Result of FASTA (omim) for
pFN21AE0991
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0991, 626 aa
1>>>pF1KE0991 626 - 626 aa - 626 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.5384+/-0.000424; mu= -22.3606+/- 0.026
mean_var=737.5543+/-157.721, 0's: 0 Z-trim(125.2): 840 B-trim: 0 in 0/61
Lambda= 0.047226
statistics sampled from 46988 (48314) to 46988 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.82), E-opt: 0.2 (0.566), width: 16
Scan time: 13.180
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006276 (OMIM: 601782) dual specificity testis-s ( 626) 4426 316.9 1.3e-85
NP_001305159 (OMIM: 601782) dual specificity testi ( 466) 3001 219.7 1.8e-56
XP_011538799 (OMIM: 604746) PREDICTED: dual specif ( 571) 1336 106.4 2.9e-22
NP_009101 (OMIM: 604746) dual specificity testis-s ( 571) 1336 106.4 2.9e-22
XP_006710350 (OMIM: 604746) PREDICTED: dual specif ( 571) 1336 106.4 2.9e-22
XP_011538802 (OMIM: 604746) PREDICTED: dual specif ( 301) 1265 101.2 5.4e-21
NP_001307729 (OMIM: 604746) dual specificity testi ( 488) 1097 90.0 2.1e-17
NP_001191355 (OMIM: 601329) LIM domain kinase 1 is ( 613) 661 60.4 2.1e-08
NP_002305 (OMIM: 601329) LIM domain kinase 1 isofo ( 647) 661 60.4 2.2e-08
XP_016855536 (OMIM: 604746) PREDICTED: dual specif ( 522) 513 50.2 2.1e-05
XP_005270412 (OMIM: 604746) PREDICTED: dual specif ( 522) 513 50.2 2.1e-05
XP_016855538 (OMIM: 604746) PREDICTED: dual specif ( 363) 486 48.2 5.8e-05
XP_016855537 (OMIM: 604746) PREDICTED: dual specif ( 363) 486 48.2 5.8e-05
XP_016876283 (OMIM: 604984) PREDICTED: serine/thre ( 517) 424 44.2 0.0014
NP_002410 (OMIM: 600050) mitogen-activated protein ( 847) 427 44.6 0.0017
NP_057952 (OMIM: 601988) LIM domain kinase 2 isofo ( 617) 413 43.5 0.0026
NP_005560 (OMIM: 601988) LIM domain kinase 2 isofo ( 638) 413 43.5 0.0027
XP_005267740 (OMIM: 600136) PREDICTED: mitogen-act (1081) 406 43.3 0.0054
NP_057062 (OMIM: 613932,616117) serine/threonine-p ( 835) 402 42.9 0.0054
NP_001271159 (OMIM: 600136) mitogen-activated prot (1104) 406 43.3 0.0055
NP_149132 (OMIM: 600136) mitogen-activated protein (1118) 406 43.3 0.0055
XP_011535090 (OMIM: 600136) PREDICTED: mitogen-act (1166) 406 43.3 0.0057
NP_001026971 (OMIM: 601988) LIM domain kinase 2 is ( 686) 397 42.5 0.006
XP_011508798 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 334) 386 41.4 0.0062
XP_011533958 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 392) 388 41.6 0.0063
XP_016858657 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 365) 386 41.4 0.0066
XP_016858658 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 365) 386 41.4 0.0066
XP_011524706 (OMIM: 601983) PREDICTED: mitogen-act ( 861) 396 42.5 0.0074
XP_011524705 (OMIM: 601983) PREDICTED: mitogen-act ( 873) 396 42.5 0.0074
XP_016866134 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 388 41.7 0.0075
XP_011533956 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 388 41.7 0.0075
XP_011533955 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 388 41.7 0.0075
XP_005266937 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 388 41.7 0.0075
NP_002022 (OMIM: 606573) tyrosine-protein kinase F ( 505) 388 41.7 0.0075
XP_005266938 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 388 41.7 0.0075
XP_005266939 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 388 41.7 0.0075
XP_011533957 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 388 41.7 0.0075
XP_005269197 (OMIM: 600447) PREDICTED: mitogen-act ( 453) 385 41.5 0.008
