FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4582, 817 aa 1>>>pF1KE4582 817 - 817 aa - 817 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2959+/-0.000849; mu= 17.2635+/- 0.052 mean_var=104.8097+/-20.816, 0's: 0 Z-trim(110.1): 24 B-trim: 43 in 1/50 Lambda= 0.125278 statistics sampled from 11371 (11389) to 11371 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.687), E-opt: 0.2 (0.35), width: 16 Scan time: 3.280 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9622.1 TGM1 gene_id:7051|Hs108|chr14 ( 817) 5599 1022.9 0 CCDS4496.1 F13A1 gene_id:2162|Hs108|chr6 ( 732) 1961 365.3 2e-100 CCDS2723.1 TGM4 gene_id:7047|Hs108|chr3 ( 684) 1632 305.9 1.5e-82 CCDS13302.1 TGM2 gene_id:7052|Hs108|chr20 ( 687) 1514 284.5 4.1e-76 CCDS33435.1 TGM3 gene_id:7053|Hs108|chr20 ( 693) 1355 255.8 1.8e-67 CCDS32213.1 TGM7 gene_id:116179|Hs108|chr15 ( 710) 1340 253.1 1.2e-66 CCDS58761.1 TGM6 gene_id:343641|Hs108|chr20 ( 625) 1329 251.1 4.4e-66 CCDS13025.1 TGM6 gene_id:343641|Hs108|chr20 ( 706) 1329 251.1 4.8e-66 CCDS32212.1 TGM5 gene_id:9333|Hs108|chr15 ( 720) 1259 238.5 3.2e-62 CCDS32211.1 TGM5 gene_id:9333|Hs108|chr15 ( 638) 1110 211.5 3.7e-54 CCDS10093.1 EPB42 gene_id:2038|Hs108|chr15 ( 721) 951 182.8 1.8e-45 CCDS45249.1 EPB42 gene_id:2038|Hs108|chr15 ( 691) 948 182.2 2.5e-45 >>CCDS9622.1 TGM1 gene_id:7051|Hs108|chr14 (817 aa) initn: 5599 init1: 5599 opt: 5599 Z-score: 5469.1 bits: 1022.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5599; 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CCDS44 VN-LQE-FLNVTSVHLFKERWDTNKVDHHTDKYENNKLIVRRGQSFYVQIDFSRPYDPRR 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 pF1KE4 DRITLELLIGNNPEVGKGTHVIIP-VGKGGSGGWKAQVVKASGQNLNLRVHTSPNAIIGK : . .: .:: :. .:::.. .: :.. :: : :..: ... : ...::. :.:: CCDS44 DLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPIVSELQSGKWGAKIVMREDRSVRLSIQSSPKCIVGK 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 FQFTVRTQSDAGEFQLPFDPRNEIYILFNPWCPEDIVYVDHEDWRQEYVLNESGRIYYGT :.. : . . : .. .:... :::::::: .: ::.:.: :.:::::. : :.:: CCDS44 FRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETDTYILFNPWCEDDAVYLDNEKEREEYVLNDIGVIFYGE 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 EAQIGERTWNYGQFDHGVLDACLYILDRRGMPYGGRGDPVNVSRVISAMVNSLDDNGVLI .: :.:.::::. :.::.:::..:: : .:::.:..:::: :::::. ::.:::. CCDS44 VNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCLYVMDRAQMDLSGRGNPIKVSRVGSAMVNAKDDEGVLV 