FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4451, 468 aa 1>>>pF1KE4451 468 - 468 aa - 468 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0122+/-0.000415; mu= 19.4132+/- 0.026 mean_var=66.3585+/-13.760, 0's: 0 Z-trim(110.6): 163 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.157444 statistics sampled from 18777 (18947) to 18777 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16 Scan time: 8.380 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000736 (OMIM: 118505,612052) neuronal acetylcho ( 468) 3131 720.5 2.4e-207 NP_000740 (OMIM: 118508) neuronal acetylcholine re ( 458) 1809 420.2 5.8e-117 XP_016877370 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 245) 1648 383.5 3.6e-106 XP_005254199 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 243) 1630 379.4 6.1e-105 NP_000735 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ac ( 627) 1406 328.8 2.7e-89 XP_006716345 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 1397 326.7 9.6e-89 XP_011542690 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 1397 326.7 9.6e-89 NP_000733 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetylcho ( 529) 1397 326.7 9.6e-89 NP_004189 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine re ( 494) 1324 310.1 8.9e-84 NP_001160166 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetyl ( 489) 1300 304.6 3.9e-82 NP_000734 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylcho ( 505) 1300 304.6 4e-82 NP_001269384 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetyl ( 514) 1247 292.6 1.7e-78 XP_011542692 (OMIM: 118508) PREDICTED: neuronal ac ( 329) 1241 291.1 3.1e-78 XP_006720445 (OMIM: 118503,612052) PREDICTED: neur ( 438) 1215 285.3 2.3e-76 NP_000070 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) acet ( 457) 1207 283.5 8.4e-76 XP_016858746 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 464) 1207 283.5 8.5e-76 XP_016883113 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 546) 1200 282.0 2.9e-75 XP_016877378 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 449) 1151 270.8 5.6e-72 XP_016877377 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 462) 1151 270.8 5.7e-72 XP_016877376 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 463) 1151 270.8 5.7e-72 XP_011519489 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 1151 270.8 6e-72 XP_011519488 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 1151 270.8 6e-72 NP_000741 (OMIM: 118509) neuronal acetylcholine re ( 498) 1151 270.8 6e-72 NP_001186208 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine ( 479) 1138 267.8 4.5e-71 XP_016877374 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 1131 266.2 1.3e-70 XP_016877375 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 1131 266.2 1.3e-70 NP_000739 (OMIM: 118507,605375) neuronal acetylcho ( 502) 1115 262.6 1.8e-69 XP_011519493 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 1046 246.9 8e-65 XP_011519492 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 1046 246.9 8e-65 NP_001034612 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) a ( 482) 1032 243.8 8.1e-64 XP_016858745 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 489) 1032 243.8 8.2e-64 NP_001294874 (OMIM: 118505,612052) neuronal acetyl ( 160) 1024 241.6 1.2e-63 XP_011526826 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 556) 968 229.3 2.1e-59 NP_000737 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetylcho ( 502) 946 224.2 6.3e-58 NP_001177384 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetyl ( 531) 944 223.8 9.1e-58 NP_060051 (OMIM: 605116) neuronal acetylcholine re ( 479) 936 221.9 2.9e-57 XP_005273454 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 370) 930 220.5 6.2e-57 XP_016868492 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 370) 930 220.5 6.2e-57 NP_065135 (OMIM: 606372) neuronal acetylcholine re ( 450) 899 213.5 9.5e-55 XP_011519480 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 380) 862 205.1 2.8e-52 XP_011519478 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 486) 859 204.5 5.5e-52 XP_016883114 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 451) 756 181.0 5.7e-45 NP_001243502 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ( 451) 756 181.0 5.7e-45 XP_011542691 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 331) 744 178.2 3e-44 XP_016868493 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 