKDCTLTCNYGNGGCQHSCEDTDTGPTCGCHQKYALHSDGRT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 CIETCAVNNGGCDRTCKDTATGVRCSCPVGFTLQPDGKTCKDINECLVNNGGCDHFCRNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_766 CIETCAVNNGGCDRTCKDTATGVRCSCPVGFTLQPDGKTCKDINECLVNNGGCDHFCRNT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VGSFECGCRKGYKLLTDERTCQDIDECSFERTCDHICINSPGSFQCLCHRGYILYGTTHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_766 VGSFECGCRKGYKLLTDERTCQDIDECSFERTCDHICINSPGSFQCLCHRGYILYGTTHC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 GDVDECSMSNGSCDQGCVNTKGSYECVCPPGRRLHWNGKDCVETGKCLSRAKTSPRAQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_766 GDVDECSMSNGSCDQGCVNTKGSYECVCPPGRRLHWNGKDCVETGKCLSRAKTSPRAQLS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 CSKAGGVESCFLSCPAHTLFVPDSENSYVLSCGVPGPQGKALQKRNGTSSGLGPSCSDAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_766 CSKAGGVESCFLSCPAHTLFVPDSENSYVLSCGVPGPQGKALQKRNGTSSGLGPSCSDAP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 TTPIKQKARFKIRDAKCHLRPHSQARAKETARQPLLDHCHVTFVTLKCDSSKKRRRGRKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_766 TTPIKQKARFKIRDAKCHLRPHSQARAKETARQPLLDHCHVTFVTLKCDSSKKRRRGRKS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 PSKEVSHITAEFEIETKMEEASDTCEADCLRKRAEQSLQAAIKTLRKSIGRQQFYVQVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_766 PSKEVSHITAEFEIETKMEEASDTCEADCLRKRAEQSLQAAIKTLRKSIGRQQFYVQVSG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 TEYEVAQRPAKALEGQGACGAGQVLQDSKCVACGPGTHFGGELGQCVSCMPGTYQDMEGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_766 TEYEVAQRPAKALEGQGACGAGQVLQDSKCVACGPGTHFGGELGQCVSCMPGTYQDMEGQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 LSCTPCPSSDGLGLPGARNVSECGGQCSPGFFSADGFKPCQACPVGTYQPEPGRTGCFPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_766 LSCTPCPSSDGLGLPGARNVSECGGQCSPGFFSADGFKPCQACPVGTYQPEPGRTGCFPC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 GGGLLTKHEGTTSFQDCEAKVHCSPGHHYNTTTHRCIRCPVGTYQPEFGQNHCITCPGNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_766 GGGLLTKHEGTTSFQDCEAKVHCSPGHHYNTTTHRCIRCPVGTYQPEFGQNHCITCPGNT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 STDFDGSTNVTHCKNQHCGGELGDYTGYIESPNYPGDYPANAECVWHIAPPPKRRILIVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_766 STDFDGSTNVTHCKNQHCGGELGDYTGYIESPNYPGDYPANAECVWHIAPPPKRRILIVV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 PEIFLPIEDECGDVLVMRKSASPTSITTYETCQTYERPIAFTSRSRKLWIQFKSNEGNSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_766 PEIFLPIEDECGDVLVMRKSASPTSITTYETCQTYERPIAFTSRSRKLWIQFKSNEGNSG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 KGFQVPYVTYDEDYQQLIEDIVRDGRLYASENHQEILKDKKLIKALFDVLAHPQNYFKYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_766 KGFQVPYVTYDEDYQQLIEDIVRDGRLYASENHQEILKDKKLIKALFDVLAHPQNYFKYT
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KE1 AQESKEMFPRSFIKLLRSKVSRFLRPYK
::::::::::::::::::::::::::::
NP_766 AQESKEMFPRSFIKLLRSKVSRFLRPYK
970 980
>>XP_005261809 (OMIM: 611746) PREDICTED: signal peptide, (1018 aa)
initn: 5372 init1: 5372 opt: 5408 Z-score: 3061.7 bits: 578.0 E(85289): 8.4e-164
Smith-Waterman score: 7160; 97.1% identity (97.1% similar) in 1018 aa overlap (1-988:1-1018)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGAAAVRWHLCVLLALGTRGRLAGGSGLPGSVDVDECSEGTDDCHIDAICQNTPKSYKCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MGAAAVRWHLCVLLALGTRGRLAGGSGLPGSVDVDECSEGTDDCHIDAICQNTPKSYKCL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 CKPGYKGEGKQCEDIDECENDYYNGGCVHECINIPGNYRCTCFDGFMLAHDGHNCLDVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CKPGYKGEGKQCEDIDECENDYYNGGCVHECINIPGNYRCTCFDGFMLAHDGHNCLDVDE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 CQDNNGGCQQICVNAMGSYECQCHSGFFLSDNQHTCIHRSNEGMNCMNKDHGCAHICRET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CQDNNGGCQQICVNAMGSYECQCHSGFFLSDNQHTCIHRSNEGMNCMNKDHGCAHICRET
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 PKGGVACDCRPGFDLAQNQKDCTLTCNYGNGGCQHSCEDTDTGPTCGCHQKYALHSDGRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PKGGVACDCRPGFDLAQNQKDCTLTCNYGNGGCQHSCEDTDTGPTCGCHQKYALHSDGRT
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KE1 CIE------------------------------TCAVNNGGCDRTCKDTATGVRCSCPVG
::: :::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CIEKDEAAIERSQFNATSVADVDKRVKRRLLMETCAVNNGGCDRTCKDTATGVRCSCPVG
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 FTLQPDGKTCKDINECLVNNGGCDHFCRNTVGSFECGCRKGYKLLTDERTCQDIDECSFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FTLQPDGKTCKDINECLVNNGGCDHFCRNTVGSFECGCRKGYKLLTDERTCQDIDECSFE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 RTCDHICINSPGSFQCLCHRGYILYGTTHCGDVDECSMSNGSCDQGCVNTKGSYECVCPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RTCDHICINSPGSFQCLCHRGYILYGTTHCGDVDECSMSNGSCDQGCVNTKGSYECVCPP