NP_002437 (OMIM: 600137) mitogen-activated protein ( 954) 395 42.5 0.0083
XP_011508795 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 376) 379 41.0 0.0093
XP_011537101 (OMIM: 603168) PREDICTED: serine/thre (1044) 393 42.4 0.0097
>>NP_006276 (OMIM: 601782) dual specificity testis-speci (626 aa)
initn: 4426 init1: 4426 opt: 4426 Z-score: 1657.9 bits: 316.9 E(85289): 1.3e-85
Smith-Waterman score: 4426; 100.0% identity (100.0% similar) in 626 aa overlap (1-626:1-626)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAGERPPLRGPGPGPGEVPGEGPPGPGGTGGGPGRGRPSSYRALRSAVSSLARVDDFHCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MAGERPPLRGPGPGPGEVPGEGPPGPGGTGGGPGRGRPSSYRALRSAVSSLARVDDFHCA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 EKIGAGFFSEVYKVRHRQSGQVMVLKMNKLPSNRGNTLREVQLMNRLRHPNILRFMGVCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EKIGAGFFSEVYKVRHRQSGQVMVLKMNKLPSNRGNTLREVQLMNRLRHPNILRFMGVCV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HQGQLHALTEYMNGGTLEQLLSSPEPLSWPVRLHLALDIARGLRYLHSKGVFHRDLTSKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 HQGQLHALTEYMNGGTLEQLLSSPEPLSWPVRLHLALDIARGLRYLHSKGVFHRDLTSKN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 CLVRREDRGFTAVVGDFGLAEKIPVYREGARKEPLAVVGSPYWMAPEVLRGELYDEKADV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 CLVRREDRGFTAVVGDFGLAEKIPVYREGARKEPLAVVGSPYWMAPEVLRGELYDEKADV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 FAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAFRTLVGDDCPLPFLLLAIHCCNLEPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 FAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAFRTLVGDDCPLPFLLLAIHCCNLEPST
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 RAPFTEITQHLEWILEQLPEPAPLTRTALTHNQGSVARGGPSATLPRPDPRLSRSRSDLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RAPFTEITQHLEWILEQLPEPAPLTRTALTHNQGSVARGGPSATLPRPDPRLSRSRSDLF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 LPPSPESPPNWGDNLTRVNPFSLREDLRGGKIKLLDTPSKPVLPLVPPSPFPSTQLPLVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LPPSPESPPNWGDNLTRVNPFSLREDLRGGKIKLLDTPSKPVLPLVPPSPFPSTQLPLVT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 TPETLVQPGTPARRCRSLPSSPELPRRMETALPGPGPPAVGPSAEEKMECEGSSPEPEPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TPETLVQPGTPARRCRSLPSSPELPRRMETALPGPGPPAVGPSAEEKMECEGSSPEPEPP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 GPAPQLPLAVATDNFISTCSSASQPWSPRSGPVLNNNPPAVVVNSPQGWAGEPWNRAQHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GPAPQLPLAVATDNFISTCSSASQPWSPRSGPVLNNNPPAVVVNSPQGWAGEPWNRAQHS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LPRAAALERTEPSPPPSAPREPDEGLPCPGCCLGPFSFGFLSMCPRPTPAVARYRNLNCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LPRAAALERTEPSPPPSAPREPDEGLPCPGCCLGPFSFGFLSMCPRPTPAVARYRNLNCE
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KE0 AGSLLCHRGHHAKPPTPSLQLPGARS
::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AGSLLCHRGHHAKPPTPSLQLPGARS
610 620
>>NP_001305159 (OMIM: 601782) dual specificity testis-sp (466 aa)
initn: 3001 init1: 3001 opt: 3001 Z-score: 1134.8 bits: 219.7 E(85289): 1.8e-56
Smith-Waterman score: 3001; 100.0% identity (100.0% similar) in 420 aa overlap (207-626:47-466)
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 TSKNCLVRREDRGFTAVVGDFGLAEKIPVYREGARKEPLAVVGSPYWMAPEVLRGELYDE
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GRSGSTWPWTLPEACGTCTPKVYFTATSHPREGARKEPLAVVGSPYWMAPEVLRGELYDE
20 30 40 50 60 70
