FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6122, 584 aa 1>>>pF1KB6122 584 - 584 aa - 584 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7915+/-0.00173; mu= -3.8320+/- 0.105 mean_var=463.4052+/-94.069, 0's: 0 Z-trim(109.6): 161 B-trim: 92 in 1/53 Lambda= 0.059579 statistics sampled from 10844 (10986) to 10844 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.337), width: 16 Scan time: 3.560 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 3876 348.4 1.5e-95 CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 ( 623) 2029 189.6 9.7e-48 CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 ( 525) 1743 165.0 2.2e-40 CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 1644 156.4 7.4e-38 CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 1644 156.4 7.5e-38 CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 1621 154.4 2.9e-37 CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 1621 154.4 3e-37 CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 1589 151.7 1.9e-36 CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 1588 151.5 1.9e-36 CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17 ( 464) 1544 147.8 2.8e-35 CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 1535 147.0 4.7e-35 CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17 ( 459) 1521 145.8 1.1e-34 CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17 ( 450) 1488 143.0 7.9e-34 CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 ( 400) 1416 136.7 5.3e-32 CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17 ( 468) 1387 134.3 3.3e-31 CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 ( 467) 1202 118.4 2e-26 CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17 ( 455) 1186 117.0 5.2e-26 CCDS8836.1 KRT1 gene_id:3848|Hs108|chr12 ( 644) 1123 111.8 2.8e-24 CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17 ( 448) 1115 110.9 3.5e-24 CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17 ( 404) 1089 108.6 1.5e-23 CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17 ( 416) 1089 108.6 1.6e-23 CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17 ( 404) 1075 107.4 3.6e-23 CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17 ( 424) 1071 107.1 4.7e-23 CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 1065 106.6 6.7e-23 CCDS8835.1 KRT2 gene_id:3849|Hs108|chr12 ( 639) 1067 107.0 7.7e-23 CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17 ( 436) 1038 104.3 3.4e-22 CCDS44895.1 KRT3 gene_id:3850|Hs108|chr12 ( 628) 1039 104.5 4e-22 CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 ( 638) 980 99.5 1.4e-20 CCDS11380.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 422) 965 98.0 2.6e-20 CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17 ( 449) 960 97.6 3.6e-20 CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17 ( 431) 957 97.3 4.2e-20 CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17 ( 456) 949 96.6 7e-20 CCDS11382.1 KRT39 gene_id:390792|Hs108|chr17 ( 491) 941 96.0 1.2e-19 CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 917 94.0 5.6e-19 CCDS8837.1 KRT77 gene_id:374454|Hs108|chr12 ( 578) 871 90.1 8.5e-18 CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 771 81.5 3.2e-15 CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 ( 564) 770 81.4 3.4e-15 CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 769 81.3 3.6e-15 CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 ( 520) 754 80.0 8.5e-15 CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 745 79.2 1.5e-14 CCDS62182.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 285) 695 74.6 1.9e-13 CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 676 73.3 9.7e-13 CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 667 72.8 2.2e-12 CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 658 71.7 2.5e-12 CCDS8839.1 KRT79 gene_id:338785|Hs108|chr12 ( 535) 659 71.8 2.5e-12 CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 658 71.7 2.6e-12 CCDS8834.1 KRT73 gene_id:319101|Hs108|chr12 ( 540) 641 70.3 7.3e-12 CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 639 70.0 7.5e-12 CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 