Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5515
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5515, 360 aa
1>>>pF1KE5515 360 - 360 aa - 360 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6683+/-0.000975; mu= 13.9731+/- 0.058
mean_var=66.0032+/-13.319, 0's: 0 Z-trim(104.2): 28 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.157867
statistics sampled from 7751 (7773) to 7751 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16
Scan time: 2.600
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2498.1 KCNJ13 gene_id:3769|Hs108|chr2 ( 360) 2380 551.2 5.1e-157
CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs108|chr1 ( 379) 857 204.3 1.4e-52
CCDS13656.1 KCNJ15 gene_id:3772|Hs108|chr21 ( 375) 785 187.9 1.2e-47
CCDS8477.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 372) 733 176.1 4.4e-44
CCDS8476.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 391) 733 176.1 4.6e-44
CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17 ( 427) 676 163.1 4e-40
CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs108|chr19 ( 436) 675 162.9 4.8e-40
CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 ( 433) 643 155.6 7.5e-38
CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 ( 433) 634 153.5 3.1e-37
CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1 ( 393) 630 152.6 5.3e-37
CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 ( 423) 628 152.2 7.8e-37
CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 ( 419) 626 151.7 1.1e-36
CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 501) 620 150.4 3.2e-36
CCDS11687.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 418) 558 136.2 4.9e-32
CCDS74141.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 453) 558 136.2 5.2e-32
CCDS31436.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 390) 556 135.7 6.3e-32
CCDS8692.1 KCNJ8 gene_id:3764|Hs108|chr12 ( 424) 538 131.7 1.2e-30
CCDS54437.1 KCNJ13 gene_id:3769|Hs108|chr2 ( 94) 528 129.2 1.5e-30
CCDS58733.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 235) 457 113.1 2.4e-25
CCDS13971.1 KCNJ4 gene_id:3761|Hs108|chr22 ( 445) 445 110.5 2.9e-24
CCDS53606.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 303) 418 104.3 1.4e-22
>>CCDS2498.1 KCNJ13 gene_id:3769|Hs108|chr2 (360 aa)
initn: 2380 init1: 2380 opt: 2380 Z-score: 2932.4 bits: 551.2 E(32554): 5.1e-157
Smith-Waterman score: 2380; 99.2% identity (99.2% similar) in 360 aa overlap (1-360:1-360)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDSSNCKVIAPLLSQRYRRMVTKDGHSTLQMDGAQRGLAYLRDAWGILMDMRWRWMMLVF
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CCDS24 MDSSNCKVIAPLLSQRYRRMVTKDGHSTLQMDGAQRGLAYLRDAWGILMDMRWRWMMLVF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SASFVVHWLVFAVLWYVLAEMNGDLELDHDAPPENHTICVKYITSFTAAFSFSLETQLTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 SASFVVHWLVFAVLWYVLAEMNGDLELDHDAPPENHTICVKYITSFTAAFSFSLETQLTI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GYGTMFPSGDCPSAIALLAIQMLLGLMLEAFITGAFVAKIARPKNRAFSIRFTDIAVVAH
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CCDS24 GYGTMFPSGDCPSAIALLAIQMLLGLMLEAFITGAFVAKIARPKNRAFSIRFTDTAVVAH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MDGKPNLIFQVANTRPSPLTSVRVSAVLYQERENGKLYQTSVDFHLDGISSDECPFFIFP
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CCDS24 MDGKPNLIFQVANTRPSPLTSVRVSAVLYQERENGKLYQTSVDFHLDGISSDECPFFIFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LTYYHSITPSSPLATLLQHENPSHFELVVFLSAMQEGTGEICQRRTSYLQSEIMLHHCFA
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CCDS24 LTYYHSITPSSPLATLLQHENPSHFELVVFLSAMQEGTGEICQRRTSYLPSEIMLHHCFA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 SLLTRGSKCEYQIKMENFDKTVPEFPTPLVSKSPNRTDLDIHINGQSIDNFQISETGLTE
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CCDS24 SLLTRGSKGEYQIKMENFDKTVPEFPTPLVSKSPNRTDLDIHINGQSIDNFQISETGLTE
310 320 330 340 350 360
>>CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs108|chr1 (379 aa)