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 KADVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAFRTLVGDDCPLPFLLLAIHCCNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KADVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAFRTLVGDDCPLPFLLLAIHCCNL
80 90 100 110 120 130
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 EPSTRAPFTEITQHLEWILEQLPEPAPLTRTALTHNQGSVARGGPSATLPRPDPRLSRSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EPSTRAPFTEITQHLEWILEQLPEPAPLTRTALTHNQGSVARGGPSATLPRPDPRLSRSR
140 150 160 170 180 190
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 SDLFLPPSPESPPNWGDNLTRVNPFSLREDLRGGKIKLLDTPSKPVLPLVPPSPFPSTQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDLFLPPSPESPPNWGDNLTRVNPFSLREDLRGGKIKLLDTPSKPVLPLVPPSPFPSTQL
200 210 220 230 240 250
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 PLVTTPETLVQPGTPARRCRSLPSSPELPRRMETALPGPGPPAVGPSAEEKMECEGSSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLVTTPETLVQPGTPARRCRSLPSSPELPRRMETALPGPGPPAVGPSAEEKMECEGSSPE
260 270 280 290 300 310
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 PEPPGPAPQLPLAVATDNFISTCSSASQPWSPRSGPVLNNNPPAVVVNSPQGWAGEPWNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PEPPGPAPQLPLAVATDNFISTCSSASQPWSPRSGPVLNNNPPAVVVNSPQGWAGEPWNR
320 330 340 350 360 370
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 AQHSLPRAAALERTEPSPPPSAPREPDEGLPCPGCCLGPFSFGFLSMCPRPTPAVARYRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AQHSLPRAAALERTEPSPPPSAPREPDEGLPCPGCCLGPFSFGFLSMCPRPTPAVARYRN
380 390 400 410 420 430
600 610 620
pF1KE0 LNCEAGSLLCHRGHHAKPPTPSLQLPGARS
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNCEAGSLLCHRGHHAKPPTPSLQLPGARS
440 450 460
>>XP_011538799 (OMIM: 604746) PREDICTED: dual specificit (571 aa)
initn: 1189 init1: 752 opt: 1336 Z-score: 520.6 bits: 106.4 E(85289): 2.9e-22
Smith-Waterman score: 1547; 54.2% identity (68.8% similar) in 509 aa overlap (25-500:25-516)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAGERPPLRGPGPGPGEVPGEGPPGPGGTGGGPGRGR--PSSYRALRSAVSSLARVDDFH
: :: :. :: ::::::: :: : :.:.:::
XP_011 MDRSKRNSIAGFPPRVERLEEFEGGGGGEGNVSQVGRVWPSSYRALISAFSRLTRLDDFT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 CAEKIGAGFFSEVYKVRHRQSGQVMVLKMNKLPSNRGNTLREVQLMNRLRHPNILRFMGV
: ::::.::::::.::::: :::::.:::: : :::.: :.:::::::: ::::::::::
XP_011 C-EKIGSGFFSEVFKVRHRASGQVMALKMNTLSSNRANMLKEVQLMNRLSHPNILRFMGV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 CVHQGQLHALTEYMNGGTLEQLLSSPEPLSWPVRLHLALDIARGLRYLHSKGVFHRDLTS
:::::::::::::.:.:.:::::.: : : ::..:: ::: :: ::: ::.:::::::
XP_011 CVHQGQLHALTEYINSGNLEQLLDSNLHLPWTVRVKLAYDIAVGLSYLHFKGIFHRDLTS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 KNCLVRREDRGFTAVVGDFGLAEKIPVYREGARKEPLAVVGSPYWMAPEVLRGELYDEKA
::::..:.. :..:::.::::::::: :..: :::::::.:::::::: : :.:::
XP_011 KNCLIKRDENGYSAVVADFGLAEKIPDVSMGSEK--LAVVGSPFWMAPEVLRDEPYNEKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAFRTLVGDDCPLPFLLLAIHCCNLEP
:::..::.:::.:::. ::::::::::.:::: ::. .::: :: :: :...:::..:
XP_011 DVFSYGIILCEIIARIQADPDYLPRTENFGLDYDAFQHMVGD-CPPDFLQLTFNCCNMDP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE0 STRAPFTEITQHLEWILEQLPEPA--------PLTRTALTHNQGSVARGGPSATLPR--P
. : :.:: . :: :: .: : : .: : . : .. . .:. :
XP_011 KLRPSFVEIGKTLEEILSRLQEEEQERDRKLQPTARGLLEKAPGVKRLSSLDDKIPHKSP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KE0 DPR----LSRSRSDLFL--PP------SPESPPNWGDNLT-RVNPFSLREDLRGGKIKLL
:: ::::.::.: :: .: : : : .::::: :.:: :::::..
