Result of FASTA (omim) for pFN21AB9420
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9420, 523 aa
  1>>>pF1KB9420 523 - 523 aa - 523 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7689+/-0.000715; mu= -14.0883+/- 0.042
 mean_var=678.5166+/-151.697, 0's: 0 Z-trim(114.9): 1553  B-trim: 449 in 1/51
 Lambda= 0.049237
 statistics sampled from 22792 (24986) to 22792 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.293), width:  16
 Scan time: 10.360

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_002586 (OMIM: 603440) cyclin-dependent kinase 1 ( 523) 3468 262.8 1.8e-69
XP_016874894 (OMIM: 603440) PREDICTED: cyclin-depe ( 523) 3468 262.8 1.8e-69
XP_016874895 (OMIM: 603440) PREDICTED: cyclin-depe ( 523) 3468 262.8 1.8e-69
NP_001163935 (OMIM: 603440) cyclin-dependent kinas ( 523) 3391 257.3 8.1e-68
XP_016885061 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 496) 2318 181.1 6.9e-45
NP_006192 (OMIM: 311550) cyclin-dependent kinase 1 ( 496) 2318 181.1 6.9e-45
XP_016885062 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 496) 2318 181.1 6.9e-45
XP_016885060 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 496) 2318 181.1 6.9e-45
XP_016885059 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 496) 2318 181.1 6.9e-45
XP_011542230 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 2318 181.1 6.9e-45
XP_011542227 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 2318 181.1 6.9e-45
XP_011542229 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 2318 181.1 6.9e-45
XP_011542228 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 2318 181.1 6.9e-45
XP_011542226 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 2318 181.1 6.9e-45
NP_148978 (OMIM: 311550) cyclin-dependent kinase 1 ( 502) 2318 181.1   7e-45
XP_011542225 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 503) 2318 181.1   7e-45
XP_011542224 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 540) 2318 181.1 7.3e-45
XP_016885058 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 543) 2318 181.1 7.3e-45
XP_011542223 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 544) 2318 181.1 7.3e-45
NP_001163931 (OMIM: 311550) cyclin-dependent kinas ( 570) 2318 181.1 7.5e-45
XP_011542222 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 571) 2318 181.1 7.5e-45
NP_002587 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 1 ( 474) 2133 167.9 6.1e-41
NP_997667 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 1 ( 474) 2133 167.9 6.1e-41
XP_011507904 (OMIM: 169190) PREDICTED: cyclin-depe ( 542) 2133 168.0 6.6e-41
NP_997668 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 1 ( 504) 2094 165.2 4.3e-40
XP_016856912 (OMIM: 169190) PREDICTED: cyclin-depe ( 572) 2094 165.2 4.6e-40
XP_016874896 (OMIM: 603440) PREDICTED: cyclin-depe ( 502) 1753 140.9 8.4e-33
XP_016867810 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 1237 104.2 8.2e-22
XP_005250495 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 1237 104.2 8.2e-22
XP_005250496 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 1237 104.2 8.2e-22
XP_016867811 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 1237 104.2 8.2e-22
XP_016867809 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 1237 104.2 8.2e-22
NP_001274065 (OMIM: 610679) cyclin-dependent kinas ( 423) 1237 104.2 8.2e-22
XP_005250493 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 450) 1237 104.2 8.5e-22
NP_036527 (OMIM: 610679) cyclin-dependent kinase 1 ( 451) 1237 104.2 8.6e-22
NP_001274064 (OMIM: 610679) cyclin-dependent kinas ( 469) 1237 104.2 8.8e-22
XP_011514608 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 469) 1237 104.2 8.8e-22
XP_005246839 (OMIM: 616147) PREDICTED: cyclin-depe ( 384) 1149 97.9 5.9e-20
NP_631897 (OMIM: 616147) cyclin-dependent kinase 1 ( 384) 1149 97.9 5.9e-20
XP_005246838 (OMIM: 616147) PREDICTED: cyclin-depe ( 435) 1149 97.9 6.4e-20
NP_004926 (OMIM: 123831,616342) cyclin-dependent-l ( 292) 1134 96.6 1.1e-19
NP_001248364 (OMIM: 616147) cyclin-dependent kinas ( 429) 1126 96.3   2e-19
NP_001248365 (OMIM: 616147) cyclin-dependent kinas ( 400) 1122 96.0 2.3e-19
XP_011509952 (OMIM: 616147) PREDICTED: cyclin-depe ( 412) 1122 96.0 2.3e-19
NP_001777 (OMIM: 116940) cyclin-dependent kinase 1 ( 297) 1099 94.2   6e-19
NP_001307847 (OMIM: 116940) cyclin-dependent kinas ( 297) 1099 94.2   6e-19
XP_005270360 (OMIM: 116940) PREDICTED: cyclin-depe ( 297) 1099 94.2   6e-19
NP_001274066 (OMIM: 610679) cyclin-dependent kinas ( 340) 1091 93.7 9.6e-19
NP_001249 (OMIM: 123828) cyclin-dependent kinase 3 ( 305) 1079 92.8 1.6e-18
NP_001789 (OMIM: 116953) cyclin-dependent kinase 2 ( 298) 1050 90.7 6.7e-18


