Result of FASTA (omim) for pFN21AB6122
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6122, 584 aa
  1>>>pF1KB6122 584 - 584 aa - 584 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5406+/-0.000686; mu= -8.4503+/- 0.043
 mean_var=533.3118+/-112.997, 0's: 0 Z-trim(117.5): 225  B-trim: 428 in 2/53
 Lambda= 0.055537
 statistics sampled from 29318 (29559) to 29318 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.347), width:  16
 Scan time:  9.720

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) kera ( 584) 3884 326.7 1.3e-88
XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) P ( 624) 3868 325.5 3.3e-88
NP_000217 (OMIM: 144200,607606) keratin, type I cy ( 623) 2029 178.1 7.4e-44
NP_061889 (OMIM: 607742) keratin, type I cytoskele ( 525) 1743 155.1 5.2e-37
XP_016879788 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 494) 1696 151.3 6.9e-36
NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, ty ( 473) 1644 147.1 1.2e-34
NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,14806 ( 472) 1643 147.1 1.3e-34
NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskele ( 456) 1628 145.8 2.8e-34
NP_000214 (OMIM: 122100,601687) keratin, type I cy ( 494) 1621 145.3 4.4e-34
XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 463) 1597 143.4 1.6e-33
NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 458) 1589 142.7 2.5e-33
NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 420) 1588 142.6 2.5e-33
XP_016880103 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 437) 1585 142.4   3e-33
NP_853513 (OMIM: 616677) keratin, type I cytoskele ( 464) 1544 139.1 3.1e-32
NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, ty ( 432) 1535 138.4 4.8e-32
NP_853515 (OMIM: 616676) keratin, type I cytoskele ( 459) 1521 137.3 1.1e-31
XP_011522716 (OMIM: 616646,616760) PREDICTED: kera ( 448) 1488 134.6 6.7e-31
NP_853512 (OMIM: 616646,616760) keratin, type I cy ( 450) 1488 134.6 6.7e-31
NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskele ( 400) 1416 128.8 3.4e-29
NP_853517 (OMIM: 616675) keratin, type I cytoskele ( 468) 1387 126.5 1.9e-28
XP_006721802 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 427) 1362 124.5 7.1e-28
XP_011522762 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 422) 1348 123.4 1.5e-27
NP_003762 (OMIM: 604540) keratin, type I cuticular ( 467) 1202 111.7 5.4e-24
NP_002271 (OMIM: 602764) keratin, type I cuticular ( 455) 1186 110.4 1.3e-23
XP_011523096 (OMIM: 602764) PREDICTED: keratin, ty ( 455) 1186 110.4 1.3e-23
NP_006112 (OMIM: 113800,139350,144200,146590,60096 ( 644) 1123 105.6 5.4e-22
NP_002269 (OMIM: 602760) keratin, type I cuticular ( 448) 1115 104.7 6.6e-22
NP_004129 (OMIM: 602761) keratin, type I cuticular ( 404) 1089 102.6 2.6e-21
NP_002268 (OMIM: 601077) keratin, type I cuticular ( 416) 1089 102.6 2.7e-21
NP_002270 (OMIM: 602762) keratin, type I cuticular ( 404) 1075 101.5 5.7e-21
NP_061883 (OMIM: 608218) keratin, type I cytoskele ( 424) 1071 101.2 7.4e-21
NP_954657 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 1065 100.7   1e-20
NP_000215 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 1065 100.7   1e-20
NP_000414 (OMIM: 146800,600194) keratin, type II c ( 639) 1067 101.1 1.2e-20
XP_011523095 (OMIM: 602763) PREDICTED: keratin, ty ( 412) 1038 98.5 4.5e-20
NP_066293 (OMIM: 602763) keratin, type I cuticular ( 436) 1038 98.5 4.7e-20
NP_476429 (OMIM: 122100,148043) keratin, type II c ( 628) 1039 98.8 5.6e-20
NP_056932 (OMIM: 616671) keratin, type II cytoskel ( 638)  980 94.1 1.5e-18
NP_056330 (OMIM: 606194) keratin, type I cytoskele ( 422)  965 92.7 2.7e-18
NP_003761 (OMIM: 604541) keratin, type I cuticular ( 449)  960 92.3 3.6e-18
NP_872303 (OMIM: 616679) keratin, type I cytoskele ( 431)  957 92.0 4.2e-18
XP_016879678 (OMIM: 616679) PREDICTED: keratin, ty ( 484)  957 92.1 4.5e-18
NP_006762 (OMIM: 604542) keratin, type I cuticular ( 456)  949 91.4 6.8e-18
NP_998821 (OMIM: 616678) keratin, type I cytoskele ( 491)  941 90.8 1.1e-17
NP_000415 (OMIM: 131760,131800,131900,131960,14804 ( 590)  917 89.0 4.7e-17
NP_778253 (OMIM: 611158) keratin, type II cytoskel ( 578)  871 85.3   6e-16
NP_775109 (OMIM: 612315,615735) keratin, type II c ( 564)  771 77.3 1.5e-13
NP_005546 (OMIM: 148042,615728) keratin, type II c ( 564)  770 77.2 1.6e-13
NP_005545 (OMIM: 148041,615726) keratin, type II c ( 564)  769 77.1 1.7e-13
NP_002263 (OMIM: 123940,193900) keratin, type II c ( 520)  754 75.9 3.7e-13


