Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4515
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4515, 547 aa
1>>>pF1KE4515 547 - 547 aa - 547 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7460+/-0.00109; mu= 16.0172+/- 0.065
mean_var=65.8098+/-13.431, 0's: 0 Z-trim(102.4): 25 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.158099
statistics sampled from 6934 (6946) to 6934 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.574), E-opt: 0.2 (0.213), width: 16
Scan time: 2.800
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5769.1 ST7 gene_id:7982|Hs108|chr7 ( 554) 3622 835.5 0
CCDS849.1 ST7L gene_id:54879|Hs108|chr1 ( 558) 2360 547.6 1.4e-155
CCDS848.1 ST7L gene_id:54879|Hs108|chr1 ( 575) 2335 541.9 7.5e-154
CCDS852.1 ST7L gene_id:54879|Hs108|chr1 ( 555) 2328 540.3 2.2e-153
CCDS76189.1 ST7L gene_id:54879|Hs108|chr1 ( 392) 2074 482.3 4.4e-136
CCDS5770.1 ST7 gene_id:7982|Hs108|chr7 ( 585) 2049 476.7 3.3e-134
CCDS850.1 ST7L gene_id:54879|Hs108|chr1 ( 544) 1891 440.7 2.2e-123
>>CCDS5769.1 ST7 gene_id:7982|Hs108|chr7 (554 aa)
initn: 2897 init1: 2897 opt: 3622 Z-score: 4462.4 bits: 835.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3622; 98.7% identity (98.7% similar) in 554 aa overlap (1-547:1-554)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAEAATGFLEQLKSCIVWSWTYLWTVWFFIVLFLVYILRVPLKINDNLSTVSMFLNTLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MAEAATGFLEQLKSCIVWSWTYLWTVWFFIVLFLVYILRVPLKINDNLSTVSMFLNTLTP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE4 KFYVALTGTSSLISGLILIFEWWYFRKYGTSFIEQVSVSHLRPLLGGVDNNSSNNS----
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KFYVALTGTSSLISGLILIFEWWYFRKYGTSFIEQVSVSHLRPLLGGVDNNSSNNSNSSN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 ---DSNRQSVSECKVWRNPLNLFRGAEYNRYTWVTGREPLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GDSDSNRQSVSECKVWRNPLNLFRGAEYNRYTWVTGREPLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DHLRPADAIMQKAWRERNPQARISAAHEALEINECATAYILLAEEEATTIAEAEKLFKQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 DHLRPADAIMQKAWRERNPQARISAAHEALEINECATAYILLAEEEATTIAEAEKLFKQA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 LKAGDGCYRRSQQLQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKRRLAMCARRLGRTREAVKMMRDLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LKAGDGCYRRSQQLQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKRRLAMCARRLGRTREAVKMMRDLM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 KEFPLLSMFNIHENLLEALLELQAYADVQAVLAKYDDISLPKSATICYTAALLKARAVSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KEFPLLSMFNIHENLLEALLELQAYADVQAVLAKYDDISLPKSATICYTAALLKARAVSD
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 KFSPEAASRRGLSTAEMNAVEAIHRAVEFNPHVPKYLLEMKSLILPPEHILKRGDSEAIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KFSPEAASRRGLSTAEMNAVEAIHRAVEFNPHVPKYLLEMKSLILPPEHILKRGDSEAIA
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 YAFFHLAHWKRVEGALNLLHCTWEGTFRMIPYPLEKGHLFYPYPICTETADRELLPSFHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 YAFFHLAHWKRVEGALNLLHCTWEGTFRMIPYPLEKGHLFYPYPICTETADRELLPSFHE