635 69.7 9.5e-12 CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 617 68.1 2.8e-11 >>CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 (584 aa) initn: 3876 init1: 3876 opt: 3876 Z-score: 1828.9 bits: 348.4 E(32554): 1.5e-95 Smith-Waterman score: 3876; 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57.1% identity (79.5% similar) in 624 aa overlap (1-584:1-613) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MSVRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSL--RISSSKGSLGGG-FSSG-GFSGGS :: : ::.. : : ::::::: :.::.. : :.::: :. ::: :::. :..::: CCDS32 MSCRQFSSSYLSRS---GGGGGGGLGSGGSIRSSYSRFSSSGGGGGGGRFSSSSGYGGGS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 FSR--GSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSS--FGGSYGGSFGG-GSFGGGS :: : .::: :: : :: .: :::...:. :..:..: :::. ::.... :.:::: CCDS32 -SRVCGRGGGGSFGYSYGGGSG-GGFSASSLGGGFGGGSRGFGGASGGGYSSSGGFGGG- 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB6 FGGGSFGGGGFGGG---GFGG--GFGGGFGG-DGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVR ::::: ::::::: :::: ::::: :: :::.:..::: :::.::.:::::::::. CCDS32 FGGGS--GGGFGGGYGSGFGGFGGFGGGAGGGDGGILTANEKSTMQELNSRLASYLDKVQ 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB6 ALEESNYELEGKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQID ::::.: .::.::..::.:.: . . ..:: ::.::::::.::..::. : . ::.:: CCDS32 ALEEANNDLENKIQDWYDKKGPA--AIQKNYSPYYNTIDDLKDQIVDLTVGNNKTLLDID 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 NARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKK :.:.. ::::.:.: : :::.:.:::::::.:::.::. :.::::: :.: ::: ::: CCDS32 NTRMTLDDFRIKFEMEQNLRQGVDADINGLRQVLDNLTMEKSDLEMQYETLQEELMALKK 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB6 NHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSK ::.:::..: . ..::::::.:.::: :::. ::.::..:::: .:::: : .. . CCDS32 NHKEEMSQLTGQNSGDVNVEINVAPGKDLTKTLNDMRQEYEQLIAKNRKDIENQYETQIT 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB6 ELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLS .. :.... ....: .:.:.::..:: :::::::::. : .:: :: .:..::: ::. CCDS32 QIEHEVSSSGQEVQSSAKEVTQLRHGVQELEIELQSQLSKKAALEKSLEDTKNRYCGQLQ 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KB6 QIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEG-----EGSSG .:: ::: :: :. ..: : :::: ::. ::.::.:::.::.::..:::: :.:.. CCDS32 MIQEQISNLEAQITDVRQEIECQNQEYSLLLSIKMRLEKEIETYHNLLEGGQEDFESSGA 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 pF1KB6 G----GGRGG--GSFG-GGYGG--GSSGGGSSGGGYGGGHG--GSSGGGYGGGSSGGGSS : ::::: ::.: :. :: :: :::.:::::::: : :.:::.:::::..::.: CCDS32 GKIGLGGRGGSGGSYGRGSRGGSGGSYGGGGSGGGYGGGSGSRGGSGGSYGGGSGSGGGS 480 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 pF1KB6 GGGYGGGS-------SSGGHGGSSSGGYGGGS-SGGG-GGGYGGGSSGGGSSSGGGYGGG :::::::: :.:::.:.:.:.::::: :::: :::::::: :. ..:::..::: CCDS32 GGGYGGGSGGGHSGGSGGGHSGGSGGNYGGGSGSGGGSGGGYGGGS-GSRGGSGGSHGGG 540 550 560 570 580 570 580 pF1KB6 SSSGGHKSSSSGSVGESSSKGPRY :. ::....: :. :.:..: : CCDS32 SGFGGESGGSYGGGEEASGSGGGYGGGSGKSSHS 590 600 610 620 >>CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 (525 aa) initn: 1234 init1: 1234 opt: 1743 Z-score: 838.5 bits: 165.0 E(32554): 2.2e-40 Smith-Waterman score: 1743; 60.2% identity (81.9% similar) in 502 aa overlap (6-494:2-494) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MSVRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRG : :.. ::::.::.... .::.. :: .:. .:::. :. :: ::. : . CCDS11 MSCSSRASSSRAGGSSSARVSAGGSSFSS----GSRCGLGGS-SAQGFRGGASSCS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB6 SSGG--GCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSS-FGGSYGGSFGGGS-FGGGS-FGGG ::: : :::: :: : . ::: : :. ::.. ::: :.:::: : :: :: : :. CCDS11 LSGGSSGAFGGSFGGGFGSCSVGGG-FGGASGSGTGFGG--GSSFGGVSGFGRGSGFCGS 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 S-FGGGGFGG-GGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYE : :..:. :: ..:::.::: : ::::.::.:: ::::::::::.::::::::::.: . CCDS11 SRFSSGATGGFYSYGGGMGGGVG-DGGLFSGGEKQTMQNLNDRLANYLDKVRALEEANTD 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 LEGKIKEWYEKHG--NSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAA ::.::::::.:.: .. : :::::::. :.::.:::. :..::.:.:.:::::::: CCDS11 LENKIKEWYDKYGPGSGDGGSGRDYSKYYSIIEDLRNQIIAATVENAGIILHIDNARLAA 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 DDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEM ::::::::::. :::::::::::::.:::.::.:..::::::::.:::::::.::::::: CCDS11 DDFRLKYENELCLRQSVEADINGLRKVLDDLTMTRSDLEMQIESFTEELAYLRKNHEEEM 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 KDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEI :.... : :.:.::::::::.:::.:::.::.:::.::::::..:: ::..: : ..: CCDS11 KNMQGSSGGEVTVEMNAAPGTDLTKLLNDMRAQYEELAEQNRREAEERFNKQSASLQAQI 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB6 DNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQI ... .: :.:::::.:..::::::::::::.:.:::..::.::. : .:::.::.:: CCDS11 STDAGAATSAKNEITELKRTLQALEIELQSQLAMKSSLEGTLADTEAGYVAQLSEIQTQI 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KB6 SALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGG----GGRGGG :::::.. :: .::.:::.::.:::::: ::: ::.::: ::.:::.... :::..: CCDS11 SALEEEICQIWGETKCQNAEYKQLLDIKTRLEVEIETYRRLLDGEGGGSSFAEFGGRNSG 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB6 SFGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSS : . : :: . ::. : :. .: CCDS11 SVNMGSRDLVSGDSRSGSCSGQGRDSSKTRVTKTIVEELVDGKVVSSQVSSISEVKVK 470 480 490 500 510 520 >>CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 (472 aa) initn: 1233 init1: 1233 opt: 1644 Z-score: 793.1 bits: 156.4 E(32554): 7.4e-38 Smith-Waterman score: 1651; 65.0% identity (83.6% similar) in 426 aa overlap (37-456:12-422) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 SSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSS---G :: ::: : : ::..::: :: :: : CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIG---GGIGGGS-SRISSVLAG 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 GGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFR-GSYGSSSFGGSYGGSFGGGS--FGGGSFGGGSFGGG :.: . :. ::: :.. .: : .: :. ..::.:::.:...: ::.: :::: .::: CCDS11 GSCRAPST--YGG--GLSVSSSRFSSGGACGLGGGYGGGFSSSSSSFGSG-FGGG-YGGG 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 GFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKE :.:.::::::::.: ::: :.::::::::::::::::::::::::.: .:: ::.. CCDS11 L--GAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRD 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 WYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYEN ::... . .: .::: :.:::.::.:.::. :.::::.::::::::::::::: :::. CCDS11 WYQRQ---RPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYET 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 EVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTG :. ::.::::::::::::::::::..:::::::::: ::::::::::::::. ::. : CCDS11 ELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGG 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 DVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISS ::::::.:::::::...::.::.:::..::.:::::: :: :..::. :. .: : ..: CCDS11 DVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQS 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 YKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQ ::::.::::..: :::::::::..: ::: :: ::.::::.::.::: .:...:::: : CCDS11 GKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQ 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 IRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGG .: : : :: ::. :::.: :::.:: ::: ::::: CCDS11 LRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSR 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 GSSGGGYGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGG CCDS11 QIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN 450 460 470 >>CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 (473 aa) initn: 1321 init1: 1157 opt: 1644 Z-score: 793.1 bits: 156.4 E(32554): 7.5e-38 Smith-Waterman score: 1644; 60.8% identity (81.9% similar) in 452 aa overlap (37-483:12-452) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 SSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSS---G :: ::: : : ::..::: :: :: : CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIG---GGIGGGS-SRISSVLAG 