FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5613, 485 aa 1>>>pF1KE5613 485 - 485 aa - 485 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0398+/-0.000957; mu= 6.7916+/- 0.058 mean_var=190.1360+/-38.107, 0's: 0 Z-trim(113.0): 129 B-trim: 853 in 1/50 Lambda= 0.093013 statistics sampled from 13558 (13700) to 13558 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.752), E-opt: 0.2 (0.421), width: 16 Scan time: 3.010 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12106.1 CELF5 gene_id:60680|Hs108|chr19 ( 485) 3280 452.5 4.7e-127 CCDS54197.1 CELF5 gene_id:60680|Hs108|chr19 ( 409) 2046 286.8 2.9e-77 CCDS10242.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 ( 481) 2033 285.1 1.1e-76 CCDS82250.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 484) 1870 263.3 4.3e-70 CCDS45857.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 484) 1851 260.7 2.5e-69 CCDS45858.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 448) 1688 238.8 9e-63 CCDS1002.1 CELF3 gene_id:11189|Hs108|chr1 ( 465) 1544 219.5 6.1e-57 CCDS32818.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 486) 1333 191.2 2.1e-48 CCDS45856.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 485) 1316 188.9 1e-47 CCDS53622.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 485) 754 113.5 5.1e-25 CCDS53623.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 512) 754 113.5 5.4e-25 CCDS53955.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 ( 344) 686 104.3 2.2e-22 CCDS53367.1 CELF3 gene_id:11189|Hs108|chr1 ( 415) 661 101.0 2.6e-21 CCDS53956.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 ( 454) 589 91.4 2.3e-18 CCDS44356.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 488) 587 91.1 2.9e-18 CCDS41488.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 490) 586 91.0 3.2e-18 CCDS44355.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 521) 586 91.0 3.3e-18 CCDS44354.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 508) 584 90.7 3.9e-18 CCDS7939.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 483) 560 87.5 3.5e-17 CCDS81565.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 514) 560 87.5 3.7e-17 CCDS7938.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 482) 558 87.2 4.2e-17 CCDS31482.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 486) 558 87.2 4.3e-17 >>CCDS12106.1 CELF5 gene_id:60680|Hs108|chr19 (485 aa) initn: 3280 init1: 3280 opt: 3280 Z-score: 2394.5 bits: 452.5 E(32554): 4.7e-127 Smith-Waterman score: 3280; 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CCDS10 FVKFGSQGEAQAAIRGLHGSRTMAGASSSLVVKLADTDRERALRRMQQMAGHLGAFHPA- 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TLPFSPYSAYAQALMQQQTTVLSTS-GSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSLNGLPATPIAPA ::.. .::. :..:.:...:... : :.: :: ..:...: :: :.:. :: CCDS10 PLPLGACGAYTTAILQHQAALLAAAQGPGLGP-VAAVAAQMQHVAAFSLV---AAPLLPA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 SGLHSPPLLGTTAVPGLVAPI-TNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLVPYPAQSPTVAET .. .::: : ..::: ::: .:::. ..: .:.:. .:.: ::: ::::::: ::. CCDS10 AAANSPPGSGPGTLPGLPAPIGVNGFGPLTPQTNGQPGSDTLYNNGLSPYPAQSPGVADP 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 LHPAFSGVQQYTAMYPTAAITPIAHSVPQPPPLLQQQQREGPEGCNLFIYHLPQEFGDTE :. :..:...:.: ::.: .:.. . :: : : :::::::::::::::::::::::.: CCDS10 LQQAYAGMHHYAAAYPSA-YAPVSTAFPQQPSALPQQQREGPEGCNLFIYHLPQEFGDAE 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 LTQMFLPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQL : : ::::: ..:.:::.::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::: CCDS10 LIQTFLPFGAVVSAKVFVDRATNQSKCFGFVSFDNPTSAQTAIQAMNGFQIGMKRLKVQL 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 KRPKDPGHPY ::::: ..:: CCDS10 KRPKDANRPY 480 >>CCDS82250.