>>NP_002586 (OMIM: 603440) cyclin-dependent kinase 17 is  (523 aa)
 initn: 3468 init1: 3468 opt: 3468  Z-score: 1368.1  bits: 262.8 E(85289): 1.8e-69
Smith-Waterman score: 3468; 100.0% identity (100.0% similar) in 523 aa overlap (1-523:1-523)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSFLHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSFLHQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 YTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSSDEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSSDEV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 QSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRAS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 LSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 LAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 LGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 EFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520   
pF1KB9 HALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
              490       500       510       520   

>>XP_016874894 (OMIM: 603440) PREDICTED: cyclin-dependen  (523 aa)
 initn: 3468 init1: 3468 opt: 3468  Z-score: 1368.1  bits: 262.8 E(85289): 1.8e-69
Smith-Waterman score: 3468; 100.0% identity (100.0% similar) in 523 aa overlap (1-523:1-523)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSFLHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSFLHQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 YTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSSDEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSSDEV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 QSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRAS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 LSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 LAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 LGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 EFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520   
pF1KB9 HALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
              490       500       510       520   

>>XP_016874895 (OMIM: 603440) PREDICTED: cyclin-dependen  (523 aa)
 initn: 3468 init1: 3468 opt: 3468  Z-score: 1368.1  bits: 262.8 E(85289): 1.8e-69
Smith-Waterman score: 3468; 100.0% identity (100.0% similar) in 523 aa overlap (1-523:1-523)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSFLHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSFLHQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 YTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSSDEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSSDEV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 QSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRAS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 LSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 LAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 LGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 EFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520   
pF1KB9 HALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
              490       500       510       520   

>>NP_001163935 (OMIM: 603440) cyclin-dependent kinase 17  (523 aa)
 initn: 3391 init1: 3391 opt: 3391  Z-score: 1338.5  bits: 257.3 E(85289): 8.1e-68
Smith-Waterman score: 3391; 100.0% identity (100.0% similar) in 512 aa overlap (1-512:1-512)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSFLHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSFLHQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 YTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSSDEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSSDEV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 QSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRAS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 LSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 LAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 LGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 EFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520   
pF1KB9 HALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::           
NP_001 HALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGVFVINHFTCRS
              490       500       510       520   

>>XP_016885061 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-dependen  (496 aa)
 initn: 2384 init1: 2312 opt: 2318  Z-score: 926.8  bits: 181.1 E(85289): 6.9e-45
Smith-Waterman score: 2352; 69.5% identity (86.9% similar) in 512 aa overlap (1-512:4-485)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB9    MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSF
          :::.::.::.::::.. ::.. .   ::. ..:...        .:  :        
XP_016 MDRMKKIKRQLSMTLRGGRGIDKT-NGAPEQIGLDESGGG-------GGSDPG-------
               10        20         30               40            

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB9 LHQYTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSS
                . : :   . . .. : . . :      .::::.:::::::::::::.:::
XP_016 ---------EAPTRAAPGELRSARGPLSSAP------EIVHEDLKMGSDGESDQASATSS
                   50        60              70        80        90

