Result of FASTA (ccds) for pFN21AE6415
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6415, 480 aa
  1>>>pF1KE6415 480 - 480 aa - 480 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5980+/-0.000992; mu= 15.9996+/- 0.059
 mean_var=64.4450+/-13.131, 0's: 0 Z-trim(103.2): 41  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.159764
 statistics sampled from 7253 (7292) to 7253 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.224), width:  16
 Scan time:  1.840

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10164.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15       ( 480) 3185 743.3 1.3e-214
CCDS45266.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15       ( 422) 1652 389.9 2.8e-108
CCDS55968.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15       ( 497) 1652 389.9 3.2e-108
CCDS10163.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15       ( 518) 1652 389.9 3.4e-108
CCDS6644.1 ALDH1A1 gene_id:216|Hs108|chr9          ( 501) 1294 307.4 2.3e-83
CCDS76794.1 ALDH1A3 gene_id:220|Hs108|chr15        ( 405) 1271 302.1 7.4e-82
CCDS10389.1 ALDH1A3 gene_id:220|Hs108|chr15        ( 512) 1271 302.1 9.1e-82
CCDS55885.1 ALDH2 gene_id:217|Hs108|chr12          ( 470) 1201 286.0   6e-77
CCDS9155.1 ALDH2 gene_id:217|Hs108|chr12           ( 517) 1201 286.0 6.6e-77
CCDS6615.1 ALDH1B1 gene_id:219|Hs108|chr9          ( 517) 1180 281.1 1.9e-75
CCDS58850.1 ALDH1L1 gene_id:10840|Hs108|chr3       ( 801)  870 209.8   9e-54
CCDS3034.1 ALDH1L1 gene_id:10840|Hs108|chr3        ( 902)  870 209.8   1e-53
CCDS58851.1 ALDH1L1 gene_id:10840|Hs108|chr3       ( 912)  870 209.8   1e-53
CCDS31891.1 ALDH1L2 gene_id:160428|Hs108|chr12     ( 923)  829 200.3 7.1e-51
CCDS55057.1 ALDH8A1 gene_id:64577|Hs108|chr6       ( 437)  821 198.4 1.3e-50
CCDS1250.2 ALDH9A1 gene_id:223|Hs108|chr1          ( 518)  683 166.6 5.8e-41
CCDS5171.1 ALDH8A1 gene_id:64577|Hs108|chr6        ( 487)  628 153.9 3.6e-37
CCDS4555.1 ALDH5A1 gene_id:7915|Hs108|chr6         ( 535)  542 134.1 3.6e-31
CCDS4556.1 ALDH5A1 gene_id:7915|Hs108|chr6         ( 548)  542 134.1 3.7e-31
CCDS4137.2 ALDH7A1 gene_id:501|Hs108|chr5          ( 539)  472 118.0 2.6e-26
CCDS82090.1 ALDH3A1 gene_id:218|Hs108|chr17        ( 380)  376 95.8 8.7e-20
CCDS11212.1 ALDH3A1 gene_id:218|Hs108|chr17        ( 453)  376 95.8   1e-19
CCDS5172.1 ALDH8A1 gene_id:64577|Hs108|chr6        ( 433)  369 94.2   3e-19
CCDS11210.1 ALDH3A2 gene_id:224|Hs108|chr17        ( 485)  361 92.4 1.2e-18
CCDS32589.1 ALDH3A2 gene_id:224|Hs108|chr17        ( 508)  361 92.4 1.2e-18
CCDS9826.1 ALDH6A1 gene_id:4329|Hs108|chr14        ( 535)  323 83.6 5.6e-16
CCDS12766.1 ALDH16A1 gene_id:126133|Hs108|chr19    ( 802)  310 80.7 6.5e-15
CCDS53272.1 ALDH4A1 gene_id:8659|Hs108|chr1        ( 503)  265 70.2 5.6e-12
CCDS188.1 ALDH4A1 gene_id:8659|Hs108|chr1          ( 563)  265 70.3 6.2e-12
CCDS46141.1 ALDH16A1 gene_id:126133|Hs108|chr19    ( 751)  266 70.5 6.9e-12


