Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2266
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2266, 852 aa
  1>>>pF1KE2266 852 - 852 aa - 852 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6778+/-0.00124; mu= 18.4769+/- 0.075
 mean_var=63.6145+/-12.662, 0's: 0 Z-trim(100.0): 24  B-trim: 0 in 0/48
 Lambda= 0.160804
 statistics sampled from 5923 (5937) to 5923 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.526), E-opt: 0.2 (0.182), width:  16
 Scan time:  3.730

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31656.1 PIWIL4 gene_id:143689|Hs108|chr11      ( 852) 5645 1319.2       0
CCDS9268.1 PIWIL1 gene_id:9271|Hs108|chr12         ( 861) 2818 663.3 4.9e-190
CCDS6029.1 PIWIL2 gene_id:55124|Hs108|chr8         ( 973) 1952 462.4 1.7e-129
CCDS83261.1 PIWIL2 gene_id:55124|Hs108|chr8        ( 937) 1603 381.5 3.8e-105
CCDS33623.1 PIWIL3 gene_id:440822|Hs108|chr22      ( 882) 1454 346.9 9.1e-95
CCDS400.1 AGO3 gene_id:192669|Hs108|chr1           ( 626)  383 98.4 4.2e-20
CCDS399.1 AGO3 gene_id:192669|Hs108|chr1           ( 860)  383 98.4 5.6e-20
CCDS6380.1 AGO2 gene_id:27161|Hs108|chr8           ( 859)  379 97.5 1.1e-19
CCDS81300.1 AGO1 gene_id:26523|Hs108|chr1          ( 782)  374 96.3 2.2e-19
CCDS398.1 AGO1 gene_id:26523|Hs108|chr1            ( 857)  374 96.3 2.4e-19
CCDS397.1 AGO4 gene_id:192670|Hs108|chr1           ( 861)  337 87.8 9.1e-17


>>CCDS31656.1 PIWIL4 gene_id:143689|Hs108|chr11           (852 aa)
 initn: 5645 init1: 5645 opt: 5645  Z-score: 7069.7  bits: 1319.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5645; 100.0% identity (100.0% similar) in 852 aa overlap (1-852:1-852)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MSGRARVKARGIARSPSATEVGRIQASPLPRSVDLSNNEASSSNGFLGTSRISTNDKYGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSGRARVKARGIARSPSATEVGRIQASPLPRSVDLSNNEASSSNGFLGTSRISTNDKYGI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 SSGDAGSTFMERGVKNKQDFMDLSICTREKLAHVRNCKTGSSGIPVKLVTNLFNLDFPQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SSGDAGSTFMERGVKNKQDFMDLSICTREKLAHVRNCKTGSSGIPVKLVTNLFNLDFPQD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 WQLYQYHVTYIPDLASRRLRIALLYSHSELSNKAKAFDGAILFLSQKLEEKVTELSSETQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WQLYQYHVTYIPDLASRRLRIALLYSHSELSNKAKAFDGAILFLSQKLEEKVTELSSETQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 RGETIKMTITLKRELPSSSPVCIQVFNIIFRKILKKLSMYQIGRNFYNPSEPMEIPQHKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RGETIKMTITLKRELPSSSPVCIQVFNIIFRKILKKLSMYQIGRNFYNPSEPMEIPQHKL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 SLWPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVLRNETVLEFMTALCQRTGLSCFTQTCEKQLIGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SLWPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVLRNETVLEFMTALCQRTGLSCFTQTCEKQLIGL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 IVLTRYNNRTYSIDDIDWSVKPTHTFQKRDGTEITYVDYYKQQYDITVSDLNQPMLVSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IVLTRYNNRTYSIDDIDWSVKPTHTFQKRDGTEITYVDYYKQQYDITVSDLNQPMLVSLL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 KKKRNDNSEAQLAHLIPELCFLTGLTDQATSDFQLMKAVAEKTRLSPSGRQQRLARLVDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KKKRNDNSEAQLAHLIPELCFLTGLTDQATSDFQLMKAVAEKTRLSPSGRQQRLARLVDN
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 IQRNTNARFELETWGLHFGSQISLTGRIVPSEKILMQDHICQPVSAADWSKDIRTCKILN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IQRNTNARFELETWGLHFGSQISLTGRIVPSEKILMQDHICQPVSAADWSKDIRTCKILN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 AQSLNTWLILCSDRTEYVAESFLNCLRRVAGSMGFNVDYPKIIKVQENPAAFVRAIQQYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AQSLNTWLILCSDRTEYVAESFLNCLRRVAGSMGFNVDYPKIIKVQENPAAFVRAIQQYV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 DPDVQLVMCILPSNQKTYYDSIKKYLSSDCPVPSQCVLARTLNKQGMMMSIATKIAMQMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DPDVQLVMCILPSNQKTYYDSIKKYLSSDCPVPSQCVLARTLNKQGMMMSIATKIAMQMT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 CKLGGELWAVEIPLKSLMVVGIDVCKDALSKDVMVVGCVASVNPRITRWFSRCILQRTMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CKLGGELWAVEIPLKSLMVVGIDVCKDALSKDVMVVGCVASVNPRITRWFSRCILQRTMT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 DVADCLKVFMTGALNKWYKYNHDLPARIIVYRAGVGDGQLKTLIEYEVPQLLSSVAESSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DVADCLKVFMTGALNKWYKYNHDLPARIIVYRAGVGDGQLKTLIEYEVPQLLSSVAESSS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 NTSSRLSVIVVRKKCMPRFFTEMNRTVQNPPLGTVVDSEATRNEWYDFYLISQVACRGTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NTSSRLSVIVVRKKCMPRFFTEMNRTVQNPPLGTVVDSEATRNEWYDFYLISQVACRGTV
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 SPTYYNVIYDDNGLKPDHMQRLTFKLCHLYYNWPGIVSVPAPCQYAHKLTFLVAQSIHKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SPTYYNVIYDDNGLKPDHMQRLTFKLCHLYYNWPGIVSVPAPCQYAHKLTFLVAQSIHKE
              790       800       810       820       830       840

              850  
pF1KE2 PSLELANHLFYL
       ::::::::::::
CCDS31 PSLELANHLFYL
              850  

>>CCDS9268.1 PIWIL1 gene_id:9271|Hs108|chr12              (861 aa)
 initn: 2843 init1: 1472 opt: 2818  Z-score: 3525.1  bits: 663.3 E(32554): 4.9e-190
Smith-Waterman score: 2840; 49.1% identity (76.3% similar) in 865 aa overlap (1-852:1-861)

               10                 20        30        40        50 
pF1KE2 MSGRARVKARGIAR---------SPSATEVGRIQASPLPRSVDLSNNEASSSNGFLGTSR
       :.::::..::: ::         : .. . : ::  : :  ..      . . :  : . 
CCDS92 MTGRARARARGRARGQETAQLVGSTASQQPGYIQPRPQPPPAEGELFGRGRQRGTAGGTA
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE2 ISTNDKYGISSGDAGSTFMERGVKNKQDFMDLSICTREKLAHVRNCKTGSSGIPVKLVTN
        : . .  ::.:    .. ::: . ..:: ::.. ::..: ::.. ::::::: :.: ::
CCDS92 KSQGLQ--ISAGFQELSLAERGGR-RRDFHDLGVNTRQNLDHVKESKTGSSGIIVRLSTN
                 70        80         90       100       110       

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE2 LFNLDFPQDWQLYQYHVTYIPDLASRRLRIALLYSHSELSNKAKAFDGAILFLSQKLEEK
        : :    .: :::::. : : . .:::: :::..: .: .: .::::.:::: ..:..:
CCDS92 HFRLTSRPQWALYQYHIDYNPLMEARRLRSALLFQHEDLIGKCHAFDGTILFLPKRLQQK
       120       130       140       150       160       170       