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 GRRLHWNGKDCVETGKCLSRAKTSPRAQLSCSKAGGVESCFLSCPAHTLFVPDSENSYVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GRRLHWNGKDCVETGKCLSRAKTSPRAQLSCSKAGGVESCFLSCPAHTLFVPDSENSYVL
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 SCGVPGPQGKALQKRNGTSSGLGPSCSDAPTTPIKQKARFKIRDAKCHLRPHSQARAKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SCGVPGPQGKALQKRNGTSSGLGPSCSDAPTTPIKQKARFKIRDAKCHLRPHSQARAKET
490 500 510 520 530 540
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pF1KE1 ARQPLLDHCHVTFVTLKCDSSKKRRRGRKSPSKEVSHITAEFEIETKMEEASDTCEADCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ARQPLLDHCHVTFVTLKCDSSKKRRRGRKSPSKEVSHITAEFEIETKMEEASDTCEADCL
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580 590 600 610 620 630
pF1KE1 RKRAEQSLQAAIKTLRKSIGRQQFYVQVSGTEYEVAQRPAKALEGQGACGAGQVLQDSKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RKRAEQSLQAAIKTLRKSIGRQQFYVQVSGTEYEVAQRPAKALEGQGACGAGQVLQDSKC
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 VACGPGTHFGGELGQCVSCMPGTYQDMEGQLSCTPCPSSDGLGLPGARNVSECGGQCSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VACGPGTHFGGELGQCVSCMPGTYQDMEGQLSCTPCPSSDGLGLPGARNVSECGGQCSPG
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KE1 FFSADGFKPCQACPVGTYQPEPGRTGCFPCGGGLLTKHEGTTSFQDCEAKVHCSPGHHYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FFSADGFKPCQACPVGTYQPEPGRTGCFPCGGGLLTKHEGTTSFQDCEAKVHCSPGHHYN
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KE1 TTTHRCIRCPVGTYQPEFGQNHCITCPGNTSTDFDGSTNVTHCKNQHCGGELGDYTGYIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TTTHRCIRCPVGTYQPEFGQNHCITCPGNTSTDFDGSTNVTHCKNQHCGGELGDYTGYIE
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KE1 SPNYPGDYPANAECVWHIAPPPKRRILIVVPEIFLPIEDECGDVLVMRKSASPTSITTYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SPNYPGDYPANAECVWHIAPPPKRRILIVVPEIFLPIEDECGDVLVMRKSASPTSITTYE
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KE1 TCQTYERPIAFTSRSRKLWIQFKSNEGNSGKGFQVPYVTYDEDYQQLIEDIVRDGRLYAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TCQTYERPIAFTSRSRKLWIQFKSNEGNSGKGFQVPYVTYDEDYQQLIEDIVRDGRLYAS
910 920 930 940 950 960
940 950 960 970 980
pF1KE1 ENHQEILKDKKLIKALFDVLAHPQNYFKYTAQESKEMFPRSFIKLLRSKVSRFLRPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ENHQEILKDKKLIKALFDVLAHPQNYFKYTAQESKEMFPRSFIKLLRSKVSRFLRPYK
970 980 990 1000 1010
>>XP_011528692 (OMIM: 611746) PREDICTED: signal peptide, (912 aa)
initn: 5372 init1: 5372 opt: 5376 Z-score: 3044.2 bits: 574.6 E(85289): 7.9e-163
Smith-Waterman score: 6360; 96.7% identity (96.7% similar) in 912 aa overlap (107-988:1-912)
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 ECENDYYNGGCVHECINIPGNYRCTCFDGFMLAHDGHNCLDVDECQDNNGGCQQICVNAM
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLAHDGHNCLDVDECQDNNGGCQQICVNAM
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 GSYECQCHSGFFLSDNQHTCIHRSNEGMNCMNKDHGCAHICRETPKGGVACDCRPGFDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSYECQCHSGFFLSDNQHTCIHRSNEGMNCMNKDHGCAHICRETPKGGVACDCRPGFDLA
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240
pF1KE1 QNQKDCTLTCNYGNGGCQHSCEDTDTGPTCGCHQKYALHSDGRTCIE-------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QNQKDCTLTCNYGNGGCQHSCEDTDTGPTCGCHQKYALHSDGRTCIEKDEAAIERSQFNA
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280
pF1KE1 -----------------TCAVNNGGCDRTCKDTATGVRCSCPVGFTLQPDGKTCKDINEC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TSVADVDKRVKRRLLMETCAVNNGGCDRTCKDTATGVRCSCPVGFTLQPDGKTCKDINEC
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 LVNNGGCDHFCRNTVGSFECGCRKGYKLLTDERTCQDIDECSFERTCDHICINSPGSFQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LVNNGGCDHFCRNTVGSFECGCRKGYKLLTDERTCQDIDECSFERTCDHICINSPGSFQC
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 LCHRGYILYGTTHCGDVDECSMSNGSCDQGCVNTKGSYECVCPPGRRLHWNGKDCVETGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LCHRGYILYGTTHCGDVDECSMSNGSCDQGCVNTKGSYECVCPPGRRLHWNGKDCVETGK
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 CLSRAKTSPRAQLSCSKAGGVESCFLSCPAHTLFVPDSENSYVLSCGVPGPQGKALQKRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CLSRAKTSPRAQLSCSKAGGVESCFLSCPAHTLFVPDSENSYVLSCGVPGPQGKALQKRN
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 GTSSGLGPSCSDAPTTPIKQKARFKIRDAKCHLRPHSQARAKETARQPLLDHCHVTFVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GTSSGLGPSCSDAPTTPIKQKARFKIRDAKCHLRPHSQARAKETARQPLLDHCHVTFVTL
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 KCDSSKKRRRGRKSPSKEVSHITAEFEIETKMEEASDTCEADCLRKRAEQSLQAAIKTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KCDSSKKRRRGRKSPSKEVSHITAEFEIETKMEEASDTCEADCLRKRAEQSLQAAIKTLR
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 KSIGRQQFYVQVSGTEYEVAQRPAKALEGQGACGAGQVLQDSKCVACGPGTHFGGELGQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KSIGRQQFYVQVSGTEYEVAQRPAKALEGQGACGAGQVLQDSKCVACGPGTHFGGELGQC