>>NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) keratin,  (584 aa)
 initn: 3884 init1: 3884 opt: 3884  Z-score: 1711.9  bits: 326.7 E(85289): 1.3e-88
Smith-Waterman score: 3884; 99.8% identity (100.0% similar) in 584 aa overlap (1-584:1-584)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSVRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MSVRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 SSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGSFGGGSFGGGSFGGGSFGGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGSFGGGSFGGGSFGGGSFGGG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 GFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 WYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYEN
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pF1KB6 EVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTG
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pF1KB6 DVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISS
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pF1KB6 YKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQ
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pF1KB6 IRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGG
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pF1KB6 GSSGGGYGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGG
       ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGG
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              550       560       570       580    
pF1KB6 GYGGGSSGGGSSSGGGYGGGSSSGGHKSSSSGSVGESSSKGPRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GYGGGSSGGGSSSGGGYGGGSSSGGHKSSSSGSVGESSSKGPRY
              550       560       570       580    

>>XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) PREDI  (624 aa)
 initn: 3868 init1: 3868 opt: 3868  Z-score: 1704.7  bits: 325.5 E(85289): 3.3e-88
Smith-Waterman score: 3868; 99.7% identity (99.8% similar) in 583 aa overlap (1-583:1-583)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSVRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MSVRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 SSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGSFGGGSFGGGSFGGGSFGGG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
XP_005 SSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGIFGGGSFGGGSFGGGSFGGG
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pF1KB6 GFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYEN
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pF1KB6 EVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTG
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pF1KB6 DVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISS
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              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 YKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQ
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pF1KB6 IRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGG
              430       440       450       460       470       480

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pF1KB6 GSSGGGYGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGG
       ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580                    
pF1KB6 GYGGGSSGGGSSSGGGYGGGSSSGGHKSSSSGSVGESSSKGPRY                
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                 
XP_005 GYGGGSSGGGSSSGGGYGGGSSSGGHKSSSSGSVGESSSKGPRSAETSWDTNKTRVIKTI
              550       560       570       580       590       600

XP_005 IEEVAPDGRVLSSMVESETKKHYY
              610       620    

>>NP_000217 (OMIM: 144200,607606) keratin, type I cytosk  (623 aa)
 initn: 3222 init1: 1268 opt: 2029  Z-score: 908.4  bits: 178.1 E(85289): 7.4e-44
Smith-Waterman score: 2075; 57.1% identity (79.5% similar) in 624 aa overlap (1-584:1-613)

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pF1KB6 MSVRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSL--RISSSKGSLGGG-FSSG-GFSGGS
       :: :  ::.. : :   ::::::: :.::.. :   :.::: :. ::: :::. :..:::
NP_000 MSCRQFSSSYLSRS---GGGGGGGLGSGGSIRSSYSRFSSSGGGGGGGRFSSSSGYGGGS
               10           20        30        40        50       

