Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4148
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4148, 583 aa
1>>>pF1KE4148 583 - 583 aa - 583 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3893+/-0.000387; mu= 14.2219+/- 0.024
mean_var=100.6611+/-20.245, 0's: 0 Z-trim(114.4): 219 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.127833
statistics sampled from 23972 (24195) to 23972 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.284), width: 16
Scan time: 11.150
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001309250 (OMIM: 614444) ras-specific guanine n ( 584) 2381 450.0 9.9e-126
XP_011517535 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 585) 2375 448.9 2.1e-125
NP_001309251 (OMIM: 614444) ras-specific guanine n ( 576) 2330 440.6 6.6e-123
NP_001309254 (OMIM: 614444) ras-specific guanine n ( 607) 2325 439.7 1.3e-122
XP_016870835 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 549) 1758 335.1 3.6e-91
XP_016870836 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 557) 1758 335.1 3.7e-91
NP_055451 (OMIM: 614444) ras-specific guanine nucl ( 557) 1758 335.1 3.7e-91
XP_016870833 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 600) 1719 327.9 5.7e-89
XP_011517538 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 515) 1556 297.8 5.7e-80
NP_001177657 (OMIM: 614444) ras-specific guanine n ( 529) 1556 297.8 5.8e-80
NP_001309249 (OMIM: 614444) ras-specific guanine n ( 537) 1556 297.8 5.9e-80
NP_001177658 (OMIM: 614444) ras-specific guanine n ( 537) 1556 297.8 5.9e-80
NP_001309253 (OMIM: 614444) ras-specific guanine n ( 514) 1551 296.9 1.1e-79
XP_016870837 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 527) 1551 296.9 1.1e-79
XP_016870839 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 384) 1494 286.3 1.2e-76
NP_001177659 (OMIM: 614444) ras-specific guanine n ( 305) 1471 282.0 1.9e-75
XP_016870838 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 520) 1356 260.9 7.2e-69
XP_011517536 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 631) 1356 261.0 8.5e-69
NP_001309252 (OMIM: 614444) ras-specific guanine n ( 507) 985 192.5 2.8e-48
XP_011517540 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 474) 977 191.0 7.4e-48
XP_016870834 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 569) 977 191.1 8.6e-48
XP_011517534 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 590) 977 191.1 8.8e-48
XP_011517533 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 591) 977 191.1 8.8e-48
XP_016870831 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 638) 977 191.1 9.4e-48
XP_011517530 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 639) 977 191.1 9.4e-48
XP_011517528 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 653) 977 191.1 9.6e-48
XP_011517527 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 660) 977 191.1 9.7e-48
XP_006717391 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 661) 977 191.1 9.7e-48
XP_016870832 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 661) 977 191.1 9.7e-48
XP_011517532 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 661) 977 191.1 9.7e-48
XP_011517537 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 661) 977 191.1 9.7e-48
XP_011517531 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 661) 977 191.1 9.7e-48
XP_011517529 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 644) 730 145.6 4.9e-34
NP_722522 (OMIM: 606600) ras-specific guanine nucl ( 489) 442 92.4 3.8e-18
NP_001139120 (OMIM: 606600) ras-specific guanine n (1257) 442 92.6 8.2e-18
XP_016877945 (OMIM: 606600) PREDICTED: ras-specifi (1260) 442 92.6 8.2e-18
XP_016877944 (OMIM: 606600) PREDICTED: ras-specifi (1270) 442 92.6 8.3e-18
NP_002882 (OMIM: 606600) ras-specific guanine nucl (1273) 442 92.6 8.3e-18
XP_016865171 (OMIM: 606614) PREDICTED: ras-specifi (1142) 429 90.2 4e-17
NP_008840 (OMIM: 606614) ras-specific guanine nucl (1237) 429 90.2 4.3e-17
XP_011531368 (OMIM: 135300,182530,610733) PREDICTE ( 978) 401 85.0 1.3e-15
XP_011531366 (OMIM: 135300,182530,610733) PREDICTE (1276) 401 85.1 1.6e-15
XP_005264572 (OMIM: 135300,182530,610733) PREDICTE (1318) 401 85.1 1.6e-15
XP_011531364 (OMIM: 135300,182530,610733) PREDICTE (1326) 401 85.1 1.6e-15
NP_005624 (OMIM: 135300,182530,610733) son of seve (1333) 401 85.1 1.6e-15
NP_008870 (OMIM: 601247,616559) son of sevenless h (1332) 378 80.8 3.1e-14
NP_005303 (OMIM: 600303) rap guanine nucleotide ex (1077) 328 71.6 1.5e-11
NP_001291204 (OMIM: 600303) rap guanine nucleotide (1094) 328 71.6 1.6e-11