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE2 VTELSSETQRGETIKMTITLKRELPSSSPVCIQVFNIIFRKILKKLSMYQIGRNFYNPSE
       :::. :.:. :: ...::::  ::: .::.:.: .:::::..:: ... :::::.:::..
CCDS92 VTEVFSKTRNGEDVRITITLTNELPPTSPTCLQFYNIIFRRLLKIMNLQQIGRNYYNPND
       180       190       200       210       220       230       

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE2 PMEIPQHKLSLWPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVLRNETVLEFMTALCQRTGLSCFTQ
       :..::.:.: .::::. :.  .: .... .:::.::::.::::.::  . ..:    : .
CCDS92 PIDIPSHRLVIWPGFTTSILQYENSIMLCTDVSHKVLRSETVLDFMFNFYHQTEEHKFQE
       240       250       260       270       280       290       

             300       310       320       330       340       350 
pF1KE2 TCEKQLIGLIVLTRYNNRTYSIDDIDWSVKPTHTFQKRDGTEITYVDYYKQQYDITVSDL
          :.::::.:::.:::.:: .:::::. .:  ::.: ::.:.....::..::.  ..::
CCDS92 QVSKELIGLVVLTKYNNKTYRVDDIDWDQNPKSTFKKADGSEVSFLEYYRKQYNQEITDL
       300       310       320       330       340       350       

             360       370        380       390       400       410
pF1KE2 NQPMLVSLLKKKRNDNSEAQL-AHLIPELCFLTGLTDQATSDFQLMKAVAEKTRLSPSGR
       .::.:::  :..:. ..     : ::::::.::::::.  .::..:: .: .:::.:  :
CCDS92 KQPVLVSQPKRRRGPGGTLPGPAMLIPELCYLTGLTDKMRNDFNVMKDLAVHTRLTPEQR
       360       370       380       390       400       410       

              420       430       440        450       460         
pF1KE2 QQRLARLVDNIQRNTNARFELETWGLHFGSQI-SLTGRIVPSEKILMQDHICQ--PVSAA
       :....::.: :..: :.. ::. ::: : :.. :..:::. .::: .  .  .  : . :
CCDS92 QREVGRLIDYIHKNDNVQRELRDWGLSFDSNLLSFSGRILQTEKIHQGGKTFDYNP-QFA
       420       430       440       450       460       470       

       470       480       490       500       510       520       
pF1KE2 DWSKDIRTCKILNAQSLNTWLILCSDRTEYVAESFLNCLRRVAGSMGFNVDYPKIIKVQE
       ::::. :   ..... :..::.. . :.  .:.:... : .:. .::...    .:.:..
CCDS92 DWSKETRGAPLISVKPLDNWLLIYTRRNYEAANSLIQNLFKVTPAMGMQMRKAIMIEVDD
        480       490       500       510       520       530      

       530       540       550       560       570       580       
pF1KE2 NPAAFVRAIQQYVDPDVQLVMCILPSNQKTYYDSIKKYLSSDCPVPSQCVLARTLNKQGM
          :..:..:: :  :.:.:.:.: ::.:  ::.::::: .:::.:::::.::::.::  
CCDS92 RTEAYLRVLQQKVTADTQIVVCLLSSNRKDKYDAIKKYLCTDCPTPSQCVVARTLGKQQT
        540       550       560       570       580       590      

       590       600       610       620       630       640       
pF1KE2 MMSIATKIAMQMTCKLGGELWAVEIPLKSLMVVGIDVCKDALSKDVMVVGCVASVNPRIT
       .:.::::::.::.::.::::: :.:::: .:.::::  .:  .    ..: :::.:  .:
CCDS92 VMAIATKIALQMNCKMGGELWRVDIPLKLVMIVGIDCYHDMTAGRRSIAGFVASINEGMT
        600       610       620       630       640       650      

       650       660       670       680       690       700       
pF1KE2 RWFSRCILQRTMTDVADCLKVFMTGALNKWYKYNHDLPARIIVYRAGVGDGQLKTLIEYE
       :::::::.:    ...: ::: . .::  : . :. .:.:::::: ::::::::::..::
CCDS92 RWFSRCIFQDRGQELVDGLKVCLQAALRAWNSCNEYMPSRIIVYRDGVGDGQLKTLVNYE
        660       670       680       690       700       710      

       710       720       730       740       750       760       
pF1KE2 VPQLLSSVAESSSNTSSRLSVIVVRKKCMPRFFTEMNRTVQNPPLGTVVDSEATRNEWYD
       :::.:. .   . . . ::.::::.:.   :::.. .  .:::  :::.: :.:: ::::
CCDS92 VPQFLDCLKSIGRGYNPRLTVIVVKKRVNTRFFAQSGGRLQNPLPGTVIDVEVTRPEWYD
        720       730       740       750       760       770      

       770       780       790       800       810       820       
pF1KE2 FYLISQVACRGTVSPTYYNVIYDDNGLKPDHMQRLTFKLCHLYYNWPGIVSVPAPCQYAH
       :...::..  :.::::.::::::..::::::.::::.::::.::::::.. :::::::::
CCDS92 FFIVSQAVRSGSVSPTHYNVIYDNSGLKPDHIQRLTYKLCHIYYNWPGVIRVPAPCQYAH
        780       790       800       810       820       830      

       830       840       850  
pF1KE2 KLTFLVAQSIHKEPSLELANHLFYL
       ::.:::.::::.::.: :.:.:.::
CCDS92 KLAFLVGQSIHREPNLSLSNRLYYL
        840       850       860 

>>CCDS6029.1 PIWIL2 gene_id:55124|Hs108|chr8              (973 aa)
 initn: 1749 init1: 554 opt: 1952  Z-score: 2438.5  bits: 462.4 E(32554): 1.7e-129
Smith-Waterman score: 1952; 39.4% identity (69.1% similar) in 779 aa overlap (83-852:204-973)

             60        70        80        90       100       110  
pF1KE2 STNDKYGISSGDAGSTFMERGVKNKQDFMDLSICTREKLAHVRNCKTGSSGIPVKLVTNL
                                     :..  .::   :   : ::.: : .:  ::
CCDS60 FSTPSRGPPQLSSPPALPQSPLHSPDRPLVLTVEHKEKELIV---KQGSKGTPQSLGLNL
           180       190       200       210          220       230

            120       130       140       150       160       170  
pF1KE2 FNLDFPQDWQLYQYHVTYIPDLASRRLRIALLYSHSELSNKAKAFDGAILFLSQKLEEKV
        ...  ..  .::::::. :..  . .:...: .:. ..... ::::.::.:  ::.. :
CCDS60 VKIQC-HNEAVYQYHVTFSPNVECKSMRFGMLKDHQAVTGNVTAFDGSILYLPVKLQQ-V
               240       250       260       270       280         

            180        190       200       210       220       230 
pF1KE2 TELSSETQRGET-IKMTITLKRELPSSSPVCIQVFNIIFRKILKKLSMYQIGRNFYNPSE
        ::.:. .   . :.. : . . :   : .::  .:..::...: :.:  .:::::.:. 
CCDS60 LELKSQRKTDSAEISIKIQMTKILEPCSDLCIPFYNVVFRRVMKLLDMKLVGRNFYDPTS
      290       300       310       320       330       340        

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE2 PMEIPQHKLSLWPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVLRNETVLEFMTALCQRTGLSCFTQ
        : . ::.:..:::.: :.   .  :.. ::::.::.::. ::. : :. :..    : .
CCDS60 AMVLQQHRLQIWPGYAASIRRTDGGLFLLADVSHKVIRNDCVLDVMHAIYQQNK-EHFQD
      350       360       370       380       390       400        

             300       310       320       330       340       350 
pF1KE2 TCEKQLIGLIVLTRYNNRTYSIDDIDWSVKPTHTFQKRDGTEITYVDYYKQQYDITVSDL
        : : :.: ::.:::::::: :::.::.  :  .:   :: :::...::...: :::.. 
CCDS60 ECTKLLVGNIVITRYNNRTYRIDDVDWNKTPKDSFTMSDGKEITFLEYYSKNYGITVKEE
       410       420       430       440       450       460       

