Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1524
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1524, 661 aa
  1>>>pF1KE1524 661 - 661 aa - 661 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8055+/-0.00107; mu= -8.4738+/- 0.064
 mean_var=450.5678+/-99.041, 0's: 0 Z-trim(115.5): 439  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.060422
 statistics sampled from 15553 (16072) to 15553 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.789), E-opt: 0.2 (0.494), width:  16
 Scan time:  4.770

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS45602.1 TNK1 gene_id:8711|Hs108|chr17          ( 661) 4609 416.4 6.3e-116
CCDS58510.1 TNK1 gene_id:8711|Hs108|chr17          ( 666) 4589 414.7 2.1e-115
CCDS33927.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3          (1086) 1347 132.3 3.6e-30
CCDS33928.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3          (1038) 1326 130.4 1.2e-29
CCDS77875.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3          (1040) 1326 130.4 1.2e-29
CCDS45667.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17         (1225)  639 70.6 1.5e-11
CCDS74052.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17         (1240)  639 70.6 1.5e-11
CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17         (1255)  639 70.6 1.5e-11
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8            (1052)  627 69.5 2.7e-11
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8           (1065)  627 69.5 2.8e-11
CCDS6057.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8           (1009)  623 69.1 3.4e-11
CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2          (1292)  619 68.9 5.1e-11
CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2           (1308)  619 68.9 5.2e-11
CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7            (1210)  618 68.8 5.2e-11
CCDS6058.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8           ( 967)  615 68.4 5.3e-11
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7           ( 976)  607 67.7 8.7e-11


>>CCDS45602.1 TNK1 gene_id:8711|Hs108|chr17               (661 aa)
 initn: 4609 init1: 4609 opt: 4609  Z-score: 2194.7  bits: 416.4 E(32554): 6.3e-116
Smith-Waterman score: 4609; 100.0% identity (100.0% similar) in 661 aa overlap (1-661:1-661)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MLPEAGSLWLLKLLRDIQLAQFYWPILEELNVTRPEHFDFVKPEDLDGIGMGRPAQRRLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MLPEAGSLWLLKLLRDIQLAQFYWPILEELNVTRPEHFDFVKPEDLDGIGMGRPAQRRLS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 EALKRLRSGPKSKNWVYKILGGFAPEHKEPTLPSDSPRHLPEPEGGLKCLIPEGAVCRGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EALKRLRSGPKSKNWVYKILGGFAPEHKEPTLPSDSPRHLPEPEGGLKCLIPEGAVCRGE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 LLGSGCFGVVHRGLWTLPSGKSVPVAVKSLRVGPEGPMGTELGDFLREVSVMMNLEHPHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLGSGCFGVVHRGLWTLPSGKSVPVAVKSLRVGPEGPMGTELGDFLREVSVMMNLEHPHV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 LRLHGLVLGQPLQMVMELAPLGSLHARLTAPAPTPPLLVALLCLFLRQLAGAMAYLGARG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LRLHGLVLGQPLQMVMELAPLGSLHARLTAPAPTPPLLVALLCLFLRQLAGAMAYLGARG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 LVHRDLATRNLLLASPRTIKVADFGLVRPLGGARGRYVMGGPRPIPYAWCAPESLRHGAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LVHRDLATRNLLLASPRTIKVADFGLVRPLGGARGRYVMGGPRPIPYAWCAPESLRHGAF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 SSASDVWMFGVTLWEMFSGGEEPWAGVPPYLILQRLEDRARLPRPPLCSRALYSLALRCW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SSASDVWMFGVTLWEMFSGGEEPWAGVPPYLILQRLEDRARLPRPPLCSRALYSLALRCW
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 APHPADRPSFSHLEGLLQEAGPSEACCVRDVTEPGALRMETGDPITVIEGSPDSTIWKGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 APHPADRPSFSHLEGLLQEAGPSEACCVRDVTEPGALRMETGDPITVIEGSPDSTIWKGQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 NGRTFKVGSFPASAVTLADAGGLPATRPVHRGTPARGDQHPGSIDGDRKKANLWDAPPAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NGRTFKVGSFPASAVTLADAGGLPATRPVHRGTPARGDQHPGSIDGDRKKANLWDAPPAR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 GQRRNMPLERMKGISRSLESVLSLGPRPTGGGSSPPEIRQARAVPQGPPGLPPRPPLSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GQRRNMPLERMKGISRSLESVLSLGPRPTGGGSSPPEIRQARAVPQGPPGLPPRPPLSSS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 SPQPSQPSRERLPWPKRKPPHNHPMGMPGARKAAALSGGLLSDPELQRKIMEVELSVHGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SPQPSQPSRERLPWPKRKPPHNHPMGMPGARKAAALSGGLLSDPELQRKIMEVELSVHGV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE1 THQECQTALGATGGDVVSAIRNLKVDQLFHLSSRSRADCWRILEHYQWDLSAASRYVLAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 THQECQTALGATGGDVVSAIRNLKVDQLFHLSSRSRADCWRILEHYQWDLSAASRYVLAR
              610       620       630       640       650       660

