FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1296, 509 aa 1>>>pF1KE1296 509 - 509 aa - 509 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8621+/-0.000829; mu= 16.8248+/- 0.050 mean_var=93.4623+/-18.763, 0's: 0 Z-trim(109.6): 71 B-trim: 74 in 1/50 Lambda= 0.132665 statistics sampled from 10946 (11019) to 10946 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.704), E-opt: 0.2 (0.338), width: 16 Scan time: 2.380 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS47134.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 509) 3523 684.5 7.7e-197 CCDS34062.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 842) 3480 676.4 3.4e-194 CCDS75191.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 830) 2729 532.6 6.3e-151 CCDS14271.1 JADE3 gene_id:9767|Hs108|chrX ( 823) 1790 352.9 7.9e-97 CCDS4176.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 790) 1378 274.0 4.2e-73 CCDS75305.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 791) 1378 274.0 4.2e-73 CCDS78061.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 834) 1378 274.1 4.3e-73 CCDS14080.1 BRD1 gene_id:23774|Hs108|chr22 (1058) 683 141.1 5.8e-33 CCDS77686.1 BRD1 gene_id:23774|Hs108|chr22 (1189) 683 141.2 6.3e-33 CCDS34437.1 BRPF3 gene_id:27154|Hs108|chr6 (1205) 673 139.3 2.4e-32 CCDS82729.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1119) 662 137.1 9.8e-32 CCDS82730.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1213) 662 137.1 1e-31 CCDS2575.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1214) 662 137.1 1e-31 CCDS33692.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1220) 662 137.1 1e-31 CCDS7135.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1027) 486 103.4 1.3e-21 CCDS55708.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1068) 486 103.4 1.3e-21 CCDS11327.1 MLLT6 gene_id:4302|Hs108|chr17 (1093) 459 98.3 4.8e-20 CCDS12138.1 KDM4B gene_id:23030|Hs108|chr19 (1096) 386 84.3 7.7e-16 CCDS47542.1 PHF14 gene_id:9678|Hs108|chr7 ( 888) 364 80.0 1.2e-14 CCDS491.1 KDM4A gene_id:9682|Hs108|chr1 (1064) 351 77.6 7.8e-14 CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (1056) 350 77.4 8.8e-14 >>CCDS47134.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 (509 aa) initn: 3523 init1: 3523 opt: 3523 Z-score: 3647.4 bits: 684.5 E(32554): 7.7e-197 Smith-Waterman score: 3523; 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CCDS14 LRELEEEFYSLVRVEDVAAELGMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQ 400 410 420 430 440 450 480 490 500 pF1KE1 REQDVLFRRLQLFTHLRQDLERVMIDTDTL ... . :...: ::::::::: CCDS14 PKEESIHTRMRMFMHLRQDLERVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEID 460 470 480 490 500 510 >>CCDS4176.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 (790 aa) initn: 2118 init1: 1372 opt: 1378 Z-score: 1426.0 bits: 274.0 E(32554): 4.2e-73 Smith-Waterman score: 2140; 63.2% identity (79.6% similar) in 506 aa overlap (2-502:4-479) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MKRGRLPSSSEDSD--DNGSLSTTWSQNSR-SQHRRSSCSRHEDRKPSEVFRTDLITA :: . ::..:: :. . ::. :. :. . .:. :....::::::::::::: CCDS41 MEEKRRKYSISSDNSDTTDSHATSTSASRCSKLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLITA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 MKLHDSYQLNPDEYYVLADPWRQEWEKGVQVPVSPGTIPQPVARVVSE-EKSLMFIRPKK ::. :::::.::.::.::::::::::::::::.. .::.::.:.. : :.. 