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 VSVYPKKELPFFILFTAGLCSFTAMLALLTHQFPELMGVFAKAFLSTLFAPLNFVMEKVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VSVYPKKELPFFILFTAGLCSFTAMLALLTHQFPELMGVFAKAFLSTLFAPLNFVMEKVE
490 500 510 520 530 540
540
pF1KE4 SILPSSLWHQLTRI
::::::::::::::
CCDS57 SILPSSLWHQLTRI
550
>>CCDS849.1 ST7L gene_id:54879|Hs108|chr1 (558 aa)
initn: 2667 init1: 1797 opt: 2360 Z-score: 2906.7 bits: 547.6 E(32554): 1.4e-155
Smith-Waterman score: 2598; 74.8% identity (88.8% similar) in 527 aa overlap (7-524:28-533)
10 20 30
pF1KE4 MAEAATGFLEQLKSCIVWSWTYLWTVWFFIVLFLVYILR
:. :.:.. .. . . : :: : :.: ::
CCDS84 MADRGGVGEAAAVGASPASVPGLNPTLGWRERLRAGLAGTGASL---WFVAGLGLLYALR
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 VPLKINDNLSTVSMFLNTLTPKFYVALTGTSSLISGLILIFEWWYFRKYGTSFIEQVSVS
.::.. .::.. ::::::::::.:::::::.:.:::::::::::
CCDS84 IPLRLCENLAA-----------------GTSSLISGLIFIFEWWYFHKHGTSFIEQVSVS
60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 HLRPLLGGVDNNSSN--------NSDSNRQSVSECKVWRNPLNLFRGAEYNRYTWVTGRE
::.::.::.... :. .....::..:::::::::::::::::: :::::::.:
CCDS84 HLQPLMGGTESSISEPGSPSRNRENETSRQNLSECKVWRNPLNLFRGAEYRRYTWVTGKE
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 PLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDSDHLRPADAIMQKAWRERNPQARISAAHEALEIN-ECAT
:::::::::::::::::::::.: :::.:..:::::::::: :::.::..:::.: .:::
CCDS84 PLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDTDFLRPSDTVMQKAWRERNPPARIKAAYQALELNNDCAT
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 AYILLAEEEATTIAEAEKLFKQALKAGDGCYRRSQQLQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKR
::.::::::::::..::.:::::::::. ::.::: ::.. :.::: ::::::::::::
CCDS84 AYVLLAEEEATTIVDAERLFKQALKAGETIYRQSQQCQHQSPQHEAQLRRDTNVLVYIKR
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 RLAMCARRLGRTREAVKMMRDLMKEFPLLSMFNIHENLLEALLELQAYADVQAVLAKYDD
:::::::.::: :::::.::::::::: :.:.::::::::.::::::: :::::::::::
CCDS84 RLAMCARKLGRIREAVKIMRDLMKEFPPLTMLNIHENLLESLLELQAYPDVQAVLAKYDD
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 ISLPKSATICYTAALLKARAVSDKFSPEAASRRGLSTAEMNAVEAIHRAVEFNPHVPKYL
:::::::.:::::::::.:.::.:::::.::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS84 ISLPKSAAICYTAALLKTRTVSEKFSPETASRRGLSTAEINAVEAIHRAVEFNPHVPKYL
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 LEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLAHWKRVEGALNLLHCTWEGTFRMIPYPLEKG
::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::.:::::::::::::::::
CCDS84 LEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLQHWKRIEGALNLLQCTWEGTFRMIPYPLEKG
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 HLFYPYPICTETADRELLPSFHEVSVYPKKELPFFILFTAGLCSFTAMLALLTHQFPELM
::::::: :::::::::::.::.::::::::::.:: ::::.:: :::.:.:::::::.:
CCDS84 HLFYPYPSCTETADRELLPTFHHVSVYPKKELPLFIHFTAGFCSSTAMIAILTHQFPEIM
470 480 490 500 510 520
520 530 540
pF1KE4 GVFAKAFLSTLFAPLNFVMEKVESILPSSLWHQLTRI
:.:::: :. :. :
CCDS84 GIFAKAVLG-LWCPQPWASSGFEENTQDLKSEDLGLSSG
530 540 550
>>CCDS848.1 ST7L gene_id:54879|Hs108|chr1 (575 aa)
initn: 2776 init1: 1797 opt: 2335 Z-score: 2875.6 bits: 541.9 E(32554): 7.5e-154
Smith-Waterman score: 2734; 77.4% identity (92.0% similar) in 527 aa overlap (7-524:28-550)
10 20 30
