FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1481, 343 aa 1>>>pF1KE1481 343 - 343 aa - 343 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1796+/-0.000402; mu= 3.0206+/- 0.025 mean_var=180.7932+/-38.578, 0's: 0 Z-trim(117.3): 124 B-trim: 1546 in 1/54 Lambda= 0.095386 statistics sampled from 29114 (29267) to 29114 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.343), width: 16 Scan time: 7.780 The best scores are: opt bits E(85289) NP_653249 (OMIM: 616478) leucine-rich repeat and g ( 825) 473 77.6 1.1e-13 XP_016867238 (OMIM: 616478) PREDICTED: leucine-ric ( 962) 304 54.4 1.2e-06 XP_016869719 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin (1324) 263 48.9 7.6e-05 XP_016869718 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin (1458) 263 48.9 8.2e-05 XP_006717007 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin (1499) 263 48.9 8.4e-05 XP_016869716 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin (1700) 263 48.9 9.3e-05 XP_011516474 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin (1700) 263 48.9 9.3e-05 XP_016869713 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin (2240) 263 49.0 0.00011 XP_006717003 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin (2278) 263 49.0 0.00012 XP_011516472 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin (2281) 263 49.0 0.00012 XP_011516471 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin (2300) 263 49.0 0.00012 XP_016869712 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin (2302) 263 49.0 0.00012 XP_011516470 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin (2315) 263 49.0 0.00012 NP_008949 (OMIM: 605496) centriolin isoform 1 [Hom (2325) 263 49.0 0.00012 XP_005251736 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin (2325) 263 49.0 0.00012 XP_011516469 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin (2340) 263 49.0 0.00012 XP_011516468 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin (2340) 263 49.0 0.00012 NP_001258369 (OMIM: 603191) nuclear encoded mitoch ( 255) 203 40.1 0.0064 NP_004919 (OMIM: 603191) nuclear encoded mitochond ( 256) 203 40.1 0.0065 NP_848547 (OMIM: 613190,613193) dynein assembly fa ( 725) 209 41.2 0.0082 XP_006721192 (OMIM: 613190,613193) PREDICTED: dyne ( 727) 209 41.2 0.0082 XP_011521157 (OMIM: 613190,613193) PREDICTED: dyne ( 741) 209 41.2 0.0084 XP_011521156 (OMIM: 613190,613193) PREDICTED: dyne ( 743) 209 41.2 0.0084 XP_016878407 (OMIM: 613190,613193) PREDICTED: dyne ( 756) 209 41.2 0.0085 XP_011521155 (OMIM: 613190,613193) PREDICTED: dyne ( 772) 209 41.3 0.0086 NP_001258370 (OMIM: 603191) nuclear encoded mitoch ( 375) 203 40.2 0.0087 XP_016883959 (OMIM: 603191) PREDICTED: nuclear enc ( 323) 201 39.9 