        
pF1KE1 P
       :
CCDS45 P
        

>>CCDS58510.1 TNK1 gene_id:8711|Hs108|chr17               (666 aa)
 initn: 2907 init1: 2862 opt: 4589  Z-score: 2185.2  bits: 414.7 E(32554): 2.1e-115
Smith-Waterman score: 4589; 99.2% identity (99.2% similar) in 666 aa overlap (1-661:1-666)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MLPEAGSLWLLKLLRDIQLAQFYWPILEELNVTRPEHFDFVKPEDLDGIGMGRPAQRRLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MLPEAGSLWLLKLLRDIQLAQFYWPILEELNVTRPEHFDFVKPEDLDGIGMGRPAQRRLS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 EALKRLRSGPKSKNWVYKILGGFAPEHKEPTLPSDSPRHLPEPEGGLKCLIPEGAVCRGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EALKRLRSGPKSKNWVYKILGGFAPEHKEPTLPSDSPRHLPEPEGGLKCLIPEGAVCRGE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 LLGSGCFGVVHRGLWTLPSGKSVPVAVKSLRVGPEGPMGTELGDFLREVSVMMNLEHPHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLGSGCFGVVHRGLWTLPSGKSVPVAVKSLRVGPEGPMGTELGDFLREVSVMMNLEHPHV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 LRLHGLVLGQPLQMVMELAPLGSLHARLTAPAPTPPLLVALLCLFLRQLAGAMAYLGARG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LRLHGLVLGQPLQMVMELAPLGSLHARLTAPAPTPPLLVALLCLFLRQLAGAMAYLGARG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 LVHRDLATRNLLLASPRTIKVADFGLVRPLGGARGRYVMGGPRPIPYAWCAPESLRHGAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LVHRDLATRNLLLASPRTIKVADFGLVRPLGGARGRYVMGGPRPIPYAWCAPESLRHGAF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 SSASDVWMFGVTLWEMFSGGEEPWAGVPPYLILQRLEDRARLPRPPLCSRALYSLALRCW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SSASDVWMFGVTLWEMFSGGEEPWAGVPPYLILQRLEDRARLPRPPLCSRALYSLALRCW
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410          
pF1KE1 APHPADRPSFSHLEGLLQEAGPSEACCVRDVTEPGALRMETGDPITVIEGS-----PDST
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::     ::::
CCDS58 APHPADRPSFSHLEGLLQEAGPSEACCVRDVTEPGALRMETGDPITVIEGSSSFHSPDST
              370       380       390       400       410       420

         420       430       440       450       460       470     
pF1KE1 IWKGQNGRTFKVGSFPASAVTLADAGGLPATRPVHRGTPARGDQHPGSIDGDRKKANLWD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IWKGQNGRTFKVGSFPASAVTLADAGGLPATRPVHRGTPARGDQHPGSIDGDRKKANLWD
              430       440       450       460       470       480

         480       490       500       510       520       530     
pF1KE1 APPARGQRRNMPLERMKGISRSLESVLSLGPRPTGGGSSPPEIRQARAVPQGPPGLPPRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 APPARGQRRNMPLERMKGISRSLESVLSLGPRPTGGGSSPPEIRQARAVPQGPPGLPPRP
              490       500       510       520       530       540

