FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5614, 531 aa 1>>>pF1KE5614 531 - 531 aa - 531 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4653+/-0.000402; mu= 18.0064+/- 0.025 mean_var=70.6816+/-14.446, 0's: 0 Z-trim(112.3): 51 B-trim: 1104 in 2/52 Lambda= 0.152553 statistics sampled from 21075 (21123) to 21075 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16 Scan time: 9.380 The best scores are: opt bits E(85289) NP_071335 (OMIM: 300316) nuclear RNA export factor ( 531) 3629 808.1 0 NP_071336 (OMIM: 300315) nuclear RNA export factor ( 626) 1181 269.4 2.3e-71 NP_006353 (OMIM: 602647) nuclear RNA export factor ( 619) 1004 230.4 1.2e-59 NP_116564 (OMIM: 300319) nuclear RNA export factor ( 365) 807 187.0 8.7e-47 NP_001074960 (OMIM: 602647) nuclear RNA export fac ( 356) 758 176.2 1.5e-43 >>NP_071335 (OMIM: 300316) nuclear RNA export factor 3 [ (531 aa) initn: 3629 init1: 3629 opt: 3629 Z-score: 4315.2 bits: 808.1 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 3629; 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