FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1373, 439 aa 1>>>pF1KE1373 439 - 439 aa - 439 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6160+/-0.0008; mu= 11.4618+/- 0.048 mean_var=99.2888+/-19.924, 0's: 0 Z-trim(110.4): 102 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.128714 statistics sampled from 11450 (11565) to 11450 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.719), E-opt: 0.2 (0.355), width: 16 Scan time: 3.360 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 489) 2499 474.4 1.1e-133 CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 650) 2436 462.7 4.8e-130 CCDS42616.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 2436 462.7 4.8e-130 CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 2434 462.3 6.2e-130 CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 652) 2434 462.3 6.2e-130 CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 634) 2431 461.8 8.9e-130 CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 483) 2349 446.5 2.7e-125 CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 597) 2300 437.4 1.8e-122 CCDS62792.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 510) 2297 436.9 2.3e-122 CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 598) 2297 436.9 2.6e-122 CCDS12900.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 466) 2279 433.5 2.1e-121 CCDS74453.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 454) 2149 409.3 3.9e-114 CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 631) 1924 367.6 1.9e-101 CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 632) 1924 367.6 1.9e-101 CCDS42610.1 LILRA6 gene_id:79168|Hs108|chr19 ( 481) 1906 364.2 1.6e-100 CCDS12890.1 LILRA4 gene_id:23547|Hs108|chr19 ( 499) 1846 353.1 3.6e-97 CCDS62791.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 482) 1746 334.5 1.4e-91 CCDS46176.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 591) 1694 324.9 1.3e-88 CCDS12885.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 590) 1692 324.5 1.7e-88 CCDS62802.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 289) 1249 242.1 5.4e-64 CCDS42611.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 491) 1071 209.2 7.5e-54 CCDS12888.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 299) 813 161.2 1.3e-39 CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 ( 410) 769 153.1 4.9e-37 CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 ( 444) 758 151.0 2.2e-36 CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 455) 754 150.3 3.7e-36 CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 438) 735 146.8 4.1e-35 CCDS42618.1 LILRB4 gene_id:11006|Hs108|chr19 ( 447) 722 144.4 2.2e-34 CCDS12902.1 LILRB4 gene_id:11006|Hs108|chr19 ( 448) 722 144.4 2.2e-34 CCDS12889.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 287) 707 141.5 1.1e-33 CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 ( 341) 553 112.9 5e-25 CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 ( 348) 509 104.7 1.5e-22 CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 342) 467 96.9 3.2e-20 CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 273) 460 95.6 6.5e-20 CCDS46182.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 287) 450 93.7 2.5e-19 CCDS46181.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 303) 450 93.8 2.6e-19 CCDS12911.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 304) 450 93.8 2.6e-19 CCDS55490.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX (1327) 400 84.8 5.7e-16 CCDS14629.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX (1336) 400 84.8 5.7e-16 CCDS55491.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX (1341) 400 84.8 5.7e-16 CCDS46184.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 339) 340 73.4 4e-13 CCDS42626.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 620) 340 73.5 6.7e-13 CCDS58678.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 321) 328 71.1 1.8e-12 CCDS62789.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 271) 302 66.3 4.4e-11 CCDS74444.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 282) 302 66.3 4.6e-11 CCDS12876.