Result of FASTA (ccds) for pFN21AE6326
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6326, 430 aa
  1>>>pF1KE6326 430 - 430 aa - 430 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4643+/-0.000962; mu= 16.1082+/- 0.058
 mean_var=62.0175+/-12.264, 0's: 0 Z-trim(104.3): 27  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.162861
 statistics sampled from 7784 (7809) to 7784 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.24), width:  16
 Scan time:  1.990

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2389.1 ACADL gene_id:33|Hs108|chr2             ( 430) 2867 682.4 2.2e-196
CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15           ( 426)  814 200.1 3.5e-51
CCDS53930.1 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15           ( 396)  756 186.4 4.2e-47
CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10           ( 432)  744 183.6 3.2e-46
CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12            ( 412)  735 181.5 1.3e-45
CCDS668.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1              ( 421)  725 179.2 6.9e-45
CCDS44165.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1            ( 425)  725 179.2 6.9e-45
CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1            ( 385)  723 178.7 8.8e-45
CCDS8498.1 ACAD8 gene_id:27034|Hs108|chr11         ( 415)  689 170.7 2.4e-42
CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10          ( 330)  645 160.3 2.5e-39
CCDS72807.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1            ( 454)  625 155.7 8.7e-38
CCDS76610.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12           ( 408)  588 147.0 3.3e-35
CCDS3053.1 ACAD9 gene_id:28976|Hs108|chr3          ( 621)  575 144.0   4e-34
CCDS42249.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17          ( 633)  565 141.6 2.1e-33
CCDS11090.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17          ( 655)  565 141.6 2.1e-33
CCDS58509.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17          ( 678)  565 141.6 2.2e-33
CCDS12286.1 GCDH gene_id:2639|Hs108|chr19          ( 438)  451 114.8 1.7e-25
CCDS31903.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12       (1059)  301 79.7 1.5e-14
CCDS44973.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12       (1090)  301 79.7 1.6e-14
CCDS3074.1 ACAD11 gene_id:84129|Hs108|chr3         ( 780)  284 75.6 1.9e-13


>>CCDS2389.1 ACADL gene_id:33|Hs108|chr2                  (430 aa)
 initn: 2867 init1: 2867 opt: 2867  Z-score: 3639.2  bits: 682.4 E(32554): 2.2e-196
Smith-Waterman score: 2867; 100.0% identity (100.0% similar) in 430 aa overlap (1-430:1-430)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MAARLLRGSLRVLGGHRAPRQLPAARCSHSGGEERLETPSAKKLTDIGIRRIFSPEHDIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 MAARLLRGSLRVLGGHRAPRQLPAARCSHSGGEERLETPSAKKLTDIGIRRIFSPEHDIF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 RKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 RKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAIV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 WEEQAYSNCSGPGFSIHSGIVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAGSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 WEEQAYSNCSGPGFSIHSGIVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAGSD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 LQGIKTNAKKDGSDWILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAHGISLFLVENGMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 LQGIKTNAKKDGSDWILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAHGISLFLVENGMK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 GFIKGRKLHKMGLKAQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADVAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 GFIKGRKLHKMGLKAQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADVAI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 SASEFMFEETRNYVKQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHEAKRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SASEFMFEETRNYVKQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHEAKRL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 DSATACMAKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 DSATACMAKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKE
              370       380       390       400       410       420

              430
pF1KE6 LIAREIVFDK
       ::::::::::
CCDS23 LIAREIVFDK
              430

>>CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15                (426 aa)
 initn: 787 init1: 680 opt: 814  Z-score: 1032.3  bits: 200.1 E(32554): 3.5e-51
Smith-Waterman score: 814; 34.9% identity (69.5% similar) in 384 aa overlap (53-429:45-424)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KE6 PAARCSHSGGEERLETPSAKKLTDIGIRRIFSPEHDIFRKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKA
                                     .: :.  .:... ::.::.. :. .: ...
CCDS10 VASWRLRPPLAGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQLRQTMAKFLQEHLAPKAQEIDRS
           20        30        40        50        60        70    