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 (484 aa) initn: 1869 init1: 584 opt: 1870 Z-score: 1371.9 bits: 263.3 E(32554): 4.3e-70 Smith-Waterman score: 2067; 66.7% identity (83.9% similar) in 471 aa overlap (26-485:37-484) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MARLTESEARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRH : .: :. : ::: ::::::.:::::. CCDS82 TLANGQADNASLSTNGLGSSPGSAGHMNGLSHSPGNPSTIP--MKDHDAIKLFIGQIPRN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LDEKDLKPLFEQFGRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGM :::::::::::.::.::::::::: .::::::::::::: :.::.:::.::::::::::: CCDS82 LDEKDLKPLFEEFGKIYELTVLKDRFTGMHKGCAFLTYCERESALKAQSALHEQKTLPGM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE5 ARPIQVKPADSESRGGRD--------RKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVLR ::::::::::::::: . ::::::::::::::.:: :::. :: :.:::.:: CCDS82 NRPIQVKPADSESRGGSSCLRQPPSHRKLFVGMLNKQQSEDDVRRLFEAFGNIEECTILR 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 GPDGSSKGCAFVKFSSHTEAQAAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQMV ::::.::::::::.:::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::. CCDS82 GPDGNSKGCAFVKYSSHAEAQAAINALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTMRRMQQMA 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 GQLGILTPSLTLPFSPYSAYAQALMQQQTTVLST--SGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSL ::.:...: ...::. :.::::::::::...... .:.::.: .::. ..::..:... CCDS82 GQMGMFNP-MAIPFGAYGAYAQALMQQQAALMASVAQGGYLNPMAAFAAAQMQQMAALNM 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 NGLPATPIAPASGLHSPPLLGTTAVPGLVAPI-TNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLVP ::: :.:..:.:: .:: . . :::.. .:: .:::.:. : .:.:: :.:.:::. : CCDS82 NGLAAAPMTPTSGGSTPPGITAPAVPSIPSPIGVNGFTGLPPQANGQPAAEAVFANGIHP 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 YPAQSPTVAETLHPAFSGVQQYTAMYPTAAITPIAHSVPQPPPLLQQQQREGPEGCNLFI :::::::.:. :. :..:::::.: :: :... :::::.. :::::::::::::: CCDS82 YPAQSPTAADPLQQAYAGVQQYAAAAYPAAYGQISQAFPQPPPMIPQQQREGPEGCNLFI 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 YHLPQEFGDTELTQMFLPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGF :::::::::.:: ::::::: :::::::::::.:::::::: CCDS82 YHLPQEFGDAELMQMFLPFG--------------------FVSFDNPASAQTAIQAMNGF 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 QIGMKRLKVQLKRPKDPGHPY :::::::::::::::: ..:: CCDS82 QIGMKRLKVQLKRPKDANRPY 470 480 >>CCDS45857.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 (484 aa) initn: 1725 init1: 728 opt: 1851 Z-score: 1358.2 bits: 260.7 E(32554): 2.5e-69 Smith-Waterman score: 2048; 66.6% identity (83.7% similar) in 473 aa overlap (26-485:37-484) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MARLTESEARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRH : .: :. : ::: ::::::.:::::. CCDS45 TLANGQADNASLSTNGLGSSPGSAGHMNGLSHSPGNPSTIP--MKDHDAIKLFIGQIPRN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LDEKDLKPLFEQFGRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGM :::::::::::.::.::::::::: .::::::::::::: :.::.:::.::::::::::: CCDS45 LDEKDLKPLFEEFGKIYELTVLKDRFTGMHKGCAFLTYCERESALKAQSALHEQKTLPGM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE5 ARPIQVKPADSESRGGRD--------RKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVLR ::::::::::::::: . ::::::::::::::.:: :::. :: :.:::.:: CCDS45 NRPIQVKPADSESRGGSSCLRQPPSHRKLFVGMLNKQQSEDDVRRLFEAFGNIEECTILR 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 GPDGSSKGCAFVKFSSHTEAQAAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQMV ::::.::::::::.:::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::. CCDS45 GPDGNSKGCAFVKYSSHAEAQAAINALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTMRRMQQMA 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 GQLGILTPSLTLPFSPYSAYAQALMQQQTTVLST--SGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSL ::.:...: ...::. :.::::: ::::...... .:.::.: .::. ..::..:... CCDS45 GQMGMFNP-MAIPFGAYGAYAQA-MQQQAALMASVAQGGYLNPMAAFAAAQMQQMAALNM 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 NGLPATPIAPASGLHSPPLLGTTAVPGLVAPI-TNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLVP ::: :.:..:.:: .:: . . :::.. .:: .:::.:. : .:.:: :.:.:::. : CCDS45 NGLAAAPMTPTSGGSTPPGITAPAVPSIPSPIGVNGFTGLPPQANGQPAAEAVFANGIHP 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 YPAQSPTVAETLHPAFSGVQQYT--AMYPTAAITPIAHSVPQPPPLLQQQQREGPEGCNL :::::::.:. :. :..:::::. : :: :: :... :::::.. :::::::::::: CCDS45 YPAQSPTAADPLQQAYAGVQQYAGPAAYP-AAYGQISQAFPQPPPMIPQQQREGPEGCNL 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 FIYHLPQEFGDTELTQMFLPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMN :::::::::::.:: ::::::: :::::::::::.:::::: CCDS45 FIYHLPQEFGDAELMQMFLPFG--------------------FVSFDNPASAQTAIQAMN 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 GFQIGMKRLKVQLKRPKDPGHPY :::::::::::::::::: ..:: CCDS45 GFQIGMKRLKVQLKRPKDANRPY 470 480 >>CCDS45858.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 (448 aa) initn: 1079 init1: 637 opt: 1688 Z-score: 1240.4 bits: 238.8 E(32554): 9e-63 Smith-Waterman score: 1829; 62.4% identity (79.6% similar) in 465 aa overlap (26-485:37-448) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MARLTESEARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRH : .: :. : ::: ::::::.:::::. CCDS45 TLANGQADNASLSTNGLGSSPGSAGHMNGLSHSPGNPSTIP--MKDHDAIKLFIGQIPRN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LDEKDLKPLFEQFGRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGM :::::::::::.::.::::::::: .::::::::::::: :.::.:::.::::::::::: CCDS45 LDEKDLKPLFEEFGKIYELTVLKDRFTGMHKGCAFLTYCERESALKAQSALHEQKTLPGM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 ARPIQVKPADSESRGGRDRKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVLRGPDGSSKG :::::::::::::: .:::::::::::::::.:: :::. :: :.:::.::::::.::: CCDS45 NRPIQVKPADSESRG-EDRKLFVGMLNKQQSEDDVRRLFEAFGNIEECTILRGPDGNSKG 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 CAFVKFSSHTEAQAAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQMVGQLGILTP :::::.:::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::.::.:...: CCDS45 CAFVKYSSHAEAQAAINALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTMRRMQQMAGQMGMFNP 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 SLTLPFSPYSAYAQALMQQQTTVLST--SGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSLNGLPATPI ...::. :.::::::::::...... .:.::.: .::. ..::..:...::: :.:. CCDS45 -MAIPFGAYGAYAQALMQQQAALMASVAQGGYLNPMAAFAAAQMQQMAALNMNGLAAAPM 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 APASGLHSPPLLGTTAVPGLVAPI-TNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLVPYPAQSPTV .:.:: .:: . . :::.. .:: .:::.:. : .:.:: :.:.:::. ::::::::. CCDS45 TPTSGGSTPPGITAPAVPSIPSPIGVNGFTGLPPQANGQPAAEAVFANGIHPYPAQSPTA 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 