initn: 812 init1: 403 opt: 857 Z-score: 1057.4 bits: 204.3 E(32554): 1.4e-52
Smith-Waterman score: 857; 44.9% identity (72.0% similar) in 321 aa overlap (11-322:19-334)
10 20 30 40
pF1KE5 MDSSNCKVIAPLLSQ--RYRRMVTKDGHSTLQMDG-AQRGLAYLRDAWGILM
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CCDS11 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLMGPGIRRRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKDLWTTFI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 DMRWRWMMLVFSASFVVHWLVFAVLWYVLAEMNGDL-ELDHDAPPENHTICVKYITSFTA
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CCDS11 DMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELD---PPANHTPCVVQVHTLTG
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 AFSFSLETQLTIGYGTMFPSGDCPSAIALLAIQMLLGLMLEAFITGAFVAKIARPKNRAF
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CCDS11 AFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKKRAE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 SIRFTDIAVVAHMDGKPNLIFQVANTRPSPLTSVRVSAVLYQ-----ERENGKLYQTSVD
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CCDS11 TIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQVNVT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 FHLDGISSDECPFFIFPLTYYHSITPSSPLATLLQHENPSHFELVVFLSAMQEGTGEICQ
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CCDS11 FQVD--TASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDLPLRSGEGDFELVLILSGTVESTSATCQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 RRTSYLQSEIMLHHCFASLLTRGSKCEYQIKMENFDKTVPEFPTPLVSKSPNRTDLDIHI
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CCDS11 VRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPEKL
300 310 320 330 340 350
350 360
pF1KE5 NGQSIDNFQISETGLTE
CCDS11 KLEESLREQAEKEGSALSVRISNV
360 370
>>CCDS13656.1 KCNJ15 gene_id:3772|Hs108|chr21 (375 aa)
initn: 714 init1: 359 opt: 785 Z-score: 968.9 bits: 187.9 E(32554): 1.2e-47
Smith-Waterman score: 785; 41.9% identity (71.9% similar) in 310 aa overlap (19-320:28-332)
10 20 30 40
pF1KE5 MDSSNCKVIAPLLSQRYRRMVTKDGHSTLQMDGAQRG--LAYLRDAWGILM
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CCDS13 MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVD-GIYLLYLQDLWTTVI
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 DMRWRWMMLVFSASFVVHWLVFAVLWYVLAEMNGDLELDHDAPPENHTICVKYITSFTAA
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CCDS13 DMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLE--PGEPISNHTPCIMKVDSLTGA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 FSFSLETQLTIGYGTMFPSGDCPSAIALLAIQMLLGLMLEAFITGAFVAKIARPKNRAFS
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CCDS13 FLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKKRAET
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 IRFTDIAVVAHMDGKPNLIFQVANTRPSPLTSVRVSAVLYQ-----ERENGKLYQTSVDF
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CCDS13 IKFSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQATVKF
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 HLDGISSDECPFFIFPLTYYHSITPSSPLATLL-QHENPSHFELVVFLSAMQEGTGEICQ
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CCDS13 HVD--SSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAVCQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 RRTSYLQSEIMLHHCFASLLTRGSKCEYQIKMENFDKTVPEFPTPLVSKSPNRTDLDIHI
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CCDS13 SRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRKSPDCTFYCADSEKQQLEEKY
300 310 320 330 340 350
350 360
pF1KE5 NGQSIDNFQISETGLTE
CCDS13 RQEDQRERELRTLLLQQSNV
360 370
>>CCDS8477.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 (372 aa)
initn: 669 init1: 324 opt: 733 Z-score: 904.9 bits: 176.1 E(32554): 4.4e-44
Smith-Waterman score: 733; 37.7% identity (67.0% similar) in 361 aa overlap (14-360:17-368)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDSSNCKVIAPLLSQRYRRMVTKDGHSTLQMDG--AQRGLAYLRDAWGILMDMRWRW
:.. :.:.:::. .... . :: . .. : : ..:..::.
