FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6249, 261 aa 1>>>pF1KE6249 261 - 261 aa - 261 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6931+/-0.000869; mu= 12.5592+/- 0.052 mean_var=65.2073+/-13.087, 0's: 0 Z-trim(106.2): 29 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.158828 statistics sampled from 8835 (8862) to 8835 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.272), width: 16 Scan time: 1.860 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6237.1 CA1 gene_id:759|Hs108|chr8 ( 261) 1763 412.6 1.4e-115 CCDS6236.1 CA13 gene_id:377677|Hs108|chr8 ( 262) 1134 268.5 3.4e-72 CCDS6239.1 CA2 gene_id:760|Hs108|chr8 ( 260) 1073 254.5 5.4e-68 CCDS6238.1 CA3 gene_id:761|Hs108|chr8 ( 260) 1023 243.0 1.5e-64 CCDS10821.1 CA7 gene_id:766|Hs108|chr16 ( 264) 974 231.8 3.7e-61 CCDS14171.1 CA5B gene_id:11238|Hs108|chrX ( 317) 850 203.4 1.6e-52 CCDS10965.1 CA5A gene_id:763|Hs108|chr16 ( 305) 825 197.7 8e-51 CCDS42173.1 CA7 gene_id:766|Hs108|chr16 ( 208) 795 190.8 6.6e-49 CCDS6174.1 CA8 gene_id:767|Hs108|chr8 ( 290) 673 162.9 2.3e-40 CCDS10186.1 CA12 gene_id:771|Hs108|chr15 ( 343) 570 139.3 3.5e-33 CCDS10185.1 CA12 gene_id:771|Hs108|chr15 ( 354) 570 139.3 3.6e-33 CCDS947.1 CA14 gene_id:23632|Hs108|chr1 ( 337) 516 126.9 1.8e-29 CCDS30578.1 CA6 gene_id:765|Hs108|chr1 ( 308) 484 119.6 2.7e-27 CCDS57970.1 CA6 gene_id:765|Hs108|chr1 ( 313) 484 119.6 2.7e-27 CCDS6585.1 CA9 gene_id:768|Hs108|chr9 ( 459) 483 119.4 4.5e-27 CCDS32684.1 CA10 gene_id:56934|Hs108|chr17 ( 328) 464 115.0 6.8e-26 CCDS76767.1 CA12 gene_id:771|Hs108|chr15 ( 283) 436 108.5 5.1e-24 CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (1448) 442 110.1 8.6e-24 CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (2315) 442 110.2 1.3e-23 CCDS12729.1 CA11 gene_id:770|Hs108|chr19 ( 328) 412 103.1 2.6e-22 CCDS11624.1 CA4 gene_id:762|Hs108|chr17 ( 312) 380 95.7 4e-20 CCDS2895.1 PTPRG gene_id:5793|Hs108|chr3 (1445) 386 97.3 6.2e-20 CCDS57971.1 CA6 gene_id:765|Hs108|chr1 ( 248) 365 92.3 3.6e-19 >>CCDS6237.1 CA1 gene_id:759|Hs108|chr8 (261 aa) initn: 1763 init1: 1763 opt: 1763 Z-score: 2188.6 bits: 412.6 E(32554): 1.4e-115 Smith-Waterman score: 1763; 100.0% identity (100.0% similar) in 261 aa overlap (1-261:1-261) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MASPDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS62 MASPDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 INVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS62 INVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS62 VAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 DPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS62 DPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAV 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 PMQHNNRPTQPLKGRTVRASF ::::::::::::::::::::: CCDS62 PMQHNNRPTQPLKGRTVRASF 250 260 >>CCDS6236.1 CA13 gene_id:377677|Hs108|chr8 (262 aa) initn: 1131 init1: 1131 opt: 1134 Z-score: 1409.6 bits: 268.5 E(32554): 3.4e-72 Smith-Waterman score: 1134; 59.8% identity (86.6% similar) in 261 aa overlap (1-261:1-261) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MASPDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEI :. .::: ..::: .:....:::.:..:::..:::.:.:.:.::.:.:..:.:..:: : CCDS62 MSRLSWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKII 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 INVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELH : ::::.:.:.:..:.:::.:::.. :::: : :.::::...::::: ::::.:.:::: CCDS62 SNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNF :.:::: :: :..::: . :::::.::....:: : .:::. :.:..:: :::.. :::: CCDS62 VVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 DPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAV : .::: : :.:::::::: ::: ::::::. :. :..::.:::.::::: ..::. :. CCDS62 DLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAA 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 PMQHNNRPTQPLKGRTVRASF . :.:: :::::: ::::: CCDS62 FLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH 250 260 >>CCDS6239.1 CA2 gene_id:760|Hs108|chr8 (260 aa) initn: 585 init1: 546 opt: 1073 Z-score: 1334.2 bits: 254.5 E(32554): 5.4e-68 Smith-Waterman score: 1073; 