FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1465, 376 aa 1>>>pF1KE1465 376 - 376 aa - 376 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7572+/-0.000388; mu= 11.4178+/- 0.024 mean_var=144.4939+/-30.483, 0's: 0 Z-trim(117.9): 348 B-trim: 1535 in 1/52 Lambda= 0.106696 statistics sampled from 29975 (30399) to 29975 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.356), width: 16 Scan time: 9.150 The best scores are: opt bits E(85289) NP_002014 (OMIM: 600245) fibromodulin precursor [H ( 376) 2569 407.0 3.8e-113 NP_002336 (OMIM: 600616) lumican precursor [Homo s ( 338) 1030 170.0 7.2e-42 NP_958505 (OMIM: 601914) prolargin precursor [Homo ( 382) 858 143.6 7.3e-34 NP_002716 (OMIM: 601914) prolargin precursor [Homo ( 382) 858 143.6 7.3e-34 NP_008966 (OMIM: 217300,603288) keratocan precurso ( 352) 813 136.6 8.4e-32 NP_060150 (OMIM: 603932,607850,608135) asporin iso ( 379) 436 78.6 2.6e-14 NP_001184225 (OMIM: 603479) extracellular matrix p ( 643) 434 78.5 4.7e-14 NP_001184224 (OMIM: 603479) extracellular matrix p ( 677) 434 78.5 4.9e-14 NP_001384 (OMIM: 603479) extracellular matrix prot ( 699) 434 78.6 5e-14 XP_016874406 (OMIM: 125255,610048) PREDICTED: deco ( 359) 425 76.9 8.1e-14 NP_598010 (OMIM: 125255,610048) decorin isoform a ( 359) 425 76.9 8.1e-14 XP_006719333 (OMIM: 125255,610048) PREDICTED: deco ( 359) 425 76.9 8.1e-14 XP_005268750 (OMIM: 125255,610048) PREDICTED: deco ( 359) 425 76.9 8.1e-14 NP_001911 (OMIM: 125255,610048) decorin isoform a ( 359) 425 76.9 8.1e-14 XP_016885213 (OMIM: 300106,301870) PREDICTED: bigl ( 368) 420 76.1 1.4e-13 NP_001702 (OMIM: 300106,301870) biglycan prepropro ( 368) 420 76.1 1.4e-13 XP_011527506 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leuc ( 649) 400 73.3 1.8e-12 NP_037413 (OMIM: 604808,615271) leucine-rich repea ( 649) 400 73.3 1.8e-12 NP_938205 (OMIM: 604808,615271) leucine-rich repea ( 649) 400 73.3 1.8e-12 XP_005260739 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leuc ( 649) 400 73.3 1.8e-12 XP_011527507 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leuc ( 649) 400 73.3 1.8e-12 XP_005273918 (OMIM: 604806) PREDICTED: leucine-ric ( 674) 394 72.4 3.5e-12 NP_037412 (OMIM: 604806) leucine-rich repeat trans ( 674) 394 72.4 3.5e-12 XP_011543185 (OMIM: 604806) PREDICTED: leucine-ric ( 674) 394 72.4 3.5e-12 XP_011534913 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12 XP_016876622 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12 NP_001333074 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 390 71.8 5.3e-12 NP_001333075 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 390 71.8 5.3e-12 XP_016876623 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12 NP_001333073 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 390 71.8 5.3e-12 XP_016876620 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12 XP_016876621 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12 XP_016876624 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12 NP_001333072 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 390 71.8 5.3e-12 XP_016876618 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12 XP_005267547 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12 NP_037363 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat trans ( 660) 390 71.8 5.3e-12 XP_016876619 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12 XP_011538979 (OMIM: 608661) PREDICTED: podocan iso ( 402) 356 66.3 1.4e-10 XP_005270514 (OMIM: 608661) PREDICTED: podocan iso ( 613) 356 66.5 1.9e-10 NP_001186009 (OMIM: 608661) podocan isoform 2 [Hom ( 642) 356 66.5 1.9e-10 NP_001186010 (OMIM: 608661) podocan isoform 