Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1391
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1391, 934 aa
1>>>pF1KE1391 934 - 934 aa - 934 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6095+/-0.00124; mu= 15.7716+/- 0.074
mean_var=158.8190+/-30.085, 0's: 0 Z-trim(106.7): 145 B-trim: 9 in 1/48
Lambda= 0.101771
statistics sampled from 8981 (9137) to 8981 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 3.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3936.1 C6 gene_id:729|Hs108|chr5 ( 934) 6589 980.9 0
CCDS47201.1 C7 gene_id:730|Hs108|chr5 ( 843) 1087 173.0 2.1e-42
CCDS60152.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 ( 539) 1070 170.3 9e-42
CCDS30730.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 ( 591) 1070 170.3 9.5e-42
CCDS60151.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 ( 529) 980 157.1 8.4e-38
CCDS3929.1 C9 gene_id:735|Hs108|chr5 ( 559) 457 80.3 1.1e-14
CCDS606.1 C8A gene_id:731|Hs108|chr1 ( 584) 413 73.9 1e-12
>>CCDS3936.1 C6 gene_id:729|Hs108|chr5 (934 aa)
initn: 6589 init1: 6589 opt: 6589 Z-score: 5239.9 bits: 980.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6589; 99.9% identity (99.9% similar) in 934 aa overlap (1-934:1-934)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MARRSVLYFILLNALINKGQACFCDHYAWTQWTSCSKTCNSGTQSRHRQIVVDKYYQENF
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CCDS39 MARRSVLYFILLNALINKGQACFCDHYAWTQWTSCSKTCNSGTQSRHRQIVVDKYYQENF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 CEQICSKQETRECNWQRCPINCLLGDFGPWSDCDPCIEKQSKVRSVLRPSQFGGQPCTEP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS39 CEQICSKQETRECNWQRCPINCLLGDFGPWSDCDPCIEKQSKVRSVLRPSQFGGQPCTAP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LVAFQPCIPSKLCKIEEADCKNKFRCDSGRCIARKLECNGENDCGDNSDERDCGRTKAVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LVAFQPCIPSKLCKIEEADCKNKFRCDSGRCIARKLECNGENDCGDNSDERDCGRTKAVC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 TRKYNPIPSVQLMGNGFHFLAGEPRGEVLDNSFTGGICKTVKSSRTSNPYRVPANLENVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 TRKYNPIPSVQLMGNGFHFLAGEPRGEVLDNSFTGGICKTVKSSRTSNPYRVPANLENVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 FEVQTAEDDLKTDFYKDLTSLGHNENQQGSFSSQGGSSFSVPIFYSSKRSENINHNSAFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 FEVQTAEDDLKTDFYKDLTSLGHNENQQGSFSSQGGSSFSVPIFYSSKRSENINHNSAFK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 QAIQASHKKDSSFIRIHKVMKVLNFTTKAKDLHLSDVFLKALNHLPLEYNSALYSRIFDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 QAIQASHKKDSSFIRIHKVMKVLNFTTKAKDLHLSDVFLKALNHLPLEYNSALYSRIFDD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 FGTHYFTSGSLGGVYDLLYQFSSEELKNSGLTEEEAKHCVRIETKKRVLFAKKTKVEHRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 FGTHYFTSGSLGGVYDLLYQFSSEELKNSGLTEEEAKHCVRIETKKRVLFAKKTKVEHRC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 TTNKLSEKHEGSFIQGAEKSISLIRGGRSEYGAALAWEKGSSGLEEKTFSEWLESVKENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 TTNKLSEKHEGSFIQGAEKSISLIRGGRSEYGAALAWEKGSSGLEEKTFSEWLESVKENP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 