AETLHPAFSGVQQYT--AMYPTAAITPIAHSVPQPPPLLQQQQREGPEGCNLFIYHLPQE :. :. :..:::::. : :: :: :... :::::.. :::::: CCDS45 ADPLQQAYAGVQQYAGPAAYP-AAYGQISQAFPQPPPMIPQQQREG-------------- 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 FGDTELTQMFLPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIGMKR :::::::::::.:::::::::::::: CCDS45 ----------------------------------FVSFDNPASAQTAIQAMNGFQIGMKR 410 420 430 480 pF1KE5 LKVQLKRPKDPGHPY :::::::::: ..:: CCDS45 LKVQLKRPKDANRPY 440 >>CCDS1002.1 CELF3 gene_id:11189|Hs108|chr1 (465 aa) initn: 1357 init1: 674 opt: 1544 Z-score: 1135.7 bits: 219.5 E(32554): 6.1e-57 Smith-Waterman score: 2067; 66.0% identity (86.3% similar) in 468 aa overlap (39-485:1-465) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 ARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRHLDEKDLKPLFEQF ::. ::::::::::::::.::::::.:::: CCDS10 MKEPDAIKLFVGQIPRHLEEKDLKPIFEQF 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 GRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGMARPIQVKPADSES :::.::::.:: :::.:::::::::::::::.:::.::::::::::: :::::::::::: CCDS10 GRIFELTVIKDKYTGLHKGCAFLTYCARDSALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPADSES 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 RGGRDRKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVLRGPDGSSKGCAFVKFSSHTEAQ :: .:::::::::.:::..::: ..:.:::.::::::::::::.:::::::::..:.::: CCDS10 RG-EDRKLFVGMLGKQQTDEDVRKMFEPFGTIDECTVLRGPDGTSKGCAFVKFQTHAEAQ 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 AAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQMVGQLGILTPSLTLPFSPYSAYA :::..::.:.:.::::::::::::::.::: ::::::.. :::...: ..: :. ::::. CCDS10 AAINTLHSSRTLPGASSSLVVKFADTEKERGLRRMQQVATQLGMFSP-IALQFGAYSAYT 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 QALMQQQTTVLSTSGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSLNGLPATPIAPASGLHSPPLLGTT :::::::...... ..:::: .... ..:...:.. ::: ::::.:.:: .:: ...: CCDS10 QALMQQQAALVAAHSAYLSPMATMAAVQMQHMAAINANGLIATPITPSSGTSTPPAIAAT 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 AVPGLVAPI-TNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLVPYPAQSPTV-AETLHPAFSGVQQY : .. : . .::.. : : :.:: ...: ::. :::::::.. .. :. :..:.:.: CCDS10 PVSAIPAALGVNGYSPVPTQPTGQPAPDALYPNGVHPYPAQSPAAPVDPLQQAYAGMQHY 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 pF1KE5 TAMYPTAAITPIAHSVPQPPPLL-------------------QQQQREGPEGCNLFIYHL :: :: :: . .: . :::: :. ::::::::.:::.::::: CCDS10 TAAYP-AAYSLVAPAFPQPPALVAQQPPPPPQQQQQQQQQQQQQQQREGPDGCNIFIYHL 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 PQEFGDTELTQMFLPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIG :::: :.:. :::.:::..::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 PQEFTDSEILQMFVPFGHVISAKVFVDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIG 390 400 410 420 430 440 470 480 pF1KE5 MKRLKVQLKRPKDPGHPY ::::::::::::: ..:: CCDS10 MKRLKVQLKRPKDANRPY 450 460 >>CCDS32818.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 (486 aa) initn: 1838 init1: 593 opt: 1333 Z-score: 982.5 bits: 191.2 E(32554): 2.1e-48 Smith-Waterman score: 2073; 66.9% identity (84.0% similar) in 474 aa overlap (26-485:37-486) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MARLTESEARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRH : .: :. : ::: ::::::.:::::. CCDS32 TLANGQADNASLSTNGLGSSPGSAGHMNGLSHSPGNPSTIP--MKDHDAIKLFIGQIPRN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LDEKDLKPLFEQFGRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGM :::::::::::.::.::::::::: .::::::::::::: :.::.:::.::::::::::: CCDS32 