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 286) 302 66.3 4.6e-11 CCDS46173.1 TARM1 gene_id:441864|Hs108|chr19 ( 271) 297 65.3 8.4e-11 >>CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 (489 aa) initn: 2499 init1: 2499 opt: 2499 Z-score: 2513.4 bits: 474.4 E(32554): 1.1e-133 Smith-Waterman score: 2499; 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83.4% identity (90.2% similar) in 439 aa overlap (1-438:1-439) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MTSILTVLICLGLSLDPRTHVQAGPLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGSLETQEYHL :: :::::::::::: :::::::: ::::::::::::::::::::::::::. :::::.: CCDS42 MTPILTVLICLGLSLGPRTHVQAGHLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGGQETQEYRL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 YREKKTALWITRIPQELVKKGQFPILSITWEHAGRYCCIYGSHTVGLSESSDPLELVVTG ::::::: ::::::::::::::::: ::::::.::: : ::: :.: ::::::::::::: CCDS42 YREKKTAPWITRIPQELVKKGQFPIPSITWEHTGRYRCYYGSDTAGRSESSDPLELVVTG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTIQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSHSHARGSSRA :: :::::: :::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::. :::::::: CCDS42 AYIKPTLSAQPSPVVNSGGNVTLQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 IFSVGPVSPSRRWSYRCYGYDSRAPYVWSLPSDLLGLLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAPGE ::::::::::::: ::::.::: .:: :::::::: ::: ::::::::::::::.::: : CCDS42 IFSVGPVSPSRRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 KLTFQCGSDAGYDRFVLYKEWGRDFLQRPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYTCSGA ::.::::::::.::::::. ::::: : :::::::::::::::::::::::: : :: CCDS42 TLTLQCGSDAGYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 YNLSSEWSAPSDPLDILITGQIRARPFLSVRPGPTVASGENVTLLCQSQGGMHTFLLTKE .:::::::::::::::::.::. : :::.::::::::::::::::::: :.::::::: CCDS42 HNLSSEWSAPSDPLDILIAGQFYDRVSLSVQPGPTVASGENVTLLCQSQGWMQTFLLTKE 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 GAADSPLRLKSKRQSHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLSSNPYLLTHPSDPLELVVS ::::.: ::.: ::.::::::::.::::::::::::::: ::.:::::::::::::::: CCDS42 GAADDPWRLRSTYQSQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVS 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE1 G-AAETLSPPQNKSDSKAGE : .. :: . ....:: CCDS42 GPSGGPSSPTTGPTSTSAGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVILLLLLLLLL 430 440 450 460 470 480 >>CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 (652 aa) initn: 2423 init1: 2423 opt: 2434 Z-score: 2446.2 bits: 462.3 E(32554): 6.2e-130 Smith-Waterman score: 2434; 83.4% identity (90.2% similar) in 439 aa overlap (1-438:1-439) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MTSILTVLICLGLSLDPRTHVQAGPLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGSLETQEYHL :: :::::::::::: :::::::: ::::::::::::::::::::::::::. :::::.: CCDS42 MTPILTVLICLGLSLGPRTHVQAGHLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGGQETQEYRL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 YREKKTALWITRIPQELVKKGQFPILSITWEHAGRYCCIYGSHTVGLSESSDPLELVVTG ::::::: ::::::::::::::::: ::::::.::: : ::: :.: ::::::::::::: CCDS42 YREKKTAPWITRIPQELVKKGQFPIPSITWEHTGRYRCYYGSDTAGRSESSDPLELVVTG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTIQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSHSHARGSSRA :: :::::: :::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::. :::::::: CCDS42 AYIKPTLSAQPSPVVNSGGNVTLQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 IFSVGPVSPSRRWSYRCYGYDSRAPYVWSLPSDLLGLLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAPGE ::::::::::::: ::::.::: .:: :::::::: ::: ::::::::::::::.::: : CCDS42 IFSVGPVSPSRRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 KLTFQCGSDAGYDRFVLYKEWGRDFLQRPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYTCSGA ::.::::::::.::::::. ::::: : :::::::::::::::::::::::: : :: CCDS42 TLTLQCGSDAGYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 YNLSSEWSAPSDPLDILITGQIRARPFLSVRPGPTVASGENVTLLCQSQGGMHTFLLTKE .:::::::::::::::::.::. : :::.::::::::::::::::::: :.::::::: CCDS42 HNLSSEWSAPSDPLDILIAGQFYDRVSLSVQPGPTVASGENVTLLCQSQGWMQTFLLTKE 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 GAADSPLRLKSKRQSHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLSSNPYLLTHPSDPLELVVS ::::.: ::.: ::.::::::::.::::::::::::::: ::.:::::::::::::::: CCDS42 GAADDPWRLRSTYQSQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVS 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE1 G-AAETLSPPQNKSDSKAGE : .. :: . ....:: CCDS42 GPSGGPSSPTTGPTSTSAGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVILLLLLLLLL 430 440 450 460 470 480 >>CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 (634 aa) initn: 2818 init1: 2431 opt: 2431 Z-score: 2443.4 bits: 461.8 E(32554): 8.9e-130 Smith-Waterman score: 2431; 83.3% identity (89.7% similar) in 438 aa overlap (1-438:1-438) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MTSILTVLICLGLSLDPRTHVQAGPLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGSLETQEYHL :: :::::::::::: :::::::: ::::::::::::::::::::::::::. :::::.: CCDS62 MTPILTVLICLGLSLGPRTHVQAGHLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGGQETQEYRL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 YREKKTALWITRIPQELVKKGQFPILSITWEHAGRYCCIYGSHTVGLSESSDPLELVVTG ::::::: ::::::::::::::::: ::::::.::: : ::: :.: ::::::::::::: CCDS62 YREKKTAPWITRIPQELVKKGQFPIPSITWEHTGRYRCYYGSDTAGRSESSDPLELVVTG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTIQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSHSHARGSSRA :: :::::: :::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::. :::::::: CCDS62 AYIKPTLSAQPSPVVNSGGNVTLQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 IFSVGPVSPSRRWSYRCYGYDSRAPYVWSLPSDLLGLLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAPGE ::::::::::::: ::::.::: .:: :::::::: ::: ::::::::::::::.::: : CCDS62 IFSVGPVSPSRRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 KLTFQCGSDAGYDRFVLYKEWGRDFLQRPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYTCSGA ::.::::::::.::::::. ::::: : :::::::::::::::::::::::: : :: CCDS62 TLTLQCGSDAGYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 YNLSSEWSAPSDPLDILITGQIRARPFLSVRPGPTVASGENVTLLCQSQGGMHTFLLTKE .:::::::::::::::::.::. : :::.::::::::::::::::::: :.::::::: CCDS62 HNLSSEWSAPSDPLDILIAGQFYDRVSLSVQPGPTVASGENVTLLCQSQGWMQTFLLTKE 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 GAADSPLRLKSKRQSHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLSSNPYLLTHPSDPLELVVS ::::.: ::.: ::.::::::::.::::::::::::::: ::.:::::::::::::::: CCDS62 GAADDPWRLRSTYQSQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVS 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE1 GAAETLSPPQNKSDSKAGE .. : . :: ..: CCDS62 AGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVILLLLLLLLLFLILRHRRQGKHWTSTQ 430 440 450 460 470 480 >>CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 (483 aa) initn: 2218 init1: 1812 opt: 2349 Z-score: 2362.9 bits: 446.5 E(32554): 2.7e-125 Smith-Waterman score: 2349; 81.8% identity (90.3% similar) in 435 aa overlap (1-435:1-433) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MTSILTVLICLGLSLDPRTHVQAGPLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGSLETQEYHL :: :::::::::::: :::::::: :::::::::::::: :::::::::::::...:::: CCDS46 MTPILTVLICLGLSLGPRTHVQAGHLPKPTLWAEPGSVIIQGSPVTLRCQGSLQAEEYHL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 YREKKTALWITRIPQELVKKGQFPILSITWEHAGRYCCIYGSHTVGLSESSDPLELVVTG :::.:.: :. :: :: :.::::: :::::::::: : : ::. . :: :::::::::: CCDS46 YRENKSASWVRRI-QEPGKNGQFPIPSITWEHAGRYHCQYYSHNHS-SEYSDPLELVVTG 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTIQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSHSHARGSSRA ::::::::::::::::::::::.:: :::::::::::::::::::: ::::::::: : : CCDS46 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTLQCVSQVAFDGFILCKEGEDEHPQRLNSHSHARGWSWA 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 IFSVGPVSPSRRWSYRCYGYDSRAPYVWSLPSDLLGLLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAPGE ::::::::::::::::::.::: .::::::::::: ::::::::::::::::::.::::: CCDS46 IFSVGPVSPSRRWSYRCYAYDSNSPYVWSLPSDLLELLVPGVSKKPSLSVQPGPMVAPGE 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 KLTFQCGSDAGYDRFVLYKEWGRDFLQRPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYTCSGA .::.:: ::.:::::::::: :::::::: ::::::::::::::::: :.:::: : .: CCDS46 SLTLQCVSDVGYDRFVLYKEGERDFLQRPGWQPQAGLSQANFTLGPVSPSHGGQYRCYSA 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 YNLSSEWSAPSDPLDILITGQIRARPFLSVRPGPTVASGENVTLLCQSQGGMHTFLLTKE .::::::::::::::::::::. :: :::.: :::: :.::::::::.: .:::::::: CCDS46 HNLSSEWSAPSDPLDILITGQFYDRPSLSVQPVPTVAPGKNVTLLCQSRGQFHTFLLTKE 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 GAADSPLRLKSKRQSHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLSSNPYLLTHPSDPLELVVS ::. ::.:.:..:... :::: :.::::::.::::::.:::::::::. :::::::::: CCDS46 GAGHPPLHLRSEHQAQQNQAEFRMGPVTSAHVGTYRCYSSLSSNPYLLSLPSDPLELVVS 360 370 380 390 400 410 430 pF1KE1 GAAETLSPPQNKSDSKAGE ::::::: :::.:: CCDS46 EAAETLSPSQNKTDSTTTSLGQHPQDYTVENLIRMGVAGLVLVVLGILLFEAQHSQRSLQ 420 430 440 450 460 470 >>CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 (597 aa) initn: 2300 init1: 1789 opt: 2300 Z-score: 2312.3 bits: 437.4 E(32554): 1.8e-122 Smith-Waterman score: 2300; 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80.4% identity (89.0% similar) in 429 aa overlap (1-429:1-428) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MTSILTVLICLGLSLDPRTHVQAGPLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGSLETQEYHL :: :.:::::::::: :::.::.: .::::::::: ::::::::::: ::::::.:::.: CCDS62 MTPIVTVLICLGLSLGPRTRVQTGTIPKPTLWAEPDSVITQGSPVTLSCQGSLEAQEYRL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 YREKKTALWITRIPQELVKKGQFPILSITWEHAGRYCCIYGSHTVGLSESSDPLELVVTG :::::.: ::::: ::::.::: : ::::::.::: : : :.. :: :::: ::.:: CCDS62 YREKKSASWITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQYYSRAR-WSELSDPLVLVMTG 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTIQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSHSHARGSSRA :: :::::: ::::::::: ::.::.::::: ::::::::::::::::::. :::::::: CCDS62 AYPKPTLSAQPSPVVTSGGRVTLQCESQVAFGGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRA 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 IFSVGPVSPSRRWSYRCYGYDSRAPYVWSLPSDLLGLLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAPGE :::::::::.::::.:::::: .::::: ::::: :::::::::::::::::::.:::: CCDS62 IFSVGPVSPNRRWSHRCYGYDLNSPYVWSSPSDLLELLVPGVSKKPSLSVQPGPVMAPGE 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 KLTFQCGSDAGYDRFVLYKEWGRDFLQRPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYTCSGA .::.:: ::.:::::::::: ::. : ::::::::::::::::::::::::::: : :: CCDS62 SLTLQCVSDVGYDRFVLYKEGERDLRQLPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 YNLSSEWSAPSDPLDILITGQIRARPFLSVRPGPTVASGENVTLLCQSQGGMHTFLLTKE .::::: ::::::::::::::::. ::.::.::::::::::::::::: .::::::: CCDS62 HNLSSECSAPSDPLDILITGQIRGTPFISVQPGPTVASGENVTLLCQSWRQFHTFLLTKA 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 GAADSPLRLKSKRQSHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLSSNPYLLTHPSDPLELVVS ::::.::::.: .. :::::::::::::::::::::::::.:.::::.:::.::::::: CCDS62 GAADAPLRLRSIHEYPKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLNSDPYLLSHPSEPLELVVS 360 370 380 390 400 410 430 pF1KE1 GAAETLSPPQNKSDSKAGE : . ::: CCDS62 GPSMGSSPPPTGPISTPAGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVVLLLLLLLLL 420 430 440 450 460 470 >>CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 (598 aa) initn: 2300 init1: 1789 opt: 2297 Z-score: 2309.3 bits: 436.9 E(32554): 2.6e-122 Smith-Waterman score: 2297; 80.4% identity (89.0% similar) in 429 aa overlap (1-429:1-428) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MTSILTVLICLGLSLDPRTHVQAGPLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGSLETQEYHL :: :.:::::::::: :::.::.: .::::::::: ::::::::::: ::::::.:::.: CCDS12 MTPIVTVLICLGLSLGPRTRVQTGTIPKPTLWAEPDSVITQGSPVTLSCQGSLEAQEYRL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 YREKKTALWITRIPQELVKKGQFPILSITWEHAGRYCCIYGSHTVGLSESSDPLELVVTG :::::.: ::::: ::::.::: : ::::::.::: : : :.. :: :::: ::.:: CCDS12 YREKKSASWITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQYYSRAR-WSELSDPLVLVMTG 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTIQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSHSHARGSSRA :: :::::: ::::::::: ::.::.::::: ::::::::::::::::::. :::::::: CCDS12 AYPKPTLSAQPSPVVTSGGRVTLQCESQVAFGGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRA 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 IFSVGPVSPSRRWSYRCYGYDSRAPYVWSLPSDLLGLLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAPGE :::::::::.::::.:::::: .::::: ::::: :::::::::::::::::::.:::: CCDS12 IFSVGPVSPNRRWSHRCYGYDLNSPYVWSSPSDLLELLVPGVSKKPSLSVQPGPVMAPGE 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 KLTFQCGSDAGYDRFVLYKEWGRDFLQRPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYTCSGA .::.:: ::.:::::::::: ::. : ::::::::::::::::::::::::::: : :: CCDS12 SLTLQCVSDVGYDRFVLYKEGERDLRQLPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 YNLSSEWSAPSDPLDILITGQIRARPFLSVRPGPTVASGENVTLLCQSQGGMHTFLLTKE .::::: ::::::::::::::::. ::.::.::::::::::::::::: .::::::: CCDS12 HNLSSECSAPSDPLDILITGQIRGTPFISVQPGPTVASGENVTLLCQSWRQFHTFLLTKA 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 GAADSPLRLKSKRQSHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLSSNPYLLTHPSDPLELVVS ::::.::::.: .. :::::::::::::::::::::::::.:.::::.:::.::::::: CCDS12 GAADAPLRLRSIHEYPKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLNSDPYLLSHPSEPLELVVS 360 370 380 390 400 410 430 pF1KE1 GAAETLSPPQNKSDSKAGE : . ::: CCDS12 GPSMGSSPPPTGPISTPAGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVVLLLLLLLLL 420 430 440 450 460 470 439 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 00:19:33 2016 done: Mon Nov 7 00:19:34 2016 Total Scan time: 3.360 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]