               90       100       110       120        130         
pF1KE6 GEVS--REVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAIVWEEQAY-SNCSGPGFSIHSG
       .: .  :: :.. :. :.::..   . :: :      ..: :: .  :.  : ... ::.
CCDS10 NEFKNLREFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISRASGAVGLSYGAHSN
           80        90       100       110       120       130    

     140       150       160       170       180       190         
pF1KE6 IVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAGSDLQGIKTNAKKDGSDWILNG
       . .. .. .:.: : ....:.. .:. :::.::.::.::::. ..: .:.: :. .::::
CCDS10 LCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMKLKAEKKGNHYILNG
          140       150       160       170       180       190    

     200       210       220       230       240       250         
pF1KE6 SKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAHGISLFLVENGMKGFIKGRKLHKMGLKAQDTA
       .: .:.::  .::.:: : :.  :   ..::. :.::.:: ::  ..:: :.:.....: 
CCDS10 NKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPASRGITAFIVEKGMPGFSTSKKLDKLGMRGSNTC
          200       210       220       230       240       250    

     260       270       280       290       300       310         
pF1KE6 ELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADVAISASEFMFEETRNYVKQRKA
       ::.::: ..::. .::.:::: : .:. :  :::..:   ..  . ....:  :.. :.:
CCDS10 ELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLHVREA
          260       270       280       290       300       310    

     320       330       340       350           360       370     
pF1KE6 FGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDN----CLQLHEAKRLDSATACMAKYWASEL
       ::. ..:.: .: :.:.. :.. . : .: :    : . : . . : : . .   ...: 
CCDS10 FGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTAK-DCAGVIL---YSAEC
          320       330       340       350        360          370

         380       390       400       410       420       430 
pF1KE6 QNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKELIAREIVFDK 
        ..:: : .:  :: ::. ..:...   ::..  : .::.:. . .:.: .  :  
CCDS10 ATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH
              380       390       400       410       420      

>>CCDS53930.1 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15                (396 aa)
 initn: 746 init1: 680 opt: 756  Z-score: 959.2  bits: 186.4 E(32554): 4.2e-47
Smith-Waterman score: 756; 35.3% identity (68.9% similar) in 351 aa overlap (84-429:48-394)

            60        70        80        90       100       110   
pF1KE6 SPEHDIFRKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGD
                                     :  .: :.. :. :.::..   . :: :  
CCDS53 WRLRPPLAGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQEFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLG
        20        30        40        50        60        70       

           120        130       140       150       160       170  
pF1KE6 LYSAAIVWEEQAY-SNCSGPGFSIHSGIVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAM
           ..: :: .  :.  : ... ::.. .. .. .:.: : ....:.. .:. :::.::
CCDS53 YLEHVLVMEEISRASGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAM
        80        90       100       110       120       130       

            180       190       200       210       220       230  
pF1KE6 TEPGAGSDLQGIKTNAKKDGSDWILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAHGISL
       .::.::::. ..: .:.: :. .::::.: .:.::  .::.:: : :.  :   ..::. 
CCDS53 SEPNAGSDVVSMKLKAEKKGNHYILNGNKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPASRGITA
       140       150       160       170       180       190       

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE6 FLVENGMKGFIKGRKLHKMGLKAQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQER
       :.::.:: ::  ..:: :.:.....: ::.::: ..::. .::.:::: : .:. :  ::
CCDS53 FIVEKGMPGFSTSKKLDKLGMRGSNTCELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLER
       200       210       220       230       240       250       

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE6 LLIADVAISASEFMFEETRNYVKQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDN--
       :..:   ..  . ....:  :.. :.:::. ..:.: .: :.:.. :.. . : .: :  
CCDS53 LVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVA
       260       270       280       290       300       310       

                360       370       380       390       400        
pF1KE6 --CLQLHEAKRLDSATACMAKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQ
         : . : . . : : . .   ...:  ..:: : .:  :: ::. ..:...   ::.. 
CCDS53 KACDEGHCTAK-DCAGVIL---YSAECATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLY
       320        330          340       350       360       370   

      410       420       430 
pF1KE6 PIYGGTNEIMKELIAREIVFDK 
        : .::.:. . .:.: .  :  
CCDS53 EIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH
           380       390      