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CCDS14 KFIEKSAEEL---------DNEVEYDMDEEDYAWLEIVNEKRKGDCVPAVSQSMFEFLMD 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 EFEQRCYDNMNHAIETEEGLGIEYDEDVVCDVCQSPDGEDGNEMVFCDKCNICVHQACYG .::.. . :. ...: :::.:: .:.. . ...: ..::: ::. ::: ::: CCDS14 RFEKESH-CENQKQGEQQSL---IDEDAVCCICMDGECQNSNVILFCDMCNLAVHQECYG 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 ILKVPEGSWLCRTCALG-VQPK-CLLCPKKGGAMKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGSP . .:::.:::: : . ..: :.:::.::::.: : . .: :: ::::::::.... 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CCDS77 LLKRLSRNGAPLLRRLQSSLQSQRSSQQRENDEEMKAAKEKLKYWQRLRHDLERARLLIE 490 500 510 520 530 540 pF1KE1 TL : CCDS77 LLRKREKLKREQVKVEQVAMELRLTPLTVLLRSVLDQLQDKDPARIFAQPVSLKEVPDYL 550 560 570 580 590 600 >>CCDS34437.1 BRPF3 gene_id:27154|Hs108|chr6 (1205 aa) initn: 592 init1: 228 opt: 673 Z-score: 694.2 bits: 139.3 E(32554): 2.4e-32 Smith-Waterman score: 681; 31.6% identity (57.6% similar) in 462 aa overlap (87-483:84-539) 60 70 80 90 100 pF1KE1 KLHDSYQLNPDEYYVLADPWRQEWEKGVQVPVSPGTIPQPVARVVSEEK--------SLM : :: .: .. ..:. :. CCDS34 IYDPLKIITEDELTAQDITECNSNKENSEQPQFPGKSKKPSSKGKKKESCSKHASGTSFH 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 FIRPKKYIVSSGSEP--PELGYVDIRTLA------DSVCRYDLNDMDAAWLELTNEEFKE . .:. .:.:: .: : : . : . :. .::... : :::...::. . CCDS34 LPQPSFRMVDSGIQPEAPPLPAAYYRYIEKPPEDLDAEVEYDMDEEDLAWLDMVNEKRRV 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 MGMPELDEYTMERVLEEFEQRCYDNMNHAIETEEGLGIEYDEDVVCDVCQSPDGEDGNEM : .. :.: .....:.. : . ... ....: :::. : :: . . ...: . CCDS34 DGHSLVSADTFELLVDRLEKESYLE-SRSSGAQQSL---IDEDAFCCVCLDDECHNSNVI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 VFCDKCNICVHQACYGILKVPEGSWLCRTCALG-VQP-KCLLCPKKGGAMKPTRSGTKWV .::: ::. ::: :::. .:::.:::: : . .: :.:::.::::.: : .: .:. CCDS34 LFCDICNLAVHQECYGVPYIPEGQWLCRCCLQSPSRPVDCILCPNKGGAFKQTSDG-HWA 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 HVSCALWIPEVSIGSPEKMEPITKVSHIPSSRWALVCSLCNEK-FGASIQCSVKNCRTAF :: ::.::::: ... .::: ...:: .:: :.: .:..: .::.::: :: ::: CCDS34 HVVCAIWIPEVCFANTVFLEPIEGIDNIPPARWKLTCYICKQKGLGAAIQCHKVNCYTAF 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 pF1KE1 HVTCAFDRGLEMKT-ILAEND------EVKFKSYCPKHS------SHRK---P------- ::::: :: :: . :.. :. .:: :: ..:: : CCDS34 HVTCAQRAGLFMKIEPMRETSLNGTIFTVRKTAYCEAHSPPGAATARRKGDSPRSISETG 350 360 370 380 390 400 380 390 400 410 420 pF1KE1 -EESL--GKGAAQENGAPECSPRNPLEPFASLEQNREEAHRVSVRKQKLQQLEDE----F ::.: : : .:. : .. .. .. . ..:. :::... .: CCDS34 DEEGLKEGDGEEEEEEEVEEEEQEAQGGVSGSLKGVPKKSKMSL-KQKIKKEPEEAGQDT 410 420 430 440 450 460 430 440 450 460 470 pF1KE1 YTFVNLLDVAR--ALRLPE-----------EVVDFLYQYWKLKRKVNFNKPLIT---PKK . . .: : . . :: . . .. :..:: :::.. . ::: . CCDS34 PSTLPMLAVPQIPSYRLNKICSGLSFQRKNQFMQRLHNYWLLKRQARNGVPLIRRLHSHL 470 480 490 500 510 520 480 490 500 pF1KE1 DEEDNLAKREQDVLFRRLQLFTHLRQDLERVMIDTDTL . . : .:::: CCDS34 QSQRNAEQREQDEKTSAVKEELKYWQKLRHDLERARLLIELIRKREKLKREQVKVQQAAM 530 540 550 560 570 580 509 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 00:05:32 2016 done: Mon Nov 7 00:05:33 2016 Total Scan time: 2.380 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]