FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2266, 852 aa 1>>>pF1KE2266 852 - 852 aa - 852 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0463+/-0.000515; mu= 22.5282+/- 0.032 mean_var=70.0738+/-14.426, 0's: 0 Z-trim(106.8): 51 B-trim: 166 in 1/48 Lambda= 0.153213 statistics sampled from 14871 (14918) to 14871 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.175), width: 16 Scan time: 12.130 The best scores are: opt bits E(85289) NP_689644 (OMIM: 610315) piwi-like protein 4 [Homo ( 852) 5645 1258.1 0 XP_011537305 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 861) 2818 633.2 1.5e-180 NP_004755 (OMIM: 605571) piwi-like protein 1 isofo ( 861) 2818 633.2 1.5e-180 XP_011537306 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 861) 2818 633.2 1.5e-180 XP_011537304 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 861) 2818 633.2 1.5e-180 NP_001177900 (OMIM: 605571) piwi-like protein 1 is ( 829) 2615 588.3 4.8e-167 XP_016875718 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 832) 2615 588.3 4.8e-167 XP_011537307 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 819) 2219 500.8 1.1e-140 NP_001242904 (OMIM: 610314) piwi-like protein 3 is ( 873) 2208 498.4 6e-140 NP_001129193 (OMIM: 610312) piwi-like protein 2 is ( 973) 1952 441.8 7e-123 NP_060538 (OMIM: 610312) piwi-like protein 2 isofo ( 973) 1952 441.8 7e-123 XP_011537308 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 481) 1730 392.5 2.4e-108 NP_001317409 (OMIM: 610312) piwi-like protein 2 is ( 937) 1603 364.7 1.1e-99 NP_001008496 (OMIM: 610314) piwi-like protein 3 is ( 882) 1454 331.7 8.9e-90 XP_005273608 (OMIM: 610312) PREDICTED: piwi-like p ( 804) 1376 314.4 1.3e-84 XP_016856017 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 585) 383 94.8 1.2e-18 XP_005270633 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 585) 383 94.8 1.2e-18 XP_016856013 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 383 94.9 1.3e-18 XP_016856014 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 383 94.9 1.3e-18 XP_016856015 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 383 94.9 1.3e-18 XP_011539184 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 383 94.9 1.3e-18 NP_803171 (OMIM: 607355) protein argonaute-3 isofo ( 626) 383 94.9 1.3e-18 XP_016856016 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 383 94.9 1.3e-18 XP_011539181 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 845) 383 95.0 1.6e-18 XP_016856012 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 860) 383 95.0 1.6e-18 NP_079128 (OMIM: 607355) protein argonaute-3 isofo ( 860) 383 95.0 1.6e-18 XP_005270632 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 860) 383 95.0 1.6e-18 XP_016868806 (OMIM: 606229) PREDICTED: protein arg ( 782) 379 94.1 2.8e-18 XP_011515268 (OMIM: 606229) PREDICTED: protein arg ( 813) 379 94.1 2.8e-18 NP_036286 (OMIM: 606229) protein argonaute-2 isofo ( 