>>CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10                (432 aa)
 initn: 733 init1: 407 opt: 744  Z-score: 943.3  bits: 183.6 E(32554): 3.2e-46
Smith-Waterman score: 744; 32.3% identity (64.9% similar) in 436 aa overlap (1-426:4-428)

                  10            20        30        40        50   
pF1KE6    MAARLLRGSLRVLGGHR----APRQLPAARCSHSGGEERLETPSAKKLTDIGIR---
          .:.:::::: :.:  .     .  ..:    . : .:  :.      .:. ::.   
CCDS76 MEGLAVRLLRGS-RLLRRNFLTCLSSWKIPPHVSKSSQSEALLN------ITNNGIHFAP
               10         20        30        40              50   

                60        70        80        90       100         
pF1KE6 -RIFSPEHDIFRKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGG
        . :. :. ....::.:: ::.. :  :  .. ... . : .   .:::.:...  . ::
CCDS76 LQTFTDEEMMIKSSVKKFAQEQIAPLVSTMDENSKMEKSVIQGLFQQGLMGIEVDPEYGG
            60        70        80        90       100       110   

     110       120       130        140       150       160        
pF1KE6 IGGDLYSAAIVWEEQAYSNCSGPGFS-IHSGIVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIG
        :... :...: :: :  . :   :  :.. .. . : .::.:::   ..::.:. : .:
CCDS76 TGASFLSTVLVIEELAKVDASVAVFCEIQNTLINTLIRKHGTEEQKATYLPQLTTEK-VG
           120       130       140       150       160       170   

      170       180       190       200       210       220        
pF1KE6 AIAMTEPGAGSDLQGIKTNAKKDGSDWILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAH
       .. ..: :::::  ..:: : :.:. ..:::::..::..  . . .:.: ..   :. ..
CCDS76 SFCLSEAGAGSDSFALKTRADKEGDYYVLNGSKMWISSAEHAGLFLVMANVD---PTIGY
            180       190       200       210       220            

       230       240       250       260       270       280       
pF1KE6 -GISLFLVENGMKGFIKGRKLHKMGLKAQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKE
        ::. :::.    :.  :.  .:.::.:..:  : ::....: . .::. ..:. : .  
CCDS76 KGITSFLVDRDTPGLHIGKPENKLGLRASSTCPLTFENVKVPEANILGQIGHGYKYAIGS
     230       240       250       260       270       280         

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pF1KE6 LPQERLLIADVAISASEFMFEETRNYVKQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAF
       : . :. ::   .. ..  :. :  :.:.:  ::: .  .: .::..:.. :.. ..: .
CCDS76 LNEGRIGIAAQMLGLAQGCFDYTIPYIKERIQFGKRLFDFQGLQHQVAHVATQLEAARLL
     290       300       310       320       330       340         

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pF1KE6 VDNCLQLHEAKRLDSATACMAKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARV
       . :  .: :: .     : ::::.:::. ....  :..  :: ::  .::. : . ::..
CCDS76 TYNAARLLEAGKPFIKEASMAKYYASEIAGQTTSKCIEWMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKI
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       410       420       430
pF1KE6 QPIYGGTNEIMKELIAREIVFDK
         :: :...:. . ::..:    
CCDS76 GTIYEGASNIQLNTIAKHIDAEY
     410       420       430  

>>CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12                 (412 aa)
 initn: 659 init1: 415 opt: 735  Z-score: 932.2  bits: 181.5 E(32554): 1.3e-45
Smith-Waterman score: 735; 33.0% identity (65.2% similar) in 397 aa overlap (30-423:10-403)

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pF1KE6 MAARLLRGSLRVLGGHRAPRQLPAARCSHSGGEERLETPSAKKLTDIGIRRIFSPE-HDI
                                    ::  .:   : : .      . .  :: :..
CCDS92                     MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQSVELPETHQM
                                   10        20        30        40

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pF1KE6 FRKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAI
       . .. : : ..:..:  .. .:         .: :  :::.... :.::: : :  . ::
CCDS92 LLQTCRDFAEKELFPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAI
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pF1KE6 VWEEQAYSNCSGPG--FSIHSGIVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGA
       . :: . . :.. :  .:..... .. : . ::.:: . ..  .:.:  :: .:..::: 
CCDS92 AMEEISRG-CASTGVIMSVNNSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGN
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pF1KE6 GSDLQGIKTNAKKDGSDWILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAHGISLFLVEN
       :::  . .:.:. .:..:.:::.:..:.:.  .....: : :..   .  .::: :::  
CCDS92 GSDAGAASTTARAEGDSWVLNGTKAWITNAWEASAAVVFASTDRALQN--KGISAFLVPM
     160       170       180       190       200         210       