2 [Hom ( 642) 356 66.5 1.9e-10 XP_016855783 (OMIM: 608661) PREDICTED: podocan iso ( 652) 356 66.5 2e-10 NP_714914 (OMIM: 608661) podocan isoform 1 [Homo s ( 661) 356 66.5 2e-10 NP_001264155 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-co ( 883) 314 60.2 2.2e-08 NP_003658 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-conta ( 907) 311 59.7 3e-08 NP_004961 (OMIM: 601489,615961) insulin-like growt ( 605) 304 58.5 4.8e-08 NP_001139478 (OMIM: 601489,615961) insulin-like gr ( 643) 304 58.5 5e-08 NP_071426 (OMIM: 610486) leucine-rich repeat-conta ( 653) 302 58.2 6.3e-08 XP_011514763 (OMIM: 610486) PREDICTED: leucine-ric ( 653) 302 58.2 6.3e-08 >>NP_002014 (OMIM: 600245) fibromodulin precursor [Homo (376 aa) initn: 2569 init1: 2569 opt: 2569 Z-score: 2152.4 bits: 407.0 E(85289): 3.8e-113 Smith-Waterman score: 2569; 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NP_002 RLKEDAVSAAFKGLKSLEYLDLSFNQIARLPSGLPVSLLTLYLDNNKISNIPDEYFKRFN 170 180 190 200 210 220 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 KLLYVRLSHNSLTNNGLASNTFNSSSLLELDLSYNQLQKIPPVNTNLENLYLQGNRINEF : :.::::: :...:. .:.:: :::.:::::::.:..:: :: :::: ::. :....: NP_002 ALQYLRLSHNELADSGIPGNSFNVSSLVELDLSYNKLKNIPTVNENLENYYLEVNQLEKF 230 240 250 260 270 280 330 340 350 360 370 pF1KE1 SISSFCTVVDVVNFSKLQVLRLDGNEIKRSAMPADAPLCLRLASLIEI .:.::: .. ...::.. ::::::.:.....: : :::.:. . . NP_002 DIKSFCKILGPLSYSKIKHLRLDGNRISETSLPPDMYECLRVANEVTLN 290 300 310 320 330 >>NP_958505 (OMIM: 601914) prolargin precursor [Homo sap (382 aa) initn: 966 init1: 360 opt: 858 Z-score: 728.9 bits: 143.6 E(85289): 7.3e-34 Smith-Waterman score: 905; 40.2% identity (68.6% similar) in 388 aa overlap (3-376:7-382) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MQWTSLLLLAGLFSLSQAQYEDDPHWWFHY-LRSQQSTYYDPYDPYPYETYEPYPY : :: : : :..:.: :. : . : : : : :: NP_958 MRSPLCW--LLPLLILASVAQGQPTRRPRPGTGPGRRPRPRPRPTPSFPQPDEPAEP--- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 GVDEGPAYTYGSPSP-PDPRDCPQECDCPPNFPTAMYCDNRNLKYLPFVPSRMKYVYFQN .: : : :: : :::.:: :::.::.:.:::.:::. .: .: :..:.:.:: NP_958 -TDLPPPLPPGPPSIFP---DCPRECYCPPDFPSALYCDSRNLRKVPVIPPRIHYLYLQN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 NQITSIQEGVFDNATGLLWIALHGNQITSDKVGRKVFSKLRHLERLYLDHNNLTRMPGPL : :: . :.::::: :: : .:.: :. ..:. :: : ::...:.: ..:. : NP_958 NFITELPVESFQNATGLRWINLDNNRIR--KIDQRVLEKLPGLVFLYMEKNQLEEVPSAL 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 PRSLRELHLDHNQISRVPNNALEGLENLTALYLQHNEIQE---VGSSMRGLRSLILLDLS ::.:..:.:..:.:::.: ... :::: : ::::.... ....::..:. :.:. NP_958 PRNLEQLRLSQNHISRIPPGVFSKLENLLLLDLQHNRLSDGVFKPDTFHGLKNLMQLNLA 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 YNHLRKVPDGLPSALEQLYMEHNNVYTVPDSYFRGAPKLLYVRLSHNSLTNNGLASNTFN .: :::.: .:.:..:::.. :.. :.:..::.. :.: ..::..:.::. :: .:.:: NP_958 HNILRKMPPRVPTAIHQLYLDSNKIETIPNGYFKSFPNLAFIRLNYNKLTDRGLPKNSFN 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 pF1KE1 SSSLLELDLSYNQLQKIPPVNTNLENLYLQGNRINEFSISSFCT--VV-------DVVNF :.:: : ::.:.....: .:. ::.:::..: :.... ...: .: :. : NP_958 ISNLLVLHLSHNRISSVPAINNRLEHLYLNNNSIEKINGTQICPNDLVAFHDFSSDLENV 290 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 SKLQVLRLDGNEIKRSAMPADAPLCLRLASLIEI .:. :::::: .: .: : .:.:: . . : NP_958 PHLRYLRLDGNYLK-PPIPLDLMMCFRLLQSVVI 350 360 370 380 >>NP_002716 (OMIM: 601914) prolargin precursor [Homo sap (382 aa) initn: 966 init1: 360 opt: 858 Z-score: 728.9 bits: 143.6 E(85289): 7.3e-34 Smith-Waterman score: 905; 40.2% identity (68.6% similar) in 388 aa overlap (3-376:7-382) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MQWTSLLLLAGLFSLSQAQYEDDPHWWFHY-LRSQQSTYYDPYDPYPYETYEPYPY : :: : : :..:.: :. : . : : : : :: NP_002 