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 GNWSGDYSRGTNPSAWVGSVEILLSYLRTGYSVPYGQCWVFAGVTTTVLRCLGLATRTVT :.:.. :. :. ::::.:::.::: : . : :::::::::: .: :::::. .: :: CCDS44 GSWDNIYAYGVPPSAWTGSVDILLEYRSSENPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARIVT 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 NFNSAHDTDTSLTMDIYFDENMKPLEHLNHDSVWNFHVWNDCWMKRPDLPSGFDGWQVVD :. ::::.:..: :::...:. . .:..:::::.: ::. :: ::::: :: :::.:: CCDS44 NYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGNVNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMTRPDLPVGFGGWQAVD 340 350 360 370 380 390 460 470 480 490 500 510 pF1KE4 ATPQETSSGIFCCGPCSVESIKNGLVYMKYDTPFIFAEVNSDKVYWQRQDDGSFKIVYVE .::::.:.:.. ::: ::..::.: : ...:.::.::::::: .: . ::. . :. CCDS44 STPQENSDGMYRCGPASVQAIKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSDLIYITAKKDGTHVVENVD 400 410 420 430 440 450 520 530 540 550 560 570 pF1KE4 EKAIGTLIVTKAISSNMREDITYLYKHPEGSDAERKAVETAAAHGSK-P-NVYANRGSAE :: ::::: :... ::: :: ::.. :: :.::: .:.: : :. . : CCDS44 ATHIGKLIVTKQIGGDGMMDITDTYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKPLNTEGVMKSRS 460 470 480 490 500 510 580 590 600 610 620 630 pF1KE4 DVAMQVEAQDAVMGQDLMVSVMLINHSSSRRTVKLHLYLSVTFYTGVSGTIFKETKKEVE .: :. :...::.:.:. .:. . :.: .: :. .: ..:::::: . ::. .: CCDS44 NVDMDFEVENAVLGKDFKLSITFRNNSHNRYTITAYLSANITFYTGVPKAEFKKETFDVT 520 530 540 550 560 570 640 650 660 670 680 690 pF1KE4 LAPGASDRVTMPVAYKEYRPHLVDQGAMLLNVSGHVKESGQVLAKQHTFRLRTPDLSLTL : : . . .. . :: .:..:... . :.....:. .:::::.. : :.. . . CCDS44 LEPLSFKKEAVLIQAGEYMGQLLEQASLHFFVTARINETRDVLAKQKSTVLTIPEIIIKV 580 590 600 610 620 630 700 710 720 730 740 750 pF1KE4 LGAAVVGQECEVQIVFKNPLPVTLTNVVFRLEGSGLQRPKILNVGDIGGNETVTLRQSFV :. :::.. : . : ::: :: :: .:.: :. :: .: : :: .. CCDS44 RGTQVVGSDMTVTVEFTNPLKETLRNVWVHLDGPGVTRPMKKMFREIRPNSTVQWEEVCR 640 650 660 670 680 690 760 770 780 790 800 810 pF1KE4 PVRPGPRQLIASLDSPQLSQVHGVIQVDVAPAPGDGGFFSDAGGDSHLGETIPMASRGGA : : :.::::..: .: .:.: ..:.. : CCDS44 PWVSGHRKLIASMSSDSLRHVYGELDVQIQRRPSM 700 710 720 730 >>CCDS2723.1 TGM4 gene_id:7047|Hs108|chr3 (684 aa) initn: 1576 init1: 1074 opt: 1632 Z-score: 1595.3 bits: 305.9 E(32554): 1.5e-82 Smith-Waterman score: 1632; 37.9% identity (69.3% similar) in 678 aa overlap (110-779:8-675) 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 