0.0094 NP_001290330 (OMIM: 615864) centrosomal protein of ( 806) 208 41.1 0.0098 >>NP_653249 (OMIM: 616478) leucine-rich repeat and guany (825 aa) initn: 343 init1: 124 opt: 473 Z-score: 367.0 bits: 77.6 E(85289): 1.1e-13 Smith-Waterman score: 473; 32.9% identity (64.8% similar) in 304 aa overlap (16-315:73-372) 10 20 30 40 pF1KE1 MSDEDDLEDSEPDQDDSEKEEDEKETEEGEDYRKEGEEFP-EEWL ::. .::. : : : . .:.: . :: . NP_653 SFPMGQKTKGSSNIASSYLLQQLMHRYQELDSDGDEDQGEGEAGSEESSESEMLNLEEEF 50 60 70 80 90 100 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 PTPLTEDMMKEGLSLLCKTGNGLAHAYVKLEVKERDLTDIYLLRSYIHLRYVDISENHLT : :. . ..: : ..:.: ..:..: .. .: :. .: .:.::. .:.: :.. NP_653 DGVLREEAVAKALHHLGRSGSGTEQVYLNLTLSGCNLIDVSILCGYVHLQKLDLSANKIE 110 120 130 140 150 160 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 DLSPLNYLTHLLWLKADGNLLRSAQMNELP--YLQIASFAYNQITDTEGIS-HPRLETLN ::: .. . .:: :.:. : : .. .: : :. :.:..:::.. .: . : : NP_653 DLSCVSCMPYLLELNASQNNL-TTFFNFKPPKNLKKADFSHNQISEICDLSAYHALTKLI 170 180 190 200 210 220 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 LKGNSIHMVTGLDPEKLISLHTVELRGNQLESTLGINLPKLKNLYLAQNMLKKVEGLEDL : :: :. ..:: : .: . : .:.. . :.: .: : :..:... . ::::: NP_653 LDGNEIEEISGL--EMCNNLIHLSLANNKITTINGLNKLPIKILCLSNNQIEMITGLEDL 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 SNLTTLHLRDNQIDTLSGFSREMKSLQYLNLRGNMVANLGELAKLRDLPKLRALVLLDNP . : .: : :::..:.:. .. :. .::. : .:.: :. ...:: ::.: ::.:: NP_653 KALQNLDLSHNQISSLQGL-ENHDLLEVINLEDNKIAELREIEYIKNLPILRVLNLLENP 280 290 300 310 320 330 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 CTDETSYRQEALVQMPYLERLDKEFYEEEERAEADVIRQRLKEEKEQEPEPQRDLEPEQS ... : .. .. : .::.. . ::.. : NP_653 IQEKSEYWFFVIFMLLRLTELDQKKIKVEEKVSAVNKYDPPPEVVAAQDHLTHVVNSVMQ 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 LI NP_653 PQRIFDSTLPSLDAPYPMLILAGPEACGKRELAHRLCRQFSTYFRYGACHTTRPPYFGEG 400 410 420 430 440 450 >>XP_016867238 (OMIM: 616478) PREDICTED: leucine-rich re (962 aa) initn: 279 init1: 124 opt: 304 Z-score: 240.4 bits: 54.4 E(85289): 1.2e-06 Smith-Waterman score: 304; 33.3% identity (64.3% similar) in 207 aa overlap (112-315:1-203) 90 100 110 120 130 pF1KE1 TDIYLLRSYIHLRYVDISENHLTDLSPLNYLTHLLWLKADGNLLRSAQMNELP--YLQIA . .:: :.:. : : .. .: : :. : XP_016 MPYLLELNASQNNL-TTFFNFKPPKNLKKA 10 20 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 SFAYNQITDTEGIS-HPRLETLNLKGNSIHMVTGLDPEKLISLHTVELRGNQLESTLGIN .:..:::.. .: . : : : :: :. ..:: : .: . : .:.. . :.: XP_016 DFSHNQISEICDLSAYHALTKLILDGNEIEEISGL--EMCNNLIHLSLANNKITTINGLN 30 40 50 60 70 80 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 LPKLKNLYLAQNMLKKVEGLEDLSNLTTLHLRDNQIDTLSGFSREMKSLQYLNLRGNMVA .: : :..:... . :::::. : .: : :::..:.:. .. :. .::. : .: XP_016 