MRSPLCW--LLPLLILASVAQGQPTRRPRPGTGPGRRPRPRPRPTPSFPQPDEPAEP--- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 GVDEGPAYTYGSPSP-PDPRDCPQECDCPPNFPTAMYCDNRNLKYLPFVPSRMKYVYFQN .: : : :: : :::.:: :::.::.:.:::.:::. .: .: :..:.:.:: NP_002 -TDLPPPLPPGPPSIFP---DCPRECYCPPDFPSALYCDSRNLRKVPVIPPRIHYLYLQN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 NQITSIQEGVFDNATGLLWIALHGNQITSDKVGRKVFSKLRHLERLYLDHNNLTRMPGPL : :: . :.::::: :: : .:.: :. ..:. :: : ::...:.: ..:. : NP_002 NFITELPVESFQNATGLRWINLDNNRIR--KIDQRVLEKLPGLVFLYMEKNQLEEVPSAL 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 PRSLRELHLDHNQISRVPNNALEGLENLTALYLQHNEIQE---VGSSMRGLRSLILLDLS ::.:..:.:..:.:::.: ... :::: : ::::.... ....::..:. :.:. NP_002 PRNLEQLRLSQNHISRIPPGVFSKLENLLLLDLQHNRLSDGVFKPDTFHGLKNLMQLNLA 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 YNHLRKVPDGLPSALEQLYMEHNNVYTVPDSYFRGAPKLLYVRLSHNSLTNNGLASNTFN .: :::.: .:.:..:::.. :.. :.:..::.. :.: ..::..:.::. :: .:.:: NP_002 HNILRKMPPRVPTAIHQLYLDSNKIETIPNGYFKSFPNLAFIRLNYNKLTDRGLPKNSFN 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 pF1KE1 SSSLLELDLSYNQLQKIPPVNTNLENLYLQGNRINEFSISSFCT--VV-------DVVNF :.:: : ::.:.....: .:. ::.:::..: :.... ...: .: :. : NP_002 ISNLLVLHLSHNRISSVPAINNRLEHLYLNNNSIEKINGTQICPNDLVAFHDFSSDLENV 290 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 SKLQVLRLDGNEIKRSAMPADAPLCLRLASLIEI .:. :::::: .: .: : .:.:: . . : NP_002 PHLRYLRLDGNYLK-PPIPLDLMMCFRLLQSVVI 350 360 370 380 >>NP_008966 (OMIM: 217300,603288) keratocan precursor [H (352 aa) initn: 889 init1: 492 opt: 813 Z-score: 691.9 bits: 136.6 E(85289): 8.4e-32 Smith-Waterman score: 865; 41.9% identity (75.4% similar) in 313 aa overlap (75-376:41-352) 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 YPYETYEPYPYGVDEGPAYTYGSPSPPDPRDCPQECDCPPNFPTAMYCDNRNLKYLPFVP .::.:: :::.::::.::.::.:: .: .: NP_008 VLFITDTVWSRSVRQVYEVHDSDDWTIHDFECPMECFCPPSFPTALYCENRGLKEIPAIP 20 30 40 50 60 70 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 SRMKYVYFQNNQITSIQEGVFDNATGLLWIALHGNQITSDKVGRKVFSKLRHLERLYLDH ::. :.:.::: : .: : :.::: : :: :. :.::. . . ..:.:..: :.:. NP_008 SRIWYLYLQNNLIETIPEKPFENATQLRWINLNKNKITNYGIEKGALSQLKKLLFLFLED 80 90 100 110 120 130 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 NNLTRMPGPLPRSLRELHLDHNQISRVPNNALEGLENLTALYLQHNEIQEVG---SSMRG :.: ..:.::::::..:.: .:..::.:.... .::::: : ::.:.. . . ....: NP_008 NELEEVPSPLPRSLEQLQLARNKVSRIPQGTFSNLENLTLLDLQNNKLVDNAFQRDTFKG 140 150 160 170 180 190 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 LRSLILLDLSYNHLRKVPDGLPSALEQLYMEHNNVYTVPDSYFRGAPKLLYVRLSHNSLT :..:. :... : ::..: ::. ::....:.. .:..:: ::. ..::.::.:. NP_008 LKNLMQLNMAKNALRNMPPRLPANTMQLFLDNNSIEGIPENYFNVIPKVAFLRLNHNKLS 200 210 220 230 240 250 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 NNGLASNTFNSSSLLELDLSYNQLQKIPPVNTNLENLYLQGNRINEFSISSFCTVVDVV- ..:: : :. ::.:.:.::.::: :.: ....:..:.:. :.:. ..: .: ... 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XP_016 TNPLKSSGIENGAFQGMKKLSYIRIADTNITSIPQGLPPSLTELHLDGNKISRVDAASLK 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 GAPKLLYVRLSHNSLT--NNGLASNTFNSSSLLELDLSYNQLQKIP---PVNTNLENLYL : .: . :: ::.. .:: .:: : :: :. :.: ..: . .. .:: XP_016 GLNNLAKLGLSFNSISAVDNGSLANT---PHLRELHLDNNKLTRVPGGLAEHKYIQVVYL 250 260 270 280 290 330 340 350 360 370 pF1KE1 QGNRINEFSISSFCTVVDVVNFSKLQVLRLDGNEIKRSAMPADAPLCLRLASLIEI ..: :. . :.:: .. .. . . : .: .. . .. :. . : :.. XP_016 HNNNISVVGSSDFCPPGHNTKKASYSGVSLFSNPVQYWEIQPSTFRCVYVRSAIQLGNYK 300 310 320 330 340 350 376 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 23:53:11 2016 done: Sun Nov 6 23:53:13 2016 Total Scan time: 9.150 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]