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 VSCMPGTYQDMEGQLSCTPCPSSDGLGLPGARNVSECGGQCSPGFFSADGFKPCQACPVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSCMPGTYQDMEGQLSCTPCPSSDGLGLPGARNVSECGGQCSPGFFSADGFKPCQACPVG
580 590 600 610 620 630
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 TYQPEPGRTGCFPCGGGLLTKHEGTTSFQDCEAKVHCSPGHHYNTTTHRCIRCPVGTYQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TYQPEPGRTGCFPCGGGLLTKHEGTTSFQDCEAKVHCSPGHHYNTTTHRCIRCPVGTYQP
640 650 660 670 680 690
770 780 790 800 810 820
pF1KE1 EFGQNHCITCPGNTSTDFDGSTNVTHCKNQHCGGELGDYTGYIESPNYPGDYPANAECVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EFGQNHCITCPGNTSTDFDGSTNVTHCKNQHCGGELGDYTGYIESPNYPGDYPANAECVW
700 710 720 730 740 750
830 840 850 860 870 880
pF1KE1 HIAPPPKRRILIVVPEIFLPIEDECGDVLVMRKSASPTSITTYETCQTYERPIAFTSRSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HIAPPPKRRILIVVPEIFLPIEDECGDVLVMRKSASPTSITTYETCQTYERPIAFTSRSR
760 770 780 790 800 810
890 900 910 920 930 940
pF1KE1 KLWIQFKSNEGNSGKGFQVPYVTYDEDYQQLIEDIVRDGRLYASENHQEILKDKKLIKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KLWIQFKSNEGNSGKGFQVPYVTYDEDYQQLIEDIVRDGRLYASENHQEILKDKKLIKAL
820 830 840 850 860 870
950 960 970 980
pF1KE1 FDVLAHPQNYFKYTAQESKEMFPRSFIKLLRSKVSRFLRPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FDVLAHPQNYFKYTAQESKEMFPRSFIKLLRSKVSRFLRPYK
880 890 900 910
>>XP_011528691 (OMIM: 611746) PREDICTED: signal peptide, (912 aa)
initn: 5372 init1: 5372 opt: 5376 Z-score: 3044.2 bits: 574.6 E(85289): 7.9e-163
Smith-Waterman score: 6360; 96.7% identity (96.7% similar) in 912 aa overlap (107-988:1-912)
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 ECENDYYNGGCVHECINIPGNYRCTCFDGFMLAHDGHNCLDVDECQDNNGGCQQICVNAM
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLAHDGHNCLDVDECQDNNGGCQQICVNAM
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 GSYECQCHSGFFLSDNQHTCIHRSNEGMNCMNKDHGCAHICRETPKGGVACDCRPGFDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSYECQCHSGFFLSDNQHTCIHRSNEGMNCMNKDHGCAHICRETPKGGVACDCRPGFDLA
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240
pF1KE1 QNQKDCTLTCNYGNGGCQHSCEDTDTGPTCGCHQKYALHSDGRTCIE-------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QNQKDCTLTCNYGNGGCQHSCEDTDTGPTCGCHQKYALHSDGRTCIEKDEAAIERSQFNA
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280
pF1KE1 -----------------TCAVNNGGCDRTCKDTATGVRCSCPVGFTLQPDGKTCKDINEC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TSVADVDKRVKRRLLMETCAVNNGGCDRTCKDTATGVRCSCPVGFTLQPDGKTCKDINEC
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 LVNNGGCDHFCRNTVGSFECGCRKGYKLLTDERTCQDIDECSFERTCDHICINSPGSFQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LVNNGGCDHFCRNTVGSFECGCRKGYKLLTDERTCQDIDECSFERTCDHICINSPGSFQC
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 LCHRGYILYGTTHCGDVDECSMSNGSCDQGCVNTKGSYECVCPPGRRLHWNGKDCVETGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LCHRGYILYGTTHCGDVDECSMSNGSCDQGCVNTKGSYECVCPPGRRLHWNGKDCVETGK
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 CLSRAKTSPRAQLSCSKAGGVESCFLSCPAHTLFVPDSENSYVLSCGVPGPQGKALQKRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CLSRAKTSPRAQLSCSKAGGVESCFLSCPAHTLFVPDSENSYVLSCGVPGPQGKALQKRN
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 GTSSGLGPSCSDAPTTPIKQKARFKIRDAKCHLRPHSQARAKETARQPLLDHCHVTFVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GTSSGLGPSCSDAPTTPIKQKARFKIRDAKCHLRPHSQARAKETARQPLLDHCHVTFVTL
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 KCDSSKKRRRGRKSPSKEVSHITAEFEIETKMEEASDTCEADCLRKRAEQSLQAAIKTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KCDSSKKRRRGRKSPSKEVSHITAEFEIETKMEEASDTCEADCLRKRAEQSLQAAIKTLR
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 KSIGRQQFYVQVSGTEYEVAQRPAKALEGQGACGAGQVLQDSKCVACGPGTHFGGELGQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KSIGRQQFYVQVSGTEYEVAQRPAKALEGQGACGAGQVLQDSKCVACGPGTHFGGELGQC
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 VSCMPGTYQDMEGQLSCTPCPSSDGLGLPGARNVSECGGQCSPGFFSADGFKPCQACPVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSCMPGTYQDMEGQLSCTPCPSSDGLGLPGARNVSECGGQCSPGFFSADGFKPCQACPVG
580 590 600 610 620 630
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 TYQPEPGRTGCFPCGGGLLTKHEGTTSFQDCEAKVHCSPGHHYNTTTHRCIRCPVGTYQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TYQPEPGRTGCFPCGGGLLTKHEGTTSFQDCEAKVHCSPGHHYNTTTHRCIRCPVGTYQP
640 650 660 670 680 690
770 780 790 800 810 820
pF1KE1 EFGQNHCITCPGNTSTDFDGSTNVTHCKNQHCGGELGDYTGYIESPNYPGDYPANAECVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EFGQNHCITCPGNTSTDFDGSTNVTHCKNQHCGGELGDYTGYIESPNYPGDYPANAECVW
700 710 720 730 740 750
830 840 850 860 870 880
pF1KE1 HIAPPPKRRILIVVPEIFLPIEDECGDVLVMRKSASPTSITTYETCQTYERPIAFTSRSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HIAPPPKRRILIVVPEIFLPIEDECGDVLVMRKSASPTSITTYETCQTYERPIAFTSRSR
760 770 780 790 800 810
890 900 910 920 930 940