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pF1KE6 GMKGFIKGRKLHKMGLKAQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIAD
          :.  :.:  :.:.....::.:.::: :.: ...::: . ::   :. : . :. ::.
CCDS92 PTPGLTLGKKEDKLGIRGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIAS
       220       230       240       250       260       270       

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pF1KE6 VAISASEFMFEETRNYVKQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHEA
        :.. ..  .. . ::...: :::  ...::..: :::..   .  .: ..    .:.. 
CCDS92 QALGIAQTALDCAVNYAENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDN
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pF1KE6 KRLDSATACMAKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEI
       :.     : :::  :::  ...... .:. :: ::. :.:  . : :::.  :: ::.::
CCDS92 KKPFIKEAAMAKLAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEI
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       420       430  
pF1KE6 MKELIAREIVFDK  
       .. .::         
CCDS92 QRLVIAGHLLRSYRS
       400       410  

>>CCDS668.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1                   (421 aa)
 initn: 693 init1: 367 opt: 725  Z-score: 919.4  bits: 179.2 E(32554): 6.9e-45
Smith-Waterman score: 725; 32.4% identity (67.1% similar) in 386 aa overlap (47-430:35-418)

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pF1KE6 RAPRQLPAARCSHSGGEERLETPSAKKLTDIGIRRIFSPEHDIFRKSVRKFFQEEVIPHH
                                     .:.   :. ..  :. ..::: .::.::  
CCDS66 FGRCCRVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVA
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pF1KE6 SEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAIVWEEQAYSNCSGPGFSI
       .:..:.::    . ..: . ::....: :. ::.:   ..: .. :: ::. :.:   .:
CCDS66 AEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYG-CTGVQTAI
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pF1KE6 HSGIVMSY-ITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAGSDLQGIKTNAKKDGSDW
       ... . .. :   :...: :... .::    . :  .::::::::. ::::.:.: :...
CCDS66 EGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDEY
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pF1KE6 ILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAH-GISLFLVENGMKGFIKGRKLHKMGLK
       :.::.:..:.::. ..  ...: .. .  .::. ... :.::    :.  :::  .:: .
CCDS66 IINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQR
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pF1KE6 AQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADVAISASEFMFEETRNYV
        .::  . :::...:   .:  .. ::   :  . . : ..:  :.. ..  ..:. .:.
CCDS66 CSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATKYA
           250       260       270       280       290       300   

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pF1KE6 KQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHEAKRLDSATACMAKYWASE
        .::.::: ... :...  :::.  .. ..:   .      .. : ..  : .:: .:..
CCDS66 LERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAFAGD
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pF1KE6 LQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKELIAREIVFDK   
       . :..: : ::. :: :.  :::. : . ::..  :: ::..:.. ..::: . ::   
CCDS66 IANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHI-DKYKN
           370       380       390       400       410        420 

>>CCDS44165.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1                 (425 aa)
 initn: 693 init1: 367 opt: 725  Z-score: 919.3  bits: 179.2 E(32554): 6.9e-45
Smith-Waterman score: 725; 32.4% identity (67.1% similar) in 386 aa overlap (47-430:39-422)

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pF1KE6 RAPRQLPAARCSHSGGEERLETPSAKKLTDIGIRRIFSPEHDIFRKSVRKFFQEEVIPHH
                                     .:.   :. ..  :. ..::: .::.::  
CCDS44 CRCSLQVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVA
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pF1KE6 SEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAIVWEEQAYSNCSGPGFSI
       .:..:.::    . ..: . ::....: :. ::.:   ..: .. :: ::. :.:   .:
CCDS44 AEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYG-CTGVQTAI
       70        80        90       100       110        120       

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pF1KE6 HSGIVMSY-ITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAGSDLQGIKTNAKKDGSDW
       ... . .. :   :...: :... .::    . :  .::::::::. ::::.:.: :...
CCDS44 EGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDEY
       130       140       150       160       170       180       

