FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5710, 845 aa 1>>>pF1KE5710 845 - 845 aa - 845 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1163+/-0.00108; mu= 0.6318+/- 0.065 mean_var=315.1315+/-63.459, 0's: 0 Z-trim(113.5): 32 B-trim: 600 in 1/54 Lambda= 0.072248 statistics sampled from 14116 (14142) to 14116 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.733), E-opt: 0.2 (0.434), width: 16 Scan time: 3.440 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34380.1 ABCF1 gene_id:23|Hs108|chr6 ( 845) 5546 592.4 1.1e-168 CCDS34381.1 ABCF1 gene_id:23|Hs108|chr6 ( 807) 3937 424.7 3.3e-118 CCDS5923.1 ABCF2 gene_id:10061|Hs108|chr7 ( 623) 1404 160.5 8.1e-39 CCDS5922.1 ABCF2 gene_id:10061|Hs108|chr7 ( 634) 1404 160.5 8.2e-39 CCDS3254.1 ABCF3 gene_id:55324|Hs108|chr3 ( 709) 1161 135.3 3.8e-31 >>CCDS34380.1 ABCF1 gene_id:23|Hs108|chr6 (845 aa) initn: 5546 init1: 5546 opt: 5546 Z-score: 3141.9 bits: 592.4 E(32554): 1.1e-168 Smith-Waterman score: 5546; 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CCDS59 IDIYHLTREMPPSDKTP-LHCVMEVDTERAMLEKEAERLAH-----EDAECEKLMELYER 150 160 170 180 190 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 LRATGAAAAEAKARRILAGLGFDPEMQNRPTQKFSGGWRMRVSLARALFMEPTLLMLDEP :. : :: .: ::: :::: : :: . . :::::::::.::::::..: .:.:::: CCDS59 LEELDADKAEMRASRILHGLGFTPAMQRKKLKDFSGGWRMRVALARALFIRPFMLLLDEP 200 210 220 230 240 250 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 TNHLDLNAVIWLNNYLQGWRKTLLIVSHDQGFLDDVCTDIIHLDAQRLHYYRGNYMTFKK ::::::.: .::.. :. ... :..:::.: ::. :::.:::. ..:.:: ::: . : CCDS59 TNHLDLDACVWLEEELKTFKRILVLVSHSQDFLNGVCTNIIHMHNKKLKYYTGNYDQYVK 260 270 280 290 300 310 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 MYQQKQKELLKQYEKQEKKLKELKAGGKSTKQAEKQTKEALTRKQQKCRRKNQDEESQEA . ... .:... .. .. ..: . .. .. ..: :.:. :. :.. ... : CCDS59 TRLELEENQMKRFHWEQDQIAHMK--NYIARFGHGSAK--LARQAQS---KEKTLQKMMA 320 330 340 350 360 600 610 620 630 640 650 pF1KE5 PELLKRP-KEYTVRFTFPDPPPLSPPVLGLHGVTFGYQGQKP-LFKNLDFGIDMDSRICI : .: .. :. : :: . :::. ...:.: : . : ...::.::::.:.:. . 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CCDS59 IETIDALADAINEFEGGMMLVSHDFRLIQQVAQEIWVCEKQTITKWPGDILAYKEHLKSK 550 560 570 580 590 600 840 pF1KE5 LGEVMVSRPRE CCDS59 LVDEEPQLTKRTHNV 610 620 >>CCDS5922.1 ABCF2 gene_id:10061|Hs108|chr7 (634 aa) initn: 1383 init1: 525 opt: 1404 Z-score: 810.3 bits: 160.5 E(32554): 8.2e-39 Smith-Waterman score: 1413; 38.1% identity (70.5% similar) in 627 aa overlap (213-831:2-605) 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 SKGKAKPQNKFAALDNEEEDKEEEIIKEKEPPKQGKEKAKKAEQGSEEEGEGEEEEEEGG : .:.:: : ..... . . .. .::.: CCDS59 MPSDLAKKKAAKKKEAAKARQRPRKGHEENG 10 20 30 250 260 270 280 290 pF1KE5 ESKADDPYAHLSKKEKKKLKKQMEYERQVASLKAANAAENDFSVSQAEMSSRQAMLE--- . . .: ....:.. . .. : . . :. :: ...: . ..: CCDS59 DV-VTEP--QVAEKNEANGRETTEVDLLTKELE-------DFEMKKAAARAVTGVLASHP 40 50 60 70 80 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 NASDIKLEKFSISAHGKELFVNADLYIVAGRRYGLVGPNGKGKTTLLKHIANRALSIPPN :..:... ..:.. ::.::. .. : . .::::::.: :: ::. ::. :..: . :: . CCDS59 NSTDVHIINLSLTFHGQELLSDTKLELNSGRRYGLIGLNGIGKSMLLSAIGKREVPIPEH 90 100 110 120 130 140 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 IDVLLCEQEVV-ADETPAVQAVLRADTKRLKLLEEERRLQGQLEQGDDTAAERLEKVYEE ::. .:. .:.:: .. :...::.: : .: .:: .:. :.: ..::. CCDS59 IDIYHLTREMPPSDKTP-LHCVMEVDTERAMLEKEAERLAH-----EDAECEKLMELYER 150 160 170 180 190 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 LRATGAAAAEAKARRILAGLGFDPEMQNRPTQKFSGGWRMRVSLARALFMEPTLLMLDEP :. : :: .: ::: :::: : :: . . :::::::::.::::::..: .:.:::: CCDS59 LEELDADKAEMRASRILHGLGFTPAMQRKKLKDFSGGWRMRVALARALFIRPFMLLLDEP 200 210 220 230 240 250 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 TNHLDLNAVIWLNNYLQGWRKTLLIVSHDQGFLDDVCTDIIHLDAQRLHYYRGNYMTFKK ::::::.: .::.. :. ... :..:::.: ::. :::.:::. ..:.:: ::: . : CCDS59 TNHLDLDACVWLEEELKTFKRILVLVSHSQDFLNGVCTNIIHMHNKKLKYYTGNYDQYVK 260 270 280 290 300 310 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 MYQQKQKELLKQYEKQEKKLKELKAGGKSTKQAEKQTKEALTRKQQKCRRKNQDEESQEA . ... .:... .. .. ..: . .. .. ..: :.:. :. :.. ... : CCDS59 TRLELEENQMKRFHWEQDQIAHMK--NYIARFGHGSAK--LARQAQS---KEKTLQKMMA 320 330 340 350 360 600 610 620 630 640 650 pF1KE5 PELLKRP-KEYTVRFTFPDPPPLSPPVLGLHGVTFGYQGQKP-LFKNLDFGIDMDSRICI : .: .. :. : :: . :::. ...:.: : . : ...::.::::.:.:. . 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