XP_011 CPRRTIWLSRSQSDIFSRKPPRTVSVLDPYYRPRDGAARTPKVNPFSARQDLMGGKIKFF
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 DTPSKPVLPLVPP--SPFPSTQLPLVTTPETLVQPGTPARRCRSLPSSPELPRRMETALP
: ::: :. :: .: :.: .::. : :. : : :: ::::.:::. .. .
XP_011 DLPSKSVISLVFDLDAPGPGT-MPLADWQEPLA-P--PIRRWRSLPGSPEFLHQEACPFV
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KE0 G------PGPPAVGPSAEEKMECEGSSPEPEPPGPAPQLPLAVATDNFISTCSSASQPWS
: ::: : . ... :: : :: : : . . ::
XP_011 GREESLSDGPPPRLSSLKYRVK-------EIPPFRASALPAAQAHEAM--DCSILQEENG
480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 PRSGPVLNNNPPAVVVNSPQGWAGEPWNRAQHSLPRAAALERTEPSPPPSAPREPDEGLP
XP_011 FGSRPQGTSPCPAGASEEMEVEERPAGSTPATFSTSGIGLQTQGKQDG
530 540 550 560 570
>>NP_009101 (OMIM: 604746) dual specificity testis-speci (571 aa)
initn: 1189 init1: 752 opt: 1336 Z-score: 520.6 bits: 106.4 E(85289): 2.9e-22
Smith-Waterman score: 1547; 54.2% identity (68.8% similar) in 509 aa overlap (25-500:25-516)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAGERPPLRGPGPGPGEVPGEGPPGPGGTGGGPGRGR--PSSYRALRSAVSSLARVDDFH
: :: :. :: ::::::: :: : :.:.:::
NP_009 MDRSKRNSIAGFPPRVERLEEFEGGGGGEGNVSQVGRVWPSSYRALISAFSRLTRLDDFT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 CAEKIGAGFFSEVYKVRHRQSGQVMVLKMNKLPSNRGNTLREVQLMNRLRHPNILRFMGV
: ::::.::::::.::::: :::::.:::: : :::.: :.:::::::: ::::::::::
NP_009 C-EKIGSGFFSEVFKVRHRASGQVMALKMNTLSSNRANMLKEVQLMNRLSHPNILRFMGV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 CVHQGQLHALTEYMNGGTLEQLLSSPEPLSWPVRLHLALDIARGLRYLHSKGVFHRDLTS
:::::::::::::.:.:.:::::.: : : ::..:: ::: :: ::: ::.:::::::
NP_009 CVHQGQLHALTEYINSGNLEQLLDSNLHLPWTVRVKLAYDIAVGLSYLHFKGIFHRDLTS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 KNCLVRREDRGFTAVVGDFGLAEKIPVYREGARKEPLAVVGSPYWMAPEVLRGELYDEKA
::::..:.. :..:::.::::::::: :..: :::::::.:::::::: : :.:::
NP_009 KNCLIKRDENGYSAVVADFGLAEKIPDVSMGSEK--LAVVGSPFWMAPEVLRDEPYNEKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAFRTLVGDDCPLPFLLLAIHCCNLEP
:::..::.:::.:::. ::::::::::.:::: ::. .::: :: :: :...:::..:
NP_009 DVFSYGIILCEIIARIQADPDYLPRTENFGLDYDAFQHMVGD-CPPDFLQLTFNCCNMDP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE0 STRAPFTEITQHLEWILEQLPEPA--------PLTRTALTHNQGSVARGGPSATLPR--P
. : :.:: . :: :: .: : : .: : . : .. . .:. :
NP_009 KLRPSFVEIGKTLEEILSRLQEEEQERDRKLQPTARGLLEKAPGVKRLSSLDDKIPHKSP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KE0 DPR----LSRSRSDLFL--PP------SPESPPNWGDNLT-RVNPFSLREDLRGGKIKLL
:: ::::.::.: :: .: : : : .::::: :.:: :::::..
