Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2276
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2276, 564 aa
1>>>pF1KE2276 564 - 564 aa - 564 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7576+/-0.000534; mu= -6.8540+/- 0.033
mean_var=358.7709+/-71.358, 0's: 0 Z-trim(117.7): 174 B-trim: 85 in 1/55
Lambda= 0.067712
statistics sampled from 29784 (29966) to 29784 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.679), E-opt: 0.2 (0.351), width: 16
Scan time: 11.840
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005546 (OMIM: 148042,615728) keratin, type II c ( 564) 3628 369.0 2.2e-101
NP_775109 (OMIM: 612315,615735) keratin, type II c ( 564) 3606 366.9 9.7e-101
NP_005545 (OMIM: 148041,615726) keratin, type II c ( 564) 3592 365.5 2.5e-100
NP_000415 (OMIM: 131760,131800,131900,131960,14804 ( 590) 2773 285.5 3.1e-76
NP_004684 (OMIM: 609025,612318) keratin, type II c ( 551) 2364 245.6 3.2e-64
NP_476429 (OMIM: 122100,148043) keratin, type II c ( 628) 2167 226.4 2.2e-58
NP_006112 (OMIM: 113800,139350,144200,146590,60096 ( 644) 2089 218.8 4.4e-56
NP_056932 (OMIM: 616671) keratin, type II cytoskel ( 638) 2051 215.0 5.7e-55
NP_002263 (OMIM: 123940,193900) keratin, type II c ( 520) 2028 212.7 2.3e-54
NP_778253 (OMIM: 611158) keratin, type II cytoskel ( 578) 1989 208.9 3.5e-53
NP_787028 (OMIM: 611160) keratin, type II cytoskel ( 535) 1980 208.0 6.1e-53
NP_000414 (OMIM: 146800,600194) keratin, type II c ( 639) 1975 207.6 9.8e-53
NP_778238 (OMIM: 608247) keratin, type II cytoskel ( 540) 1866 196.9 1.4e-49
NP_258259 (OMIM: 608245,615896) keratin, type II c ( 523) 1846 194.9 5.2e-49
NP_542785 (OMIM: 608246) keratin, type II cytoskel ( 511) 1830 193.4 1.5e-48
NP_001139697 (OMIM: 608246) keratin, type II cytos ( 511) 1830 193.4 1.5e-48
NP_778223 (OMIM: 194300,608248,613981,614929) kera ( 529) 1797 190.2 1.5e-47
NP_149034 (OMIM: 602766) keratin, type II cuticula ( 600) 1753 185.9 3.1e-46
XP_011536637 (OMIM: 602766) PREDICTED: keratin, ty ( 600) 1753 185.9 3.1e-46
XP_016874238 (OMIM: 608245,615896) PREDICTED: kera ( 441) 1726 183.1 1.6e-45
XP_016874325 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 419) 1724 182.9 1.7e-45
XP_016874323 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 442) 1722 182.8 2.1e-45
NP_002264 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskel ( 483) 1702 180.8 8.5e-45
NP_001243222 (OMIM: 148060) keratin, type II cytos ( 483) 1702 180.8 8.5e-45
NP_001243211 (OMIM: 148060) keratin, type II cytos ( 511) 1702 180.9 8.8e-45
NP_005547 (OMIM: 148059) keratin, type II cytoskel ( 469) 1701 180.7 8.9e-45
NP_775487 (OMIM: 611159) keratin, type II cytoskel ( 520) 1613 172.2 3.7e-42
XP_011536627 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, ty ( 445) 1579 168.8 3.3e-41
NP_149022 (OMIM: 601078) keratin, type II cuticula ( 513) 1508 161.9 4.5e-39
XP_016874324 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 439) 1500 161.1 6.9e-39
XP_016874322 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 445) 1500 161.1 7e-39
NP_002274 (OMIM: 602032,602767) keratin, type II c ( 507) 1440 155.3 4.5e-37
NP_002272 (OMIM: 158000,602153) keratin, type II c ( 505) 1424 153.7 1.3e-36
NP_001307127 (OMIM: 158000,601928) keratin, type I ( 486) 1383 149.7 2e-35
XP_016874785 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 486) 1383 149.7 2e-35
NP_002273 (OMIM: 158000,602765) keratin, type II c ( 493) 1382 149.6 2.2e-35
XP_005268923 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 563) 1383 149.7 2.3e-35
NP_001287743 (OMIM: 611159) keratin, type II cytos ( 410) 1259 137.5 8e-32
XP_011536590 (OMIM: 611158) PREDICTED: keratin, ty ( 345) 1249 136.5 1.4e-31
NP_001139698 (OMIM: 608246) keratin, type II cytos ( 469) 1204 132.2 3.7e-30
XP_016874783 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, ty ( 292) 1082 120.1 1e-26
XP_011536591 (OMIM: 611158) PREDICTED: keratin, ty ( 322) 1056 117.6 6.3e-26