             360       370          380       390       400        
pF1KE2 NQPMLVSLLKKKRNDNSEAQLAH---LIPELCFLTGLTDQATSDFQLMKAVAEKTRLSPS
       .::.:.    ..:.::    :     :.::: :.::. ..  .::. :: .:..  :::.
CCDS60 DQPLLIHR-PSERQDNHGMLLKGEILLLPELSFMTGIPEKMKKDFRAMKDLAQQINLSPK
       470        480       490       500       510       520      

      410       420       430       440        450       460       
pF1KE2 GRQQRLARLVDNIQRNTNARFELETWGLHFGSQI-SLTGRIVPSEKILMQDHICQPVSAA
        ... :  :.. : .:  :  ::  :::.. ... .. ::..: :.: ...      .  
CCDS60 QHHSALECLLQRIAKNEAATNELMRWGLRLQKDVHKIEGRVLPMERINLKNTSFITSQEL
        530       540       550       560       570       580      

       470        480       490       500       510       520      
pF1KE2 DWSKDI-RTCKILNAQSLNTWLILCSDRTEYVAESFLNCLRRVAGSMGFNVDYPKIIKVQ
       .: :.. :  .::.   .. : ..   :.   :. ..: :...:: .:. .. :  ....
CCDS60 NWVKEVTRDPSILTIP-MHFWALFYPKRAMDQARELVNMLEKIAGPIGMRMSPPAWVELK
        590       600        610       620       630       640     

        530        540         550       560       570       580   
pF1KE2 ENPA-AFVRAIQQYVDPD--VQLVMCILPSNQKTYYDSIKKYLSSDCPVPSQCVLARTLN
       ..   ..::.::. .  .  .:.:.::. . .   : .:::    . ::::: : .::..
CCDS60 DDRIETYVRTIQSTLGAEGKIQMVVCIIMGPRDDLYGAIKKLCCVQSPVPSQVVNVRTIG
         650       660       670       680       690       700     

           590       600       610       620       630       640   
pF1KE2 KQGMMMSIATKIAMQMTCKLGGELWAVEIPLKSLMVVGIDVCKDALSKDVMVVGCVASVN
       .   . :.: :: .:..::::::::.:.::::.:::.:.:: .:       ::: :::.:
CCDS60 QPTRLRSVAQKILLQINCKLGGELWGVDIPLKQLMVIGMDVYHDPSRGMRSVVGFVASIN
         710       720       730       740       750       760     

           650       660       670       680       690       700   
pF1KE2 PRITRWFSRCILQRTMTDVADCLKVFMTGALNKWYKYNHDLPARIIVYRAGVGDGQLKTL
         .:.:.:: ..:    ...: ::. ..:.:.:.:. :: :: .:.::: ::.::::::.
CCDS60 LTLTKWYSRVVFQMPHQEIVDSLKLCLVGSLKKFYEVNHCLPEKIVVYRDGVSDGQLKTV
         770       780       790       800       810       820     

           710       720       730       740       750       760   
pF1KE2 IEYEVPQLLSSVAESSSNTSSRLSVIVVRKKCMPRFFTEMNRTVQNPPLGTVVDSEATRN
        .::.::: ..  :.  : . .. :.::.::    ..    ..  .:  :::::   :  
CCDS60 ANYEIPQL-QKCFEAFENYQPKMVVFVVQKKISTNLYLAAPQNFVTPTPGTVVDHTITSC
         830        840       850       860       870       880    

           770       780       790       800       810       820   
pF1KE2 EWYDFYLISQVACRGTVSPTYYNVIYDDNGLKPDHMQRLTFKLCHLYYNWPGIVSVPAPC
       :: ::::... . .:   ::.:  . .  .:.:::::::::::::.:.:::: . :::::
CCDS60 EWVDFYLLAHHVRQGCGIPTHYVCVLNTANLSPDHMQRLTFKLCHMYWNWPGTIRVPAPC
          890       900       910       920       930       940    

           830       840       850  
pF1KE2 QYAHKLTFLVAQSIHKEPSLELANHLFYL
       .:::::.:: .. .:.::...: ..::.:
CCDS60 KYAHKLAFLSGHILHHEPAIQLCENLFFL
          950       960       970   

>>CCDS83261.1 PIWIL2 gene_id:55124|Hs108|chr8             (937 aa)
 initn: 1641 init1: 554 opt: 1603  Z-score: 2001.2  bits: 381.5 E(32554): 3.8e-105
Smith-Waterman score: 1767; 37.5% identity (65.9% similar) in 779 aa overlap (83-852:204-937)

             60        70        80        90       100       110  
pF1KE2 STNDKYGISSGDAGSTFMERGVKNKQDFMDLSICTREKLAHVRNCKTGSSGIPVKLVTNL
                                     :..  .::   :   : ::.: : .:  ::
CCDS83 FSTPSRGPPQLSSPPALPQSPLHSPDRPLVLTVEHKEKELIV---KQGSKGTPQSLGLNL
           180       190       200       210          220       230

            120       130       140       150       160       170  
pF1KE2 FNLDFPQDWQLYQYHVTYIPDLASRRLRIALLYSHSELSNKAKAFDGAILFLSQKLEEKV
        ...  ..  .::::::. :..  . .:...: .:. ..... ::::.::.:  ::.. :
CCDS83 VKIQC-HNEAVYQYHVTFSPNVECKSMRFGMLKDHQAVTGNVTAFDGSILYLPVKLQQ-V
               240       250       260       270       280         

            180        190       200       210       220       230 
pF1KE2 TELSSETQRGET-IKMTITLKRELPSSSPVCIQVFNIIFRKILKKLSMYQIGRNFYNPSE
        ::.:. .   . :.. : . . :   : .::  .:..::...: :.:  .:::::.:. 
CCDS83 LELKSQRKTDSAEISIKIQMTKILEPCSDLCIPFYNVVFRRVMKLLDMKLVGRNFYDPTS
      290       300       310       320       330       340        

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE2 PMEIPQHKLSLWPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVLRNETVLEFMTALCQRTGLSCFTQ
        : . ::.:..:::.: :.   .  :.. ::::.::.::. ::. : :. :..    : .
CCDS83 AMVLQQHRLQIWPGYAASIRRTDGGLFLLADVSHKVIRNDCVLDVMHAIYQQNK-EHFQD
      350       360       370       380       390       400        

             300       310       320       330       340       350 
pF1KE2 TCEKQLIGLIVLTRYNNRTYSIDDIDWSVKPTHTFQKRDGTEITYVDYYKQQYDITVSDL
        : : :.: ::.:::::::: :::.::.  :  .:   :: :::...::...: :::.. 
CCDS83 ECTKLLVGNIVITRYNNRTYRIDDVDWNKTPKDSFTMSDGKEITFLEYYSKNYGITVKEE
       410       420       430       440       450       460       

             360       370          380       390       400        
pF1KE2 NQPMLVSLLKKKRNDNSEAQLAH---LIPELCFLTGLTDQATSDFQLMKAVAEKTRLSPS
       .::.:.    ..:.::    :     :.::: :.::. ..  .::. :: .:..  :::.
CCDS83 DQPLLIHR-PSERQDNHGMLLKGEILLLPELSFMTGIPEKMKKDFRAMKDLAQQINLSPK
       470        480       490       500       510       520      

      410       420       430       440        450       460       
pF1KE2 GRQQRLARLVDNIQRNTNARFELETWGLHFGSQI-SLTGRIVPSEKILMQDHICQPVSAA
        ... :  :.. : .:  :  ::  :::.. ... .. ::..: :.: ...      .  
CCDS83 QHHSALECLLQRIAKNEAATNELMRWGLRLQKDVHKIEGRVLPMERINLKNTSFITSQEL
        530       540       550       560       570       580      

       470        480       490       500       510       520      
pF1KE2 DWSKDI-RTCKILNAQSLNTWLILCSDRTEYVAESFLNCLRRVAGSMGFNVDYPKIIKVQ
       .: :.. :  .::.   .. : ..   :.   :. ..: :...:: .:. .. :  ....
CCDS83 NWVKEVTRDPSILTIP-MHFWALFYPKRAMDQARELVNMLEKIAGPIGMRMSPPAWVELK
        590       600        610       620       630       640     