PGSRGSDSRRPVSRGSGVNAAGDGTIREGMLVVNGVDLLSSRSDQNRREHHTDEYEYDEL : : .:.:.. .: ::: :.. . CCDS27 MMDASKELQVLHIDFLNQ---DNAVSHHTWEFQTSSP 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 IVRRGQPFHMLLLLSRTYESSDRITLELLIGNNPEVGKGTHVII-PVGKGGSGGWKAQVV . :::: ::. :.:.. .: .. ::. : :: ..: : :.. : . .:.: . CCDS27 VFRRGQVFHLRLVLNQPLQSYHQLKLEFSTGPNPSIAKHTLVVLDPRTPSDHYNWQATLQ 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 KASGQNLNLRVHTSPNAIIGKFQFTVRTQSDAGEFQLPFDPRNEIYILFNPWCPEDIVYV . ::..... : .:::::.::.:..:.: :. : . .: .:.:::::: ::.:.. CCDS27 NESGKEVTVAVTSSPNAILGKYQLNVKT----GNHILK-SEENILYLLFNPWCKEDMVFM 100 110 120 130 140 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 DHEDWRQEYVLNESGRIYYGTEAQIGERTWNYGQFDHGVLDACLYILDRRGMPYGGRGDP :: :.::.::..: : :. .: . ::.:::...::: :. .: . .. : :: CCDS27 PDEDERKEYILNDTGCHYVGAARSIKCKPWNFGQFEKNVLDCCISLLTESSLKPTDRRDP 150 160 170 180 190 200 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 VNVSRVISAMVNSLDDNGVLIGNWSGDYSRGTNPSAWVGSVEILLSYLRTGYSVPYGQCW : : :.. ::.. .:::::::.::: :: : :.::. :: .: : .: .:::: CCDS27 VLVCRAMCAMMSFEKGQGVLIGNWTGDYEGGTAPYKWTGSAPILQQYYNTKQAVCFGQCW 210 220 230 240 250 260 380 390 400 410 420 430 pF1KE4 VFAGVTTTVLRCLGLATRTVTNFNSAHDTDTSLTMDIYFDENMKPLEHLNHDSVWNFHVW ::::. ::::: ::. .:.::.:.:::::. .::.: : .:: . . ..:::::::::: CCDS27 VFAGILTTVLRALGIPARSVTGFDSAHDTERNLTVDTYVNENGEKITSMTHDSVWNFHVW 270 280 290 300 310 320 440 450 460 470 480 490 pF1KE4 NDCWMKRPDLPSGFDGWQVVDATPQETSSGIFCCGPCSVESIKNGLVYMKYDTPFIFAEV .: ::::::::.:.::::.::::::: :.:.::::: . .:..: ... ::: :.:.:: CCDS27 TDAWMKRPDLPKGYDGWQAVDATPQERSQGVFCCGPSPLTAIRKGDIFIVYDTRFVFSEV 330 340 350 360 370 380 500 510 520 530 540 550 pF1KE4 NSDKVYWQ-RQDDGS--FKIVYVEEKAIGTLIVTKAISSNMREDITYLYKHPEGSDAERK :.:.. : .. .:. .... .: .:: : :::.... :.:::: ::.::::. ::. CCDS27 NGDRLIWLVKMVNGQEELHVISMETTSIGKNISTKAVGQDRRRDITYEYKYPEGSSEERQ 390 400 410 420 430 440 560 570 580 590 600 610 pF1KE4 AVETAAAHGSKPNVYANRGSAED-VAMQVEAQDAVMGQDLMVSVMLINHSSSRRTVKLHL ... : :. . : :. . :.:...:...:... .:.: .... ..:.. CCDS27 VMDHAFLLLSSEREH-RRPVKENFLHMSVQSDDVLLGNSVNFTVILKRKTAALQNVNILG 450 460 470 480 490 500 620 630 640 650 660 670 pF1KE4 YLSVTFYTGVSGTIFKETKKEVELAPGASDRVTMPVAYKEYRPHLV---DQGAMLLNVSG . . .::: . . . . .: .. : ..::. . : : :. :. .. . . CCDS27 SFELQLYTGKKMAKLCDLNKTSQIQ-GQVSEVTLTLDSKTYINSLAILDDEPVIRGFIIA 510 520 530 540 550 560 680 690 700 710 720 730 pF1KE4 