>>CCDS10164.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15            (480 aa)
 initn: 3185 init1: 3185 opt: 3185  Z-score: 3966.2  bits: 743.3 E(32554): 1.3e-214
Smith-Waterman score: 3185; 100.0% identity (100.0% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-480)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MTSSKIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MTSSKIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 ATGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ATGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 ATMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ATMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVC
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 GQIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEVGKLIQEAAGRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GQIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEVGKLIQEAAGRS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 NLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 RSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 IEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKAL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE6 TVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
              430       440       450       460       470       480

>>CCDS45266.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15            (422 aa)
 initn: 1652 init1: 1652 opt: 1652  Z-score: 2057.4  bits: 389.9 E(32554): 2.8e-108
Smith-Waterman score: 2466; 91.0% identity (91.0% similar) in 422 aa overlap (97-480:1-422)

         70        80        90       100       110       120      
pF1KE6 CEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVLATMESL
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45                               MDASERGRLLDKLADLVERDRAVLATMESL
                                             10        20        30

        130       140       150       160       170       180      
pF1KE6 NGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCGQIIPW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCGQIIPW
               40        50        60        70        80        90

        190       200       210       220                          
pF1KE6 NFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKE------------------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                  
CCDS45 NFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILPGYGPTA
              100       110       120       130       140       150

                          230       240       250       260        
pF1KE6 --------------------VGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYAVE
                           ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYAVE
              160       170       180       190       200       210

      270       280       290       300       310       320        
pF1KE6 QAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQIDKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQIDKK
              220       230       240       250       260       270

      330       340       350       360       370       380        
pF1KE6 QYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQEIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQEIL
              280       290       300       310       320       330

      390       400       410       420       430       440        
pF1KE6 RFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFGGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFGGF
              340       350       360       370       380       390

      450       460       470       480
pF1KE6 KMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
              400       410       420  

>>CCDS55968.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15            (497 aa)
 initn: 1652 init1: 1652 opt: 1652  Z-score: 2056.3  bits: 389.9 E(32554): 3.2e-108
Smith-Waterman score: 2856; 91.5% identity (91.5% similar) in 484 aa overlap (35-480:14-497)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KE6 KIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNPATGE
                                     ::   :::::::::::::::::::::::::
CCDS55                  MKNQCETVWLKSPIKLKLIFINNEWQNSESGRVFPVYNPATGE
                                10        20        30        40   

           70        80        90       100       110       120    
pF1KE6 QVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVLATME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVLATME
            50        60        70        80        90       100   

          130       140       150       160       170       180    
pF1KE6 SLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCGQII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCGQII
           110       120       130       140       150       160   

          190       200       210       220                        
pF1KE6 PWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKE----------------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                
CCDS55 PWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILPGYGP
           170       180       190       200       210       220   

                            230       240       250       260      
pF1KE6 ----------------------VGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYA
                             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TAGAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYA
           230       240       250       260       270       280   

        270       280       290       300       310       320      
pF1KE6 VEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQID
           290       300       310       320       330       340   

        330       340       350       360       370       380      
pF1KE6 KKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQE
           350       360       370       380       390       400   

        390       400       410       420       430       440      
pF1KE6 ILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFG
           410       420       430       440       450       460   

        450       460       470       480
pF1KE6 GFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
           470       480       490       

>>CCDS10163.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15            (518 aa)
 initn: 1652 init1: 1652 opt: 1652  Z-score: 2056.0  bits: 389.9 E(32554): 3.4e-108
Smith-Waterman score: 3066; 92.6% identity (92.6% similar) in 512 aa overlap (7-480:7-518)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MTSSKIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNP
             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MTSSKIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 ATGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ATGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 ATMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ATMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVC
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220                    
pF1KE6 GQIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKE------------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::            
CCDS10 GQIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILP
              190       200       210       220       230       240

                                230       240       250       260  
pF1KE6 --------------------------VGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADAD
                                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GYGPTAGAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADAD
              250       260       270       280       290       300

            270       280       290       300       310       320  
pF1KE6 LDYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LDYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQG
              310       320       330       340       350       360

            330       340       350       360       370       380  
pF1KE6 PQIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PQIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFG
              370       380       390       400       410       420

            390       400       410       420       430       440  
pF1KE6 PVQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PVQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQ
              430       440       450       460       470       480

            450       460       470       480
pF1KE6 SPFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SPFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
              490       500       510        