pF1KE1 KLWIQFKSNEGNSGKGFQVPYVTYDEDYQQLIEDIVRDGRLYASENHQEILKDKKLIKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KLWIQFKSNEGNSGKGFQVPYVTYDEDYQQLIEDIVRDGRLYASENHQEILKDKKLIKAL
820 830 840 850 860 870
950 960 970 980
pF1KE1 FDVLAHPQNYFKYTAQESKEMFPRSFIKLLRSKVSRFLRPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FDVLAHPQNYFKYTAQESKEMFPRSFIKLLRSKVSRFLRPYK
880 890 900 910
>>NP_001317128 (OMIM: 611747) signal peptide, CUB and EG (999 aa)
initn: 2673 init1: 2673 opt: 3736 Z-score: 2122.1 bits: 404.2 E(85289): 1.8e-111
Smith-Waterman score: 4733; 64.3% identity (80.5% similar) in 1012 aa overlap (19-988:36-999)
10 20 30 40
pF1KE1 MGAAAVRWHLCVLLALGTRGRLAGGSGLPGSVDVDECSEGTDDCHIDA
::: :: : :::::..: :::: ::
NP_001 RNRPGAAWAVLLLLLLLPPLLLLAGAVPPGRGRAAG----PQE-DVDECAQGLDDCHADA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 ICQNTPKSYKCLCKPGYKGEGKQCEDIDECENDYYNGGCVHECINIPGNYRCTCFDGFML
.::::: :::: :::::.:::.:::::::: :. ::::::.:.::::::::::::::::
NP_001 LCQNTPTSYKCSCKPGYQGEGRQCEDIDECGNEL-NGGCVHDCLNIPGNYRCTCFDGFML
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 AHDGHNCLDVDECQDNNGGCQQICVNAMGSYECQCHSGFFLSDNQHTCIHRSNEGMNCMN
::::::::::::: .::::::. :::.:::::: :. :::::::::::::::.::..:::
NP_001 AHDGHNCLDVDECLENNGGCQHTCVNVMGSYECCCKEGFFLSDNQHTCIHRSEEGLSCMN
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 KDHGCAHICRETPKGGVACDCRPGFDLAQNQKDCTLTCNYGNGGCQHSCEDTDTGPTCGC
:::::.:::.:.:.:.:::.:::::.::.::.:: ::::.:::::::::.:: :: :.:
NP_001 KDHGCSHICKEAPRGSVACECRPGFELAKNQRDCILTCNHGNGGCQHSCDDTADGPECSC
180 190 200 210 220 230
230 240 250
pF1KE1 HQKYALHSDGRTCIE------------------------------TCAVNNGGCDRTCKD
: .: .:.:::.:.: :::::::::::::::
NP_001 HPQYKMHTDGRSCLEREDTVLEVTESNTTSVVDGDKRVKRRLLMETCAVNNGGCDRTCKD
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 TATGVRCSCPVGFTLQPDGKTCKDINECLVNNGGCDHFCRNTVGSFECGCRKGYKLLTDE
:.:::.:::::::::: ::::::::.:: . ::::::::.: ::::.:::.::.::::::
NP_001 TSTGVHCSCPVGFTLQLDGKTCKDIDECQTRNGGCDHFCKNIVGSFDCGCKKGFKLLTDE
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 RTCQDIDECSFERTCDHICINSPGSFQCLCHRGYILYGTTHCGDVDECSMSNGSCDQGCV
..:::.::::..::::: ::: ::.: : :.::: ::: :::::..:::..::.:.: ::
NP_001 KSCQDVDECSLDRTCDHSCINHPGTFACACNRGYTLYGFTHCGDTNECSINNGGCQQVCV
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 NTKGSYECVCPPGRRLHWNGKDCVETGKCLSRAKTSPRAQLSCSKAGGVESCFLSCPAHT
:: ::::: : :: .:::: :::::. : : ...:::..: :.:.:: ..::: : :
NP_001 NTVGSYECQCHPGYKLHWNKKDCVEV-KGLLPTSVSPRVSLHCGKSGGGDGCFLRC--H-
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 LFVPDSENSYVLSCGVPGPQGKALQKRNGTSSGLGPSCSDAPTTPIKQKARFKIRDAKCH
::. : :: .: :. .. ::. ..::
NP_001 -------------------------------SGIHLS-SD--VTTIRTSVTFKLNEGKCS
480 490 500
500 510 520 530 540 550
pF1KE1 LRPHSQARAKETARQPLLDHCHVT------FVTLKCDSSKKR--RRGRKSPSKEVSHITA
:. .:. . .: : . : . .:.: :.:.:. :: : ::. ::.
NP_001 LK---NAELFPEGLRPALPEKHSSVKESFRYVNLTCSSGKQVPGAPGRPSTPKEM-FITV
510 520 530 540 550
560 570 580 590 600 610
pF1KE1 EFEIETKMEEASDTCEADCLRKRAEQSLQAAIKTLRKSIGRQQFYVQVSGTEYEVAQRPA
:::.::...:.. .:. .:. ::.:. :. ::.::::.. :.::..:.:: . .::..:
NP_001 EFELETNQKEVTASCDLSCIVKRTEKRLRKAIRTLRKAVHREQFHLQLSGMNLDVAKKPP
560 570 580 590 600 610
620 630 640 650 660
pF1KE1 KALEGQG-ACGAGQVLQDSKCVACGPGTHFGGELGQCVSCMPGTYQDMEGQLSCTPCP--
.. : :. .::.:: ...::.: ::.. : .:. : ::.:. :::..: :::
NP_001 RTSERQAESCGVGQGHAENQCVSCRAGTYYDGARERCILCPNGTFQNEEGQMTCEPCPRP
620 630 640 650 660 670
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 -SSDGLGLPGARNVSECGGQCSPGFFSADGFKPCQACPVGTYQPEPGRTGCFPCGGGLLT
.: .: : : :.::::: :.:: .::::: ::: : .::.::: :::.:::::::: :
NP_001 GNSGALKTPEAWNMSECGGLCQPGEYSADGFAPCQLCALGTFQPEAGRTSCFPCGGGLAT
680 690 700 710 720 730
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 KHEGTTSFQDCEAKVHCSPGHHYNTTTHRCIRCPVGTYQPEFGQNHCITCPGNTSTDFDG
::.:.:::::::..:.::::: :::::::::::::::::::::.:.:..:::::.:::::
NP_001 KHQGATSFQDCETRVQCSPGHFYNTTTHRCIRCPVGTYQPEFGKNNCVSCPGNTTTDFDG
740 750 760 770 780 790
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 STNVTHCKNQHCGGELGDYTGYIESPNYPGDYPANAECVWHIAPPPKRRILIVVPEIFLP
:::.:.:::..:::::::.:::::::::::.::::.::.: : :::::::::::::::::
NP_001 STNITQCKNRRCGGELGDFTGYIESPNYPGNYPANTECTWTINPPPKRRILIVVPEIFLP
800 810 820 830 840 850
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 IEDECGDVLVMRKSASPTSITTYETCQTYERPIAFTSRSRKLWIQFKSNEGNSGKGFQVP
:::.::: :::::..: .:.:::::::::::::::::::.:::::::::::::..:::::
NP_001 IEDDCGDYLVMRKTSSSNSVTTYETCQTYERPIAFTSRSKKLWIQFKSNEGNSARGFQVP
860 870 880 890 900 910
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 YVTYDEDYQQLIEDIVRDGRLYASENHQEILKDKKLIKALFDVLAHPQNYFKYTAQESKE
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
NP_001 YVTYDEDYQELIEDIVRDGRLYASENHQEILKDKKLIKALFDVLAHPQNYFKYTAQESRE
920 930 940 950 960 970
970 980
pF1KE1 MFPRSFIKLLRSKVSRFLRPYK
:::::::.::::::::::::::
NP_001 MFPRSFIRLLRSKVSRFLRPYK
980 990