NP_009 CPRRTIWLSRSQSDIFSRKPPRTVSVLDPYYRPRDGAARTPKVNPFSARQDLMGGKIKFF
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 DTPSKPVLPLVPP--SPFPSTQLPLVTTPETLVQPGTPARRCRSLPSSPELPRRMETALP
: ::: :. :: .: :.: .::. : :. : : :: ::::.:::. .. .
NP_009 DLPSKSVISLVFDLDAPGPGT-MPLADWQEPLA-P--PIRRWRSLPGSPEFLHQEACPFV
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KE0 G------PGPPAVGPSAEEKMECEGSSPEPEPPGPAPQLPLAVATDNFISTCSSASQPWS
: ::: : . ... :: : :: : : . . ::
NP_009 GREESLSDGPPPRLSSLKYRVK-------EIPPFRASALPAAQAHEAM--DCSILQEENG
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530 540 550 560 570
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Smith-Waterman score: 1547; 54.2% identity (68.8% similar) in 509 aa overlap (25-500:25-516)
10 20 30 40 50
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: :: :. :: ::::::: :: : :.:.:::
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10 20 30 40 50 60
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: ::::.::::::.::::: :::::.:::: : :::.: :.:::::::: ::::::::::
XP_006 C-EKIGSGFFSEVFKVRHRASGQVMALKMNTLSSNRANMLKEVQLMNRLSHPNILRFMGV
70 80 90 100 110
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pF1KE0 CVHQGQLHALTEYMNGGTLEQLLSSPEPLSWPVRLHLALDIARGLRYLHSKGVFHRDLTS
:::::::::::::.:.:.:::::.: : : ::..:: ::: :: ::: ::.:::::::
XP_006 CVHQGQLHALTEYINSGNLEQLLDSNLHLPWTVRVKLAYDIAVGLSYLHFKGIFHRDLTS
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 KNCLVRREDRGFTAVVGDFGLAEKIPVYREGARKEPLAVVGSPYWMAPEVLRGELYDEKA
::::..:.. :..:::.::::::::: :..: :::::::.:::::::: : :.:::
XP_006 KNCLIKRDENGYSAVVADFGLAEKIPDVSMGSEK--LAVVGSPFWMAPEVLRDEPYNEKA
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 DVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAFRTLVGDDCPLPFLLLAIHCCNLEP
:::..::.:::.:::. ::::::::::.:::: ::. .::: :: :: :...:::..:
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240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 STRAPFTEITQHLEWILEQLPEPA--------PLTRTALTHNQGSVARGGPSATLPR--P
. : :.:: . :: :: .: : : .: : . : .. . .:. :
XP_006 KLRPSFVEIGKTLEEILSRLQEEEQERDRKLQPTARGLLEKAPGVKRLSSLDDKIPHKSP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KE0 DPR----LSRSRSDLFL--PP------SPESPPNWGDNLT-RVNPFSLREDLRGGKIKLL
:: ::::.::.: :: .: : : : .::::: :.:: :::::..
XP_006 CPRRTIWLSRSQSDIFSRKPPRTVSVLDPYYRPRDGAARTPKVNPFSARQDLMGGKIKFF
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pF1KE0 DTPSKPVLPLVPP--SPFPSTQLPLVTTPETLVQPGTPARRCRSLPSSPELPRRMETALP
: ::: :. :: .: :.: .::. : :. : : :: ::::.:::. .. .