pF1KE4 MAEAATGFLEQLKSCIVWSWTYLWTVWFFIVLFLVYILR
:. :.:.. .. . . : :: : :.: ::
CCDS84 MADRGGVGEAAAVGASPASVPGLNPTLGWRERLRAGLAGTGASL---WFVAGLGLLYALR
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 VPLKINDNLSTVSMFLNTLTPKFYVALTGTSSLISGLILIFEWWYFRKYGTSFIEQVSVS
.::.. .::..:..:::.::::::::::::::::::::.:::::::.:.:::::::::::
CCDS84 IPLRLCENLAAVTVFLNSLTPKFYVALTGTSSLISGLIFIFEWWYFHKHGTSFIEQVSVS
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 HLRPLLGGVDNNSSN--------NSDSNRQSVSECKVWRNPLNLFRGAEYNRYTWVTGRE
::.::.::.... :. .....::..:::::::::::::::::: :::::::.:
CCDS84 HLQPLMGGTESSISEPGSPSRNRENETSRQNLSECKVWRNPLNLFRGAEYRRYTWVTGKE
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 PLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDSDHLRPADAIMQKAWRERNPQARISAAHEALEIN-ECAT
:::::::::::::::::::::.: :::.:..:::::::::: :::.::..:::.: .:::
CCDS84 PLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDTDFLRPSDTVMQKAWRERNPPARIKAAYQALELNNDCAT
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 AYILLAEEEATTIAEAEKLFKQALKAGDGCYRRSQQLQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKR
::.::::::::::..::.:::::::::. ::.::: ::.. :.::: ::::::::::::
CCDS84 AYVLLAEEEATTIVDAERLFKQALKAGETIYRQSQQCQHQSPQHEAQLRRDTNVLVYIKR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 RLAMCARRLGRTREAVKMMRDLMKEFPLLSMFNIHENLLEALLELQAYADVQAVLAKYDD
:::::::.::: :::::.::::::::: :.:.::::::::.::::::: :::::::::::
CCDS84 RLAMCARKLGRIREAVKIMRDLMKEFPPLTMLNIHENLLESLLELQAYPDVQAVLAKYDD
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 ISLPKSATICYTAALLKARAVSDKFSPEAASRRGLSTAEMNAVEAIHRAVEFNPHVPKYL
:::::::.:::::::::.:.::.:::::.::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS84 ISLPKSAAICYTAALLKTRTVSEKFSPETASRRGLSTAEINAVEAIHRAVEFNPHVPKYL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 LEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLAHWKRVEGALNLLHCTWEGTFRMIPYPLEKG
::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::.:::::::::::::::::
CCDS84 LEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLQHWKRIEGALNLLQCTWEGTFRMIPYPLEKG
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 HLFYPYPICTETADRELLPSFHEVSVYPKKELPFFILFTAGLCSFTAMLALLTHQFPELM
::::::: :::::::::::.::.::::::::::.:: ::::.:: :::.:.:::::::.:
CCDS84 HLFYPYPSCTETADRELLPTFHHVSVYPKKELPLFIHFTAGFCSSTAMIAILTHQFPEIM
480 490 500 510 520 530
520 530 540
pF1KE4 GVFAKAFLSTLFAPLNFVMEKVESILPSSLWHQLTRI
:.:::: :. :. :
CCDS84 GIFAKAVLG-LWCPQPWASSGFEENTQDLKSEDLGLSSG
540 550 560 570
>>CCDS852.1 ST7L gene_id:54879|Hs108|chr1 (555 aa)
initn: 2221 init1: 1802 opt: 2328 Z-score: 2867.3 bits: 540.3 E(32554): 2.2e-153
Smith-Waterman score: 2727; 77.8% identity (92.7% similar) in 519 aa overlap (7-516:28-543)
10 20 30
pF1KE4 MAEAATGFLEQLKSCIVWSWTYLWTVWFFIVLFLVYILR
:. :.:.. .. . . ..:: : :.: ::
CCDS85 MADRGGVGEAAAVGASPASVPGLNPTLGWRERLRAGLAGTGA---SLWFVAGLGLLYALR
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 VPLKINDNLSTVSMFLNTLTPKFYVALTGTSSLISGLILIFEWWYFRKYGTSFIEQVSVS
.::.. .::..:..:::.::::::::::::::::::::.:::::::.:.:::::::::::
CCDS85 IPLRLCENLAAVTVFLNSLTPKFYVALTGTSSLISGLIFIFEWWYFHKHGTSFIEQVSVS
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 HLRPLLGGVDNNSSN--------NSDSNRQSVSECKVWRNPLNLFRGAEYNRYTWVTGRE