>>XP_005253089 (OMIM: 611747) PREDICTED: signal peptide, (1028 aa)
initn: 3453 init1: 1965 opt: 3568 Z-score: 2027.5 bits: 386.7 E(85289): 3.4e-106
Smith-Waterman score: 4828; 64.5% identity (81.7% similar) in 1012 aa overlap (19-988:36-1028)
10 20 30 40
pF1KE1 MGAAAVRWHLCVLLALGTRGRLAGGSGLPGSVDVDECSEGTDDCHIDA
::: :: : :::::..: :::: ::
XP_005 RNRPGAAWAVLLLLLLLPPLLLLAGAVPPGRGRAAG----PQE-DVDECAQGLDDCHADA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 ICQNTPKSYKCLCKPGYKGEGKQCEDIDECENDYYNGGCVHECINIPGNYRCTCFDGFML
.::::: :::: :::::.:::.:::::::: :. ::::::.:.::::::::::::::::
XP_005 LCQNTPTSYKCSCKPGYQGEGRQCEDIDECGNEL-NGGCVHDCLNIPGNYRCTCFDGFML
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 AHDGHNCLDVDECQDNNGGCQQICVNAMGSYECQCHSGFFLSDNQHTCIHRSNEGMNCMN
::::::::::::: .::::::. :::.:::::: :. :::::::::::::::.::..:::
XP_005 AHDGHNCLDVDECLENNGGCQHTCVNVMGSYECCCKEGFFLSDNQHTCIHRSEEGLSCMN
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 KDHGCAHICRETPKGGVACDCRPGFDLAQNQKDCTLTCNYGNGGCQHSCEDTDTGPTCGC
:::::.:::.:.:.:.:::.:::::.::.::.:: ::::.:::::::::.:: :: :.:
XP_005 KDHGCSHICKEAPRGSVACECRPGFELAKNQRDCILTCNHGNGGCQHSCDDTADGPECSC
180 190 200 210 220 230
230 240 250
pF1KE1 HQKYALHSDGRTCIE------------------------------TCAVNNGGCDRTCKD
: .: .:.:::.:.: :::::::::::::::
XP_005 HPQYKMHTDGRSCLEREDTVLEVTESNTTSVVDGDKRVKRRLLMETCAVNNGGCDRTCKD
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 TATGVRCSCPVGFTLQPDGKTCKDINECLVNNGGCDHFCRNTVGSFECGCRKGYKLLTDE
:.:::.:::::::::: ::::::::.:: . ::::::::.: ::::.:::.::.::::::
XP_005 TSTGVHCSCPVGFTLQLDGKTCKDIDECQTRNGGCDHFCKNIVGSFDCGCKKGFKLLTDE
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 RTCQDIDECSFERTCDHICINSPGSFQCLCHRGYILYGTTHCGDVDECSMSNGSCDQGCV
..:::.::::..::::: ::: ::.: : :.::: ::: :::::..:::..::.:.: ::
XP_005 KSCQDVDECSLDRTCDHSCINHPGTFACACNRGYTLYGFTHCGDTNECSINNGGCQQVCV
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 NTKGSYECVCPPGRRLHWNGKDCVETGKCLSRAKTSPRAQLSCSKAGGVESCFLSCPAHT
:: ::::: : :: .:::: :::::. : : ...:::..: :.:.:: ..::: : .
XP_005 NTVGSYECQCHPGYKLHWNKKDCVEV-KGLLPTSVSPRVSLHCGKSGGGDGCFLRCHSGI
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 LFVPDSENSYVLSCGVPGPQGKALQKRNGTSSGLGPSCSDAPTTPIKQKARFKIRDAKCH
. ...: ..:: .: . :: : .. : .: :. .. ::. ..::
XP_005 HLSSGLQGAYSVTCGSSSPLRNKQQKSNDSAFG--------DVTTIRTSVTFKLNEGKCS
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KE1 LRPHSQARAKETARQPLLDHCHVT------FVTLKCDSSKKR--RRGRKSPSKEVSHITA
:. .:. . .: : . : . .:.: :.:.:. :: : ::. ::.
XP_005 LK---NAELFPEGLRPALPEKHSSVKESFRYVNLTCSSGKQVPGAPGRPSTPKEM-FITV
540 550 560 570 580
560 570 580 590 600 610
pF1KE1 EFEIETKMEEASDTCEADCLRKRAEQSLQAAIKTLRKSIGRQQFYVQVSGTEYEVAQRPA
:::.::...:.. .:. .:. ::.:. :. ::.::::.. :.::..:.:: . .::..:
XP_005 EFELETNQKEVTASCDLSCIVKRTEKRLRKAIRTLRKAVHREQFHLQLSGMNLDVAKKPP
590 600 610 620 630 640
620 630 640 650 660
pF1KE1 KALEGQG-ACGAGQVLQDSKCVACGPGTHFGGELGQCVSCMPGTYQDMEGQLSCTPCP--
.. : :. .::.:: ...::.: ::.. : .:. : ::.:. :::..: :::
XP_005 RTSERQAESCGVGQGHAENQCVSCRAGTYYDGARERCILCPNGTFQNEEGQMTCEPCPRP
650 660 670 680 690 700
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 -SSDGLGLPGARNVSECGGQCSPGFFSADGFKPCQACPVGTYQPEPGRTGCFPCGGGLLT
.: .: : : :.::::: :.:: .::::: ::: : .::.::: :::.:::::::: :
XP_005 GNSGALKTPEAWNMSECGGLCQPGEYSADGFAPCQLCALGTFQPEAGRTSCFPCGGGLAT
710 720 730 740 750 760
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 KHEGTTSFQDCEAKVHCSPGHHYNTTTHRCIRCPVGTYQPEFGQNHCITCPGNTSTDFDG
::.:.:::::::..:.::::: :::::::::::::::::::::.:.:..:::::.:::::
XP_005 KHQGATSFQDCETRVQCSPGHFYNTTTHRCIRCPVGTYQPEFGKNNCVSCPGNTTTDFDG
770 780 790 800 810 820
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 STNVTHCKNQHCGGELGDYTGYIESPNYPGDYPANAECVWHIAPPPKRRILIVVPEIFLP
:::.:.:::..:::::::.:::::::::::.::::.::.: : :::::::::::::::::
XP_005 STNITQCKNRRCGGELGDFTGYIESPNYPGNYPANTECTWTINPPPKRRILIVVPEIFLP
830 840 850 860 870 880
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 IEDECGDVLVMRKSASPTSITTYETCQTYERPIAFTSRSRKLWIQFKSNEGNSGKGFQVP
:::.::: :::::..: .:.:::::::::::::::::::.:::::::::::::..:::::
XP_005 IEDDCGDYLVMRKTSSSNSVTTYETCQTYERPIAFTSRSKKLWIQFKSNEGNSARGFQVP
890 900 910 920 930 940
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 YVTYDEDYQQLIEDIVRDGRLYASENHQEILKDKKLIKALFDVLAHPQNYFKYTAQESKE
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
XP_005 YVTYDEDYQELIEDIVRDGRLYASENHQEILKDKKLIKALFDVLAHPQNYFKYTAQESRE
950 960 970 980 990 1000
970 980
pF1KE1 MFPRSFIKLLRSKVSRFLRPYK
:::::::.::::::::::::::
XP_005 MFPRSFIRLLRSKVSRFLRPYK
1010 1020
>>NP_689966 (OMIM: 614708) signal peptide, CUB and EGF-l (993 aa)
initn: 4135 init1: 2251 opt: 3137 Z-score: 1785.5 bits: 341.9 E(85289): 1e-92
Smith-Waterman score: 4963; 66.0% identity (85.6% similar) in 1002 aa overlap (1-988:1-993)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGAAAVRWHLCVLLALGTRGRLAGGSGLPGSVDVDECSEGTDDCHIDAICQNTPKSYKCL
::.. : :: ::.: ...: : : .. ::::: ::::.:::::::::::.::::.