HVKESGQVLAKQHTFRLRTPDLSLTLLGAAVVGQECEVQIVFKNPLPVTLTNVVFRLEGS .. :: ...:.. .. :..:. : ... .:: . .::: : . ::.: : ::. CCDS27 EIVESKEIMASEVFTSFQYPEFSIELPNTGRIGQLLVCNCIFKNTLAIPLTDVKFSLESL 570 580 590 600 610 620 740 750 760 770 780 790 pF1KE4 GLQRPKILNVGDIGGNETVTLRQSFVPVRPGPRQLIASLDSPQLSQVHGVIQVDVAPAPG :.. . . : . .::. . . .:.. ::...:..:.: :..... CCDS27 GISSLQTSDHGTVQPGETIQSQIKCTPIKTGPKKFIVKLSSKQVKEINAQKIVLITK 630 640 650 660 670 680 800 810 pF1KE4 DGGFFSDAGGDSHLGETIPMASRGGA >>CCDS13302.1 TGM2 gene_id:7052|Hs108|chr20 (687 aa) initn: 741 init1: 647 opt: 1514 Z-score: 1480.0 bits: 284.5 E(32554): 4.1e-76 Smith-Waterman score: 1514; 37.4% identity (66.6% similar) in 698 aa overlap (110-789:5-687) 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 PGSRGSDSRRPVSRGSGVNAAGDGTIREGMLVVNGVDLLSSRSDQNRREHHTDEYEYDEL ::.. :: . . : :.::: . ..: CCDS13 MAEELVLERCDL---ELETNGRDHHTADLCREKL 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 IVRRGQPFHMLLLL-SRTYESS-DRITLELLIGNNPEVGKGTHVIIPVGKG-GSGGWKAQ .::::::: . : . .:.::.: : .:. .. : : ::.. .:. . : : : CCDS13 VVRRGQPFWLTLHFEGRNYEASVDSLTFSVVTGPAPSQEAGTKARFPLRDAVEEGDWTAT 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 VVKASGQNLNLRVHTSPNAIIGKFQFTVRTQSDAGEFQLPFDPRNEIYILFNPWCPEDIV :: . .:.:.. : :: :: ......... .: ... .::: ::: : : CCDS13 VVDQQDCTLSLQLTTPANAPIGLYRLSLEASTG---YQGSSFVLGHFILLFNAWCPADAV 100 110 120 130 140 260 270 280 290 300 pF1KE4 YVDHEDWRQEYVLNESGRIYYGTEAQIGERTWNYGQFDHGVLDACLYILD-------RRG :.: :. ::::::...: :: :. : . ::.:::. :.:: :: .:: : CCDS13 YLDSEEERQEYVLTQQGFIYQGSAKFIKNIPWNFGQFEDGILDICLILLDVNPKFLKNAG 150 160 170 180 190 200 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 MPYGGRGDPVNVSRVISAMVNSLDDNGVLIGNWSGDYSRGTNPSAWVGSVEILLSYLRTG . :..:: :.::.:.::: ::.:::.: :...:. :..: .:.:::.:: . : CCDS13 RDCSRRSSPVYVGRVVSGMVNCNDDQGVLLGRWDNNYGDGVSPMSWIGSVDILRRWKNHG 210 220 230 240 250 260 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 -YSVPYGQCWVFAGVTTTVLRCLGLATRTVTNFNSAHDTDTSLTMDIYFDENMKPLEHLN : ::::::::.:. :::::::. ::.:::.::::: ...: .. :: ... .. . CCDS13 CQRVKYGQCWVFAAVACTVLRCLGIPTRVVTNYNSAHDQNSNLLIE-YFRNEFGEIQGDK 270 280 290 300 310 320 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 HDSVWNFHVWNDCWMKRPDLPSGFDGWQVVDATPQETSSGIFCCGPCSVESIKNGLVYMK . .:::: : . :: :::: :..:::..: :::: : : .:::: :..::.: . : CCDS13 SEMIWNFHCWVESWMTRPDLQPGYEGWQALDPTPQEKSEGTYCCGPVPVRAIKEGDLSTK 330 340 350 360 370 380 490 500 510 