        530        540         550       560       570       580   
pF1KE2 ENPA-AFVRAIQQYVDPD--VQLVMCILPSNQKTYYDSIKKYLSSDCPVPSQCVLARTLN
       ..   ..::.::. .  .  .:.:.::. . .   : .:::    . ::::: : .::..
CCDS83 DDRIETYVRTIQSTLGAEGKIQMVVCIIMGPRDDLYGAIKKLCCVQSPVPSQVVNVRTIG
         650       660       670       680       690       700     

           590       600       610       620       630       640   
pF1KE2 KQGMMMSIATKIAMQMTCKLGGELWAVEIPLKSLMVVGIDVCKDALSKDVMVVGCVASVN
       .   . :.: :: .:..::::::::.:.::::.:::.:.:: .:       ::: :::.:
CCDS83 QPTRLRSVAQKILLQINCKLGGELWGVDIPLKQLMVIGMDVYHDPSRGMRSVVGFVASIN
         710       720       730       740       750       760     

           650       660       670       680       690       700   
pF1KE2 PRITRWFSRCILQRTMTDVADCLKVFMTGALNKWYKYNHDLPARIIVYRAGVGDGQLKTL
         .:.:.:: ..:    ...: ::. ..:.:.:.:. :: :: .:.::: ::.::::::.
CCDS83 LTLTKWYSRVVFQMPHQEIVDSLKLCLVGSLKKFYEVNHCLPEKIVVYRDGVSDGQLKTV
         770       780       790       800       810       820     

           710       720       730       740       750       760   
pF1KE2 IEYEVPQLLSSVAESSSNTSSRLSVIVVRKKCMPRFFTEMNRTVQNPPLGTVVDSEATRN
        .::.::: ..  :.  : . .. :.::.::    ..    ..  .:  :::::   :  
CCDS83 ANYEIPQL-QKCFEAFENYQPKMVVFVVQKKISTNLYLAAPQNFVTPTPGTVVDHTITSC
         830        840       850       860       870       880    

           770       780       790       800       810       820   
pF1KE2 EWYDFYLISQVACRGTVSPTYYNVIYDDNGLKPDHMQRLTFKLCHLYYNWPGIVSVPAPC
       ::                                    :::::::.:.:::: . :::::
CCDS83 EW------------------------------------LTFKLCHMYWNWPGTIRVPAPC
                                              890       900        

           830       840       850  
pF1KE2 QYAHKLTFLVAQSIHKEPSLELANHLFYL
       .:::::.:: .. .:.::...: ..::.:
CCDS83 KYAHKLAFLSGHILHHEPAIQLCENLFFL
      910       920       930       

>>CCDS33623.1 PIWIL3 gene_id:440822|Hs108|chr22           (882 aa)
 initn: 1432 init1: 561 opt: 1454  Z-score: 1814.8  bits: 346.9 E(32554): 9.1e-95
Smith-Waterman score: 2193; 39.5% identity (69.7% similar) in 887 aa overlap (1-852:1-882)

               10                         20        30             
pF1KE2 MSGRARVKARGIAR--------SP-------SAT--EVGRIQASPLPRSVDLSN----NE
       : ::::..::: ::        .:       :::  :  ..:..: : . ..      . 
CCDS33 MPGRARTRARGRARRRESYQQEAPGGPRAPGSATTQEPPQLQSTPRPLQEEVPVVRPLQP
               10        20        30        40        50        60

      40        50        60        70        80        90         
pF1KE2 ASSSNGFLGTSRISTNDKYGISSGDAGSTFMERGVKNKQDFMDLSICTREKLAHVRNCKT
        .. .:  : .. .   . :  .:   . ..:: . .   :.:: . ::. . ::.. ::
CCDS33 RAARGGAGGGAQSQGVKEPGPEAGLHTAPLQERRIGGV--FQDLVVNTRQDMKHVKDSKT
               70        80        90         100       110        

     100       110        120       130       140       150        
pF1KE2 GSSGIPVKLVTNLFN-LDFPQDWQLYQYHVTYIPDLASRRLRIALLYSHSELSNKAKAFD
       :: :  :.:..: :  .. :: :  :.:.: : ::. .  ::  :: .: .  .. . ::
CCDS33 GSEGTVVQLLANHFRVISRPQ-WVAYKYNVDYKPDIEDGNLRTILLDQHRRKFGERHIFD
      120       130        140       150       160       170       

      160       170       180       190       200       210        
pF1KE2 GAILFLSQKLEEKVTELSSETQRGETIKMTITLKRELPSSSPVCIQVFNIIFRKILKKLS
       :  :.::. :.:. .:  : :.  . .:.:. ...::  .:: :.. .::.::. .: :.
CCDS33 GNSLLLSRPLKERRVEWLSTTKDKNIVKITVEFSKELTPTSPDCLRYYNILFRRTFKLLD
       180       190       200       210       220       230       

      220       230       240         250       260       270      
pF1KE2 MYQIGRNFYNPSEPMEIPQHKLSL--WPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVLRNETVLEF
       . :.:::.:. .. ... .:  ::  : :.. ::  .: .. . ::::.:.:: ::. .:
CCDS33 FEQVGRNYYTKKKAIQLYRHGTSLEIWLGYVTSVLQYENSITLCADVSHKLLRIETAYDF
       240       250       260       270       280       290       

        280       290       300       310       320       330      
pF1KE2 MTALCQRTGLSCFTQTCEKQLIGLIVLTRYNNRTYSIDDIDWSVKPTHTFQKRDGTEITY
       .     ..  . . .   ..::: ::::.:::.:: .:::::. .:  ::.: ::..:::
CCDS33 IKRTSAQAQTGNIREEVTNKLIGSIVLTKYNNKTYRVDDIDWKQNPEDTFNKSDGSKITY
       300       310       320       330       340       350       

        340       350       360        370       380       390     
pF1KE2 VDYYKQQYDITVSDLNQPMLVSLLKKKRN-DNSEAQLAHLIPELCFLTGLTDQATSDFQL
       .:::.::.   :.  .::.:::  . :..  ... .   :::.:: .:::::.  .:...
CCDS33 IDYYRQQHKEIVTVKKQPLLVSQGRWKKGLTGTQREPILLIPQLCHMTGLTDEICKDYSI
       360       370       380       390       400       410       

         400       410       420       430       440        450    
pF1KE2 MKAVAEKTRLSPSGRQQRLARLVDNIQRNTNARFELETWGLHFGSQ-ISLTGRIVPSEKI
       .: .:..:::::  :.. : ......: : ..:  :. : :.: .. .:. ::.. . .:
CCDS33 VKELAKHTRLSPRRRHHTLKEFINTLQDNKKVRELLQLWDLKFDTNFLSVPGRVLKNANI
       420       430       440       450       460       470       

          460       470       480       490       500       510    
pF1KE2 LMQDHICQPVSAADWSKDIRTCKILNAQSLNTWLILCSDRTEYVAESFLNCLRRVAGSMG
       ..  .. .  : .:::..::   .:::. :..:::: :  ..  : :. . :. :.. ::
CCDS33 VQGRRMVKANSQGDWSREIRELPLLNAMPLHSWLILYSRSSHREAMSLKGHLQSVTAPMG
       480       490       500       510       520       530       

          520       530       540                550       560     
pF1KE2 FNVDYPKIIKVQENPAAFVRAIQQYVDPDVQL---------VMCILPSNQKTYYDSIKKY
       ...   ..:.:. .  ... ....:. : .:.         :.::::...:  :::::.:
CCDS33 ITMKPAEMIEVDGDANSYIDTLRKYTRPTLQMGMSCLLVFKVICILPNDDKRRYDSIKRY
       540       550       560       570       580       590       