AVIDFELAPIVDLVRNIPCAVTKRNNLRKALQEYAAKFDPCQCAPCPNNGRPTLSGTECL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 AVIDFELAPIVDLVRNIPCAVTKRNNLRKALQEYAAKFDPCQCAPCPNNGRPTLSGTECL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 CVCQSGTYGENCEKQSPDYKSNAVDGQWGCWSSWSTCDATYKRSRTRECNNPAPQRGGKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 CVCQSGTYGENCEKQSPDYKSNAVDGQWGCWSSWSTCDATYKRSRTRECNNPAPQRGGKR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 CEGEKRQEEDCTFSIMENNGQPCINDDEEMKEVDLPEIEADSGCPQPVPPENGFIRNEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 CEGEKRQEEDCTFSIMENNGQPCINDDEEMKEVDLPEIEADSGCPQPVPPENGFIRNEKQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 LYLVGEDVEISCLTGFETVGYQYFRCLPDGTWRQGDVECQRTECIKPVVQEVLTITPFQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LYLVGEDVEISCLTGFETVGYQYFRCLPDGTWRQGDVECQRTECIKPVVQEVLTITPFQR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 LYRIGESIELTCPKGFVVAGPSRYTCQGNSWTPPISNSLTCEKDTLTKLKGHCQLGQKQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LYRIGESIELTCPKGFVVAGPSRYTCQGNSWTPPISNSLTCEKDTLTKLKGHCQLGQKQS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 GSECICMSPEEDCSHHSEDLCVFDTDSNDYFTSPACKFLAEKCLNNQQLHFLHIGSCQDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 GSECICMSPEEDCSHHSEDLCVFDTDSNDYFTSPACKFLAEKCLNNQQLHFLHIGSCQDG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 RQLEWGLERTRLSSNSTKKESCGYDTCYDWEKCSASTSKCVCLLPPQCFKGGNQLYCVKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 RQLEWGLERTRLSSNSTKKESCGYDTCYDWEKCSASTSKCVCLLPPQCFKGGNQLYCVKM
850 860 870 880 890 900
910 920 930
pF1KE1 GSSTSEKTLNICEVGTIRCANRKMEILHPGKCLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 GSSTSEKTLNICEVGTIRCANRKMEILHPGKCLA
910 920 930
>>CCDS47201.1 C7 gene_id:730|Hs108|chr5 (843 aa)
initn: 1078 init1: 391 opt: 1087 Z-score: 874.6 bits: 173.0 E(32554): 2.1e-42
Smith-Waterman score: 1685; 32.5% identity (61.4% similar) in 874 aa overlap (79-934:25-840)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 QIVVDKYYQENFCEQICSKQETRECNWQRCPINCLLGDFGPWSDCDPCIEKQSKVRSVLR
:.:: ..:::.:. : . :.. :::
CCDS47 MKVISLFILVGFIGEFQSFSSASSPVNCQWDFYAPWSECNGCTKTQTRRRSVAV
10 20 30 40 50
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 PSQFGGQPCTEPLVAFQPCIPSKLCKIEEADCKNKFRCDSGRCIARKLECNGENDCG-DN
.:.:::::. : : :.. : ::. : ..::: ::.::...: :::..:: :.
CCDS47 YGQYGGQPCVGNAFETQSCEPTRGCPTEEG-CGERFRCFSGQCISKSLVCNGDSDCDEDS
60 70 80 90 100 110
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 SDERDC--GRTKAVCTRKYNPIPSVQLMGNGFHFLAGEPRGEVLDNSFTGGICKTVKSSR
.:: : .. . : .: :...: :::.. :.:. :..:.... :: :. : :.
CCDS47 ADEDRCEDSERRPSCDID-KPPPNIELTGNGYNELTGQFRNRVINTKSFGGQCRKVFSGD
120 130 140 150 160 170
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 TSNPYRVPANLENVGFEVQTAEDDLKTDFYKDLTSLGHNENQQGSFSSQGGSSFSVPIFY
.. ::. .:. . :.:. ..:.. .::.. : .. . . . ::. : :.
CCDS47 GKDFYRLSGNVLSYTFQVKI-NNDFNYEFYNSTWSYVKHTSTEHTSSSRKRS------FF
180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 SSKRSENINHNSAFKQAIQASHK-KDSSFIRIHKVMKVLNFTTKAKD-LHLSDVFLKALN
:. : . ...: .. :: :. ... ......: .: .. . :.:.. : : :.
