Result of FASTA (ccds) for pFN21AE5710
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5710, 845 aa
  1>>>pF1KE5710 845 - 845 aa - 845 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1163+/-0.00108; mu= 0.6318+/- 0.065
 mean_var=315.1315+/-63.459, 0's: 0 Z-trim(113.5): 32  B-trim: 600 in 1/54
 Lambda= 0.072248
 statistics sampled from 14116 (14142) to 14116 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.733), E-opt: 0.2 (0.434), width:  16
 Scan time:  3.440

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34380.1 ABCF1 gene_id:23|Hs108|chr6            ( 845) 5546 592.4 1.1e-168
CCDS34381.1 ABCF1 gene_id:23|Hs108|chr6            ( 807) 3937 424.7 3.3e-118
CCDS5923.1 ABCF2 gene_id:10061|Hs108|chr7          ( 623) 1404 160.5 8.1e-39
CCDS5922.1 ABCF2 gene_id:10061|Hs108|chr7          ( 634) 1404 160.5 8.2e-39
CCDS3254.1 ABCF3 gene_id:55324|Hs108|chr3          ( 709) 1161 135.3 3.8e-31


>>CCDS34380.1 ABCF1 gene_id:23|Hs108|chr6                 (845 aa)
 initn: 5546 init1: 5546 opt: 5546  Z-score: 3141.9  bits: 592.4 E(32554): 1.1e-168
Smith-Waterman score: 5546; 99.9% identity (99.9% similar) in 845 aa overlap (1-845:1-845)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MPKAPKQQPPEPEWIGDGESTSPSDKVVKKGKKDKKIKKTFFEELAVEDKQAGEEEKVLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MPKAPKQQPPEPEWIGDGESTSPSDKVVKKGKKDKKIKKTFFEELAVEDKQAGEEEKVLK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 EKEQQQQQQQQQQKKKRDTRKGRRKKDVDDDGEEKELMERLKKLSVPTSDEEDEVPAPKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EKEQQQQQQQQQQKKKRDTRKGRRKKDVDDDGEEKELMERLKKLSVPTSDEEDEVPAPKP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 RGGKKTKGGNVFAALIQDQSEEEEEEEKHPPKPAKPEKNRINKAVPEEQQPALKGKKGKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS34 RGGKKTKGGNVFAALIQDQSEEEEEEEKHPPKPAKPEKNRINKAVSEEQQPALKGKKGKE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 EKSKGKAKPQNKFAALDNEEEDKEEEIIKEKEPPKQGKEKAKKAEQGSEEEGEGEEEEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EKSKGKAKPQNKFAALDNEEEDKEEEIIKEKEPPKQGKEKAKKAEQGSEEEGEGEEEEEE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 GGESKADDPYAHLSKKEKKKLKKQMEYERQVASLKAANAAENDFSVSQAEMSSRQAMLEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GGESKADDPYAHLSKKEKKKLKKQMEYERQVASLKAANAAENDFSVSQAEMSSRQAMLEN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 ASDIKLEKFSISAHGKELFVNADLYIVAGRRYGLVGPNGKGKTTLLKHIANRALSIPPNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ASDIKLEKFSISAHGKELFVNADLYIVAGRRYGLVGPNGKGKTTLLKHIANRALSIPPNI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 DVLLCEQEVVADETPAVQAVLRADTKRLKLLEEERRLQGQLEQGDDTAAERLEKVYEELR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DVLLCEQEVVADETPAVQAVLRADTKRLKLLEEERRLQGQLEQGDDTAAERLEKVYEELR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 ATGAAAAEAKARRILAGLGFDPEMQNRPTQKFSGGWRMRVSLARALFMEPTLLMLDEPTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ATGAAAAEAKARRILAGLGFDPEMQNRPTQKFSGGWRMRVSLARALFMEPTLLMLDEPTN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 HLDLNAVIWLNNYLQGWRKTLLIVSHDQGFLDDVCTDIIHLDAQRLHYYRGNYMTFKKMY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HLDLNAVIWLNNYLQGWRKTLLIVSHDQGFLDDVCTDIIHLDAQRLHYYRGNYMTFKKMY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 QQKQKELLKQYEKQEKKLKELKAGGKSTKQAEKQTKEALTRKQQKCRRKNQDEESQEAPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QQKQKELLKQYEKQEKKLKELKAGGKSTKQAEKQTKEALTRKQQKCRRKNQDEESQEAPE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 LLKRPKEYTVRFTFPDPPPLSPPVLGLHGVTFGYQGQKPLFKNLDFGIDMDSRICIVGPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLKRPKEYTVRFTFPDPPPLSPPVLGLHGVTFGYQGQKPLFKNLDFGIDMDSRICIVGPN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE5 GVGKSTLLLLLTGKLTPTHGEMRKNHRLKIGFFNQQYAEQLRMEETPTEYLQRGFNLPYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GVGKSTLLLLLTGKLTPTHGEMRKNHRLKIGFFNQQYAEQLRMEETPTEYLQRGFNLPYQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE5 DARKCLGRFGLESHAHTIQICKLSGGQKARVVFAELACREPDVLILDEPTNNLDIESIDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DARKCLGRFGLESHAHTIQICKLSGGQKARVVFAELACREPDVLILDEPTNNLDIESIDA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE5 LGEAINEYKGAVIVVSHDARLITETNCQLWVVEEQSVSQIDGDFEDYKREVLEALGEVMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LGEAINEYKGAVIVVSHDARLITETNCQLWVVEEQSVSQIDGDFEDYKREVLEALGEVMV
              790       800       810       820       830       840

