FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6326, 430 aa 1>>>pF1KE6326 430 - 430 aa - 430 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4643+/-0.000962; mu= 16.1082+/- 0.058 mean_var=62.0175+/-12.264, 0's: 0 Z-trim(104.3): 27 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.162861 statistics sampled from 7784 (7809) to 7784 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16 Scan time: 1.990 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2389.1 ACADL gene_id:33|Hs108|chr2 ( 430) 2867 682.4 2.2e-196 CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 ( 426) 814 200.1 3.5e-51 CCDS53930.1 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 ( 396) 756 186.4 4.2e-47 CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 ( 432) 744 183.6 3.2e-46 CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 ( 412) 735 181.5 1.3e-45 CCDS668.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 421) 725 179.2 6.9e-45 CCDS44165.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 425) 725 179.2 6.9e-45 CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 385) 723 178.7 8.8e-45 CCDS8498.1 ACAD8 gene_id:27034|Hs108|chr11 ( 415) 689 170.7 2.4e-42 CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 ( 330) 645 160.3 2.5e-39 CCDS72807.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 454) 625 155.7 8.7e-38 CCDS76610.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 ( 408) 588 147.0 3.3e-35 CCDS3053.1 ACAD9 gene_id:28976|Hs108|chr3 ( 621) 575 144.0 4e-34 CCDS42249.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 633) 565 141.6 2.1e-33 CCDS11090.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 655) 565 141.6 2.1e-33 CCDS58509.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 678) 565 141.6 2.2e-33 CCDS12286.1 GCDH gene_id:2639|Hs108|chr19 ( 438) 451 114.8 1.7e-25 CCDS31903.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12 (1059) 301 79.7 1.5e-14 CCDS44973.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12 (1090) 301 79.7 1.6e-14 CCDS3074.1 ACAD11 gene_id:84129|Hs108|chr3 ( 780) 284 75.6 1.9e-13 >>CCDS2389.1 ACADL gene_id:33|Hs108|chr2 (430 aa) initn: 2867 init1: 2867 opt: 2867 Z-score: 3639.2 bits: 682.4 E(32554): 2.2e-196 Smith-Waterman score: 2867; 100.0% identity (100.0% similar) in 430 aa overlap (1-430:1-430) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MAARLLRGSLRVLGGHRAPRQLPAARCSHSGGEERLETPSAKKLTDIGIRRIFSPEHDIF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS23 MAARLLRGSLRVLGGHRAPRQLPAARCSHSGGEERLETPSAKKLTDIGIRRIFSPEHDIF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 RKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAIV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS23 RKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAIV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 WEEQAYSNCSGPGFSIHSGIVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAGSD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS23 WEEQAYSNCSGPGFSIHSGIVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAGSD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 LQGIKTNAKKDGSDWILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAHGISLFLVENGMK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS23 LQGIKTNAKKDGSDWILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAHGISLFLVENGMK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 GFIKGRKLHKMGLKAQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADVAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS23 GFIKGRKLHKMGLKAQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADVAI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 SASEFMFEETRNYVKQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHEAKRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS23 SASEFMFEETRNYVKQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHEAKRL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 DSATACMAKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS23 DSATACMAKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKE 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 LIAREIVFDK :::::::::: CCDS23 LIAREIVFDK 430 >>CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 (426 aa) initn: 787 init1: 680 opt: 814 Z-score: 1032.3 bits: 200.1 E(32554): 3.5e-51 Smith-Waterman score: 814; 34.9% identity (69.5% similar) in 384 aa overlap (53-429:45-424) 30 40 50 60 70 80 pF1KE6 PAARCSHSGGEERLETPSAKKLTDIGIRRIFSPEHDIFRKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKA .: :. .:... ::.::.. :. .: ... CCDS10 VASWRLRPPLAGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQLRQTMAKFLQEHLAPKAQEIDRS 