::.::.::.... :. .....::..:::::::::::::::::: :::::::.:
CCDS85 HLQPLMGGTESSISEPGSPSRNRENETSRQNLSECKVWRNPLNLFRGAEYRRYTWVTGKE
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 PLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDSDHLRPADAIMQKAWRERNPQARISAAHEALEIN-ECAT
:::::::::::::::::::::.: :::.:..:::::::::: :::.::..:::.: .:::
CCDS85 PLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDTDFLRPSDTVMQKAWRERNPPARIKAAYQALELNNDCAT
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 AYILLAEEEATTIAEAEKLFKQALKAGDGCYRRSQQLQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKR
::.::::::::::..::.:::::::::. ::.::: ::.. :.::: ::::::::::::
CCDS85 AYVLLAEEEATTIVDAERLFKQALKAGETIYRQSQQCQHQSPQHEAQLRRDTNVLVYIKR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 RLAMCARRLGRTREAVKMMRDLMKEFPLLSMFNIHENLLEALLELQAYADVQAVLAKYDD
:::::::.::: :::::.::::::::: :.:.::::::::.::::::: :::::::::::
CCDS85 RLAMCARKLGRIREAVKIMRDLMKEFPPLTMLNIHENLLESLLELQAYPDVQAVLAKYDD
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 ISLPKSATICYTAALLKARAVSDKFSPEAASRRGLSTAEMNAVEAIHRAVEFNPHVPKYL
:::::::.:::::::::.:.::.:::::.::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS85 ISLPKSAAICYTAALLKTRTVSEKFSPETASRRGLSTAEINAVEAIHRAVEFNPHVPKYL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 LEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLAHWKRVEGALNLLHCTWEGTFRMIPYPLEKG
::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::.:::::::::::::::::
CCDS85 LEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLQHWKRIEGALNLLQCTWEGTFRMIPYPLEKG
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 HLFYPYPICTETADRELLPSFHEVSVYPKKELPFFILFTAGLCSFTAMLALLTHQFPELM
::::::: :::::::::::.::.::::::::::.:: ::::.:: :::.:.:::::::.:
CCDS85 HLFYPYPSCTETADRELLPTFHHVSVYPKKELPLFIHFTAGFCSSTAMIAILTHQFPEIM
480 490 500 510 520 530
520 530 540
pF1KE4 GVFAKAFLSTLFAPLNFVMEKVESILPSSLWHQLTRI
:.::::
CCDS85 GIFAKAVSMISRTCVDYL
540 550
>>CCDS76189.1 ST7L gene_id:54879|Hs108|chr1 (392 aa)
initn: 2103 init1: 1797 opt: 2074 Z-score: 2556.6 bits: 482.3 E(32554): 4.4e-136
Smith-Waterman score: 2074; 84.0% identity (95.1% similar) in 368 aa overlap (158-524:1-367)
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VWRNPLNLFRGAEYNRYTWVTGREPLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDSDHLRPADAIMQKAW
:::::::::::::::.: :::.:..:::::
CCDS76 MNLSAQDHQTFFTCDTDFLRPSDTVMQKAW
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 RERNPQARISAAHEALEIN-ECATAYILLAEEEATTIAEAEKLFKQALKAGDGCYRRSQQ
::::: :::.::..:::.: .:::::.::::::::::..::.:::::::::. ::.:::
CCDS76 RERNPPARIKAAYQALELNNDCATAYVLLAEEEATTIVDAERLFKQALKAGETIYRQSQQ
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKRRLAMCARRLGRTREAVKMMRDLMKEFPLLSMFNIHE
::.. :.::: :::::::::::::::::::.::: :::::.::::::::: :.:.::::
CCDS76 CQHQSPQHEAQLRRDTNVLVYIKRRLAMCARKLGRIREAVKIMRDLMKEFPPLTMLNIHE
100 110 120 130 140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 NLLEALLELQAYADVQAVLAKYDDISLPKSATICYTAALLKARAVSDKFSPEAASRRGLS
::::.::::::: ::::::::::::::::::.:::::::::.:.::.:::::.:::::::
CCDS76 NLLESLLELQAYPDVQAVLAKYDDISLPKSAAICYTAALLKTRTVSEKFSPETASRRGLS