CCDS47 RSSSSSSRSYTSHTNEI----HKGKSYQLLVVENTVEVAQFINNNPEFLQLAEPFWKELS
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 HLPLEYNSALYSRIFDDFGTHYFTSGSLGGVYDLLYQFSSEELKNSGLTEEEAKHCVRIE
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CCDS47 HLPSLYDYSAYRRLIDQYGTHYLQSGSLGGEYRVLFYVDSEKLKQNDFNSVEEKKCKSSG
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 TKKRVLFAKKTKVEHRCTTNKLSEKHEGSFIQGAEKSISLIRGGRSEYGAALAW-EKGSS
. : :.. : : . . : .. ... .. .:::: . . ..:.. : .
CCDS47 WHFVVKFSS-----HGCKELENALKAASGTQNNVLRGEPFIRGGGAGFISGLSYLELDNP
350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 GLEEKTFSEWLESVKENPAVIDFELAPIVDLVRNIPCAVTKRNNLRKALQEYAAKFDPCQ
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CCDS47 AGNKRRYSAWAESVTNLPQVIKQKLTPLYELVKEVPCASVKKLYLKWALEEYLDEFDPCH
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 CAPCPNNGRPTLSGTECLCVCQSGTYGENCEKQS-PDYKSNAVDGQWGCWSSWSTCDATY
: :: :.: :. ::.::: :. :.: ::. ....::: :.:::::: : .
CCDS47 CRPCQNGGLATVEGTHCLCHCKPYTFGAACEQGVLVGNQAGGVDGGWSCWSSWSPC-VQG
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630
pF1KE1 KRSRTRECNNPAPQRGGKRCEGEKRQEEDCTFSIMENNGQPCINDDEEMKEVDLPE----
:..:.:::::: :. ::. : :: . .: .:::.... : :
CCDS47 KKTRSRECNNPPPSGGGRSCVGETTESTQC--------------EDEELEHLRLLEPHCF
520 530 540 550 560
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 ---IEADSGCPQPVPPENGFIRNEKQLYLVGEDVEISCLTGFETVGYQYFRCLPDGTWRQ
. ::.: ..::...: .. ::..: .: :. .: :: : :
CCDS47 PLSLVPTEFCPSPPALKDGFVQDEGTMFPVGKNVVYTCNEGYSLIGNPVARCGEDLRWLV
570 580 590 600 610 620
700 710 720 730 740 750
pF1KE1 GDVECQRTECIKPVVQEVLTITPFQRLYRIGESIELTCPKGFVVAGPSRYTCQGNS--WT
:...::. :. ::... . : . .: .::.. ..: :. . ::: . : :.: :.
CCDS47 GEMHCQKIACVLPVLMDGIQSHPQKPFYTVGEKVTVSCSGGMSLEGPSAFLC-GSSLKWS
630 640 650 660 670 680
760 770 780 790 800 810
pF1KE1 PPISNSLTCEKDT-LTKLKGHCQLGQKQSGSECICMSPEEDCSHHSEDLCVFDTDSNDYF
: ..:. .:.. ::. .:: .: ..:.:.: : : :. : :.:. : :. .
CCDS47 PEMKNARCVQKENPLTQAVPKCQRWEKLQNSRCVCKMPYE-CGP-SLDVCAQDERSKRIL
690 700 710 720 730
820 830 840 850 860 870
pF1KE1 TSPACKFLAEKCLNNQQLHFLHIGSCQDGRQLEW-GLERTRLSSNSTKKESCGYDTCYDW
.:: .: :: :: ::. : . : ... : .:: .: :
CCDS47 PLTVCK-----------MHVLH---CQ-GRNYTLTGRDSCTLPASAEK--ACG--ACPLW
740 750 760 770
880 890 900 910 920 930
pF1KE1 EKCSASTSKCVCLLPPQCFKGGNQLYCVKMGSSTSEKTLNICEVGTIRCANRKMEILHPG
::.: .::::: .: . : .. ::..... :.:.. ::.:..:: .... .