            
pF1KE5 SRPRE
       :::::
CCDS34 SRPRE
            

>>CCDS34381.1 ABCF1 gene_id:23|Hs108|chr6                 (807 aa)
 initn: 3874 init1: 3874 opt: 3937  Z-score: 2235.8  bits: 424.7 E(32554): 3.3e-118
Smith-Waterman score: 5214; 95.4% identity (95.4% similar) in 845 aa overlap (1-845:1-807)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MPKAPKQQPPEPEWIGDGESTSPSDKVVKKGKKDKKIKKTFFEELAVEDKQAGEEEKVLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MPKAPKQQPPEPEWIGDGESTSPSDKVVKKGKKDKKIKKTFFEELAVEDKQAGEEEKVLK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 EKEQQQQQQQQQQKKKRDTRKGRRKKDVDDDGEEKELMERLKKLSVPTSDEEDEVPAPKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EKEQQQQQQQQQQKKKRDTRKGRRKKDVDDDGEEKELMERLKKLSVPTSDEEDEVPAPKP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 RGGKKTKGGNVFAALIQDQSEEEEEEEKHPPKPAKPEKNRINKAVPEEQQPALKGKKGKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS34 RGGKKTKGGNVFAALIQDQSEEEEEEEKHPPKPAKPEKNRINKAVSEEQQPALKGKKGKE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 EKSKGKAKPQNKFAALDNEEEDKEEEIIKEKEPPKQGKEKAKKAEQGSEEEGEGEEEEEE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::               
CCDS34 EKSKGKAKPQNKFAALDNEEEDKEEEIIKEKEPPKQGKEKAKKAE---------------
              190       200       210       220                    

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 GGESKADDPYAHLSKKEKKKLKKQMEYERQVASLKAANAAENDFSVSQAEMSSRQAMLEN
                              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 -----------------------QMEYERQVASLKAANAAENDFSVSQAEMSSRQAMLEN
                                230       240       250       260  

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 ASDIKLEKFSISAHGKELFVNADLYIVAGRRYGLVGPNGKGKTTLLKHIANRALSIPPNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ASDIKLEKFSISAHGKELFVNADLYIVAGRRYGLVGPNGKGKTTLLKHIANRALSIPPNI
            270       280       290       300       310       320  

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 DVLLCEQEVVADETPAVQAVLRADTKRLKLLEEERRLQGQLEQGDDTAAERLEKVYEELR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DVLLCEQEVVADETPAVQAVLRADTKRLKLLEEERRLQGQLEQGDDTAAERLEKVYEELR
            330       340       350       360       370       380  

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 ATGAAAAEAKARRILAGLGFDPEMQNRPTQKFSGGWRMRVSLARALFMEPTLLMLDEPTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ATGAAAAEAKARRILAGLGFDPEMQNRPTQKFSGGWRMRVSLARALFMEPTLLMLDEPTN
            390       400       410       420       430       440  