NP_689 MGSGRVP-GLC-LLVLLVHARAAQYS--KAAQDVDECVEGTDNCHIDAICQNTPRSYKCI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 CKPGYKGEGKQCEDIDECENDYYNGGCVHECINIPGNYRCTCFDGFMLAHDGHNCLDVDE
:: :: :.::.:.:.:::: . :.::::.:.::::::::::.::: :::::::::::::
NP_689 CKSGYTGDGKHCKDVDECERED-NAGCVHDCVNIPGNYRCTCYDGFHLAHDGHNCLDVDE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 CQDNNGGCQQICVNAMGSYECQCHSGFFLSDNQHTCIHRSNEGMNCMNKDHGCAHICRET
: ..:::::: ::: ::::::.:. ::::::::::::.: .::::::::.::::::::::
NP_689 CAEGNGGCQQSCVNMMGSYECHCREGFFLSDNQHTCIQRPEEGMNCMNKNHGCAHICRET
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 PKGGVACDCRPGFDLAQNQKDCTLTCNYGNGGCQHSCEDTDTGPTCGCHQKYALHSDGRT
::::.::.:::::.:..::.:: ::::::::::::.:.::. :: :::: :..::.::.:
NP_689 PKGGIACECRPGFELTKNQRDCKLTCNYGNGGCQHTCDDTEQGPRCGCHIKFVLHTDGKT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 CIETCAVNNGGCDRTCKDTATGVRCSCPVGFTLQPDGKTCKDINECLVNNGGCDHFCRNT
::::::::::::: :.:.::::.:.::::: :::: ::::::.:: .:::::::.::::
NP_689 CIETCAVNNGGCDSKCHDAATGVHCTCPVGFMLQPDRKTCKDIDECRLNNGGCDHICRNT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VGSFECGCRKGYKLLTDERTCQDIDECSFERTCDHICINSPGSFQCLCHRGYILYGTTHC
::::::.:.:::::: .::.:::::::::.:::::::.:.::::::::::::.::: :::
NP_689 VGSFECSCKKGYKLLINERNCQDIDECSFDRTCDHICVNTPGSFQCLCHRGYLLYGITHC
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pF1KE1 GDVDECSMSNGSCDQGCVNTKGSYECVCPPGR-RLHWNGKDCVETGKCLSRAKTSPRAQL
:::::::.. :.: ::.:: :::.:.:: :. :::::::::.: :: . .: .:.:
NP_689 GDVDECSINRGGCRFGCINTPGSYQCTCPAGQGRLHWNGKDCTEPLKCQGSPGAS-KAML
360 370 380 390 400 410
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pF1KE1 SCSKAGGVESCFLSCPAHTLFVPDSENSYVLSCGVPGPQGK-ALQKRNGTSSGLGPSCSD
::...: ..: :.::... :.:.:::....:::.:.:.. : .::.:.. . : .
NP_689 SCNRSGKKDTCALTCPSRARFLPESENGFTVSCGTPSPRAAPARAGHNGNSTN-SNHCHE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 APTTPIKQKARFKIRDAKCHLRPHSQARAKETAR------QPLLDHCHVTFVTLKCDSSK
: . :::.: :::.::::.:. .......:..: : ..:.:::. ::::::.
NP_689 AAVLSIKQRASFKIKDAKCRLHLRNKGKTEEAGRITGPGGAPC-SECQVTFIHLKCDSSR
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 KR--RRGRKSPSKEVSHITAEFEIETKMEEASDTCEADCLRKRAEQSLQAAIKTLRKSIG
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NP_689 KGKGRRARTPPGKEVTRLTLELEAEVRAEETTASCGLPCLRQRMERRLKGSLKMLRKSIN
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640
pF1KE1 RQQFYVQVSGTEYEVAQRPA----KALEGQGACGAGQVLQDSKCVACGPGTHFGGELGQC
...: ....: .::.:..:. . : . .: :: .:::.: ::.. :. ::
NP_689 QDRFLLRLAGLDYELAHKPGLVAGERAEPMESCRPGQHRAGTKCVSCPQGTYYHGQTEQC
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 VSCMPGTYQDMEGQLSCTPCPSSDGLGLPGARNVSECGGQCSPGFFSADGFKPCQACPVG
: : ::.:. :::::: ::.::. : :: ::. :.::: :: :.::::::: :: :
NP_689 VPCPAGTFQEREGQLSCDLCPGSDAHGPLGATNVTTCAGQCPPGQHSVDGFKPCQPCPRG
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 TYQPEPGRTGCFPCGGGLLTKHEGTTSFQDCEAKVHCSPGHHYNTTTHRCIRCPVGTYQP
::::: ::: :::::::: :::::. :::::..::.:::::.:::. :::::: .:.:::
NP_689 TYQPEAGRTLCFPCGGGLTTKHEGAISFQDCDTKVQCSPGHYYNTSIHRCIRCAMGSYQP
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KE1 EFGQNHCITCPGNTSTDFDGSTNVTHCKNQHCGGELGDYTGYIESPNYPGDYPANAECVW
.: :: : :::::::::::::.:..:::..::::::..:::::::::::.:::..::.:
NP_689 DFRQNFCSRCPGNTSTDFDGSTSVAQCKNRQCGGELGEFTGYIESPNYPGNYPAGVECIW
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KE1 HIAPPPKRRILIVVPEIFLPIEDECGDVLVMRKSASPTSITTYETCQTYERPIAFTSRSR
.: :::::.::::::::::: ::::::::::::..::.::::::::::::::::::.:::
NP_689 NINPPPKRKILIVVPEIFLPSEDECGDVLVMRKNSSPSSITTYETCQTYERPIAFTARSR
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
pF1KE1 KLWIQFKSNEGNSGKGFQVPYVTYDEDYQQLIEDIVRDGRLYASENHQEILKDKKLIKAL
::::.::..:.::..:::.:::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::.