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TAEMNAVEAIHRAVEFNPHVPKYLLEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLAHWKRVE
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:
CCDS76 TAEINAVEAIHRAVEFNPHVPKYLLEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLQHWKRIE
220 230 240 250 260 270
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 GALNLLHCTWEGTFRMIPYPLEKGHLFYPYPICTETADRELLPSFHEVSVYPKKELPFFI
::::::.:::::::::::::::::::::::: :::::::::::.::.::::::::::.::
CCDS76 GALNLLQCTWEGTFRMIPYPLEKGHLFYPYPSCTETADRELLPTFHHVSVYPKKELPLFI
280 290 300 310 320 330
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 LFTAGLCSFTAMLALLTHQFPELMGVFAKAFLSTLFAPLNFVMEKVESILPSSLWHQLTR
::::.:: :::.:.:::::::.::.:::: :. :. :
CCDS76 HFTAGFCSSTAMIAILTHQFPEIMGIFAKAVLG-LWCPQPWASSGFEENTQDLKSEDLGL
340 350 360 370 380
pF1KE4 I
CCDS76 SSG
390
>>CCDS5770.1 ST7 gene_id:7982|Hs108|chr7 (585 aa)
initn: 2806 init1: 2042 opt: 2049 Z-score: 2523.0 bits: 476.7 E(32554): 3.3e-134
Smith-Waterman score: 3371; 91.9% identity (93.3% similar) in 566 aa overlap (1-536:1-565)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAEAATGFLEQLKSCIVWSWTYLWTVWFFIVLFLVYILRVPLKINDNLSTVSMFLNTLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MAEAATGFLEQLKSCIVWSWTYLWTVWFFIVLFLVYILRVPLKINDNLSTVSMFLNTLTP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE4 KFYVALTGTSSLISGLILIFEWWYFRKYGTSFIEQVSVSHLRPLLGGVDNNSSNNS----
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KFYVALTGTSSLISGLILIFEWWYFRKYGTSFIEQVSVSHLRPLLGGVDNNSSNNSNSSN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 ---DSNRQSVSECKVWRNPLNLFRGAEYNRYTWVTGREPLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GDSDSNRQSVSECKVWRNPLNLFRGAEYNRYTWVTGREPLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210
pF1KE4 DHLRPADAIMQKAWRERNPQARISAAHEALEINE-----------------------CAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS57 DHLRPADAIMQKAWRERNPQARISAAHEALEINEIRSRVEVPLIASSTIWEIKLLPKCAT
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 AYILLAEEEATTIAEAEKLFKQALKAGDGCYRRSQQLQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 AYILLAEEEATTIAEAEKLFKQALKAGDGCYRRSQQLQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKR
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 RLAMCARRLGRTREAVKMMRDLMKEFPLLSMFNIHENLLEALLELQAYADVQAVLAKYDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 RLAMCARRLGRTREAVKMMRDLMKEFPLLSMFNIHENLLEALLELQAYADVQAVLAKYDD
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 ISLPKSATICYTAALLKARAVSDKFSPEAASRRGLSTAEMNAVEAIHRAVEFNPHVPKYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 ISLPKSATICYTAALLKARAVSDKFSPEAASRRGLSTAEMNAVEAIHRAVEFNPHVPKYL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 LEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLAHWKRVEGALNLLHCTWEGTFRMIPYPLEKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLAHWKRVEGALNLLHCTWEGTFRMIPYPLEKG
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 HLFYPYPICTETADRELLPSFHEVSVYPKKELPFFILFTAGLCSFTAMLALLTHQFPELM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 HLFYPYPICTETADRELLPSFHEVSVYPKKELPFFILFTAGLCSFTAMLALLTHQFPELM
490 500 510 520 530 540
520 530 540
pF1KE4 GVFAKAFLSTLFAPLNFVMEKVESILPSSLWHQLTRI
::::::... .: .: . .::.