60.2% identity (82.6% similar) in 259 aa overlap (3-261:2-259) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MASPDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEI : ::: .::::.: : .:::.:. :::::: : .:.: ::::.::::. ::. .: CCDS62 MSHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRI 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 INVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELH .: ::.:.:.:.:.....::::::.. .:::.:::::::: . .::::::: ::.:::: CCDS62 LNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELH 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNF ..:::. ::.....:... :::::.:...::: :.: ::::.:.:..:::::: : :::: CCDS62 LVHWNT-KYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNF 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 DPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAV :: ::: :::.:::::::: ::: : ::::. :: :::::::. .::.: : ::. CCDS62 DPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEE 180 190 200 210 220 230 250 260 pF1KE6 PMQHNNRPTQPLKGRTVRASF : : ::.::::.: ..::: CCDS62 LMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK 240 250 260 >>CCDS6238.1 CA3 gene_id:761|Hs108|chr8 (260 aa) initn: 1022 init1: 535 opt: 1023 Z-score: 1272.2 bits: 243.0 E(32554): 1.5e-64 Smith-Waterman score: 1023; 54.5% identity (83.7% similar) in 257 aa overlap (5-261:4-259) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MASPDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEI .::: ..:::..: .:.: :.:.:::::...:.. .:: ::.: ::::. ..:: : CCDS62 MAKEWGYASHNGPDHWHELFPNAKGENQSPVELHTKDIRHDPSLQPWSVSYDGGSAKTI 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 INVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELH .: :.. .: :.:. .::.:.:::. ::: :::.::::...::::::::::::.:::: CCDS62 LNNGKTCRVVFDDTYDRSMLRGGPLPGPYRLRQFHLHWGSSDDHGSEHTVDGVKYAAELH 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNF ..::: ::... :: .. ::.::::...:.:. : ..: ::::. ::::::.::::.: CCDS62 LVHWNP-KYNTFKEALKQRDGIAVIGIFLKIGHENGEFQIFLDALDKIKTKGKEAPFTKF 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 DPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAV ::: :.:. :.::: ::.: :: : ..:.. :: ..:::.:.:..:::::..:.. : CCDS62 DPSCLFPACRDYWTYQGSFTTPPCEECIVWLLLKEPMTVSSDQMAKLRSLLSSAENEPPV 180 190 200 210 220 230 250 260 pF1KE6 PMQHNNRPTQPLKGRTVRASF :. : :: ::...:.::::: CCDS62 PLVSNWRPPQPINNRVVRASFK 240 250 260 >>CCDS10821.1 CA7 gene_id:766|Hs108|chr16 (264 aa) initn: 974 init1: 974 opt: 974 Z-score: 1211.5 bits: 231.8 E(32554): 3.7e-61 Smith-Waterman score: 974; 51.6% identity (78.9% similar) in 256 aa overlap (6-261:7-262) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MASPDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKE ::: . .:: .: ::::::.:. :::..: .:.. .. ::.:. .::. . CCDS10 MTGHHGWGYGQDDGPSHWHKLYPIAQGDRQSPINIISSQAVYSPSLQPLELSYEACMSLS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 IINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAEL : : ::: .:.:.:.:.:.:. :::. ::: :::::::. .. :::::::: .. .:: CCDS10 ITNNGHSVQVDFNDSDDRTVVTGGPLEGPYRLKQFHFHWGKKHDVGSEHTVDGKSFPSEL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 HVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTN :..:::. :::...:::: :::::.::....:. .:..... ::: .. :: .: :. CCDS10 HLVHWNAKKYSTFGEAASAPDGLAVVGVFLETGDEHPSMNRLTDALYMVRFKGTKAQFSC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 FDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNA :.:. :::.: .:::::::: ::: ::::::. .: : .: .:...::::: . : :. CCDS10 FNPKCLLPASRHYWTYPGSLTTPPLSESVTWIVLREPICISERQMGKFRSLLFTSEDDER 190 200 210 220 230 240 240 250 260 pF1KE6 VPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF . : .: :: ::::::.:.::: CCDS10 IHMVNNFRPPQPLKGRVVKASFRA 250 260 >>CCDS14171.1 CA5B gene_id:11238|Hs108|chrX (317 aa) initn: 842 init1: 842 opt: 850 Z-score: 1056.6 bits: 203.4 E(32554): 1.6e-52 Smith-Waterman score: 850; 49.4% identity (76.3% similar) in 245 aa overlap (17-261:52-296) 10 20 30 40 pF1KE6 MASPDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLK : .. . .:. :::..:. .. .: .:: CCDS14 KFQIPRFMPARPCSLYTCTYKTRNRALHPLWESVDLVPGGDRQSPINIRWRDSVYDPGLK 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 PISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGS :...::.::: .. : :.:: :.:::. ..::.::::. .::: :::::::. . :: CCDS14 PLTISYDPATCLHVWNNGYSFLVEFEDSTDKSVIKGGPLEHNYRLKQFHFHWGAIDAWGS 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 EHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQ :::::. . ::::..:::.... .. .:: . .:::::::..:.:. . .:::..:.: CCDS14 EHTVDSKCFPAELHLVHWNAVRFENFEDAALEENGLAVIGVFLKLGKHHKELQKLVDTLP 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 AIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQ .:: : . : .:::: :.:. :.::: :::: ::: ::::::: :. . :. .:: : CCDS14 SIKHKDALVEFGSFDPSCLMPTCPDYWTYSGSLTTPPLSESVTWIIKKQPVEVDHDQLEQ 210 220 230 240 250 260 230 240 250 260 pF1KE6 FRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF ::.:: . ::.. : : :: ::: .::::.:: CCDS14 FRTLLFTSEGEKEKRMVDNFRPLQPLMNRTVRSSFRHDYVLNVQAKPKPATSQATP 270 280 290 300 310 >>CCDS10965.1 CA5A gene_id:763|Hs108|chr16 (305 aa) initn: 813 init1: 813 opt: 825 Z-score: 1025.9 bits: 197.7 E(32554): 8e-51 Smith-Waterman score: 825; 48.8% identity (71.1% similar) in 256 aa overlap (6-261:41-296) 10 20 30 pF1KE6 MASPDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIK : .... :. . .:. :::..:. CCDS10 AFSFLVEQMWAPLWSRSMRPGRWCSQRSCAWQTSNNTLHPLWTVPVSVPGGTRQSPINIQ 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 TSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFH .. .: .:::. :::. :. : :.:. :.:.:.: . : ..:::. . ::: ::: CCDS10 WRDSVYDPQLKPLRVSYEAASCLYIWNTGYLFQVEFDDATEASGISGGPLENHYRLKQFH 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 FHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEAN ::::..:: :::::::: : ::::..::::.::.. ::. .:::::::..:.: . CCDS10 FHWGAVNEGGSEHTVDGHAYPAELHLVHWNSVKYQNYKEAVVGENGLAVIGVFLKLGAHH 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 PKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKE ::...: : :: : :: . ::::::::. :.::: :::: ::: ::::::: :: CCDS10 QTLQRLVDILPEIKHKDARAAMRPFDPSTLLPTCWDYWTYAGSLTTPPLTESVTWIIQKE 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 pF1KE6 SISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF . :. ::. ::.:: .. :.. : .: :: ::: .: : ::: CCDS10 PVEVAPSQLSAFRTLLFSALGEEEKMMVNNYRPLQPLMNRKVWASFQATNEGTRS 260 270 280 290 300 >>CCDS42173.1 CA7 gene_id:766|Hs108|chr16 (208 aa) initn: 795 init1: 795 opt: 795 Z-score: 991.5 bits: 190.8 E(32554): 6.6e-49 Smith-Waterman score: 795; 54.0% identity (80.2% similar) in 202 aa overlap (60-261:5-206) 30 40 50 60 70 80 pF1KE6 SPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSY : : ::: .:.:.:.:.:.:. :::. : CCDS42 MSLSITNNGHSVQVDFNDSDDRTVVTGGPLEGPY 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 RLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLM :: :::::::. .. :::::::: .. .:::..:::. :::...:::: :::::.::.. CCDS42 RLKQFHFHWGKKHDVGSEHTVDGKSFPSELHLVHWNAKKYSTFGEAASAPDGLAVVGVFL 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 KVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVT ..:. .:..... ::: .. :: .: :. :.:. :::.: .:::::::: ::: :::: CCDS42 ETGDEHPSMNRLTDALYMVRFKGTKAQFSCFNPKCLLPASRHYWTYPGSLTTPPLSESVT 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 WIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF ::. .: : .: .:...::::: . : :. . : .: :: ::::::.:.::: CCDS42 WIVLREPICISERQMGKFRSLLFTSEDDERIHMVNNFRPPQPLKGRVVKASFRA 160 170 180 190 200 >>CCDS6174.1 CA8 gene_id:767|Hs108|chr8 (290 aa) initn: 569 init1: 303 opt: 673 Z-score: 838.0 bits: 162.9 E(32554): 2.3e-40 Smith-Waterman score: 673; 39.2% identity (70.9% similar) in 268 aa overlap (5-261:28-289) 10 20 30 pF1KE6 MASPDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTS .:::.. : : :. ..: :::. :::..... CCDS61 MADLSFIEDTVAFPEKEEDEEEEEEGVEWGYEE--GVE-WGLVFPDANGEYQSPINLNSR 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 ETKHDTSLKPISVSYNPATAK--EIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDS--YRLFQ :...: :: . .: : .. . :. : ::...: .. ..:::.:::. .. ..:.. CCDS61 EARYDPSLLDVRLSPNYVVCRDCEVTNDGHTIQVILK---SKSVLSGGPLPQGHEFELYE 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 FHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGE .:::: :..::::::. . :::. ::::. ..:. ::..: :.:.:......:. 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