KLPIKILCLSNNQIEMITGLEDLKALQNLDLSHNQISSLQGL-ENHDLLEVINLEDNKIA 90 100 110 120 130 140 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 NLGELAKLRDLPKLRALVLLDNPCTDETSYRQEALVQMPYLERLDKEFYEEEERAEADVI .: :. ...:: ::.: ::.:: ... : .. .. : .::.. . ::.. : XP_016 ELREIEYIKNLPILRVLNLLENPIQEKSEYWFFVIFMLLRLTELDQKKIKVEEKVSAVNK 150 160 170 180 190 200 320 330 340 pF1KE1 RQRLKEEKEQEPEPQRDLEPEQSLI XP_016 YDPPPEVVAAQDHLTHVVNSVMQPQRIFDSTLPSLDAPYPMLILAGPEACGKRELAHRLC 210 220 230 240 250 260 >>XP_016869719 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin isof (1324 aa) initn: 255 init1: 156 opt: 263 Z-score: 208.0 bits: 48.9 E(85289): 7.6e-05 Smith-Waterman score: 263; 30.9% identity (66.5% similar) in 188 aa overlap (157-337:100-280) 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SAQMNELPYLQIASFAYNQITDTEGISHPRLETLNLK-----GNSIHMVTGLDPEKLISL ...:::. :...... .: :: ..: XP_016 DHKGADSHAGVRYITEALIKKLTKQDNLALIKSLNLSLSKDGGKKFKYIENL--EKCVKL 70 80 90 100 110 120 190 200 210 220 230 pF1KE1 HTVELRGNQLESTLGIN-LPKLKNLYLAQNMLKKVEGLEDLSNLTTLHLRDNQIDTLS-G ....: : . . .. : ::..: :. : ..:.::.:.. :: :.: :.:. . XP_016 EVLNLSYNLIGKIEKLDKLLKLRELNLSYNKISKIEGIENMCNLQKLNLAGNEIEHIPVW 130 140 150 160 170 180 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 FSREMKSLQYLNLRGNMVANLGELAKLRDLPKLRALVLLDNPCTDETSYRQEALVQMPYL .....:::. :::.:: ...: ...::. : : .:.:..:: . : : .. .. : XP_016 LGKKLKSLRVLNLKGNKISSLQDISKLKPLQDLISLILVENPVVTLPHYLQFTIFHLRSL 190 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 pF1KE1 ERLDKEFYEEEERAEADVIRQRLKEEKEQEPEPQRDLEPEQSLI : :. . ..: :: .:.. :. .. : :::: XP_016 ESLEGQPVTTQDRQEA---FERFSLEEVERLE--RDLEKKMIETEELKSKQTRFLEEIKN 250 260 270 280 290 300 XP_016 QDKLNKSLKEEAMLQKQSCEELKSDLNTKNELLKQKTIELTRACQKQYELEQELAFYKID 310 320 330 340 350 360 >>XP_016869718 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin isof (1458 aa) initn: 255 init1: 156 opt: 263 Z-score: 207.4 bits: 48.9 E(85289): 8.2e-05 Smith-Waterman score: 263; 30.9% identity (66.5% similar) in 188 aa overlap (157-337:100-280) 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SAQMNELPYLQIASFAYNQITDTEGISHPRLETLNLK-----GNSIHMVTGLDPEKLISL ...:::. :...... .: :: ..: XP_016 DHKGADSHAGVRYITEALIKKLTKQDNLALIKSLNLSLSKDGGKKFKYIENL--EKCVKL 70 80 90 100 110 120 190 200 210 220 230 pF1KE1 HTVELRGNQLESTLGIN-LPKLKNLYLAQNMLKKVEGLEDLSNLTTLHLRDNQIDTLS-G ....: : . . .. : ::..: :. : ..:.::.:.. :: :.: :.:. . XP_016 EVLNLSYNLIGKIEKLDKLLKLRELNLSYNKISKIEGIENMCNLQKLNLAGNEIEHIPVW 130 140 150 160 170 180 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 FSREMKSLQYLNLRGNMVANLGELAKLRDLPKLRALVLLDNPCTDETSYRQEALVQMPYL .....:::. :::.:: ...: ...::. : : .:.:..:: . : : .. .. : XP_016 LGKKLKSLRVLNLKGNKISSLQDISKLKPLQDLISLILVENPVVTLPHYLQFTIFHLRSL 190 