         570       580       590       600       610       620     
pF1KE2 LSSDCPVPSQCVLARTLNKQGMMMSIATKIAMQMTCKLGGELWAVEIPLKSLMVVGIDVC
       : . ::.:::::. .::.:  .  .:.::::.::.::.:: :: ::  ..  : ::::  
CCDS33 LCTKCPIPSQCVVKKTLEKV-QARTIVTKIAQQMNCKMGGALWKVETDVQRTMFVGIDCF
       600       610        620       630       640       650      

         630       640       650       660       670       680     
pF1KE2 KDALSKDVMVVGCVASVNPRITRWFSRCILQRTMTDVADCLKVFMTGALNKWYKYNHDLP
       .: ....  ..: :::.: ..:.:.:.:..:.:  ...  :.. . .::. : : . ..:
CCDS33 HDIVNRQKSIAGFVASTNAELTKWYSQCVIQKTGEELVKELEICLKAALDVWCKNESSMP
        660       670       680       690       700       710      

         690       700       710       720       730       740     
pF1KE2 ARIIVYRAGVGDGQLKTLIEYEVPQLLSSVAESSSNTSSRLSVIVVRKKCMPRFFTEMNR
         .:::: :::::::..:...:. .. :.  .. : ..  :. :::.:.   ::: . . 
CCDS33 HSVIVYRDGVGDGQLQALLDHEAKKM-STYLKTISPNNFTLAFIVVKKRINTRFFLKHGS
        720       730       740        750       760       770     

         750       760       770       780       790       800     
pF1KE2 TVQNPPLGTVVDSEATRNEWYDFYLISQVACRGTVSPTYYNVIYDDNGLKPDHMQRLTFK
       . :::: :::.: : ::::::::...:: .  :::.::.::::::  ::.:: .::::. 
CCDS33 NFQNPPPGTVIDVELTRNEWYDFFIVSQSVQDGTVTPTHYNVIYDTIGLSPDTVQRLTYC
         780       790       800       810       820       830     

         810       820       830       840       850  
pF1KE2 LCHLYYNWPGIVSVPAPCQYAHKLTFLVAQSIHKEPSLELANHLFYL
       :::.::: :::. :::::.:::::..::.::::.::.  :...::::
CCDS33 LCHMYYNLPGIIRVPAPCHYAHKLAYLVGQSIHQEPNRSLSTRLFYL
         840       850       860       870       880  

>>CCDS400.1 AGO3 gene_id:192669|Hs108|chr1                (626 aa)
 initn: 427 init1: 254 opt: 383  Z-score: 474.5  bits: 98.4 E(32554): 4.2e-20
Smith-Waterman score: 548; 24.7% identity (57.0% similar) in 567 aa overlap (295-831:27-578)

          270       280       290       300          310       320 
pF1KE2 YKVLRNETVLEFMTALCQRTGLSCFTQTCEKQLIGLIVLTRYNN---RTYSIDDIDWSVK
                                     :.. :: : . . .   : : . ..     
CCDS40     MCEVLDIHNIDEQPRPLTDSHRVKFTKEIKGLKVEVTHCGTMRRKYRVCNVTRRPA
                   10        20        30        40        50      

               330         340       350       360       370       
pF1KE2 PTHTF--QKRDGTEI--TYVDYYKQQYDITVSDLNQPMLVSLLKKKRNDNSEAQLAHLIP
         .::  : ..:  .  : ..:....: . ..  . : : .. .....     .. ... 
CCDS40 SHQTFPLQLENGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYPHLPCL-QVGQEQKHTYLPLEVCNIVA
         60        70        80        90        100       110     

       380       390       400       410       420       430       
pF1KE2 ELCFLTGLTDQATSDFQLMKAVAEKTRLSPSGRQQRLARLVDNIQRNTNARFELETWGLH
           .  :::. ::   ..::.:   : .:. ::....::: . . .:.  :  :     
CCDS40 GQRCIKKLTDNQTST--MIKATA---RSAPD-RQEEISRLVRSANYETDP-FVQEFQFKV
         120       130            140        150        160        

       440       450         460       470       480       490     
pF1KE2 FGSQISLTGRIVPSEKILM--QDHICQPVSAADWSKDIRTCKILNAQSLNTWLILC--SD
          .  .:::..:.  . .  ...     : . :  :.:  .. ..  .. : : :  ..
CCDS40 RDEMAHVTGRVLPAPMLQYGGRNRTVATPSHGVW--DMRGKQFHTGVEIKMWAIACFATQ
      170       180       190       200         210       220      

             500       510        520       530       540          
pF1KE2 RT--EYVAESFLNCLRRVAGSMGFNVD-YPKIIKVQENPAAFVRAIQQYVD---PDVQLV
       :   : . ..: . ::... . :. ..  : . :  .. :  :. . ...      .::.
CCDS40 RQCREEILKGFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQG-ADSVEPMFRHLKNTYSGLQLI
        230       240       250       260        270       280     

       550       560       570       580       590       600       
pF1KE2 MCILPSNQKTYYDSIKKYLSSDCPVPSQCVLARTLNKQGMMMSIATKIAMQMTCKLGGEL
       . :::..  .: . .:.  ..   . .::: .... : . .    ... .... :::: .
CCDS40 IVILPGKTPVYAE-VKRVGDTLLGMATQCVQVKNVIKTSPQ--TLSNLCLKINVKLGG-I
         290        300       310       320         330       340  

       610              620       630         640       650        
pF1KE2 WAVEIP-------LKSLMVVGIDVCKDALS--KDVMVVGCVASVNPRITRWFSRCILQRT
         . .:        . .. .: :: .   .  :   ... :.:.. . .:. .   .:: 
CCDS40 NNILVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRP
             350       360       370       380       390       400 

      660       670       680       690       700       710        
pF1KE2 MTDVADCLKVFMTGALNKWYKYNHDLPARIIVYRAGVGDGQLKTLIEYEVPQLLSSVAES
         .. . :  ..   : ..:: ..  :.::: :: ::..::.. .. ::.  .  .    
CCDS40 RQEIIQDLASMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFRQVLYYELLAIREACISL
             410       420       430       440       450       460 

      720       730       740           750       760       770    
pF1KE2 SSNTSSRLSVIVVRKKCMPRFF----TEMNRTVQNPPLGTVVDSEATRNEWYDFYLISQV
        .. .  .. :::.:.   :.:    ::      : : ::.::.. :.   .:::: :..
CCDS40 EKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADRTERVGRSGNIPAGTTVDTDITHPYEFDFYLCSHA
             470       480       490       500       510       520 

          780       790       800       810       820       830    
pF1KE2 ACRGTVSPTYYNVIYDDNGLKPDHMQRLTFKLCHLYYNWPGIVSVPAPCQYAHKLTFLVA
       . .::  :..:.:..::: .  :..: ::..::: :      ::.:::  ::: ..:   
CCDS40 GIQGTSRPSHYHVLWDDNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRAR
             530       540       550       560       570       580 

          840       850                             
pF1KE2 QSIHKEPSLELANHLFYL                           
                                                    
CCDS40 YHLVDKEHDSAEGSHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHQDTLRTMYFA
             590       600       610       620      

>>CCDS399.1 AGO3 gene_id:192669|Hs108|chr1                (860 aa)
 initn: 436 init1: 254 opt: 383  Z-score: 472.2  bits: 98.4 E(32554): 5.6e-20
Smith-Waterman score: 661; 23.4% identity (54.7% similar) in 806 aa overlap (100-831:24-812)

      70        80        90       100       110       120         
pF1KE2 MERGVKNKQDFMDLSICTREKLAHVRNCKTGSSGIPVKLVTNLFNLDFPQDWQLYQYHVT
                                     :. : :.::..: :....:.  ..: :.: 
CCDS39        MEIGSAGPAGAQPLLMVPRRPGYGTMGKPIKLLANCFQVEIPK-IDVYLYEVD
                      10        20        30        40         50  

     130       140          150          160        170            
pF1KE2 YIPDLASRRLR---IALLYSHSELS---NKAKAFDGA-ILFLSQKLEEKVT------ELS
         ::   ::.    .  . .: ...   ..  ..::   :. .. :   .:       : 
CCDS39 IKPDKCPRRVNREVVDSMVQHFKVTIFGDRRPVYDGKRSLYTANPLPVATTGVDLDVTLP
             60        70        80        90       100       110  