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pF1KE6 ILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAH-GISLFLVENGMKGFIKGRKLHKMGLK
       :.::.:..:.::. ..  ...: .. .  .::. ... :.::    :.  :::  .:: .
CCDS44 IINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQR
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pF1KE6 AQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADVAISASEFMFEETRNYV
        .::  . :::...:   .:  .. ::   :  . . : ..:  :.. ..  ..:. .:.
CCDS44 CSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATKYA
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pF1KE6 KQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHEAKRLDSATACMAKYWASE
        .::.::: ... :...  :::.  .. ..:   .      .. : ..  : .:: .:..
CCDS44 LERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAFAGD
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pF1KE6 LQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKELIAREIVFDK   
       . :..: : ::. :: :.  :::. : . ::..  :: ::..:.. ..::: . ::   
CCDS44 IANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHI-DKYKN
       370       380       390       400       410       420      

>>CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1                 (385 aa)
 initn: 693 init1: 367 opt: 723  Z-score: 917.4  bits: 178.7 E(32554): 8.8e-45
Smith-Waterman score: 723; 32.6% identity (67.4% similar) in 380 aa overlap (53-430:5-382)

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pF1KE6 PAARCSHSGGEERLETPSAKKLTDIGIRRIFSPEHDIFRKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKA
                                     :. ..  :. ..::: .::.::  .:..:.
CCDS65                           MLQEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVAAEYDKT
                                         10        20        30    

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pF1KE6 GEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAIVWEEQAYSNCSGPGFSIHSGIVM
       ::    . ..: . ::....: :. ::.:   ..: .. :: ::. :.:   .:... . 
CCDS65 GEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYG-CTGVQTAIEGNSLG
           40        50        60        70         80        90   

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pF1KE6 SY-ITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAGSDLQGIKTNAKKDGSDWILNGSK
       .. :   :...: :... .::    . :  .::::::::. ::::.:.: :...:.::.:
CCDS65 QMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDEYIINGQK
           100       110       120       130       140       150   

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pF1KE6 VFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAH-GISLFLVENGMKGFIKGRKLHKMGLKAQDTAE
       ..:.::. ..  ...: .. .  .::. ... :.::    :.  :::  .:: . .::  
CCDS65 MWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQRCSDTRG
           160       170       180       190       200       210   

              270       280       290       300       310       320
pF1KE6 LFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADVAISASEFMFEETRNYVKQRKAF
       . :::...:   .:  .. ::   :  . . : ..:  :.. ..  ..:. .:. .::.:
CCDS65 IVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATKYALERKTF
           220       230       240       250       260       270   

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pF1KE6 GKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHEAKRLDSATACMAKYWASELQNSVA
       :: ... :...  :::.  .. ..:   .      .. : ..  : .:: .:... :..:
CCDS65 GKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAFAGDIANQLA
           280       290       300       310       320       330   

              390       400       410       420       430   
pF1KE6 YDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKELIAREIVFDK   
        : ::. :: :.  :::. : . ::..  :: ::..:.. ..::: . ::   
CCDS65 TDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHI-DKYKN
           340       350       360       370       380      

>>CCDS8498.1 ACAD8 gene_id:27034|Hs108|chr11              (415 aa)
 initn: 663 init1: 293 opt: 689  Z-score: 873.8  bits: 170.7 E(32554): 2.4e-42
Smith-Waterman score: 689; 32.5% identity (65.0% similar) in 400 aa overlap (31-427:18-413)

               10        20        30        40         50         
pF1KE6 MAARLLRGSLRVLGGHRAPRQLPAARCSHSGGEERLETPSAKKLTD-IGIRRIFSPEHDI
                                     :: . :   . ..::. :     .. :.  
CCDS84              MLWSGCRRFGARLGCLPGGLRVLVQTGHRSLTSCIDPSMGLNEEQKE
                            10        20        30        40       

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE6 FRKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAI
       :.: .  :  .:. :. .::..      .: .::.. :. :: :   .:: : .  ....
CCDS84 FQKVAFDFAAREMAPNMAEWDQKELFPVDVMRKAAQLGFGGVYIQTDVGGSGLSRLDTSV
        50        60        70        80        90       100       