CCDS84 MFKHLRKWVVTRFFGHSRQRARLVSKDGRCNIEFGNVEAQSRFIFFVDIWTTVLDLKWRY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MMLVFSASFVVHWLVFAVLWYVLAEMNGDLELDHDAPPENHTICVKYITSFTAAFSFSLE
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CCDS84 KMTIFITAFLGSWFFFGLLWYAVAYIHKDLPEFH--PSANHTPCVENINGLTSAFLFSLE
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 TQLTIGYGTMFPSGDCPSAIALLAIQMLLGLMLEAFITGAFVAKIARPKNRAFSIRFTDI
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CCDS84 TQVTIGYGFRCVTEQCATAIFLLIFQSILGVIINSFMCGAILAKISRPKKRAKTITFSKN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 AVVAHMDGKPNLIFQVANTRPSPLTSVRVSAVLYQ-----ERENGKLYQTSVDFHLDGIS
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CCDS84 AVISKRGGKLCLLIRVANLRKSLLIGSHIYGKLLKTTVTPEGETIILDQININFVVD--A
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE5 SDECPFFIFPLTYYHSITPSSPL-----ATLLQHENPSHFELVVFLSAMQEGTGEICQRR
..: ::: ::: :: : .::. ::::.. :::::::.. :.:. :: :
CCDS84 GNENLFFISPLTIYHVIDHNSPFFHMAAETLLQQD----FELVVFLDGTVESTSATCQVR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 TSYLQSEIMLHHCFASLLTRGSKCEYQIKMENFDKTVPEFPTPLVSKS-PNRTDLDIHIN
:::. :.. . :: .... .. .:.. ..::.::: : :: . :. :. ...
CCDS84 TSYVPEEVLWGYRFAPIVSKTKEGKYRVDFHNFSKTV-EVETPHCAMCLYNEKDVRARMK
300 310 320 330 340 350
350 360
pF1KE5 -GQSIDNFQISETGLTE
: . :: .::.. :.
CCDS84 RGYDNPNFILSEVNETDDTKM
360 370
>>CCDS8476.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 (391 aa)
initn: 669 init1: 324 opt: 733 Z-score: 904.6 bits: 176.1 E(32554): 4.6e-44
Smith-Waterman score: 733; 37.7% identity (67.0% similar) in 361 aa overlap (14-360:36-387)
10 20 30 40
pF1KE5 MDSSNCKVIAPLLSQRYRRMVTKDGHSTLQMDG--AQRGLAYL
:.. :.:.:::. .... . :: . ..
CCDS84 RNVFDTLIRVLTESMFKHLRKWVVTRFFGHSRQRARLVSKDGRCNIEFGNVEAQSRFIFF
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 RDAWGILMDMRWRWMMLVFSASFVVHWLVFAVLWYVLAEMNGDLELDHDAPPENHTICVK
: : ..:..::. : .: ..:. :. :..:::..: .. :: : : ::: ::.
CCDS84 VDIWTTVLDLKWRYKMTIFITAFLGSWFFFGLLWYAVAYIHKDLPEFH--PSANHTPCVE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 YITSFTAAFSFSLETQLTIGYGTMFPSGDCPSAIALLAIQMLLGLMLEAFITGAFVAKIA
:...:.:: ::::::.::::: . .: .:: :: .: .::.....:. ::..:::.
CCDS84 NINGLTSAFLFSLETQVTIGYGFRCVTEQCATAIFLLIFQSILGVIINSFMCGAILAKIS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KE5 RPKNRAFSIRFTDIAVVAHMDGKPNLIFQVANTRPSPLTSVRVSAVLYQ-----ERENGK
:::.:: .: :. ::... :: :...::: : : : . .. . : . : :.