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pF1KB6 FSR--GSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSS--FGGSYGGSFGG-GSFGGGS
        ::  : .::: :: : :: .: :::...:. :..:..:  :::. ::.... :.:::: 
NP_000 -SRVCGRGGGGSFGYSYGGGSG-GGFSASSLGGGFGGGSRGFGGASGGGYSSSGGFGGG-
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       :::::  :::::::   ::::  ::::: :: :::.:..::: :::.::.:::::::::.
NP_000 FGGGS--GGGFGGGYGSGFGGFGGFGGGAGGGDGGILTANEKSTMQELNSRLASYLDKVQ
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pF1KB6 ALEESNYELEGKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQID
       ::::.: .::.::..::.:.: .  .  ..:: ::.::::::.::..::. : . ::.::
NP_000 ALEEANNDLENKIQDWYDKKGPA--AIQKNYSPYYNTIDDLKDQIVDLTVGNNKTLLDID
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pF1KB6 NARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKK
       :.:.. ::::.:.: :  :::.:.:::::::.:::.::. :.::::: :.: :::  :::
NP_000 NTRMTLDDFRIKFEMEQNLRQGVDADINGLRQVLDNLTMEKSDLEMQYETLQEELMALKK
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pF1KB6 NHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSK
       ::.:::..: . ..::::::.:.::: :::. ::.::..::::  .:::: :  .. .  
NP_000 NHKEEMSQLTGQNSGDVNVEINVAPGKDLTKTLNDMRQEYEQLIAKNRKDIENQYETQIT
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pF1KB6 ELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLS
       ..  :.... ....:  .:.:.::..:: :::::::::. : .:: :: .:..::: ::.
NP_000 QIEHEVSSSGQEVQSSAKEVTQLRHGVQELEIELQSQLSKKAALEKSLEDTKNRYCGQLQ
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pF1KB6 QIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEG-----EGSSG
       .:: ::: :: :. ..: : :::: ::. ::.::.:::.::.::..::::     :.:..
NP_000 MIQEQISNLEAQITDVRQEIECQNQEYSLLLSIKMRLEKEIETYHNLLEGGQEDFESSGA
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pF1KB6 G----GGRGG--GSFG-GGYGG--GSSGGGSSGGGYGGGHG--GSSGGGYGGGSSGGGSS
       :    :::::  ::.: :. ::  :: :::.:::::::: :  :.:::.:::::..::.:
NP_000 GKIGLGGRGGSGGSYGRGSRGGSGGSYGGGGSGGGYGGGSGSRGGSGGSYGGGSGSGGGS
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     510              520       530         540       550       560
pF1KB6 GGGYGGGS-------SSGGHGGSSSGGYGGGS-SGGG-GGGYGGGSSGGGSSSGGGYGGG
       ::::::::       :.:::.:.:.:.::::: :::: :::::::: :. ..:::..:::
NP_000 GGGYGGGSGGGHSGGSGGGHSGGSGGNYGGGSGSGGGSGGGYGGGS-GSRGGSGGSHGGG
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pF1KB6 SSSGGHKSSSSGSVGESSSKGPRY          
       :. ::....: :.  :.:..:  :          
NP_000 SGFGGESGGSYGGGEEASGSGGGYGGGSGKSSHS
     590       600       610       620   

>>NP_061889 (OMIM: 607742) keratin, type I cytoskeletal   (525 aa)
 initn: 1234 init1: 1234 opt: 1743  Z-score: 785.4  bits: 155.1 E(85289): 5.2e-37
Smith-Waterman score: 1743; 60.2% identity (81.9% similar) in 502 aa overlap (6-494:2-494)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSVRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRG
            : :.. ::::.::....   .::.. ::    .:. .:::. :. :: ::. : .
NP_061     MSCSSRASSSRAGGSSSARVSAGGSSFSS----GSRCGLGGS-SAQGFRGGASSCS
                   10        20            30         40        50 

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pF1KB6 SSGG--GCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSS-FGGSYGGSFGGGS-FGGGS-FGGG
        :::  : :::: ::  :  . ::: : :. ::.. :::  :.:::: : :: :: : :.
NP_061 LSGGSSGAFGGSFGGGFGSCSVGGG-FGGASGSGTGFGG--GSSFGGVSGFGRGSGFCGS
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pF1KB6 S-FGGGGFGG-GGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYE
       : :..:. ::  ..:::.::: : ::::.::.:: ::::::::::.::::::::::.: .
NP_061 SRFSSGATGGFYSYGGGMGGGVG-DGGLFSGGEKQTMQNLNDRLANYLDKVRALEEANTD
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pF1KB6 LEGKIKEWYEKHG--NSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAA
       ::.::::::.:.:  ..  :  :::::::. :.::.:::.  :..::.:.:.::::::::
NP_061 LENKIKEWYDKYGPGSGDGGSGRDYSKYYSIIEDLRNQIIAATVENAGIILHIDNARLAA
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pF1KB6 DDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEM
       ::::::::::. :::::::::::::.:::.::.:..::::::::.:::::::.:::::::
NP_061 DDFRLKYENELCLRQSVEADINGLRKVLDDLTMTRSDLEMQIESFTEELAYLRKNHEEEM
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pF1KB6 KDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEI
       :.... : :.:.::::::::.:::.:::.::.:::.::::::..::  ::..:  : ..:
NP_061 KNMQGSSGGEVTVEMNAAPGTDLTKLLNDMRAQYEELAEQNRREAEERFNKQSASLQAQI
       290       300       310       320       330       340       

