Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4486
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4486, 502 aa
1>>>pF1KE4486 502 - 502 aa - 502 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1874+/-0.00089; mu= 18.7123+/- 0.054
mean_var=65.4486+/-13.442, 0's: 0 Z-trim(105.2): 84 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.158535
statistics sampled from 8232 (8321) to 8232 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.256), width: 16
Scan time: 3.200
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5672.1 CYP3A5 gene_id:1577|Hs108|chr7 ( 502) 3312 766.6 0
CCDS5674.1 CYP3A4 gene_id:1576|Hs108|chr7 ( 503) 2878 667.3 1.1e-191
CCDS5673.1 CYP3A7 gene_id:1551|Hs108|chr7 ( 503) 2800 649.5 2.5e-186
CCDS75639.1 CYP3A51P gene_id:100861540|Hs108|chr7 ( 535) 2787 646.5 2.1e-185
CCDS5676.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 503) 2595 602.6 3.3e-172
CCDS5675.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 504) 2583 599.9 2.2e-171
CCDS5677.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 420) 2160 503.1 2.5e-142
CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 393) 1481 347.8 1.3e-95
CCDS55134.1 CYP3A5 gene_id:1577|Hs108|chr7 ( 140) 721 173.7 1.2e-43
CCDS55174.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 580) 633 153.9 4.4e-37
CCDS74303.1 CYP4F8 gene_id:11283|Hs108|chr19 ( 520) 588 143.6 5.1e-34
CCDS544.1 CYP4X1 gene_id:260293|Hs108|chr1 ( 509) 582 142.2 1.3e-33
CCDS42517.1 CYP4F12 gene_id:66002|Hs108|chr19 ( 524) 576 140.8 3.4e-33
CCDS545.1 CYP4Z1 gene_id:199974|Hs108|chr1 ( 505) 569 139.2 1e-32
CCDS59362.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 ( 520) 567 138.8 1.4e-32
CCDS34119.1 CYP4V2 gene_id:285440|Hs108|chr4 ( 525) 561 137.4 3.7e-32
CCDS543.1 CYP4A11 gene_id:1579|Hs108|chr1 ( 519) 555 136.0 9.5e-32
CCDS12331.1 CYP4F22 gene_id:126410|Hs108|chr19 ( 531) 547 134.2 3.4e-31
CCDS12337.1 CYP4F11 gene_id:57834|Hs108|chr19 ( 524) 543 133.3 6.4e-31
CCDS12332.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 ( 520) 539 132.4 1.2e-30
CCDS41328.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 512) 536 131.7 1.9e-30
CCDS542.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 511) 534 131.2 2.6e-30
CCDS30707.1 CYP4A22 gene_id:284541|Hs108|chr1 ( 519) 534 131.2 2.7e-30
CCDS12336.1 CYP4F2 gene_id:8529|Hs108|chr19 ( 520) 531 130.5 4.3e-30
CCDS5856.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 460) 529 130.1 5.3e-30
CCDS5855.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 534) 529 130.1 6e-30
CCDS8954.1 CYP27B1 gene_id:1594|Hs108|chr12 ( 508) 519 127.8 2.8e-29
CCDS81318.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 497) 513 126.4 7.2e-29
CCDS12570.1 CYP2B6 gene_id:1555|Hs108|chr19 ( 491) 510 125.7 1.1e-28
CCDS12573.1 CYP2S1 gene_id:29785|Hs108|chr19 ( 504) 508 125.3 1.6e-28
CCDS613.1 CYP2J2 gene_id:1573|Hs108|chr1 ( 502) 503 124.1 3.5e-28
CCDS7818.1 CYP2R1 gene_id:120227|Hs108|chr11 ( 501) 501 123.7 4.8e-28
CCDS7437.1 CYP2C9 gene_id:1559|Hs108|chr10 ( 490) 500 123.4 5.6e-28
CCDS12572.1 CYP2F1 gene_id:1572|Hs108|chr19 ( 491) 486 120.2 5.1e-27
CCDS7438.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 ( 490) 475 117.7 2.9e-26
CCDS34047.1 CYP2U1 gene_id:113612|Hs108|chr4 ( 544) 475 117.7 3.2e-26
CCDS33491.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20 ( 514) 474 117.5 3.6e-26
CCDS7436.1 CYP2C19 gene_id:1557|Hs108|chr10 ( 490) 467 115.9 1e-25
CCDS12569.1 CYP2A7 gene_id:1549|Hs108|chr19 ( 494) 463 115.0 2e-25
CCDS33285.1 CYP27C1 gene_id:339761|Hs108|chr2 ( 372) 461 114.4 2.1e-25