NP_001074961 (OMIM: 611161) keratin, type II cytos ( 422) 1056 117.7 7.6e-26
XP_016874326 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 271) 1051 117.0 7.8e-26
NP_872313 (OMIM: 611161) keratin, type II cytoskel ( 452) 1056 117.7 8e-26
XP_011536559 (OMIM: 608247) PREDICTED: keratin, ty ( 508) 1015 113.7 1.4e-24
NP_001287739 (OMIM: 602032,602767) keratin, type I ( 295) 885 100.8 6.3e-21
XP_011536312 (OMIM: 611159) PREDICTED: keratin, ty ( 488) 872 99.8 2.2e-20
XP_006717563 (OMIM: 116300,193060) PREDICTED: vime ( 466) 786 91.3 7.1e-18
NP_003371 (OMIM: 116300,193060) vimentin [Homo sap ( 466) 786 91.3 7.1e-18
>>NP_005546 (OMIM: 148042,615728) keratin, type II cytos (564 aa)
initn: 3628 init1: 3628 opt: 3628 Z-score: 1941.2 bits: 369.0 E(85289): 2.2e-101
Smith-Waterman score: 3628; 100.0% identity (100.0% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 EELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRATGGGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRATGGGLS
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KE2 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
::::::::::::::::::::::::
NP_005 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
550 560
>>NP_775109 (OMIM: 612315,615735) keratin, type II cytos (564 aa)
initn: 3606 init1: 3606 opt: 3606 Z-score: 1929.6 bits: 366.9 E(85289): 9.7e-101
Smith-Waterman score: 3606; 98.8% identity (99.8% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
NP_775 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 EELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
NP_775 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCASLQAAIADAEQRGEMAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRATGGGLS
:::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: :::::
NP_775 VGQVNVSVVQSTISSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGIGGGFSSSSGRAIGGGLS
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KE2 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
::::::::::::::::::::::::
NP_775 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
550 560
>>NP_005545 (OMIM: 148041,615726) keratin, type II cytos (564 aa)
initn: 3592 init1: 3592 opt: 3592 Z-score: 1922.2 bits: 365.5 E(85289): 2.5e-100
Smith-Waterman score: 3592; 98.6% identity (99.8% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
NP_005 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
NP_005 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELR
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
NP_005 VRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 EELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRATGGGLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
NP_005 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGLS
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KE2 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
::::::::::::::::::::::::
NP_005 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
550 560
>>NP_000415 (OMIM: 131760,131800,131900,131960,148040,17 (590 aa)
initn: 2636 init1: 2488 opt: 2773 Z-score: 1489.5 bits: 285.5 E(85289): 3.1e-76
Smith-Waterman score: 2864; 77.0% identity (90.1% similar) in 588 aa overlap (3-563:2-589)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLG-----GACGGAG
: .... .:.. :.::. :: :.:::..:.:.: : . :.::.: :::: .:
NP_000 MSRQSSVSFRSGGSRSFSTASAITPSVSRTSFTSVSRSGGGGGGGFGRVSLAGACGVGG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 FGSRSLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGG-AGSGFGFGGGAGIGFGLGG
.::::::.:::::::::. .. .. . .:. :::.::::: :::::::::::: ::::::
NP_000 YGSRSLYNLGGSKRISISTSGGSFRNRFGAGAGGGYGFGGGAGSGFGFGGGAGGGFGLGG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 GAGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKF
:::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::
NP_000 GAGFGGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPSIQRVRTEEREQIKTLNNKF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 ASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