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 HLDLNAVIWLNNYLQGWRKTLLIVSHDQGFLDDVCTDIIHLDAQRLHYYRGNYMTFKKMY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HLDLNAVIWLNNYLQGWRKTLLIVSHDQGFLDDVCTDIIHLDAQRLHYYRGNYMTFKKMY
            450       460       470       480       490       500  

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 QQKQKELLKQYEKQEKKLKELKAGGKSTKQAEKQTKEALTRKQQKCRRKNQDEESQEAPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QQKQKELLKQYEKQEKKLKELKAGGKSTKQAEKQTKEALTRKQQKCRRKNQDEESQEAPE
            510       520       530       540       550       560  

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 LLKRPKEYTVRFTFPDPPPLSPPVLGLHGVTFGYQGQKPLFKNLDFGIDMDSRICIVGPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLKRPKEYTVRFTFPDPPPLSPPVLGLHGVTFGYQGQKPLFKNLDFGIDMDSRICIVGPN
            570       580       590       600       610       620  

              670       680       690       700       710       720
pF1KE5 GVGKSTLLLLLTGKLTPTHGEMRKNHRLKIGFFNQQYAEQLRMEETPTEYLQRGFNLPYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GVGKSTLLLLLTGKLTPTHGEMRKNHRLKIGFFNQQYAEQLRMEETPTEYLQRGFNLPYQ
            630       640       650       660       670       680  

              730       740       750       760       770       780
pF1KE5 DARKCLGRFGLESHAHTIQICKLSGGQKARVVFAELACREPDVLILDEPTNNLDIESIDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DARKCLGRFGLESHAHTIQICKLSGGQKARVVFAELACREPDVLILDEPTNNLDIESIDA
            690       700       710       720       730       740  

              790       800       810       820       830       840
pF1KE5 LGEAINEYKGAVIVVSHDARLITETNCQLWVVEEQSVSQIDGDFEDYKREVLEALGEVMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LGEAINEYKGAVIVVSHDARLITETNCQLWVVEEQSVSQIDGDFEDYKREVLEALGEVMV
            750       760       770       780       790       800  

            
pF1KE5 SRPRE
       :::::
CCDS34 SRPRE
            

>>CCDS5923.1 ABCF2 gene_id:10061|Hs108|chr7               (623 aa)
 initn: 1383 init1: 525 opt: 1404  Z-score: 810.4  bits: 160.5 E(32554): 8.1e-39
Smith-Waterman score: 1413; 38.1% identity (70.5% similar) in 627 aa overlap (213-831:2-605)

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE5 SKGKAKPQNKFAALDNEEEDKEEEIIKEKEPPKQGKEKAKKAEQGSEEEGEGEEEEEEGG
                                     :   .:.:: : ..... . . .. .::.:
CCDS59                              MPSDLAKKKAAKKKEAAKARQRPRKGHEENG
                                            10        20        30 

            250       260       270       280       290            
pF1KE5 ESKADDPYAHLSKKEKKKLKKQMEYERQVASLKAANAAENDFSVSQAEMSSRQAMLE---
       .  . .:  ....:.. . ..  : .  .  :.       :: ...:   .  ..:    
CCDS59 DV-VTEP--QVAEKNEANGRETTEVDLLTKELE-------DFEMKKAAARAVTGVLASHP
                 40        50        60               70        80 

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pF1KE5 NASDIKLEKFSISAHGKELFVNADLYIVAGRRYGLVGPNGKGKTTLLKHIANRALSIPPN
       :..:... ..:.. ::.::. .. : . .::::::.: :: ::. ::. :..: . :: .
CCDS59 NSTDVHIINLSLTFHGQELLSDTKLELNSGRRYGLIGLNGIGKSMLLSAIGKREVPIPEH
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pF1KE5 IDVLLCEQEVV-ADETPAVQAVLRADTKRLKLLEEERRLQGQLEQGDDTAAERLEKVYEE
       ::.    .:.  .:.:: .. :...::.:  : .: .::       .:.  :.: ..::.
CCDS59 IDIYHLTREMPPSDKTP-LHCVMEVDTERAMLEKEAERLAH-----EDAECEKLMELYER
             150        160       170       180            190     

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pF1KE5 LRATGAAAAEAKARRILAGLGFDPEMQNRPTQKFSGGWRMRVSLARALFMEPTLLMLDEP
       :.   :  :: .: ::: :::: : :: .  . :::::::::.::::::..: .:.::::
CCDS59 LEELDADKAEMRASRILHGLGFTPAMQRKKLKDFSGGWRMRVALARALFIRPFMLLLDEP
         200       210       220       230       240       250     