NP_689 KLWINFKTSEANSARGFQIPYVTYDEDYEQLVEDIVRDGRLYASENHQEILKDKKLIKAF
900 910 920 930 940 950
950 960 970 980
pF1KE1 FDVLAHPQNYFKYTAQESKEMFPRSFIKLLRSKVSRFLRPYK
:.:::::::::::: .. :::.:.::::::::::: ::::::
NP_689 FEVLAHPQNYFKYT-EKHKEMLPKSFIKLLRSKVSSFLRPYK
960 970 980 990
>>XP_005253092 (OMIM: 611747) PREDICTED: signal peptide, (953 aa)
initn: 2941 init1: 1453 opt: 3080 Z-score: 1753.6 bits: 335.9 E(85289): 6.1e-91
Smith-Waterman score: 4340; 61.9% identity (80.2% similar) in 936 aa overlap (19-912:36-952)
10 20 30 40
pF1KE1 MGAAAVRWHLCVLLALGTRGRLAGGSGLPGSVDVDECSEGTDDCHIDA
::: :: : :::::..: :::: ::
XP_005 RNRPGAAWAVLLLLLLLPPLLLLAGAVPPGRGRAAG----PQE-DVDECAQGLDDCHADA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 ICQNTPKSYKCLCKPGYKGEGKQCEDIDECENDYYNGGCVHECINIPGNYRCTCFDGFML
.::::: :::: :::::.:::.:::::::: :. ::::::.:.::::::::::::::::
XP_005 LCQNTPTSYKCSCKPGYQGEGRQCEDIDECGNEL-NGGCVHDCLNIPGNYRCTCFDGFML
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 AHDGHNCLDVDECQDNNGGCQQICVNAMGSYECQCHSGFFLSDNQHTCIHRSNEGMNCMN
::::::::::::: .::::::. :::.:::::: :. :::::::::::::::.::..:::
XP_005 AHDGHNCLDVDECLENNGGCQHTCVNVMGSYECCCKEGFFLSDNQHTCIHRSEEGLSCMN
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 KDHGCAHICRETPKGGVACDCRPGFDLAQNQKDCTLTCNYGNGGCQHSCEDTDTGPTCGC
:::::.:::.:.:.:.:::.:::::.::.::.:: ::::.:::::::::.:: :: :.:
XP_005 KDHGCSHICKEAPRGSVACECRPGFELAKNQRDCILTCNHGNGGCQHSCDDTADGPECSC
180 190 200 210 220 230
230 240 250
pF1KE1 HQKYALHSDGRTCIE------------------------------TCAVNNGGCDRTCKD
: .: .:.:::.:.: :::::::::::::::
XP_005 HPQYKMHTDGRSCLEREDTVLEVTESNTTSVVDGDKRVKRRLLMETCAVNNGGCDRTCKD
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 TATGVRCSCPVGFTLQPDGKTCKDINECLVNNGGCDHFCRNTVGSFECGCRKGYKLLTDE
:.:::.:::::::::: ::::::::.:: . ::::::::.: ::::.:::.::.::::::
XP_005 TSTGVHCSCPVGFTLQLDGKTCKDIDECQTRNGGCDHFCKNIVGSFDCGCKKGFKLLTDE
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 RTCQDIDECSFERTCDHICINSPGSFQCLCHRGYILYGTTHCGDVDECSMSNGSCDQGCV
..:::.::::..::::: ::: ::.: : :.::: ::: :::::..:::..::.:.: ::
XP_005 KSCQDVDECSLDRTCDHSCINHPGTFACACNRGYTLYGFTHCGDTNECSINNGGCQQVCV
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 NTKGSYECVCPPGRRLHWNGKDCVETGKCLSRAKTSPRAQLSCSKAGGVESCFLSCPAHT
:: ::::: : :: .:::: :::::. : : ...:::..: :.:.:: ..::: : .
XP_005 NTVGSYECQCHPGYKLHWNKKDCVEV-KGLLPTSVSPRVSLHCGKSGGGDGCFLRCHSGI
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 LFVPDSENSYVLSCGVPGPQGKALQKRNGTSSGLGPSCSDAPTTPIKQKARFKIRDAKCH
. ...: ..:: .: . :: : .. : .: :. .. ::. ..::
XP_005 HLSSGLQGAYSVTCGSSSPLRNKQQKSNDSAFG--------DVTTIRTSVTFKLNEGKCS
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KE1 LRPHSQARAKETARQPLLDHCHVT------FVTLKCDSSKKR--RRGRKSPSKEVSHITA
:. .:. . .: : . : . .:.: :.:.:. :: : ::. ::.