NP_941372 (OMIM: 600303) rap guanine nucleotide ex (1095) 328 71.6 1.6e-11
XP_006717137 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1100) 328 71.6 1.6e-11
>>NP_001309250 (OMIM: 614444) ras-specific guanine nucle (584 aa)
initn: 1648 init1: 1648 opt: 2381 Z-score: 2378.3 bits: 450.0 E(85289): 9.9e-126
Smith-Waterman score: 2381; 63.1% identity (84.4% similar) in 588 aa overlap (5-583:5-584)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDLMNGQASSVNIAATASEKSSSSESLSDKGSEL-KKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITL
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NP_001 MYKRNGLMASVLVTSATPQGSSSSDSLEGQSCDYASKSYDAVVFDVLKVTPEEFASQITL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAE
::.::::::::.::.::::.::::.: :::.::::::::.:::::::::: :::::::::
NP_001 MDIPVFKAIQPEELASCGWSKKEKHSLAPNVVAFTRRFNQVSFWVVREILTAQTLKIRAE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSK
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NP_001 ILSHFVKIAKKLLELNNLHSLMSVVSALQSAPIFRLTKTWALLNRKDKTTFEKLDYLMSK
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180 190 200 210 220 230
pF1KE4 EDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRII
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NP_001 EDNYKRTREYIRSLKMVPSIPYLGIYLLDLIYIDSAYPASGSIMENEQRSNQMNNILRII
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SDLQQSCEYD-IPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASRE
.::: :: :: . ::::::::.::.::::::::::::::::::.::::.:.:: ..:.:
NP_001 ADLQVSCSYDHLTTLPHVQKYLKSVRYIEELQKFVEDDNYKLSLRIEPGSSSPRLVSSKE
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300 310 320 330 340 350
pF1KE4 DLVGPEVGA-SPQSGRKSVAAEGAL---LPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYNFIHKMNT
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NP_001 DLAGPSAGSGSARFSRRPTCPDTSVAGSLP-TPPVPR------HRKSHSLGNNMMCQLSV
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 AEFKSATFPNAGPRHLLDDSVMEPHAPSRGQA--ESSTLSSGISIGSSDGSELSEETSWP
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NP_001 VESKSATFPSEKARHLLDDSVLESRSPRRGLALTSSSAVTNGLSLGSSESSEFSEEMS-S
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 AFERNRLYHSLGPVTRV-ARNGYRSHMKASSSAESEDLAVHLYPGAVTIQGVLRRKTLLK
..::.::: .::: :: .::. :.. . : . .. .. :..: ::::::::
NP_001 GLERGRLYATLGPNWRVPVRNSPRTRSCVYSPTGPCICSLGNSAAVPTMEGPLRRKTLLK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 EGKKPTVASWTKYWAALCGTQLFYYAAKSLKATERKHFKSTSNKNVSVIGWMVMMADDPE
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NP_001 EGRKPALSSWTRYWVILSGSTLLYYGAKSLRGTDRKHYKSTPGKKVSIVGWMVQLPDDPE
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580
pF1KE4 HPDLFLLTDSEKGNSYKFQAGNRMNAMLWFKHLSAACQSNKQQVPTNLMTFE
:::.: :.. .::: ::::.:.:..:.:: :::. ::.::. :::.:::.::
NP_001 HPDIFQLNNPDKGNVYKFQTGSRFHAILWHKHLDDACKSNRPQVPANLMSFE
540 550 560 570 580
>>XP_011517535 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specific gu (585 aa)
initn: 1924 init1: 1189 opt: 2375 Z-score: 2372.3 bits: 448.9 E(85289): 2.1e-125
Smith-Waterman score: 2375; 62.9% identity (83.8% similar) in 588 aa overlap (5-583:5-585)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDLMNGQASSVNIAATASEKSSSSESLSDKGSEL-KKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITL
:: .:: ..... . ::::.:: .. . .::.::::::::::::::.:.::::
XP_011 MYKRNGLMASVLVTSATPQGSSSSDSLEGQSCDYASKSYDAVVFDVLKVTPEEFASQITL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAE
::.::::::::.::.::::.::::.: :::.::::::::.:::::::::: :::::::::
XP_011 MDIPVFKAIQPEELASCGWSKKEKHSLAPNVVAFTRRFNQVSFWVVREILTAQTLKIRAE
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120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSK
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XP_011 ILSHFVKIAKKLLELNNLHSLMSVVSALQSAPIFRLTKTWALLNRKDKTTFEKLDYLMSK
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pF1KE4 EDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRII
:::::: :.:: ::::.: :::::::: :: :::::::..:::.::::::: ::::::::
XP_011 EDNYKRTREYIRSLKMVPSIPYLGIYLLDLIYIDSAYPASGSIMENEQRSNQMNNILRII
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240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SDLQQSCEYD-IPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASRE
.::: :: :: . ::::::::.::.::::::::::::::::::.::::.:.:: ..:.:
XP_011 ADLQVSCSYDHLTTLPHVQKYLKSVRYIEELQKFVEDDNYKLSLRIEPGSSSPRLVSSKE
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300 310 320 330 340 350
pF1KE4 DLVGPEVGA-SPQSGRKSVAAEGAL---LPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYNFIHKMNT
::.:: .:. : . .:. . . .. :: ::: :: ::: :::: :.. ....