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 pF1KE6 GEVS--REVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAIVWEEQAY-SNCSGPGFSIHSG .: . :: :.. :. :.::.. . :: : ..: :: . :. : ... ::. CCDS10 NEFKNLREFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISRASGAVGLSYGAHSN 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 pF1KE6 IVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAGSDLQGIKTNAKKDGSDWILNG . .. .. .:.: : ....:.. .:. :::.::.::.::::. ..: .:.: :. .:::: CCDS10 LCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMKLKAEKKGNHYILNG 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 pF1KE6 SKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAHGISLFLVENGMKGFIKGRKLHKMGLKAQDTA .: .:.:: .::.:: : :. : ..::. :.::.:: :: ..:: :.:.....: CCDS10 NKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPASRGITAFIVEKGMPGFSTSKKLDKLGMRGSNTC 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 ELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADVAISASEFMFEETRNYVKQRKA ::.::: ..::. .::.:::: : .:. : :::..: .. . ....: :.. :.: CCDS10 ELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLHVREA 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 FGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDN----CLQLHEAKRLDSATACMAKYWASEL ::. ..:.: .: :.:.. :.. . : .: : : . : . . : : . . ...: CCDS10 FGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTAK-DCAGVIL---YSAEC 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 QNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKELIAREIVFDK ..:: : .: :: ::. ..:... ::.. : .::.:. . .:.: . : CCDS10 ATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH 380 390 400 410 420 >>CCDS53930.1 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 (396 aa) initn: 746 init1: 680 opt: 756 Z-score: 959.2 bits: 186.4 E(32554): 4.2e-47 Smith-Waterman score: 756; 35.3% identity (68.9% similar) in 351 aa overlap (84-429:48-394) 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 SPEHDIFRKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGD : .: :.. :. :.::.. . :: : CCDS53 WRLRPPLAGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQEFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLG 20 30 40 50 60 70 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 LYSAAIVWEEQAY-SNCSGPGFSIHSGIVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAM ..: :: . :. : ... ::.. .. .. .:.: : ....:.. .:. :::.:: CCDS53 YLEHVLVMEEISRASGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAM 80 90 100 110 120 130 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 TEPGAGSDLQGIKTNAKKDGSDWILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAHGISL .::.::::. ..: .:.: :. .::::.: .:.:: .::.:: : :. : ..::. CCDS53 SEPNAGSDVVSMKLKAEKKGNHYILNGNKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPASRGITA 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 FLVENGMKGFIKGRKLHKMGLKAQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQER :.::.:: :: ..:: :.:.....: ::.::: ..::. .::.:::: : .:. : :: CCDS53 FIVEKGMPGFSTSKKLDKLGMRGSNTCELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLER 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 LLIADVAISASEFMFEETRNYVKQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDN-- :..: .. . ....: :.. :.:::. ..:.: .: :.:.. :.. . : .: : CCDS53 LVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVA 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 pF1KE6 --CLQLHEAKRLDSATACMAKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQ : . : . . : : . . ...: ..:: : .: :: ::. ..:... ::.. CCDS53 KACDEGHCTAK-DCAGVIL---YSAECATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLY 320 330 340 350 360 370 410 420 430 pF1KE6 PIYGGTNEIMKELIAREIVFDK : .::.:. . .:.: . : CCDS53 EIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH 380 390 >>CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 (432 aa) initn: 733 init1: 407 opt: 744 Z-score: 943.3 bits: 183.6 E(32554): 3.2e-46 Smith-Waterman score: 744; 32.3% identity (64.9% similar) in 436 aa overlap (1-426:4-428) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MAARLLRGSLRVLGGHR----APRQLPAARCSHSGGEERLETPSAKKLTDIGIR--- .:.:::::: :.: . . ..: . : .: :. .:. ::. CCDS76 MEGLAVRLLRGS-RLLRRNFLTCLSSWKIPPHVSKSSQSEALLN------ITNNGIHFAP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 -RIFSPEHDIFRKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGG . :. :. ....::.:: ::.. : : .. ... . : . .:::.:... . :: CCDS76 LQTFTDEEMMIKSSVKKFAQEQIAPLVSTMDENSKMEKSVIQGLFQQGLMGIEVDPEYGG 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 