         540       550       560       570       580       590     
pF1KE1 PLSSSSPQPSQPSRERLPWPKRKPPHNHPMGMPGARKAAALSGGLLSDPELQRKIMEVEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PLSSSSPQPSQPSRERLPWPKRKPPHNHPMGMPGARKAAALSGGLLSDPELQRKIMEVEL
              550       560       570       580       590       600

         600       610       620       630       640       650     
pF1KE1 SVHGVTHQECQTALGATGGDVVSAIRNLKVDQLFHLSSRSRADCWRILEHYQWDLSAASR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SVHGVTHQECQTALGATGGDVVSAIRNLKVDQLFHLSSRSRADCWRILEHYQWDLSAASR
              610       620       630       640       650       660

         660 
pF1KE1 YVLARP
       ::::::
CCDS58 YVLARP
             

>>CCDS33927.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3               (1086 aa)
 initn: 1505 init1: 421 opt: 1347  Z-score: 655.2  bits: 132.3 E(32554): 3.6e-30
Smith-Waterman score: 1358; 40.6% identity (63.2% similar) in 601 aa overlap (1-578:64-635)

                                             10        20        30
pF1KE1                               MLPEAGSLWLLKLLRDIQLAQFYWPILEEL
                                     : :: :. :::.:: ..:: :..  . ..:
CCDS33 AGIWGSMGERSAYQRLAGGEEGPQRLGGGRMQPEEGTGWLLELLSEVQLQQYFLRLRDDL
            40        50        60        70        80        90   

               40        50        60        70        80          
pF1KE1 NVTRPEHFDFVKPEDLDGIGMGRPAQRRLSEALKRLRSGPKSKNWVYKILGG------FA
       ::::  ::..:: :::. ::::::.:::: ::.:: ..  : :.:. :...:      : 
CCDS33 NVTRLSHFEYVKNEDLEKIGMGRPGQRRLWEAVKRRKALCKRKSWMSKVFSGKRLEAEFP
           100       110       120       130       140       150   

           90       100           110       120       130       140
pF1KE1 PEHKEPTLPSDSPRHL-PEPEGGLK---CLIPEGAVCRGELLGSGCFGVVHRGLWTLPSG
       :.:.. :. . ::    :  :: :.   ::: :  .   : ::.: ::::.:: :  :::
CCDS33 PHHSQSTFRKTSPAPGGPAGEGPLQSLTCLIGEKDLRLLEKLGDGSFGVVRRGEWDAPSG
           160       170       180       190       200       210   

              150       160        170       180       190         
pF1KE1 KSVPVAVKSLRVGPEGPMGTE-LGDFLREVSVMMNLEHPHVLRLHGLVLGQPLQMVMELA
       :.: :::: :.  :.     : . ::.:::..: .:.: ...::.:.::  :..:: :::
CCDS33 KTVSVAVKCLK--PDVLSQPEAMDDFIREVNAMHSLDHRNLIRLYGVVLTPPMKMVTELA
           220         230       240       250       260       270 

     200       210       220       230       240       250         
pF1KE1 PLGSLHARLTAPAPTPPLLVALLCLFLRQLAGAMAYLGARGLVHRDLATRNLLLASPRTI
       :::::  ::        .:.. :  .  :.: .:.:: .. ..:::::.::::::.   .
CCDS33 PLGSLLDRLRKHQGH--FLLGTLSRYAVQVAEGMGYLESKRFIHRDLAARNLLLATRDLV
             280         290       300       310       320         

     260       270       280       290       300       310         
pF1KE1 KVADFGLVRPLGGARGRYVMGGPRPIPYAWCAPESLRHGAFSSASDVWMFGVTLWEMFSG
       :..::::.: :     .:::   : .:.::::::::.  .:: :::.:::::::::::. 
CCDS33 KIGDFGLMRALPQNDDHYVMQEHRKVPFAWCAPESLKTRTFSHASDTWMFGVTLWEMFTY
     330       340       350       360       370       380         

