FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9529, 353 aa 1>>>pF1KE9529 353 - 353 aa - 353 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3084+/-0.000947; mu= 15.4382+/- 0.056 mean_var=92.5596+/-25.356, 0's: 0 Z-trim(105.0): 281 B-trim: 1125 in 2/48 Lambda= 0.133310 statistics sampled from 7803 (8171) to 7803 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16 Scan time: 2.640 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 2383 469.1 2.5e-132 CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 760 157.0 2.4e-38 CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 645 134.9 1e-31 CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 645 134.9 1.1e-31 CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 645 134.9 1.1e-31 CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 588 123.9 2.1e-28 CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 534 113.5 2.8e-25 CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 532 113.1 3.6e-25 CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 515 109.8 3.5e-24 CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 507 108.3 1e-23 CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 502 107.4 2.1e-23 CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 490 105.1 1e-22 CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 482 103.5 2.9e-22 CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 482 103.5 3e-22 CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 480 103.1 3.7e-22 CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 480 103.1 3.8e-22 CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 480 103.1 3.9e-22 CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 478 102.7 5e-22 CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 478 102.8 5.4e-22 CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 477 102.6 5.9e-22 CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 471 101.4 1.2e-21 CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 468 100.8 2e-21 CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 466 100.4 2.4e-21 CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 460 99.3 5.4e-21 CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 460 99.3 5.5e-21 CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 459 99.1 6.4e-21 CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 458 98.9 7e-21 CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 456 98.5 9.6e-21 CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 455 98.3 1.1e-20 CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 453 98.0 1.4e-20 CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 453 98.0 1.5e-20 CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 453 98.0 1.5e-20 CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 453 98.0 1.5e-20 CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 453 98.0 1.5e-20 CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 453 98.0 1.5e-20 CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 453 98.0 1.5e-20 CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 453 98.0 1.5e-20 CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 453 98.0 1.6e-20 CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 453 98.1 1.7e-20 CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 447 96.8 3e-20 CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 445 96.4 4e-20 CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 439 95.2 9.1e-20 CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12 ( 404) 439 95.3 9.6e-20 CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 437 94.9 1.2e-19 CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 437 94.9 1.3e-19 CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 433 94.1 2e-19 CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 433 94.1 2e-19 CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 432 93.8 2.1e-19 CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 432 93.9 2.2e-19 CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 430 93.5 3e-19 >>CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 (353 aa) initn: 2383 init1: 2383 opt: 2383 Z-score: 2489.3 bits: 469.1 E(32554): 2.5e-132 Smith-Waterman score: 2383; 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CCDS99 SPWKISMFLSVREDSVPTTASFSADMLNVTLQGPTLNGTFAQ--SKCPQV-EWLGWLNTI 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 pF1KE9 LPTFIISICFFGLLGNLFVLLVFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWN : :. . .. : :.::: :: : . . .::::::.::::.::... :::::: .: : CCDS99 QPPFLWVLFVLATLENIFVLSVFCLHKSSCTVAEIYLGNLAAADLILACGLPFWAITISN 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 QFNWPFGALLCRVINGVIKANLFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCV .:.: :: ::::.:..:. ::. :: ... .: ::: .::. :. :.. : :.. . CCDS99 NFDWLFGETLCRVVNAIISMNLYSSICFLMLVSIDRYLALVKTMSMGRMRGVRWAKLYSL 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 LIWVVGGLLSIPTFLLRSIQAVPDL--NITACILLLPHEAWHFARIVELNILGFLLPLAA .:: ::: : ...:... : :.:::.. : :. . ::..::::::.. CCDS99 VIWGCTLLLSSPMLVFRTMKEYSDEGHNVTACVISYPSLIWEVFTNMLLNVVGFLLPLSV 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 IVFFNYHILASLRTREEVSRTRCGGRKDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQ :.: ...:. ::. .:... . . . ..:.:.:.... :..:: :... .::. : . CCDS99 ITFCTMQIMQVLRN-NEMQKFKEI-QTERRATVLVLVVLLLFIICWLPFQISTFLDTLHR 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 VQAVRGCFWEDFIDLGLQLANFFAFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAP . . .: : .::. :.:.:.:..:: :::..::.::. :: : ::.:. : CCDS99 LGILSSCQDERIIDVITQIASFMAYSNSCLNPLVYVIVGKRFRKKSWEVYQGVCQKGGCR 300 310 320 330 340 350 340 350 pF1KE9 ISSSHRKEIFQLFWRN CCDS99 SEPIQMENSMGTLRTSISVERQIHKLQDWAGSRQ 360 370 380 390 >>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (359 aa) initn: 453 init1: 414 opt: 645 Z-score: 682.7 bits: 134.9 E(32554): 1e-31 Smith-Waterman score: 645; 32.8% identity (65.0% similar) in 314 aa overlap (27-334:16-324) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAW--DLLHRVLPTFIISICFFGLLGNLFV :. :.: . . ..::. : :..:: .: CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLV 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 LLVFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCRVINGVIK ..:. . . .:: ..: ::: .:: :.: ::.:: .. :::: ::.. .. .. CCDS31 VIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVS 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 ANLFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIPTFLLRSI ::. :.::.. .: ::: ..:::: :: .. :.:::..::...:: :.:... :.. CCDS31 FNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNV 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 QAVPDLNITACILLLPHEAWHFARIVEL----NILGFLLPLAAIVFFNYHILASLRTREE . . :::.: . .:. . . . : ::::::.:. :. : .:. : CCDS31 FFIENTNITVCAF--HYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYE 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 VSRTRCGGRKDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQAVRGCFWEDFIDLGL ..... :.:. .:...:. :. : :...:.::. :.:. .: : :..: .. CCDS31 IQKNK--PRNDD-IFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAM 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 QLANFFAFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKEIFQLFWRN .. .:. :. :::..: :.:. :. .: : ::. CCDS31 PITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDN 290 300 310 320 330 340 CCDS31 VSSSTKKPAPCFEVE 350 >>CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (388 aa) initn: 453 init1: 414 opt: 645 Z-score: 682.3 bits: 134.9 E(32554): 1.1e-31 Smith-Waterman score: 645; 32.8% identity (65.0% similar) in 314 aa overlap (27-334:45-353) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAW--DLLHRVLPTFIISICFFGLLG :. :.: . . ..::. : :..: CCDS82 VFDIVFATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFG 20 30 40 50 60 70 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 NLFVLLVFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCRVIN : .:..:. . . .:: ..: ::: .:: :.: ::.:: .. :::: ::.. . CCDS82 NSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIAS 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 GVIKANLFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIPTFL . .. ::. :.::.. .: ::: ..:::: :: .. :.:::..::...:: :.:... CCDS82 ASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAII 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 LRSIQAVPDLNITACILLLPHEAWHFARIVEL----NILGFLLPLAAIVFFNYHILASLR :.. . . :::.: . .:. . . . : ::::::.:. :. : .:. CCDS82 HRNVFFIENTNITVCAF--HYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALK 200 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 TREEVSRTRCGGRKDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQAVRGCFWEDFI :..... :.:. .:...:. :. : :...:.::. :.:. .: : :.. CCDS82 KAYEIQKNK--PRNDD-IFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIV 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 DLGLQLANFFAFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKEIFQLF : .. .. .:. :. :::..: :.:. :. .: : ::. CCDS82 DTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYR 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 WRN CCDS82 PSDNVSSSTKKPAPCFEVE 370 380 >>CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (394 aa) initn: 453 init1: 414 opt: 645 Z-score: 682.2 bits: 134.9 E(32554): 1.1e-31 Smith-Waterman score: 645; 32.8% identity (65.0% similar) in 314 aa overlap (27-334:51-359) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAW--DLLHRVLPTFIISICFFGLLG :. :.: . . ..::. : :..: CCDS82 VFDIVFATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFG 30 40 50 60 70 80 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 NLFVLLVFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCRVIN : .:..:. . . .:: ..: ::: .:: :.: ::.:: .. :::: ::.. . CCDS82 NSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIAS 90 100 110 120 130 140 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 GVIKANLFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIPTFL . .. ::. :.::.. .: ::: ..:::: :: .. :.:::..::...:: :.:... CCDS82 ASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAII 150 160 170 180 190 200 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 LRSIQAVPDLNITACILLLPHEAWHFARIVEL----NILGFLLPLAAIVFFNYHILASLR :.. . . :::.: . .:. . . . : ::::::.:. :. : .:. CCDS82 HRNVFFIENTNITVCAF--HYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALK 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 TREEVSRTRCGGRKDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQAVRGCFWEDFI :..... :.:. .:...:. :. : :...:.::. :.:. .: : :.. CCDS82 KAYEIQKNK--PRNDD-IFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIV 260 270 280 290 300 310 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 DLGLQLANFFAFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKEIFQLF : .. .. .:. :. :::..: :.:. :. .: : ::. CCDS82 DTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYR 320 330 340 350 360 370 pF1KE9 WRN CCDS82 PSDNVSSSTKKPAPCFEVE 380 390 >>CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX (363 aa) initn: 542 init1: 274 opt: 588 Z-score: 623.4 bits: 123.9 E(32554): 2.1e-28 Smith-Waterman score: 588; 30.9% identity (63.0% similar) in 311 aa overlap (21-328:30-334) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAWDLLHRVLPTFIISICFFG ... :.. : : ..: . : .: CCDS14 MKGNSTLATTSKNITSGLHFGLVNISGNNESTLNCSQKPS--DKHLDAIPILYYIIFVIG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 LLGNLFVLLVFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCR .: :. :. .: . .:. ::. :::..::... ::.:: ...: :: ..:. CCDS14 FLVNIVVVTLFCCQKGPKKVSSIYIFNLAVADLLLLATLPLWATYYSYRYDWLFGPVMCK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 VINGVIKANLFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIP :... . :.: :::... .: :::. ...:. :.:.. :: :.: .. : :.: CCDS14 VFGSFLTLNMFASIFFITCMSVDRYQSVIYPFLSQRRNPW-QASYIVPLVWCMACLSSLP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 