LDEKDLKPLFEEFGKIYELTVLKDRFTGMHKGCAFLTYCERESALKAQSALHEQKTLPGM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE5 ARPIQVKPADSESRGG---------RDRKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVL ::::::::::::::: .:::::::::::::::.:: :::. :: :.:::.: CCDS32 NRPIQVKPADSESRGGSSCLRQPPSQDRKLFVGMLNKQQSEDDVRRLFEAFGNIEECTIL 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 RGPDGSSKGCAFVKFSSHTEAQAAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQM :::::.::::::::.:::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::: CCDS32 RGPDGNSKGCAFVKYSSHAEAQAAINALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTMRRMQQM 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 VGQLGILTPSLTLPFSPYSAYAQALMQQQTTVLST--SGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVS .::.:...: ...::. :.::::::::::...... .:.::.: .::. ..::..:.. CCDS32 AGQMGMFNP-MAIPFGAYGAYAQALMQQQAALMASVAQGGYLNPMAAFAAAQMQQMAALN 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 LNGLPATPIAPASGLHSPPLLGTTAVPGLVAPI-TNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLV .::: :.:..:.:: .:: . . :::.. .:: .:::.:. : .:.:: :.:.:::. CCDS32 MNGLAAAPMTPTSGGSTPPGITAPAVPSIPSPIGVNGFTGLPPQANGQPAAEAVFANGIH 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 PYPAQSPTVAETLHPAFSGVQQYT--AMYPTAAITPIAHSVPQPPPLLQQQQREGPEGCN ::::::::.:. :. :..:::::. : :: :: :... :::::.. ::::::::::: CCDS32 PYPAQSPTAADPLQQAYAGVQQYAGPAAYP-AAYGQISQAFPQPPPMIPQQQREGPEGCN 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 LFIYHLPQEFGDTELTQMFLPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAM ::::::::::::.:: ::::::: :::::::::::.::::: CCDS32 LFIYHLPQEFGDAELMQMFLPFG--------------------FVSFDNPASAQTAIQAM 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 NGFQIGMKRLKVQLKRPKDPGHPY ::::::::::::::::::: ..:: CCDS32 NGFQIGMKRLKVQLKRPKDANRPY 470 480 >>CCDS45856.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 (485 aa) initn: 1734 init1: 737 opt: 1316 Z-score: 970.2 bits: 188.9 E(32554): 1e-47 Smith-Waterman score: 2056; 66.7% identity (83.8% similar) in 474 aa overlap (26-485:37-485) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MARLTESEARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRH : .: :. : ::: ::::::.:::::. CCDS45 TLANGQADNASLSTNGLGSSPGSAGHMNGLSHSPGNPSTIP--MKDHDAIKLFIGQIPRN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LDEKDLKPLFEQFGRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGM :::::::::::.::.::::::::: .::::::::::::: :.::.:::.::::::::::: CCDS45 LDEKDLKPLFEEFGKIYELTVLKDRFTGMHKGCAFLTYCERESALKAQSALHEQKTLPGM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE5 ARPIQVKPADSESRGG---------RDRKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVL ::::::::::::::: .:::::::::::::::.:: :::. :: :.:::.: CCDS45 NRPIQVKPADSESRGGSSCLRQPPSQDRKLFVGMLNKQQSEDDVRRLFEAFGNIEECTIL 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 RGPDGSSKGCAFVKFSSHTEAQAAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQM :::::.::::::::.:::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::: CCDS45 RGPDGNSKGCAFVKYSSHAEAQAAINALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTMRRMQQM 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 VGQLGILTPSLTLPFSPYSAYAQALMQQQTTVLST--SGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVS .::.:...: ...::. :.::::: ::::...... .:.::.: .::. ..::..:.. CCDS45 AGQMGMFNP-MAIPFGAYGAYAQA-MQQQAALMASVAQGGYLNPMAAFAAAQMQQMAALN 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 LNGLPATPIAPASGLHSPPLLGTTAVPGLVAPI-TNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLV .::: :.:..:.:: .:: . . :::.. .:: .:::.:. : .:.:: :.:.:::. CCDS45 MNGLAAAPMTPTSGGSTPPGITAPAVPSIPSPIGVNGFTGLPPQANGQPAAEAVFANGIH 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 PYPAQSPTVAETLHPAFSGVQQYT--AMYPTAAITPIAHSVPQPPPLLQQQQREGPEGCN ::::::::.:. :. :..:::::. : :: :: :... :::::.. ::::::::::: CCDS45 PYPAQSPTAADPLQQAYAGVQQYAGPAAYP-AAYGQISQAFPQPPPMIPQQQREGPEGCN 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 LFIYHLPQEFGDTELTQMFLPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAM ::::::::::::.:: ::::::: :::::::::::.::::: CCDS45 LFIYHLPQEFGDAELMQMFLPFG--------------------FVSFDNPASAQTAIQAM 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 NGFQIGMKRLKVQLKRPKDPGHPY ::::::::::::::::::: ..:: CCDS45 NGFQIGMKRLKVQLKRPKDANRPY 470 480 >>CCDS53622.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 (485 aa) initn: 1274 init1: 561 opt: 754 Z-score: 562.6 bits: 113.5 E(32554): 5.1e-25 Smith-Waterman score: 1259; 44.9% identity (69.7% similar) in 485 aa overlap (35-485:7-485) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 TESEARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRHLDEKDLKPL .:: . ::::::.::::.:: .::::. : CCDS53 MNGTLDHPD-QPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLREL 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FEQFGRIYELTVLKDPYTG--MHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGMARPIQVK :::.: .::..::.: . . ::: :.:. .: .:..::.:::..:.:::: .:::.: CCDS53 FEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQMK 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 PADSESRGGRDRKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVLRGPDGSSKGCAFVKFS :::::. . .:::::.::..:. .:.:. .:. :: :.:: .:::::: :.::::: :. CCDS53 PADSEKNNVEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFT 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 pF1KE5 SHTEAQAAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRM-QQMVGQL---------GI ... ::.::.:.: .::: : :: .:::::::.:.. .:: ::. :. : CCDS53 TRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASVWGN 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LTPSLTLPFSPYSAYAQALMQQQTTVLSTSGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSLNGLPA-- :. :: . . : : :.: .. .. : : : ... ..:...:.. . : CCDS53 LAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASAAQN 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 pF1KE5 TPI---------APASGLHSPPLLGTTAVPGLVAPITNGFAGVVPFPGGHPALETVYANG :: .: : : : ... . : ::.. .... . :. .:.. : CCDS53 TPSGTNALTTSSSPLSVLTSSGSSPSSSSSNSVNPIAS-LGALQTLAGATAGLNVGSLAG 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 pF1KE5 LVPYPAQ---------SPTVAETLHPAFSGVQQYTAMYPTAAITPIAHS--VPQPPPLLQ .. . . .. :.: :.::.:::.: ::. . .. . : CCDS53 MAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAA----AALPTLYNQNLLTQQSIGAA 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 QQQREGPEGCNLFIYHLPQEFGDTELTQMFLPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDN .:.::::: ::::::::::::: .: :::.::::..:.:::.:. :: ::::::::.:: CCDS53 GSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDN 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 PASAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRPKDPGHPY :.:::::::.::::::::::::::::: :. ..:: CCDS53 PVSAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY 460 470 480 485 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 05:09:31 2016 done: Tue Nov 8 05:09:32 2016 Total Scan time: 3.010 Total Display time: 0.070 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]