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pF1KB6 DNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQI
       ...    .: :.:::::.:..::::::::::::.:.:::..::.::. : .:::.::.::
NP_061 STDAGAATSAKNEITELKRTLQALEIELQSQLAMKSSLEGTLADTEAGYVAQLSEIQTQI
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pF1KB6 SALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGG----GGRGGG
       :::::.. :: .::.:::.::.:::::: ::: ::.::: ::.:::....    :::..:
NP_061 SALEEEICQIWGETKCQNAEYKQLLDIKTRLEVEIETYRRLLDGEGGGSSFAEFGGRNSG
       410       420       430       440       450       460       

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pF1KB6 SFGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSS
       : . :     :: . ::.  : :. .:                                 
NP_061 SVNMGSRDLVSGDSRSGSCSGQGRDSSKTRVTKTIVEELVDGKVVSSQVSSISEVKVK  
       470       480       490       500       510       520       

>>XP_016879788 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, type I  (494 aa)
 initn: 1213 init1: 1213 opt: 1696  Z-score: 765.3  bits: 151.3 E(85289): 6.9e-36
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               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSVRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRG
            : :.. ::::.::....   .::.. ::    .:. .:::. :. :: ::. : .
XP_016     MSCSSRASSSRAGGSSSARVSAGGSSFSS----GSRCGLGGS-SAQGFRGGASSCS
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pF1KB6 SSGG--GCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSS-FGGSYGGSFGGGS-FGGGS-FGGG
        :::  : :::: ::  :  . ::: : :. ::.. :::  :.:::: : :: :: : :.
XP_016 LSGGSSGAFGGSFGGGFGSCSVGGG-FGGASGSGTGFGG--GSSFGGVSGFGRGSGFCGS
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pF1KB6 S-FGGGGFGG-GGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYE
       : :..:. ::  ..:::.::: : ::::.::.:: ::::::::::.::::::::::.: .
XP_016 SRFSSGATGGFYSYGGGMGGGVG-DGGLFSGGEKQTMQNLNDRLANYLDKVRALEEANTD
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           180         190       200       210       220       230 
pF1KB6 LEGKIKEWYEKHG--NSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAA
       ::.::::::.:.:  ..  :  :::::::. :.::.:::.  :..::.:.:.::::::::
XP_016 LENKIKEWYDKYGPGSGDGGSGRDYSKYYSIIEDLRNQIIAATVENAGIILHIDNARLAA
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pF1KB6 DDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEM
       ::::::::::. :::::::::::::.:::.::.:..::::::::.:::::::.:::::::
XP_016 DDFRLKYENELCLRQSVEADINGLRKVLDDLTMTRSDLEMQIESFTEELAYLRKNHEEEM
       230       240       250       260       270       280       

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pF1KB6 KDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEI
       :.... : :.:.::::::::.:::.:::.::.:::.::::::..::  ::..:  : ..:
XP_016 KNMQGSSGGEVTVEMNAAPGTDLTKLLNDMRAQYEELAEQNRREAEERFNKQSASLQAQI
       290       300       310       320       330       340       

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pF1KB6 DNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQI
       ...    .: :.:::::.:..::::::::::::.:.:::..::.::. : .:::.::.::
XP_016 STDAGAATSAKNEITELKRTLQALEIELQSQLAMKSSLEGTLADTEAGYVAQLSEIQTQI
       350       360       370       380       390       400       

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pF1KB6 SALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGG
       :::::.. :: .::.:::.::.:::::: ::: ::.::: ::.:::              
XP_016 SALEEEICQIWGETKCQNAEYKQLLDIKTRLEVEIETYRRLLDGEGGEVYTRMMRMVDVA
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pF1KB6 GYGGGSSGGGSSGGGYGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYG
                                                                   