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 GGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGSFGGGSFGGGSFGGGSFGGGGFG :.: . :. :: ::.. .: .: :. ..::.:::.:...: :..:::: :: : : CCDS11 GSCRAPST--YG--GGLSVSSRFSSGGACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAG 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 -GGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKEWY :::.:.::::::.: ::: :.::::::::::::::::::::::::.: .:: ::..:: CCDS11 FGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWY 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 EKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYENEV ... : : .::: :.:::.::.:.:. : .::. .:::::::::::::: :::.:. CCDS11 QRQRPS---EIKDYSPYFKTIEDLRNKIIAATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHEL 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 ALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDV ::::.::::.::::::::::::...:::::::.: ::::::.::::::: ::. . ::: CCDS11 ALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDV 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 NVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISSYK ::::.:::::::...::.::.::::.::.::.:::.:: :..::. :. .: : ..: . CCDS11 NVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEKNRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSR 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 SEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQIR ::.::::: .:.:::::::::..: ::: :: ::.::::.::::::. :...:::: :.: CCDS11 SEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLR 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 AETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGG-SFGGGYGGGSSGGG : : :. ::: :::.: :::.:: ::: ::::: . .. ...: :... ::... CCDS11 CEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSS 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 SSGGGYGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGGG :: CCDS11 SSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS 460 470 >>CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 (456 aa) initn: 1189 init1: 1189 opt: 1621 Z-score: 782.6 bits: 154.4 E(32554): 2.9e-37 Smith-Waterman score: 1621; 62.2% identity (83.3% similar) in 437 aa overlap (48-478:9-434) 20 30 40 50 60 70 pF1KB6 GGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSS---GGGCFGGSS-GG ::. :.::: .::.: ::: :::.: .: CCDS11 MTTTFLQTSSSTFGGGS-TRGGSLLAGGGGFGGGSLSG 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KB6 YGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGSFGGGSFGGGSFGGGSFGGGGFGGGGFGGGFGG :: .....: : . ::. ::.:::.. .::::. :: ::::::: :::::: CCDS11 GGGSRSISASSAR--FVSSGSGGGYGGGMRVCGFGGGA---GSVFGGGFGGG-VGGGFGG 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KB6 GFGG-DGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKEWYEKHGNSHQGE :::: ::::::::::.:::::::::::::::::::::.: .:: ::..::.:. . CCDS11 GFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTS--- 100 110 120 130 140 200 210 220 230 240 250 pF1KB6 PR-DYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYENEVALRQSVEAD :. :::.:.:::..:...:. : ::. ..:.::::::::::::::::::.::::.:::: CCDS11 PECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEAD 150 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 pF1KB6 INGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPG :::::::::::::...:::::::.:.:::::::::::::::.. . .:.:::::.:::: CCDS11 INGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPG 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 pF1KB6 VDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRN ::::..: .:: ::: .::.::.:.:::: :..::. :. .: :.:.. :.:::.:::. CCDS11 VDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRT 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 pF1KB6 VQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTE .: :::::::::..: .:: :::::: :: .::.:::. :..:: ::...: : : :: : CCDS11 MQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQE 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 pF1KB6 YQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGH :..::::: :::.:: ::::::::. .. .: . .:: ::.:: CCDS11 YKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMAGIAIREASSGG-GGSSSNFHINVEESVDGQ 