NP_000 ASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDE
::::::::::::::.::::::::::::.:::::: :::::::::::::::.::.:.: ::
NP_000 LDSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLKKDVDAAYMNKVELEAKVDALMDE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 INFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAES
:::.. ..::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::
NP_000 INFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIANRSRTEAES
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 WYQTKYEELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQ
:::::::::: :::::::::::::.::.:.::::::::.:::.::::::::: :::::::
NP_000 WYQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRLRAEIDNVKKQCANLQNAIADAEQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 RGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEEC
:::.:::::.::: ::.::::::::.::::.:::::::.::::::::::::::::::::
NP_000 RGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMNTKLALDVEIATYRKLLEGEEC
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KE2 RLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLG----------LGGGSSYSY-------
::.::::: :::::: :.::::::..:: :.::: :.:::: ::
NP_000 RLSGEGVGPVNISVVTSSVSSGYGSGSGYGGGLGGGLGGGLGGGLAGGSSGSYYSSSSGG
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KE2 ---GSGLGVGG-GFSSSSGRATGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
:.::.::: :::.::::. : :..: ::.::..:...:.::::::.:
NP_000 VGLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGSSSSVKFVSTTSSSRKSFKS
540 550 560 570 580 590
>>NP_004684 (OMIM: 609025,612318) keratin, type II cytos (551 aa)
initn: 2438 init1: 2145 opt: 2364 Z-score: 1274.0 bits: 245.6 E(85289): 3.2e-64
Smith-Waterman score: 2562; 71.4% identity (89.5% similar) in 573 aa overlap (3-564:2-551)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSR-GSGGLGG-ACGGAGFGS
: ...: .:.::::::..:: :...:: :::.::.:: :::::: . .::.:::
NP_004 MSRQSSITFQSGSRRGFSTTSAITPAAGRSRFSSVSVARSAAGSGGLGRISSAGASFGS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 RSLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGL
::::.:::.::.::.: . . .:.:.::.. .: ..::::.:::.:
NP_004 RSLYNLGGAKRVSINGCGSSCRSGFGGRASNRFG---VNSGFGYGGGVG-----------
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 AGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFI
:::.::.::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::
NP_004 -GGFSGPSFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLHLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFI
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 DKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSE
:::::::::::::.:::.::::::..::::::::::..: ..:::::..:. :::::..:
NP_004 DKVRFLEQQNKVLETKWALLQEQGSRTVRQNLEPLFDSYTSELRRQLESITTERGRLEAE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFL
::::::.:::.: .::::::::::::::::.:::::::::::::::.::. .: .::::.
NP_004 LRNMQDVVEDFKVRYEDEINKRTAAENEFVALKKDVDAAYMNKVELEAKVKSLPEEINFI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 RALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQT
....::::::.::...::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::
NP_004 HSVFDAELSQLQTQVGDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESWYQT
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 KYEELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEM
::::::.::::::::::::::::.:.::::::::.::: :::::..::.::::::::::.
NP_004 KYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEISEMNRMIQRLRAEIDSVKKQCSSLQTAIADAEQRGEL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 ALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNG
:::::. :: ::.::::::::.::::.:::::::.::::::::::::::::::::::.:
NP_004 ALKDARAKLVDLEEALQKAKQDMARLLREYQELMNIKLALDVEIATYRKLLEGEECRLSG
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KE2 EGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSG-LGLGGGSSYSY--------GSGLGVGGGFSS
:::. :::::: ::.:::::..:..:.: :::::::.::. :.::: :.:::.