     320       330       340        350       360       370        
pF1KE1 GEEPWAGVPPYLILQRLEDRA-RLPRPPLCSRALYSLALRCWAPHPADRPSFSHLEGLLQ
       :.::: :.    ::.... .. :::::  : . .:.. ..::: .: :::.:  :. .: 
CCDS33 GQEPWIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDCPQDIYNVMVQCWAHKPEDRPTFVALRDFLL
     390       400       410       420       430       440         

      380       390       400       410       420       430        
pF1KE1 EAGPSEACCVRDVTEPGALRMETGDPITVIEGSPDSTIWKGQNGRTFKVGSFPASAVTLA
       :: :..   ..:  ::  :... .: ::::::  ..  :.::: ::. :: :: ..::  
CCDS33 EAQPTDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIEGRAENYWWRGQNTRTLCVGPFPRNVVT--
     450       460       470       480       490       500         

      440          450       460       470       480        490    
pF1KE1 DAGGLPA---TRPVHRGTPARGDQHPGSIDGDRKKANLWDAPPARGQRR-NMPLERMKGI
       ...:: :   ..:.. .       : :  :.: ..   :  :    .   . :..    .
CCDS33 SVAGLSAQDISQPLQNSFI-----HTGHGDSDPRHC--WGFPDRIDELYLGNPMDPPDLL
       510       520            530         540       550       560

          500       510       520       530       540       550    
pF1KE1 SRSLESVLSLGPRPTGGGSSPPEIRQARAVPQGPPGLPPRPPLSSSSPQPSQPSRERLPW
       :  : .  :  :.  ::            : . ::  ::.: . ...:  .  :... : 
CCDS33 SVELST--SRPPQHLGG------------VKREPPPRPPQPAFFTQKPTYDPVSEDQDPL
                570                   580       590       600      

                 560       570       580       590       600       
pF1KE1 PK-------RKPPHNHPMGMPGARKAAALSGGLLSDPELQRKIMEVELSVHGVTHQECQT
        .       :::  . : :.  :. .: . :                             
CCDS33 SSDFKRLGLRKP--GLPRGLWLAKPSARVPGTKASRGSGAEVTLIDFGEEPVVPALRPCA
        610         620       630       640       650       660    

       610       620       630       640       650       660       
pF1KE1 ALGATGGDVVSAIRNLKVDQLFHLSSRSRADCWRILEHYQWDLSAASRYVLARP      
                                                                   
CCDS33 PSLAQLAMDACSLLDETPPQSPTRALPRPLHPTPVVDWDARPLPPPPAYDDVAQDEDDFE
          670       680       690       700       710       720    

>>CCDS33928.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3               (1038 aa)
 initn: 1677 init1: 421 opt: 1326  Z-score: 645.6  bits: 130.4 E(32554): 1.2e-29
Smith-Waterman score: 1328; 40.8% identity (63.2% similar) in 593 aa overlap (1-575:1-566)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MLPEAGSLWLLKLLRDIQLAQFYWPILEELNVTRPEHFDFVKPEDLDGIGMGRPAQRRLS
       : :: :. :::.:: ..:: :..  . ..:::::  ::..:: :::. ::::::.:::: 
CCDS33 MQPEEGTGWLLELLSEVQLQQYFLRLRDDLNVTRLSHFEYVKNEDLEKIGMGRPGQRRLW
               10        20        30        40        50        60

               70        80              90       100           110
pF1KE1 EALKRLRSGPKSKNWVYKILGG------FAPEHKEPTLPSDSPRHL-PEPEGGLK---CL
       ::.:: ..  : :.:. :...:      : :.:.. :. . ::    :  :: :.   ::
CCDS33 EAVKRRKALCKRKSWMSKVFSGKRLEAEFPPHHSQSTFRKTSPAPGGPAGEGPLQSLTCL
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150       160          
pF1KE1 IPEGAVCRGELLGSGCFGVVHRGLWTLPSGKSVPVAVKSLRVGPEGPMGTE-LGDFLREV
       : :  .   : ::.: ::::.:: :  ::::.: :::: :.  :.     : . ::.:::
CCDS33 IGEKDLRLLEKLGDGSFGVVRRGEWDAPSGKTVSVAVKCLK--PDVLSQPEAMDDFIREV
              130       140       150       160         170        