859) 379 94.1 3e-18 XP_011515267 (OMIM: 606229) PREDICTED: protein arg ( 873) 379 94.1 3e-18 XP_011515270 (OMIM: 606229) PREDICTED: protein arg ( 918) 379 94.1 3.1e-18 XP_016856508 (OMIM: 606228) PREDICTED: protein arg ( 706) 374 92.9 5.5e-18 NP_001304052 (OMIM: 606228) protein argonaute-1 is ( 782) 374 93.0 5.9e-18 NP_036331 (OMIM: 606228) protein argonaute-1 isofo ( 857) 374 93.0 6.4e-18 XP_011539538 (OMIM: 606228) PREDICTED: protein arg ( 860) 374 93.0 6.4e-18 NP_001304051 (OMIM: 606228) protein argonaute-1 is ( 891) 374 93.0 6.6e-18 XP_011539186 (OMIM: 607356) PREDICTED: protein arg ( 660) 337 84.7 1.5e-15 XP_011539185 (OMIM: 607356) PREDICTED: protein arg ( 711) 337 84.7 1.6e-15 XP_005270635 (OMIM: 607356) PREDICTED: protein arg ( 794) 337 84.8 1.7e-15 XP_005270636 (OMIM: 607356) PREDICTED: protein arg ( 794) 337 84.8 1.7e-15 NP_060099 (OMIM: 607356) protein argonaute-4 [Homo ( 861) 337 84.8 1.9e-15 NP_001158095 (OMIM: 606229) protein argonaute-2 is ( 825) 186 51.4 2e-05 XP_016856507 (OMIM: 606228) PREDICTED: protein arg ( 725) 167 47.2 0.00033 XP_016856506 (OMIM: 606228) PREDICTED: protein arg ( 873) 167 47.2 0.00038 XP_016856505 (OMIM: 606228) PREDICTED: protein arg ( 876) 167 47.2 0.00038 >>NP_689644 (OMIM: 610315) piwi-like protein 4 [Homo sap (852 aa) initn: 5645 init1: 5645 opt: 5645 Z-score: 6739.5 bits: 1258.1 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5645; 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XP_011 MTGRARARARGRARGQETAQLVGSTASQQPGYIQPRPQPPPAEGELFGRGRQRGTAGGTA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 ISTNDKYGISSGDAGSTFMERGVKNKQDFMDLSICTREKLAHVRNCKTGSSGIPVKLVTN : . . ::.: .. ::: . ..:: ::.. ::..: ::.. ::::::: :.: :: XP_011 KSQGLQ--ISAGFQELSLAERGGR-RRDFHDLGVNTRQNLDHVKESKTGSSGIIVRLSTN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LFNLDFPQDWQLYQYHVTYIPDLASRRLRIALLYSHSELSNKAKAFDGAILFLSQKLEEK : : .: :::::. : : . .:::: :::..: .: .: .::::.:::: ..:..: XP_011 HFRLTSRPQWALYQYHIDYNPLMEARRLRSALLFQHEDLIGKCHAFDGTILFLPKRLQQK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 VTELSSETQRGETIKMTITLKRELPSSSPVCIQVFNIIFRKILKKLSMYQIGRNFYNPSE :::. :.:. :: ...:::: ::: .::.:.: .:::::..:: ... :::::.:::.. XP_011 VTEVFSKTRNGEDVRITITLTNELPPTSPTCLQFYNIIFRRLLKIMNLQQIGRNYYNPND 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 PMEIPQHKLSLWPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVLRNETVLEFMTALCQRTGLSCFTQ :..::.:.: .::::. :. .: .... .:::.::::.::::.:: . ..: : . 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XP_011 DWSKETRGAPLISVKPLDNWLLIYTRRNYEAANSLIQNLFKVTPAMGMQMRKAIMIEVDD 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 NPAAFVRAIQQYVDPDVQLVMCILPSNQKTYYDSIKKYLSSDCPVPSQCVLARTLNKQGM :..:..:: : :.:.:.:.: ::.: ::.::::: .:::.:::::.::::.:: XP_011 RTEAYLRVLQQKVTADTQIVVCLLSSNRKDKYDAIKKYLCTDCPTPSQCVVARTLGKQQT 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 MMSIATKIAMQMTCKLGGELWAVEIPLKSLMVVGIDVCKDALSKDVMVVGCVASVNPRIT .:.::::::.::.::.::::: :.:::: .:.:::: .: . ..: :::.: .: XP_011 VMAIATKIALQMNCKMGGELWRVDIPLKLVMIVGIDCYHDMTAGRRSIAGFVASINEGMT 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 RWFSRCILQRTMTDVADCLKVFMTGALNKWYKYNHDLPARIIVYRAGVGDGQLKTLIEYE :::::::.: ...: ::: . .:: : . :. .:.:::::: ::::::::::..:: XP_011 RWFSRCIFQDRGQELVDGLKVCLQAALRAWNSCNEYMPSRIIVYRDGVGDGQLKTLVNYE 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 pF1KE2 VPQLLSSVAESSSNTSSRLSVIVVRKKCMPRFFTEMNRTVQNPPLGTVVDSEATRNEWYD :::.:. :. .: :. :: XP_011 VPQFLD---------------------CLKS-------------IG--------RGYKYD 720 730 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 FYLISQVACRGTVSPTYYNVIYDDNGLKPDHMQRLTFKLCHLYYNWPGIVSVPAPCQYAH :...::.. :.::::.::::::..::::::.::::.::::.::::::.. ::::::::: XP_011 FFIVSQAVRSGSVSPTHYNVIYDNSGLKPDHIQRLTYKLCHIYYNWPGVIRVPAPCQYAH 740 750 760 770 780 790 830 840 850 pF1KE2 KLTFLVAQSIHKEPSLELANHLFYL ::.:::.::::.::.: :.:.:.:: XP_011 KLAFLVGQSIHREPNLSLSNRLYYL 800 810 >>NP_001242904 (OMIM: 610314) piwi-like protein 3 isofor (873 aa) initn: 1358 init1: 568 opt: 2208 Z-score: 2633.5 bits: 498.4 E(85289): 6e-140 Smith-Waterman score: 2221; 39.9% identity (70.4% similar) in 878 aa overlap (1-852:1-873) 10 20 30 pF1KE2 MSGRARVKARGIAR--------SP-------SAT--EVGRIQASPLPRSVDLSN----NE : ::::..::: :: .: ::: : ..:..: : . .. . NP_001 MPGRARTRARGRARRRESYQQEAPGGPRAPGSATTQEPPQLQSTPRPLQEEVPVVRPLQP 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 ASSSNGFLGTSRISTNDKYGISSGDAGSTFMERGVKNKQDFMDLSICTREKLAHVRNCKT .. .: : .. . . : .: . ..:: . . :.:: . ::. . ::.. :: NP_001 RAARGGAGGGAQSQGVKEPGPEAGLHTAPLQERRIGGV--FQDLVVNTRQDMKHVKDSKT 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 GSSGIPVKLVTNLFN-LDFPQDWQLYQYHVTYIPDLASRRLRIALLYSHSELSNKAKAFD :: : :.:..: : .. :: : :.:.: : ::. . :: :: .: . .. . :: NP_001 GSEGTVVQLLANHFRVISRPQ-WVAYKYNVDYKPDIEDGNLRTILLDQHRRKFGERHIFD 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 GAILFLSQKLEEKVTELSSETQRGETIKMTITLKRELPSSSPVCIQVFNIIFRKILKKLS : :.::. :.:. .: : :. . .:.:. ...:: .:: :.. .::.::. .: :. NP_001 GNSLLLSRPLKERRVEWLSTTKDKNIVKITVEFSKELTPTSPDCLRYYNILFRRTFKLLD 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 MYQIGRNFYNPSEPMEIPQHKLSL--WPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVLRNETVLEF . :.:::.:. .. ... .: :: : :.. :: .: .. . ::::.:.:: ::. .: NP_001 FEQVGRNYYTKKKAIQLYRHGTSLEIWLGYVTSVLQYENSITLCADVSHKLLRIETAYDF 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 MTALCQRTGLSCFTQTCEKQLIGLIVLTRYNNRTYSIDDIDWSVKPTHTFQKRDGTEITY . .. . . . ..::: ::::.:::.:: .:::::. .: ::.: ::..::: NP_001 IKRTSAQAQTGNIREEVTNKLIGSIVLTKYNNKTYRVDDIDWKQNPEDTFNKSDGSKITY 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 VDYYKQQYDITVSDLNQPMLVSLLKKKRN-DNSEAQLAHLIPELCFLTGLTDQATSDFQL .:::.::. :. .::.::: . :.. ... . :::.:: .:::::. .:... 