NP_004 EGVSPVNISVVTSTLSSGYGSGSSIGGGNLGLGGGSGYSFTTSGGHSLGAGLG-GSGFSA
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560
pF1KE2 SSGRATGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
.:.: :: ::..:..:...:.:::.::: :
NP_004 TSNR----GL---GGSGSSVKFVSTTSSSQKSYTH
530 540 550
>>NP_476429 (OMIM: 122100,148043) keratin, type II cytos (628 aa)
initn: 2033 init1: 1558 opt: 2167 Z-score: 1169.2 bits: 226.4 E(85289): 2.2e-58
Smith-Waterman score: 2251; 63.7% identity (80.4% similar) in 606 aa overlap (9-560:7-610)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
.. ... .:::. :: . : :: .: .. : . :.:. : :..::::::
NP_476 MSRQASKTSGGGSQGFSGRSAVVSGSSR--MSCVAHSGGAGGGAYGFRSGAGGFGSRS
10 20 30 40 50
70 80 90
pF1KE2 LYGLGGSKRISI------------GGG--SCAISGGYGSRAGGSYG--FGGA-------G
::.:::.: ::: ::: :::..::::. :..:: :::. :
NP_476 LYNLGGNKSISISVAAGGSRAGGFGGGRSSCAFAGGYGGGFGSGYGGGFGGGFGGGRGMG
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KE2 SGFG----FGGGAGIG----FGLGGGAGLAGGFGGPGFPVCP--------PGGIQEVTVN
.::: :::..:.: :: :: : .::::::: : ::::::::.:
NP_476 GGFGGAGGFGGAGGFGGAGGFGGPGGFGGSGGFGGPGSLGSPGGFGPGGFPGGIQEVTIN
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 QSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQ
:::: :::..::: : .:.:.:::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.:
NP_476 QSLLQPLNVEIDPQIGQVKAQEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWNLLQQQ
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250
pF1KE2 GTKTVR--QNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINK
::... .:::::::..:: :: ::::.::::::::::.::.:::::.:.::::::::
NP_476 GTSSISGTNNLEPLFENHINYLRSYLDNILGERGRLDSELKNMEDLVEDFKKKYEDEINK
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 RTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVV
::::::::::::::::.:::::::::::.:.: :::.:::.::::::::::.::::::::
NP_476 RTAAENEFVTLKKDVDSAYMNKVELQAKVDALIDEIDFLRTLYDAELSQMQSHISDTSVV
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 LSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQITAGRHGDDLRNTKQ
:::::::.::::::::::.::::.:::::.::::. :::: ::: :::::::::::::.
NP_476 LSMDNNRSLDLDSIIAEVRAQYEDIAQRSKAEAEALYQTKLGELQTTAGRHGDDLRNTKS
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 EIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQ
:: :.::::::::.::. :::: ::::.:::.:::.::::::::. ::. :. :::.::.
NP_476 EIIELNRMIQRLRAEIEGVKKQNANLQTAIAEAEQHGEMALKDANAKLQELQAALQQAKD
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 DLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVSS----
::::::..:::::::::::::::::::::::::: :..:: . :.::::.:...:
NP_476 DLARLLRDYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEEYRMSGECPSAVSISVVSSSTTSASAG
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540
pF1KE2 GYGGASGVGSGLGLGGG--------SSYSYGSGLGVGGGFSS-SSGRATGGGLSSVGGGS
::::. : : : ::::: :... :.: :.::::.. ::: . :.:..:..:.
NP_476 GYGGGYGGGMGGGLGGGFSAGGGSGSGFGRGGGGGIGGGFGGGSSGFSGGSGFGSISGAR
540 550 560 570 580 590
550 560
pF1KE2 STIKYTTTSSSSRKSYKH
.. ::.: .
NP_476 YGVSGGGFSSASNRGGSIKFSQSSQSSQRYSR
600 610 620
>>NP_006112 (OMIM: 113800,139350,144200,146590,600962,60 (644 aa)
initn: 2175 init1: 1974 opt: 2089 Z-score: 1127.9 bits: 218.8 E(85289): 4.4e-56
Smith-Waterman score: 2199; 63.4% identity (82.1% similar) in 585 aa overlap (3-557:2-584)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAG-----
: . . :: : :::..:: . . .: :: :. :: :.:: ..:::.:
NP_006 MSRQFSSRSGYRSGGGFSSGSAGIINYQRRTTSS-STRRSGGGGGRFSSCGGGGGSFGA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE2 ---FGSRSLYGLGGSKRISI----GGG-SCAISGGYGSRAGGSYGFGGAG-SGFGFGGGA
:::::: .::::: ::: ::: . ...::::. . :. ::::.: .: :.:::.
NP_006 GGGFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGGYGGGGFGGGGFGGGGFGGGGIGGGG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 GIGFGLGGGAGLAGGFGGPGF-----PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRA
::: :::. .::::: :. ::::::::::::.::::: :::..::: ::.:..