CCDS57 GVFAKAMID-IFCSAEFRDWNCKSIFMRVEDELEIPPAPQSQHFQN
550 560 570 580
>>CCDS850.1 ST7L gene_id:54879|Hs108|chr1 (544 aa)
initn: 2535 init1: 1332 opt: 1891 Z-score: 2328.7 bits: 440.7 E(32554): 2.2e-123
Smith-Waterman score: 2449; 71.9% identity (86.3% similar) in 527 aa overlap (7-524:28-519)
10 20 30
pF1KE4 MAEAATGFLEQLKSCIVWSWTYLWTVWFFIVLFLVYILR
:. :.:.. .. . . : :: : :.: ::
CCDS85 MADRGGVGEAAAVGASPASVPGLNPTLGWRERLRAGLAGTGASL---WFVAGLGLLYALR
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 VPLKINDNLSTVSMFLNTLTPKFYVALTGTSSLISGLILIFEWWYFRKYGTSFIEQVSVS
.::.. .::..:..:::.::::::::::::::::::::.:::::::.:.:::::::::::
CCDS85 IPLRLCENLAAVTVFLNSLTPKFYVALTGTSSLISGLIFIFEWWYFHKHGTSFIEQVSVS
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 HLRPLLGGVDNNSSN--------NSDSNRQSVSECKVWRNPLNLFRGAEYNRYTWVTGRE
::.::.::.... :. .....::..:::::::::::::::::: :::::::.:
CCDS85 HLQPLMGGTESSISEPGSPSRNRENETSRQNLSECKVWRNPLNLFRGAEYRRYTWVTGKE
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 PLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDSDHLRPADAIMQKAWRERNPQARISAAHEALEIN-ECAT
:::::::::::::::::::::.: :::.:..:::::::::: :::.::..:::.: .:::
CCDS85 PLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDTDFLRPSDTVMQKAWRERNPPARIKAAYQALELNNDCAT
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 AYILLAEEEATTIAEAEKLFKQALKAGDGCYRRSQQLQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKR
::.::::::::::..::.:::::::::. ::.::: ::.. :.::: ::::::::::::
CCDS85 AYVLLAEEEATTIVDAERLFKQALKAGETIYRQSQQCQHQSPQHEAQLRRDTNVLVYIKR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 RLAMCARRLGRTREAVKMMRDLMKEFPLLSMFNIHENLLEALLELQAYADVQAVLAKYDD
:::::::.::: :::::.::::::::: :.:.::::::::.::::::: :::::::::::
CCDS85 RLAMCARKLGRIREAVKIMRDLMKEFPPLTMLNIHENLLESLLELQAYPDVQAVLAKYDD
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 ISLPKSATICYTAALLKARAVSDKFSPEAASRRGLSTAEMNAVEAIHRAVEFNPHVPKYL
:::::::.:::::::::.:.::.:::::.::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS85 ISLPKSAAICYTAALLKTRTVSEKFSPETASRRGLSTAEINAVEAIHRAVEFNPHVPKYL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 LEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLAHWKRVEGALNLLHCTWEGTFRMIPYPLEKG
::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::.:::::::
CCDS85 LEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLQHWKRIEGALNLLQCTWEGTF----------
420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 HLFYPYPICTETADRELLPSFHEVSVYPKKELPFFILFTAGLCSFTAMLALLTHQFPELM
:.::::::::::.:: ::::.:: :::.:.:::::::.:
CCDS85 ---------------------HHVSVYPKKELPLFIHFTAGFCSSTAMIAILTHQFPEIM
470 480 490 500
520 530 540
pF1KE4 GVFAKAFLSTLFAPLNFVMEKVESILPSSLWHQLTRI
:.:::: :. :. :
CCDS85 GIFAKAVLG-LWCPQPWASSGFEENTQDLKSEDLGLSSG
510 520 530 540
547 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 00:19:20 2016 done: Sun Nov 6 00:19:20 2016
Total Scan time: 2.800 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]