CCDS7541.1 CYP17A1 gene_id:1586|Hs108|chr10 ( 508) 460 114.3 3.2e-25
CCDS12568.1 CYP2A6 gene_id:1548|Hs108|chr19 ( 494) 456 113.4 6e-25
CCDS7435.1 CYP2C18 gene_id:1562|Hs108|chr10 ( 490) 453 112.7 9.6e-25
CCDS2423.1 CYP27A1 gene_id:1593|Hs108|chr2 ( 531) 448 111.6 2.3e-24
CCDS12571.1 CYP2A13 gene_id:1553|Hs108|chr19 ( 494) 441 109.9 6.5e-24
CCDS7686.1 CYP2E1 gene_id:1571|Hs108|chr10 ( 493) 439 109.5 8.8e-24
CCDS4735.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 495) 424 106.1 9.6e-23
CCDS46721.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 497) 418 104.7 2.5e-22
CCDS55175.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 466) 414 103.8 4.4e-22
CCDS47406.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 465) 403 101.2 2.5e-21
>>CCDS5672.1 CYP3A5 gene_id:1577|Hs108|chr7 (502 aa)
initn: 3312 init1: 3312 opt: 3312 Z-score: 4091.6 bits: 766.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3312; 100.0% identity (100.0% similar) in 502 aa overlap (1-502:1-502)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDLIPNLAVETWLLLAVSLVLLYLYGTRTHGLFKRLGIPGPTPLPLLGNVLSYRQGLWKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MDLIPNLAVETWLLLAVSLVLLYLYGTRTHGLFKRLGIPGPTPLPLLGNVLSYRQGLWKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DTECYKKYGKMWGTYEGQLPVLAITDPDVIRTVLVKECYSVFTNRRSLGPVGFMKSAISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DTECYKKYGKMWGTYEGQLPVLAITDPDVIRTVLVKECYSVFTNRRSLGPVGFMKSAISL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMFPIIAQYGDVLVRNLRREAEKGKPVTLKDIFGAYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMFPIIAQYGDVLVRNLRREAEKGKPVTLKDIFGAYS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 MDVITGTSFGVNIDSLNNPQDPFVESTKKFLKFGFLDPLFLSIILFPFLTPVFEALNVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MDVITGTSFGVNIDSLNNPQDPFVESTKKFLKFGFLDPLFLSIILFPFLTPVFEALNVSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FPKDTINFLSKSVNRMKKSRLNDKQKHRLDFLQLMIDSQNSKETESHKALSDLELAAQSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FPKDTINFLSKSVNRMKKSRLNDKQKHRLDFLQLMIDSQNSKETESHKALSDLELAAQSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IFIFAGYETTSSVLSFTLYELATHPDVQQKLQKEIDAVLPNKAPPTYDAVVQMEYLDMVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IFIFAGYETTSSVLSFTLYELATHPDVQQKLQKEIDAVLPNKAPPTYDAVVQMEYLDMVV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 NETLRLFPVAIRLERTCKKDVEINGVFIPKGSMVVIPTYALHHDPKYWTEPEEFRPERFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 NETLRLFPVAIRLERTCKKDVEINGVFIPKGSMVVIPTYALHHDPKYWTEPEEFRPERFS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KKKDSIDPYIYTPFGTGPRNCIGMRFALMNMKLALIRVLQNFSFKPCKETQIPLKLDTQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KKKDSIDPYIYTPFGTGPRNCIGMRFALMNMKLALIRVLQNFSFKPCKETQIPLKLDTQG
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE4 LLQPEKPIVLKVDSRDGTLSGE
::::::::::::::::::::::
CCDS56 LLQPEKPIVLKVDSRDGTLSGE
490 500
>>CCDS5674.1 CYP3A4 gene_id:1576|Hs108|chr7 (503 aa)
initn: 2397 init1: 2397 opt: 2878 Z-score: 3555.1 bits: 667.3 E(32554): 1.1e-191
Smith-Waterman score: 2878; 84.3% identity (95.6% similar) in 502 aa overlap (1-501:1-502)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDLIPNLAVETWLLLAVSLVLLYLYGTRTHGLFKRLGIPGPTPLPLLGNVLSYRQGLWKF
: :::.::.::::::::::::::::::..:::::.::::::::::.:::.:::..:. :
CCDS56 MALIPDLAMETWLLLAVSLVLLYLYGTHSHGLFKKLGIPGPTPLPFLGNILSYHKGFCMF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DTECYKKYGKMWGTYEGQLPVLAITDPDVIRTVLVKECYSVFTNRRSLGPVGFMKSAISL
: ::.:::::.:: :.:: :::::::::.:.::::::::::::::: .:::::::::::.