XP_006 DLPSKSVISLVFDLDAPGPGT-MPLADWQEPLA-P--PIRRWRSLPGSPEFLHQEACPFV
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460 470 480 490 500
pF1KE0 G------PGPPAVGPSAEEKMECEGSSPEPEPPGPAPQLPLAVATDNFISTCSSASQPWS
: ::: : . ... :: : :: : : . . ::
XP_006 GREESLSDGPPPRLSSLKYRVK-------EIPPFRASALPAAQAHEAM--DCSILQEENG
480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 PRSGPVLNNNPPAVVVNSPQGWAGEPWNRAQHSLPRAAALERTEPSPPPSAPREPDEGLP
XP_006 FGSRPQGTSPCPAGASEEMEVEERPAGSTPATFSTSGIGLQTQGKQDG
530 540 550 560 570
>>XP_011538802 (OMIM: 604746) PREDICTED: dual specificit (301 aa)
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Smith-Waterman score: 1265; 70.3% identity (83.9% similar) in 273 aa overlap (25-295:25-293)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAGERPPLRGPGPGPGEVPGEGPPGPGGTGGGPGRGR--PSSYRALRSAVSSLARVDDFH
: :: :. :: ::::::: :: : :.:.:::
XP_011 MDRSKRNSIAGFPPRVERLEEFEGGGGGEGNVSQVGRVWPSSYRALISAFSRLTRLDDFT
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pF1KE0 CAEKIGAGFFSEVYKVRHRQSGQVMVLKMNKLPSNRGNTLREVQLMNRLRHPNILRFMGV
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XP_011 C-EKIGSGFFSEVFKVRHRASGQVMALKMNTLSSNRANMLKEVQLMNRLSHPNILRFMGV
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pF1KE0 CVHQGQLHALTEYMNGGTLEQLLSSPEPLSWPVRLHLALDIARGLRYLHSKGVFHRDLTS
:::::::::::::.:.:.:::::.: : : ::..:: ::: :: ::: ::.:::::::
XP_011 CVHQGQLHALTEYINSGNLEQLLDSNLHLPWTVRVKLAYDIAVGLSYLHFKGIFHRDLTS
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::::..:.. :..:::.::::::::: :..: :::::::.:::::::: : :.:::
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180 190 200 210 220 230
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:::..::.:::.:::. ::::::::::.:::: ::. .::: :: :: :...:::
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240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 STRAPFTEITQHLEWILEQLPEPAPLTRTALTHNQGSVARGGPSATLPRPDPRLSRSRSD
XP_011 RKHLG
300
>>NP_001307729 (OMIM: 604746) dual specificity testis-sp (488 aa)
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:::::::::::::::::::.:.:.:::::.: : : ::..:: ::: :: ::: ::.:
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pF1KE0 HRDLTSKNCLVRREDRGFTAVVGDFGLAEKIPVYREGARKEPLAVVGSPYWMAPEVLRGE
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pF1KE0 LYDEKADVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAFRTLVGDDCPLPFLLLAIH
:.::::::..::.:::.:::. ::::::::::.:::: ::. .::: :: :: :...
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pF1KE0 CCNLEPSTRAPFTEITQHLEWILEQLPEPA--------PLTRTALTHNQGSVARGGPSAT
:::..:. : :.:: . :: :: .: : : .: : . : .. .
NP_001 CCNMDPKLRPSFVEIGKTLEEILSRLQEEEQERDRKLQPTARGLLEKAPGVKRLSSLDDK
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pF1KE0 LPR--PDPR----LSRSRSDLFL--PP------SPESPPNWGDNLT-RVNPFSLREDLRG
.:. : :: ::::.::.: :: .: : : : .::::: :.:: :
NP_001 IPHKSPCPRRTIWLSRSQSDIFSRKPPRTVSVLDPYYRPRDGAARTPKVNPFSARQDLMG
270 280 290 300 310 320
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pF1KE0 GKIKLLDTPSKPVLPLVPP--SPFPSTQLPLVTTPETLVQPGTPARRCRSLPSSPELPRR
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NP_001 GKIKFFDLPSKSVISLVFDLDAPGPGT-MPLADWQEPLA-P--PIRRWRSLPGSPEFLHQ
330 340 350 360 370 380
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pF1KE0 METALPG------PGPPAVGPSAEEKMECEGSSPEPEPPGPAPQLPLAVATDNFISTCSS
. : ::: : . ... :: : :: : : . . ::
NP_001 EACPFVGREESLSDGPPPRLSSLKYRVK-------EIPPFRASALPAAQAHEAM--DCSI
390 400 410 420 430
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pF1KE0 ASQPWSPRSGPVLNNNPPAVVVNSPQGWAGEPWNRAQHSLPRAAALERTEPSPPPSAPRE
NP_001 LQEENGFGSRPQGTSPCPAGASEEMEVEERPAGSTPATFSTSGIGLQTQGKQDG
440 450 460 470 480
>>NP_001191355 (OMIM: 601329) LIM domain kinase 1 isofor (613 aa)
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10 20 30 40
pF1KE0 MAGERPPLRGPGPGPGEVPGEGPPGPGGTGGGPGR----GRPSSYRALRSAVS
:: :. :. .. :: : :..