IGGDLYSAAIVWEEQAYSNCSGPGFS-IHSGIVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIG :... :...: :: : . : : :.. .. . : .::.::: ..::.:. : .: CCDS76 TGASFLSTVLVIEELAKVDASVAVFCEIQNTLINTLIRKHGTEEQKATYLPQLTTEK-VG 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 AIAMTEPGAGSDLQGIKTNAKKDGSDWILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAH .. ..: ::::: ..:: : :.:. ..:::::..::.. . . .:.: .. :. .. CCDS76 SFCLSEAGAGSDSFALKTRADKEGDYYVLNGSKMWISSAEHAGLFLVMANVD---PTIGY 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 -GISLFLVENGMKGFIKGRKLHKMGLKAQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKE ::. :::. :. :. .:.::.:..: : ::....: . .::. ..:. : . CCDS76 KGITSFLVDRDTPGLHIGKPENKLGLRASSTCPLTFENVKVPEANILGQIGHGYKYAIGS 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 LPQERLLIADVAISASEFMFEETRNYVKQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAF : . :. :: .. .. :. : :.:.: ::: . .: .::..:.. :.. ..: . CCDS76 LNEGRIGIAAQMLGLAQGCFDYTIPYIKERIQFGKRLFDFQGLQHQVAHVATQLEAARLL 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 VDNCLQLHEAKRLDSATACMAKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARV . : .: :: . : ::::.:::. .... :.. :: :: .::. : . ::.. CCDS76 TYNAARLLEAGKPFIKEASMAKYYASEIAGQTTSKCIEWMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKI 350 360 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 QPIYGGTNEIMKELIAREIVFDK :: :...:. . ::..: CCDS76 GTIYEGASNIQLNTIAKHIDAEY 410 420 430 >>CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 (412 aa) initn: 659 init1: 415 opt: 735 Z-score: 932.2 bits: 181.5 E(32554): 1.3e-45 Smith-Waterman score: 735; 33.0% identity (65.2% similar) in 397 aa overlap (30-423:10-403) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MAARLLRGSLRVLGGHRAPRQLPAARCSHSGGEERLETPSAKKLTDIGIRRIFSPE-HDI :: .: : : . . . :: :.. CCDS92 MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQSVELPETHQM 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 FRKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAI . .. : : ..:..: .. .: .: : :::.... :.::: : : . :: CCDS92 LLQTCRDFAEKELFPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAI 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 VWEEQAYSNCSGPG--FSIHSGIVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGA . :: . . :.. : .:..... .. : . ::.:: . .. .:.: :: .:..::: CCDS92 AMEEISRG-CASTGVIMSVNNSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGN 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 GSDLQGIKTNAKKDGSDWILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAHGISLFLVEN ::: . .:.:. .:..:.:::.:..:.:. .....: : :.. . .::: ::: CCDS92 GSDAGAASTTARAEGDSWVLNGTKAWITNAWEASAAVVFASTDRALQN--KGISAFLVPM 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 GMKGFIKGRKLHKMGLKAQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIAD :. :.: :.:.....::.:.::: :.: ...::: . :: :. : . :. ::. CCDS92 PTPGLTLGKKEDKLGIRGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIAS 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 VAISASEFMFEETRNYVKQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHEA :.. .. .. . ::...: ::: ...::..: :::.. . .: .. .:.. CCDS92 QALGIAQTALDCAVNYAENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDN 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 KRLDSATACMAKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEI :. : ::: ::: ...... .:. :: ::. :.: . : :::. :: ::.:: CCDS92 KKPFIKEAAMAKLAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEI 340 350 360 370 380 390 420 430 pF1KE6 MKELIAREIVFDK .. .:: CCDS92 QRLVIAGHLLRSYRS 400 410 >>CCDS668.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 (421 aa) initn: 693 init1: 367 opt: 725 Z-score: 919.4 bits: 179.2 E(32554): 6.9e-45 Smith-Waterman score: 725; 32.4% identity (67.1% similar) in 386 aa overlap (47-430:35-418) 20 30 40 50 60 70 pF1KE6 RAPRQLPAARCSHSGGEERLETPSAKKLTDIGIRRIFSPEHDIFRKSVRKFFQEEVIPHH .:. :. .. :. ..::: .::.:: CCDS66 FGRCCRVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVA 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KE6 SEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAIVWEEQAYSNCSGPGFSI .:..:.:: . ..: . ::....: :. ::.: ..: .. :: ::. :.: .: CCDS66 AEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYG-CTGVQTAI 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 190 pF1KE6 HSGIVMSY-ITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAGSDLQGIKTNAKKDGSDW ... . .. : :...: :... .:: . : .::::::::. ::::.:.: :... CCDS66 EGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDEY 130 140 150 160 170 180 200 210 220 230 240 250 pF1KE6 ILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAH-GISLFLVENGMKGFIKGRKLHKMGLK :.::.:..:.::. .. ...: .. . .::. ... :.:: :. ::: .:: . CCDS66 IINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQR 190 200 210 220 230 240 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 AQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADVAISASEFMFEETRNYV .:: . :::...: .: .. :: : . . : ..: :.. .. ..:. .:. CCDS66 CSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATKYA 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 KQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHEAKRLDSATACMAKYWASE .::.::: ... :... :::. .. ..: . .. : .. : .:: .:.. CCDS66 LERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAFAGD 310 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 LQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKELIAREIVFDK . :..: : ::. :: :. :::. : . ::.. :: ::..:.. ..::: . :: CCDS66 IANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHI-DKYKN 370 380 390 400 410 420 >>CCDS44165.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 (425 aa) initn: 693 init1: 367 opt: 725 Z-score: 919.3 bits: 179.2 E(32554): 6.9e-45 Smith-Waterman score: 725; 32.4% identity (67.1% similar) in 386 aa overlap (47-430:39-422) 20 30 40 50 60 70 pF1KE6 RAPRQLPAARCSHSGGEERLETPSAKKLTDIGIRRIFSPEHDIFRKSVRKFFQEEVIPHH .:. :. .. :. ..::: .::.:: CCDS44 CRCSLQVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVA 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KE6 SEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAIVWEEQAYSNCSGPGFSI .:..:.:: . ..: . ::....: :. ::.: ..: .. :: ::. :.: .: CCDS44 AEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYG-CTGVQTAI 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 190 pF1KE6 HSGIVMSY-ITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAGSDLQGIKTNAKKDGSDW ... . .. : :...: :... .:: . : .::::::::. ::::.:.: :... CCDS44 EGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDEY 130 140 150 160 170 180 200 210 220 230 240 250 pF1KE6 ILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAH-GISLFLVENGMKGFIKGRKLHKMGLK :.::.:..:.::. .. ...: .. . .::. ... :.:: :. ::: .:: . CCDS44 IINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQR 190 200 210 220 230 240 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 AQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADVAISASEFMFEETRNYV .:: . :::...: .: .. :: : . . : ..: :.. .. ..:. .:. CCDS44 CSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATKYA 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 KQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHEAKRLDSATACMAKYWASE .::.::: ... :... :::. .. ..: . .. : .. : .:: .:.. CCDS44 LERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAFAGD 310 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 LQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKELIAREIVFDK . :..: : ::. :: :. :::. : . ::.. :: ::..:.. ..::: . :: CCDS44 IANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHI-DKYKN 370 380 390 400 410 420 >>CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 (385 aa) initn: 693 init1: 367 opt: 723 Z-score: 917.4 bits: 178.7 E(32554): 8.8e-45 Smith-Waterman score: 723; 32.6% identity (67.4% similar) in 380 aa overlap (53-430:5-382) 30 40 50 60 70 80 pF1KE6 PAARCSHSGGEERLETPSAKKLTDIGIRRIFSPEHDIFRKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKA :. .. :. ..::: .::.:: .:..:. CCDS65 MLQEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVAAEYDKT 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 GEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAIVWEEQAYSNCSGPGFSIHSGIVM :: . ..: . ::....: :. ::.: ..: .. :: ::. :.: .:... . CCDS65 GEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYG-CTGVQTAIEGNSLG 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 SY-ITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAGSDLQGIKTNAKKDGSDWILNGSK .. : :...: :... .:: . : .::::::::. ::::.:.: :...:.::.: CCDS65 QMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDEYIINGQK 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 VFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAH-GISLFLVENGMKGFIKGRKLHKMGLKAQDTAE ..:.::. .. ...: .. . .::. ... :.:: :. ::: .:: . .:: CCDS65 MWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQRCSDTRG 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 LFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADVAISASEFMFEETRNYVKQRKAF . :::...: .: .. :: : . . : ..: :.. .. ..:. .:. .::.: CCDS65 IVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATKYALERKTF 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 GKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHEAKRLDSATACMAKYWASELQNSVA :: ... :... :::. .. ..: . .. : .. : .:: .:... :..: CCDS65 GKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAFAGDIANQLA 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 pF1KE6 YDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKELIAREIVFDK : ::. :: :. :::. : . ::.. :: ::..:.. ..::: . :: CCDS65 TDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHI-DKYKN 340 350 360 370 380 >>CCDS8498.1 ACAD8 gene_id:27034|Hs108|chr11 (415 aa) initn: 663 init1: 293 opt: 689 Z-score: 873.8 bits: 170.7 E(32554): 2.4e-42 Smith-Waterman score: 689; 32.5% identity (65.0% similar) in 400 aa overlap (31-427:18-413) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MAARLLRGSLRVLGGHRAPRQLPAARCSHSGGEERLETPSAKKLTD-IGIRRIFSPEHDI :: . : . ..::. : .. :. CCDS84 MLWSGCRRFGARLGCLPGGLRVLVQTGHRSLTSCIDPSMGLNEEQKE 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 FRKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAI :.: . : .:. :. .::.. .: .::.. :. :: : .:: : . .... CCDS84 FQKVAFDFAAREMAPNMAEWDQKELFPVDVMRKAAQLGFGGVYIQTDVGGSGLSRLDTSV 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 VWEEQAYSNCSGPGF-SIHSGIVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAG ..: : . : .. :::. . .: . :.::: ..: : . . . ... .::::.: CCDS84 IFEALATGCTSTTAYISIHN-MCAWMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSG 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 SDLQGIKTNAKKDGSDWILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAHGISLFLVENG :: .. :.:::.:. .::::::.:::... ::. .:. :. .:.: .::: ..::.: CCDS84 SDAASLLTSAKKQGDHYILNGSKAFISGAGESDIYVVMCRTG--GPGP-KGISCIVVEKG 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 MKGFIKGRKLHKMGLKAQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADV :. :.: .:.: ..: : ..::: .:.. .: :..:: .. : :. ::. CCDS84 TPGLSFGKKEKKVGWNSQPTRAVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAVRGLNGGRINIASC 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 AISASEFMFEETRNYVKQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHEAK ...:.. ::.... :: ::. .: : .: ::.. :.. ..: .: : . . CCDS84 SLGAAHASVILTRDHLNVRKQFGEPLASNQYLQFTLADMATRLVAARLMVRNAAVALQEE 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 RLDSATAC-MAKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEI : :... : ::: .:.. .. . .:.:::.::. .: . . :.::. : :.::. CCDS84 RKDAVALCSMAKLFATDECFAICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEV 350 360 370 380 390 400 420 430 pF1KE6 MKELIAREIVFDK :. ::.: .. CCDS84 MRILISRSLLQE 410 >>CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 (330 aa) initn: 575 init1: 407 opt: 645 Z-score: 819.5 bits: 160.3 E(32554): 2.5e-39 Smith-Waterman score: 645; 33.7% identity (66.6% similar) in 329 aa overlap (99-426:1-326) 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 QEEVIPHHSEWEKAGEVSREVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIGGDLYSAAIVWEEQAYSN .:... . :: :... :...: :: : . CCDS81 MGIEVDPEYGGTGASFLSTVLVIEELAKVD 10 20 30 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 CSGPGFS-IHSGIVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAGSDLQGIKTN : : :.. .. . : .::.::: ..::.:. : .:.. ..: ::::: ..:: CCDS81 ASVAVFCEIQNTLINTLIRKHGTEEQKATYLPQLTTEK-VGSFCLSEAGAGSDSFALKTR 40 50 60 70 80 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 AKKDGSDWILNGSKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAHGISLFLVENGMKGFIKGRK : :.:. ..:::::..::.. . . .:.: : . .::. :::. :. :. CCDS81 ADKEGDYYVLNGSKMWISSAEHAGLFLVMA--NVDPTIGYKGITSFLVDRDTPGLHIGKP 90 100 110 120 130 140 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 LHKMGLKAQDTAELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADVAISASEFMF .:.::.:..: : ::....: . .::. ..:. : . : . :. :: .. .. : CCDS81 ENKLGLRASSTCPLTFENVKVPEANILGQIGHGYKYAIGSLNEGRIGIAAQMLGLAQGCF 150 160 170 180 190 200 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 EETRNYVKQRKAFGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDNCLQLHEAKRLDSATACM . : :.:.: ::: . .: .::..:.. :.. ..: .. : .: :: . : : CCDS81 DYTIPYIKERIQFGKRLFDFQGLQHQVAHVATQLEAARLLTYNAARLLEAGKPFIKEASM 210 220 230 240 250 260 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 AKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKELIAREIV :::.:::. .... :.. :: :: .::. : . ::.. :: :...:. . ::..: CCDS81 AKYYASEIAGQTTSKCIEWMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKIGTIYEGASNIQLNTIAKHID 270 280 290 300 310 320 430 pF1KE6 FDK CCDS81 AEY 330 430 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 12:07:57 2016 done: Tue Nov 8 12:07:58 2016 Total Scan time: 1.990 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]