        180                         190       200          210     
pF1KE2 SETQRGETIKMTI------------------TLKRELPSSSPVC---IQVFNIIFRKILK
       .:  . . .:..:                  :: . :  ..:.    ... ....:. : 
CCDS39 GEGGKDRPFKVSIKFVSRVSWHLLHEVLTGRTLPEPLELDKPISTNPVHAVDVVLRH-LP
            120       130       140       150       160        170 

         220       230        240       250       260        270   
pF1KE2 KLSMYQIGRNFYNPSEPMEIPQHK-LSLWPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVL-RNETV
       ....  .::.:..  : .. :      .: ::  ::     :.... :::  .. . . :
CCDS39 SMKYTPVGRSFFSAPEGYDHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPV
             180       190       200       210       220       230 

           280               290       300          310       320  
pF1KE2 LEFMTALCQ--------RTGLSCFTQTCEKQLIGLIVLTRYNN---RTYSIDDIDWSVKP
       ..::  . .        :   .       :.. :: : . . .   : : . ..      
CCDS39 IQFMCEVLDIHNIDEQPRPLTDSHRVKFTKEIKGLKVEVTHCGTMRRKYRVCNVTRRPAS
             240       250       260       270       280       290 

              330         340       350       360       370        
pF1KE2 THTF--QKRDGTEI--TYVDYYKQQYDITVSDLNQPMLVSLLKKKRNDNSEAQLAHLIPE
        .::  : ..:  .  : ..:....: . ..  . : : .. .....     .. ...  
CCDS39 HQTFPLQLENGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYPHLPCL-QVGQEQKHTYLPLEVCNIVAG
             300       310       320        330       340       350

      380       390       400       410       420       430        
pF1KE2 LCFLTGLTDQATSDFQLMKAVAEKTRLSPSGRQQRLARLVDNIQRNTNARFELETWGLHF
          .  :::. ::   ..::.:   : .:. ::....::: . . .:.  :  :      
CCDS39 QRCIKKLTDNQTS--TMIKATA---RSAPD-RQEEISRLVRSANYETDP-FVQEFQFKVR
              360         370           380       390        400   

      440       450         460       470       480       490      
pF1KE2 GSQISLTGRIVPSEKILM--QDHICQPVSAADWSKDIRTCKILNAQSLNTWLILC--SDR
         .  .:::..:.  . .  ...     : . :  :.:  .. ..  .. : : :  ..:
CCDS39 DEMAHVTGRVLPAPMLQYGGRNRTVATPSHGVW--DMRGKQFHTGVEIKMWAIACFATQR
           410       420       430         440       450       460 

            500       510        520       530       540           
pF1KE2 T--EYVAESFLNCLRRVAGSMGFNVD-YPKIIKVQENPAAFVRAIQQYVD---PDVQLVM
          : . ..: . ::... . :. ..  : . :  .. :  :. . ...      .::..
CCDS39 QCREEILKGFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQG-ADSVEPMFRHLKNTYSGLQLII
             470       480       490        500       510       520

      550       560       570       580       590       600        
pF1KE2 CILPSNQKTYYDSIKKYLSSDCPVPSQCVLARTLNKQGMMMSIATKIAMQMTCKLGGELW
        :::..  .: . .:.  ..   . .::: .... : . .    ... .... :::: . 
CCDS39 VILPGKTPVYAE-VKRVGDTLLGMATQCVQVKNVIKTSPQ--TLSNLCLKINVKLGG-IN
              530        540       550         560       570       

      610              620       630         640       650         
pF1KE2 AVEIP-------LKSLMVVGIDVCKDALS--KDVMVVGCVASVNPRITRWFSRCILQRTM
        . .:        . .. .: :: .   .  :   ... :.:.. . .:. .   .::  
CCDS39 NILVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPR
        580       590       600       610       620       630      

     660       670       680       690       700       710         
pF1KE2 TDVADCLKVFMTGALNKWYKYNHDLPARIIVYRAGVGDGQLKTLIEYEVPQLLSSVAESS
        .. . :  ..   : ..:: ..  :.::: :: ::..::.. .. ::.  .  .     
CCDS39 QEIIQDLASMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFRQVLYYELLAIREACISLE
        640       650       660       670       680       690      

     720       730       740           750       760       770     
pF1KE2 SNTSSRLSVIVVRKKCMPRFF----TEMNRTVQNPPLGTVVDSEATRNEWYDFYLISQVA
       .. .  .. :::.:.   :.:    ::      : : ::.::.. :.   .:::: :...
CCDS39 KDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADRTERVGRSGNIPAGTTVDTDITHPYEFDFYLCSHAG
        700       710       720       730       740       750      

         780       790       800       810       820       830     
pF1KE2 CRGTVSPTYYNVIYDDNGLKPDHMQRLTFKLCHLYYNWPGIVSVPAPCQYAHKLTFLVAQ
        .::  :..:.:..::: .  :..: ::..::: :      ::.:::  ::: ..:    
CCDS39 IQGTSRPSHYHVLWDDNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARY
        760       770       780       790       800       810      

         840       850                             
pF1KE2 SIHKEPSLELANHLFYL                           
                                                   
CCDS39 HLVDKEHDSAEGSHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHQDTLRTMYFA
        820       830       840       850       860

>>CCDS6380.1 AGO2 gene_id:27161|Hs108|chr8                (859 aa)
 initn: 410 init1: 242 opt: 379  Z-score: 467.2  bits: 97.5 E(32554): 1.1e-19
Smith-Waterman score: 679; 24.8% identity (57.4% similar) in 800 aa overlap (100-831:32-811)

      70        80        90       100       110       120         
pF1KE2 MERGVKNKQDFMDLSICTREKLAHVRNCKTGSSGIPVKLVTNLFNLDFPQDWQLYQYHVT
                                     :.::  .:: .:.:..:.:.  ..:.:.. 
CCDS63 YSGAGPALAPPAPPPPIQGYAFKPPPRPDFGTSGRTIKLQANFFEMDIPK-IDIYHYELD
              10        20        30        40        50         60

     130       140             150        160          170         
pF1KE2 YIPDLASRRLR---IALLYSHSE---LSNKAKAFDG-AILFLSQKL---EEKVTELSSET
         :.   ::.    .  . .: .   ....  .:::   :. .. :   ..::    .  
CCDS63 IKPEKCPRRVNREIVEHMVQHFKTQIFGDRKPVFDGRKNLYTAMPLPIGRDKVELEVTLP
               70        80        90       100       110       120

     180                      190       200       210       220    
pF1KE2 QRGET--IKMTI-------------TLKRELPSSSPVCIQVFNIIFRKILKKLSMYQIGR
        .:.   .:..:             .:. .:::     ::......:. : .. .  .::
CCDS63 GEGKDRIFKVSIKWVSCVSLQALHDALSGRLPSVPFETIQALDVVMRH-LPSMRYTPVGR
              130       140       150       160        170         

          230        240       250       260        270       280  
pF1KE2 NFYNPSEPMEIPQHK-LSLWPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVL-RNETVLEFMTALC-
       .:.. ::    :      .: ::  ::     :.... :::  .. . . :.::.  .  
CCDS63 SFFTASEGCSNPLGGGREVWFGFHQSVRPSLWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIEFVCEVLD
     180       190       200       210       220       230         

                   290         300          310       320          
pF1KE2 ------QRTGLSCFTQTCE--KQLIGLIVLTRYNN---RTYSIDDIDWSVKPTHTF--QK
             :.  :.  .:  .  :.. :: :   . .   : : . ..       .::  :.
CCDS63 FKSIEEQQKPLTD-SQRVKFTKEIKGLKVEITHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQQ
     240       250        260       270       280       290        