NP_001 LSSPAYTPSGEAGSSARQKPVLRSCSIDRSPGAGSLGSPASQRKDLGRSESLRVV-CRPH
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NP_001 RIFRPSDLIHGEVLGKGCFGQAIKVTHRETGEVMVMKELIRFDEETQRTFLKEVKVMRCL
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pF1KE0 RHPNILRFMGVCVHQGQLHALTEYMNGGTLEQLLSSPEP-LSWPVRLHLALDIARGLRYL
.:::.:.:.:: .. .:. .:::..::::. ...: . : :. .: ::: :. ::
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pF1KE0 HSKGVFHRDLTSKNCLVRREDRGFTAVVGDFGLA----------EKIPVYREGARKEPLA
:: ...::::.:.::::: :... .::.::::: : . .. ::. .
NP_001 HSMNIIHRDLNSHNCLVR-ENKN--VVVADFGLARLMVDEKTQPEGLRSLKKPDRKKRYT
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pF1KE0 VVGSPYWMAPEVLRGELYDEKADVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAF-R
:::.:::::::.. :. ::::.:::.:::::::.:.:: ::::::::: ::::.: .:
NP_001 VVGNPYWMAPEMINGRSYDEKVDVFSFGIVLCEIIGRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLD
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pF1KE0 TLVGDDCPLPFLLLAIHCCNLEPSTRAPFTEITQHLEWILEQLPEPAPLTRTALTHNQG-
.:: :. ....::.:.: : :... . :: . .: :: ..:
NP_001 RYCPPNCPPSFFPITVRCCDLDPEKRPSFVKLEHWLETLRMHLAGHLPLGPQLEQLDRGF
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340 350 360 370 380 390
pF1KE0 -SVARGGPSATLPRPDPRLSRSRSDLFLPPSPESPPNWGDNLTRVNPFSLREDLRGGKIK
. : : :. .:.
NP_001 WETYRRGESGLPAHPEVPD
600 610
>>NP_002305 (OMIM: 601329) LIM domain kinase 1 isoform 1 (647 aa)
initn: 731 init1: 319 opt: 661 Z-score: 271.4 bits: 60.4 E(85289): 2.2e-08
Smith-Waterman score: 778; 40.2% identity (65.9% similar) in 346 aa overlap (24-349:303-644)
10 20 30 40
pF1KE0 MAGERPPLRGPGPGPGEVPGEGPPGPGGTGGGPGR----GRPSSYRALRSAVS
:: :. :. .. :: : :..
NP_002 LSSPAYTPSGEAGSSARQKPVLRSCSIDRSPGAGSLGSPASQRKDLGRSESLRVV-CRPH
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pF1KE0 SLARVDDFHCAEKIGAGFFSEVYKVRHRQSGQVMVLK-MNKLPSNRGNT-LREVQLMNRL
. : .:. .: .: : :... :: ::..:.:::.: . .. . : :.::..: :
NP_002 RIFRPSDLIHGEVLGKGCFGQAIKVTHRETGEVMVMKELIRFDEETQRTFLKEVKVMRCL
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pF1KE0 RHPNILRFMGVCVHQGQLHALTEYMNGGTLEQLLSSPEP-LSWPVRLHLALDIARGLRYL
.:::.:.:.:: .. .:. .:::..::::. ...: . : :. .: ::: :. ::
NP_002 EHPNVLKFIGVLYKDKRLNFITEYIKGGTLRGIIKSMDSQYPWSQRVSFAKDIASGMAYL
400 410 420 430 440 450
170 180 190 200 210
pF1KE0 HSKGVFHRDLTSKNCLVRREDRGFTAVVGDFGLA----------EKIPVYREGARKEPLA
:: ...::::.:.::::: :... .::.::::: : . .. ::. .