     170       180       190       200       210       220         
pF1KE1 SVMMNLEHPHVLRLHGLVLGQPLQMVMELAPLGSLHARLTAPAPTPPLLVALLCLFLRQL
       ..: .:.: ...::.:.::  :..:: ::::::::  ::        .:.. :  .  :.
CCDS33 NAMHSLDHRNLIRLYGVVLTPPMKMVTELAPLGSLLDRLRKHQG--HFLLGTLSRYAVQV
      180       190       200       210       220         230      

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE1 AGAMAYLGARGLVHRDLATRNLLLASPRTIKVADFGLVRPLGGARGRYVMGGPRPIPYAW
       : .:.:: .. ..:::::.::::::.   .:..::::.: :     .:::   : .:.::
CCDS33 AEGMGYLESKRFIHRDLAARNLLLATRDLVKIGDFGLMRALPQNDDHYVMQEHRKVPFAW
        240       250       260       270       280       290      

     290       300       310       320       330       340         
pF1KE1 CAPESLRHGAFSSASDVWMFGVTLWEMFSGGEEPWAGVPPYLILQRLEDRA-RLPRPPLC
       ::::::.  .:: :::.:::::::::::. :.::: :.    ::.... .. :::::  :
CCDS33 CAPESLKTRTFSHASDTWMFGVTLWEMFTYGQEPWIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDC
        300       310       320       330       340       350      

      350       360       370       380       390       400        
pF1KE1 SRALYSLALRCWAPHPADRPSFSHLEGLLQEAGPSEACCVRDVTEPGALRMETGDPITVI
        . .:.. ..::: .: :::.:  :. .: :: :..   ..:  ::  :... .: ::::
CCDS33 PQDIYNVMVQCWAHKPEDRPTFVALRDFLLEAQPTDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVI
        360       370       380       390       400       410      

      410       420       430       440          450       460     
pF1KE1 EGSPDSTIWKGQNGRTFKVGSFPASAVTLADAGGLPA---TRPVHRGTPARGDQHPGSID
       ::  ..  :.::: ::. :: :: ..::  ...:: :   ..:.. .       : :  :
CCDS33 EGRAENYWWRGQNTRTLCVGPFPRNVVT--SVAGLSAQDISQPLQNSF-----IHTGHGD
        420       430       440         450       460              

         470       480        490       500       510       520    
pF1KE1 GDRKKANLWDAPPARGQRR-NMPLERMKGISRSLESVLSLGPRPTGGGSSPPEIRQARAV
       .: ..   :  :    .   . :..    .:  : .  :  :.  ::      ...    
CCDS33 SDPRHC--WGFPDRIDELYLGNPMDPPDLLSVELST--SRPPQHLGG------VKK----
     470         480       490       500         510               

          530       540         550       560       570       580  
pF1KE1 PQGPPGLPPRPPLSSSSPQPS--QPSRERLPWPKRKPPHNHPMGMPGARKAAALSGGLLS
       :   :    . ::::.  . .  .:.  :  :   ::    : :  ..: ..:       
CCDS33 PTYDPVSEDQDPLSSDFKRLGLRKPGLPRGLW-LAKPSARVP-GTKASRGSGAEVTLIDF
         520       530       540        550        560       570   

            590       600       610       620       630       640  
pF1KE1 DPELQRKIMEVELSVHGVTHQECQTALGATGGDVVSAIRNLKVDQLFHLSSRSRADCWRI
                                                                   
CCDS33 GEEPVVPALRPCAPSLAQLAMDACSLLDETPPQSPTRALPRPLHPTPVVDWDARPLPPPP
           580       590       600       610       620       630   

>>CCDS77875.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3               (1040 aa)
 initn: 1505 init1: 421 opt: 1326  Z-score: 645.5  bits: 130.4 E(32554): 1.2e-29
Smith-Waterman score: 1328; 40.8% identity (63.2% similar) in 593 aa overlap (1-575:33-598)