CCDS56 DMECHKKYGKVWGFYDGQQPVLAITDPDMIKTVLVKECYSVFTNRRPFGPVGFMKSAISI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMFPIIAQYGDVLVRNLRREAEKGKPVTLKDIFGAYS
::::::::.:::::::::::::::: ::::::::::::::::::: ::::::::.:::::
CCDS56 AEDEEWKRLRSLLSPTFTSGKLKEMVPIIAQYGDVLVRNLRREAETGKPVTLKDVFGAYS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 MDVITGTSFGVNIDSLNNPQDPFVESTKKFLKFGFLDPLFLSIILFPFLTPVFEALNVSL
:::::.:::::::::::::::::::.:::.:.: ::::.:::: .:::: :..:.::. .
CCDS56 MDVITSTSFGVNIDSLNNPQDPFVENTKKLLRFDFLDPFFLSITVFPFLIPILEVLNICV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FPKDTINFLSKSVNRMKKSRLNDKQKHRLDFLQLMIDSQNSKETESHKALSDLELAAQSI
::... ::: :::.:::.:::.: ::::.::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS56 FPREVTNFLRKSVKRMKESRLEDTQKHRVDFLQLMIDSQNSKETESHKALSDLELVAQSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IFIFAGYETTSSVLSFTLYELATHPDVQQKLQKEIDAVLPNKAPPTYDAVVQMEYLDMVV
:::::::::::::::: .::::::::::::::.:::::::::::::::.:.:::::::::
CCDS56 IFIFAGYETTSSVLSFIMYELATHPDVQQKLQEEIDAVLPNKAPPTYDTVLQMEYLDMVV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 NETLRLFPVAIRLERTCKKDVEINGVFIPKGSMVVIPTYALHHDPKYWTEPEEFRPERFS
::::::::.:.::::.:::::::::.::::: .:.::.::::.:::::::::.: :::::
CCDS56 NETLRLFPIAMRLERVCKKDVEINGMFIPKGVVVMIPSYALHRDPKYWTEPEKFLPERFS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE4 KK-KDSIDPYIYTPFGTGPRNCIGMRFALMNMKLALIRVLQNFSFKPCKETQIPLKLDTQ
:: ::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS56 KKNKDNIDPYIYTPFGSGPRNCIGMRFALMNMKLALIRVLQNFSFKPCKETQIPLKLSLG
430 440 450 460 470 480
480 490 500
pF1KE4 GLLQPEKPIVLKVDSRDGTLSGE
::::::::.::::.:::::.::
CCDS56 GLLQPEKPVVLKVESRDGTVSGA
490 500
>>CCDS5673.1 CYP3A7 gene_id:1551|Hs108|chr7 (503 aa)
initn: 2364 init1: 2364 opt: 2800 Z-score: 3458.7 bits: 649.5 E(32554): 2.5e-186
Smith-Waterman score: 2800; 81.9% identity (94.6% similar) in 502 aa overlap (1-501:1-502)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDLIPNLAVETWLLLAVSLVLLYLYGTRTHGLFKRLGIPGPTPLPLLGNVLSYRQGLWKF
:::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::::.:::.::.:.: : :
CCDS56 MDLIPNLAVETWLLLAVSLILLYLYGTRTHGLFKKLGIPGPTPLPFLGNALSFRKGYWTF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DTECYKKYGKMWGTYEGQLPVLAITDPDVIRTVLVKECYSVFTNRRSLGPVGFMKSAISL
: :::::: :.:: :. : :.:::::::.:.::::::::::::::: .:::::::.:::.
CCDS56 DMECYKKYRKVWGIYDCQQPMLAITDPDMIKTVLVKECYSVFTNRRPFGPVGFMKNAISI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMFPIIAQYGDVLVRNLRREAEKGKPVTLKDIFGAYS
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::: ::::::: .:::::
CCDS56 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMVPIIAQYGDVLVRNLRREAETGKPVTLKHVFGAYS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 MDVITGTSFGVNIDSLNNPQDPFVESTKKFLKFGFLDPLFLSIILFPFLTPVFEALNVSL
:::::.:::::.:::::::::::::.:::.:.:. :::. ::: .::::::..::::...