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB9 DEVQSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSR
       ::::::. : .::.  :.:: ::.:::::::::::.:.:::::: .::: ::.:.::: :
XP_016 DEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLR
              100       110       120       130       140       150

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB9 RASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIR
       :.:::::::::.::::::.:::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::
XP_016 RVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIR
              160       170       180       190       200       210

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB9 EVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQI
       :::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::.::::::..::::::::.:.
XP_016 EVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNIINMHNVKLFLFQL
              220       230       240       250       260       270

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB9 LRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPP
       :::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::
XP_016 LRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPP
              280       290       300       310       320       330

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB9 DVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGIS
       :.::::..::::::::::::::.:::.:::::::::::..::.:::.::::..:::::: 
XP_016 DILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGIL
              340       350       360       370       380       390

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB9 SNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLG
       ::::::.::.:::. . :..:::::::.: .:.::.::.:...:.:::.:::: .: :::
XP_016 SNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLG
              400       410       420       430       440       450

       480       490       500       510       520   
pF1KB9 PRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
        ::: ::...:::.::::::::. ..:.::.:..:           
XP_016 ERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAFRVVDTEF
              460       470       480       490      

>>NP_006192 (OMIM: 311550) cyclin-dependent kinase 16 is  (496 aa)
 initn: 2384 init1: 2312 opt: 2318  Z-score: 926.8  bits: 181.1 E(85289): 6.9e-45
Smith-Waterman score: 2352; 69.5% identity (86.9% similar) in 512 aa overlap (1-512:4-485)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB9    MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSF
          :::.::.::.::::.. ::.. .   ::. ..:...        .:  :        
NP_006 MDRMKKIKRQLSMTLRGGRGIDKT-NGAPEQIGLDESGGG-------GGSDPG-------
               10        20         30               40            

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB9 LHQYTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSS
                . : :   . . .. : . . :      .::::.:::::::::::::.:::
NP_006 ---------EAPTRAAPGELRSARGPLSSAP------EIVHEDLKMGSDGESDQASATSS
                   50        60              70        80        90

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB9 DEVQSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSR
       ::::::. : .::.  :.:: ::.:::::::::::.:.:::::: .::: ::.:.::: :
NP_006 DEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLR
              100       110       120       130       140       150

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB9 RASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIR
       :.:::::::::.::::::.:::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::
NP_006 RVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIR
              160       170       180       190       200       210

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB9 EVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQI
       :::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::.::::::..::::::::.:.
NP_006 EVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNIINMHNVKLFLFQL
              220       230       240       250       260       270

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB9 LRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPP
       :::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::
NP_006 LRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPP
              280       290       300       310       320       330

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB9 DVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGIS
       :.::::..::::::::::::::.:::.:::::::::::..::.:::.::::..:::::: 
NP_006 DILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGIL
              340       350       360       370       380       390

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB9 SNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLG
       ::::::.::.:::. . :..:::::::.: .:.::.::.:...:.:::.:::: .: :::
NP_006 SNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLG
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        ::: ::...:::.::::::::. ..:.::.:..:           
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>>XP_016885060 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-dependen  (496 aa)
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XP_016 ERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAFRVVDTEF
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>>XP_016885059 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-dependen  (496 aa)
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       :.:::::::::.::::::.:::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::
XP_016 RVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIR
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pF1KB9 LRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPP
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XP_016 LRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPP
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pF1KB9 DVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGIS
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XP_016 DILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGIL
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pF1KB9 SNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLG
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XP_016 SNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLG
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pF1KB9 PRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
        ::: ::...:::.::::::::. ..:.::.:..:           
XP_016 ERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAFRVVDTEF
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>>XP_011542230 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-dependen  (497 aa)
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                  10        20        30        40        50       
pF1KB9    MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSF
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XP_011 MDRMKKIKRQLSMTLRGGRGIDKT-NGAPEQIGLDESGGG-------GGSDP--------
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XP_011 --------GEAPTRAAPGELRSARGPLSSAP------EIVHEDLKMGSDGESDQASATSS
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pF1KB9 DEVQSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSR
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