XP_016 SILTEMTNKKQGSQQAAQSKRLKYLKL                                 
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>>NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, type I  (473 aa)
 initn: 1321 init1: 1157 opt: 1644  Z-score: 743.0  bits: 147.1 E(85289): 1.2e-34
Smith-Waterman score: 1644; 60.8% identity (81.9% similar) in 452 aa overlap (37-483:12-452)

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pF1KB6 SSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSS---G
                                     :: ::: : :   ::..::: :: ::   :
NP_005                    MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIG---GGIGGGS-SRISSVLAG
                                  10        20            30       

            70        80        90       100       110       120   
pF1KB6 GGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGSFGGGSFGGGSFGGGSFGGGGFG
       :.: . :.  ::  ::.. .:  .: :. ..::.:::.:...:  :..::::  :: : :
NP_005 GSCRAPST--YG--GGLSVSSRFSSGGACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAG
        40            50        60        70        80        90   

            130       140       150       160       170       180  
pF1KB6 -GGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKEWY
        :::.:.::::::.:  ::: :.::::::::::::::::::::::::.: .:: ::..::
NP_005 FGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWY
           100       110       120       130       140       150   

            190       200       210       220       230       240  
pF1KB6 EKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYENEV
       ...  :   : .::: :.:::.::.:.:.  : .::. .:::::::::::::: :::.:.
NP_005 QRQRPS---EIKDYSPYFKTIEDLRNKIIAATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHEL
              160       170       180       190       200       210

            250       260       270       280       290       300  
pF1KB6 ALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDV
       ::::.::::.::::::::::::...:::::::.: ::::::.:::::::  ::. . :::
NP_005 ALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDV
              220       230       240       250       260       270

            310       320       330       340       350       360  
pF1KB6 NVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISSYK
       ::::.:::::::...::.::.::::.::.::.:::.::  :..::. :. .: : ..: .
NP_005 NVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEKNRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSR
              280       290       300       310       320       330

            370       380       390       400       410       420  
pF1KB6 SEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQIR
       ::.::::: .:.:::::::::..: ::: :: ::.::::.::::::. :...:::: :.:
NP_005 SEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLR
              340       350       360       370       380       390

            430       440       450       460        470       480 
pF1KB6 AETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGG-SFGGGYGGGSSGGG
        : : :. ::: :::.: :::.:: ::: ::::: .  .. ...: :...     ::...
NP_005 CEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSS
              400       410       420       430       440       450

             490       500       510       520       530       540 
pF1KB6 SSGGGYGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGGG
       ::                                                          
NP_005 SSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS                                     
              460       470                                        

>>NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,148066,16  (472 aa)
 initn: 1232 init1: 1232 opt: 1643  Z-score: 742.6  bits: 147.1 E(85289): 1.3e-34
Smith-Waterman score: 1650; 65.0% identity (83.6% similar) in 426 aa overlap (37-456:12-422)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KB6 SSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSS---G
                                     :: ::: : :   ::..::: :: ::   :
NP_000                    MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIG---GGIGGGS-SRISSVLAG
                                  10        20            30       

            70        80         90       100         110       120
pF1KB6 GGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFR-GSYGSSSFGGSYGGSFGGGS--FGGGSFGGGSFGGG
       :.: . :.  :::  :.. .: : .: :. ..::.:::.:...:  ::.: :::: .:::
NP_000 GSCRAPST--YGG--GLSVSSSRFSSGGAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSG-FGGG-YGGG
        40            50        60        70        80          90 

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 GFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKE
          :.:.::::::::.:  ::: :.::::::::::::::::::::::::.: .:: ::..
NP_000 L--GAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRD
               100       110       120       130       140         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 WYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYEN
       ::...   . .: .::: :.:::.::.:.::. :.::::.::::::::::::::: :::.
NP_000 WYQRQ---RPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYET
     150          160       170       180       190       200      

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 EVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTG
       :. ::.::::::::::::::::::..:::::::::: ::::::::::::::. ::.   :
NP_000 ELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGG
        210       220       230       240       250       260      

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 DVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISS
       ::::::.:::::::...::.::.:::..::.:::::: ::  :..::. :. .: : ..:
NP_000 DVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQS
        270       280       290       300       310       320      

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 YKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQ
        ::::.::::..: :::::::::..: ::: :: ::.::::.::.::: .:...:::: :
NP_000 GKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQ
        330       340       350       360       370       380      