XP_011 DLAGPSAGSGSARFSRRPTCPDTSVAGSLP-TPPVPR------HRKSHSLGNNMMCQLSV
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 AEFKSATFPNAGPRHLLDDSVMEPHAPSRGQA--ESSTLSSGISIGSSDGSELSEETSWP
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XP_011 VESKSATFPSEKARHLLDDSVLESRSPRRGLALTSSSAVTNGLSLGSSESSEFSEEMSSG
360 370 380 390 400 410
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pF1KE4 AFERNRLYHSLGPVTRV-ARNGYRSHMKASSSAESEDLAVHLYPGAVTIQGVLRRKTLLK
:.::: .::: :: .::. :.. . : . .. .. :..: ::::::::
XP_011 LESRGRLYATLGPNWRVPVRNSPRTRSCVYSPTGPCICSLGNSAAVPTMEGPLRRKTLLK
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pF1KE4 EGKKPTVASWTKYWAALCGTQLFYYAAKSLKATERKHFKSTSNKNVSVIGWMVMMADDPE
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XP_011 EGRKPALSSWTRYWVILSGSTLLYYGAKSLRGTDRKHYKSTPGKKVSIVGWMVQLPDDPE
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pF1KE4 HPDLFLLTDSEKGNSYKFQAGNRMNAMLWFKHLSAACQSNKQQVPTNLMTFE
:::.: :.. .::: ::::.:.:..:.:: :::. ::.::. :::.:::.::
XP_011 HPDIFQLNNPDKGNVYKFQTGSRFHAILWHKHLDDACKSNRPQVPANLMSFE
540 550 560 570 580
>>NP_001309251 (OMIM: 614444) ras-specific guanine nucle (576 aa)
initn: 1291 init1: 1291 opt: 2330 Z-score: 2327.5 bits: 440.6 E(85289): 6.6e-123
Smith-Waterman score: 2330; 62.4% identity (83.2% similar) in 588 aa overlap (5-583:5-576)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDLMNGQASSVNIAATASEKSSSSESLSDKGSEL-KKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITL
:: .:: ..... . ::::.:: .. . .::.::::::::::::::.:.::::
NP_001 MYKRNGLMASVLVTSATPQGSSSSDSLEGQSCDYASKSYDAVVFDVLKVTPEEFASQITL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAE
::.::::::::.::.::::.::::.: :::.::::::::.:::::::::: :::::::::
NP_001 MDIPVFKAIQPEELASCGWSKKEKHSLAPNVVAFTRRFNQVSFWVVREILTAQTLKIRAE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSK
.:::..: :::: ::::::.::.:::.::::::::::::::::.::::::::::.:.:::
NP_001 ILSHFVKIAKKLLELNNLHSLMSVVSALQSAPIFRLTKTWALLNRKDKTTFEKLDYLMSK
130 140 150 160 170 180
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pF1KE4 EDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRII
:::::: :.:: ::::.: :::::::: :: :::::::..:::.::::::: ::::::::
NP_001 EDNYKRTREYIRSLKMVPSIPYLGIYLLDLIYIDSAYPASGSIMENEQRSNQMNNILRII
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SDLQQSCEYD-IPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASRE
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NP_001 ADLQVSCSYDHLTTLPHVQKYLKSVRYIEELQKFVEDDNYKLSLRIEPGSSSPRLVSSKE
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pF1KE4 DLVGPEVGA-SPQSGRKSVAAEGAL---LPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYNFIHKMNT
::.:: .:. : . .:. . . .. :: ::: :: ::: :::: :.. ....
NP_001 DLAGPSAGSGSARFSRRPTCPDTSVAGSLP-TPPVPR------HRKSHSLGNNMMCQLSV
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NP_001 VESKSATFPSEKARHLLDDSVLESRSPRRGLALTSSSAVTNGLSLGSSESSEFSEEMS-S
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pF1KE4 AFERNRLYHSLGPVTRV-ARNGYRSHMKASSSAESEDLAVHLYPGAVTIQGVLRRKTLLK
..::.::: .::: :: .::. :.. . : . .. .. :..: ::::::::
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pF1KE4 EGKKPTVASWTKYWAALCGTQLFYYAAKSLKATERKHFKSTSNKNVSVIGWMVMMADDPE
::.::...:::.::. : :. :.::.::::..:.::: ::..::::.. ::::
NP_001 EGRKPALSSWTRYWVILSGSTLLYYGAKSLRGTDRKH--------VSIVGWMVQLPDDPE
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pF1KE4 HPDLFLLTDSEKGNSYKFQAGNRMNAMLWFKHLSAACQSNKQQVPTNLMTFE
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NP_001 HPDIFQLNNPDKGNVYKFQTGSRFHAILWHKHLDDACKSNRPQVPANLMSFE
530 540 550 560 570
>>NP_001309254 (OMIM: 614444) ras-specific guanine nucle (607 aa)
initn: 2134 init1: 1189 opt: 2325 Z-score: 2322.2 bits: 439.7 E(85289): 1.3e-122
Smith-Waterman score: 2325; 62.7% identity (83.6% similar) in 579 aa overlap (5-574:5-576)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDLMNGQASSVNIAATASEKSSSSESLSDKGSEL-KKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITL
:: .:: ..... . ::::.:: .. . .::.::::::::::::::.:.::::
NP_001 MYKRNGLMASVLVTSATPQGSSSSDSLEGQSCDYASKSYDAVVFDVLKVTPEEFASQITL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAE
::.::::::::.::.::::.::::.: :::.::::::::.:::::::::: :::::::::
NP_001 MDIPVFKAIQPEELASCGWSKKEKHSLAPNVVAFTRRFNQVSFWVVREILTAQTLKIRAE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSK
.:::..: :::: ::::::.::.:::.::::::::::::::::.::::::::::.:.:::
NP_001 ILSHFVKIAKKLLELNNLHSLMSVVSALQSAPIFRLTKTWALLNRKDKTTFEKLDYLMSK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 EDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRII
:::::: :.:: ::::.: :::::::: :: :::::::..:::.::::::: ::::::::
NP_001 EDNYKRTREYIRSLKMVPSIPYLGIYLLDLIYIDSAYPASGSIMENEQRSNQMNNILRII
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SDLQQSCEYD-IPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASRE
.::: :: :: . ::::::::.::.::::::::::::::::::.::::.:.:: ..:.:
NP_001 ADLQVSCSYDHLTTLPHVQKYLKSVRYIEELQKFVEDDNYKLSLRIEPGSSSPRLVSSKE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 DLVGPEVGA-SPQSGRKSVAAEGAL---LPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYNFIHKMNT
::.:: .:. : . .:. . . .. :: ::: :: ::: :::: :.. ....