CCDS84 RPKKRAKTITFSKNAVISKRGGKLCLLIRVANLRKSLLIGSHIYGKLLKTTVTPEGETII
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 LYQTSVDFHLDGISSDECPFFIFPLTYYHSITPSSPL-----ATLLQHENPSHFELVVFL
: : ...: .: ...: ::: ::: :: : .::. ::::.. :::::::
CCDS84 LDQININFVVD--AGNENLFFISPLTIYHVIDHNSPFFHMAAETLLQQD----FELVVFL
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 SAMQEGTGEICQRRTSYLQSEIMLHHCFASLLTRGSKCEYQIKMENFDKTVPEFPTPLVS
.. :.:. :: ::::. :.. . :: .... .. .:.. ..::.::: : :: .
CCDS84 DGTVESTSATCQVRTSYVPEEVLWGYRFAPIVSKTKEGKYRVDFHNFSKTV-EVETPHCA
300 310 320 330 340 350
340 350 360
pF1KE5 KS-PNRTDLDIHIN-GQSIDNFQISETGLTE
:. :. ... : . :: .::.. :.
CCDS84 MCLYNEKDVRARMKRGYDNPNFILSEVNETDDTKM
360 370 380 390
>>CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17 (427 aa)
initn: 612 init1: 323 opt: 676 Z-score: 833.8 bits: 163.1 E(32554): 4e-40
Smith-Waterman score: 676; 37.8% identity (65.9% similar) in 323 aa overlap (15-331:42-357)
10 20 30 40
pF1KE5 MDSSNCKVIAPLLSQRYRRMVTKDGHSTLQ-MDGAQRGLAYLRD
: :.: :::: ..: .. ...: :: :
CCDS11 VSSEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFINVGEKGQRYLAD
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 AWGILMDMRWRWMMLVFSASFVVHWLVFAVLWYVLAEMNGDLELDHDAPPENHTICVKYI
. .:.:::::...: .::. :: :. .....: ..::: :: :... ::. .
CCDS11 IFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDL----DASKEGKA-CVSEV
80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 TSFTAAFSFSLETQLTIGYGTMFPSGDCPSAIALLAIQMLLGLMLEAFITGAFVAKIARP
.:::::: ::.::: ::::: . .:: :. ....: ..: ...::: :: .::.:.:
CCDS11 NSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFIIGAVMAKMAKP
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 KNRAFSIRFTDIAVVAHMDGKPNLIFQVANTRPSPLTSVRVSAVLYQER---ENGKLYQT
:.: .. :. ::.: ::: :...:.: : : :. ..: : : . : :. .
CCDS11 KKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRITSEGEYIPLD
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KE5 SVDFHLDGISSDECPFFIFPLTYYHSITPSSPLATLLQHE-NPSHFELVVFLSAMQEGTG
..:... :. . :.. :.: : : .::: : ... . . ::.::.: .: :.:.
CCDS11 QIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIVVILEGMVEATA
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 EICQRRTSYLQSEIMLHHCFASLLTRGSKCEYQIKMENFDKTVPEFP-TPLVSKSPNRTD
: :.::: .::. : . .: . : :.. . : :: : : ::: :
CCDS11 MTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFE-EKHYYKVDYSRFHKTY-EVPNTPLCSARDLAEK
310 320 330 340 350 360
340 350 360
pF1KE5 LDIHINGQSIDNFQISETGLTE
CCDS11 KYILSNANSFCYENEVALTSKEEDDSENGVPESTSTDTPPDIDLHNQASVPLEPRPLRRE
370 380 390 400 410 420
>>CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs108|chr19 (436 aa)
initn: 553 init1: 310 opt: 675 Z-score: 832.4 bits: 162.9 E(32554): 4.8e-40
Smith-Waterman score: 675; 38.9% identity (65.6% similar) in 334 aa overlap (10-331:39-362)
10 20 30
pF1KE5 MDSSNCKVIAPLLS---QRYRRMVTKDGHSTLQ-MDGAQ
::. : .: :.: :::: ... .. .
CCDS12 RLSGALDSGDSRAGDEEEAGPGLCRNGWAPAPVQSPVGRRRGRFVKKDGHCNVRFVNLGG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
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: ....:: ::: :.:::: .::::. . .::.:.: ...: . : .:.::..::
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160 170 180 190 200 210
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220 230 240 250 260
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:. :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]