TFLLRSIQAVPDLNITACILLLPHEA---WHFARIVELNILGFLLPLAAIVFFNYHILAS :: .:..... :...:::. .: : : . . :::::..:: :. . : CCDS14 TFYFRDVRTIEYLGVNACIMAFPPEKYAQWSAGIALMKNILGFIIPLIFIATCYFGIRKH 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 LRTREEVSRTRCGGRKDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQAVRGCFWED : . ...: .: .. . ..:.::..:: :.: ..::. : . .. .: CCDS14 LLKTNSYGKNRI--TRD-QVLKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVINSCEVIA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 FIDLGLQLANFFAFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKEIFQ :::.: .: ...:::: .:: .: ::: :. :. ... CCDS14 VIDLALPFAILLGFTNSCVNPFLYCFVGNRFQQKLRSVFRVPITWLQGKRESMSCRKSSS 300 310 320 330 340 350 350 pF1KE9 LFWRN CCDS14 LREMETFVS 360 >>CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 (355 aa) initn: 478 init1: 170 opt: 534 Z-score: 567.4 bits: 113.5 E(32554): 2.8e-25 Smith-Waterman score: 541; 30.2% identity (65.1% similar) in 315 aa overlap (22-329:20-318) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAWDLLHRVLPTFIISICFFGLLGNLFVLL .:: :... : . ..:: . . .::.::..:.: CCDS27 METPNTTEDYDTTTEFDYGDATPCQKVNER-AFGAQLLPPLYSLVFVIGLVGNILVVL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 VFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCRVINGVIKAN :.. .: :.. ::: ::: :::.:.. :::: . .. .: :: .:....: .. CCDS27 VLVQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKD-DWVFGDAMCKILSGFYYTG 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 LFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIPTFLLRSIQA :. ::... .. ::: ..:: . . : . . .: ..::... : :.: . . . : CCDS27 LYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFSKTQW 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE9 VPDLNITACILLLPHEA---WHFARIVELNILGFLLPLAAIVFFNYHILASLRTREEVSR ... .: : .:::. :.. . ..::..:..::: .... :. : : . CCDS27 --EFTHHTCSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKILLRRPN--- 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 TRCGGRKDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFF----AFLEFLFQVQAVRGCFWEDFIDLG .: ::.. ::..... :.. :.::.. .: .::: .. : .::. CCDS27 -----EKKSKAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLF----THECEQSRHLDLA 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 LQLANFFAFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKEIFQLFWRN .:... .:.:. .:::::.:::. :: . .:... CCDS27 VQVTEVIAYTHCCVNPVIYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSST 290 300 310 320 330 340 CCDS27 SPSTGEHELSAGF 350 >>CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 (355 aa) initn: 502 init1: 202 opt: 532 Z-score: 565.3 bits: 113.1 E(32554): 3.6e-25 Smith-Waterman score: 532; 29.1% identity (66.9% similar) in 296 aa overlap (39-331:37-320) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 ELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAWDLLHRVLPTFIISICFFGLLGNLFVLLVFLLPRRQ .: .: . :.:::: .:.::... .. CCDS26 LSVTTVTDYYYPDIFSSPCDAELIQTNGKLLLAVFYCLLFVFSLLGNSLVILVLVVCKKL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 LNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCRVINGVIKANLFISIFLV .....:: ::: :::.::...:: . . .: : ::...:.:..: ... :.:.. CCDS26 RSITDVYLLNLALSDLLFVFSFPFQTYYLLDQ--WVFGTVMCKVVSGFYYIGFYSSMFFI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 VAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIPTFLLRSIQAVPDLNITA . .: ::: ..:: . . . . :.. . :. .:... . .:: :: :.. . .. CCDS26 TLMSVDRYLAVVHAVYALKVRTIRMGTTLCLAVWLTAIMATIP--LLVFYQVASEDGVLQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 CILLLPHEA--WHFARIVELNILGFLLPLAAIVFFNYHILASLRTREEVSRTRCGGRKDS : . ... :.. ..::::.:.:.. ..: .:: .:. :: ... . CCDS26 CYSFYNQQTLKWKIFTNFKMNILGLLIPFTIFMFCYIKILHQLK--------RCQNHNKT 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 KTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQAVRGCFWEDFIDLGLQLANFFAFTNSS :. :.: .:.: :. :.:.. :: : ... . :: . . . .......::. CCDS26 