>>CCDS6644.1 ALDH1A1 gene_id:216|Hs108|chr9               (501 aa)
 initn: 1294 init1: 1294 opt: 1294  Z-score: 1610.3  bits: 307.4 E(32554): 2.3e-83
Smith-Waterman score: 2212; 66.7% identity (84.0% similar) in 493 aa overlap (26-480:9-501)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MTSSKIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNP
                                ::    .:.:.::::::::::..: ::. :::.::
CCDS66                  MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVFNP
                                10        20        30        40   

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 ATGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVL
       :: :..:.:.:.:: :.::::.::: ::..:: :: :::::::::: :::::.:::: .:
CCDS66 ATEEELCQVEEGDKEDVDKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRLLL
            50        60        70        80        90       100   

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 ATMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVC
       :::::.:::: . .:.  :: : :::.:: :::::::.: :::.::..::.:::::::::
CCDS66 ATMESMNGGKLYSNAYLNDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIGVC
           110       120       130       140       150       160   

              190       200       210       220                    
pF1KE6 GQIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKE------------
       ::::::::::.:. :::.::: ::::::.::::::::.::....::::            
CCDS66 GQIIPWNFPLVMLIWKIGPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNIVP
           170       180       190       200       210       220   

                                230       240       250       260  
pF1KE6 --------------------------VGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADAD
                                 :::::.::::.::::::::::::::: :..::::
CCDS66 GYGPTAGAAISSHMDIDKVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLADAD
           230       240       250       260       270       280   

            270       280       290       300       310       320  
pF1KE6 LDYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQG
       :: ::: ::.:::..::::: :.::::::::::.:::::::::::. ..:.:. : . ::
CCDS66 LDNAVEFAHHGVFYHQGQCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVTQG
           290       300       310       320       330       340   

            330       340       350       360       370       380  
pF1KE6 PQIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFG
       :::::.::.:::.::.::  :::::::::   : ::.:..:::::::::.::::::::::
CCDS66 PQIDKEQYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEEIFG
           350       360       370       380       390       400   

            390       400       410       420       430       440  
pF1KE6 PVQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQ
       :::.:..::..:.::.::::. .:: :.:::.::.::.:.:::.::::::.:::....::
CCDS66 PVQQIMKFKSLDDVIKRANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVSAQ
           410       420       430       440       450       460   

            450       460       470       480
pF1KE6 SPFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
        :::::::::::::.::.:..::.::::::::: ::::
CCDS66 CPFGGFKMSGNGRELGEYGFHEYTEVKTVTVKISQKNS
           470       480       490       500 

>>CCDS76794.1 ALDH1A3 gene_id:220|Hs108|chr15             (405 aa)
 initn: 1694 init1: 1271 opt: 1271  Z-score: 1583.1  bits: 302.1 E(32554): 7.4e-82
Smith-Waterman score: 1584; 57.7% identity (74.7% similar) in 454 aa overlap (26-479:20-404)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MTSSKIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNP
                                :: :  :::.:.:::::::::..:.::. : . ::
CCDS76       MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNP
                     10        20        30        40        50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 ATGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVL
       .: ::.:::.:.:: :.::::.::..::. :: :::.::  ::::: .::::::::::.:
CCDS76 STREQICEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATL
           60        70        80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 ATMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVC
       :                             ::.                      : :: 
CCDS76 A-----------------------------AGF----------------------PPGVV
                                                             120   

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 GQIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEVGKLIQEAAGRS
       . :.:   : .  : .  : .   : ..            . :.   :::::..:::.::
CCDS76 N-IVPGFGPTVGAAISSHPQI---NKIA------------FTGS--TEVGKLVKEAASRS
            130       140                      150         160     

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 NLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVR
       ::::::::::::.: :. :::::: ::: :::::::::::::::.::.::::..: ::::
CCDS76 NLKRVTLELGGKNPCIVCADADLDLAVECAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVR
         170       180       190       200       210       220     

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 RSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFF
       :::: ::.: ::.:::  ::::::::.::..::::::.::  :::::::::...  ::.:
CCDS76 RSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGPQIDQKQFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLF
         230       240       250       260       270       280     

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 IEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKAL
       :.:::::.:::.::::::::::::: ::.::...:::.:::..:.::.:::::....:::
CCDS76 IKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGPVQPILKFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKAL
         290       300       310       320       330       340     

              430       440       450       460       470       480
pF1KE6 TVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
        ..::...::::::::::: ::.:::::::::::::.::..: ::.::::::.:. .:: 
CCDS76 KLASALESGTVWINCYNALYAQAPFGGFKMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
         350       360       370       380       390       400     