NP_002 HSMNIIHRDLNSHNCLVR-ENKN--VVVADFGLARLMVDEKTQPEGLRSLKKPDRKKRYT
460 470 480 490 500
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pF1KE0 VVGSPYWMAPEVLRGELYDEKADVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAF-R
:::.:::::::.. :. ::::.:::.:::::::.:.:: ::::::::: ::::.: .:
NP_002 VVGNPYWMAPEMINGRSYDEKVDVFSFGIVLCEIIGRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLD
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pF1KE0 TLVGDDCPLPFLLLAIHCCNLEPSTRAPFTEITQHLEWILEQLPEPAPLTRTALTHNQG-
.:: :. ....::.:.: : :... . :: . .: :: ..:
NP_002 RYCPPNCPPSFFPITVRCCDLDPEKRPSFVKLEHWLETLRMHLAGHLPLGPQLEQLDRGF
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pF1KE0 -SVARGGPSATLPRPDPRLSRSRSDLFLPPSPESPPNWGDNLTRVNPFSLREDLRGGKIK
. : : :. .:.
NP_002 WETYRRGESGLPAHPEVPD
630 640
>>XP_016855536 (OMIM: 604746) PREDICTED: dual specificit (522 aa)
initn: 1194 init1: 403 opt: 513 Z-score: 218.1 bits: 50.2 E(85289): 2.1e-05
Smith-Waterman score: 1229; 47.7% identity (60.9% similar) in 509 aa overlap (25-500:25-467)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAGERPPLRGPGPGPGEVPGEGPPGPGGTGGGPGRGR--PSSYRALRSAVSSLARVDDFH
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XP_016 MDRSKRNSIAGFPPRVERLEEFEGGGGGEGNVSQVGRVWPSSYRALISAFSRLTRLDDFT
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XP_016 C-EKIGSGFFSEVFKVRHRASGQVMALKMNTLSSNRANMLKEVQLMNRLSHPNILRFMGV
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::::::::::::
XP_016 CVHQGQLHALTE------------------------------------------------
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pF1KE0 KNCLVRREDRGFTAVVGDFGLAEKIPVYREGARKEPLAVVGSPYWMAPEVLRGELYDEKA
:::..:.. :..:::.::::::::: :..: :::::::.:::::::: : :.:::
XP_016 -NCLIKRDENGYSAVVADFGLAEKIPDVSMGSEK--LAVVGSPFWMAPEVLRDEPYNEKA
140 150 160 170 180
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pF1KE0 DVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAFRTLVGDDCPLPFLLLAIHCCNLEP
:::..::.:::.:::. ::::::::::.:::: ::. .::: :: :: :...:::..:
XP_016 DVFSYGIILCEIIARIQADPDYLPRTENFGLDYDAFQHMVGD-CPPDFLQLTFNCCNMDP
190 200 210 220 230 240
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pF1KE0 STRAPFTEITQHLEWILEQLPEPA--------PLTRTALTHNQGSVARGGPSATLPR--P
. : :.:: . :: :: .: : : .: : . : .. . .:. :
XP_016 KLRPSFVEIGKTLEEILSRLQEEEQERDRKLQPTARGLLEKAPGVKRLSSLDDKIPHKSP
250 260 270 280 290 300
350 360 370 380 390
pF1KE0 DPR----LSRSRSDLFL--PP------SPESPPNWGDNLT-RVNPFSLREDLRGGKIKLL
:: ::::.::.: :: .: : : : .::::: :.:: :::::..
XP_016 CPRRTIWLSRSQSDIFSRKPPRTVSVLDPYYRPRDGAARTPKVNPFSARQDLMGGKIKFF
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 DTPSKPVLPLVPP--SPFPSTQLPLVTTPETLVQPGTPARRCRSLPSSPELPRRMETALP
: ::: :. :: .: :.: .::. : :. : : :: ::::.:::. .. .
XP_016 DLPSKSVISLVFDLDAPGPGT-MPLADWQEPLA-P--PIRRWRSLPGSPEFLHQEACPFV
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500
pF1KE0 G------PGPPAVGPSAEEKMECEGSSPEPEPPGPAPQLPLAVATDNFISTCSSASQPWS
: ::: : . ... :: : :: : : . . ::
XP_016 GREESLSDGPPPRLSSLKYRVK-------EIPPFRASALPAAQAHEAM--DCSILQEENG
430 440 450 460 470
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 PRSGPVLNNNPPAVVVNSPQGWAGEPWNRAQHSLPRAAALERTEPSPPPSAPREPDEGLP
XP_016 FGSRPQGTSPCPAGASEEMEVEERPAGSTPATFSTSGIGLQTQGKQDG
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626 residues in 1 query sequences
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