390 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 550 pF1KB6 GGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGGGYGGGSSGGGS CCDS11 VVSSHKREI 450 >>CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 (494 aa) initn: 1512 init1: 1180 opt: 1621 Z-score: 782.2 bits: 154.4 E(32554): 3e-37 Smith-Waterman score: 1623; 60.9% identity (83.3% similar) in 432 aa overlap (31-461:21-441) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MSVRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRG .:: . . ..... ..:..:..:. : CCDS11 MDLSNNTMSLSVRTPGLSRRLSSQSVIGRPRGMSASSVGSGYGGSAFGFG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 SSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGSFGGGSFGGGSFGGGSFGGG .: :: :...: .:. .:::::: :: ....:..:: ..::::::: : CCDS11 ASCGGGFSAASM-FGSSSGFGGGS--GSSMAGGLGAGYGRALGGGSFGGL--------GM 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 GFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKE ::::. ::..: :.:::::::.:: :::::::::::::::::::::.: :::.::.: CCDS11 GFGGSPGGGSLGILSGNDGGLLSGSEKETMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELENKIRE 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 pF1KB6 WYEKHGN-SHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYE ::: .:. . .. :::::: :.::.:.:.. . ::..:::::::::::.:::.::: CCDS11 WYETRGTGTADASQSDYSKYYPLIEDLRNKIISASIGNAQLLLQIDNARLAAEDFRMKYE 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 NEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVST ::.::::.::::::::::::::::::..:::::::::.:::::.:::::.:....: . CCDS11 NELALRQGVEADINGLRRVLDELTLTRTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEDELQSFRVGGP 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 GDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQIS :.:.:::.::::::::.:::.::.::: .:::::::::::: ::: :: ::..: ::.. CCDS11 GEVSVEMDAAPGVDLTRLLNDMRAQYETIAEQNRKDAEAWFIEKSGELRKEISTNTEQLQ 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB6 SYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQ : :::.:.::: : ::::::::::.:.::: ::::.:: ::.::::.: :: :: :: CCDS11 SSKSEVTDLRRAFQNLEIELQSQLAMKKSLEDSLAEAEGDYCAQLSQVQQLISNLEAQLL 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB6 QIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSG :.::..: ::...:.::..: ::: ::.::: ::.::... : CCDS11 QVRADAERQNVDHQRLLNVKARLELEIETYRRLLDGEAQGDGLEESLFVTDSKSQAQSTD 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KB6 GGSSGGGYGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGG CCDS11 SSKDPTKTRKIKTVVQEMVNGEVVSSQVQEIEELM 460 470 480 490 >>CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 (458 aa) initn: 1516 init1: 1174 opt: 1589 Z-score: 767.7 bits: 151.7 E(32554): 1.9e-36 Smith-Waterman score: 1624; 62.0% identity (83.1% similar) in 437 aa overlap (33-462:2-418) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 VRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRG-S :::..::..: ::::..:. . :. .:: : CCDS11 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGG-GRGVS 10 20 30 70 80 90 100 110 pF1KB6 SGGGCF--GGSSGGYGGLG---GFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGSFGGGSFGGGSFGGGS . . : :::.::::: : :::::. .:.:::.:::..::: .::: CCDS11 TCSTRFVSGGSAGGYGG-GVSCGFGGGA------GSGFGGGYGGGLGGG------YGGGL 40 50 60 70 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 FGGGGFGGGGFGGGFGGGFGG-DGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELE ::::::: :.::: ::. :::::.::::.:::::::::::::.:::::::.: .:: CCDS11 --GGGFGGG-FAGGFVD-FGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLE 80 90 100 110 120 130 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 GKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFR ::..:. :. : . :::: :::::..:...::. : .: ..:.:::::::::::: CCDS11 VKIRDWHLKQ--SPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRVILEIDNARLAADDFR 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 LKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLR ::::::.::::::::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::.:::::::::.. CCDS11 LKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFS 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 NVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNI : .:.:::::.:.::.:::..: .:: ::: .::.::.::: ::. :: ::. :...: CCDS11 NQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWFHTKSAELNKEVSTNT 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KB6 EQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALE .:.. :.:::::::..:.:::::::::..: .:: ..:::: :: .::.:::. ::..: CCDS11 AMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIE 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KB6 EQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGG ::...:.: :::: ::..::::: :::.:: ::::::::. .. : CCDS11 AQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMIGFPSSAGSVSPRST 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 pF1KB6 GSSGGGSSGGGYGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSS CCDS11 SVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP 440 450 >>CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 (420 aa) initn: 1516 init1: 1174 opt: 1588 Z-score: 767.7 bits: 151.5 E(32554): 1.9e-36 Smith-Waterman score: 1623; 62.6% identity (83.5% similar) in 431 aa overlap (33-456:2-412) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 VRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRG-S :::..::..: ::::..:. . :. .:: : CCDS11 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGG-GRGVS 10 20 30 70 80 90 100 110 pF1KB6 SGGGCF--GGSSGGYGGLG---GFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGSFGGGSFGGGSFGGGS . . : :::.::::: : :::::. .:.:::.:::..::: .::: CCDS11 TCSTRFVSGGSAGGYGG-GVSCGFGGGA------GSGFGGGYGGGLGGG------YGGGL 40 50 60 70 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 FGGGGFGGGGFGGGFGGGFGG-DGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELE ::::::: :.::: ::. :::::.::::.:::::::::::::.:::::::.: .:: CCDS11 --GGGFGGG-FAGGFVD-FGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLE 80 90 100 110 120 130 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 GKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFR ::..:. :. : . :::: :::::..:...::. : .: ..:.:::::::::::: CCDS11 VKIRDWHLKQ--SPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRVILEIDNARLAADDFR 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 LKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLR ::::::.::::::::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::.:::::::::.. 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CCDS11 AQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKKRQPP 380 390 400 410 420 480 490 500 510 520 530 pF1KB6 GSSGGGSSGGGYGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSS >>CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17 (464 aa) initn: 1432 init1: 1157 opt: 1544 Z-score: 746.7 bits: 147.8 E(32554): 2.8e-35 Smith-Waterman score: 1544; 60.8% identity (82.3% similar) in 424 aa overlap (57-478:5-416) 30 40 50 60 70 80 pF1KB6 GGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFR :: :: :. .: :.. ..::. CCDS11 MSLQFSNGSRHV-CL---RSGAGSVRPLNGGA-- 10 20 90 100 110 120 130 140 pF1KB6 GSYGSSSFGGSYGGSFGGGSFGGGSFGGGSFGGGGFGGGGFGGGFGGGFGG-DGGLLSGN : :::. ::: .:: . ..::: :: ::. .::..:.. ::.: .::::::: CCDS11 GFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGGL---GSVPGGSHAGGALGNAACIGFAGSEGGLLSGN 30 40 50 60 70 80 150 160 170 180 190 200 pF1KB6 EKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKEWYEKHG-NSHQGEPRDYSKYYKTID :::::::::::::::::.::::::.: ::: ::: ::::.: .: .: .:::.:. ::. 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CCDS11 TKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEK 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 pF1KB6 EIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGHGGSSGGGYGGGSS ::.:: :..:.:.: . ..: ::.: :.:: CCDS11 EIETYCRLIDGDGNSCSKSKG---FGSGSPGNSSKDLSKTTLVKTVVEELDQRGKVLSSR 390 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 560 pF1KB6 GGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGGGYGGGSSGGGSSSGGGYGGGSSSG CCDS11 IHSIEEKTSKMTNGKTEQRVPF 450 460 584 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 23:56:28 2016 done: Sun Nov 6 23:56:29 2016 Total Scan time: 3.560 Total Display time: 0.110 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]