KAIRLVLIVVIASLLFWVPFNVVLFLTSLHSMHILDGCSISQQLTYATHVTEIISFTHCC 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 pF1KE9 LNPVIYVFVGRLFRTKVWELY-KQCTPKSLAPISSSHRKEIFQLFWRN .:::::.:::. :. .. :.. :.:. CCDS26 VNPVIYAFVGEKFKKHLSEIFQKSCSQIFNYLGRQMPRESCEKSSSCQQHSSRSSSVDYI 300 310 320 330 340 350 >>CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 (352 aa) initn: 367 init1: 179 opt: 515 Z-score: 547.7 bits: 109.8 E(32554): 3.5e-24 Smith-Waterman score: 515; 29.5% identity (64.1% similar) in 312 aa overlap (38-345:31-330) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 LELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAWDLLHRVLPTFIISICFFGLLGNLFVLLVFLLPRR :.:: . . .::..::..:.:... .: CCDS27 MDYQVSSPIYDINYYTSEPCQKINVKQIAARLLPPLYSLVFIFGFVGNMLVILILINCKR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 QLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCRVINGVIKANLFISIFL ....::: ::: ::: :.: .::::. : : :: .:....:. ..: .::. CCDS27 LKSMTDIYLLNLAISDLFFLLTVPFWAHYAAAQ--WDFGNTMCQLLTGLYFIGFFSGIFF 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 VVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIPTFLLRSIQAVPDLNIT .. .. ::: ..:: . . . . . :: :. :::. . :.: ... : :. : CCDS27 IILLTIDRYLAVVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWVVAVFASLPGIIFTRSQK-EGLHYT 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 ACILLLPHEAWHFAR---IVELNILGFLLPLAAIVFFNYHILASL-RTREEVSRTRCGGR : .:. ..: . ... :::..::: ..:. :: .: : :.: .: : CCDS27 -CSSHFPYSQYQFWKNFQTLKIVILGLVLPLLVMVICYSGILKTLLRCRNEKKRHR---- 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 KDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQAVRGCFWEDFIDLGLQLANFFAFT .. ::.:....... ::::.. .:. . . .. .: . .: ..:... ...: CCDS27 ----AVRLIFTIMIVYFLFWAPYNIVLLLNTFQEFFGLNNCSSSNRLDQAMQVTETLGMT 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 pF1KE9 NSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKEIFQLFWRN . .::.::.:::. ::. . .... : . : ..: CCDS27 HCCINPIIYAFVGEKFRNYLLVFFQKHIAKRFCKCCSIFQQEAPERASSVYTRSTGEQEI 290 300 310 320 330 340 CCDS27 SVGL 350 >>CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 (369 aa) initn: 234 init1: 199 opt: 507 Z-score: 539.1 bits: 108.3 E(32554): 1e-23 Smith-Waterman score: 507; 31.7% identity (61.8% similar) in 309 aa overlap (23-320:27-320) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAW-DLLHRVLPTFI-ISICFFGLLG .: .: : . :: .. ::: . .:..:: : CCDS11 MDMADEPLNGSHTWLSIPFDLNGSVVSTNTSNQTEPYYDLTSNAVLTFIYFVVCIIGLCG 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 NLFVLLVFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCRVIN : .:. :.: .. ....::. ::: .: .:.::::: : .. .:::: .:::. CCDS11 NTLVIYVILRYAKMKTITNIYILNLAIADELFMLGLPFLAMQV-ALVHWPFGKAICRVVM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 GVIKANLFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIPTFL : : : ::: ....: ::: ..:::. : . .: : :.. . .: :. :. .: .. CCDS11 TVDGINQFTSIFCLTVMSIDRYLAVVHPIKSAKWRRPRTAKMITMAVWGVSLLVILPIMI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 LRSIQAVPDLNITACILLLPHE--AWHFARIVELNILGFLLPLAAIVFFNYHILASLRTR .... . . ..: . : : ::. . :. :::::.::. : . :. .... CCDS11 YAGLRS-NQWGRSSCTINWPGESGAWYTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFIIIKVKS- 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 EEVSRTRCGG--RKDS--KTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQ---AVRGCF : : :. :: : :.: .. .:..:. :: :...: . .. :..: : CCDS11 ---SGIRVGSSKRKKSEKKVTRMVSIVVAVFIFCWLPFYIFNVSSVSMAISPTPALKGMF 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 WEDFIDLGLQLANFFAFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKE ::. . ....:: ::..:.:.. :. CCDS11 --DFVVV-------LTYANSCANPILYAFLSDNFKKSFQNVLCLVKVSGTDDGERSDSKQ 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 IFQLFWRN CCDS11 DKSRLNETTETQRTLLNGDLQTSI 350 360 353 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 23:55:44 2016 done: Sun Nov 6 23:55:45 2016 Total Scan time: 2.640 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]