FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9420, 523 aa 1>>>pF1KB9420 523 - 523 aa - 523 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7689+/-0.000715; mu= -14.0883+/- 0.042 mean_var=678.5166+/-151.697, 0's: 0 Z-trim(114.9): 1553 B-trim: 449 in 1/51 Lambda= 0.049237 statistics sampled from 22792 (24986) to 22792 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.293), width: 16 Scan time: 10.360 The best scores are: opt bits E(85289) NP_002586 (OMIM: 603440) cyclin-dependent kinase 1 ( 523) 3468 262.8 1.8e-69 XP_016874894 (OMIM: 603440) PREDICTED: cyclin-depe ( 523) 3468 262.8 1.8e-69 XP_016874895 (OMIM: 603440) PREDICTED: cyclin-depe ( 523) 3468 262.8 1.8e-69 NP_001163935 (OMIM: 603440) cyclin-dependent kinas ( 523) 3391 257.3 8.1e-68 XP_016885061 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 496) 2318 181.1 6.9e-45 NP_006192 (OMIM: 311550) cyclin-dependent kinase 1 ( 496) 2318 181.1 6.9e-45 XP_016885062 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 496) 2318 181.1 6.9e-45 XP_016885060 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 496) 2318 181.1 6.9e-45 XP_016885059 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 496) 2318 181.1 6.9e-45 XP_011542230 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 2318 181.1 6.9e-45 XP_011542227 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 2318 181.1 6.9e-45 XP_011542229 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 2318 181.1 6.9e-45 XP_011542228 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 2318 181.1 6.9e-45 XP_011542226 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 497) 2318 181.1 6.9e-45 NP_148978 (OMIM: 311550) cyclin-dependent kinase 1 ( 502) 2318 181.1 7e-45 XP_011542225 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 503) 2318 181.1 7e-45 XP_011542224 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 540) 2318 181.1 7.3e-45 XP_016885058 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 543) 2318 181.1 7.3e-45 XP_011542223 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 544) 2318 181.1 7.3e-45 NP_001163931 (OMIM: 311550) cyclin-dependent kinas ( 570) 2318 181.1 7.5e-45 XP_011542222 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-depe ( 571) 2318 181.1 7.5e-45 NP_002587 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 1 ( 474) 2133 167.9 6.1e-41 NP_997667 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 1 ( 474) 2133 167.9 6.1e-41 XP_011507904 (OMIM: 169190) PREDICTED: cyclin-depe ( 542) 2133 168.0 6.6e-41 NP_997668 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 1 ( 504) 2094 165.2 4.3e-40 XP_016856912 (OMIM: 169190) PREDICTED: cyclin-depe ( 572) 2094 165.2 4.6e-40 XP_016874896 (OMIM: 603440) PREDICTED: cyclin-depe ( 502) 1753 140.9 8.4e-33 XP_016867810 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 1237 104.2 8.2e-22 XP_005250495 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 1237 104.2 8.2e-22 XP_005250496 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 1237 104.2 8.2e-22 XP_016867811 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 1237 104.2 8.2e-22 XP_016867809 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 423) 1237 104.2 8.2e-22 NP_001274065 (OMIM: 610679) cyclin-dependent kinas ( 423) 1237 104.2 8.2e-22 XP_005250493 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 450) 1237 104.2 8.5e-22 NP_036527 (OMIM: 610679) cyclin-dependent kinase 1 ( 451) 1237 104.2 8.6e-22 NP_001274064 (OMIM: 610679) cyclin-dependent kinas ( 469) 1237 104.2 8.8e-22 XP_011514608 (OMIM: 610679) PREDICTED: cyclin-depe ( 469) 1237 104.2 8.8e-22 XP_005246839 (OMIM: 616147) PREDICTED: cyclin-depe ( 384) 1149 97.9 5.9e-20 NP_631897 (OMIM: 616147) cyclin-dependent kinase 1 ( 384) 1149 97.9 5.9e-20 XP_005246838 (OMIM: 616147) PREDICTED: cyclin-depe ( 435) 1149 97.9 6.4e-20 NP_004926 (OMIM: 123831,616342) cyclin-dependent-l ( 292) 1134 96.6 1.1e-19 NP_001248364 (OMIM: 616147) cyclin-dependent kinas ( 429) 1126 96.3 2e-19 NP_001248365 (OMIM: 616147) cyclin-dependent kinas ( 400) 1122 96.0 2.3e-19 XP_011509952 (OMIM: 616147) PREDICTED: cyclin-depe ( 412) 1122 96.0 2.3e-19 NP_001777 (OMIM: 116940) cyclin-dependent kinase 1 ( 297) 1099 94.2 6e-19 NP_001307847 (OMIM: 116940) cyclin-dependent kinas ( 297) 1099 94.2 6e-19 XP_005270360 (OMIM: 116940) PREDICTED: cyclin-depe ( 297) 1099 94.2 6e-19 NP_001274066 (OMIM: 610679) cyclin-dependent kinas ( 340) 1091 93.7 9.6e-19 NP_001249 (OMIM: 123828) cyclin-dependent kinase 3 ( 305) 1079 92.8 1.6e-18 NP_001789 (OMIM: 116953) cyclin-dependent kinase 2 ( 298) 1050 90.7 6.7e-18 >>NP_002586 (OMIM: 603440) cyclin-dependent kinase 17 is (523 aa) initn: 3468 init1: 3468 opt: 3468 Z-score: 1368.1 bits: 262.8 E(85289): 1.8e-69 Smith-Waterman score: 3468; 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100.0% identity (100.0% similar) in 512 aa overlap (1-512:1-512) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSFLHQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSFLHQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 YTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSSDEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 YTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSSDEV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 QSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 QSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRAS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 LSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 LLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 LAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 LGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNE 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB9 EFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 EFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRI 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB9 HALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF :::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 HALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGVFVINHFTCRS 490 500 510 520 >>XP_016885061 (OMIM: 311550) PREDICTED: cyclin-dependen (496 aa) initn: 2384 init1: 2312 opt: 2318 Z-score: 926.8 bits: 181.1 E(85289): 6.9e-45 Smith-Waterman score: 2352; 69.5% identity (86.9% similar) in 512 aa overlap (1-512:4-485) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSF :::.::.::.::::.. ::.. . ::. ..:... .: : XP_016 MDRMKKIKRQLSMTLRGGRGIDKT-NGAPEQIGLDESGGG-------GGSDPG------- 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 LHQYTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSS . : : . . .. : . . : .::::.:::::::::::::.::: XP_016 ---------EAPTRAAPGELRSARGPLSSAP------EIVHEDLKMGSDGESDQASATSS 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 DEVQSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSR ::::::. : .::. :.:: ::.:::::::::::.:.:::::: .::: ::.:.::: : XP_016 DEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLR 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 RASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIR :.:::::::::.::::::.:::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::: XP_016 RVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIR 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB9 EVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQI :::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::.::::::..::::::::.:. XP_016 EVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNIINMHNVKLFLFQL 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB9 LRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPP :::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::: XP_016 LRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPP 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 DVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGIS :.::::..::::::::::::::.:::.:::::::::::..::.:::.::::..:::::: XP_016 DILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGIL 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB9 SNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLG ::::::.::.:::. . :..:::::::.: .:.::.::.:...:.:::.:::: .: ::: XP_016 SNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLG 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 pF1KB9 PRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF ::: ::...:::.::::::::. ..:.::.:..: XP_016 ERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAFRVVDTEF 460 470 480 490 >>NP_006192 (OMIM: 311550) cyclin-dependent kinase 16 is (496 aa) initn: 2384 init1: 2312 opt: 2318 Z-score: 926.8 bits: 181.1 E(85289): 6.9e-45 Smith-Waterman score: 2352; 69.5% identity (86.9% similar) in 512 aa overlap (1-512:4-485) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSF :::.::.::.::::.. ::.. . ::. ..:... .: : NP_006 MDRMKKIKRQLSMTLRGGRGIDKT-NGAPEQIGLDESGGG-------GGSDPG------- 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 LHQYTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSS . : : . . .. : . . : .::::.:::::::::::::.::: NP_006 ---------EAPTRAAPGELRSARGPLSSAP------EIVHEDLKMGSDGESDQASATSS 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 DEVQSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSR ::::::. : .::. :.:: ::.:::::::::::.:.:::::: .::: ::.:.::: : NP_006 DEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLR 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 RASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIR :.:::::::::.::::::.:::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::: NP_006 RVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIR 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB9 EVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQI :::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::.::::::..::::::::.:. 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XP_011 EVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNIINMHNVKLFLFQL 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB9 LRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPP :::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::: XP_011 LRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPP 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 DVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGIS :.::::..::::::::::::::.:::.:::::::::::..::.:::.::::..:::::: XP_011 DILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGIL 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB9 SNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLG ::::::.::.:::. . :..:::::::.: .:.::.::.:...:.:::.:::: .: ::: XP_011 SNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLG 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 pF1KB9 PRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPET-GHGKNRRQSMLF ::: ::...:::.::::::::. ..:.::.:.. . :.. : :. 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