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pF1KE5 TNHLDLNAVIWLNNYLQGWRKTLLIVSHDQGFLDDVCTDIIHLDAQRLHYYRGNYMTFKK
       ::::::.: .::.. :. ... :..:::.: ::. :::.:::.  ..:.:: :::  . :
CCDS59 TNHLDLDACVWLEEELKTFKRILVLVSHSQDFLNGVCTNIIHMHNKKLKYYTGNYDQYVK
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pF1KE5 MYQQKQKELLKQYEKQEKKLKELKAGGKSTKQAEKQTKEALTRKQQKCRRKNQDEESQEA
          . ... .:... .. .. ..:  .  .. .. ..:  :.:. :.   :..  ... :
CCDS59 TRLELEENQMKRFHWEQDQIAHMK--NYIARFGHGSAK--LARQAQS---KEKTLQKMMA
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pF1KE5 PELLKRP-KEYTVRFTFPDPPPLSPPVLGLHGVTFGYQGQKP-LFKNLDFGIDMDSRICI
         : .:  .. :. : ::    . :::. ...:.: :  . : ...::.::::.:.:. .
CCDS59 SGLTERVVSDKTLSFYFPPCGKIPPPVIMVQNVSFKYTKDGPCIYNNLEFGIDLDTRVAL
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pF1KE5 VGPNGVGKSTLLLLLTGKLTPTHGEMRKNHRLKIGFFNQQYAEQLRMEETPTEYLQRGFN
       :::::.:::::: ::::.: :: : .::. ..::: ..:.  ::: .. .: ::... . 
CCDS59 VGPNGAGKSTLLKLLTGELLPTDGMIRKHSHVKIGRYHQHLQEQLDLDLSPLEYMMKCYP
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pF1KE5 L--PYQDARKCLGRFGLESHAHTIQICKLSGGQKARVVFAELACREPDVLILDEPTNNLD
            .. :: .::.:: .. ..  : .:: ::: :: .: :: ..: .:.::::::.::
CCDS59 EIKEKEEMRKIIGRYGLTGKQQVSPIRNLSDGQKCRVCLAWLAWQNPHMLFLDEPTNHLD
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pF1KE5 IESIDALGEAINEYKGAVIVVSHDARLITETNCQLWVVEEQSVSQIDGDFEDYKREVLEA
       ::.::::..::::..:....:::: ::: ..  ..:: :.:....  ::.  ::...   
CCDS59 IETIDALADAINEFEGGMMLVSHDFRLIQQVAQEIWVCEKQTITKWPGDILAYKEHLKSK
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          840         
pF1KE5 LGEVMVSRPRE    
                      
CCDS59 LVDEEPQLTKRTHNV
      610       620   

>>CCDS5922.1 ABCF2 gene_id:10061|Hs108|chr7               (634 aa)
 initn: 1383 init1: 525 opt: 1404  Z-score: 810.3  bits: 160.5 E(32554): 8.2e-39
Smith-Waterman score: 1413; 38.1% identity (70.5% similar) in 627 aa overlap (213-831:2-605)

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE5 SKGKAKPQNKFAALDNEEEDKEEEIIKEKEPPKQGKEKAKKAEQGSEEEGEGEEEEEEGG
                                     :   .:.:: : ..... . . .. .::.:
CCDS59                              MPSDLAKKKAAKKKEAAKARQRPRKGHEENG
                                            10        20        30 

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pF1KE5 ESKADDPYAHLSKKEKKKLKKQMEYERQVASLKAANAAENDFSVSQAEMSSRQAMLE---
       .  . .:  ....:.. . ..  : .  .  :.       :: ...:   .  ..:    
CCDS59 DV-VTEP--QVAEKNEANGRETTEVDLLTKELE-------DFEMKKAAARAVTGVLASHP
                 40        50        60               70        80 

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pF1KE5 NASDIKLEKFSISAHGKELFVNADLYIVAGRRYGLVGPNGKGKTTLLKHIANRALSIPPN
       :..:... ..:.. ::.::. .. : . .::::::.: :: ::. ::. :..: . :: .
CCDS59 NSTDVHIINLSLTFHGQELLSDTKLELNSGRRYGLIGLNGIGKSMLLSAIGKREVPIPEH
              90       100       110       120       130       140 