>>CCDS10389.1 ALDH1A3 gene_id:220|Hs108|chr15             (512 aa)
 initn: 1271 init1: 1271 opt: 1271  Z-score: 1581.5  bits: 302.1 E(32554): 9.1e-82
Smith-Waterman score: 2195; 65.9% identity (84.1% similar) in 492 aa overlap (26-479:20-511)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MTSSKIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNP
                                :: :  :::.:.:::::::::..:.::. : . ::
CCDS10       MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNP
                     10        20        30        40        50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 ATGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVL
       .: ::.:::.:.:: :.::::.::..::. :: :::.::  ::::: .::::::::::.:
CCDS10 STREQICEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATL
           60        70        80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 ATMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVC
       :..:... :::::.::..::.: :.:.::.:::::::.: :::.: .   ::::::::::
CCDS10 AALETMDTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVC
          120       130       140       150       160       170    

              190       200       210       220                    
pF1KE6 GQIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKE------------
       : : ::::::::..::.:::::::::.:.::::::::.:::.:.::::            
CCDS10 GAITPWNFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVP
          180       190       200       210       220       230    

                                230       240       250       260  
pF1KE6 --------------------------VGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADAD
                                 ::::..:::.::::::::::::::.: :. ::::
CCDS10 GFGPTVGAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADAD
          240       250       260       270       280       290    

            270       280       290       300       310       320  
pF1KE6 LDYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQG
       :: ::: :::::::::::::::.::.::::..: :::::::: ::.: ::.:::  ::::
CCDS10 LDLAVECAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQG
          300       310       320       330       340       350    

            330       340       350       360       370       380  
pF1KE6 PQIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFG
       ::::.::..::::::.::  :::::::::...  ::.::.:::::.:::.::::::::::
CCDS10 PQIDQKQFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFG
          360       370       380       390       400       410    

            390       400       410       420       430       440  
pF1KE6 PVQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQ
       ::: ::.::...:::.:::..:.::.:::::....::: ..::...::::::::::: ::
CCDS10 PVQPILKFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQ
          420       430       440       450       460       470    

            450       460       470       480
pF1KE6 SPFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
       .:::::::::::::.::..: ::.::::::.:. .:: 
CCDS10 APFGGFKMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
          480       490       500       510  

>>CCDS55885.1 ALDH2 gene_id:217|Hs108|chr12               (470 aa)
 initn: 1347 init1: 1201 opt: 1201  Z-score: 1494.9  bits: 286.0 E(32554): 6e-77
Smith-Waterman score: 1728; 54.2% identity (73.1% similar) in 498 aa overlap (21-480:20-470)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MTSSKIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNP
                           :. . .:.:. . :.  ..:::::::... : ..::. ::
CCDS55  MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNP
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 ATGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVL
       .::: .:.: :.:::                                             
CCDS55 STGEVICQVAEGDKA---------------------------------------------
      60        70                                                 

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 ATMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVC
         .:.:..:::.. .. :::. :.: .::::::::: :: :::.:::.:..:::::.:::
CCDS55 --LETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVC
             80        90       100       110       120       130  

              190       200       210       220                    
pF1KE6 GQIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKE------------
       :::::::::::: :::..:::  ::.::.: ::::::.:::.. ::::            
CCDS55 GQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVP
            140       150       160       170       180       190  

                                230       240       250       260  
pF1KE6 --------------------------VGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADAD
                                 .:..:: ::: ::::::::::::::::::..:::
CCDS55 GFGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDAD
            200       210       220       230       240       250  

            270       280       290       300       310       320  
pF1KE6 LDYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQG
       .:.:::::: ..:::::::: :::: ::.:.::.:::.::: ::: ::::.:::  ::::
CCDS55 MDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQG
            260       270       280       290       300       310  

            330       340       350       360       370       380  
pF1KE6 PQIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFG
       ::.:. :..:::  :..:  ::::: :::   . .:.::.::::..: : : ::::::::
CCDS55 PQVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFG
            320       330       340       350       360       370  

            390       400       410       420       430       440  
pF1KE6 PVQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQ
       ::..::.:::..::. ::::: .::.:::::.:..::  .:.:.::::::.:::....::
CCDS55 PVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQ
            380       390       400       410       420       430  