      330         340       350       360       370       380      
pF1KE2 RDG--TEITYVDYYKQQYDITVSDLNQPMLVSLLKKKRNDNSEAQLAHLIPELCFLTGLT
       ..:  .: : ..:.:... ...   . : : .. .....     .. ...     .  ::
CCDS63 ESGQTVECTVAQYFKDRHKLVLRYPHLPCL-QVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLT
      300       310       320        330       340       350       

        390       400       410       420       430       440      
pF1KE2 DQATSDFQLMKAVAEKTRLSPSGRQQRLARLVDNIQRNTNARFELETWGLHFGSQIS-LT
       :. ::   ...:.:   : .:. ::.....:. . . ::.    .. .:.   .... .:
CCDS63 DNQTS--TMIRATA---RSAPD-RQEEISKLMRSASFNTDPY--VREFGIMVKDEMTDVT
       360            370        380       390         400         

         450          460       470       480       490            
pF1KE2 GRIVPSEKILMQDH---ICQPVSAADWSKDIRTCKILNAQSLNTWLILC--SDR--TEYV
       ::..   .::.  .   :  ::... :  :.:. .. ..  ...: : :   .:  ::  
CCDS63 GRVLQPPSILYGGRNKAIATPVQGV-W--DMRNKQFHTGIEIKVWAIACFAPQRQCTEVH
     410       420       430          440       450       460      

      500       510        520       530       540          550    
pF1KE2 AESFLNCLRRVAGSMGFNVD-YPKIIKVQENPAAFVRAIQQYVD---PDVQLVMCILPSN
        .:: . ::... . :. ..  : . :  .. :  :. . ...      .:::. :::..
CCDS63 LKSFTEQLRKISRDAGMPIQGQPCFCKYAQG-ADSVEPMFRHLKNTYAGLQLVVVILPGK
        470       480       490        500       510       520     

          560       570       580       590       600       610    
pF1KE2 QKTYYDSIKKYLSSDCPVPSQCVLARTLNKQGMMMSIATKIAMQMTCKLGGELWAVEIPL
         .: . .:.  ..   . .:::  .  : :    .  ... .... :::: .  . .: 
CCDS63 TPVYAE-VKRVGDTVLGMATQCVQMK--NVQRTTPQTLSNLCLKINVKLGG-VNNILLPQ
         530        540       550         560       570        580 

                 620       630         640       650       660     
pF1KE2 -------KSLMVVGIDVCKDALS--KDVMVVGCVASVNPRITRWFSRCILQRTMTDVADC
              . .. .: :: .   .  :   ... :.:.. . .:. .   .:.   .. . 
CCDS63 GRPPVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPNRYCATVRVQQHRQEIIQD
             590       600       610       620       630       640 

         670       680       690       700       710       720     
pF1KE2 LKVFMTGALNKWYKYNHDLPARIIVYRAGVGDGQLKTLIEYEVPQLLSSVAESSSNTSSR
       : ...   : ..:: ..  :.::: :: ::..::.. ....:.  .  .  .  .. .  
CCDS63 LAAMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFQQVLHHELLAIREACIKLEKDYQPG
             650       660       670       680       690       700 

         730       740           750       760       770       780 
pF1KE2 LSVIVVRKKCMPRFF-TEMNRTVQ---NPPLGTVVDSEATRNEWYDFYLISQVACRGTVS
       .. :::.:.   :.: :. :. :    : : ::.::.. :.   .:::: :... .::  
CCDS63 ITFIVVQKRHHTRLFCTDKNERVGKSGNIPAGTTVDTKITHPTEFDFYLCSHAGIQGTSR
             710       720       730       740       750       760 

             790       800       810       820       830       840 
pF1KE2 PTYYNVIYDDNGLKPDHMQRLTFKLCHLYYNWPGIVSVPAPCQYAHKLTFLVAQSIHKEP
       :..:.:..::: .. :..: ::..::: :      ::.:::  ::: ..:          
CCDS63 PSHYHVLWDDNRFSSDELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKE
             770       780       790       800       810       820 

             850                             
pF1KE2 SLELANHLFYL                           
                                             
CCDS63 HDSAEGSHTSGQSNGRDHQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
             830       840       850         

>>CCDS81300.1 AGO1 gene_id:26523|Hs108|chr1               (782 aa)
 initn: 414 init1: 225 opt: 374  Z-score: 461.6  bits: 96.3 E(32554): 2.2e-19
Smith-Waterman score: 646; 24.7% identity (58.6% similar) in 671 aa overlap (203-831:82-734)

            180       190       200       210       220       230  
pF1KE2 TELSSETQRGETIKMTITLKRELPSSSPVCIQVFNIIFRKILKKLSMYQIGRNFYNPSEP
                                     .:.... .:. : .. .  .::.:..: : 
CCDS81 KVSIKWLAIVSWRMLHEALVSGQIPVPLESVQALDVAMRH-LASMRYTPVGRSFFSPPEG
              60        70        80        90        100       110

             240       250       260        270       280          
pF1KE2 MEIPQHK-LSLWPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVL-RNETVLEFMTALCQRTGLSC--
       .  :      .: ::  ::     :.... :::  .. . . :.:::  . .  ...   
CCDS81 YYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIEFMCEVLDIRNIDEQP
              120       130       140       150       160       170

        290           300          310       320         330       
pF1KE2 --FTQTCE----KQLIGLIVLTRYNN---RTYSIDDIDWSVKPTHTF--QKRDG--TEIT
         .:.. .    :.. :: : . . .   : : . ..       .::  : ..:  .: :
CCDS81 KPLTDSQRVRFTKEIKGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLESGQTVECT
              180       190       200       210       220       230

         340       350       360       370       380       390     
pF1KE2 YVDYYKQQYDITVSDLNQPMLVSLLKKKRNDNSEAQLAHLIPELCFLTGLTDQATSDFQL
        ..:.::.:.. ..  . : : .. .....     .. ...     .  :::. ::   .
CCDS81 VAQYFKQKYNLQLKYPHLPCL-QVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTS--TM
              240       250        260       270       280         

         400       410       420       430       440        450    
pF1KE2 MKAVAEKTRLSPSGRQQRLARLVDNIQRNTNARFELETWGLHFGSQIS-LTGRIVPSEKI
       .::.:   : .:. ::....::. : . : .    .. .:..  .... .:::..:.  :
CCDS81 IKATA---RSAPD-RQEEISRLMKNASYNLDPY--IQEFGIKVKDDMTEVTGRVLPAP-I
       290           300       310         320       330        340

          460          470       480       490           500       
pF1KE2 LMQDHICQPVSAAD---WSKDIRTCKILNAQSLNTWLILC----SDRTEYVAESFLNCLR
       :.     . ... .   :  :.:  .. :.  ...: : :    ..  : : ..: . ::
CCDS81 LQYGGRNRAIATPNQGVW--DMRGKQFYNGIEIKVWAIACFAPQKQCREEVLKNFTDQLR
              350         360       370       380       390        

       510        520       530       540          550       560   
pF1KE2 RVAGSMGFNVD-YPKIIKVQENPAAFVRAIQQYVD---PDVQLVMCILPSNQKTYYDSIK
       ... . :. ..  : . :  .. :  :. . ...      .::.. :::..  .: . .:
CCDS81 KISKDAGMPIQGQPCFCKYAQG-ADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAE-VK
      400       410       420        430       440       450       

           570       580       590       600       610             
pF1KE2 KYLSSDCPVPSQCVLARTLNKQGMMMSIATKIAMQMTCKLGGELWAVEIP-------LKS
       .  ..   . .::: .... : . .    ... .... :::: .  . .:        . 
CCDS81 RVGDTLLGMATQCVQVKNVVKTSPQT--LSNLCLKINVKLGG-INNILVPHQRSAVFQQP
        460       470       480         490        500       510   

        620       630         640       650       660       670    
pF1KE2 LMVVGIDVCKDALS--KDVMVVGCVASVNPRITRWFSRCILQRTMTDVADCLKVFMTGAL
       .. .: :: .   .  :   ... :.:.. . .:. .   .::   .. . :. ..   :
CCDS81 VIFLGADVTHPPAGDGKKPSITAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIEDLSYMVRELL
           520       530       540       550       560       570   