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pF1KE5 IDVLLCEQEVV-ADETPAVQAVLRADTKRLKLLEEERRLQGQLEQGDDTAAERLEKVYEE
       ::.    .:.  .:.:: .. :...::.:  : .: .::       .:.  :.: ..::.
CCDS59 IDIYHLTREMPPSDKTP-LHCVMEVDTERAMLEKEAERLAH-----EDAECEKLMELYER
             150        160       170       180            190     

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pF1KE5 LRATGAAAAEAKARRILAGLGFDPEMQNRPTQKFSGGWRMRVSLARALFMEPTLLMLDEP
       :.   :  :: .: ::: :::: : :: .  . :::::::::.::::::..: .:.::::
CCDS59 LEELDADKAEMRASRILHGLGFTPAMQRKKLKDFSGGWRMRVALARALFIRPFMLLLDEP
         200       210       220       230       240       250     

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pF1KE5 TNHLDLNAVIWLNNYLQGWRKTLLIVSHDQGFLDDVCTDIIHLDAQRLHYYRGNYMTFKK
       ::::::.: .::.. :. ... :..:::.: ::. :::.:::.  ..:.:: :::  . :
CCDS59 TNHLDLDACVWLEEELKTFKRILVLVSHSQDFLNGVCTNIIHMHNKKLKYYTGNYDQYVK
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pF1KE5 MYQQKQKELLKQYEKQEKKLKELKAGGKSTKQAEKQTKEALTRKQQKCRRKNQDEESQEA
          . ... .:... .. .. ..:  .  .. .. ..:  :.:. :.   :..  ... :
CCDS59 TRLELEENQMKRFHWEQDQIAHMK--NYIARFGHGSAK--LARQAQS---KEKTLQKMMA
         320       330         340       350            360        

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pF1KE5 PELLKRP-KEYTVRFTFPDPPPLSPPVLGLHGVTFGYQGQKP-LFKNLDFGIDMDSRICI
         : .:  .. :. : ::    . :::. ...:.: :  . : ...::.::::.:.:. .
CCDS59 SGLTERVVSDKTLSFYFPPCGKIPPPVIMVQNVSFKYTKDGPCIYNNLEFGIDLDTRVAL
      370       380       390       400       410       420        

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pF1KE5 VGPNGVGKSTLLLLLTGKLTPTHGEMRKNHRLKIGFFNQQYAEQLRMEETPTEYLQRGFN
       :::::.:::::: ::::.: :: : .::. ..::: ..:.  ::: .. .: ::... . 
CCDS59 VGPNGAGKSTLLKLLTGELLPTDGMIRKHSHVKIGRYHQHLQEQLDLDLSPLEYMMKCYP
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pF1KE5 L--PYQDARKCLGRFGLESHAHTIQICKLSGGQKARVVFAELACREPDVLILDEPTNNLD
            .. :: .::.:: .. ..  : .:: ::: :: .: :: ..: .:.::::::.::
CCDS59 EIKEKEEMRKIIGRYGLTGKQQVSPIRNLSDGQKCRVCLAWLAWQNPHMLFLDEPTNHLD
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pF1KE5 IESIDALGEAINEYKGAVIVVSHDARLITETNCQLWVVEEQSVSQIDGDFEDYKREVLEA
       ::.::::..::::..:....:::: ::: ..  ..:: :.:....  ::.  ::...   
CCDS59 IETIDALADAINEFEGGMMLVSHDFRLIQQVAQEIWVCEKQTITKWPGDILAYKEHLKSK
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          840                    
pF1KE5 LGEVMVSRPRE               
                                 
CCDS59 LVDEEPQLTKRTHNVCTLTLASLPRP
      610       620       630    

>>CCDS3254.1 ABCF3 gene_id:55324|Hs108|chr3               (709 aa)
 initn: 1077 init1: 532 opt: 1161  Z-score: 672.8  bits: 135.3 E(32554): 3.8e-31
Smith-Waterman score: 1506; 43.3% identity (72.3% similar) in 589 aa overlap (255-828:124-696)

