FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6716, 755 aa 1>>>pF1KE6716 755 - 755 aa - 755 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3369+/-0.000921; mu= 15.3649+/- 0.055 mean_var=81.9142+/-16.636, 0's: 0 Z-trim(106.8): 33 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.141708 statistics sampled from 9187 (9204) to 9187 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16 Scan time: 2.960 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3322.1 SENP5 gene_id:205564|Hs108|chr3 ( 755) 5178 1068.6 0 CCDS77876.1 SENP5 gene_id:205564|Hs108|chr3 ( 709) 4299 888.9 0 CCDS73958.1 SENP3 gene_id:26168|Hs108|chr17 ( 574) 1040 222.6 1.4e-57 CCDS44868.2 SENP1 gene_id:29843|Hs108|chr12 ( 644) 541 120.6 7.7e-27 CCDS33902.1 SENP2 gene_id:59343|Hs108|chr3 ( 589) 488 109.8 1.3e-23 >>CCDS3322.1 SENP5 gene_id:205564|Hs108|chr3 (755 aa) initn: 5178 init1: 5178 opt: 5178 Z-score: 5717.6 bits: 1068.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5178; 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CCDS73 LAPPDASILISNVCSIGDHVAQELFQGSDLGMAEEAERPGEKAGQH-SPLREEHVT-CVQ 270 280 290 300 310 510 520 530 540 550 pF1KE6 GFLDEVMKKYGSLVPLSEKEVLGRLKDVFNEDFS--NRKPFINREITNYRARHQKC---N ..::: .. ::::.::: ::. .:.:.:...:: .:: .. . : .:. . . CCDS73 SILDEFLQTYGSLIPLSTDEVVEKLEDIFQQEFSTPSRKGLVLQLIQSYQRMPGNAMVRG 320 330 340 350 360 370 560 570 580 590 600 610 pF1KE6 FRIFYNKHMLDMDDLATLDGQNWLNDQVINMYGELIMDAVPDKVHFFNSFFHRQLVTKGY ::. :..:.: ::::.:: :::::::::.::::.:.::.::.:::::::::. .: :::: CCDS73 FRVAYKRHVLTMDDLGTLYGQNWLNDQVMNMYGDLVMDTVPEKVHFFNSFFYDKLRTKGY 380 390 400 410 420 430 620 630 640 650 660 670 pF1KE6 NGVKRWTKKVDLFKKSLLLIPIHLEVHWSLITVTLSNRIISFYDSQGIHFKFCVENIRKY .:::::::.::.:.: :::::::::::::::.: . : :...::: . : ..: :: CCDS73 DGVKRWTKNVDIFNKELLLIPIHLEVHWSLISVDVRRRTITYFDSQRTLNRRCPKHIAKY 440 450 460 470 480 490 680 690 700 710 720 730 pF1KE6 LLTEAREKNRPEFLQGWQTAVTKCIPQQKNDSDCGVFVLQYCKCLALEQPFQFSQEDMPR : .:: .:.: .: :::. . .:.::::::.::::::: ::: :::.:.:.:::. CCDS73 LQAEAVKKDRLDFHQGWKGYFKMNVARQNNDSDCGAFVLQYCKHLALSQPFSFTQQDMPK 500 510 520 530 540 550 740 750 pF1KE6 VRKRIYKELCECRLMD .:..::::::.:.: CCDS73 LRRQIYKELCHCKLTV 560 570 >>CCDS44868.2 SENP1 gene_id:29843|Hs108|chr12 (644 aa) initn: 431 init1: 279 opt: 541 Z-score: 595.3 bits: 120.6 E(32554): 7.7e-27 Smith-Waterman score: 542; 29.8% identity (57.2% similar) in 463 aa overlap (306-754:214-644) 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 QETRRENGEGGSCSPFPSPEPKDPSCRHQPYFPDMDSSAVVKGTNSHVPDCHTKGSSFLG .:: : . .. :. . .:.: . CCDS44 ETVQEEEREIYRQLLQMVTGKQFTIAKPTTHFPLHLSRCLSSSKNTLKDSLFKNGNSCAS 190 200 210 220 230 240 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 KELSLDEAFPDQQNGSATNAWDQSSCSSPKWECTELIHDIPLPEHRSNTMFISETEREIM . .. : . ..:::. .: . : . . :. . . :.:. . .. . CCDS44 QIIGSDTS----SSGSASILTNQEQLSHSVYSLSSYTPDVAFGSKDSGTLHHPHHHHSVP 250 260 270 280 290 400 410 420 430 440 450 pF1KE6 ----TLGQENQTSSVSDDRVKLSVSGADTSVSSVDGPVSQKAVQNENSYQMEEDGSLKQS .:. : : ::. . :.:. ..: . : :. : : ..: :. .: CCDS44 HQPDNLAASNTQSEGSDSVILLKVKDSQTPT-----P-SSTFFQAE--LWIKELTSVYDS 300 310 320 330 340 350 460 470 480 490 500 510 pF1KE6 ILSSELLDHPYCKSPLEAPLVCSGLKLENQVGGGKNSQKASPVDDEQLSVCLSGFLDEVM . : : . .. : .:.:.:: . ... : : :: : : . CCDS44 -RARERLRQIEEQKAL-------ALQLQNQ----RLQEREHSVHD---SVELH--LRVPL 360 370 380 390 520 530 540 550 560 pF1KE6 KKYGSLVPLSEKEVLG-RLKDVFNEDFSNRKPFINREITN-YRARHQKCNFRIFYNKHML .: .. ..: . : .: : .: : . ...:: : .: .: . . . . CCDS44 EKEIPVTVVQETQKKGHKLTDSEDE-FPEITEEMEKEIKNVFRNGNQDEVLSEAF-RLTI 400 410 420 430 440 450 570 580 590 600 610 620 pF1KE6 DMDDLATLDGQNWLNDQVINMYGELIMDAVPDK----VHFFNSFFHRQLVTKGYNGVKRW :. ::. :::::..::.: ...:. .: :: ::.:: .: : ::..:::: CCDS44 TRKDIQTLNHLNWLNDEIINFYMNMLMERSKEKGLPSVHAFNTFFFTKLKTAGYQAVKRW 460 470 480 490 500 510 630 640 650 660 670 680 pF1KE6 TKKVDLFKKSLLLIPIHLEVHWSLITVTLSNRIISFYDSQG-IHFKFCVENIRKYLLTEA :::::.:. ..::.:::: ::: : .: . .. :..:::.: :. . : . . .:: :. CCDS44 TKKVDVFSVDILLVPIHLGVHWCLAVVDFRKKNITYYDSMGGINNEAC-RILLQYLKQES 520 530 540 550 560 570 690 700 710 720 730 740 pF1KE6 REKNRPEF-LQGWQ--TAVTKCIPQQKNDSDCGVFVLQYCKCLALEQPFQFSQEDMPRVR .:.: :: .::: . .. :::: : ::::.:. .: :.. ..:..:.:. :: : CCDS44 IDKKRKEFDTNGWQLFSKKSQEIPQQMNGSDCGMFACKYADCITKDRPINFTQQHMPYFR 580 590 600 610 620 630 750 pF1KE6 KRIYKELCECRLMD ::. :. . .:. CCDS44 KRMVWEILHRKLL 640 >>CCDS33902.1 SENP2 gene_id:59343|Hs108|chr3 (589 aa) initn: 443 init1: 250 opt: 488 Z-score: 537.4 bits: 109.8 E(32554): 1.3e-23 Smith-Waterman score: 488; 30.6% identity (63.9% similar) in 291 aa overlap (475-754:304-589) 450 460 470 480 490 500 pF1KE6 DGSLKQSILSSELLDHPYCKSPLEAPLVCSGLKLENQVGGGKNSQKASPVDDEQLSVCL- :...::. .. . . : .:..:. : CCDS33 RLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTETMVGIRFENE---SRRGYQLEPDLSEEVSARLR 280 290 300 310 320 330 510 520 530 540 550 560 pF1KE6 --SGFLDEVMKKYGSLVPLSEKEVLGRLKDVFNEDFSNRKPFINREITNYRARHQKCNFR :: . .... :.. .::. :. .: ..:. . ...::.: .. . .. CCDS33 LGSGS-NGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDEIL 340 350 360 370 380 570 580 590 600 610 pF1KE6 IFYNKHMLDMDDLATLDGQNWLNDQVINMYGELIMDAVPDK----VHFFNSFFHRQLVTK : . :. :: . .::::.:::.: .:... . .: :..::. .: . CCDS33 SSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLKSG 390 400 410 420 430 440 620 630 640 650 660 670 pF1KE6 GYNGVKRWTKKVDLFKKSLLLIPIHLEVHWSLITVTLSNRIISFYDSQGIH-FKFCVENI ::..:::::: :.::.. ..:.::: .:::::... : .. ... ::.: . ..: : . CCDS33 GYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRIC-EIL 450 460 470 480 490 500 680 690 700 710 720 730 pF1KE6 RKYLLTEAREKNRPEF-LQGWQTAVTK--CIPQQKNDSDCGVFVLQYCKCLALEQPFQFS .:: :.. : .. : : : :::: : ::::.:. .: .. ..:. :. CCDS33 LQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITFT 510 520 530 540 550 560 740 750 pF1KE6 QEDMPRVRKRIYKELCECRLMD :..:: ::.. :. . .:. CCDS33 QHQMPLFRKKMVWEILHQQLL 570 580 755 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 15:39:35 2016 done: Tue Nov 8 15:39:35 2016 Total Scan time: 2.960 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]