          680       690       700       710       720       730    
pF1KE2 NKWYKYNHDLPARIIVYRAGVGDGQLKTLIEYEVPQLLSSVAESSSNTSSRLSVIVVRKK
        ..:: ..  :.::: :: :: .:::  ...::.  . ..  .  .. .  .. :::.:.
CCDS81 IQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVPEGQLPQILHYELLAIRDACIKLEKDYQPGITYIVVQKR
           580       590       600       610       620       630   

          740           750       760       770       780       790
pF1KE2 CMPRFF-TEMNRTVQ---NPPLGTVVDSEATRNEWYDFYLISQVACRGTVSPTYYNVIYD
          :.: .. :. .    : : ::.::.. :.   .:::: :... .::  :..: :..:
CCDS81 HHTRLFCADKNERIGKSGNIPAGTTVDTNITHPFEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYYVLWD
           640       650       660       670       680       690   

              800       810       820       830       840       850
pF1KE2 DNGLKPDHMQRLTFKLCHLYYNWPGIVSVPAPCQYAHKLTFLVAQSIHKEPSLELANHLF
       :: .  :..: ::..::: :      ::.:::  ::. ..:                   
CCDS81 DNRFTADELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKEHDSGEGSHI
           700       710       720       730       740       750   

                                    
pF1KE2 YL                           
                                    
CCDS81 SGQSNGRDPQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
           760       770       780  

>>CCDS398.1 AGO1 gene_id:26523|Hs108|chr1                 (857 aa)
 initn: 414 init1: 225 opt: 374  Z-score: 460.9  bits: 96.3 E(32554): 2.4e-19
Smith-Waterman score: 708; 24.5% identity (58.1% similar) in 801 aa overlap (100-831:30-809)

      70        80        90       100       110       120         
pF1KE2 MERGVKNKQDFMDLSICTREKLAHVRNCKTGSSGIPVKLVTNLFNLDFPQDWQLYQYHVT
                                     :. : :.::..: :..:.:.  ..:.:.: 
CCDS39  MEAGPSGAAAGAYLPPLQQVFQAPRRPGIGTVGKPIKLLANYFEVDIPK-IDVYHYEVD
                10        20        30        40         50        

     130       140             150               160       170     
pF1KE2 YIPDLASRRLR---IALLYSHSE---LSNKAKAFDG--------AILFLSQKLEEKVTEL
         ::   ::.    .  . .: .   ....  ..::        :. . ..... .:: .
CCDS39 IKPDKCPRRVNREVVEYMVQHFKPQIFGDRKPVYDGKKNIYTVTALPIGNERVDFEVT-I
       60        70        80        90       100       110        

         180       190                 200          210       220  
pF1KE2 SSETQRGETIKMTIT---------LKRELPSSS-PV---CIQVFNIIFRKILKKLSMYQI
        .:  . . .:..:          :.. : :.. ::    .:.... .:. : .. .  .
CCDS39 PGEG-KDRIFKVSIKWLAIVSWRMLHEALVSGQIPVPLESVQALDVAMRH-LASMRYTPV
       120        130       140       150       160        170     

            230        240       250       260        270       280
pF1KE2 GRNFYNPSEPMEIPQHK-LSLWPGFAISVSYFERKLLFSADVSYKVL-RNETVLEFMTAL
       ::.:..: : .  :      .: ::  ::     :.... :::  .. . . :.:::  .
CCDS39 GRSFFSPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIEFMCEV
         180       190       200       210       220       230     

                  290           300          310       320         
pF1KE2 CQRTGLSC----FTQTCE----KQLIGLIVLTRYNN---RTYSIDDIDWSVKPTHTF--Q
        .  ...     .:.. .    :.. :: : . . .   : : . ..       .::  :
CCDS39 LDIRNIDEQPKPLTDSQRVRFTKEIKGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQ
         240       250       260       270       280       290     

       330         340       350       360       370       380     
pF1KE2 KRDG--TEITYVDYYKQQYDITVSDLNQPMLVSLLKKKRNDNSEAQLAHLIPELCFLTGL
        ..:  .: : ..:.::.:.. ..  . : : .. .....     .. ...     .  :
CCDS39 LESGQTVECTVAQYFKQKYNLQLKYPHLPCL-QVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKL
         300       310       320        330       340       350    

         390       400       410       420       430       440     
pF1KE2 TDQATSDFQLMKAVAEKTRLSPSGRQQRLARLVDNIQRNTNARFELETWGLHFGSQIS-L
       ::. ::   ..::.:   : .:. ::....::. : . : .    .. .:..  .... .
CCDS39 TDNQTS--TMIKATA---RSAPD-RQEEISRLMKNASYNLDPY--IQEFGIKVKDDMTEV
          360            370        380       390         400      

          450       460          470       480       490           
pF1KE2 TGRIVPSEKILMQDHICQPVSAAD---WSKDIRTCKILNAQSLNTWLILC----SDRTEY
       :::..:.  ::.     . ... .   :  :.:  .. :.  ...: : :    ..  : 
CCDS39 TGRVLPAP-ILQYGGRNRAIATPNQGVW--DMRGKQFYNGIEIKVWAIACFAPQKQCREE
        410        420       430         440       450       460   

       500       510        520       530       540          550   
pF1KE2 VAESFLNCLRRVAGSMGFNVD-YPKIIKVQENPAAFVRAIQQYVD---PDVQLVMCILPS
       : ..: . ::... . :. ..  : . :  .. :  :. . ...      .::.. :::.
CCDS39 VLKNFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQG-ADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPG
           470       480       490        500       510       520  

           560       570       580       590       600       610   
pF1KE2 NQKTYYDSIKKYLSSDCPVPSQCVLARTLNKQGMMMSIATKIAMQMTCKLGGELWAVEIP
       .  .: . .:.  ..   . .::: .... : . .    ... .... :::: .  . .:
CCDS39 KTPVYAE-VKRVGDTLLGMATQCVQVKNVVKTSPQ--TLSNLCLKINVKLGG-INNILVP
             530       540       550         560       570         

                  620       630         640       650       660    
pF1KE2 -------LKSLMVVGIDVCKDALS--KDVMVVGCVASVNPRITRWFSRCILQRTMTDVAD
               . .. .: :: .   .  :   ... :.:.. . .:. .   .::   .. .
CCDS39 HQRSAVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSITAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIE
      580       590       600       610       620       630        

          670       680       690       700       710       720    
pF1KE2 CLKVFMTGALNKWYKYNHDLPARIIVYRAGVGDGQLKTLIEYEVPQLLSSVAESSSNTSS
        :. ..   : ..:: ..  :.::: :: :: .:::  ...::.  . ..  .  .. . 
CCDS39 DLSYMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVPEGQLPQILHYELLAIRDACIKLEKDYQP
      640       650       660       670       680       690        

          730       740           750       760       770       780
pF1KE2 RLSVIVVRKKCMPRFF-TEMNRTVQ---NPPLGTVVDSEATRNEWYDFYLISQVACRGTV
        .. :::.:.   :.: .. :. .    : : ::.::.. :.   .:::: :... .:: 
CCDS39 GITYIVVQKRHHTRLFCADKNERIGKSGNIPAGTTVDTNITHPFEFDFYLCSHAGIQGTS
      700       710       720       730       740       750        

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 SPTYYNVIYDDNGLKPDHMQRLTFKLCHLYYNWPGIVSVPAPCQYAHKLTFLVAQSIHKE
        :..: :..::: .  :..: ::..::: :      ::.:::  ::. ..:         
CCDS39 RPSHYYVLWDDNRFTADELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDK
      760       770       780       790       800       810        

              850                             
pF1KE2 PSLELANHLFYL                           
                                              
CCDS39 EHDSGEGSHISGQSNGRDPQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
      820       830       840       850       




852 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Mon Nov  7 00:11:28 2016 done: Mon Nov  7 00:11:29 2016
 Total Scan time:  3.730 Total Display time:  0.300

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com