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NP_001 LELKSQRKTDSAEISIKIQMTKILEPCSDLCIPFYNVVFRRVMKLLDMKLVGRNFYDPTS 290 300 310 320 330 340 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 PMEIPQHKLSLWPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVLRNETVLEFMTALCQRTGLSCFTQ : . ::.:..:::.: :. . :.. ::::.::.::. ::. : :. :.. : . NP_001 AMVLQQHRLQIWPGYAASIRRTDGGLFLLADVSHKVIRNDCVLDVMHAIYQQNK-EHFQD 350 360 370 380 390 400 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 TCEKQLIGLIVLTRYNNRTYSIDDIDWSVKPTHTFQKRDGTEITYVDYYKQQYDITVSDL : : :.: ::.:::::::: :::.::. : .: :: :::...::...: :::.. NP_001 ECTKLLVGNIVITRYNNRTYRIDDVDWNKTPKDSFTMSDGKEITFLEYYSKNYGITVKEE 410 420 430 440 450 460 360 370 380 390 400 pF1KE2 NQPMLVSLLKKKRNDNSEAQLAH---LIPELCFLTGLTDQATSDFQLMKAVAEKTRLSPS .::.:. ..:.:: : :.::: :.::. .. .::. :: .:.. :::. NP_001 DQPLLIHR-PSERQDNHGMLLKGEILLLPELSFMTGIPEKMKKDFRAMKDLAQQINLSPK 470 480 490 500 510 520 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 GRQQRLARLVDNIQRNTNARFELETWGLHFGSQI-SLTGRIVPSEKILMQDHICQPVSAA ... : :.. : .: : :: :::.. ... .. ::..: :.: ... . NP_001 QHHSALECLLQRIAKNEAATNELMRWGLRLQKDVHKIEGRVLPMERINLKNTSFITSQEL 530 540 550 560 570 580 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 DWSKDI-RTCKILNAQSLNTWLILCSDRTEYVAESFLNCLRRVAGSMGFNVDYPKIIKVQ .: :.. : .::. .. : .. :. :. ..: :...:: .:. .. : .... NP_001 NWVKEVTRDPSILTIP-MHFWALFYPKRAMDQARELVNMLEKIAGPIGMRMSPPAWVELK 590 600 610 620 630 640 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 ENPA-AFVRAIQQYVDPD--VQLVMCILPSNQKTYYDSIKKYLSSDCPVPSQCVLARTLN .. ..::.::. . . .:.:.::. . . : .::: . ::::: : .::.. NP_001 DDRIETYVRTIQSTLGAEGKIQMVVCIIMGPRDDLYGAIKKLCCVQSPVPSQVVNVRTIG 650 660 670 680 690 700 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 KQGMMMSIATKIAMQMTCKLGGELWAVEIPLKSLMVVGIDVCKDALSKDVMVVGCVASVN . . :.: :: .:..::::::::.:.::::.:::.:.:: .: ::: :::.: NP_001 QPTRLRSVAQKILLQINCKLGGELWGVDIPLKQLMVIGMDVYHDPSRGMRSVVGFVASIN 710 720 730 740 750 760 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 PRITRWFSRCILQRTMTDVADCLKVFMTGALNKWYKYNHDLPARIIVYRAGVGDGQLKTL .:.:.:: ..: ...: ::. ..:.:.:.:. :: :: .:.::: ::.::::::. NP_001 LTLTKWYSRVVFQMPHQEIVDSLKLCLVGSLKKFYEVNHCLPEKIVVYRDGVSDGQLKTV 770 780 790 800 810 820 710 720 730 740 750 760 pF1KE2 IEYEVPQLLSSVAESSSNTSSRLSVIVVRKKCMPRFFTEMNRTVQNPPLGTVVDSEATRN .::.::: .. :. : . .. :.::.:: .. .. .: ::::: : NP_001 ANYEIPQL-QKCFEAFENYQPKMVVFVVQKKISTNLYLAAPQNFVTPTPGTVVDHTITSC 830 840 850 860 870 880 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 EWYDFYLISQVACRGTVSPTYYNVIYDDNGLKPDHMQRLTFKLCHLYYNWPGIVSVPAPC :: ::::... . .: ::.: . . .:.:::::::::::::.:.:::: . ::::: NP_001 EWVDFYLLAHHVRQGCGIPTHYVCVLNTANLSPDHMQRLTFKLCHMYWNWPGTIRVPAPC 890 900 910 920 930 940 830 840 850 pF1KE2 QYAHKLTFLVAQSIHKEPSLELANHLFYL .:::::.:: .. .:.::...: ..::.: NP_001 KYAHKLAFLSGHILHHEPAIQLCENLFFL 950 960 970 852 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 00:11:29 2016 done: Mon Nov 7 00:11:31 2016 Total Scan time: 12.130 Total Display time: 0.290 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]