                                             10        20        30
pF1KE1                               MLPEAGSLWLLKLLRDIQLAQFYWPILEEL
                                     : :: :. :::.:: ..:: :..  . ..:
CCDS77 AARRFPGLELSFPLLARLRRRLYTRLGGGRMQPEEGTGWLLELLSEVQLQQYFLRLRDDL
             10        20        30        40        50        60  

               40        50        60        70        80          
pF1KE1 NVTRPEHFDFVKPEDLDGIGMGRPAQRRLSEALKRLRSGPKSKNWVYKILGG------FA
       ::::  ::..:: :::. ::::::.:::: ::.:: ..  : :.:. :...:      : 
CCDS77 NVTRLSHFEYVKNEDLEKIGMGRPGQRRLWEAVKRRKALCKRKSWMSKVFSGKRLEAEFP
             70        80        90       100       110       120  

           90       100           110       120       130       140
pF1KE1 PEHKEPTLPSDSPRHL-PEPEGGLK---CLIPEGAVCRGELLGSGCFGVVHRGLWTLPSG
       :.:.. :. . ::    :  :: :.   ::: :  .   : ::.: ::::.:: :  :::
CCDS77 PHHSQSTFRKTSPAPGGPAGEGPLQSLTCLIGEKDLRLLEKLGDGSFGVVRRGEWDAPSG
            130       140       150       160       170       180  

              150       160        170       180       190         
pF1KE1 KSVPVAVKSLRVGPEGPMGTE-LGDFLREVSVMMNLEHPHVLRLHGLVLGQPLQMVMELA
       :.: :::: :.  :.     : . ::.:::..: .:.: ...::.:.::  :..:: :::
CCDS77 KTVSVAVKCLK--PDVLSQPEAMDDFIREVNAMHSLDHRNLIRLYGVVLTPPMKMVTELA
            190         200       210       220       230       240

     200       210       220       230       240       250         
pF1KE1 PLGSLHARLTAPAPTPPLLVALLCLFLRQLAGAMAYLGARGLVHRDLATRNLLLASPRTI
       :::::  ::        .:.. :  .  :.: .:.:: .. ..:::::.::::::.   .
CCDS77 PLGSLLDRLRKHQG--HFLLGTLSRYAVQVAEGMGYLESKRFIHRDLAARNLLLATRDLV
              250         260       270       280       290        

     260       270       280       290       300       310         
pF1KE1 KVADFGLVRPLGGARGRYVMGGPRPIPYAWCAPESLRHGAFSSASDVWMFGVTLWEMFSG
       :..::::.: :     .:::   : .:.::::::::.  .:: :::.:::::::::::. 
CCDS77 KIGDFGLMRALPQNDDHYVMQEHRKVPFAWCAPESLKTRTFSHASDTWMFGVTLWEMFTY
      300       310       320       330       340       350        

     320       330       340        350       360       370        
pF1KE1 GEEPWAGVPPYLILQRLEDRA-RLPRPPLCSRALYSLALRCWAPHPADRPSFSHLEGLLQ
       :.::: :.    ::.... .. :::::  : . .:.. ..::: .: :::.:  :. .: 
CCDS77 GQEPWIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDCPQDIYNVMVQCWAHKPEDRPTFVALRDFLL
      360       370       380       390       400       410        

      380       390       400       410       420       430        
pF1KE1 EAGPSEACCVRDVTEPGALRMETGDPITVIEGSPDSTIWKGQNGRTFKVGSFPASAVTLA
       :: :..   ..:  ::  :... .: ::::::  ..  :.::: ::. :: :: ..::  
CCDS77 EAQPTDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIEGRAENYWWRGQNTRTLCVGPFPRNVVT--
      420       430       440       450       460       470        

      440          450       460       470       480        490    
pF1KE1 DAGGLPA---TRPVHRGTPARGDQHPGSIDGDRKKANLWDAPPARGQRR-NMPLERMKGI
       ...:: :   ..:.. .       : :  :.: ..   :  :    .   . :..    .
CCDS77 SVAGLSAQDISQPLQNSF-----IHTGHGDSDPRHC--WGFPDRIDELYLGNPMDPPDLL
        480       490            500         510       520         