CCDS56 MDVITSTSFGVSIDSLNNPQDPFVENTKKLLRFNPLDPFVLSIKVFPFLTPILEALNITV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FPKDTINFLSKSVNRMKKSRLNDKQKHRLDFLQLMIDSQNSKETESHKALSDLELAAQSI
::. .:.::.:::...:..::.. ::::.:::::::::::::..:.::::::::: ::::
CCDS56 FPRKVISFLTKSVKQIKEGRLKETQKHRVDFLQLMIDSQNSKDSETHKALSDLELMAQSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IFIFAGYETTSSVLSFTLYELATHPDVQQKLQKEIDAVLPNKAPPTYDAVVQMEYLDMVV
:::::::::::::::: .::::::::::::.:::::.:::::::::::.:.:.:::::::
CCDS56 IFIFAGYETTSSVLSFIIYELATHPDVQQKVQKEIDTVLPNKAPPTYDTVLQLEYLDMVV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 NETLRLFPVAIRLERTCKKDVEINGVFIPKGSMVVIPTYALHHDPKYWTEPEEFRPERFS
::::::::::.::::.:::::::::.::::: .:.::.:.::::::::::::.: :::::
CCDS56 NETLRLFPVAMRLERVCKKDVEINGMFIPKGVVVMIPSYVLHHDPKYWTEPEKFLPERFS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE4 KK-KDSIDPYIYTPFGTGPRNCIGMRFALMNMKLALIRVLQNFSFKPCKETQIPLKLDTQ
:: ::.::::::::::.::::::::::::.::::::.::::::::::::::::::::
CCDS56 KKNKDNIDPYIYTPFGSGPRNCIGMRFALVNMKLALVRVLQNFSFKPCKETQIPLKLRFG
430 440 450 460 470 480
480 490 500
pF1KE4 GLLQPEKPIVLKVDSRDGTLSGE
::: :::::::..::: :.::
CCDS56 GLLLTEKPIVLKAESRDETVSGA
490 500
>>CCDS75639.1 CYP3A51P gene_id:100861540|Hs108|chr7 (535 aa)
initn: 2785 init1: 2364 opt: 2787 Z-score: 3442.2 bits: 646.5 E(32554): 2.1e-185
Smith-Waterman score: 2787; 81.8% identity (94.6% similar) in 500 aa overlap (1-499:1-500)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDLIPNLAVETWLLLAVSLVLLYLYGTRTHGLFKRLGIPGPTPLPLLGNVLSYRQGLWKF
:::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::::.:::.::.:.: : :
CCDS75 MDLIPNLAVETWLLLAVSLILLYLYGTRTHGLFKKLGIPGPTPLPFLGNALSFRKGYWTF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DTECYKKYGKMWGTYEGQLPVLAITDPDVIRTVLVKECYSVFTNRRSLGPVGFMKSAISL
: :::::: :.:: :. : :.:::::::.:.::::::::::::::: .:::::::.:::.
CCDS75 DMECYKKYRKVWGIYDCQQPMLAITDPDMIKTVLVKECYSVFTNRRPFGPVGFMKNAISI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMFPIIAQYGDVLVRNLRREAEKGKPVTLKDIFGAYS
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::: ::::::: .:::::
CCDS75 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMVPIIAQYGDVLVRNLRREAETGKPVTLKHVFGAYS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 MDVITGTSFGVNIDSLNNPQDPFVESTKKFLKFGFLDPLFLSIILFPFLTPVFEALNVSL
:::::.:::::.:::::::::::::.:::.:.:. :::. ::: .::::::..::::...
CCDS75 MDVITSTSFGVSIDSLNNPQDPFVENTKKLLRFNPLDPFVLSIKVFPFLTPILEALNITV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FPKDTINFLSKSVNRMKKSRLNDKQKHRLDFLQLMIDSQNSKETESHKALSDLELAAQSI
::. .:.::.:::...:..::.. ::::.:::::::::::::..:.::::::::: ::::
CCDS75 FPRKVISFLTKSVKQIKEGRLKETQKHRVDFLQLMIDSQNSKDSETHKALSDLELMAQSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IFIFAGYETTSSVLSFTLYELATHPDVQQKLQKEIDAVLPNKAPPTYDAVVQMEYLDMVV
:::::::::::::::: .::::::::::::.:::::.:::::::::::.:.:.:::::::
CCDS75 IFIFAGYETTSSVLSFIIYELATHPDVQQKVQKEIDTVLPNKAPPTYDTVLQLEYLDMVV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 NETLRLFPVAIRLERTCKKDVEINGVFIPKGSMVVIPTYALHHDPKYWTEPEEFRPERFS
::::::::::.::::.:::::::::.::::: .:.::.:.::::::::::::.: :::::
CCDS75 NETLRLFPVAMRLERVCKKDVEINGMFIPKGVVVMIPSYVLHHDPKYWTEPEKFLPERFS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE4 KK-KDSIDPYIYTPFGTGPRNCIGMRFALMNMKLALIRVLQNFSFKPCKETQIPLKLDTQ
:: ::.::::::::::.::::::::::::.::::::.::::::::::::::::::::
CCDS75 KKNKDNIDPYIYTPFGSGPRNCIGMRFALVNMKLALVRVLQNFSFKPCKETQIPLKLRFG
430 440 450 460 470 480
480 490 500
pF1KE4 GLLQPEKPIVLKVDSRDGTLSGE
::: :::::::..::: :.
