FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6714, 1184 aa 1>>>pF1KE6714 1184 - 1184 aa - 1184 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4164+/-0.00122; mu= 16.8610+/- 0.073 mean_var=114.1960+/-21.324, 0's: 0 Z-trim(104.5): 99 B-trim: 2 in 1/51 Lambda= 0.120019 statistics sampled from 7823 (7911) to 7823 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.593), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16 Scan time: 4.040 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10203.1 CILP gene_id:8483|Hs108|chr15 (1184) 8118 1418.1 0 CCDS12405.1 CILP2 gene_id:148113|Hs108|chr19 (1156) 3576 631.7 3.1e-180 >>CCDS10203.1 CILP gene_id:8483|Hs108|chr15 (1184 aa) initn: 8118 init1: 8118 opt: 8118 Z-score: 7599.4 bits: 1418.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 8118; 99.7% identity (100.0% similar) in 1184 aa overlap (1-1184:1-1184) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 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CCDS12 SEWTSWFNVDHPGGDGDFESLAAIRFYYGPARVCPRPLALEARTTDWALPSAVGERVHLN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 PREGFWCLNREQRPGQNCSNYTVRFLCPPGSLRRDTERIWSPWSPWSKCSAACGQTGVQT : .::::::::: :. :::: ::: :: : :. :.::. ::..:: : . CCDS12 PTRGFWCLNREQPRGRRCSNYHVRFRCP-------LEASWGAWGPWGPCSGSCGP-GRRL 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 RTRICLAEMVSLCSEASEEGQHCMGQDCTACDLTCPMGQVNADCDACMCQDFMLHGAVSL : : : . . : :.:.:. : .:.: :.: : : .: :.: CCDS12 RRRHCPSPAGDACPGRPLEAQKCVRPRCPGCSL-----------DTCECPDHILLGSVVT 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 PGGAPASGAAIYLLTKTPKLLTQTDSDGRFRIPGLCPDGKSILKITKVKF-APIVLTMPK :.: : :: . : . : .. .:. : ::.::.: :... .. : : . .. . CCDS12 PSGQPLLGARVSLRDQ-PGTVATSDAHGTFRVPGVCADSRANIRAQMDGFSAGEAQAQAN 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 TSLKAATIKAEFVRAETPYMVMNPETKARRAGQSVSLCCKATGKPRPDKYFWYHNDTLLD :....:: . . : ::.: .::...:.:::.:..::::.: : : :: :.:: :::: CCDS12 GSISVVTIILD--KLEKPYLVKHPESRVREAGQNVTFCCKASGTPMPKKYSWFHNGTLLD 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 PSLYKHESKLVLRKLQQHQAGEYFCKAQSDAGAVKSKVAQLIVIASDETPCNPVPESYLI . . ..: :: :. ::: : ::: ..::::.: .:.: :.: . :.: :. ::: CCDS12 RRAHGYGAHLELRGLRPDQAGIYHCKAWNEAGAVRSGTARLTVLAPGQPACDPRPREYLI 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 RLPHDCFQNATNSFYYDVGRCPVKTCAGQQDNGIRCRDAVQNCCGISKTEEREIQCSGYT .::.:: : ... : ::: :: : . .. :: :: . ::.. . :.:::.: ::. 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CCDS12 LEDEAPLGELVLPSGAFRRADGKPYSGPVEARVTFVDPRDLTSAASAPSDLRFVDSDGEL 580 590 600 610 620 630 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 FPLRTYGMFSVDFRDEVTSEPLNAGKVKVHLDSTQVKMPEHISTVKLWSLNPDTGLWEEE :::::::::::.: ..: :..: : :.. ..:..:: :. ..:::::::.::::::: CCDS12 APLRTYGMFSVDLRAPGSAEQLQVGPVAVRVAASQIHMPGHVEALKLWSLNPETGLWEEE 640 650 660 670 680 690 720 730 740 750 760 pF1KE6 GDFKFENQR--RNKREDRTFLVGNLEIRERRLFNLDVPESRRCFVKVRAYRSERFLPSEQ . :. :.. : .::.:.:::::.:::::::::::::: :::::::::: ...: :::: CCDS12 SGFRREGSSGPRVRREERVFLVGNVEIRERRLFNLDVPERRRCFVKVRAYANDKFTPSEQ 700 710 720 730 740 750 770 780 790 800 810 820 pF1KE6 IQGVVISVINLEPRTGFLSNPRAWGRFDSVITGPNGACVPAFCDDQSPDAYSAYVLASLA ..:::....:::: :: .::::::::::..:::::::.::::: . ::::.: : :.:. CCDS12 VEGVVVTLVNLEPAPGFSANPRAWGRFDSAVTGPNGACLPAFCDADRPDAYTALVTATLG 760 770 780 790 800 810 830 840 850 860 870 880 pF1KE6 GEELQAVESSPKFNPNAIGVPQPYLNKLNYRRTDHEDPRVKKTAFQISMAKPRPNSAEES ::::. . : :. : ..:: ::::..:.::::::.:: :...:.:..:::::.. :. 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