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 pF1KE1 ERLDKEFYEEEERAEADVIRQRLKEEKEQEPEPQRDLEPEQSLI : :. . ..: :: .:.. :. .. : :::: XP_016 ESLEGQPVTTQDRQEA---FERFSLEEVERLE--RDLEKKMIETEELKSKQTRFLEEIKN 250 260 270 280 290 300 XP_016 QDKLNKSLKEEAMLQKQSCEELKSDLNTKNELLKQKTIELTRACQKQYELEQELAFYKID 310 320 330 340 350 360 >>XP_006717007 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin isof (1499 aa) initn: 255 init1: 156 opt: 263 Z-score: 207.2 bits: 48.9 E(85289): 8.4e-05 Smith-Waterman score: 263; 30.9% identity (66.5% similar) in 188 aa overlap (157-337:100-280) 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SAQMNELPYLQIASFAYNQITDTEGISHPRLETLNLK-----GNSIHMVTGLDPEKLISL ...:::. :...... .: :: ..: XP_006 DHKGADSHAGVRYITEALIKKLTKQDNLALIKSLNLSLSKDGGKKFKYIENL--EKCVKL 70 80 90 100 110 120 190 200 210 220 230 pF1KE1 HTVELRGNQLESTLGIN-LPKLKNLYLAQNMLKKVEGLEDLSNLTTLHLRDNQIDTLS-G ....: : . . .. : ::..: :. : ..:.::.:.. :: :.: :.:. . XP_006 EVLNLSYNLIGKIEKLDKLLKLRELNLSYNKISKIEGIENMCNLQKLNLAGNEIEHIPVW 130 140 150 160 170 180 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 FSREMKSLQYLNLRGNMVANLGELAKLRDLPKLRALVLLDNPCTDETSYRQEALVQMPYL .....:::. :::.:: ...: ...::. : : .:.:..:: . : : .. .. : XP_006 LGKKLKSLRVLNLKGNKISSLQDISKLKPLQDLISLILVENPVVTLPHYLQFTIFHLRSL 190 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 pF1KE1 ERLDKEFYEEEERAEADVIRQRLKEEKEQEPEPQRDLEPEQSLI : :. . ..: :: .:.. :. .. : :::: XP_006 ESLEGQPVTTQDRQEA---FERFSLEEVERLE--RDLEKKMIETEELKSKQTRFLEEIKN 250 260 270 280 290 300 XP_006 QDKLNKSLKEEAMLQKQSCEELKSDLNTKNELLKQKTIELTRACQKQYELEQELAFYKID 310 320 330 340 350 360 >>XP_016869716 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin isof (1700 aa) initn: 255 init1: 156 opt: 263 Z-score: 206.4 bits: 48.9 E(85289): 9.3e-05 Smith-Waterman score: 263; 30.9% identity (66.5% similar) in 188 aa overlap (157-337:100-280) 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SAQMNELPYLQIASFAYNQITDTEGISHPRLETLNLK-----GNSIHMVTGLDPEKLISL ...:::. :...... .: :: ..: XP_016 DHKGADSHAGVRYITEALIKKLTKQDNLALIKSLNLSLSKDGGKKFKYIENL--EKCVKL 70 80 90 100 110 120 190 200 210 220 230 pF1KE1 HTVELRGNQLESTLGIN-LPKLKNLYLAQNMLKKVEGLEDLSNLTTLHLRDNQIDTLS-G ....: : . . .. : ::..: :. : ..:.::.:.. :: :.: :.:. . XP_016 EVLNLSYNLIGKIEKLDKLLKLRELNLSYNKISKIEGIENMCNLQKLNLAGNEIEHIPVW 130 140 150 160 170 180 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 FSREMKSLQYLNLRGNMVANLGELAKLRDLPKLRALVLLDNPCTDETSYRQEALVQMPYL .....:::. :::.:: ...: ...::. : : .:.:..:: . : : .. .. : XP_016 LGKKLKSLRVLNLKGNKISSLQDISKLKPLQDLISLILVENPVVTLPHYLQFTIFHLRSL 190 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 pF1KE1 ERLDKEFYEEEERAEADVIRQRLKEEKEQEPEPQRDLEPEQSLI : :. . ..: :: .:.. :. .. : :::: XP_016 