NP_001 DLAGPSAGSGSARFSRRPTCPDTSVAGSLP-TPPVPR------HRKSHSLGNNMMCQLSV
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pF1KE4 AEFKSATFPNAGPRHLLDDSVMEPHAPSRGQA--ESSTLSSGISIGSSDGSELSEETSWP
.: ::::::. ::::::::.: ..: :: : ::....:.:.:::..::.::: :
NP_001 VESKSATFPSEKARHLLDDSVLESRSPRRGLALTSSSAVTNGLSLGSSESSEFSEEMSSG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 AFERNRLYHSLGPVTRV-ARNGYRSHMKASSSAESEDLAVHLYPGAVTIQGVLRRKTLLK
:.::: .::: :: .::. :.. . : . .. .. :..: ::::::::
NP_001 LESRGRLYATLGPNWRVPVRNSPRTRSCVYSPTGPCICSLGNSAAVPTMEGPLRRKTLLK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 EGKKPTVASWTKYWAALCGTQLFYYAAKSLKATERKHFKSTSNKNVSVIGWMVMMADDPE
::.::...:::.::. : :. :.::.::::..:.:::.::: .:.::..::::.. ::::
NP_001 EGRKPALSSWTRYWVILSGSTLLYYGAKSLRGTDRKHYKSTPGKKVSIVGWMVQLPDDPE
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pF1KE4 HPDLFLLTDSEKGNSYKFQAGNRMNAMLWFKHLSAACQSNKQQVPTNLMTFE
:::.: :.. .::: ::::.:.:..:.:: :::. ::.::. :
NP_001 HPDIFQLNNPDKGNVYKFQTGSRFHAILWHKHLDDACKSNRPQEAGAAPGPTGTDSHEVD
540 550 560 570 580 590
NP_001 HLEGGAGKEAGPCA
600
>>XP_016870835 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specific gu (549 aa)
initn: 1986 init1: 1189 opt: 1758 Z-score: 1757.7 bits: 335.1 E(85289): 3.6e-91
Smith-Waterman score: 2236; 61.3% identity (80.4% similar) in 587 aa overlap (5-583:5-549)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDLMNGQASSVNIAATASEKSSSSESLSDKGSEL-KKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITL
:: .:: ..... . ::::.:: .. . .::.::::::::::::::.:.::::
XP_016 MYKRNGLMASVLVTSATPQGSSSSDSLEGQSCDYASKSYDAVVFDVLKVTPEEFASQITL
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60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAE
::.::::::::.::.::::.::::.: :::.::::::::.:::::::::: :::::::::
XP_016 MDIPVFKAIQPEELASCGWSKKEKHSLAPNVVAFTRRFNQVSFWVVREILTAQTLKIRAE
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pF1KE4 VLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSK
.:::..: :::: ::::::.::.:::.::::::::::::::::.::::::::::.:.:::
XP_016 ILSHFVKIAKKLLELNNLHSLMSVVSALQSAPIFRLTKTWALLNRKDKTTFEKLDYLMSK
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180 190 200 210 220 230
pF1KE4 EDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRII
:::::: :.:: ::::.: :::::::: :: :::::::..:::.::::::: ::::::::
XP_016 EDNYKRTREYIRSLKMVPSIPYLGIYLLDLIYIDSAYPASGSIMENEQRSNQMNNILRII
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SDLQQSCEYD-IPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASRE
.::: :: :: . ::::::::.::.::::::::::::::::::.::::.:.:: ..:.:
XP_016 ADLQVSCSYDHLTTLPHVQKYLKSVRYIEELQKFVEDDNYKLSLRIEPGSSSPRLVSSKE
250 260 270 280 290 300
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pF1KE4 DLVGPEVGA-SPQSGRKSVAAEGAL---LPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYNFIHKMNT
::.:: .:. : . .:. . . .. :: ::: :: ::: :::: :.. ....