CCDS75 GLLLTEKPIVLKAESRDETFVDMEPIHMDFLRSLAFQGPHLCFFWELLCPTIRSR
490 500 510 520 530
>>CCDS5676.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 (503 aa)
initn: 2185 init1: 2185 opt: 2595 Z-score: 3205.3 bits: 602.6 E(32554): 3.3e-172
Smith-Waterman score: 2595; 75.7% identity (91.8% similar) in 502 aa overlap (1-501:1-502)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDLIPNLAVETWLLLAVSLVLLYLYGTRTHGLFKRLGIPGPTPLPLLGNVLSYRQGLWKF
::::::.:.:::.:.:.::::::.:::..: :::.::::::::::.::..: : .:::.:
CCDS56 MDLIPNFAMETWVLVATSLVLLYIYGTHSHKLFKKLGIPGPTPLPFLGTILFYLRGLWNF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DTECYKKYGKMWGTYEGQLPVLAITDPDVIRTVLVKECYSVFTNRRSLGPVGFMKSAISL
: :: .:::.::: :::: :.:.: :::.:.:::::::::::::. :::.::.:::.:.
CCDS56 DRECNEKYGEMWGLYEGQQPMLVIMDPDMIKTVLVKECYSVFTNQMPLGPMGFLKSALSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMFPIIAQYGDVLVRNLRREAEKGKPVTLKDIFGAYS
::::::::::.::::.::: :.::: :::.: ::.:::.::.:::..: ..:::.::::.
CCDS56 AEDEEWKRIRTLLSPAFTSVKFKEMVPIISQCGDMLVRSLRQEAENSKSINLKDFFGAYT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 MDVITGTSFGVNIDSLNNPQDPFVESTKKFLKFGFLDPLFLSIILFPFLTPVFEALNVSL
::::::: ::::.::::::::::... ::.::. ::::..: : :::::::::::::..:
CCDS56 MDVITGTLFGVNLDSLNNPQDPFLKNMKKLLKLDFLDPFLLLISLFPFLTPVFEALNIGL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FPKDTINFLSKSVNRMKKSRLNDKQKHRLDFLQLMIDSQNSKETESHKALSDLELAAQSI
::::. .::..:..:::.:::.::::::.::.: ::::::::::.::::::::::.::::
CCDS56 FPKDVTHFLKNSIERMKESRLKDKQKHRVDFFQQMIDSQNSKETKSHKALSDLELVAQSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IFIFAGYETTSSVLSFTLYELATHPDVQQKLQKEIDAVLPNKAPPTYDAVVQMEYLDMVV
:.:::.:.:::..: : .::::::::::::::.::::::::::: ::::.::::::::::
CCDS56 IIIFAAYDTTSTTLPFIMYELATHPDVQQKLQEEIDAVLPNKAPVTYDALVQMEYLDMVV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 NETLRLFPVAIRLERTCKKDVEINGVFIPKGSMVVIPTYALHHDPKYWTEPEEFRPERFS
:::::::::. :. :.::::.:::::::::: :..: ::::::::::::::.: :::::
CCDS56 NETLRLFPVVSRVTRVCKKDIEINGVFIPKGLAVMVPIYALHHDPKYWTEPEKFCPERFS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE4 KK-KDSIDPYIYTPFGTGPRNCIGMRFALMNMKLALIRVLQNFSFKPCKETQIPLKLDTQ
:: ::::: : : :::.:::::::::::: :.:::.::.:::::::::::::::::::.
CCDS56 KKNKDSIDLYRYIPFGAGPRNCIGMRFALTNIKLAVIRALQNFSFKPCKETQIPLKLDNL
430 440 450 460 470 480
480 490 500
pF1KE4 GLLQPEKPIVLKVDSRDGTLSGE
.::::::::::: ::: ::
CCDS56 PILQPEKPIVLKVHLRDGITSGP
490 500
>>CCDS5675.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 (504 aa)
initn: 2160 init1: 2160 opt: 2583 Z-score: 3190.4 bits: 599.9 E(32554): 2.2e-171
Smith-Waterman score: 2583; 75.5% identity (91.7% similar) in 503 aa overlap (1-501:1-503)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDLIPNLAVETWLLLAVSLVLLYLYGTRTHGLFKRLGIPGPTPLPLLGNVLSYRQGLWKF
::::::.:.:::.:.:.::::::.:::..: :::.::::::::::.::..: : .:::.:
CCDS56 MDLIPNFAMETWVLVATSLVLLYIYGTHSHKLFKKLGIPGPTPLPFLGTILFYLRGLWNF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DTECYKKYGKMWGTYEGQLPVLAITDPDVIRTVLVKECYSVFTNRRSLGPVGFMKSAISL
: :: .:::.::: :::: :.:.: :::.:.:::::::::::::. :::.::.:::.:.