CCDS47 GKCDAESSKCVCREASECEEEGFSI-CVEVNGK--EQTMSECEAGALRCRGQSISVTSIR
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 KCLA
: :
CCDS47 PCAAETQ
840
>>CCDS60152.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 (539 aa)
initn: 965 init1: 208 opt: 1070 Z-score: 863.5 bits: 170.3 E(32554): 9e-42
Smith-Waterman score: 1070; 30.9% identity (64.1% similar) in 551 aa overlap (79-612:10-539)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 QIVVDKYYQENFCEQICSKQETRECNWQRCPINCLLGDFGPWSDCDPCIEKQSKVRSVLR
::.: :.... :. :::: .:. . .:.
CCDS60 MRSVDVTLMPIDCELSSWSSWTTCDPCQKKRYRYAYLLQ
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 PSQFGGQPCTEPLVAFQPCIPSKLCKIEEADCKNKFRC-DSGRCIARKLECNGENDCGDN
:::: :.::. . :. .. : .. :.. : : ..:::. :.: :::.:::::.
CCDS60 PSQFHGEPCNFSDKEVEDCVTNRPCG-SQVRCEG-FVCAQTGRCVNRRLLCNGDNDCGDQ
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 SDERDCGRTKAVCTRKYNPIPSVQLMGNGFHFLAGEPRGEVLDNSFTGGICKT--VKSSR
::: .: : : .... .. ...:...... .: :::. . .: :. . ..:
CCDS60 SDEANCRRIYKKCQHEMDQYWGIGSLASGINLFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSPHYILNTR
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 TSNPYRVPANLENVG--FEVQTAEDDLKTDFYKDLTSLGHNENQQGSFSSQGGSSFS--V
.:: : . .. .: : . .:: ...: ...:..: ::. .
CCDS60 FRKPYNVESYTPQTQGKYEFILKEYESYSDFERNVTE---------KMASKSGFSFGFKI
160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 P-IFYSSKRSENINHNSAFKQAIQASHKKDSSFIRIHKVMKVLNFTTKAKDLHLSDVFLK
: :: . :.. . .... . :: : : :.. .. ..: .. : ..: : ::.
CCDS60 PGIFELGISSQSDRGKHYIRRTKRFSHTK-SVFLHARSDLEVAHYKLKPRSLMLHYEFLQ
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 ALNHLPLEYNSALYSRIFDDFGTHYFTSGSLGGVYDLLYQFSSEELKNSGLTEEEAKHCV
...:::::. . : .: ::::::.: . :::.:. ...: .. . : .... :.
CCDS60 RVKRLPLEYSYGEYRDLFRDFGTHYITEAVLGGIYEYTLVMNKEAMERGDYTLNNVHACA
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450
pF1KE1 RIETK-----KRVLFAKKTKV-EHRCTTNKLSEKHEGSFIQGAEKSISLIRGGRSEYGAA
. . : ..: . ..: . : :....... . . .: . :.::: ::. ..
CCDS60 KNDFKIGGAIEEVYVSLGVSVGKCRGILNEIKDRNKRDTM--VEDLVVLVRGGASEHITT
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 LAWEKGSSGLEEKTFSEWLESVKENPAVIDFELAPIVDLVRNIPCAVTK--RNNLRKALQ
::... .. ..:: ..:. :::.: .. :. .:: : .. :.:...::.
CCDS60 LAYQELPTA---DLMQEWGDAVQYNPAIIKVKVEPLYELVTATDFAYSSTVRQNMKQALE
390 400 410 420 430 440
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 EYAAKFDPCQCAPCPNNGRPTLSGTECLCVCQSGTYGENCEKQSPDYKSNA-VDGQWGCW
:. . . :.:::: .:: :.:.:..: :.: :. : :: .:..:. .::.:.::
CCDS60 EFQKEVSSCHCAPCQGNGVPVLKGSRCDCICPVGSQGLACEV---SYRKNTPIDGKWNCW
450 460 470 480 490
580 590 600 610 620 630
pF1KE1 SSWSTCDATYKRSRTRECNNPAPQRGGKRCEGEKRQEEDCTFSIMENNGQPCINDDEEMK
:.::.:.. ...: :.:::: :: ::. : : . ::.