XP_005 LK---NAELFPEGLRPALPEKHSSVKESFRYVNLTCSSGKQVPGAPGRPSTPKEM-FITV
540 550 560 570 580
560 570 580 590 600 610
pF1KE1 EFEIETKMEEASDTCEADCLRKRAEQSLQAAIKTLRKSIGRQQFYVQVSGTEYEVAQRPA
:::.::...:.. .:. .:. ::.:. :. ::.::::.. :.::..:.:: . .::..:
XP_005 EFELETNQKEVTASCDLSCIVKRTEKRLRKAIRTLRKAVHREQFHLQLSGMNLDVAKKPP
590 600 610 620 630 640
620 630 640 650 660
pF1KE1 KALEGQG-ACGAGQVLQDSKCVACGPGTHFGGELGQCVSCMPGTYQDMEGQLSCTPCP--
.. : :. .::.:: ...::.: ::.. : .:. : ::.:. :::..: :::
XP_005 RTSERQAESCGVGQGHAENQCVSCRAGTYYDGARERCILCPNGTFQNEEGQMTCEPCPRP
650 660 670 680 690 700
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 -SSDGLGLPGARNVSECGGQCSPGFFSADGFKPCQACPVGTYQPEPGRTGCFPCGGGLLT
.: .: : : :.::::: :.:: .::::: ::: : .::.::: :::.:::::::: :
XP_005 GNSGALKTPEAWNMSECGGLCQPGEYSADGFAPCQLCALGTFQPEAGRTSCFPCGGGLAT
710 720 730 740 750 760
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 KHEGTTSFQDCEAKVHCSPGHHYNTTTHRCIRCPVGTYQPEFGQNHCITCPGNTSTDFDG
::.:.:::::::..:.::::: :::::::::::::::::::::.:.:..:::::.:::::
XP_005 KHQGATSFQDCETRVQCSPGHFYNTTTHRCIRCPVGTYQPEFGKNNCVSCPGNTTTDFDG
770 780 790 800 810 820
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 STNVTHCKNQHCGGELGDYTGYIESPNYPGDYPANAECVWHIAPPPKRRILIVVPEIFLP
:::.:.:::..:::::::.:::::::::::.::::.::.: : :::::::::::::::::
XP_005 STNITQCKNRRCGGELGDFTGYIESPNYPGNYPANTECTWTINPPPKRRILIVVPEIFLP
830 840 850 860 870 880
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 IEDECGDVLVMRKSASPTSITTYETCQTYERPIAFTSRSRKLWIQFKSNEGNSGKGFQVP
:::.::: :::::..: .:.:::::::::::::::::::.:::::::::::::..:::::
XP_005 IEDDCGDYLVMRKTSSSNSVTTYETCQTYERPIAFTSRSKKLWIQFKSNEGNSARGFQVP
890 900 910 920 930 940
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 YVTYDEDYQQLIEDIVRDGRLYASENHQEILKDKKLIKALFDVLAHPQNYFKYTAQESKE
:::::.
XP_005 YVTYDDA
950
>>XP_016873569 (OMIM: 611747) PREDICTED: signal peptide, (958 aa)
initn: 3224 init1: 1965 opt: 3009 Z-score: 1713.7 bits: 328.5 E(85289): 1e-88
Smith-Waterman score: 4423; 61.7% identity (77.3% similar) in 1012 aa overlap (19-988:36-958)
10 20 30 40
pF1KE1 MGAAAVRWHLCVLLALGTRGRLAGGSGLPGSVDVDECSEGTDDCHIDA
::: :: : :::::..: :::: ::
XP_016 RNRPGAAWAVLLLLLLLPPLLLLAGAVPPGRGRAAG----PQE-DVDECAQGLDDCHADA
10 20 30 40 50 60
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pF1KE1 ICQNTPKSYKCLCKPGYKGEGKQCEDIDECENDYYNGGCVHECINIPGNYRCTCFDGFML
.::::: :::: :::::.:::.:::::::: :. ::::::.:.::::::::::::::::
XP_016 LCQNTPTSYKCSCKPGYQGEGRQCEDIDECGNEL-NGGCVHDCLNIPGNYRCTCFDGFML
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 AHDGHNCLDVDECQDNNGGCQQICVNAMGSYECQCHSGFFLSDNQHTCIHRSNEGMNCMN
::::::::::::: .::::::. :::.:::::: :. :::::::::::::::.::..:::
XP_016 AHDGHNCLDVDECLENNGGCQHTCVNVMGSYECCCKEGFFLSDNQHTCIHRSEEGLSCMN
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 KDHGCAHICRETPKGGVACDCRPGFDLAQNQKDCTLTCNYGNGGCQHSCEDTDTGPTCGC
:::::.:::.:.:.:.:::.:::::.::.::.:: ::::.:::::::::.:: :: :.:
XP_016 KDHGCSHICKEAPRGSVACECRPGFELAKNQRDCILTCNHGNGGCQHSCDDTADGPECSC
180 190 200 210 220 230
230 240 250
pF1KE1 HQKYALHSDGRTCIE------------------------------TCAVNNGGCDRTCKD
: .: .:.:::.:.: :::::::::::::::
XP_016 HPQYKMHTDGRSCLEREDTVLEVTESNTTSVVDGDKRVKRRLLMETCAVNNGGCDRTCKD
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 TATGVRCSCPVGFTLQPDGKTCKDINECLVNNGGCDHFCRNTVGSFECGCRKGYKLLTDE
:.:::.:::::::::: ::::::::.:: . ::::::::.: ::::.:::.::.::::::
XP_016 TSTGVHCSCPVGFTLQLDGKTCKDIDECQTRNGGCDHFCKNIVGSFDCGCKKGFKLLTDE
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 RTCQDIDECSFERTCDHICINSPGSFQCLCHRGYILYGTTHCGDVDECSMSNGSCDQGCV
..:::.::::..::::: ::: ::.: : :.::: ::: ::::.:
XP_016 KSCQDVDECSLDRTCDHSCINHPGTFACACNRGYTLYGFTHCGEV---------------
360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 NTKGSYECVCPPGRRLHWNGKDCVETGKCLSRAKTSPRAQLSCSKAGGVESCFLSCPAHT
:: . : ...:::..: :.:.:: ..::: : :
XP_016 --KG----LLP---------------------TSVSPRVSLHCGKSGGGDGCFLRC--H-
410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 LFVPDSENSYVLSCGVPGPQGKALQKRNGTSSGLGPSCSDAPTTPIKQKARFKIRDAKCH
::. : :: .: :. .. ::. ..::
XP_016 -------------------------------SGIHLS-SD--VTTIRTSVTFKLNEGKCS
440 450 460
500 510 520 530 540 550
pF1KE1 LRPHSQARAKETARQPLLDHCHVT------FVTLKCDSSKKR--RRGRKSPSKEVSHITA
:. .:. . .: : . : . .:.: :.:.:. :: : ::. ::.
XP_016 LK---NAELFPEGLRPALPEKHSSVKESFRYVNLTCSSGKQVPGAPGRPSTPKEM-FITV
470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
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.. : :. .::.:: ...::.: ::.. : .:. : ::.:. :::..: :::
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XP_016 MFPRSFIRLLRSKVSRFLRPYK
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XP_011 LCQNTPTSYKCSCKPGYQGEGRQCEDIDECGNEL-NGGCVHDCLNIPGNYRCTCFDGFML
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..:::.::::..::::: ::: ::.: : :.::: ::: :::::..:::..::.:.: ::
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:: ::::: : :: .:::: ::::. .. .:: .:. .: : :
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XP_011 KTPEAWNMSECGGLCQPGEYSADGFAPCQLCALGTFQPEAGRTSCFPCGGGLATKHQGAT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]