CCDS56 DRECNEKYGEMWGLYEGQQPMLVIMDPDMIKTVLVKECYSVFTNQMPLGPMGFLKSALSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMFPIIAQYGDVLVRNLRREAEKGKPVTLKDIFGAYS
::::::::::.::::.::: :.::: :::.: ::.:::.::.:::..: ..:::.::::.
CCDS56 AEDEEWKRIRTLLSPAFTSVKFKEMVPIISQCGDMLVRSLRQEAENSKSINLKDFFGAYT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 MDVITGTSFGVNIDSLNNPQDPFVESTKKFLKFGFLDPLFLSIILFPFLTPVFEALNVSL
::::::: ::::.::::::::::... ::.::. ::::..: : :::::::::::::..:
CCDS56 MDVITGTLFGVNLDSLNNPQDPFLKNMKKLLKLDFLDPFLLLISLFPFLTPVFEALNIGL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FPKDTINFLSKSVNRMKKSRLNDKQKHRLDFLQLMIDSQNSKETESHKALSDLELAAQSI
::::. .::..:..:::.:::.::::::.::.: ::::::::::.::::::::::.::::
CCDS56 FPKDVTHFLKNSIERMKESRLKDKQKHRVDFFQQMIDSQNSKETKSHKALSDLELVAQSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IFIFAGYETTSSVLSFTLYELATHPDVQQKLQKEIDAVLPNKAPPTYDAVVQMEYLDMVV
:.:::.:.:::..: : .::::::::::::::.::::::::::: ::::.::::::::::
CCDS56 IIIFAAYDTTSTTLPFIMYELATHPDVQQKLQEEIDAVLPNKAPVTYDALVQMEYLDMVV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE4 NETLRLFPVAIRLERTCKKDVEINGVFIPKGSMVVIPTYALHHDPKYWTEPEEFRPE-RF
:::::::::. :. :.::::.:::::::::: :..: ::::::::::::::.: :: ::
CCDS56 NETLRLFPVVSRVTRVCKKDIEINGVFIPKGLAVMVPIYALHHDPKYWTEPEKFCPESRF
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 SKK-KDSIDPYIYTPFGTGPRNCIGMRFALMNMKLALIRVLQNFSFKPCKETQIPLKLDT
::: ::::: : : :::.:::::::::::: :.:::.::.:::::::::::::::::::.
CCDS56 SKKNKDSIDLYRYIPFGAGPRNCIGMRFALTNIKLAVIRALQNFSFKPCKETQIPLKLDN
430 440 450 460 470 480
480 490 500
pF1KE4 QGLLQPEKPIVLKVDSRDGTLSGE
.::::::::::: ::: ::
CCDS56 LPILQPEKPIVLKVHLRDGITSGP
490 500
>>CCDS5677.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 (420 aa)
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Smith-Waterman score: 2160; 74.9% identity (92.8% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDLIPNLAVETWLLLAVSLVLLYLYGTRTHGLFKRLGIPGPTPLPLLGNVLSYRQGLWKF
::::::.:.:::.:.:.::::::.:::..: :::.::::::::::.::..: : .:::.:
CCDS56 MDLIPNFAMETWVLVATSLVLLYIYGTHSHKLFKKLGIPGPTPLPFLGTILFYLRGLWNF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DTECYKKYGKMWGTYEGQLPVLAITDPDVIRTVLVKECYSVFTNRRSLGPVGFMKSAISL
: :: .:::.::: :::: :.:.: :::.:.:::::::::::::. :::.::.:::.:.
CCDS56 DRECNEKYGEMWGLYEGQQPMLVIMDPDMIKTVLVKECYSVFTNQMPLGPMGFLKSALSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMFPIIAQYGDVLVRNLRREAEKGKPVTLKDIFGAYS
::::::::::.::::.::: :.::: :::.: ::.:::.::.:::..: ..:::.::::.