331) 744 178.2 3e-44 NP_000860 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine recep ( 484) 701 168.6 3.5e-41 NP_001155244 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine re ( 463) 698 167.9 5.4e-41 XP_011520455 (OMIM: 609756) PREDICTED: CHRNA7-FAM7 ( 412) 644 155.6 2.4e-37 NP_647536 (OMIM: 609756) CHRNA7-FAM7A fusion prote ( 412) 644 155.6 2.4e-37 XP_011519479 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 401) 641 154.9 3.8e-37 >>NP_000736 (OMIM: 118505,612052) neuronal acetylcholine (468 aa) initn: 3131 init1: 3131 opt: 3131 Z-score: 3843.6 bits: 720.5 E(85289): 2.4e-207 Smith-Waterman score: 3131; 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NP_000 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGF---NSIAENEDALLRHLFQGYQK 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV ::::: : :: ::. ::: :::::::::::::::::::::::: : ::::::::::::. NP_000 WVRPVLHSNDTIKVYFGLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHS 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KE4 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGT-STKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPF :.:::.:.: ::::::.::::::::. ::.... ::::.:::::.::::::.::::::: NP_000 IKVPSESLWLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPF 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 DLQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCWYPY : ::::::::::::::..::.:: ...::..::::::::::..: : :::: :. ::. 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NP_000 EEIIPSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQK 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 pF1KE4 LPKLLCMRSHVDRYFT-QKEETES---------------GSGPKSSRNTLEAALDSIRYI :::::::..::::: . .:::.. ..: : :: : :::::: NP_000 LPKLLCMKDHVDRYSSPEKEESQPVVKGKVLEKKKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYI 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 TRHIMKENDVREVVEDWKFIAQVLDRMFLWTFLFVSIVGSLGLFVPVIYKWANILIPVHI .::. ::. . .::.::::.::::::.::: ::.::..::. .:.:.. : NP_000 SRHVKKEHFISQVVQDWKFVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH 410 420 430 440 450 pF1KE4 GNANK >>XP_016877370 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neuronal (245 aa) initn: 1648 init1: 1648 opt: 1648 Z-score: 2027.1 bits: 383.5 E(85289): 3.6e-106 Smith-Waterman score: 1648; 100.0% identity (100.0% similar) in 238 aa overlap (1-238:1-238) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYER 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGTSTKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPFD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGTSTKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPFD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 LQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCWYPYV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 LQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCWYPLL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 TYSFVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLLVIE XP_016 KIGNS >>XP_005254199 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neuronal (243 aa) initn: 1630 init1: 1630 opt: 1630 Z-score: 2005.1 bits: 379.4 E(85289): 6.1e-105 Smith-Waterman score: 1630; 100.0% identity (100.0% similar) in 236 aa overlap (1-236:1-236) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYER 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGTSTKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPFD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGTSTKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPFD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 LQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCWYPYV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 LQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCWLLKI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 TYSFVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLLVIE XP_005 GNS >>NP_000735 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal acetyl (627 aa) initn: 1495 init1: 531 opt: 1406 Z-score: 1724.3 bits: 328.8 E(85289): 2.7e-89 Smith-Waterman score: 1406; 58.2% identity (78.0% similar) in 364 aa overlap (7-367:5-359) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYER :: : ::: . :. : : :. :. . :. :. ::: ::. :.. NP_000 MELGGPGAPRLLPPLLLLLGT--------GLLRASSHVETRAHAEERLLKKLFSGYNK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV : ::: ...: . ..:::.:.::.:::::::.::::::.:::: : ::::.: :: .. NP_000 WSRPVANISDVVLVRFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWVKQEWHDYKLRWDPADYENVTS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE4 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGTS-TKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPF ::.::. .: :::::..:::: : : ::. . ..: : ::::: :::::.:::::::: NP_000 IRIPSELIWRPDIVLYNNADGDFAVTHLTKAHLFHDGRVQWTPPAIYKSSCSIDVTFFPF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 DLQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCW--Y : :::.::::::::: ...:.. . ::. ::...::: ::.:.:. ..: :: : NP_000 DQQNCTMKFGSWTYDKAKIDLVNMHSRVDQLDFWESGEWVIVDAVGTYNTRKYECCAEIY 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 PYVTYSFVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLL : .::.:::.:::::::. :::::. .: ::::::::::. :::: :: :::.::::::: NP_000 PDITYAFVIRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSECGEKITLCISVLLSLTVFLL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 VIEEIIPSSSKVIPLIGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAPLVRKIFL .: :::::.: :::::::::.::::::::::..:::..:.:::: ::. : ::..:: NP_000 LITEIIPSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPRTHT-MPTWVRRVFL 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 HTLPKLLCMRSHVDRYFTQKEETESGSGPKSSRNTLEAALDSIRYITRHIMKENDVREVV .:.:: :. NP_000 DIVPRLLLMKRPSVVKDNCRRLIESMHKMASAPRFWPEPEGEPPATSGTQSLHPPSPSFC 350 360 370 380 390 400 >-- initn: 227 init1: 180 opt: 197 Z-score: 240.1 bits: 54.2 E(85289): 1.2e-06 Smith-Waterman score: 197; 33.6% identity (61.9% similar) in 113 aa overlap (341-449:512-620) 320 330 340 350 360 pF1KE4 PLIGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAPLVRKIFLHTLP-KLLCMR-- : .::.: : . : : : . 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XP_011 NTSDVVIVRFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWLKQEWSDYKLRWNPTDFGNITSLRVPSE 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 SVWTPDIVLFDNADGRFEGTS-TKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPFDLQNCS .: :::::..::::.: : ::. . .::: :.::: :::::.::::::::: :::. XP_011 MIWIPDIVLYNNADGEFAVTHMTKAHLFSTGTVHWVPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQQNCK 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 MKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCW--YPYVTYS ::::::::: ...:. .: :: .:....::: ::.:::. ... .:: :: :::. XP_011 MKFGSWTYDKAKIDLEQMEQTVDLKDYWESGEWAIVNATGTYNSKKYDCCAEIYPDVTYA 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 FVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLLVIEEII :::.:::::::. :::::. .: ::::::::::. :::: :: :::.:::::::.: ::: XP_011 FVIRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSDCGEKITLCISVLLSLTVFLLLITEII 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 PSSSKVIPLIGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAPLVRKIFLHTLPKL ::.: :::::::::.::::::::::..:::..:.:::: :::. : :: .: .:. XP_011 PSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPSTHT-MPHWVRGALLGCVPRW 320 330 340 350 360 370 370 380 pF1KE4 L-----------C-------------MRSHVD---RYFTQKEETE--------------- : : ..:.:: : . .:: . XP_011 LLMNRPPPPVELCHPLRLKLSPSYHWLESNVDAEEREVVVEEEDRWACAGHVAPSVGTLC 380 390 400 410 420 430 390 400 410 420 pF1KE4 ------SG-SGPKSS----------RNTLEAALDSIRYITRHIMKENDVREVVEDWKFIA :: ::::. .. ::....::. :. .:. : ::::..: XP_011 SHGHLHSGASGPKAEALLQEGELLLSPHMQKALEGVHYIADHLRSEDADSSVKEDWKYVA 440 450 460 470 480 490 430 440 450 460 pF1KE4 QVLDRMFLWTFLFVSIVGSLGLFVPVIYKWANILIPVHIGNANK .:.::.::: :..: ..: XP_011 MVIDRIFLWLFIIVCFLGTIGLFLPPFLAGMI 500 510 520 >>NP_000733 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetylcholine (529 aa) initn: 1554 init1: 540 opt: 1397 Z-score: 1714.2 bits: 326.7 E(85289): 9.6e-89 Smith-Waterman score: 1464; 51.1% identity (70.7% similar) in 468 aa overlap (37-442:49-515) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 GPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYERWVRPVE : . .: .. :: :.: ::. :.::.::: NP_000 LLLTPAGGEEAKRPPPRAPGDPLSSPSPTALPQGGSHTETEDRLFKHLFRGYNRWARPVP 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 HLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKVIRVPSD . .: . ..:::.:.::.:::::::.::::::::::: : :::::: :.:.: .::::. NP_000 NTSDVVIVRFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWLKQEWSDYKLRWNPTDFGNITSLRVPSE 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 