NP_006 FGGFGSGGGGFGGGGFGGGGYGGGYGPVCPPGGIQEVTINQSLLQPLNVEIDPEIQKVKS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 EEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNL
.::::::.:::.:::::::::::::::.::.::: :::. :.: .:::: ::..::::
NP_006 REREQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNLEPYFESFINNL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 RRQLDNIVGERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNK
::..:.. ....::::::.::::.::: .::::::::::: :::::::.:::::.:::.:
NP_006 RRRVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTIKKDVDGAYMTK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 VELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQY
:.:::: :.: .::.:: :::.::::::::.::.:.:.:::::::.::::::::::::::
NP_006 VDLQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDLDSIIAEVKAQY
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 EEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQ
:.:::.:.::::: ::.::::::::::::::..::.: ::.:.::.:::::::::.::::
NP_006 EDIAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRSEIDNVKKQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 CANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVE
.::: .:.::::::: :::::::::. ::::::.::.::::::..::::::.:::::.:
NP_006 ISNLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDLE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KE2 IATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLG-GGSSY-----
::::: :::::: :..:: . .:..:: : .. . ::. : :.: : : :::::
NP_006 IATYRTLLEGEESRMSGECAPNVSVSVSTSHTTISGGGSRG-GGGGGYGSGGSSYGSGGG
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KE2 SYGSGLGVGGGFSS----SSGRATGGG-LSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
::::: : ::: .: .:. ..::: .: :::.. .: . :::
NP_006 SYGSGGGGGGGRGSYGSGGSSYGSGGGSYGSGGGGGGHGSYGSGSSSGGYRGGSGGGGGG
540 550 560 570 580 590
NP_006 SSGGRGSGGGSSGGSIGGRGSSSGGVKSSGGSSSVKFVSTTYSGVTR
600 610 620 630 640
>>NP_056932 (OMIM: 616671) keratin, type II cytoskeletal (638 aa)
initn: 2091 init1: 1845 opt: 2051 Z-score: 1107.9 bits: 215.0 E(85289): 5.7e-55
Smith-Waterman score: 2208; 65.6% identity (81.0% similar) in 588 aa overlap (9-559:8-584)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACG---GAG-F
.: :. .:::. :: . : :: . :.:: :.:: :::: ::: :
NP_056 MNRQVCKKSFSGRSQGFSGRSAVVSGSSRMS----CVARSGGAGG--GACGFRSGAGSF
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KE2 GSRSLYGLGGSKRISI------------GGG--SCAISGGYGSRAGGSYG--FGGA-GSG
::::::.::..: ::: ::: ::...::::. ::::: :::. : :
NP_056 GSRSLYNLGSNKSISISVAAGSSRAGGFGGGRSSCGFAGGYGGGFGGSYGGGFGGGRGVG
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 FGFGGGAGIGFGLGG--GAGLAGG---FGGPG-F-PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQI
::::..:.: : :: : :. :: ::::: : : ::::::: :::::: :::..:
NP_056 SGFGGAGGFG-GAGGFGGPGVFGGPGSFGGPGGFGPGGFPGGIQEVIVNQSLLQPLNVEI
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 DPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEP
:: : .:.:.:::::::::::::::::::::::::::::.::: :::.: : . ..:::
NP_056 DPQIGQVKAQEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWELLQQQTTGSGPSSLEP
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKK
::.::. : .:::...:::: :..::..:::::::.:.::::::::::::::::: :::
NP_056 CFESYISFLCKQLDSLLGERGNLEGELKSMQDLVEDFKKKYEDEINKRTAAENEFVGLKK
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 DVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDS
:::::.:::::::::.:.::::..:::.::. ::::::.: ::::::::::::: ::: :
NP_056 DVDAAFMNKVELQAKVDSLTDEVSFLRTLYEMELSQMQSHASDTSVVLSMDNNRCLDLGS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 IIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLR
:::::.::::::::::..:::. :::: ::: :::::::::::::.:: :.::::::::
NP_056 IIAEVRAQYEEIAQRSKSEAEALYQTKLGELQTTAGRHGDDLRNTKSEIMELNRMIQRLR
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 SEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELM
.::..:::: ::::.:::.::::::::::::. ::. :. ::::::.::::::..:::::
NP_056 AEIENVKKQNANLQTAIAEAEQRGEMALKDANAKLQDLQTALQKAKDDLARLLRDYQELM
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KE2 NVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVS-SG--------YGGASGV
:::::::::::::::::::::::..:: . : ::::....: :: .::.::
NP_056 NVKLALDVEIATYRKLLEGEECRMSGECQSAVCISVVSNVTSTSGSSGSSRGVFGGVSGS
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 GSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRATGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYK
::: : :::: : .:: ::.:: .:. : ...: :.:: .:. .: ..::.::
NP_056 GSG-GYKGGSSSSSSSGYGVSGGSGSGYGGVSSG---STGGRGSSGSYQSSSSGSRLGGA
540 550 560 570 580
pF1KE2 H
NP_056 GSISVSHSGMGSSSGSIQTSGGSGYKSGGGGSTSIRFSQTTSSSQHSSTK
590 600 610 620 630
>>NP_002263 (OMIM: 123940,193900) keratin, type II cytos (520 aa)
initn: 1961 init1: 1865 opt: 2028 Z-score: 1096.9 bits: 212.7 E(85289): 2.3e-54
Smith-Waterman score: 2118; 67.1% identity (86.1% similar) in 517 aa overlap (16-531:13-506)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
:::: .:: . : .:..:::.:.: :: .: :...::::::
NP_002 MIARQQCVRGGPRGFSCGSAIVGGGKRGAFSSVSMS-----GG-AGRCSSGGFGSRS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
::.: :.: ::. : : ::: :. ::::: ::: :: :: :: .: .