          500       510       520       530       540         550  
pF1KE1 SRSLESVLSLGPRPTGGGSSPPEIRQARAVPQGPPGLPPRPPLSSSSPQPS--QPSRERL
       :  : .  :  :.  ::      ...    :   :    . ::::.  . .  .:.  : 
CCDS77 SVELST--SRPPQHLGG------VKK----PTYDPVSEDQDPLSSDFKRLGLRKPGLPRG
     530         540                 550       560       570       

            560       570       580       590       600       610  
pF1KE1 PWPKRKPPHNHPMGMPGARKAAALSGGLLSDPELQRKIMEVELSVHGVTHQECQTALGAT
        :   ::    : :  ..: ..:                                     
CCDS77 LW-LAKPSARVP-GTKASRGSGAEVTLIDFGEEPVVPALRPCAPSLAQLAMDACSLLDET
        580        590       600       610       620       630     

>>CCDS45667.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17              (1225 aa)
 initn: 471 init1: 265 opt: 639  Z-score: 321.0  bits: 70.6 E(32554): 1.5e-11
Smith-Waterman score: 647; 30.0% identity (55.6% similar) in 513 aa overlap (89-583:668-1153)

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>>CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17              (1255 aa)
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>>CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8                 (1052 aa)
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       90       100       110       120       130       140        
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                                     :. .: : :: ::.:..  : . .. ::.:
CCDS63 DDYAEIIDEEDTYTMPSTRDYEIQRERIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPALAVAIK
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pF1KE1 SLRVGPEGPMGTELGDFLREVSVMMNLEHPHVLRLHGLVLGQPLQMVMELAPLGSLHARL
       . .      .  .   ::.:. .: ...:::...: :..  .:. ..:::  :: :.. :
CCDS63 TCKNCTSDSVREK---FLQEALTMRQFDHPHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFL
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pF1KE1 TAPAPTPPLLVALLCLFLRQLAGAMAYLGARGLVHRDLATRNLLLASPRTIKVADFGLVR
        .   .  : .: : :.  ::. :.::: .. .::::.:.::.:..:   .:..:::: :
CCDS63 QVRKYS--LDLASLILYAYQLSTALAYLESKRFVHRDIAARNVLVSSNDCVKLGDFGLSR
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        .    . :  ..   .:  : ::::.    :.:::::::::: .::..  : .:. :: 
CCDS63 YM--EDSTYYKASKGKLPIKWMAPESINFRRFTSASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVK
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pF1KE1 PYLILQRLEDRARLPRPPLCSRALYSLALRCWAPHPADRPSFSHLEG----LLQEAGPSE
          .. :.:.  ::: :: :  .::::  .:::  :. :: :..:..    .:.:   ..
CCDS63 NNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKAQQ
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pF1KE1 ACCVR----------------DVTEPGALRMETGDPITVIEG---SPDSTI---------
          .:                : . :   :    .: .  ::   ::.  .         
CCDS63 EERMRMESRRQATVSWDSGGSDEAPPKPSRPGYPSPRSS-EGFYPSPQHMVQTNHYQVSG
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pF1KE1 WKGQNGRTFKVGS-FPASAVTLADAGGLPATRP--VHRGTPARGDQHPGSIDGDRK--KA
       . :..: :  .:: .:..: .: :       ::  .    :   :.   .. :  .   .
CCDS63 YPGSHGITAMAGSIYPGQA-SLLDQTDSWNHRPQEIAMWQPNVEDSTVLDLRGIGQVLPT
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pF1KE1 NLWDAPPARGQRRNMPLER-MKGISRSLES--VLSLGP--RPTGGGSSP---PEIRQ--A
       .: .    : :..    .: ..   : :.    :: :   :  :. ..:    .: :  .
CCDS63 HLMEERLIRQQQEMEEDQRWLEKEERFLKPDVRLSRGSIDREDGSLQGPIGNQHIYQPVG
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pF1KE1 RAVPQGPPGLPPRP--P-----LSS-SSPQPSQPSRERLPWPKRKPPHNHPMGMPGARKA
       .  : .::  ::::  :     :.: :::  :     .:   . .:: .  .   . .  
CCDS63 KPDPAAPPKKPPRPGAPGHLGSLASLSSPADSYNEGVKLQPQEISPPPTANLDRSNDKVY
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         ..: . .  :.. ::                                           
CCDS63 ENVTGLVKAVIEMSSKIQPAPPEEYVPMVKEVGLALRTLLATVDETIPLLPASTHREIEM
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>>CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8                (1065 aa)
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Smith-Waterman score: 643; 29.5% identity (53.7% similar) in 484 aa overlap (119-569:425-893)