CCDS56 AEDEEWKRIRTLLSPAFTSVKFKEMVPIISQCGDMLVRSLRQEAENSKSINLKDFFGAYT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 MDVITGTSFGVNIDSLNNPQDPFVESTKKFLKFGFLDPLFLSIILFPFLTPVFEALNVSL
::::::: ::::.::::::::::... ::.::. ::::..: : :::::::::::::..:
CCDS56 MDVITGTLFGVNLDSLNNPQDPFLKNMKKLLKLDFLDPFLLLISLFPFLTPVFEALNIGL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FPKDTINFLSKSVNRMKKSRLNDKQKHRLDFLQLMIDSQNSKETESHKALSDLELAAQSI
::::. .::..:..:::.:::.::::::.::.: ::::::::::.::::::::::.::::
CCDS56 FPKDVTHFLKNSIERMKESRLKDKQKHRVDFFQQMIDSQNSKETKSHKALSDLELVAQSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IFIFAGYETTSSVLSFTLYELATHPDVQQKLQKEIDAVLPNKAPPTYDAVVQMEYLDMVV
:.:::.:.:::..: : .::::::::::::::.::::::::::: ::::.::::::::::
CCDS56 IIIFAAYDTTSTTLPFIMYELATHPDVQQKLQEEIDAVLPNKAPVTYDALVQMEYLDMVV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 NETLRLFPVAIRLERTCKKDVEINGVFIPKGSMVVIPTYALHHDPKYWTEPEEFRPERFS
:::::::::. :. :.::::.:::::::::: :..: ::::::::::::::.: :::
CCDS56 NETLRLFPVVSRVTRVCKKDIEINGVFIPKGLAVMVPIYALHHDPKYWTEPEKFCPERSH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KKKDSIDPYIYTPFGTGPRNCIGMRFALMNMKLALIRVLQNFSFKPCKETQIPLKLDTQG
>>CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 (393 aa)
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Smith-Waterman score: 1574; 56.3% identity (68.8% similar) in 503 aa overlap (1-501:1-392)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDLIPNLAVETWLLLAVSLVLLYLYGTRTHGLFKRLGIPGPTPLPLLGNVLSY-RQGLWK
::::::.:.:::.:.:.::::::.:::..: :::.::::::::::.::..: : :..: :
CCDS64 MDLIPNFAMETWVLVATSLVLLYIYGTHSHKLFKKLGIPGPTPLPFLGTILFYLRRSLNK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 FDTECYKKYGKMWGTYEGQLPVLAITDPDVIRTVLVKECYSVFTNRRSLGPVGFMKSAIS
. . . : : ::. : .
CCDS64 IPSWAW------WLT-----PVI----P-------------------------------A
70
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LAEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMFPIIAQYGDVLVRNLRREAEKGKPVTLKDIFGAY
: : : .: :. ::. : :. .::
CCDS64 LWEAE--------------AG------------GSPKVRSSR-------PALPTWVFGIL
80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SMDVITGTSFGVNIDSLNNPQDPFVESTKKFLKFGFLDPLFLSIILFPFLTPVFEALNVS
. .:. .: : : :::::::::::::..
CCDS64 TENVMKNTE-----------------------KCG---------ALFPFLTPVFEALNIG
110 120
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 LFPKDTINFLSKSVNRMKKSRLNDKQKHRLDFLQLMIDSQNSKETESHKALSDLELAAQS
:::::. .::..:..:::.:::.::::::.::.: ::::::::::.::::::::::.:::
CCDS64 LFPKDVTHFLKNSIERMKESRLKDKQKHRVDFFQQMIDSQNSKETKSHKALSDLELVAQS
130 140 150 160 170 180
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 IIFIFAGYETTSSVLSFTLYELATHPDVQQKLQKEIDAVLPNKAPPTYDAVVQMEYLDMV
::.:::.:.:::..: : .::::::::::::::.::::::::::: ::::.:::::::::
CCDS64 IIIIFAAYDTTSTTLPFIMYELATHPDVQQKLQEEIDAVLPNKAPVTYDALVQMEYLDMV
190 200 210 220 230 240
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 VNETLRLFPVAIRLERTCKKDVEINGVFIPKGSMVVIPTYALHHDPKYWTEPEEFRPERF
::::::::::. :. :.::::.:::::::::: :..: ::::::::::::::.: ::::
CCDS64 VNETLRLFPVVSRVTRVCKKDIEINGVFIPKGLAVMVPIYALHHDPKYWTEPEKFCPERF
250 260 270 280 290 300
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 SKK-KDSIDPYIYTPFGTGPRNCIGMRFALMNMKLALIRVLQNFSFKPCKETQIPLKLDT
::: ::::: : : :::.:::::::::::: :.:::.::.:::::::::::::::::::.