ESLEGQPVTTQDRQEA---FERFSLEEVERLE--RDLEKKMIETEELKSKQTRFLEEIKN 250 260 270 280 290 300 XP_016 QDKLNKSLKEEAMLQKQSCEELKSDLNTKNELLKQKTIELTRACQKQYELEQELAFYKID 310 320 330 340 350 360 >>XP_011516474 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin isof (1700 aa) initn: 255 init1: 156 opt: 263 Z-score: 206.4 bits: 48.9 E(85289): 9.3e-05 Smith-Waterman score: 263; 30.9% identity (66.5% similar) in 188 aa overlap (157-337:100-280) 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SAQMNELPYLQIASFAYNQITDTEGISHPRLETLNLK-----GNSIHMVTGLDPEKLISL ...:::. :...... .: :: ..: XP_011 DHKGADSHAGVRYITEALIKKLTKQDNLALIKSLNLSLSKDGGKKFKYIENL--EKCVKL 70 80 90 100 110 120 190 200 210 220 230 pF1KE1 HTVELRGNQLESTLGIN-LPKLKNLYLAQNMLKKVEGLEDLSNLTTLHLRDNQIDTLS-G ....: : . . .. : ::..: :. : ..:.::.:.. :: :.: :.:. . XP_011 EVLNLSYNLIGKIEKLDKLLKLRELNLSYNKISKIEGIENMCNLQKLNLAGNEIEHIPVW 130 140 150 160 170 180 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 FSREMKSLQYLNLRGNMVANLGELAKLRDLPKLRALVLLDNPCTDETSYRQEALVQMPYL .....:::. :::.:: ...: ...::. : : .:.:..:: . : : .. .. : XP_011 LGKKLKSLRVLNLKGNKISSLQDISKLKPLQDLISLILVENPVVTLPHYLQFTIFHLRSL 190 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 pF1KE1 ERLDKEFYEEEERAEADVIRQRLKEEKEQEPEPQRDLEPEQSLI : :. . ..: :: .:.. :. .. : :::: XP_011 ESLEGQPVTTQDRQEA---FERFSLEEVERLE--RDLEKKMIETEELKSKQTRFLEEIKN 250 260 270 280 290 300 XP_011 QDKLNKSLKEEAMLQKQSCEELKSDLNTKNELLKQKTIELTRACQKQYELEQELAFYKID 310 320 330 340 350 360 >>XP_016869713 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin isof (2240 aa) initn: 228 init1: 156 opt: 263 Z-score: 204.8 bits: 49.0 E(85289): 0.00011 Smith-Waterman score: 263; 30.9% identity (66.5% similar) in 188 aa overlap (157-337:100-280) 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SAQMNELPYLQIASFAYNQITDTEGISHPRLETLNLK-----GNSIHMVTGLDPEKLISL ...:::. :...... .: :: ..: XP_016 DHKGADSHAGVRYITEALIKKLTKQDNLALIKSLNLSLSKDGGKKFKYIENL--EKCVKL 70 80 90 100 110 120 190 200 210 220 230 pF1KE1 HTVELRGNQLESTLGIN-LPKLKNLYLAQNMLKKVEGLEDLSNLTTLHLRDNQIDTLS-G ....: : . . .. : ::..: :. : ..:.::.:.. :: :.: :.:. . XP_016 EVLNLSYNLIGKIEKLDKLLKLRELNLSYNKISKIEGIENMCNLQKLNLAGNEIEHIPVW 130 140 150 160 170 180 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 FSREMKSLQYLNLRGNMVANLGELAKLRDLPKLRALVLLDNPCTDETSYRQEALVQMPYL .....:::. :::.:: ...: ...::. : : .:.:..:: . : : .. .. : XP_016 LGKKLKSLRVLNLKGNKISSLQDISKLKPLQDLISLILVENPVVTLPHYLQFTIFHLRSL 190 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 pF1KE1 ERLDKEFYEEEERAEADVIRQRLKEEKEQEPEPQRDLEPEQSLI : :. . ..: :: .:.. :. .. : :::: XP_016 ESLEGQPVTTQDRQEA---FERFSLEEVERLE--RDLEKKMIETEELKSKQTRFLEEIKN 250 260 270 280 290 300 XP_016 QDKLNKSLKEEAMLQKQSCEELKSDLNTKNELLKQKTIELTRACQKQYELEQELAFYKID 310 320 330 340 350 360 >>XP_006717003 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin isof (2278 aa) initn: 258 init1: 156 opt: 263 Z-score: 204.7 bits: 49.0 E(85289): 0.00012 Smith-Waterman score: 263; 30.9% identity (66.5% similar) in 188 aa overlap (157-337:100-280) 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SAQMNELPYLQIASFAYNQITDTEGISHPRLETLNLK-----GNSIHMVTGLDPEKLISL ...:::. :...... .: :: ..: XP_006 DHKGADSHAGVRYITEALIKKLTKQDNLALIKSLNLSLSKDGGKKFKYIENL--EKCVKL 70 80 90 100 110 120 190 200 210 220 230 pF1KE1 HTVELRGNQLESTLGIN-LPKLKNLYLAQNMLKKVEGLEDLSNLTTLHLRDNQIDTLS-G ....: : . . .. : ::..: :. : ..:.::.:.. :: :.: :.:. . XP_006 EVLNLSYNLIGKIEKLDKLLKLRELNLSYNKISKIEGIENMCNLQKLNLAGNEIEHIPVW 130 140 150 160 170 180 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 FSREMKSLQYLNLRGNMVANLGELAKLRDLPKLRALVLLDNPCTDETSYRQEALVQMPYL .....:::. :::.:: ...: ...::. : : .:.:..:: . : : .. .. : XP_006 LGKKLKSLRVLNLKGNKISSLQDISKLKPLQDLISLILVENPVVTLPHYLQFTIFHLRSL 190 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 pF1KE1 ERLDKEFYEEEERAEADVIRQRLKEEKEQEPEPQRDLEPEQSLI : :. . ..: :: .:.. :. .. : :::: XP_006 ESLEGQPVTTQDRQEA---FERFSLEEVERLE--RDLEKKMIETEELKSKQTRFLEEIKN 250 260 270 280 290 300 XP_006 QDKLNKSLKEEAMLQKQSCEELKSDLNTKNELLKQKTIELTRACQKQYELEQELAFYKID 310 320 330 340 350 360 >>XP_011516472 (OMIM: 605496) PREDICTED: centriolin isof (2281 aa) initn: 228 init1: 156 opt: 263 Z-score: 204.7 bits: 49.0 E(85289): 0.00012 Smith-Waterman score: 263; 30.9% identity (66.5% similar) in 188 aa overlap (157-337:100-280) 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SAQMNELPYLQIASFAYNQITDTEGISHPRLETLNLK-----GNSIHMVTGLDPEKLISL ...:::. :...... .: :: ..: XP_011 DHKGADSHAGVRYITEALIKKLTKQDNLALIKSLNLSLSKDGGKKFKYIENL--EKCVKL 70 80 90 100 110 120 190 200 210 220 230 pF1KE1 HTVELRGNQLESTLGIN-LPKLKNLYLAQNMLKKVEGLEDLSNLTTLHLRDNQIDTLS-G ....: : . . .. : ::..: :. : ..:.::.:.. :: :.: :.:. . XP_011 EVLNLSYNLIGKIEKLDKLLKLRELNLSYNKISKIEGIENMCNLQKLNLAGNEIEHIPVW 130 140 150 160 170 180 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 FSREMKSLQYLNLRGNMVANLGELAKLRDLPKLRALVLLDNPCTDETSYRQEALVQMPYL .....:::. :::.:: ...: ...::. : : .:.:..:: . : : .. .. : XP_011 LGKKLKSLRVLNLKGNKISSLQDISKLKPLQDLISLILVENPVVTLPHYLQFTIFHLRSL 190 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 pF1KE1 ERLDKEFYEEEERAEADVIRQRLKEEKEQEPEPQRDLEPEQSLI : :. . ..: :: .:.. :. .. : :::: XP_011 ESLEGQPVTTQDRQEA---FERFSLEEVERLE--RDLEKKMIETEELKSKQTRFLEEIKN 250 260 270 280 290 300 XP_011 QDKLNKSLKEEAMLQKQSCEELKSDLNTKNELLKQKTIELTRACQKQYELEQELAFYKID 310 320 330 340 350 360 343 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 00:16:37 2016 done: Mon Nov 7 00:16:38 2016 Total Scan time: 7.780 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]