520 530 540 pF1KE4 YDTPFIFAEVNSDKVYWQRQDDGSFKIVYVEEKAIGTLIVTKAISSNMREDITYLYKHPE ::.::.:::::.: : : .::::: . . .: : ::... . :::::. ::.:: CCDS13 YDAPFVFAEVNADVVDWIQQDDGSVHKSINRSLIVGLKISTKSVGRDEREDITHTYKYPE 390 400 410 420 430 440 550 560 570 580 590 600 pF1KE4 GSDAERKAVETAAAHGSKPNVYANRGSAEDVAMQVEA-QDAVMGQDLMVSVMLINHSSSR ::. ::.: : : : .: . : .::.... :. ::.:. : . . :... . CCDS13 GSSEEREAF-TRANHLNKLAEKEETG----MAMRIRVGQSMNMGSDFDVFAHITNNTAEE 450 460 470 480 490 500 610 620 630 640 650 660 pF1KE4 RTVKLHLYLSVTFYTGVSGTIFKETKK--EVELAPGASDRVTMPVAYKEYRPHLVDQGAM . .: : .. :.:. : :: ...: : . : . . :..:: :.... CCDS13 YVCRLLLCARTVSYNGILGPECG-TKYLLNLNLEPFSEKSVPLCILYEKYRDCLTESN-- 510 520 530 540 550 670 680 690 700 710 720 pF1KE4 LLNVSGHVKES--GQVLAKQHTFRLRTPDLSLTLLGAAVVGQECEVQIVFKNPLPVTLTN :..: . . : .. : .. . :..:.... .:: .. ... ..:::::.: . CCDS13 LIKVRALLVEPVINSYLLAERDLYLENPEIKIRILGEPKQKRKLVAEVSLQNPLPVALEG 560 570 580 590 600 610 730 740 750 760 770 780 pF1KE4 VVFRLEGSGL-QRPKILNVGD-IGGNETVTLRQSFVPVRPGPRQLIASLDSPQLSQVHGV .: .::.:: .. : ... : . ..: : .:....:.. : ..:.....: .:. :.: CCDS13 CTFTVEGAGLTEEQKTVEIPDPVEAGEEVKVRMDLLPLHMGLHKLVVNFESDKLKAVKGF 620 630 640 650 660 670 790 800 810 pF1KE4 IQVDVAPAPGDGGFFSDAGGDSHLGETIPMASRGGA .: ..:: CCDS13 RNVIIGPA 680 >>CCDS33435.1 TGM3 gene_id:7053|Hs108|chr20 (693 aa) initn: 855 init1: 523 opt: 1355 Z-score: 1324.6 bits: 255.8 E(32554): 1.8e-67 Smith-Waterman score: 1551; 36.4% identity (68.6% similar) in 700 aa overlap (114-787:5-692) 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 GSDSRRPVSRGSGVNAAGDGTIREGMLVVNGVDLLSSRSDQNRREHHTDEYEYDELIVRR ::. .. .. ::. ::::.. .:::.:: CCDS33 MAALGVQSINWQTAFNRQAHHTDKFSSQELILRR 10 20 30 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 GQPFHMLLLLSRTYESSDRITLELLIGNNPEVGKGTHVIIPVGKGGSGGWKAQVVKASGQ :: :..:..... :..:. . . : : . :....:...:.::::.: . ..:. CCDS33 GQNFQVLMIMNKGLGSNERLEFIVSTGPYPSESAMTKAVFPLSNGSSGGWSAVLQASNGN 40 50 60 70 80 90 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 NLNLRVHTSPNAIIGKFQFTVRTQSDAGEFQLPFDPRNEIYILFNPWCPEDIVYVDHEDW .:.. . . .: ::.. .... :..: .. . . . .::::: : :.. .. CCDS33 TLTISISSPASAPIGRYTMALQIFSQGGISSVKL---GTFILLFNPWLNVDSVFMGNHAE 100 110 120 130 140 150 270 280 290 300 310 pF1KE4 RQEYVLNESGRIYYGTEAQIGERTWNYGQFDHGVLDACLYILDRR-------GMPYGGRG :.::: ...: :. :. .:: ::.:::.. .:. :: :::: . ..:. 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