CCDS64 SKKNKDSIDLYRYIPFGAGPRNCIGMRFALTNIKLAVIRALQNFSFKPCKETQIPLKLDN
310 320 330 340 350 360
480 490 500
pF1KE4 QGLLQPEKPIVLKVDSRDGTLSGE
.::::::::::: ::: ::
CCDS64 LPILQPEKPIVLKVHLRDGITSGP
370 380 390
>>CCDS55134.1 CYP3A5 gene_id:1577|Hs108|chr7 (140 aa)
initn: 721 init1: 721 opt: 721 Z-score: 897.0 bits: 173.7 E(32554): 1.2e-43
Smith-Waterman score: 721; 100.0% identity (100.0% similar) in 106 aa overlap (1-106:1-106)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDLIPNLAVETWLLLAVSLVLLYLYGTRTHGLFKRLGIPGPTPLPLLGNVLSYRQGLWKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MDLIPNLAVETWLLLAVSLVLLYLYGTRTHGLFKRLGIPGPTPLPLLGNVLSYRQGLWKF
10 20 30 40 50 60
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pF1KE4 DTECYKKYGKMWGTYEGQLPVLAITDPDVIRTVLVKECYSVFTNRRSLGPVGFMKSAISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DTECYKKYGKMWGTYEGQLPVLAITDPDVIRTVLVKECYSVFTNRRICATTSTIKMQTHS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMFPIIAQYGDVLVRNLRREAEKGKPVTLKDIFGAYS
CCDS55 VTMWLPPAVLQSQHGVCLFL
130 140
>>CCDS55174.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 (580 aa)
initn: 1040 init1: 253 opt: 633 Z-score: 779.2 bits: 153.9 E(32554): 4.4e-37
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20 30 40 50 60 70
pF1KE4 VSLVLLYLYGTRTHGLFKRLGIPGPTPLPLLGNVLSYRQGLWKFDTECYKKYGKMWGTYE
.::. .:::.:. . : : :: . : :
CCDS55 ALLALLKWYSTSAFSRLEKLGLRHPKPSPFIGNLTFFRQGFWESQMELRKLYGPLCGYYL
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 GQLPVLAITDPDVIRTVLVKECYSVFTNRRSLG-PVGFMKSAISLAEDEEWKRIRSLLSP
:. ..:..::.:. ::: : .: :::: . : . ... . .:..:...:. :
CCDS55 GRRMFIVISEPDMIKQVLV-ENFSNFTNRMASGLEFKSVADSVLFLRDKRWEEVRGALMS
90 100 110 120 130 140
140
pF1KE4 TFTSGKLKE----------------------------------------------MFPII
.:. ::.: : :.:
CCDS55 AFSPEKLNELGLLIMQERIKGHMGGQQAPQRIPPTRLSKPSGIYVNLHYATLPFCMVPLI
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 AQYGDVLVRNLRREAEKGKPVTLKDIFGAYSMDVITGTSFGVNIDSLNNPQDPFVESTKK
.: :.:. .:.: ::.: .. . :. ::.....::. .:: . :.::::. :.
CCDS55 SQACDLLLAHLKRYAESGDAFDIQRCYCNYTTDVVASVAFGTPVDSWQAPEDPFVKHCKR
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 FLKFGFLDPLFLSIILFP-FLTPVFEALNVSLFPKDTIN-FLSKSVNRMKKSRLNDKQ--
:..: . :... .. :: ...:. . : . .: .: :..: . . : :.:
CCDS55 FFEFCIPRPILVLLLSFPSIMVPLARILPNK--NRDELNGFFNKLIRNVIALR--DQQAA
270 280 290 300 310
270 280 290
pF1KE4 -KHRLDFLQLMIDSQNS-----------------------KETESH------KALSDLEL
..: ::::...:...: . ...: . :. :.
CCDS55 EERRRDFLQMVLDARHSASPMGVQDFDIVRDVFSSTGCKPNPSRQHQPSPMARPLTVDEI
320 330 340 350 360 370
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 AAQSIIFIFAGYETTSSVLSFTLYELATHPDVQQKLQKEIDAVLPNKAPPTYDAVVQ-ME
..:..::..:::: ...:::. : :::.:: :.:: .:.:. .. : . .. . .
CCDS55 VGQAFIFLIAGYEIITNTLSFATYLLATNPDCQEKLLREVDVFKEKHMAPEFCSLEEGLP
380 390 400 410 420 430
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 YLDMVVNETLRLFPVAIRLERTCKKDVEINGVFIPKGSMVVIPTYALHHDPKYWTEPEEF
:::::. ::::..: :.:. : .: :. : :: :... . . ::::::..: :: :
CCDS55 YLDMVIAETLRMYPPAFRFTREAAQDCEVLGQRIPAGAVLEMAVGALHHDPEHWPSPETF
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 RPERFSKK-KDSIDPYIYTPFGTGPRNCIGMRFALMNMKLALIRVLQNFSFKPCKETQIP
::::. . ... :. : :::.:::.:.:.:..:...::.:..::..: :. : :::.:
CCDS55 NPERFTAEARQQHRPFTYLPFGAGPRSCLGVRLGLLEVKLTLLHVLHKFRFQACPETQVP
500 510 520 530 540 550
480 490 500
pF1KE4 LKLDTQGLLQPEKPIVLKVDSRDGTLSGE
:.:.... : :.. . .:. ::
CCDS55 LQLESKSALGPKNGVYIKIVSR
560 570 580
502 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 00:49:39 2016 done: Sun Nov 6 00:49:39 2016
Total Scan time: 3.200 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]