          230       240       250       260       270        280   
pF1KE5 EQGSEEEGEGEEEEEEGGESKADDPYAHLSKKEKKKLKKQMEYERQVASLKAANA-AEND
                                     .: . .:: ..: . .  .::..:  . ..
CCDS32 SKITENYDCGTKLPGLLKREQSSTVNAKKLEKAEARLKAKQEKRSEKDTLKTSNPLVLEE
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pF1KE5 FSVSQAEMSSRQAMLENAS-----DIKLEKFSISAHGKELFVNADLYIVAGRRYGLVGPN
        :.:::  : ... ::...     :...:.:..:   . :...::. .. :::::::: :
CCDS32 ASASQAG-SRKESRLESSGKNKSYDVRIENFDVSFGDRVLLAGADVNLAWGRRYGLVGRN
           160        170       180       190       200       210  

      340       350       360       370       380       390        
pF1KE5 GKGKTTLLKHIANRALSIPPNIDVLLCEQEVVADETPAVQAVLRADTKRLKLLEEERRLQ
       : ::::::: .:.:.: .: .:..:  ::::..:.:::.:.::..:. :  ::..::.: 
CCDS32 GLGKTTLLKMLATRSLRVPAHISLLHVEQEVAGDDTPALQSVLESDSVREDLLRRERELT
            220       230       240       250       260       270  

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pF1KE5 GQLEQG--DDTAAERLEKVYEELRATGAAAAEAKARRILAGLGFDPEMQNRPTQKFSGGW
       .:.  :  . . : .: ..: .:.   :  : :.:  ::::::: :.::..::..:::::
CCDS32 AQIAAGRAEGSEAAELAEIYAKLEEIEADKAPARASVILAGLGFTPKMQQQPTREFSGGW
            280       290       300       310       320       330  

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pF1KE5 RMRVSLARALFMEPTLLMLDEPTNHLDLNAVIWLNNYLQGWRKTLLIVSHDQGFLDDVCT
       :::..:::::: .: ::.:::::: ::. :..::.:::: : .:.:.::::..::. . :
CCDS32 RMRLALARALFARPDLLLLDEPTNMLDVRAILWLENYLQTWPSTILVVSHDRNFLNAIAT
            340       350       360       370       380       390  

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pF1KE5 DIIHLDAQRLHYYRGNYMTFKKMYQQKQKELLKQYEKQEKKLKELKAGGKSTKQAEKQTK
       ::::: .:::  :::.. :: :   .::..::.: .. : .           .: ... .
CCDS32 DIIHLHSQRLDGYRGDFETFIK---SKQERLLNQQREYEAQ-----------QQYRQHIQ
            400       410          420       430                   

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pF1KE5 EALTRKQQKCRRKNQDEES----QEAPELLKRPKEYTVRFTFPDP-PPLSPPVLGLHGVT
         . : . .  : .: . .    .. :::    ::  : . :::    .:::.: :  : 
CCDS32 VFIDRFRYNANRASQVQSKLKMLEKLPELKPVDKESEVVMKFPDGFEKFSPPILQLDEVD
      440       450       460       470       480       490        

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pF1KE5 FGYQGQKPLFKNLDFGIDMDSRICIVGPNGVGKSTLLLLLTGKLTPTHGEMRKNHR-LKI
       : :. .. .:. :. . :..::::.:: ::.::::.: :: : :.:..: .:. :: :::
CCDS32 FYYDPKHVIFSRLSVSADLESRICVVGENGAGKSTMLKLLLGDLAPVRG-IRHAHRNLKI
      500       510       520       530       540        550       

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pF1KE5 GFFNQQYAEQLRMEETPTEYLQRGF-NLPYQDARKCLGRFGLESHAHTIQICKLSGGQKA
       :.:.:...::: .. . .: : : : . : .. :. :::.:. ..     . .::::::.
CCDS32 GYFSQHHVEQLDLNVSAVELLARKFPGRPEEEYRHQLGRYGISGELAMRPLASLSGGQKS
       560       570       580       590       600       610       

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pF1KE5 RVVFAELACREPDVLILDEPTNNLDIESIDALGEAINEYKGAVIVVSHDARLITETNCQL
       ::.::...   :.  :::::::.::.:.:.:::.:.:...:.::.:::: :.:  .  .:
CCDS32 RVAFAQMTMPCPNFYILDEPTNHLDMETIEALGRALNNFRGGVILVSHDERFIRLVCREL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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