FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4582, 817 aa 1>>>pF1KE4582 817 - 817 aa - 817 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1845+/-0.000349; mu= 17.7705+/- 0.022 mean_var=104.6831+/-20.540, 0's: 0 Z-trim(117.2): 40 B-trim: 49 in 1/54 Lambda= 0.125353 statistics sampled from 28966 (29006) to 28966 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.34), width: 16 Scan time: 10.680 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000350 (OMIM: 190195,242300) protein-glutamine ( 817) 5599 1023.6 0 NP_000120 (OMIM: 134570,188050,608446,613225) coag ( 732) 1961 365.6 4.4e-100 NP_003232 (OMIM: 600585) protein-glutamine gamma-g ( 684) 1632 306.1 3.4e-82 XP_011532344 (OMIM: 600585) PREDICTED: protein-glu ( 729) 1632 306.1 3.6e-82 NP_001310245 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamm ( 687) 1514 284.8 9e-76 XP_011527330 (OMIM: 190196) PREDICTED: protein-glu ( 687) 1514 284.8 9e-76 NP_004604 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-g ( 687) 1514 284.8 9e-76 NP_001310247 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamm ( 627) 1395 263.2 2.5e-69 NP_003236 (OMIM: 600238) protein-glutamine gamma-g ( 693) 1355 256.0 4.1e-67 NP_443187 (OMIM: 606776) protein-glutamine gamma-g ( 710) 1340 253.3 2.8e-66 XP_016877392 (OMIM: 606776) PREDICTED: protein-glu ( 711) 1340 253.3 2.8e-66 NP_945189 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-g ( 548) 1330 251.4 7.9e-66 NP_001241663 (OMIM: 613900,613908) protein-glutami ( 625) 1329 251.3 9.9e-66 NP_945345 (OMIM: 613900,613908) protein-glutamine ( 706) 1329 251.3 1.1e-65 NP_001310246 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamm ( 606) 1283 243.0 3.1e-63 NP_963925 (OMIM: 603805,609796) protein-glutamine ( 720) 1259 238.7 7.1e-62 NP_004236 (OMIM: 603805,609796) protein-glutamine ( 638) 1110 211.7 8.4e-54 XP_011519652 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 721) 951 183.0 4.2e-45 NP_000110 (OMIM: 177070,612690) erythrocyte membra ( 721) 951 183.0 4.2e-45 XP_011519653 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 721) 951 183.0 4.2e-45 XP_011519651 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 721) 951 183.0 4.2e-45 NP_001107606 (OMIM: 177070,612690) erythrocyte mem ( 691) 948 182.4 5.9e-45 XP_011519654 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 709) 769 150.0 3.3e-35 XP_011519656 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 536) 732 143.3 2.8e-33 XP_005254282 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 656) 618 122.7 5.2e-27 XP_011519655 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 686) 618 122.7 5.4e-27 XP_011520532 (OMIM: 603805,609796) PREDICTED: prot ( 377) 394 82.0 5.3e-15 XP_016878218 (OMIM: 603805,609796) PREDICTED: prot ( 377) 394 82.0 5.3e-15 >>NP_000350 (OMIM: 190195,242300) protein-glutamine gamm (817 aa) initn: 5599 init1: 5599 opt: 5599 Z-score: 5472.8 bits: 1023.6 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5599; 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NP_000 RGTQVVGSDMTVTVEFTNPLKETLRNVWVHLDGPGVTRPMKKMFREIRPNSTVQWEEVCR 640 650 660 670 680 690 760 770 780 790 800 810 pF1KE4 PVRPGPRQLIASLDSPQLSQVHGVIQVDVAPAPGDGGFFSDAGGDSHLGETIPMASRGGA : : :.::::..: .: .:.: ..:.. : NP_000 PWVSGHRKLIASMSSDSLRHVYGELDVQIQRRPSM 700 710 720 730 >>NP_003232 (OMIM: 600585) protein-glutamine gamma-gluta (684 aa) initn: 1576 init1: 1074 opt: 1632 Z-score: 1596.7 bits: 306.1 E(85289): 3.4e-82 Smith-Waterman score: 1632; 37.9% identity (69.3% similar) in 678 aa overlap (110-779:8-675) 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 PGSRGSDSRRPVSRGSGVNAAGDGTIREGMLVVNGVDLLSSRSDQNRREHHTDEYEYDEL : : .:.:.. .: ::: :.. . NP_003 MMDASKELQVLHIDFLNQ---DNAVSHHTWEFQTSSP 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 IVRRGQPFHMLLLLSRTYESSDRITLELLIGNNPEVGKGTHVII-PVGKGGSGGWKAQVV . :::: ::. :.:.. .: .. ::. : :: ..: : :.. : . .:.: . 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NP_003 NESGKEVTVAVTSSPNAILGKYQLNVKT----GNHILK-SEENILYLLFNPWCKEDMVFM 100 110 120 130 140 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 DHEDWRQEYVLNESGRIYYGTEAQIGERTWNYGQFDHGVLDACLYILDRRGMPYGGRGDP :: :.::.::..: : :. .: . ::.:::...::: :. .: . .. : :: NP_003 PDEDERKEYILNDTGCHYVGAARSIKCKPWNFGQFEKNVLDCCISLLTESSLKPTDRRDP 150 160 170 180 190 200 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 VNVSRVISAMVNSLDDNGVLIGNWSGDYSRGTNPSAWVGSVEILLSYLRTGYSVPYGQCW : : :.. ::.. .:::::::.::: :: : :.::. :: .: : .: .:::: NP_003 VLVCRAMCAMMSFEKGQGVLIGNWTGDYEGGTAPYKWTGSAPILQQYYNTKQAVCFGQCW 210 220 230 240 250 260 380 390 400 410 420 430 pF1KE4 VFAGVTTTVLRCLGLATRTVTNFNSAHDTDTSLTMDIYFDENMKPLEHLNHDSVWNFHVW ::::. ::::: ::. .:.::.:.:::::. .::.: : .:: . . ..:::::::::: NP_003 VFAGILTTVLRALGIPARSVTGFDSAHDTERNLTVDTYVNENGEKITSMTHDSVWNFHVW 270 280 290 300 310 320 440 450 460 470 480 490 pF1KE4 NDCWMKRPDLPSGFDGWQVVDATPQETSSGIFCCGPCSVESIKNGLVYMKYDTPFIFAEV .: ::::::::.:.::::.::::::: :.:.::::: . .:..: ... ::: :.:.:: NP_003 TDAWMKRPDLPKGYDGWQAVDATPQERSQGVFCCGPSPLTAIRKGDIFIVYDTRFVFSEV 330 340 350 360 370 380 500 510 520 530 540 550 pF1KE4 NSDKVYWQ-RQDDGS--FKIVYVEEKAIGTLIVTKAISSNMREDITYLYKHPEGSDAERK :.:.. : .. .:. .... .: .:: : :::.... :.:::: ::.::::. ::. 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