            450       460       470       480
pF1KE6 SPFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
       :::::.::::.:::.::.::. :.::::::::.:::::
CCDS55 SPFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
            440       450       460       470

>>CCDS9155.1 ALDH2 gene_id:217|Hs108|chr12                (517 aa)
 initn: 1201 init1: 1201 opt: 1201  Z-score: 1494.2  bits: 286.0 E(32554): 6.6e-77
Smith-Waterman score: 2062; 61.0% identity (81.7% similar) in 498 aa overlap (21-480:20-517)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MTSSKIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNP
                           :. . .:.:. . :.  ..:::::::... : ..::. ::
CCDS91  MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNP
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 ATGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVL
       .::: .:.: :.:: :.::::.::: ::.::: :::::::.:::::..::::.::::. :
CCDS91 STGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYL
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 ATMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVC
       :..:.:..:::.. .. :::. :.: .::::::::: :: :::.:::.:..:::::.:::
CCDS91 AALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVC
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220                    
pF1KE6 GQIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKE------------
       :::::::::::: :::..:::  ::.::.: ::::::.:::.. ::::            
CCDS91 GQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVP
     180       190       200       210       220       230         

                                230       240       250       260  
pF1KE6 --------------------------VGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADAD
                                 .:..:: ::: ::::::::::::::::::..:::
CCDS91 GFGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDAD
     240       250       260       270       280       290         

            270       280       290       300       310       320  
pF1KE6 LDYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQG
       .:.:::::: ..:::::::: :::: ::.:.::.:::.::: ::: ::::.:::  ::::
CCDS91 MDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQG
     300       310       320       330       340       350         

            330       340       350       360       370       380  
pF1KE6 PQIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFG
       ::.:. :..:::  :..:  ::::: :::   . .:.::.::::..: : : ::::::::
CCDS91 PQVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFG
     360       370       380       390       400       410         

            390       400       410       420       430       440  
pF1KE6 PVQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQ
       ::..::.:::..::. ::::: .::.:::::.:..::  .:.:.::::::.:::....::
CCDS91 PVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQ
     420       430       440       450       460       470         

            450       460       470       480
pF1KE6 SPFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
       :::::.::::.:::.::.::. :.::::::::.:::::
CCDS91 SPFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
     480       490       500       510       

>>CCDS6615.1 ALDH1B1 gene_id:219|Hs108|chr9               (517 aa)
 initn: 1180 init1: 1180 opt: 1180  Z-score: 1468.1  bits: 281.1 E(32554): 1.9e-75
Smith-Waterman score: 2051; 60.5% identity (81.4% similar) in 501 aa overlap (18-480:17-517)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MTSSKIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNP
                        : ..:   ::::  : .: :...:::::::.. : ..::. ::
CCDS66  MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNP
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 ATGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVL
       .::: . .: :.:.::.:.::.::: :: ::: :::::::::::::..:::::::::. :
CCDS66 TTGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNRLADLVERDRVYL
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 ATMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVC
       :..:.:..:::: ... .::. :::..::.:::::: :: :::.::..: ::::::.:::
CCDS66 ASLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVC
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220                    
pF1KE6 GQIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKE------------
       ::::::::::.: .::.::::  :::::.: ::::::::::...::::            
CCDS66 GQIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIIT
     180       190       200       210       220       230         

                                230       240       250       260  
pF1KE6 --------------------------VGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADAD
                                 ::.:::.::: :::::::::::::::.:..::::
CCDS66 GYGPTAGAAIAQHVDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADAD
     240       250       260       270       280       290         

            270       280       290       300       310       320  
pF1KE6 LDYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQG
       ...:::: :...:::.:::: :::: :::::::.::..:.::.::.: ::.::.  :.::
CCDS66 MEHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQG
     300       310       320       330       340       350         

            330       340       350       360       370       380  
pF1KE6 PQIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFG
       ::.::.:....:  :: :  ::::: :::. .:..::::.::::..: ::::::::::::
CCDS66 PQVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFG
     360       370       380       390       400       410         

            390       400       410       420       430       440  
pF1KE6 PVQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQ
       ::: ...:: ..::.:::::. .::.::::: :..::.  ..:.::::::.: :: .. .
CCDS66 PVQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCH
     420       430       440       450       460       470         

            450       460       470       480
pF1KE6 SPFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
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CCDS66 TPFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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