SVWTPDIVLFDNADGRFEGTS-TKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPFDLQNCS .: :::::..::::.: : ::. . .::: :.::: :::::.::::::::: :::. NP_000 MIWIPDIVLYNNADGEFAVTHMTKAHLFSTGTVHWVPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQQNCK 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 MKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCW--YPYVTYS ::::::::: ...:. .: :: .:....::: ::.:::. ... .:: :: :::. NP_000 MKFGSWTYDKAKIDLEQMEQTVDLKDYWESGEWAIVNATGTYNSKKYDCCAEIYPDVTYA 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 FVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLLVIEEII :::.:::::::. :::::. .: ::::::::::. :::: :: :::.:::::::.: ::: NP_000 FVIRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSDCGEKITLCISVLLSLTVFLLLITEII 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 PSSSKVIPLIGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAPLVRKIFLHTLPKL ::.: :::::::::.::::::::::..:::..:.:::: :::. : :: .: .:. NP_000 PSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPSTHT-MPHWVRGALLGCVPRW 320 330 340 350 360 370 370 380 pF1KE4 L-----------C-------------MRSHVD---RYFTQKEETE--------------- : : ..:.:: : . .:: . NP_000 LLMNRPPPPVELCHPLRLKLSPSYHWLESNVDAEEREVVVEEEDRWACAGHVAPSVGTLC 380 390 400 410 420 430 390 400 410 420 pF1KE4 ------SG-SGPKSS----------RNTLEAALDSIRYITRHIMKENDVREVVEDWKFIA :: ::::. .. ::....::. :. .:. : ::::..: NP_000 SHGHLHSGASGPKAEALLQEGELLLSPHMQKALEGVHYIADHLRSEDADSSVKEDWKYVA 440 450 460 470 480 490 430 440 450 460 pF1KE4 QVLDRMFLWTFLFVSIVGSLGLFVPVIYKWANILIPVHIGNANK .:.::.::: :..: ..: NP_000 MVIDRIFLWLFIIVCFLGTIGLFLPPFLAGMI 500 510 520 >>NP_004189 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine recept (494 aa) initn: 1440 init1: 517 opt: 1324 Z-score: 1625.1 bits: 310.1 E(85289): 8.9e-84 Smith-Waterman score: 1411; 47.3% identity (73.1% similar) in 457 aa overlap (47-451:34-488) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 VQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYERWVRPVEHLNDKIKIKF :. :.. ::. :....::::...: . ..: NP_004 SKGQGFLHGGLCLWLCVFTPFFKGCVGCATEERLFHKLFSHYNQFIRPVENVSDPVTVHF 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 GLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKVIRVPSDSVWTPDIVLF .::.::..::: ::.: ::.::.. : : ::::.: .: ::...:::.:..: :::::. NP_004 EVAITQLANVDEVNQIMETNLWLRHIWNDYKLRWDPMEYDGIETLRVPADKIWKPDIVLY 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 DNADGRF--EGTSTKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPFDLQNCSMKFGSWTYD .:: : : :: .::....::: .:::::: .:::: .:.:::::: ::::.:::::::: NP_004 NNAVGDFQVEG-KTKALLKYNGMITWTPPAIFKSSCPMDITFFPFDHQNCSLKFGSWTYD 130 140 150 160 170 180 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 GSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCW--YPYVTYSFVIKRLPLF ...:... . :: ::..:.::::..:.: : . .:: : .:::: :.:::.: NP_004 KAEIDLLIIGSKVDMNDFWENSEWEIIDASGYKHDIKYNCCEEIYTDITYSFYIRRLPMF 190 200 210 220 230 240 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 YTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLLVIEEIIPSSSKVIPL ::. :::::. .::::::::::::. :::. :: :::.::::::::: : :::.: :.:: NP_004 YTINLIIPCLFISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETIPSTSLVVPL 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 IGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAPLVRKIFLHTLPKLLCMRSHVDR .::::.::::::::::.::::..:::.:. .::. : :. .::. ::..: :: .:. NP_004 VGEYLLFTMIFVTLSIVVTVFVLNIHYRTPTTHT-MPRWVKTVFLKLLPQVLLMRWPLDK 310 320 330 340 350 360 380 390 pF1KE4 --------------YFTQKEETESGSGPK---------------SSRNTL---------- : . : . :. .:. : NP_004 TRGTGSDAVPRGLARRPAKGKLASHGEPRHLKECFHCHKSNELATSKRRLSHQPLQWVVE 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 pF1KE4 --------EAALDSIRYITRHIMKENDVREVVEDWKFIAQVLDRMFLWTFLFVSIVGSLG : ...:...:.... ..:...:: .:::..:.:.::.:::.:..: . :. : NP_004 NSEHSPEVEDVINSVQFIAENMKSHNETKEVEDDWKYVAMVVDRVFLWVFIIVCVFGTAG 430 440 450 460 470 480 450 460 pF1KE4 LFV-PVIYKWANILIPVHIGNANK ::. :.. NP_004 LFLQPLLGNTGKS 490 >>NP_001160166 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylchol (489 aa) initn: 1332 init1: 523 opt: 1300 Z-score: 1595.7 bits: 304.6 E(85289): 3.9e-82 Smith-Waterman score: 1301; 53.6% identity (77.2% similar) in 364 aa overlap (6-366:13-356) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKD : :: : :::: : ..: .: :.:. :.. 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