XP_016 DLAGPSAGSGSARFSRRPTCPDTSVAGSLP-TPPVPR------HRKSHSLGNNMMCQLSV
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 AEFKSATFPNAGPRHLLDDSVMEPHAPSRGQA--ESSTLSSGISIGSSDGSELSEETSWP
.: ::::::. ::::::::.: ..: :: : ::....:.:.:::..::.::: :
XP_016 VESKSATFPSEKARHLLDDSVLESRSPRRGLALTSSSAVTNGLSLGSSESSEFSEEMS--
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 AFERNRLYHSLGPVTRVARNGYRSHMKASSSAESEDLAVHLYPGAVTIQGVLRRKTLLKE
. : :: . : .:.: : :..: :::::::::
XP_016 ----SGLESPTGPC--ICSLG-------NSAA---------VP---TMEGPLRRKTLLKE
420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 GKKPTVASWTKYWAALCGTQLFYYAAKSLKATERKHFKSTSNKNVSVIGWMVMMADDPEH
:.::...:::.::. : :. :.::.::::..:.::: ::..::::.. :::::
XP_016 GRKPALSSWTRYWVILSGSTLLYYGAKSLRGTDRKH--------VSIVGWMVQLPDDPEH
450 460 470 480 490
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pF1KE4 PDLFLLTDSEKGNSYKFQAGNRMNAMLWFKHLSAACQSNKQQVPTNLMTFE
::.: :.. .::: ::::.:.:..:.:: :::. ::.::. :::.:::.::
XP_016 PDIFQLNNPDKGNVYKFQTGSRFHAILWHKHLDDACKSNRPQVPANLMSFE
500 510 520 530 540
>>XP_016870836 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specific gu (557 aa)
initn: 2252 init1: 1189 opt: 1758 Z-score: 1757.6 bits: 335.1 E(85289): 3.7e-91
Smith-Waterman score: 2287; 62.0% identity (81.6% similar) in 587 aa overlap (5-583:5-557)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDLMNGQASSVNIAATASEKSSSSESLSDKGSEL-KKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITL
:: .:: ..... . ::::.:: .. . .::.::::::::::::::.:.::::
XP_016 MYKRNGLMASVLVTSATPQGSSSSDSLEGQSCDYASKSYDAVVFDVLKVTPEEFASQITL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAE
::.::::::::.::.::::.::::.: :::.::::::::.:::::::::: :::::::::
XP_016 MDIPVFKAIQPEELASCGWSKKEKHSLAPNVVAFTRRFNQVSFWVVREILTAQTLKIRAE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSK
.:::..: :::: ::::::.::.:::.::::::::::::::::.::::::::::.:.:::
XP_016 ILSHFVKIAKKLLELNNLHSLMSVVSALQSAPIFRLTKTWALLNRKDKTTFEKLDYLMSK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 EDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRII
:::::: :.:: ::::.: :::::::: :: :::::::..:::.::::::: ::::::::
XP_016 EDNYKRTREYIRSLKMVPSIPYLGIYLLDLIYIDSAYPASGSIMENEQRSNQMNNILRII
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SDLQQSCEYD-IPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASRE
.::: :: :: . ::::::::.::.::::::::::::::::::.::::.:.:: ..:.:
XP_016 ADLQVSCSYDHLTTLPHVQKYLKSVRYIEELQKFVEDDNYKLSLRIEPGSSSPRLVSSKE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 DLVGPEVGA-SPQSGRKSVAAEGAL---LPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYNFIHKMNT
::.:: .:. : . .:. . . .. :: ::: :: ::: :::: :.. ....