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pF1KE1 EPTLPSDSPRHLPEPEGGLKCLIPEGAVCRGELLGSGCFGVVHRGLWTLPSGKSVPVAVK
                                     :. .: : :: ::.:..  : . .. ::.:
CCDS56 DDYAEIIDEEDTYTMPSTRDYEIQRERIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPALAVAIK
          400       410       420       430       440       450    

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pF1KE1 SLRVGPEGPMGTELGDFLREVSVMMNLEHPHVLRLHGLVLGQPLQMVMELAPLGSLHARL
       . .      .  .   ::.:. .: ...:::...: :..  .:. ..:::  :: :.. :
CCDS56 TCKNCTSDSVREK---FLQEALTMRQFDHPHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFL
          460          470       480       490       500       510 

      210       220       230       240       250       260        
pF1KE1 TAPAPTPPLLVALLCLFLRQLAGAMAYLGARGLVHRDLATRNLLLASPRTIKVADFGLVR
        .   .  : .: : :.  ::. :.::: .. .::::.:.::.:..:   .:..:::: :
CCDS56 QVRKYS--LDLASLILYAYQLSTALAYLESKRFVHRDIAARNVLVSSNDCVKLGDFGLSR
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pF1KE1 PLGGARGRYVMGGPRPIPYAWCAPESLRHGAFSSASDVWMFGVTLWEMFSGGEEPWAGVP
        .    . :  ..   .:  : ::::.    :.:::::::::: .::..  : .:. :: 
CCDS56 YM--EDSTYYKASKGKLPIKWMAPESINFRRFTSASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVK
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pF1KE1 PYLILQRLEDRARLPRPPLCSRALYSLALRCWAPHPADRPSFSHLEGLLQEAGPSEACCV
          .. :.:.  ::: :: :  .::::  .:::  :. :: :..:.. :.     :    
CCDS56 NNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEK---
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pF1KE1 RDVTEPGALRMETGDPITVI--EGSPDSTIWK----GQNGRTFKVGSFPASAVTLA----
         . .   .:::.    ::    :. : .  :    :  .   . : .:.    .     
CCDS56 --AQQEERMRMESRRQATVSWDSGGSDEAPPKPSRPGYPSPRSSEGFYPSPQHMVQTNHY
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pF1KE1 DAGGLPATRPVHRGTPARGDQHPG---------SIDGDRKKANLW-----DAP--PARGQ
       ...: :..   :  :   :. .::         : .   ..  .:     :.     :: 
CCDS56 QVSGYPGS---HGITAMAGSIYPGQASLLDQTDSWNHRPQEIAMWQPNVEDSTVLDLRGI
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pF1KE1 RRNMPLERMKGISRSLESVLSLGPRPTGGGSS--PPEIRQARAVPQGPPGLPPRPPLSSS
        . .: . :.      .. .    :          :..: .:.  .   :    :  .. 
CCDS56 GQVLPTHLMEERLIRQQQEMEEDQRWLEKEERFLKPDVRLSRGSIDREDGSLQGPIGNQH
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pF1KE1 SPQP-SQPSRERLPWPKRKP---PHNHPM-GMPGARKAAALSGGLLSDPELQRKIMEVEL
         :: ..:..:.  : .:.:   :.. :  : ::                          
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661 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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