     120       130        140       150       160       170        
pF1KE6 VWEEQAYSNCSGPGF-SIHSGIVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAG
       ..:  : .  :  .. :::. .   .: . :.::: ..: : . . . ...  .::::.:
CCDS84 IFEALATGCTSTTAYISIHN-MCAWMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSG
       110       120        130       140       150       160      

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE6 SDLQGIKTNAKKDGSDWILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAHGISLFLVENG
       ::  .. :.:::.:. .::::::.:::... ::. .:.  :.  .:.: .::: ..::.:
CCDS84 SDAASLLTSAKKQGDHYILNGSKAFISGAGESDIYVVMCRTG--GPGP-KGISCIVVEKG
        170       180       190       200         210        220   

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pF1KE6 MKGFIKGRKLHKMGLKAQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADV
         :.  :.: .:.: ..: :  ..:::  .:..  .: :..::   .. :   :. ::. 
CCDS84 TPGLSFGKKEKKVGWNSQPTRAVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAVRGLNGGRINIASC
           230       240       250       260       270       280   

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pF1KE6 AISASEFMFEETRNYVKQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHEAK
       ...:..     ::.... :: ::. .:  : .:  ::.. :.. ..: .: :     . .
CCDS84 SLGAAHASVILTRDHLNVRKQFGEPLASNQYLQFTLADMATRLVAARLMVRNAAVALQEE
           290       300       310       320       330       340   

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pF1KE6 RLDSATAC-MAKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEI
       : :... : ::: .:..   ..  . .:.:::.::. .: . .   :.::. :  :.::.
CCDS84 RKDAVALCSMAKLFATDECFAICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEV
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       420       430
pF1KE6 MKELIAREIVFDK
       :. ::.: ..   
CCDS84 MRILISRSLLQE 
           410      

>>CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10               (330 aa)
 initn: 575 init1: 407 opt: 645  Z-score: 819.5  bits: 160.3 E(32554): 2.5e-39
Smith-Waterman score: 645; 33.7% identity (66.6% similar) in 329 aa overlap (99-426:1-326)

       70        80        90       100       110       120        
pF1KE6 QEEVIPHHSEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAIVWEEQAYSN
                                     .:...  . :: :... :...: :: :  .
CCDS81                               MGIEVDPEYGGTGASFLSTVLVIEELAKVD
                                             10        20        30

      130        140       150       160       170       180       
pF1KE6 CSGPGFS-IHSGIVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAGSDLQGIKTN
        :   :  :.. .. . : .::.:::   ..::.:. : .:.. ..: :::::  ..:: 
CCDS81 ASVAVFCEIQNTLINTLIRKHGTEEQKATYLPQLTTEK-VGSFCLSEAGAGSDSFALKTR
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       190       200       210       220       230       240       
pF1KE6 AKKDGSDWILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAHGISLFLVENGMKGFIKGRK
       : :.:. ..:::::..::..  . . .:.:  : .     .::. :::.    :.  :. 
CCDS81 ADKEGDYYVLNGSKMWISSAEHAGLFLVMA--NVDPTIGYKGITSFLVDRDTPGLHIGKP
      90       100       110         120       130       140       

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pF1KE6 LHKMGLKAQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADVAISASEFMF
        .:.::.:..:  : ::....: . .::. ..:. : .  : . :. ::   .. ..  :
CCDS81 ENKLGLRASSTCPLTFENVKVPEANILGQIGHGYKYAIGSLNEGRIGIAAQMLGLAQGCF
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pF1KE6 EETRNYVKQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHEAKRLDSATACM
       . :  :.:.:  ::: .  .: .::..:.. :.. ..: .. :  .: :: .     : :
CCDS81 DYTIPYIKERIQFGKRLFDFQGLQHQVAHVATQLEAARLLTYNAARLLEAGKPFIKEASM
       210       220       230       240       250       260       

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       :::.:::. ....  :..  :: ::  .::. : . ::..  :: :...:. . ::..: 
CCDS81 AKYYASEIAGQTTSKCIEWMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKIGTIYEGASNIQLNTIAKHID
       270       280       290       300       310       320       

       430
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       330




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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