XP_016 DLAGPSAGSGSARFSRRPTCPDTSVAGSLP-TPPVPR------HRKSHSLGNNMMCQLSV
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 AEFKSATFPNAGPRHLLDDSVMEPHAPSRGQA--ESSTLSSGISIGSSDGSELSEETSWP
.: ::::::. ::::::::.: ..: :: : ::....:.:.:::..::.::: :
XP_016 VESKSATFPSEKARHLLDDSVLESRSPRRGLALTSSSAVTNGLSLGSSESSEFSEEMS--
360 370 380 390 400 410
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pF1KE4 AFERNRLYHSLGPVTRVARNGYRSHMKASSSAESEDLAVHLYPGAVTIQGVLRRKTLLKE
. : :: . : .:.: : :..: :::::::::
XP_016 ----SGLESPTGPC--ICSLG-------NSAA---------VP---TMEGPLRRKTLLKE
420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 GKKPTVASWTKYWAALCGTQLFYYAAKSLKATERKHFKSTSNKNVSVIGWMVMMADDPEH
:.::...:::.::. : :. :.::.::::..:.:::.::: .:.::..::::.. :::::
XP_016 GRKPALSSWTRYWVILSGSTLLYYGAKSLRGTDRKHYKSTPGKKVSIVGWMVQLPDDPEH
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580
pF1KE4 PDLFLLTDSEKGNSYKFQAGNRMNAMLWFKHLSAACQSNKQQVPTNLMTFE
::.: :.. .::: ::::.:.:..:.:: :::. ::.::. :::.:::.::
XP_016 PDIFQLNNPDKGNVYKFQTGSRFHAILWHKHLDDACKSNRPQVPANLMSFE
510 520 530 540 550
>>NP_055451 (OMIM: 614444) ras-specific guanine nucleoti (557 aa)
initn: 2252 init1: 1189 opt: 1758 Z-score: 1757.6 bits: 335.1 E(85289): 3.7e-91
Smith-Waterman score: 2287; 62.0% identity (81.6% similar) in 587 aa overlap (5-583:5-557)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDLMNGQASSVNIAATASEKSSSSESLSDKGSEL-KKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITL
:: .:: ..... . ::::.:: .. . .::.::::::::::::::.:.::::
NP_055 MYKRNGLMASVLVTSATPQGSSSSDSLEGQSCDYASKSYDAVVFDVLKVTPEEFASQITL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAE
::.::::::::.::.::::.::::.: :::.::::::::.:::::::::: :::::::::
NP_055 MDIPVFKAIQPEELASCGWSKKEKHSLAPNVVAFTRRFNQVSFWVVREILTAQTLKIRAE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSK
.:::..: :::: ::::::.::.:::.::::::::::::::::.::::::::::.:.:::
NP_055 ILSHFVKIAKKLLELNNLHSLMSVVSALQSAPIFRLTKTWALLNRKDKTTFEKLDYLMSK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 EDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRII
:::::: :.:: ::::.: :::::::: :: :::::::..:::.::::::: ::::::::
NP_055 EDNYKRTREYIRSLKMVPSIPYLGIYLLDLIYIDSAYPASGSIMENEQRSNQMNNILRII
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SDLQQSCEYD-IPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASRE
.::: :: :: . ::::::::.::.::::::::::::::::::.::::.:.:: ..:.:
NP_055 ADLQVSCSYDHLTTLPHVQKYLKSVRYIEELQKFVEDDNYKLSLRIEPGSSSPRLVSSKE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 DLVGPEVGA-SPQSGRKSVAAEGAL---LPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYNFIHKMNT
::.:: .:. : . .:. . . .. :: ::: :: ::: :::: :.. ....
NP_055 DLAGPSAGSGSARFSRRPTCPDTSVAGSLP-TPPVPR------HRKSHSLGNNMMCQLSV
310 320 330 340 350
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pF1KE4 AEFKSATFPNAGPRHLLDDSVMEPHAPSRGQA--ESSTLSSGISIGSSDGSELSEETSWP
.: ::::::. ::::::::.: ..: :: : ::....:.:.:::..::.::: :
NP_055 VESKSATFPSEKARHLLDDSVLESRSPRRGLALTSSSAVTNGLSLGSSESSEFSEEMS--
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 AFERNRLYHSLGPVTRVARNGYRSHMKASSSAESEDLAVHLYPGAVTIQGVLRRKTLLKE
. : :: . : .:.: : :..: :::::::::
NP_055 ----SGLESPTGPC--ICSLG-------NSAA---------VP---TMEGPLRRKTLLKE
420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 GKKPTVASWTKYWAALCGTQLFYYAAKSLKATERKHFKSTSNKNVSVIGWMVMMADDPEH
:.::...:::.::. : :. :.::.::::..:.:::.::: .:.::..::::.. :::::
NP_055 GRKPALSSWTRYWVILSGSTLLYYGAKSLRGTDRKHYKSTPGKKVSIVGWMVQLPDDPEH
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580
pF1KE4 PDLFLLTDSEKGNSYKFQAGNRMNAMLWFKHLSAACQSNKQQVPTNLMTFE
::.: :.. .::: ::::.:.:..:.:: :::. ::.::. :::.:::.::
NP_055 PDIFQLNNPDKGNVYKFQTGSRFHAILWHKHLDDACKSNRPQVPANLMSFE
510 520 530 540 550
>>XP_016870833 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specific gu (600 aa)
initn: 1562 init1: 699 opt: 1719 Z-score: 1718.3 bits: 327.9 E(85289): 5.7e-89
Smith-Waterman score: 1740; 49.1% identity (67.3% similar) in 633 aa overlap (5-574:5-569)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDLMNGQASSVNIAATASEKSSSSESLSDKGSEL-KKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITL
:: .:: ..... . ::::.:: .. . .::.::::::::::::::.:.::::
XP_016 MYKRNGLMASVLVTSATPQGSSSSDSLEGQSCDYASKSYDAVVFDVLKVTPEEFASQITL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAE
::.::::::::.::.::::.::::.: :::.::::::::.