CCDS60 SNWSSCSGR-RKTRQRQCNNPPPQNGGSPCSGPASETLDCS
500 510 520 530
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 EVDLPEIEADSGCPQPVPPENGFIRNEKQLYLVGEDVEISCLTGFETVGYQYFRCLPDGT
>>CCDS30730.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 (591 aa)
initn: 965 init1: 208 opt: 1070 Z-score: 863.0 bits: 170.3 E(32554): 9.5e-42
Smith-Waterman score: 1070; 30.9% identity (64.1% similar) in 551 aa overlap (79-612:62-591)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 QIVVDKYYQENFCEQICSKQETRECNWQRCPINCLLGDFGPWSDCDPCIEKQSKVRSVLR
::.: :.... :. :::: .:. . .:.
CCDS30 GERPHSFGSNAVNKSFAKSRQMRSVDVTLMPIDCELSSWSSWTTCDPCQKKRYRYAYLLQ
40 50 60 70 80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 PSQFGGQPCTEPLVAFQPCIPSKLCKIEEADCKNKFRC-DSGRCIARKLECNGENDCGDN
:::: :.::. . :. .. : .. :.. : : ..:::. :.: :::.:::::.
CCDS30 PSQFHGEPCNFSDKEVEDCVTNRPCG-SQVRCEG-FVCAQTGRCVNRRLLCNGDNDCGDQ
100 110 120 130 140
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 SDERDCGRTKAVCTRKYNPIPSVQLMGNGFHFLAGEPRGEVLDNSFTGGICKT--VKSSR
::: .: : : .... .. ...:...... .: :::. . .: :. . ..:
CCDS30 SDEANCRRIYKKCQHEMDQYWGIGSLASGINLFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSPHYILNTR
150 160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 TSNPYRVPANLENVG--FEVQTAEDDLKTDFYKDLTSLGHNENQQGSFSSQGGSSFS--V
.:: : . .. .: : . .:: ...: ...:..: ::. .
CCDS30 FRKPYNVESYTPQTQGKYEFILKEYESYSDFERNVTE---------KMASKSGFSFGFKI
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 P-IFYSSKRSENINHNSAFKQAIQASHKKDSSFIRIHKVMKVLNFTTKAKDLHLSDVFLK
: :: . :.. . .... . :: : : :.. .. ..: .. : ..: : ::.
CCDS30 PGIFELGISSQSDRGKHYIRRTKRFSHTK-SVFLHARSDLEVAHYKLKPRSLMLHYEFLQ
270 280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 ALNHLPLEYNSALYSRIFDDFGTHYFTSGSLGGVYDLLYQFSSEELKNSGLTEEEAKHCV
...:::::. . : .: ::::::.: . :::.:. ...: .. . : .... :.
CCDS30 RVKRLPLEYSYGEYRDLFRDFGTHYITEAVLGGIYEYTLVMNKEAMERGDYTLNNVHACA
320 330 340 350 360 370
410 420 430 440 450
pF1KE1 RIETK-----KRVLFAKKTKV-EHRCTTNKLSEKHEGSFIQGAEKSISLIRGGRSEYGAA
. . : ..: . ..: . : :....... . . .: . :.::: ::. ..
CCDS30 KNDFKIGGAIEEVYVSLGVSVGKCRGILNEIKDRNKRDTM--VEDLVVLVRGGASEHITT
380 390 400 410 420 430
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 LAWEKGSSGLEEKTFSEWLESVKENPAVIDFELAPIVDLVRNIPCAVTK--RNNLRKALQ
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18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 23:50:20 2016 done: Sun Nov 6 23:50:21 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]