NP_002 LYNLRGNKSISM---SVA-----GSRQGAC--FGGAG-GFGTGG-----FG-GGFGGSFS
60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
: ::::::::: :::::::.::::::::...::: ::.::.::::::: :::::::::::
NP_002 GKGGPGFPVCPAGGIQEVTINQSLLTPLHVEIDPEIQKVRTEEREQIKLLNNKFASFIDK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELR
:.:::::::::.:::.:::.: : : .::::::: :.. ::.:::.. ...:::.:::.
NP_002 VQFLEQQNKVLETKWNLLQQQTTTTSSKNLEPLFETYLSVLRKQLDTLGNDKGRLQSELK
160 170 180 190 200 210
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pF1KE2 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
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NP_002 TMQDSVEDFKTKYEEEINKRTAAENDFVVLKKDVDAAYLNKVELEAKVDSLNDEINFLKV
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NP_002 LYDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVRAQYEEIAQRSKAEAEALYQTKV
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pF1KE2 EELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
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NP_002 QQLQISVDQHGDNLKNTKSEIAELNRMIQRLRAEIENIKKQCQTLQVSVADAEQRGENAL
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pF1KE2 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
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NP_002 KDAHSKRVELEAALQQAKEELARMLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLLEGEEYRMSGEC
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NP_002 QSAVSISVVSGSTSTGGISGGLGSGSGFGLSSGFGSGSGSGFGFGGSVSGSSSSKIISTT
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pF1KE2 SSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
NP_002 TLNKRR
520
>>NP_778253 (OMIM: 611158) keratin, type II cytoskeletal (578 aa)
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Smith-Waterman score: 1989; 59.1% identity (82.1% similar) in 560 aa overlap (12-563:13-561)
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pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSR
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NP_778 MSHQFSSQSAFSSMSRRVYSTSSSAGSGGGSPAVGSVCYARGRCGGG-GYGIHGRGFGSR
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pF1KE2 SLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGG-GAGIGFGLGGGAGL
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NP_778 SLYNLGGSRSISINLMGRSTSGF--CQGGGVGGFGG-GRGFGVGSTGAG-GFG-GGGFGG
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pF1KE2 AG----GFGGPGF-PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNK
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NP_778 AGFGTSNFGLGGFGPYCPPGGIQEVTINQSLLEPLHLEVDPEIQRIKTQEREQIMVLNNK
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pF1KE2 FASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERG
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NP_778 FASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVNTSTGTNNLEPLLENYIGDLRRQVDLLSAEQM
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NP_778 RQNAEVRSMQDVVEDYKSKYEDEINKRTGSENDFVVLKKDVDAAYVSKVDLESRVDTLTG
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pF1KE2 EINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAE
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NP_778 EVNFLKYLFLTELSQVQTHISDTNVILSMDNNRSLDLDSIIDAVRTQYELIAQRSKDEAE
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NP_778 ALYQTKYQELQITAGRHGDDLKNSKMEIAELNRTVQRLQAEISNVKKQIEQMQSLISDAE
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NP_778 ERGEQALQDAWQKLQDLEEALQQSKEELARLLRDYQAMLGVKLSLDVEIATYRQLLEGEE
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pF1KE2 CRLNGEGVGQVNISVVQSTVS--SGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSS
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NP_778 SRMSGELQSHVSISVQNSQVSVNGGAGGGGSYGSG-GYGGGSGGGYGGGRSYRGG--GAR
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NP_778 GRSGGGYGSGCGGGGGS--YGGSGRSGRGSSRVQIIQTSTNTSHRRILE
540 550 560 570
564 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 23:57:53 2016 done: Sun Nov 6 23:57:55 2016
Total Scan time: 11.840 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]