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 IRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGG
       .: : : :: ::. :::.: :::.:: ::: :::::                        
NP_000 LRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSR
        390       400       410       420       430       440      

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 GSSGGGYGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGG
                                                                   
NP_000 QIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN                                  
        450       460       470                                    

>>NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskeletal   (456 aa)
 initn: 1189 init1: 1189 opt: 1628  Z-score: 736.3  bits: 145.8 E(85289): 2.8e-34
Smith-Waterman score: 1628; 62.8% identity (83.6% similar) in 433 aa overlap (48-472:9-431)

        20        30        40        50        60           70    
pF1KB6 GGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSS---GGGCFGGSS-GG
                                     ::. :.::: .::.:   ::: :::.: .:
NP_002                       MTTTFLQTSSSTFGGGS-TRGGSLLAGGGGFGGGSLSG
                                     10         20        30       

            80        90       100       110       120       130   
pF1KB6 YGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGSFGGGSFGGGSFGGGSFGGGGFGGGGFGGGFGG
        ::  .....: :  . ::. ::.:::..   .::::.   ::  :::::::  ::::::
NP_002 GGGSRSISASSAR--FVSSGSGGGYGGGMRVCGFGGGA---GSVFGGGFGGG-VGGGFGG
        40        50          60        70           80         90 

            140       150       160       170       180       190  
pF1KB6 GFGG-DGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKEWYEKHGNSHQGE
       :::: ::::::::::.:::::::::::::::::::::.: .:: ::..::.:.  .    
NP_002 GFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTS---
             100       110       120       130       140           

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB6 PR-DYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYENEVALRQSVEAD
       :. :::.:.:::..:...:.  : ::. ..:.::::::::::::::::::.::::.::::
NP_002 PECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEAD
      150       160       170       180       190       200        

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB6 INGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPG
       :::::::::::::...:::::::.:.:::::::::::::::.. .  .:.:::::.::::
NP_002 INGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPG
      210       220       230       240       250       260        

             320       330       340       350       360       370 
pF1KB6 VDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRN
       ::::..: .:: ::: .::.::.:.::::  :..::. :. .: :.:.. :.:::.:::.
NP_002 VDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRT
      270       280       290       300       310       320        

             380       390       400       410       420       430 
pF1KB6 VQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTE
       .: :::::::::..: .:: :::::: :: .::.:::. :..:: ::...: : : :: :
NP_002 MQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQE
      330       340       350       360       370       380        

             440       450         460       470       480         
pF1KB6 YQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGS--SGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGYGG
       :..::::: :::.:: ::::::::. .  .: : : ..: :::                 
NP_002 YKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMAGIGIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQV
      390       400       410       420       430       440        

     490       500       510       520       530       540         
pF1KB6 GHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGGGYGGGSSGG
                                                                   
NP_002 VSSHKREI                                                    
      450                                                          

>>NP_000214 (OMIM: 122100,601687) keratin, type I cytosk  (494 aa)
 initn: 1512 init1: 1180 opt: 1621  Z-score: 732.9  bits: 145.3 E(85289): 4.4e-34
Smith-Waterman score: 1623; 60.9% identity (83.3% similar) in 432 aa overlap (31-461:21-441)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSVRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRG
                                     .::  . .   .....  ..:..:..:. :
NP_000           MDLSNNTMSLSVRTPGLSRRLSSQSVIGRPRGMSASSVGSGYGGSAFGFG
                         10        20        30        40        50

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 SSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGSFGGGSFGGGSFGGGSFGGG
       .: :: :...:  .:. .::::::  ::  ....:..:: ..:::::::         : 
NP_000 ASCGGGFSAASM-FGSSSGFGGGS--GSSMAGGLGAGYGRALGGGSFGGL--------GM
               60         70          80        90                 

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 GFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKE
       ::::.  ::..:   :.:::::::.:: :::::::::::::::::::::.: :::.::.:
NP_000 GFGGSPGGGSLGILSGNDGGLLSGSEKETMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELENKIRE
     100       110       120       130       140       150         

               190       200       210       220       230         
pF1KB6 WYEKHGN-SHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYE
       ::: .:. . ..   ::::::  :.::.:.:.. .  ::..:::::::::::.:::.:::
NP_000 WYETRGTGTADASQSDYSKYYPLIEDLRNKIISASIGNAQLLLQIDNARLAAEDFRMKYE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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