XP_016 MDIPVFKAIQPEELASCGWSKKEKHSLAPNVVAFTRRFNQ--------------------
70 80 90 100
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pF1KE4 VLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSK
::.::::::::::.:.:::
XP_016 -----------------------------------------LLNRKDKTTFEKLDYLMSK
110
180 190 200
pF1KE4 EDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLG------------------------------------
:::::: :.:: ::::.: :::::
XP_016 EDNYKRTREYIRSLKMVPSIPYLGTNTGTASESSAWSQPHRWSSVNVDRIRVRKERMALD
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240
pF1KE4 ------------------IYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRIISDLQQS
::: :: :::::::..:::.::::::: ::::::::.::: :
XP_016 PMMQASSRHVSTGSLGEGIYLLDLIYIDSAYPASGSIMENEQRSNQMNNILRIIADLQVS
180 190 200 210 220 230
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pF1KE4 CEYD-IPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASREDLVGPE
: :: . ::::::::.::.::::::::::::::::::.::::.:.:: ..:.:::.::
XP_016 CSYDHLTTLPHVQKYLKSVRYIEELQKFVEDDNYKLSLRIEPGSSSPRLVSSKEDLAGPS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VGA-SPQSGRKSVAAEGAL---LPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYNFIHKMNTAEFKSA
.:. : . .:. . . .. :: ::: :: ::: :::: :.. .....: :::
XP_016 AGSGSARFSRRPTCPDTSVAGSLP-TPPVPR------HRKSHSLGNNMMCQLSVVESKSA
300 310 320 330 340 350
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pF1KE4 TFPNAGPRHLLDDSVMEPHAPSRGQA--ESSTLSSGISIGSSDGSELSEETSWPAFERNR
:::. ::::::::.: ..: :: : ::....:.:.:::..::.::: : :.:
XP_016 TFPSEKARHLLDDSVLESRSPRRGLALTSSSAVTNGLSLGSSESSEFSEEMSSGLESRGR
360 370 380 390 400 410
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pF1KE4 LYHSLGPVTRV-ARNGYRSHMKASSSAESEDLAVHLYPGAVTIQGVLRRKTLLKEGKKPT
:: .::: :: .::. :.. . : . .. .. :..: ::::::::::.::.
XP_016 LYATLGPNWRVPVRNSPRTRSCVYSPTGPCICSLGNSAAVPTMEGPLRRKTLLKEGRKPA
420 430 440 450 460 470
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pF1KE4 VASWTKYWAALCGTQLFYYAAKSLKATERKHFKSTSNKNVSVIGWMVMMADDPEHPDLFL
..:::.::. : :. :.::.::::..:.:::.::: .:.::..::::.. :::::::.:
XP_016 LSSWTRYWVILSGSTLLYYGAKSLRGTDRKHYKSTPGKKVSIVGWMVQLPDDPEHPDIFQ
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580
pF1KE4 LTDSEKGNSYKFQAGNRMNAMLWFKHLSAACQSNKQQVPTNLMTFE
:.. .::: ::::.:.:..:.:: :::. ::.::. :
XP_016 LNNPDKGNVYKFQTGSRFHAILWHKHLDDACKSNRPQEAGAAPGPTGTDSHEVDHLEGGA
540 550 560 570 580 590
XP_016 GKEAGPCA
600
>>XP_011517538 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specific gu (515 aa)
initn: 2128 init1: 1189 opt: 1556 Z-score: 1556.8 bits: 297.8 E(85289): 5.7e-80
Smith-Waterman score: 2039; 57.5% identity (75.1% similar) in 586 aa overlap (5-583:5-515)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDLMNGQASSVNIAATASEKSSSSESLSDKGSEL-KKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITL
:: .:: ..... . ::::.:: .. . .::.::::::::::::::.:.::::
XP_011 MYKRNGLMASVLVTSATPQGSSSSDSLEGQSCDYASKSYDAVVFDVLKVTPEEFASQITL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAE
::.::::::::.::.::::.::::.: :::.::::::::.:::::::::: :::::::::
XP_011 MDIPVFKAIQPEELASCGWSKKEKHSLAPNVVAFTRRFNQVSFWVVREILTAQTLKIRAE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSK
.:::..: :::: ::::::.::.:::.::::::::::::::::.::::::::::.:.:::
XP_011 ILSHFVKIAKKLLELNNLHSLMSVVSALQSAPIFRLTKTWALLNRKDKTTFEKLDYLMSK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 EDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRII
:::::: :.:: ::::.: :::::::: :: :::::::..:::.::::::: ::::::::
XP_011 EDNYKRTREYIRSLKMVPSIPYLGIYLLDLIYIDSAYPASGSIMENEQRSNQMNNILRII
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SDLQQSCEYD-IPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASRE
.::: :: :: . ::::::::.::.::::::::::::::::::.::::.:.:: ..:.:
XP_011 ADLQVSCSYDHLTTLPHVQKYLKSVRYIEELQKFVEDDNYKLSLRIEPGSSSPRLVSSKE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 DLVGPEVGA-SPQSGRKSVAAEGAL---LPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYNFIHKMNT
::.:: .:. : . .:. . . .. :: ::: :: ::: :::: :
XP_011 DLAGPSAGSGSARFSRRPTCPDTSVAGSLP-TPPVPR------HRKSHSLGNN-------
310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 AEFKSATFPNAGPRHLLDDSVMEPHAPSRGQAESSTLSSGISIGSSDGSELSEETSWPAF
XP_011 ------------------------------------------------------------
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pF1KE4 ERNRLYHSLGPVTRV-ARNGYRSHMKASSSAESEDLAVHLYPGAVTIQGVLRRKTLLKEG
:.::: .::: :: .::. :.. . : . .. .. :..: ::::::::::
XP_011 -RGRLYATLGPNWRVPVRNSPRTRSCVYSPTGPCICSLGNSAAVPTMEGPLRRKTLLKEG
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pF1KE4 KKPTVASWTKYWAALCGTQLFYYAAKSLKATERKHFKSTSNKNVSVIGWMVMMADDPEHP
.::...:::.::. : :. :.::.::::..:.:::.::: .:.::..::::.. ::::::
XP_011 RKPALSSWTRYWVILSGSTLLYYGAKSLRGTDRKHYKSTPGKKVSIVGWMVQLPDDPEHP
410 420 430 440 450 460
540 550 560 570 580
pF1KE4 DLFLLTDSEKGNSYKFQAGNRMNAMLWFKHLSAACQSNKQQVPTNLMTFE
:.: :.. .::: ::::.:.:..:.:: :::. ::.::. :::.:::.::
XP_011 DIFQLNNPDKGNVYKFQTGSRFHAILWHKHLDDACKSNRPQVPANLMSFE
470 480 490 500 510
>>NP_001177657 (OMIM: 614444) ras-specific guanine nucle (529 aa)
initn: 2066 init1: 1189 opt: 1556 Z-score: 1556.6 bits: 297.8 E(85289): 5.8e-80
Smith-Waterman score: 1938; 56.5% identity (73.5% similar) in 577 aa overlap (5-574:5-498)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDLMNGQASSVNIAATASEKSSSSESLSDKGSEL-KKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITL
:: .:: ..... . ::::.:: .. . .::.::::::::::::::.:.::::
NP_001 MYKRNGLMASVLVTSATPQGSSSSDSLEGQSCDYASKSYDAVVFDVLKVTPEEFASQITL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAE
::.::::::::.::.::::.::::.: :::.::::::::.:::::::::: :::::::::
NP_001 MDIPVFKAIQPEELASCGWSKKEKHSLAPNVVAFTRRFNQVSFWVVREILTAQTLKIRAE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSK
.:::..: :::: ::::::.::.:::.::::::::::::::::.::::::::::.:.:::
NP_001 ILSHFVKIAKKLLELNNLHSLMSVVSALQSAPIFRLTKTWALLNRKDKTTFEKLDYLMSK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 EDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRII
:::::: :.:: ::::.: :::::::: :: :::::::..:::.::::::: ::::::::
NP_001 EDNYKRTREYIRSLKMVPSIPYLGIYLLDLIYIDSAYPASGSIMENEQRSNQMNNILRII
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SDLQQSCEYD-IPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASRE
.::: :: :: . ::::::::.::.::::::::::::::::::.::::.:.:: ..:.:
NP_001 ADLQVSCSYDHLTTLPHVQKYLKSVRYIEELQKFVEDDNYKLSLRIEPGSSSPRLVSSKE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 DLVGPEVGA-SPQSGRKSVAAEGAL---LPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYNFIHKMNT
::.:: .:. : . .:. . . .. :: ::: :: ::: :::: :
NP_001 DLAGPSAGSGSARFSRRPTCPDTSVAGSLP-TPPVPR------HRKSHSLGNN-------
310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 AEFKSATFPNAGPRHLLDDSVMEPHAPSRGQAESSTLSSGISIGSSDGSELSEETSWPAF
NP_001 ------------------------------------------------------------
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 ERNRLYHSLGPVTRV-ARNGYRSHMKASSSAESEDLAVHLYPGAVTIQGVLRRKTLLKEG
:.::: .::: :: .::. :.. . : . .. .. :..: ::::::::::
NP_001 -RGRLYATLGPNWRVPVRNSPRTRSCVYSPTGPCICSLGNSAAVPTMEGPLRRKTLLKEG
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pF1KE4 KKPTVASWTKYWAALCGTQLFYYAAKSLKATERKHFKSTSNKNVSVIGWMVMMADDPEHP
.::...:::.::. : :. :.::.::::..:.::: ::..::::.. ::::::
NP_001 RKPALSSWTRYWVILSGSTLLYYGAKSLRGTDRKH--------VSIVGWMVQLPDDPEHP
410 420 430 440 450
540 550 560 570 580
pF1KE4 DLFLLTDSEKGNSYKFQAGNRMNAMLWFKHLSAACQSNKQQVPTNLMTFE
:.: :.. .::: ::::.:.:..:.:: :::. ::.::. :
NP_001 DIFQLNNPDKGNVYKFQTGSRFHAILWHKHLDDACKSNRPQEAGAAPGPTGTDSHEVDHL
460 470 480 490 500 510
NP_001 EGGAGKEAGPCA
520
583 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 17:10:56 2016 done: Sat Nov 5 17:10:57 2016
Total Scan time: 11.150 Total Display time: 0.160
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]